DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'VDY'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1J78_B_VDYB500 1j78 VDY

DB00146
(Calcidiol)
Homo sapiens VITAMIN D BINDING
PROTEIN
no annotation 10 GLU B   8
VAL B  12
PHE B  24
LEU B  31
TYR B  32
LYS B  35
LEU B  47
TYR B  68
SER B  76
MET B 107
VDY B 500
1MZ9_A_VDYA1002 1mz9 VDY

DB00146
(Calcidiol)
Mus musculus CARTILAGE OLIGOMERIC
MATRIX PROTEIN
PF11598
(COMP)
no annotation
21 ILE B  58
ILE A  58
ILE C  58
LEU D  61
LEU C  61
LEU E  61
LEU B  61
LEU A  61
VAL E  65
VAL A  65
VAL C  65
VAL D  65
VAL B  65
CYS D  68
CYS E  68
ALA A  70
ALA E  70
ALA D  70
ALA C  70
CYS C  71
CYS D  71
VDY A1002
1MZ9_D_VDYD1001 1mz9 VDY

DB00146
(Calcidiol)
Mus musculus CARTILAGE OLIGOMERIC
MATRIX PROTEIN
PF11598
(COMP)
no annotation
16 LEU A  37
THR D  40
THR C  40
THR A  40
THR E  40
LEU C  44
LEU E  44
LEU B  44
LEU D  44
VAL D  47
VAL E  47
VAL B  47
LEU A  51
LEU C  51
LEU D  51
LEU B  51
VDY D1001
3A51_A_VDYA6178 3a51 VDY

DB00146
(Calcidiol)
Pseudonocardia
autotrophica
VITAMIN D
HYDROXYLASE
PF00067
(p450)
11 THR A  84
MET A  86
ILE A  88
LYS A 180
ASN A 181
LEU A 232
ILE A 235
THR A 240
VAL A 283
PRO A 287
LEU A 387
VDY A6178
3A51_B_VDYB6178 3a51 VDY

DB00146
(Calcidiol)
Pseudonocardia
autotrophica
VITAMIN D
HYDROXYLASE
no annotation 13 PRO B  83
THR B  84
MET B  86
LEU B  89
LYS B 180
ASN B 181
MET B 184
LEU B 232
ILE B 235
THR B 240
VAL B 283
PRO B 287
LEU B 387
VDY B6178
3A51_C_VDYC6178 3a51 VDY

DB00146
(Calcidiol)
Pseudonocardia
autotrophica
VITAMIN D
HYDROXYLASE
no annotation 13 THR C  84
MET C  86
ILE C  88
LEU C  89
LYS C 180
ASN C 181
MET C 184
LEU C 232
ILE C 235
THR C 240
VAL C 283
PRO C 287
LEU C 387
VDY C6178
3A51_D_VDYD6178 3a51 VDY

DB00146
(Calcidiol)
Pseudonocardia
autotrophica
VITAMIN D
HYDROXYLASE
no annotation 12 THR D  84
MET D  86
ILE D  88
LYS D 180
ASN D 181
MET D 184
LEU D 232
ILE D 235
THR D 240
VAL D 283
PRO D 287
LEU D 387
VDY D6178
3A51_E_VDYE6178 3a51 VDY

DB00146
(Calcidiol)
Pseudonocardia
autotrophica
VITAMIN D
HYDROXYLASE
no annotation 13 THR E  84
MET E  86
ILE E  88
LYS E 180
ASN E 181
MET E 184
LEU E 232
ILE E 235
ALA E 236
THR E 240
VAL E 283
PRO E 287
LEU E 387
VDY E6178
5IEN_A_VDYA201 5ien VDY

DB00146
(Calcidiol)
synthetic
construct
CDL2.2 PF14534
(DUF4440)
24 LEU A  12
PHE A  15
TYR A  31
ILE A  37
PRO A  39
MET A  42
LEU A  54
TRP A  55
LEU A  58
MET A  61
VAL A  63
LEU A  68
ILE A  86
LEU A  88
GLY A  90
PRO A  91
ILE A 100
TYR A 104
GLU A 106
LEU A 118
THR A 121
ALA A 123
LEU A 125
GLU A 131
VDY A 201
5IEN_B_VDYB201 5ien VDY

DB00146
(Calcidiol)
synthetic
construct
CDL2.2 no annotation 22 LEU B  12
PHE B  15
TYR B  31
ILE B  37
PRO B  39
MET B  42
LEU B  54
TRP B  55
LEU B  58
MET B  61
VAL B  63
LEU B  68
ILE B  86
LEU B  88
PRO B  91
ILE B 100
TYR B 104
GLU B 106
LEU B 118
THR B 121
ALA B 123
LEU B 125
VDY B 201
5IEO_A_VDYA206 5ieo VDY

DB00146
(Calcidiol)
synthetic
construct
CDL2.3A PF14534
(DUF4440)
20 LEU A  12
PHE A  15
TYR A  31
ILE A  37
PRO A  39
MET A  42
LEU A  54
TRP A  55
LEU A  58
MET A  61
PHE A  68
PHE A  86
LEU A  88
ILE A 100
TYR A 104
GLU A 106
LEU A 118
THR A 121
ALA A 123
LEU A 125
VDY A 206
5IEP_A_VDYA201 5iep VDY

DB00146
(Calcidiol)
synthetic
construct
CDL2.3B PF14534
(DUF4440)
21 LEU A  12
PHE A  15
TYR A  31
ILE A  37
PRO A  39
MET A  42
LEU A  54
TRP A  55
LEU A  58
MET A  61
VAL A  63
PHE A  68
PHE A  86
LEU A  88
ILE A 100
TYR A 104
GLU A 106
LEU A 118
THR A 121
ALA A 123
LEU A 125
VDY A 201