DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'RIO'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1M4G_A_RIOA500 1m4g RIO

DB03615
(Ribostamycin)
Mycobacterium
tuberculosis
AMINOGLYCOSIDE
2'-N-ACETYLTRANSFERA
SE
PF13527
(Acetyltransf_9)
9 ASP A  35
ASP A  40
GLU A  82
GLY A  83
SER A 117
SER A 119
ARG A 123
ASP A 152
ASP A 179
RIO A 500
1M4G_B_RIOB501 1m4g RIO

DB03615
(Ribostamycin)
Mycobacterium
tuberculosis
AMINOGLYCOSIDE
2'-N-ACETYLTRANSFERA
SE
None 9 ASP B  35
ASP B  40
GLU B  82
GLY B  83
SER B 117
SER B 119
ASP B 152
THR B 155
ASP B 179
RIO B 501
1S3Z_A_RIOA500 1s3z RIO

DB03615
(Ribostamycin)
Salmonella
enterica
AMINOGLYCOSIDE
6'-N-ACETYLTRANSFERA
SE
None
PF00583
(Acetyltransf_1)
9 ARG A  18
TRP A  22
HIS A  25
TYR B  66
ASN B  68
GLU A  79
ASP A 115
GLU B 136
VAL B 138
RIO A 500
1S3Z_B_RIOB501 1s3z RIO

DB03615
(Ribostamycin)
Salmonella
enterica
AMINOGLYCOSIDE
6'-N-ACETYLTRANSFERA
SE
None
PF00583
(Acetyltransf_1)
8 ARG B  18
TRP B  22
HIS B  25
TYR A  66
GLU B  79
ASP B 115
GLU A 136
VAL A 138
RIO B 501
2BUE_A_RIOA1201 2bue RIO

DB03615
(Ribostamycin)
Escherichia
coli
AAC(6')-IB PF13523
(Acetyltransf_8)
11 TRP A  49
GLY A  50
TYR A  65
GLU A  73
GLN A  91
TYR A  93
SER A  98
TRP A 102
TRP A 103
ASP A 115
ASP A 152
RIO A1201
5IQD_A_RIOA600 5iqd RIO

DB03615
(Ribostamycin)
Staphylococcus
aureus
BIFUNCTIONAL AAC/APH PF01636
(APH)
11 ASP A 374
SER A 376
TYR A 408
GLU A 411
SER A 413
GLU A 415
GLU A 416
VAL A 444
GLU A 445
TYR A 448
GLU A 451
RIO A 600
5IQD_B_RIOB600 5iqd RIO

DB03615
(Ribostamycin)
Staphylococcus
aureus
BIFUNCTIONAL AAC/APH None 11 ASP B 374
SER B 376
TYR B 408
GLU B 411
SER B 413
GLU B 415
GLU B 416
VAL B 444
GLU B 445
TYR B 448
GLU B 451
RIO B 600
5IQD_C_RIOC600 5iqd RIO

DB03615
(Ribostamycin)
Staphylococcus
aureus
BIFUNCTIONAL AAC/APH None 12 ASP C 374
SER C 376
ASN C 378
TYR C 408
GLU C 411
SER C 413
GLU C 415
GLU C 416
VAL C 444
GLU C 445
TYR C 448
GLU C 451
RIO C 600
5IQD_D_RIOD600 5iqd RIO

DB03615
(Ribostamycin)
Staphylococcus
aureus
BIFUNCTIONAL AAC/APH None 11 ASP D 374
SER D 376
TYR D 408
GLU D 411
SER D 413
GLU D 415
GLU D 416
VAL D 444
GLU D 445
TYR D 448
GLU D 451
RIO D 600
6C5U_A_RIOA600 6c5u RIO

DB03615
(Ribostamycin)
Staphylococcus
aureus
BIFUNCTIONAL AAC/APH PF01636
(APH)
10 ASP A 374
SER A 376
ASN A 378
TYR A 408
GLU A 411
SER A 413
GLU A 415
GLU A 416
GLU A 445
TYR A 448
RIO A 600
6C5U_B_RIOB600 6c5u RIO

DB03615
(Ribostamycin)
Staphylococcus
aureus
BIFUNCTIONAL AAC/APH None 9 ASP B 374
SER B 376
TYR B 408
GLU B 411
SER B 413
GLU B 415
GLU B 416
GLU B 445
TYR B 448
RIO B 600
6C5U_D_RIOD600 6c5u RIO

DB03615
(Ribostamycin)
Staphylococcus
aureus
BIFUNCTIONAL AAC/APH None 10 ASP D 374
SER D 376
ASN D 378
TYR D 408
GLU D 411
SER D 413
GLU D 415
GLU D 416
GLU D 445
TYR D 448
RIO D 600