DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'Vibrio cholerae'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1VHW_A_ADNA252 1vhw ADN

DB00640
(Adenosine) 		Vibrio cholerae PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE 		PF01048
(PNP_UDP_1)
no annotation 		11 HIS D   5
ARG D  44
MET A  65
ARG A  88
SER A  91
GLY A  93
VAL A 179
GLU A 180
MET A 181
GLU A 182
ILE A 207
 ADN A 252
1VHW_B_ADNB252 1vhw ADN

DB00640
(Adenosine) 		Vibrio cholerae PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE 		no annotation 9 HIS F   5
ARG F  44
MET B  65
ARG B  88
SER B  91
GLY B  93
VAL B 179
MET B 181
GLU B 182
 ADN B 252
1VHW_C_ADNC252 1vhw ADN

DB00640
(Adenosine) 		Vibrio cholerae PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE 		no annotation 11 HIS E   5
ARG E  44
MET C  65
ARG C  88
SER C  91
GLY C  93
VAL C 179
GLU C 180
MET C 181
GLU C 182
ILE C 207
 ADN C 252
1VHW_D_ADND252 1vhw ADN

DB00640
(Adenosine) 		Vibrio cholerae PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE 		PF01048
(PNP_UDP_1)
no annotation 		11 HIS A   5
ARG A  44
MET D  65
ARG D  88
SER D  91
GLY D  93
VAL D 179
GLU D 180
MET D 181
GLU D 182
ILE D 207
 ADN D 252
1VHW_E_ADNE252 1vhw ADN

DB00640
(Adenosine) 		Vibrio cholerae PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE 		no annotation 11 HIS C   5
ARG C  44
MET E  65
ARG E  88
SER E  91
GLY E  93
VAL E 179
GLU E 180
MET E 181
GLU E 182
ILE E 207
 ADN E 252
1VHW_F_ADNF252 1vhw ADN

DB00640
(Adenosine) 		Vibrio cholerae PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE 		no annotation 10 HIS B   5
ARG B  44
MET F  65
ARG F  88
SER F  91
GLY F  93
VAL F 179
GLU F 180
MET F 181
GLU F 182
 ADN F 252
3LUS_B_X8ZB1001 3lus X8Z

DB01197
(Captopril) 		Vibrio cholerae ORGANIC
HYDROPEROXIDE
RESISTANCE PROTEIN 		PF02566
(OsmC)
no annotation 		9 TYR B  37
PRO B  38
PRO B  50
GLU B  51
CYS A  61
ASN A  64
ALA A  65
PHE B  96
PRO A 125
 X8Z B1001
3TGV_B_BEZB1 3tgv BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Vibrio cholerae HEME-BINDING PROTEIN
HUTZ 		None 6 ARG B  22
GLN B  48
TYR B  53
PHE B  95
PRO B 140
LEU B 144
 BEZ B   1
3TGV_B_BEZB160 3tgv BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Vibrio cholerae HEME-BINDING PROTEIN
HUTZ 		None 4 LEU B  14
GLY B 150
LEU B 151
GLU B 152
 BEZ B 160
3TGV_C_BEZC1 3tgv BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Vibrio cholerae HEME-BINDING PROTEIN
HUTZ 		None 5 ARG C  22
TYR C  53
PHE C  95
PRO C 140
LEU C 144
 BEZ C   1
3TGV_D_BEZD1 3tgv BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Vibrio cholerae HEME-BINDING PROTEIN
HUTZ 		None 6 ARG D  22
GLN D  48
TYR D  53
PHE D  95
PRO D 140
LEU D 144
 BEZ D   1
4FO4_A_MOAA502 4fo4 MOA

DB01024
(Mycophenolic
acid) 		Vibrio cholerae INOSINE
5'-MONOPHOSPHATE
DEHYDROGENASE 		PF00478
(IMPDH) 		8 ASP A 250
SER A 251
SER A 252
ASN A 279
CYS A 307
THR A 309
MET A 390
GLY A 391
 MOA A 502
4FO4_B_MOAB502 4fo4 MOA

DB01024
(Mycophenolic
acid) 		Vibrio cholerae INOSINE
5'-MONOPHOSPHATE
DEHYDROGENASE 		no annotation 8 SER B 251
SER B 252
ASN B 279
GLY B 302
CYS B 307
THR B 309
MET B 390
GLY B 391
 MOA B 502
4FXS_A_MOAA702 4fxs MOA

DB01024
(Mycophenolic
acid) 		Vibrio cholerae INOSINE-5'-MONOPHOSP
HATE DEHYDROGENASE 		PF00478
(IMPDH)
PF00571
(CBS) 		9 ASP A 250
SER A 251
SER A 252
ASN A 279
ILE A 301
GLY A 302
CYS A 307
THR A 309
ASP A 340
 MOA A 702
4MI4_A_SPMA201 4mi4 SPM

DB00127
(Spermine) 		Vibrio cholerae SPERMIDINE
N1-ACETYLTRANSFERASE 		PF13302
(Acetyltransf_3) 		6 ASN A  22
GLU A  33
GLU A  34
TYR A  36
GLU A  37
GLU A  41
 SPM A 201
4MI4_B_SPMB201 4mi4 SPM

DB00127
(Spermine) 		Vibrio cholerae SPERMIDINE
N1-ACETYLTRANSFERASE 		no annotation 7 ASN B  22
GLU B  33
GLU B  34
TYR B  36
GLU B  37
GLU B  41
ARG C  56
 SPM B 201
4MI4_C_SPMC201 4mi4 SPM

DB00127
(Spermine) 		Vibrio cholerae SPERMIDINE
N1-ACETYLTRANSFERASE 		PF13302
(Acetyltransf_3)
no annotation 		7 ASN C  22
GLU C  33
GLU C  34
TYR C  36
GLU C  37
GLU C  41
TYR A  78
 SPM C 201
4MJ8_A_SPMA201 4mj8 SPM

DB00127
(Spermine) 		Vibrio cholerae SPERMIDINE
N1-ACETYLTRANSFERASE 		PF13302
(Acetyltransf_3)
no annotation 		8 ASN A  22
MET A  28
GLU A  33
GLU A  34
TYR A  36
GLU A  37
GLU A  41
TYR C  78
 SPM A 201
4MJ8_A_SPMA202 4mj8 SPM

DB00127
(Spermine) 		Vibrio cholerae SPERMIDINE
N1-ACETYLTRANSFERASE 		PF13302
(Acetyltransf_3) 		8 TRP A  31
GLU A  33
ILE A  74
GLU A  75
GLU A  84
GLN A  86
ILE A  87
LEU A 121
 SPM A 202
4MJ8_B_SPMB201 4mj8 SPM

DB00127
(Spermine) 		Vibrio cholerae SPERMIDINE
N1-ACETYLTRANSFERASE 		no annotation 8 ASN B  22
MET B  28
GLU B  33
GLU B  34
TYR B  36
GLU B  37
GLU B  41
ARG C  56
 SPM B 201
4MJ8_C_SPMC201 4mj8 SPM

DB00127
(Spermine) 		Vibrio cholerae SPERMIDINE
N1-ACETYLTRANSFERASE 		no annotation 7 ASN C  22
MET C  28
GLU C  33
GLU C  34
TYR C  36
GLU C  37
GLU C  41
 SPM C 201
4P6V_E_RBFE201 4p6v RBF

DB00140
(Riboflavin) 		Vibrio cholerae NA(+)-TRANSLOCATING
NADH-QUINONE
REDUCTASE SUBUNIT B;
NA(+)-TRANSLOCATING
NADH-QUINONE
REDUCTASE SUBUNIT E 		PF02508
(Rnf-Nqr)
PF03116
(NQR2_RnfD_RnfE) 		5 VAL E  35
LYS E  36
HIS B 398
VAL B 399
GLU B 402
 RBF E 201
4PB1_A_RBVA501 4pb1 RBV

DB00811
(Ribavirin) 		Vibrio cholerae NUPC FAMILY PROTEIN PF01773
(Nucleos_tra2_N)
PF07662
(Nucleos_tra2_C)
PF07670
(Gate) 		14 GLY A 153
GLN A 154
THR A 155
GLU A 156
ALA A 185
TYR A 192
LEU A 259
ASN A 331
GLU A 332
PHE A 333
PHE A 366
ASN A 368
SER A 371
ILE A 374
 RBV A 501
4PD5_A_GEOA501 4pd5 GEO

DB00441
(Gemcitabine) 		Vibrio cholerae NUPC FAMILY PROTEIN PF01773
(Nucleos_tra2_N)
PF07662
(Nucleos_tra2_C)
PF07670
(Gate) 		13 GLY A 153
GLN A 154
ALA A 185
VAL A 188
TYR A 192
LEU A 259
ASN A 331
GLU A 332
PHE A 333
PHE A 366
ASN A 368
SER A 371
ILE A 374
 GEO A 501
4PD9_A_ADNA501 4pd9 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Vibrio cholerae NUPC FAMILY PROTEIN PF01773
(Nucleos_tra2_N)
PF07662
(Nucleos_tra2_C)
PF07670
(Gate) 		15 GLY A 153
GLN A 154
THR A 155
GLU A 156
ALA A 185
VAL A 188
TYR A 192
LEU A 259
ASN A 331
GLU A 332
PHE A 333
PHE A 366
ASN A 368
SER A 371
ILE A 374
 ADN A 501
4R87_E_SPME202 4r87 SPM

DB00127
(Spermine) 		Vibrio cholerae SPERMIDINE
N1-ACETYLTRANSFERASE 		no annotation 5 GLU E  33
GLU E  34
TYR E  36
GLU E  37
GLU E  41
 SPM E 202
4R87_G_SPMG202 4r87 SPM

DB00127
(Spermine) 		Vibrio cholerae SPERMIDINE
N1-ACETYLTRANSFERASE 		no annotation 9 ASN G  22
MET G  28
GLU G  33
GLU G  34
TYR G  36
GLU G  37
GLU G  41
ASN E  53
ARG E  56
 SPM G 202
4R87_H_SPMH202 4r87 SPM

DB00127
(Spermine) 		Vibrio cholerae SPERMIDINE
N1-ACETYLTRANSFERASE 		no annotation 6 ASN H  22
MET H  28
GLU H  33
TYR H  36
GLU H  37
GLU H  41
 SPM H 202
4R87_I_SPMI202 4r87 SPM

DB00127
(Spermine) 		Vibrio cholerae SPERMIDINE
N1-ACETYLTRANSFERASE 		no annotation 7 ASN I  22
MET I  28
GLU I  33
GLU I  34
TYR I  36
GLU I  37
GLU I  41
 SPM I 202
4R87_J_SPMJ202 4r87 SPM

DB00127
(Spermine) 		Vibrio cholerae SPERMIDINE
N1-ACETYLTRANSFERASE 		no annotation 7 MET J  28
TRP J  31
GLU J  33
TYR J  36
GLU J  37
GLU J  41
ARG L  56
 SPM J 202
4R87_K_SPMK202 4r87 SPM

DB00127
(Spermine) 		Vibrio cholerae SPERMIDINE
N1-ACETYLTRANSFERASE 		no annotation 9 ASN K  22
MET K  28
TRP K  31
GLU K  33
GLU K  34
TYR K  36
GLU K  37
GLU K  41
ARG I  56
 SPM K 202
4U9U_A_ACTA1502 4u9u ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Vibrio cholerae NA(+)-TRANSLOCATING
NADH-QUINONE
REDUCTASE SUBUNIT F 		PF00175
(FAD_binding_6)
PF00970
(NAD_binding_1) 		5 ARG A 229
GLY A 282
ALA A 283
GLY A 379
PRO A 380
 ACT A1502
4U9U_B_ACTB1502 4u9u ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Vibrio cholerae NA(+)-TRANSLOCATING
NADH-QUINONE
REDUCTASE SUBUNIT F 		None 5 ARG B 229
GLY B 282
ALA B 283
GLY B 379
PRO B 380
 ACT B1502
6EKU_A_ZMRA901 6eku ZMR

DB00558
(Zanamivir) 		Vibrio cholerae SIALIDASE no annotation 18 ARG A 250
ILE A 251
GLU A 269
ARG A 271
ASP A 276
PRO A 277
ASP A 318
GLN A 343
ASN A 344
ASN A 571
LEU A 606
SER A 644
GLU A 645
ARG A 661
ASP A 663
PHE A 664
ARG A 738
TYR A 766
 ZMR A 901
6N91_A_DCFA401 6n91 DCF

DB00552
(Pentostatin) 		Vibrio cholerae ADENOSINE DEAMINASE PF00962
(A_deaminase) 		16 HIS A  12
HIS A  14
ASP A  16
LEU A  56
LEU A  60
LEU A  63
TYR A 103
ILE A 139
SER A 141
ALA A 169
GLY A 170
HIS A 197
GLU A 200
HIS A 221
ASP A 278
ASP A 279
 DCF A 401
6N91_B_DCFB401 6n91 DCF

DB00552
(Pentostatin) 		Vibrio cholerae ADENOSINE DEAMINASE None 16 HIS B  12
HIS B  14
ASP B  16
LEU B  56
LEU B  60
LEU B  63
TYR B 103
ILE B 139
SER B 141
ALA B 169
GLY B 170
HIS B 197
GLU B 200
HIS B 221
ASP B 278
ASP B 279
 DCF B 401