DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'RIT'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1HXW_B_RITB301 1hxw RIT

DB00503
(Ritonavir)
Human
immunodeficienc
y virus 1
HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
20 ARG B   8
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
GLY A  27
ALA B  28
ASP A  29
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
RIT B 301
1N49_B_RITB301 1n49 RIT

DB00503
(Ritonavir)
Human
immunodeficienc
y virus 1
PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
18 ARG B   8
ASN A  25
ASN B  25
GLY B  27
ALA B  28
ASP A  29
ASP B  30
VAL B  32
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
ALA A  82
ILE A  84
ILE B  84
RIT B 301
1N49_D_RITD401 1n49 RIT

DB00503
(Ritonavir)
Human
immunodeficienc
y virus 1
PROTEASE no annotation 17 ARG C   8
ASN D  25
ASN C  25
GLY C  27
ALA C  28
ASP D  29
ASP C  30
VAL C  32
ILE C  47
GLY D  49
GLY C  49
ILE D  50
ILE C  50
PRO C  81
PRO D  81
ILE D  84
ILE C  84
RIT D 401
1RL8_A_RITA9001 1rl8 RIT

DB00503
(Ritonavir)
Human
immunodeficienc
y virus 1
PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation
24 ARG B   8
ARG A   8
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL A  32
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
ALA B  82
ALA A  82
ILE A  84
ILE B  84
RIT A9001
1SH9_B_RITB301 1sh9 RIT

DB00503
(Ritonavir)
Human
immunodeficienc
y virus 1
POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation
18 ARG B   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  30
ILE A  32
ILE B  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
ILE B  50
PRO A  81
PRO B  81
ALA B  82
RIT B 301
2B60_B_RITB100 2b60 RIT

DB00503
(Ritonavir)
Human
immunodeficienc
y virus 1
GAG-POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation
23 ARG B   8
ARG A   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ILE B  32
ILE A  32
ILE A  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
ALA B  82
ALA A  82
ILE A  84
ILE B  84
RIT B 100
3NDW_A_RITA100 3ndw RIT

DB00503
(Ritonavir)
Human
immunodeficienc
y virus 1
PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
22 ARG B   8
ARG A   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP A  30
VAL A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
RIT A 100
3NDX_A_RITA100 3ndx RIT

DB00503
(Ritonavir)
Human
immunodeficienc
y virus 1
PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
23 ARG B   8
ARG A   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
RIT A 100
3NXU_A_RITA600 3nxu RIT

DB00503
(Ritonavir)
Homo sapiens CYTOCHROME P450 3A4 PF00067
(p450)
19 PHE A  57
ARG A 105
PHE A 108
SER A 119
ILE A 120
LEU A 210
LEU A 211
PHE A 215
THR A 224
PHE A 241
ILE A 301
PHE A 304
ALA A 305
THR A 309
ILE A 369
ALA A 370
ARG A 372
GLU A 374
GLY A 481
RIT A 600
3NXU_B_RITB600 3nxu RIT

DB00503
(Ritonavir)
Homo sapiens CYTOCHROME P450 3A4 no annotation 21 ARG B 105
PHE B 108
MET B 114
SER B 119
ILE B 120
LEU B 210
LEU B 211
PHE B 213
PHE B 215
THR B 224
PHE B 241
ILE B 301
PHE B 304
ALA B 305
THR B 309
ILE B 369
ALA B 370
ARG B 372
LEU B 373
GLU B 374
GLY B 481
RIT B 600
3PRS_A_RITA1001 3prs RIT

DB00503
(Ritonavir)
Cryphonectria
parasitica
ENDOTHIAPEPSIN PF00026
(Asp)
22 ILE A  10
ASP A  11
ASP A  15
ALA A  16
ASP A  33
ASP A  35
GLY A  37
ILE A  77
TYR A  79
GLY A  80
ASP A  81
ASP A 119
LEU A 125
THR A 135
PHE A 194
ILE A 217
ASP A 219
THR A 222
THR A 223
TYR A 226
ILE A 300
ILE A 304
RIT A1001
3Q70_A_RITA2001 3q70 RIT

DB00503
(Ritonavir)
Candida
albicans
CANDIDAPEPSIN-2 PF00026
(Asp)
18 THR A  13
ILE A  30
ASP A  32
GLY A  34
SER A  35
ILE A  82
TYR A  84
GLY A  85
SER A  88
ILE A 119
ASP A 120
ASN A 131
GLU A 193
ASP A 218
THR A 221
THR A 222
TYR A 225
ILE A 305
RIT A2001
3TNE_A_RITA401 3tne RIT

DB00503
(Ritonavir)
Candida
parapsilosis
SECRETED ASPARTIC
PROTEASE
PF00026
(Asp)
18 PRO A  12
ILE A  30
ASP A  32
GLY A  34
SER A  35
ILE A  76
TYR A  78
GLY A  79
ASP A  80
SER A  82
VAL A 113
ASP A 114
ASN A 125
ASP A 220
THR A 223
THR A 224
TYR A 227
ILE A 303
RIT A 401
3TNE_B_RITB401 3tne RIT

DB00503
(Ritonavir)
Candida
parapsilosis
SECRETED ASPARTIC
PROTEASE
PF00026
(Asp)
no annotation
20 ILE B  30
ASP B  32
GLY B  34
SER B  35
LYS A  49
ILE B  76
TYR B  78
GLY B  79
ASP B  80
SER B  82
VAL B 113
ASP B 114
ILE B 117
ASN B 125
ASP B 220
THR B 223
THR B 224
TYR B 227
ASP B 301
ILE B 303
RIT B 401
4EYR_B_RITB301 4eyr RIT

DB00503
(Ritonavir)
Human
immunodeficienc
y virus 1
HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
15 ARG B   8
LEU A  23
ASN A  25
ASN B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
VAL A  32
ILE A  50
PRO B  81
THR A  82
THR B  82
RIT B 301
4NJV_A_RITA500 4njv RIT

DB00503
(Ritonavir)
Human
immunodeficienc
y virus 1
PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
23 ARG B   8
ARG A   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
THR A  82
THR B  82
ILE A  84
ILE B  84
RIT A 500
4NJV_D_RITD500 4njv RIT

DB00503
(Ritonavir)
Human
immunodeficienc
y virus 1
PROTEASE no annotation 24 ARG D   8
ARG C   8
ASP D  25
ASP C  25
GLY C  27
GLY D  27
ALA D  28
ASP D  29
ASP C  29
ASP D  30
VAL C  32
VAL D  32
ILE D  47
ILE C  47
GLY D  49
GLY C  49
ILE D  50
ILE C  50
PRO D  81
PRO C  81
THR D  82
THR C  82
ILE D  84
ILE C  84
RIT D 500
5VC0_A_RITA602 5vc0 RIT

DB00503
(Ritonavir)
Homo sapiens CYTOCHROME P450 3A4 PF00067
(p450)
19 PHE A  57
ASP A  76
ARG A 105
ARG A 106
PHE A 108
SER A 119
ILE A 120
LEU A 210
LEU A 211
PHE A 213
PHE A 215
THR A 224
ILE A 301
PHE A 304
ALA A 305
THR A 309
ILE A 369
ALA A 370
ARG A 372
RIT A 602
5VCE_A_RITA602 5vce RIT

DB00503
(Ritonavir)
Homo sapiens CYTOCHROME P450 3A4 PF00067
(p450)
18 ARG A 105
ARG A 106
PHE A 108
SER A 119
ILE A 120
ARG A 212
PHE A 213
PHE A 215
ILE A 223
THR A 224
PHE A 241
ILE A 301
PHE A 304
ALA A 305
THR A 309
ILE A 369
ALA A 370
GLU A 374
RIT A 602
5VEU_A_RITA602 5veu RIT

DB00503
(Ritonavir)
Homo sapiens CYTOCHROME P450 3A5 no annotation 15 ARG A 105
ARG A 106
SER A 119
LEU A 120
PHE A 210
PHE A 213
PHE A 220
PHE A 241
ILE A 301
PHE A 304
ALA A 305
THR A 309
ALA A 370
GLY A 480
LEU A 481
RIT A 602
5VEU_B_RITB602 5veu RIT

DB00503
(Ritonavir)
Homo sapiens CYTOCHROME P450 3A5 no annotation 14 ARG B 106
SER B 119
LEU B 120
PHE B 210
PHE B 215
PHE B 241
ILE B 301
PHE B 304
ALA B 305
THR B 309
ALA B 370
ILE B 371
GLU B 374
GLY B 480
RIT B 602
5VEU_H_RITH602 5veu RIT

DB00503
(Ritonavir)
Homo sapiens CYTOCHROME P450 3A5 no annotation 17 ARG H 105
ARG H 106
SER H 119
LEU H 120
PHE H 210
PHE H 213
GLY H 214
PHE H 220
LEU H 240
PHE H 241
ILE H 301
PHE H 304
ALA H 305
THR H 309
GLU H 374
GLY H 480
LEU H 481
RIT H 602