DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'RBV'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
3SFU_A_RBVA601 3sfu RBV

DB00811
(Ribavirin)
Norwalk virus RNA POLYMERASE PF00680
(RdRP_1)
9 ASP A 250
SER A 303
THR A 308
THR A 309
ASN A 312
TYR A 344
GLY A 345
ASP A 346
ASP A 347
RBV A 601
3SFU_B_RBVB601 3sfu RBV

DB00811
(Ribavirin)
Norwalk virus RNA POLYMERASE no annotation 9 ASP B 250
THR B 309
ASN B 312
TYR B 344
GLY B 345
ASP B 346
ASP B 347
LEU B 394
ARG B 395
RBV B 601
3SFU_C_RBVC601 3sfu RBV

DB00811
(Ribavirin)
Norwalk virus RNA POLYMERASE no annotation 11 LYS C 169
ARG C 185
LEU C 187
ASP C 250
LEU C 301
SER C 303
THR C 308
THR C 309
ASN C 312
GLY C 345
ASP C 346
RBV C 601
4PB1_A_RBVA501 4pb1 RBV

DB00811
(Ribavirin)
Vibrio cholerae NUPC FAMILY PROTEIN PF01773
(Nucleos_tra2_N)
PF07662
(Nucleos_tra2_C)
PF07670
(Gate)
14 GLY A 153
GLN A 154
THR A 155
GLU A 156
ALA A 185
TYR A 192
LEU A 259
ASN A 331
GLU A 332
PHE A 333
PHE A 366
ASN A 368
SER A 371
ILE A 374
RBV A 501
5AXD_A_RBVA502 5axd RBV

DB00811
(Ribavirin)
Mus musculus ADENOSYLHOMOCYSTEINA
SE
PF00670
(AdoHcyase_NAD)
PF05221
(AdoHcyase)
15 HIS A  55
THR A  57
GLU A  59
THR A  60
ASP A 131
GLU A 156
THR A 157
LYS A 186
ASP A 190
HIS A 301
LEU A 344
LEU A 347
GLY A 352
HIS A 353
MET A 358
RBV A 502
5AXD_C_RBVC502 5axd RBV

DB00811
(Ribavirin)
Mus musculus ADENOSYLHOMOCYSTEINA
SE
no annotation 15 HIS C  55
THR C  57
GLU C  59
THR C  60
ASP C 131
GLU C 156
THR C 157
LYS C 186
ASP C 190
HIS C 301
LEU C 344
LEU C 347
GLY C 352
HIS C 353
MET C 358
RBV C 502