DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'AB1'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1MUI_B_AB1B100 1mui AB1

DB01601
(Lopinavir)
Human
immunodeficienc
y virus 1
PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
23 ARG B   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
AB1 B 100
1RV7_B_AB1B1001 1rv7 AB1

DB01601
(Lopinavir)
Human
immunodeficienc
y virus 1
PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
11 LEU B  23
ASN A  25
ALA A  28
ILE A  50
THR A  80
THR B  80
PRO A  81
PRO B  81
ALA B  82
VAL A  84
VAL B  84
AB1 B1001
2O4S_A_AB1A400 2o4s AB1

DB01601
(Lopinavir)
Human
immunodeficienc
y virus 1
PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
27 ARG B   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL A  32
VAL B  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  48
GLY B  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
AB1 A 400
2Q5K_A_AB1A201 2q5k AB1

DB01601
(Lopinavir)
Human
immunodeficienc
y virus 1
PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
21 ARG B   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
ILE B  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
AB1 A 201
2QHC_B_AB1B9001 2qhc AB1

DB01601
(Lopinavir)
Human
immunodeficienc
y virus 1
PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation
23 ARG B   8
ARG A   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
AB1 B9001
2RKF_A_AB1A501 2rkf AB1

DB01601
(Lopinavir)
Human
immunodeficienc
y virus 1
PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation
25 ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
ILE B  32
ILE A  32
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
ALA B  82
ALA A  82
ILE A  84
ILE B  84
AB1 A 501
2RKG_B_AB1B501 2rkg AB1

DB01601
(Lopinavir)
Human
immunodeficienc
y virus 1
PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation
24 LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
ILE B  32
ILE A  32
VAL A  48
VAL B  48
GLY A  50
GLY B  50
ILE B  51
ILE A  51
PRO B  82
PRO A  82
ILE A  85
ILE B  85
AB1 B 501
2Z54_A_AB1A200 2z54 AB1

DB01601
(Lopinavir)
Human
immunodeficienc
y virus 1
HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
24 ARG B   8
ARG A   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
AB1 A 200
3OGQ_A_AB1A200 3ogq AB1

DB01601
(Lopinavir)
Feline
immunodeficienc
y virus
FIV PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
23 ARG B  13
LEU A  28
LEU B  28
ASP B  30
ASP A  30
GLY B  32
ALA B  33
ALA A  33
ASP B  34
ASP A  34
ILE B  35
ILE A  35
VAL A  37
MET A  56
MET B  56
GLY A  58
GLY B  58
ILE B  59
ILE A  59
SER B  98
VAL B  99
LEU A 101
LEU B 101
AB1 A 200
4L1A_A_AB1A101 4l1a AB1

DB01601
(Lopinavir)
Human
immunodeficienc
y virus 1
MDR769 HIV-1
PROTEASE
PF00077
(RVP)
17 ARG B   8
ARG A   8
ASN A  25
ASN B  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP A  30
GLY B  48
ILE A  50
THR A  80
PRO A  81
PRO B  81
THR A  82
THR B  82
VAL A  84
AB1 A 101
6DJ1_B_AB1B201 6dj1 AB1

DB01601
(Lopinavir)
Human
immunodeficienc
y virus 1
HIV-1 PROTEASE None
PF00077
(RVP)
27 ARG B   8
ARG A   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL A  32
VAL B  32
ILE B  47
GLY A  48
GLY B  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
AB1 B 201
6DJ2_B_AB1B201 6dj2 AB1

DB01601
(Lopinavir)
Human
immunodeficienc
y virus 1
HIV-1 PROTEASE None
PF00077
(RVP)
22 ARG B   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE B  47
ILE A  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
AB1 B 201