DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'MTX'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1AO8_A_MTXA170 1ao8 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Lactobacillus
casei
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
16 LEU A   4
TRP A   5
ALA A   6
LEU A  19
ASP A  26
LEU A  27
PHE A  30
ARG A  31
THR A  34
THR A  45
SER A  48
PHE A  49
LEU A  54
ARG A  57
ALA A  97
THR A 116
MTX A 170
1AXW_A_MTXA732 1axw MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
THYMIDYLATE SYNTHASE PF00303
(Thymidylat_synt)
12 LYS A  48
HIS A  51
ILE A  79
TRP A  83
LEU A 143
ASP A 169
LEU A 172
GLY A 173
PHE A 176
TYR A 209
VAL A 262
ALA A 263
MTX A 732
1AXW_B_MTXB733 1axw MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
THYMIDYLATE SYNTHASE no annotation 11 LYS B  48
HIS B  51
ILE B  79
TRP B  80
TRP B  83
ASP B 169
LEU B 172
GLY B 173
PHE B 176
TYR B 209
VAL B 262
MTX B 733
1D1G_A_MTXA171 1d1g MTX

DB00563
(Methotrexate)
Thermotoga
maritima
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
13 VAL A   6
ALA A   8
ASP A  27
ARG A  28
LYS A  29
ARG A  32
GLU A  50
ILE A  51
ARG A  53
LEU A  55
ARG A  58
ILE A 100
THR A 121
MTX A 171
1D1G_B_MTXB171 1d1g MTX

DB00563
(Methotrexate)
Thermotoga
maritima
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
no annotation 12 VAL B   6
ALA B   8
ASP B  27
ARG B  28
ARG B  32
GLU B  50
ILE B  51
ARG B  53
LEU B  55
ARG B  58
ILE B 100
THR B 121
MTX B 171
1DDR_A_MTXA200 1ddr MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
14 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
LYS A  32
THR A  46
SER A  49
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
MTX A 200
1DDR_B_MTXB200 1ddr MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
no annotation 14 ILE B   5
ALA B   7
ASP B  27
LEU B  28
TRP B  30
PHE B  31
LYS B  32
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
ARG B  57
ILE B  94
TYR B 100
THR B 113
MTX B 200
1DDS_A_MTXA201 1dds MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
13 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
MTX A 201
1DDS_B_MTXB201 1dds MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
no annotation 13 ILE B   5
ALA B   7
ASP B  27
LEU B  28
LYS B  32
SER B  49
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
ARG B  57
ILE B  94
TYR B 100
THR B 113
MTX B 201
1DF7_A_MTXA501 1df7 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Mycobacterium
tuberculosis
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
15 ILE A   5
TRP A   6
ALA A   7
ILE A  20
ASP A  27
GLN A  28
ARG A  32
LEU A  50
PRO A  51
VAL A  54
LEU A  57
ARG A  60
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
MTX A 501
1DHI_A_MTXA161 1dhi MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
12 ILE A   5
ALA A   7
LEU A  28
LYS A  32
SER A  49
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
MTX A 161
1DHI_B_MTXB361 1dhi MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
no annotation 11 ILE B   5
ALA B   7
LEU B  28
LYS B  32
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
ARG B  57
ILE B  94
TYR B 100
THR B 113
MTX B 361
1DHJ_A_MTXA161 1dhj MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
12 ILE A   5
ALA A   7
LEU A  28
LYS A  32
SER A  49
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
MTX A 161
1DHJ_B_MTXB361 1dhj MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
no annotation 12 ILE B   5
ALA B   7
LEU B  28
LYS B  32
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
PRO B  55
ARG B  57
ILE B  94
TYR B 100
THR B 113
MTX B 361
1DLS_A_MTXA188 1dls MTX

DB00563
(Methotrexate)
Homo sapiens DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
16 ILE A   7
ALA A   9
TYR A  22
ARG A  28
GLU A  30
PHE A  31
GLN A  35
SER A  59
ILE A  60
PRO A  61
ASN A  64
LEU A  67
ARG A  70
VAL A 115
TYR A 121
THR A 136
MTX A 188
1DRA_A_MTXA161 1dra MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
13 ILE A   5
ALA A   7
GLU A  27
LEU A  28
LYS A  32
SER A  49
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
MTX A 161
1DRA_B_MTXB361 1dra MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
no annotation 12 ILE B   5
ALA B   7
GLU B  27
LEU B  28
LYS B  32
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
ARG B  57
ILE B  94
TYR B 100
THR B 113
MTX B 361
1DRB_A_MTXA161 1drb MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
12 ILE A   5
ALA A   7
LEU A  28
LYS A  32
SER A  49
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
MTX A 161
1DRB_B_MTXB361 1drb MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
no annotation 12 ILE B   5
ALA B   7
LEU B  28
PHE B  31
LYS B  32
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
ARG B  57
ILE B  94
TYR B 100
THR B 113
MTX B 361
1DRE_A_MTXA161 1dre MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
14 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
PHE A  31
LYS A  32
SER A  49
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
MTX A 161
1E7W_A_MTXA301 1e7w MTX

DB00563
(Methotrexate)
Leishmania
major
PTERIDINE REDUCTASE PF00106
(adh_short)
PF13561
(adh_short_C2)
12 ARG A  17
SER A 111
PHE A 113
PRO A 115
ASP A 181
LEU A 188
TYR A 191
TYR A 194
LEU A 226
LEU A 229
ASP A 232
MET A 233
MTX A 301
1E7W_B_MTXB301 1e7w MTX

DB00563
(Methotrexate)
Leishmania
major
PTERIDINE REDUCTASE no annotation 11 ARG B  17
SER B 111
PHE B 113
PRO B 115
ASP B 181
LEU B 188
TYR B 191
TYR B 194
LEU B 226
TRP B 238
HIS B 241
MTX B 301
1MXF_A_MTXA1278 1mxf MTX

DB00563
(Methotrexate)
Trypanosoma
cruzi
PTERIDINE REDUCTASE
2
PF13561
(adh_short_C2)
10 ARG A  22
SER A 103
TYR A 105
ASP A 169
LEU A 176
TYR A 182
LEU A 214
PRO A 218
THR A 225
TYR A 229
MTX A1278
1MXF_B_MTXB2278 1mxf MTX

DB00563
(Methotrexate)
Trypanosoma
cruzi
PTERIDINE REDUCTASE
2
no annotation 11 ARG B  22
SER B 103
TYR B 105
ASP B 169
LEU B 176
PHE B 179
TYR B 182
LEU B 214
PRO B 218
THR B 225
TYR B 229
MTX B2278
1MXF_C_MTXC3278 1mxf MTX

DB00563
(Methotrexate)
Trypanosoma
cruzi
PTERIDINE REDUCTASE
2
no annotation 11 ARG C  22
SER C 103
TYR C 105
ASP C 169
LEU C 176
PHE C 179
TYR C 182
LEU C 214
PRO C 218
THR C 225
TYR C 229
MTX C3278
1MXF_D_MTXD4278 1mxf MTX

DB00563
(Methotrexate)
Trypanosoma
cruzi
PTERIDINE REDUCTASE
2
no annotation 11 ARG D  22
SER D 103
TYR D 105
ASP D 169
LEU D 176
PHE D 179
TYR D 182
LEU D 214
PRO D 218
THR D 225
TYR D 229
MTX D4278
1P33_A_MTXA351 1p33 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Leishmania
tarentolae
PTERIDINE REDUCTASE
1
PF13561
(adh_short_C2)
13 ARG A  17
SER A 111
PHE A 113
PRO A 115
ASP A 181
LEU A 188
TYR A 191
TYR A 194
LEU A 226
LEU A 229
PRO A 230
MET A 233
TYR A 241
MTX A 351
1P33_B_MTXB352 1p33 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Leishmania
tarentolae
PTERIDINE REDUCTASE
1
no annotation 13 ARG B  17
SER B 111
PHE B 113
PRO B 115
ASP B 181
LEU B 188
TYR B 191
TYR B 194
LEU B 226
LEU B 229
PRO B 230
MET B 233
TYR B 241
MTX B 352
1P33_C_MTXC353 1p33 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Leishmania
tarentolae
PTERIDINE REDUCTASE
1
no annotation 13 ARG C  17
SER C 111
PHE C 113
PRO C 115
ASP C 181
LEU C 188
TYR C 191
TYR C 194
LEU C 226
LEU C 229
PRO C 230
MET C 233
TYR C 241
MTX C 353
1P33_D_MTXD354 1p33 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Leishmania
tarentolae
PTERIDINE REDUCTASE
1
no annotation 12 ARG D  17
SER D 111
PHE D 113
PRO D 115
ASP D 181
LEU D 188
TYR D 191
TYR D 194
LEU D 229
PRO D 230
MET D 233
TYR D 241
MTX D 354
1RA3_A_MTXA161 1ra3 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
12 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
LYS A  32
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
MTX A 161
1RB3_A_MTXA161 1rb3 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
10 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
LYS A  32
ILE A  50
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
MTX A 161
1RB3_B_MTXB161 1rb3 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
no annotation 13 ILE B   5
ALA B   7
ASP B  27
LEU B  28
TRP B  30
LYS B  32
SER B  49
ILE B  50
LEU B  54
ARG B  57
ILE B  94
TYR B 100
THR B 113
MTX B 161
1RG7_A_MTXA161 1rg7 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
15 ILE A   5
ALA A   7
ALA A  19
ASN A  23
ASP A  27
LEU A  28
LYS A  32
THR A  46
SER A  49
ILE A  50
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
MTX A 161
1RH3_A_MTXA161 1rh3 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
13 ILE A   5
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
PHE A  31
LYS A  32
SER A  49
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
MTX A 161
1RX3_A_MTXA161 1rx3 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
15 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
PHE A  31
LYS A  32
SER A  49
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
MTX A 161
1TDR_A_MTXA170 1tdr MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
TELLUROMETHIONYL
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
15 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
SER A  49
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
MTX A 170
1TDR_B_MTXB170 1tdr MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
TELLUROMETHIONYL
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
no annotation 10 ALA B   7
ASP B  27
LEU B  28
LYS B  32
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
ARG B  57
TYR B 100
THR B 113
MTX B 170
1U70_A_MTXA187 1u70 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Mus musculus DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
16 ILE A   7
ALA A   9
ARG A  22
GLU A  30
PHE A  31
GLN A  35
SER A  59
ILE A  60
PRO A  61
ASN A  64
LEU A  67
LYS A  68
ARG A  70
VAL A 115
TYR A 121
THR A 136
MTX A 187
1U72_A_MTXA188 1u72 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Homo sapiens DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
14 ALA A   9
LEU A  22
GLU A  30
PHE A  31
GLN A  35
SER A  59
ILE A  60
PRO A  61
ASN A  64
LEU A  67
ARG A  70
VAL A 115
TYR A 121
THR A 136
MTX A 188
2C7V_A_MTXA1272 2c7v MTX

DB00563
(Methotrexate)
Trypanosoma
brucei
PTERIDINE REDUCTASE PF13561
(adh_short_C2)
9 ARG A  14
SER A  95
PHE A  97
PRO A  99
PHE A 171
TYR A 174
PRO A 210
MET A 213
TRP A 221
MTX A1272
2C7V_B_MTXB1272 2c7v MTX

DB00563
(Methotrexate)
Trypanosoma
brucei
PTERIDINE REDUCTASE no annotation 12 ARG B  14
SER B  95
PHE B  97
PRO B  99
ASP B 161
PHE B 171
TYR B 174
LEU B 209
PRO B 210
MET B 213
GLU B 217
TRP B 221
MTX B1272
2C7V_C_MTXC1272 2c7v MTX

DB00563
(Methotrexate)
Trypanosoma
brucei
PTERIDINE REDUCTASE no annotation 12 ARG C  14
SER C  95
PHE C  97
PRO C  99
ASP C 161
PHE C 171
TYR C 174
LEU C 209
PRO C 210
MET C 213
GLU C 217
TRP C 221
MTX C1272
2C7V_D_MTXD1272 2c7v MTX

DB00563
(Methotrexate)
Trypanosoma
brucei
PTERIDINE REDUCTASE no annotation 10 ARG D  14
SER D  95
PHE D  97
PRO D  99
ASP D 161
PHE D 171
TYR D 174
PRO D 210
MET D 213
TRP D 221
MTX D1272
2DRC_A_MTXA161 2drc MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
13 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
LYS A  32
SER A  49
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
MTX A 161
2DRC_B_MTXB161 2drc MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
no annotation 12 ILE B   5
ALA B   7
ASP B  27
LEU B  28
LYS B  32
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
ARG B  57
ILE B  94
TYR B 100
THR B 113
MTX B 161
2OIP_A_MTXA605 2oip MTX

DB00563
(Methotrexate)
Cryptosporidium
hominis
CHAIN A, CRYSTAL
STRUCTURE OF DHFR
PF00186
(DHFR_1)
PF00303
(Thymidylat_synt)
14 VAL A   9
ALA A  11
LEU A  25
ASP A  32
LEU A  33
LYS A  34
PHE A  36
SER A  37
THR A  58
ILE A  62
LEU A  67
ARG A  70
TYR A 119
THR A 134
MTX A 605
2OIP_B_MTXB609 2oip MTX

DB00563
(Methotrexate)
Cryptosporidium
hominis
CHAIN A, CRYSTAL
STRUCTURE OF DHFR
no annotation 14 VAL B   9
ALA B  11
LEU B  25
ASP B  32
LEU B  33
LYS B  34
PHE B  36
SER B  37
THR B  58
ILE B  62
LEU B  67
ARG B  70
TYR B 119
THR B 134
MTX B 609
2OIP_C_MTXC613 2oip MTX

DB00563
(Methotrexate)
Cryptosporidium
hominis
CHAIN A, CRYSTAL
STRUCTURE OF DHFR
no annotation 12 VAL C   9
ALA C  11
LEU C  25
ASP C  32
LEU C  33
PHE C  36
SER C  37
THR C  58
LEU C  67
ARG C  70
TYR C 119
THR C 134
MTX C 613
2OIP_D_MTXD617 2oip MTX

DB00563
(Methotrexate)
Cryptosporidium
hominis
CHAIN A, CRYSTAL
STRUCTURE OF DHFR
no annotation 14 VAL D   9
ALA D  11
LEU D  25
ASP D  32
LEU D  33
PHE D  36
SER D  37
THR D  58
ILE D  62
LEU D  67
ARG D  70
CYS D 113
TYR D 119
THR D 134
MTX D 617
2OIP_E_MTXE621 2oip MTX

DB00563
(Methotrexate)
Cryptosporidium
hominis
CHAIN A, CRYSTAL
STRUCTURE OF DHFR
no annotation 14 VAL E   9
ALA E  11
LEU E  25
ASP E  32
LEU E  33
LYS E  34
PHE E  36
SER E  37
THR E  58
ILE E  62
LEU E  67
ARG E  70
TYR E 119
THR E 134
MTX E 621
2QK8_A_MTXA200 2qk8 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Bacillus
anthracis
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
16 MET A   6
ALA A   8
LEU A  21
GLU A  28
LEU A  29
VAL A  32
LYS A  33
ASN A  47
ILE A  51
ARG A  53
LEU A  55
PRO A  56
ARG A  58
PHE A  96
TYR A 102
THR A 115
MTX A 200
3CD2_A_MTXA307 3cd2 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Pneumocystis
carinii
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
13 ILE A  10
LEU A  25
GLU A  32
ILE A  33
SER A  34
LYS A  37
PRO A  66
PHE A  69
LEU A  72
ARG A  75
ILE A 123
TYR A 129
THR A 144
MTX A 307
3CL9_A_MTXA602 3cl9 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Trypanosoma
cruzi
BIFUNCTIONAL
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE-THYMIDYLAT
E SYNTHASE (DHFR-TS)
PF00186
(DHFR_1)
PF00303
(Thymidylat_synt)
16 VAL A  26
ALA A  28
ILE A  41
ASP A  48
MET A  49
ARG A  53
THR A  80
SER A  83
ILE A  84
PRO A  85
PHE A  88
LEU A  91
PRO A  92
ARG A  94
TYR A 160
THR A 178
MTX A 602
3DAT_A_MTXA201 3dat MTX

DB00563
(Methotrexate)
Bacillus
anthracis
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
16 MET A   6
ALA A   8
LEU A  21
GLU A  28
LEU A  29
GLN A  30
VAL A  32
LYS A  33
ASN A  47
ILE A  51
ARG A  53
LEU A  55
ARG A  58
PHE A  96
TYR A 102
THR A 115
MTX A 201
3DAU_A_MTXA201 3dau MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
15 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
ALA A  29
LYS A  32
SER A  49
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
MTX A 201
3DFR_A_MTXA164 3dfr MTX

DB00563
(Methotrexate)
Lactobacillus
casei
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
14 LEU A   4
TRP A   5
ALA A   6
LEU A  19
ASP A  26
LEU A  27
HIS A  28
ARG A  31
SER A  48
PRO A  50
LEU A  54
ARG A  57
ALA A  97
THR A 116
MTX A 164
3DRC_A_MTXA161 3drc MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
13 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
LYS A  32
SER A  49
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
MTX A 161
3DRC_B_MTXB361 3drc MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
no annotation 12 ILE B   5
ALA B   7
ASP B  27
LEU B  28
LYS B  32
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
ARG B  57
ILE B  94
TYR B 100
THR B 113
MTX B 361
3EIG_A_MTXA200 3eig MTX

DB00563
(Methotrexate)
Homo sapiens DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
17 ILE A   7
ALA A   9
ASP A  21
LEU A  22
GLU A  30
ARG A  31
ARG A  32
GLU A  35
SER A  59
ILE A  60
PRO A  61
ASN A  64
LEU A  67
ARG A  70
VAL A 115
TYR A 121
THR A 136
MTX A 200
3HJ3_A_MTXA605 3hj3 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Cryptosporidium
hominis
CHAIN A, CRYSTAL
STRUCTURE OF DHFR
PF00186
(DHFR_1)
PF00303
(Thymidylat_synt)
13 VAL A   9
ALA A  11
LEU A  25
ASP A  32
LEU A  33
PHE A  36
SER A  37
THR A  58
ILE A  62
LEU A  67
ARG A  70
TYR A 119
THR A 134
MTX A 605
3HJ3_B_MTXB609 3hj3 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Cryptosporidium
hominis
CHAIN A, CRYSTAL
STRUCTURE OF DHFR
no annotation 14 VAL B   9
ALA B  11
LEU B  25
ASP B  32
LEU B  33
LYS B  34
PHE B  36
SER B  37
THR B  58
ILE B  62
LEU B  67
ARG B  70
TYR B 119
THR B 134
MTX B 609
3HJ3_C_MTXC613 3hj3 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Cryptosporidium
hominis
CHAIN A, CRYSTAL
STRUCTURE OF DHFR
no annotation 12 VAL C   9
ALA C  11
LEU C  25
ASP C  32
LEU C  33
PHE C  36
SER C  37
THR C  58
LEU C  67
ARG C  70
TYR C 119
THR C 134
MTX C 613
3HJ3_D_MTXD615 3hj3 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Cryptosporidium
hominis
CHAIN A, CRYSTAL
STRUCTURE OF DHFR
no annotation 14 VAL D   9
ALA D  11
LEU D  25
ASP D  32
LEU D  33
PHE D  36
SER D  37
THR D  58
ILE D  62
LEU D  67
ARG D  70
CYS D 113
TYR D 119
THR D 134
MTX D 615
3IA4_A_MTXA164 3ia4 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Moritella
profunda
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
16 ILE A   6
ALA A   8
MET A  21
GLU A  28
LEU A  29
GLN A  30
PHE A  32
LYS A  33
SER A  50
ILE A  51
ARG A  53
LEU A  55
ARG A  58
ILE A  96
TYR A 102
THR A 115
MTX A 164
3IA4_B_MTXB164 3ia4 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Moritella
profunda
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
no annotation 16 ILE B   6
ALA B   8
MET B  21
GLU B  28
LEU B  29
GLN B  30
PHE B  32
LYS B  33
SER B  50
ILE B  51
ARG B  53
LEU B  55
ARG B  58
ILE B  96
TYR B 102
THR B 115
MTX B 164
3IA4_C_MTXC164 3ia4 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Moritella
profunda
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
no annotation 16 ILE C   6
ALA C   8
MET C  21
GLU C  28
LEU C  29
GLN C  30
PHE C  32
LYS C  33
SER C  50
ILE C  51
ARG C  53
LEU C  55
ARG C  58
ILE C  96
TYR C 102
THR C 115
MTX C 164
3IA4_D_MTXD164 3ia4 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Moritella
profunda
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
no annotation 15 ILE D   6
ALA D   8
MET D  21
GLU D  28
LEU D  29
PHE D  32
LYS D  33
SER D  50
ILE D  51
ARG D  53
LEU D  55
ARG D  58
ILE D  96
TYR D 102
THR D 115
MTX D 164
3IX9_A_MTXA200 3ix9 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Streptococcus
pneumoniae
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
no annotation
13 ILE A   8
TRP A   9
ALA A  10
ASP B  20
LEU A  23
GLU A  30
LEU A  31
GLN A  32
LYS A  35
LEU A  58
ARG A  61
VAL A 100
THR A 119
MTX A 200
3IX9_B_MTXB200 3ix9 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Streptococcus
pneumoniae
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
no annotation
14 ILE B   8
TRP B   9
ALA B  10
ARG A  22
LEU B  23
GLU B  30
LEU B  31
GLN B  32
LYS B  35
ARG B  56
LEU B  58
ARG B  61
VAL B 100
THR B 119
MTX B 200
3QXT_A_MTXA2000 3qxt MTX

DB00563
(Methotrexate)
Lama glama ANTI-METHOTREXATE
CDR1-3 GRAFT VHH
PF07686
(V-set)
12 VAL A   4
ALA A  26
ARG A  28
SER A  30
SER A  31
ARG A  32
TRP A  34
MET A  36
ARG A  74
ASN A  79
VAL A  81
ALA A 100
MTX A2000
3QXT_B_MTXB2000 3qxt MTX

DB00563
(Methotrexate)
Lama glama ANTI-METHOTREXATE
CDR1-3 GRAFT VHH
no annotation 14 VAL B   4
LEU B   6
ALA B  26
ARG B  28
SER B  30
SER B  31
ARG B  32
TRP B  34
MET B  36
ARG B  74
ASN B  79
VAL B  81
ALA B 100
TYR B 120
MTX B2000
3QXV_A_MTXA2000 3qxv MTX

DB00563
(Methotrexate)
Lama glama ANTI-METHOTREXATE
CDR1-4 GRAFT VHH
PF07686
(V-set)
13 VAL A   4
LEU A   6
ALA A  26
SER A  30
SER A  31
TRP A  34
MET A  36
ARG A  74
ASN A  76
TYR A  79
VAL A  81
ALA A 100
TYR A 120
MTX A2000
3QXV_B_MTXB2000 3qxv MTX

DB00563
(Methotrexate)
Lama glama ANTI-METHOTREXATE
CDR1-4 GRAFT VHH
no annotation 14 VAL B   4
LEU B   6
ALA B  26
ARG B  28
SER B  30
SER B  31
TRP B  34
MET B  36
ARG B  74
ASN B  76
TYR B  79
VAL B  81
ALA B 100
TYR B 120
MTX B2000
3QXV_C_MTXC2000 3qxv MTX

DB00563
(Methotrexate)
Lama glama ANTI-METHOTREXATE
CDR1-4 GRAFT VHH
no annotation 11 VAL C   4
ALA C  26
ARG C  28
SER C  30
TRP C  34
MET C  36
ARG C  74
ASN C  76
TYR C  79
VAL C  81
ALA C 100
MTX C2000
3QXV_D_MTXD2000 3qxv MTX

DB00563
(Methotrexate)
Lama glama ANTI-METHOTREXATE
CDR1-4 GRAFT VHH
no annotation 15 VAL D   4
LEU D   6
ALA D  26
ARG D  28
SER D  30
SER D  31
ARG D  32
TRP D  34
MET D  36
ARG D  74
ASN D  76
TYR D  79
VAL D  81
ALA D 100
TYR D 120
MTX D2000
3QXV_E_MTXE2000 3qxv MTX

DB00563
(Methotrexate)
Lama glama ANTI-METHOTREXATE
CDR1-4 GRAFT VHH
no annotation 13 CYS E  24
ALA E  26
ARG E  28
SER E  30
SER E  31
TRP E  34
MET E  36
ARG E  74
ASN E  76
TYR E  79
VAL E  81
ALA E 100
TYR E 120
MTX E2000
3TQ9_A_MTXA2001 3tq9 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Coxiella
burnetii
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
12 ILE A   6
ALA A   8
LEU A  21
ASP A  28
LEU A  29
LYS A  33
SER A  50
ILE A  51
LEU A  55
ARG A  58
ILE A  96
THR A 115
MTX A2001
4DFR_A_MTXA161 4dfr MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
14 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
LYS A  32
THR A  46
SER A  49
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
MTX A 161
4DFR_B_MTXB162 4dfr MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
no annotation 12 ILE B   5
ALA B   7
ASP B  27
LEU B  28
LYS B  32
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
ARG B  57
ILE B  94
TYR B 100
THR B 113
MTX B 162
4GH8_A_MTXA201 4gh8 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
15 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  28
LEU A  29
LYS A  33
SER A  50
ILE A  51
PRO A  52
ASN A  55
LEU A  58
ARG A  61
ILE A  98
TYR A 104
THR A 117
MTX A 201
4GH8_B_MTXB201 4gh8 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
no annotation 14 ILE B   5
ALA B   7
MET B  20
ASP B  28
LEU B  29
LYS B  33
SER B  50
ILE B  51
PRO B  52
ASN B  55
ARG B  61
ILE B  98
TYR B 104
THR B 117
MTX B 201
4KN0_A_MTXA301 4kn0 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Homo sapiens FOLATE RECEPTOR BETA PF03024
(Folate_rec)
13 TYR A  76
PHE A  78
ASP A  97
TYR A 101
GLN A 116
TRP A 118
ARG A 119
ARG A 152
GLY A 153
TRP A 154
TRP A 156
TRP A 187
SER A 190
MTX A 301
4KY8_A_MTXA603 4ky8 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Cryptosporidium
hominis
BIFUNCTIONAL
THYMIDYLATE
SYNTHASE-DIHYDROFOLA
TE REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
PF00303
(Thymidylat_synt)
12 VAL A   9
ALA A  11
LEU A  25
ASP A  32
LEU A  33
LYS A  34
SER A  37
SER A  61
ILE A  62
LEU A  67
ARG A  70
THR A 134
MTX A 603
4KY8_B_MTXB603 4ky8 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Cryptosporidium
hominis
BIFUNCTIONAL
THYMIDYLATE
SYNTHASE-DIHYDROFOLA
TE REDUCTASE
no annotation 12 VAL B   9
ALA B  11
LEU B  25
ASP B  32
LEU B  33
LYS B  34
SER B  37
SER B  61
ILE B  62
LEU B  67
ARG B  70
THR B 134
MTX B 603
4KY8_C_MTXC603 4ky8 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Cryptosporidium
hominis
BIFUNCTIONAL
THYMIDYLATE
SYNTHASE-DIHYDROFOLA
TE REDUCTASE
no annotation 12 VAL C   9
ALA C  11
LEU C  25
ASP C  32
LEU C  33
LYS C  34
SER C  37
SER C  61
ILE C  62
LEU C  67
ARG C  70
THR C 134
MTX C 603
4KY8_D_MTXD603 4ky8 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Cryptosporidium
hominis
BIFUNCTIONAL
THYMIDYLATE
SYNTHASE-DIHYDROFOLA
TE REDUCTASE
no annotation 12 VAL D   9
ALA D  11
LEU D  25
ASP D  32
LEU D  33
LYS D  34
SER D  37
SER D  61
ILE D  62
LEU D  67
ARG D  70
THR D 134
MTX D 603
4KY8_E_MTXE603 4ky8 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Cryptosporidium
hominis
BIFUNCTIONAL
THYMIDYLATE
SYNTHASE-DIHYDROFOLA
TE REDUCTASE
no annotation 12 VAL E   9
ALA E  11
LEU E  25
ASP E  32
LEU E  33
LYS E  34
SER E  37
SER E  61
ILE E  62
LEU E  67
ARG E  70
THR E 134
MTX E 603
4L6H_A_MTXA803 4l6h MTX

DB00563
(Methotrexate)
Candida
albicans
5-METHYLTETRAHYDROPT
EROYLTRIGLUTAMATE--H
OMOCYSTEINE
METHYLTRANSFERASE
PF01717
(Meth_synt_2)
PF08267
(Meth_synt_1)
10 LYS A  19
ASP A 504
TRP A 523
SER A 526
TYR A 527
ARG A 530
TYR A 531
VAL A 532
PRO A 535
TRP A 576
MTX A 803
4L8F_B_MTXB301 4l8f MTX

DB00563
(Methotrexate)
Danio rerio GAMMA-GLUTAMYL
HYDROLASE
no annotation 11 PHE B  20
GLY B  71
GLY B  72
GLY B  73
ALA B 108
LEU B 109
GLU B 112
HIS B 169
GLN B 170
TRP B 171
HIS B 218
MTX B 301
4L8F_D_MTXD301 4l8f MTX

DB00563
(Methotrexate)
Danio rerio GAMMA-GLUTAMYL
HYDROLASE
no annotation 11 PHE D  20
GLY D  71
GLY D  72
GLY D  73
ALA D 108
LEU D 109
GLU D 112
HIS D 169
GLN D 170
TRP D 171
HIS D 218
MTX D 301
4L8W_G_MTXG301 4l8w MTX

DB00563
(Methotrexate)
Danio rerio GAMMA-GLUTAMYL
HYDROLASE
no annotation 9 PHE G  20
GLY G  71
GLY G  73
CYS G 108
LEU G 109
GLU G 112
HIS G 169
GLN G 170
TRP G 171
MTX G 301
4L8W_I_MTXI301 4l8w MTX

DB00563
(Methotrexate)
Danio rerio GAMMA-GLUTAMYL
HYDROLASE
no annotation 9 PHE I  20
GLY I  71
GLY I  73
CYS I 108
LEU I 109
GLU I 112
HIS I 169
GLN I 170
TRP I 171
MTX I 301
4P66_A_MTXA201 4p66 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
11 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
LYS A  32
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
MTX A 201
4P68_A_MTXA201 4p68 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Escherichia
coli
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
11 ILE A   5
MET A  20
ASP A  27
PHE A  31
LYS A  32
SER A  49
ILE A  50
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
MTX A 201
4Q0D_A_MTXA604 4q0d MTX

DB00563
(Methotrexate)
Cryptosporidium
hominis
BIFUNCTIONAL
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE-THYMIDYLAT
E SYNTHASE
PF00186
(DHFR_1)
PF00303
(Thymidylat_synt)
12 VAL A   9
ALA A  11
LEU A  25
ASP A  32
LEU A  33
LYS A  34
SER A  37
ILE A  62
LEU A  67
ARG A  70
TYR A 119
THR A 134
MTX A 604
4Q0D_B_MTXB604 4q0d MTX

DB00563
(Methotrexate)
Cryptosporidium
hominis
BIFUNCTIONAL
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE-THYMIDYLAT
E SYNTHASE
no annotation 12 VAL B   9
ALA B  11
LEU B  25
ASP B  32
LEU B  33
LYS B  34
SER B  37
ILE B  62
LEU B  67
ARG B  70
TYR B 119
THR B 134
MTX B 604
4Q0D_C_MTXC604 4q0d MTX

DB00563
(Methotrexate)
Cryptosporidium
hominis
BIFUNCTIONAL
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE-THYMIDYLAT
E SYNTHASE
no annotation 14 VAL C   9
ALA C  11
LEU C  25
ASP C  32
LEU C  33
LYS C  34
SER C  37
SER C  61
ILE C  62
LEU C  67
ARG C  70
CYS C 113
TYR C 119
THR C 134
MTX C 604
4Q0D_D_MTXD604 4q0d MTX

DB00563
(Methotrexate)
Cryptosporidium
hominis
BIFUNCTIONAL
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE-THYMIDYLAT
E SYNTHASE
no annotation 14 VAL D   9
ALA D  11
LEU D  25
ASP D  32
LEU D  33
LYS D  34
SER D  37
SER D  61
ILE D  62
LEU D  67
ARG D  70
CYS D 113
TYR D 119
THR D 134
MTX D 604
4Q0D_E_MTXE604 4q0d MTX

DB00563
(Methotrexate)
Cryptosporidium
hominis
BIFUNCTIONAL
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE-THYMIDYLAT
E SYNTHASE
no annotation 12 VAL E   9
ALA E  11
LEU E  25
ASP E  32
LEU E  33
LYS E  34
SER E  37
ILE E  62
LEU E  67
ARG E  70
TYR E 119
THR E 134
MTX E 604
4QI9_A_MTXA201 4qi9 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Yersinia pestis DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
12 ILE A   6
ALA A   8
ASP A  28
LEU A  29
LYS A  33
SER A  50
ILE A  51
ARG A  53
LEU A  55
ARG A  58
TYR A 101
THR A 114
MTX A 201
4QI9_B_MTXB201 4qi9 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Yersinia pestis DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
no annotation 12 ILE B   6
ALA B   8
ASP B  28
LEU B  29
LYS B  33
SER B  50
ILE B  51
ARG B  53
LEU B  55
ARG B  58
TYR B 101
THR B 114
MTX B 201
4QI9_C_MTXC201 4qi9 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Yersinia pestis DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
no annotation 11 ILE C   6
ALA C   8
ASP C  28
LYS C  33
SER C  50
ILE C  51
ARG C  53
LEU C  55
ARG C  58
TYR C 101
THR C 114
MTX C 201
5HI6_A_MTXA201 5hi6 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Yersinia pestis DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
12 ILE A   6
ALA A   8
ASP A  28
LEU A  29
LYS A  33
SER A  50
ILE A  51
ARG A  53
LEU A  55
ARG A  58
TYR A 101
THR A 114
MTX A 201
5HI6_B_MTXB201 5hi6 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Yersinia pestis DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
no annotation 12 ILE B   6
ALA B   8
ASP B  28
LEU B  29
LYS B  33
SER B  50
ILE B  51
ARG B  53
LEU B  55
ARG B  58
TYR B 101
THR B 114
MTX B 201
5J7W_C_MTXC402 5j7w MTX

DB00563
(Methotrexate)
Enterococcus
faecalis
THYMIDYLATE SYNTHASE no annotation 13 LEU C  55
GLU C  59
ILE C  80
TRP C  81
TRP C  84
LEU C 194
ASP C 220
LEU C 223
GLY C 224
PHE C 227
TYR C 260
ILE C 313
ALA C 314
MTX C 402
5J7W_D_MTXD402 5j7w MTX

DB00563
(Methotrexate)
Enterococcus
faecalis
THYMIDYLATE SYNTHASE no annotation 13 LEU D  55
GLU D  59
ILE D  80
TRP D  81
TRP D  84
LEU D 194
ASP D 220
LEU D 223
GLY D 224
PHE D 227
TYR D 260
ILE D 313
ALA D 314
MTX D 402
5X66_A_MTXA402 5x66 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Homo sapiens THYMIDYLATE SYNTHASE PF00303
(Thymidylat_synt)
no annotation
12 ARG A  78
PHE A  80
ILE A 108
ASP B 119
ASP A 218
LEU A 221
GLY A 222
PHE A 225
ASN A 226
TYR A 258
MET A 311
ALA A 312
MTX A 402
5X66_B_MTXB402 5x66 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Homo sapiens THYMIDYLATE SYNTHASE no annotation 11 PHE B  80
ILE B 108
ASP B 218
LEU B 221
GLY B 222
PHE B 225
ASN B 226
TYR B 258
THR B 306
MET B 311
ALA B 312
MTX B 402
5X66_C_MTXC402 5x66 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Homo sapiens THYMIDYLATE SYNTHASE no annotation 9 ILE C 108
ASP C 218
LEU C 221
GLY C 222
PHE C 225
ASN C 226
TYR C 258
MET C 311
ALA C 312
MTX C 402
5X66_D_MTXD402 5x66 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Homo sapiens THYMIDYLATE SYNTHASE no annotation 10 ARG D  78
PHE D  80
ILE D 108
ASP D 218
GLY D 222
PHE D 225
ASN D 226
TYR D 258
MET D 311
ALA D 312
MTX D 402
5X66_E_MTXE402 5x66 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Homo sapiens THYMIDYLATE SYNTHASE no annotation 11 PHE E  80
LYS E 107
ILE E 108
ASP E 218
LEU E 221
GLY E 222
PHE E 225
ASN E 226
TYR E 258
MET E 311
ALA E 312
MTX E 402
5X66_F_MTXF402 5x66 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Homo sapiens THYMIDYLATE SYNTHASE no annotation 12 LYS F  77
PHE F  80
ILE F 108
ASP F 218
LEU F 221
GLY F 222
PHE F 225
TYR F 258
THR F 306
MET F 311
ALA F 312
VAL F 313
MTX F 402
6DEB_B_MTXB302 6deb MTX

DB00563
(Methotrexate)
Campylobacter
jejuni
BIFUNCTIONAL PROTEIN
FOLD
no annotation 13 LEU B  93
GLN B  95
LEU B  96
PRO B  97
LYS B 104
ASP B 118
PHE B 120
THR B 140
SER B 166
ILE B 168
VAL B 169
VAL B 228
THR B 265
MTX B 302
6DEB_B_MTXB303 6deb MTX

DB00563
(Methotrexate)
Campylobacter
jejuni
BIFUNCTIONAL PROTEIN
FOLD
no annotation 5 TYR B  47
LYS B  51
GLN B  95
GLY B 209
ILE B 230
MTX B 303