DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'TOP'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1DG5_A_TOPA201 1dg5 TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Mycobacterium
tuberculosis
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
11 ILE A   5
TRP A   6
ALA A   7
ILE A  20
ASP A  27
PHE A  31
SER A  49
LEU A  50
PRO A  51
ILE A  94
TYR A 100
TOP A 201
1DYR_A_TOPA407 1dyr TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Pneumocystis
carinii
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
11 ILE A  10
ALA A  12
LEU A  25
GLU A  32
ILE A  33
PHE A  36
ILE A  65
PRO A  66
ILE A 123
TYR A 129
THR A 144
TOP A 407
2BFM_A_TOPA1290 2bfm TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Leishmania
major
PTERIDINE REDUCTASE
1
PF00106
(adh_short)
PF13561
(adh_short_C2)
no annotation
9 PHE A 113
ASP A 181
LEU A 188
TYR A 194
LEU A 226
LEU A 229
HIS A 241
TYR A 283
ARG D 287
TOP A1290
2BFM_B_TOPB1290 2bfm TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Leishmania
major
PTERIDINE REDUCTASE
1
no annotation 9 PHE B 113
ASP B 181
LEU B 188
TYR B 191
TYR B 194
LEU B 226
LEU B 229
HIS B 241
ARG C 287
TOP B1290
2W3A_A_TOPA1190 2w3a TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Homo sapiens DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
11 ILE A   7
ALA A   9
GLU A  30
PHE A  31
PHE A  34
THR A  56
ILE A  60
PRO A  61
VAL A 115
TYR A 121
THR A 136
TOP A1190
2W3A_B_TOPB1189 2w3a TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Homo sapiens DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
no annotation 10 ILE B   7
ALA B   9
GLU B  30
PHE B  31
PHE B  34
THR B  56
ILE B  60
LEU B  67
TYR B 121
THR B 136
TOP B1189
2W3V_A_TOPA1169 2w3v TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Mycobacterium
avium
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
12 VAL A   9
TRP A  10
ALA A  11
ILE A  24
ASP A  31
LEU A  32
PHE A  35
SER A  53
LEU A  54
ILE A 102
TYR A 108
THR A 121
TOP A1169
2W9G_A_TOPA1159 2w9g TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Staphylococcus
aureus
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
10 LEU A   5
ALA A   7
LEU A  20
ASP A  27
LEU A  28
VAL A  31
SER A  49
ILE A  50
PHE A  92
THR A 111
TOP A1159
2W9H_A_TOPA1160 2w9h TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Staphylococcus
aureus
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
10 LEU A   5
ALA A   7
LEU A  20
ASP A  27
LEU A  28
VAL A  31
SER A  49
ILE A  50
PHE A  92
THR A 111
TOP A1160
2W9S_A_TOPA1160 2w9s TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Staphylococcus
aureus
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE TYPE 1
FROM TN4003
PF00186
(DHFR_1)
11 ILE A   5
ALA A   7
LEU A  20
ASP A  27
LEU A  28
ILE A  31
SER A  49
ILE A  50
PHE A  92
TYR A  98
THR A 111
TOP A1160
2W9S_B_TOPB1160 2w9s TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Staphylococcus
aureus
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE TYPE 1
FROM TN4003
no annotation 11 ILE B   5
ALA B   7
LEU B  20
ASP B  27
LEU B  28
ILE B  31
SER B  49
ILE B  50
PHE B  92
TYR B  98
THR B 111
TOP B1160
2W9S_C_TOPC1160 2w9s TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Staphylococcus
aureus
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE TYPE 1
FROM TN4003
no annotation 10 ILE C   5
ALA C   7
LEU C  20
ASP C  27
ILE C  31
SER C  49
ILE C  50
PHE C  92
TYR C  98
THR C 111
TOP C1160
2W9S_D_TOPD1158 2w9s TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Staphylococcus
aureus
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE TYPE 1
FROM TN4003
no annotation 10 ILE D   5
ALA D   7
LEU D  20
ASP D  27
LEU D  28
ILE D  31
SER D  49
PHE D  92
TYR D  98
THR D 111
TOP D1158
2W9S_E_TOPE1160 2w9s TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Staphylococcus
aureus
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE TYPE 1
FROM TN4003
no annotation 8 ILE E   5
ALA E   7
LEU E  20
ASP E  27
ILE E  31
PHE E  92
TYR E  98
THR E 111
TOP E1160
2W9S_F_TOPF1159 2w9s TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Staphylococcus
aureus
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE TYPE 1
FROM TN4003
no annotation 10 ILE F   5
ALA F   7
LEU F  20
ASP F  27
LEU F  28
ILE F  31
SER F  49
PHE F  92
TYR F  98
THR F 111
TOP F1159
3FL9_A_TOPA200 3fl9 TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Bacillus
anthracis
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE (DHFR)
PF00186
(DHFR_1)
10 MET A   6
ALA A   8
LEU A  21
GLU A  28
VAL A  32
ALA A  50
ILE A  51
LEU A  55
PHE A  96
TYR A 102
TOP A 200
3FL9_B_TOPB200 3fl9 TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Bacillus
anthracis
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE (DHFR)
no annotation 12 MET B   6
ALA B   8
ASN B  20
LEU B  21
GLU B  28
LEU B  29
VAL B  32
ILE B  51
LEU B  55
PHE B  96
TYR B 102
THR B 115
TOP B 200
3FL9_C_TOPC200 3fl9 TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Bacillus
anthracis
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE (DHFR)
no annotation 11 MET C   6
ALA C   8
ASN C  20
LEU C  21
GLU C  28
LEU C  29
VAL C  32
ILE C  51
LEU C  55
PHE C  96
THR C 115
TOP C 200
3FL9_D_TOPD200 3fl9 TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Bacillus
anthracis
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE (DHFR)
no annotation 9 MET D   6
ALA D   8
LEU D  21
GLU D  28
VAL D  32
ILE D  51
LEU D  55
PHE D  96
TYR D 102
TOP D 200
3FL9_E_TOPE200 3fl9 TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Bacillus
anthracis
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE (DHFR)
no annotation 10 MET E   6
ALA E   8
LEU E  21
GLU E  28
LEU E  29
VAL E  32
ILE E  51
LEU E  55
PHE E  96
THR E 115
TOP E 200
3FL9_F_TOPF200 3fl9 TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Bacillus
anthracis
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE (DHFR)
no annotation 10 MET F   6
ALA F   8
ASN F  20
LEU F  21
GLU F  28
VAL F  32
ALA F  50
ILE F  51
LEU F  55
PHE F  96
TOP F 200
3FL9_G_TOPG200 3fl9 TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Bacillus
anthracis
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE (DHFR)
no annotation 12 MET G   6
ALA G   8
ASN G  20
LEU G  21
GLU G  28
LEU G  29
VAL G  32
ILE G  51
LEU G  55
PHE G  96
TYR G 102
THR G 115
TOP G 200
3FL9_H_TOPH200 3fl9 TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Bacillus
anthracis
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE (DHFR)
no annotation 9 MET H   6
ALA H   8
GLU H  28
LEU H  29
VAL H  32
ILE H  51
LEU H  55
PHE H  96
THR H 115
TOP H 200
3FRB_X_TOPX300 3frb TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Staphylococcus
aureus
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
11 LEU X   5
ALA X   7
LEU X  20
ASP X  27
LEU X  28
VAL X  31
SER X  49
ILE X  50
PHE X  92
TYR X  98
THR X 111
TOP X 300
3FRE_X_TOPX300 3fre TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Staphylococcus
aureus
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
9 ALA X   7
LEU X  20
ASP X  27
LEU X  28
VAL X  31
SER X  49
ILE X  50
PHE X  92
THR X 111
TOP X 300
3JW3_A_TOPA208 3jw3 TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Bacillus
anthracis
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
10 MET A   6
ALA A   8
GLU A  28
LEU A  29
VAL A  32
ILE A  51
LEU A  55
ILE A  96
TYR A 102
THR A 115
TOP A 208
3JW3_B_TOPB208 3jw3 TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Bacillus
anthracis
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
no annotation 9 MET B   6
ALA B   8
LEU B  21
GLU B  28
VAL B  32
ILE B  51
LEU B  55
ILE B  96
TYR B 102
TOP B 208
3JW5_A_TOPA208 3jw5 TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Bacillus
anthracis
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
11 MET A   6
ALA A   8
ASN A  20
LEU A  21
GLU A  28
LEU A  29
VAL A  32
ASN A  47
ILE A  51
PHE A  96
THR A 115
TOP A 208
3JW5_B_TOPB208 3jw5 TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Bacillus
anthracis
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
no annotation 10 MET B   6
ALA B   8
LEU B  21
GLU B  28
LEU B  29
VAL B  32
ILE B  51
LEU B  55
PHE B  96
THR B 115
TOP B 208
3N0H_A_TOPA187 3n0h TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Homo sapiens DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
11 ILE A   7
ALA A   9
GLU A  30
PHE A  31
PHE A  34
THR A  56
ILE A  60
LEU A  67
VAL A 115
TYR A 121
THR A 136
TOP A 187
3N0H_A_TOPA191 3n0h TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Homo sapiens DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
4 ASP A  21
PRO A  61
LYS A  63
PHE A  64
TOP A 191
3S3V_A_TOPA187 3s3v TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Homo sapiens DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
12 ILE A   7
ALA A   9
GLU A  30
PHE A  31
PHE A  34
LYS A  35
THR A  56
ILE A  60
LEU A  67
VAL A 115
TYR A 121
THR A 136
TOP A 187
3S3V_A_TOPA193 3s3v TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Homo sapiens DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
5 ASP A  21
LEU A  22
ILE A  60
PRO A  61
PHE A  64
TOP A 193
3TQ8_A_TOPA2001 3tq8 TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Coxiella
burnetii
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
9 ILE A   6
ALA A   8
LEU A  21
ASP A  28
PHE A  32
SER A  50
ILE A  51
ILE A  96
THR A 115
TOP A2001
4G8Z_X_TOPX301 4g8z TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Pneumocystis
jirovecii
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
10 ILE X  10
ALA X  12
LEU X  25
GLU X  32
PHE X  36
SER X  64
PRO X  66
ILE X 123
TYR X 129
THR X 144
TOP X 301
4KM2_A_TOPA202 4km2 TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Mycobacterium
tuberculosis
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
13 ILE A   5
TRP A   6
ALA A   7
ILE A  20
ASP A  27
PHE A  31
THR A  46
LEU A  50
VAL A  54
LEU A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
TOP A 202
4KM2_B_TOPB202 4km2 TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Mycobacterium
tuberculosis
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
no annotation 13 ILE B   5
TRP B   6
ALA B   7
ILE B  20
ASP B  27
PHE B  31
THR B  46
LEU B  50
VAL B  54
LEU B  57
ILE B  94
TYR B 100
THR B 113
TOP B 202
4XT7_A_TOPA302 4xt7 TOP

DB00440
(Trimethoprim)
Mycobacterium
tuberculosis
RV2671 PF01872
(RibD_C)
11 ASN A  44
ILE A  46
THR A  58
SER A  59
GLY A  60
ASP A  67
ARG A  68
PHE A  71
GLU A  91
GLU A 193
THR A 214
TOP A 302