DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'Thermus thermophilus'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1FJG_A_SRYA1634 1fjg SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RIBOSOMAL RNA;
30S RIBOSOMAL
PROTEIN S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		4 LYS L  46
LYS L  47
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1634
1JZS_A_MRCA1301 1jzs MRC

DB00410
(Mupirocin) 		Thermus
thermophilus 		ISOLEUCYL-TRNA
SYNTHETASE 		PF00133
(tRNA-synt_1)
PF08264
(Anticodon_1) 		11 GLY A  45
PRO A  46
HIS A  54
HIS A  57
SER A 521
GLU A 550
GLY A 551
ASP A 553
GLN A 554
LEU A 583
ILE A 584
 MRC A1301
1KIJ_A_NOVA400 1kij NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Thermus
thermophilus 		DNA GYRASE SUBUNIT B PF00204
(DNA_gyraseB)
PF02518
(HATPase_c)
no annotation 		16 ILE B  10
ASN A  45
ASP A  48
GLU A  49
ASP A  72
ARG A  75
ILE A  77
PRO A  78
ASP A  80
ILE A  93
LYS A 102
PHE A 103
LYS A 109
VAL A 117
ARG A 135
THR A 166
 NOV A 400
1KIJ_B_NOVB444 1kij NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Thermus
thermophilus 		DNA GYRASE SUBUNIT B PF00204
(DNA_gyraseB)
PF02518
(HATPase_c)
no annotation 		16 ILE A  10
ASN B  45
ASP B  48
GLU B  49
ASP B  72
ARG B  75
ILE B  77
PRO B  78
ASP B  80
ILE B  93
TYR B  94
PHE B 103
VAL B 117
ALA B 119
ARG B 135
THR B 166
 NOV B 444
1ODI_A_ADNA1237 1odi ADN

DB00640
(Adenosine) 		Thermus
thermophilus 		PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE 		PF01048
(PNP_UDP_1)
no annotation 		13 HIS B   5
ARG B  44
MET A  65
ARG A  87
THR A  90
GLY A  92
GLU A 156
GLU A 179
MET A 180
GLU A 181
SER A 203
ASN A 204
ILE A 206
 ADN A1237
1ODI_B_ADNB1237 1odi ADN

DB00640
(Adenosine) 		Thermus
thermophilus 		PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE 		PF01048
(PNP_UDP_1)
no annotation 		13 HIS A   5
ARG A  44
MET B  65
ARG B  87
THR B  90
GLY B  92
GLU B 156
GLU B 179
MET B 180
GLU B 181
SER B 203
ASN B 204
ILE B 206
 ADN B1237
1ODI_C_ADNC1238 1odi ADN

DB00640
(Adenosine) 		Thermus
thermophilus 		PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE 		no annotation 13 HIS D   5
ARG D  44
MET C  65
ARG C  87
THR C  90
GLY C  92
GLU C 156
GLU C 179
MET C 180
GLU C 181
SER C 203
ASN C 204
ILE C 206
 ADN C1238
1ODI_D_ADND1237 1odi ADN

DB00640
(Adenosine) 		Thermus
thermophilus 		PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE 		no annotation 13 HIS C   5
ARG C  44
MET D  65
ARG D  87
THR D  90
GLY D  92
GLU D 156
GLU D 179
MET D 180
GLU D 181
SER D 203
ASN D 204
ILE D 206
 ADN D1237
1ODI_E_ADNE1237 1odi ADN

DB00640
(Adenosine) 		Thermus
thermophilus 		PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE 		no annotation 13 HIS F   5
ARG F  44
MET E  65
ARG E  87
THR E  90
GLY E  92
GLU E 156
GLU E 179
MET E 180
GLU E 181
SER E 203
ASN E 204
ILE E 206
 ADN E1237
1ODI_F_ADNF1238 1odi ADN

DB00640
(Adenosine) 		Thermus
thermophilus 		PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE 		no annotation 13 HIS E   5
ARG E  44
MET F  65
ARG F  87
THR F  90
GLY F  92
GLU F 156
GLU F 179
MET F 180
GLU F 181
SER F 203
ASN F 204
ILE F 206
 ADN F1238
1UAY_A_ADNA1001 1uay ADN

DB00640
(Adenosine) 		Thermus
thermophilus 		TYPE II
3-HYDROXYACYL-COA
DEHYDROGENASE 		PF00106
(adh_short) 		11 GLY A   9
ALA A  11
SER A  12
ASP A  33
LEU A  34
ARG A  35
ASP A  47
VAL A  48
ALA A  74
VAL A  76
VAL A 100
 ADN A1001
1UAY_B_ADNB1002 1uay ADN

DB00640
(Adenosine) 		Thermus
thermophilus 		TYPE II
3-HYDROXYACYL-COA
DEHYDROGENASE 		no annotation 10 GLY B   9
ALA B  11
SER B  12
ASP B  33
LEU B  34
ASP B  47
VAL B  48
ALA B  74
VAL B  76
VAL B 100
 ADN B1002
1V2X_A_SAMA400 1v2x SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		TRNA (GM18)
METHYLTRANSFERASE 		PF00588
(SpoU_methylas_C)
PF12105
(SpoU_methylase) 		13 THR A  99
LEU A 101
PHE A 121
GLY A 122
TRP A 126
GLY A 127
LYS A 141
ILE A 142
MET A 144
SER A 150
LEU A 151
VAL A 153
ALA A 156
 SAM A 400
1WG8_A_SAMA3142 1wg8 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		PREDICTED
S-ADENOSYLMETHIONINE
-DEPENDENT
METHYLTRANSFERASE 		PF01795
(Methyltransf_5) 		16 PRO A   8
THR A  30
GLY A  32
GLY A  33
GLY A  35
HIS A  36
ASP A  51
GLN A  52
ASP A  53
ASN A  74
PHE A  75
ASP A  96
SER A 100
HIS A 103
MET A 123
ARG A 271
 SAM A3142
1WG8_B_SAMB3141 1wg8 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		PREDICTED
S-ADENOSYLMETHIONINE
-DEPENDENT
METHYLTRANSFERASE 		None 15 PRO B   8
THR B  30
GLY B  32
GLY B  33
GLY B  35
HIS B  36
ASP B  51
GLN B  52
ASP B  53
ASN B  74
PHE B  75
ASP B  96
SER B 100
HIS B 103
MET B 123
 SAM B3141
2A68_C_RBTC8001 2a68 RBT

DB00615
(Rifabutin) 		Thermus
thermophilus 		DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE BETA
CHAIN;
RNA POLYMERASE SIGMA
FACTOR RPOD 		PF00140
(Sigma70_r1_2)
PF00562
(RNA_pol_Rpb2_6)
PF04539
(Sigma70_r3)
PF04542
(Sigma70_r2)
PF04545
(Sigma70_r4)
PF04560
(RNA_pol_Rpb2_7)
PF04561
(RNA_pol_Rpb2_2)
PF04563
(RNA_pol_Rpb2_1)
PF04565
(RNA_pol_Rpb2_3)
PF10385
(RNA_pol_Rpb2_45) 		11 ARG C 134
ASP F 323
GLN C 390
GLN C 393
PHE C 394
ASP C 396
HIS C 406
ARG C 409
SER C 411
PRO C 444
ILE C 452
 RBT C8001
2A68_M_RBTM8002 2a68 RBT

DB00615
(Rifabutin) 		Thermus
thermophilus 		DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE BETA
CHAIN;
RNA POLYMERASE SIGMA
FACTOR RPOD 		no annotation 13 ARG M 134
ASP P 323
LYS P 325
GLN M 390
GLN M 393
PHE M 394
ASP M 396
HIS M 406
ARG M 409
SER M 411
PRO M 444
ILE M 452
ASN M 563
 RBT M8002
2A69_C_RPTC8001 2a69 RPT

DB01201
(Rifapentine) 		Thermus
thermophilus 		DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE BETA
CHAIN;
RNA POLYMERASE SIGMA
FACTOR RPOD 		PF00140
(Sigma70_r1_2)
PF00562
(RNA_pol_Rpb2_6)
PF04539
(Sigma70_r3)
PF04542
(Sigma70_r2)
PF04545
(Sigma70_r4)
PF04560
(RNA_pol_Rpb2_7)
PF04561
(RNA_pol_Rpb2_2)
PF04563
(RNA_pol_Rpb2_1)
PF04565
(RNA_pol_Rpb2_3)
PF10385
(RNA_pol_Rpb2_45) 		11 ARG C 134
ASP F 323
GLN C 390
GLN C 393
PHE C 394
ASP C 396
HIS C 406
ARG C 409
SER C 411
PRO C 444
ILE C 452
 RPT C8001
2A69_M_RPTM8002 2a69 RPT

DB01201
(Rifapentine) 		Thermus
thermophilus 		DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE BETA
CHAIN 		no annotation 14 ARG M 134
GLN M 390
GLN M 393
PHE M 394
ASP M 396
ARG M 405
HIS M 406
ARG M 409
SER M 411
PRO M 444
ILE M 452
ASN M 563
MET M1000
GLU M1002
 RPT M8002
2BTE_A_LEUA1894 2bte LEU

DB00149
(L-
Leucine) 		Thermus
thermophilus 		AMINOACYL-TRNA
SYNTHETASE 		PF00133
(tRNA-synt_1_2)
PF08264
(tRNA-synt_1)
PF13603
(Anticodon_1)
PF14795
(tRNA-synt_1) 		8 MET A  40
TYR A  43
ASP A  80
SER A 504
TYR A 507
TYR A 535
HIS A 541
HIS A 545
 LEU A1894
2BTE_D_LEUD1893 2bte LEU

DB00149
(L-
Leucine) 		Thermus
thermophilus 		AMINOACYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 8 MET D  40
TYR D  43
ASP D  80
SER D 504
TYR D 507
TYR D 535
HIS D 541
HIS D 545
 LEU D1893
2BYT_A_LEUA1301 2byt LEU

DB00149
(L-
Leucine) 		Thermus
thermophilus 		LEUCYL-TRNA
SYNTHETASE 		PF00133
(Anticodon_1)
PF08264
(tRNA-synt_1_2)
PF13603
(tRNA-synt_1)
PF14795
(Leucyl-specific) 		7 MET A  40
TYR A  43
ASP A  80
TYR A 507
TYR A 535
HIS A 541
HIS A 545
 LEU A1301
2BYT_D_LEUD1601 2byt LEU

DB00149
(L-
Leucine) 		Thermus
thermophilus 		LEUCYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 7 MET D  40
TYR D  43
ASP D  80
TYR D 507
TYR D 535
HIS D 541
HIS D 545
 LEU D1601
2EJ3_A_GBNA2414 2ej3 GBN

DB00996
(Gabapentin) 		Thermus
thermophilus 		BRANCHED-CHAIN AMINO
ACID
AMINOTRANSFERASE 		PF01063
(Aminotran_4) 		8 TYR A  95
ARG A  97
GLY A 196
GLU A 197
GLY A 255
THR A 256
ALA A 257
ALA A 258
 GBN A2414
2EJ3_B_GBNB914 2ej3 GBN

DB00996
(Gabapentin) 		Thermus
thermophilus 		BRANCHED-CHAIN AMINO
ACID
AMINOTRANSFERASE 		no annotation 10 PHE B  36
TYR B  95
ARG B  97
TYR B 164
GLY B 196
GLU B 197
GLY B 255
THR B 256
ALA B 257
ALA B 258
 GBN B 914
2EJ3_C_GBNC1414 2ej3 GBN

DB00996
(Gabapentin) 		Thermus
thermophilus 		BRANCHED-CHAIN AMINO
ACID
AMINOTRANSFERASE 		no annotation 8 TYR C  95
ARG C  97
GLY C 196
GLU C 197
GLY C 255
THR C 256
ALA C 257
ALA C 258
 GBN C1414
2NXE_A_SAMA302 2nxe SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL PROTEIN
L11
METHYLTRANSFERASE 		PF06325
(PrmA) 		15 PHE A  99
GLY A 100
THR A 107
ASP A 126
LEU A 127
GLY A 128
GLY A 130
LEU A 134
ASP A 149
ILE A 150
ASP A 151
SER A 175
ASN A 191
LEU A 192
LEU A 196
 SAM A 302
2NXE_B_SAMB303 2nxe SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL PROTEIN
L11
METHYLTRANSFERASE 		None 15 PHE B  99
GLY B 100
THR B 107
ASP B 126
LEU B 127
GLY B 128
GLY B 130
LEU B 134
ASP B 149
ILE B 150
ASP B 151
SER B 175
ASN B 191
LEU B 192
LEU B 196
 SAM B 303
2OWC_A_ACRA600 2owc ACR

DB00284
(Acarbose) 		Thermus
thermophilus 		4-ALPHA-GLUCANOTRANS
FERASE 		PF02446
(Glyco_hydro_77) 		11 SER A  57
TYR A  59
GLN A  60
GLN A 256
TRP A 258
ASP A 293
HIS A 394
ASP A 395
ASN A 464
PRO A 466
TRP A 473
 ACR A 600
2OWW_A_ACRA600 2oww ACR

DB00284
(Acarbose) 		Thermus
thermophilus 		4-ALPHA-GLUCANOTRANS
FERASE 		PF02446
(Glyco_hydro_77) 		11 SER A  57
TYR A  59
GLN A  60
GLN A 256
TRP A 258
ASP A 293
HIS A 394
ASP A 395
ASN A 464
PRO A 466
TRP A 473
 ACR A 600
2V0G_A_LEUA1887 2v0g LEU

DB00149
(L-
Leucine) 		Thermus
thermophilus 		AMINOACYL-TRNA
SYNTHETASE 		PF00133
(tRNA-synt_1)
PF08264
(Anticodon_1)
PF13603
(Leucyl-specific)
PF14795
(tRNA-synt_1) 		8 MET A  40
TYR A  43
ASP A  80
SER A 504
TYR A 507
TYR A 535
HIS A 541
HIS A 545
 LEU A1887
2V0G_D_LEUD1883 2v0g LEU

DB00149
(L-
Leucine) 		Thermus
thermophilus 		AMINOACYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 5 TYR D  43
ASP D  80
TYR D 507
TYR D 535
HIS D 541
 LEU D1883
2YQZ_A_SAMA301 2yqz SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		HYPOTHETICAL PROTEIN
TTHA0223 		PF08241
(Methyltransf_11) 		17 TYR A  12
GLU A  45
GLY A  47
GLY A  49
ARG A  52
ILE A  53
LEU A  67
ASP A  68
ALA A  69
ASP A  70
ASP A  94
ALA A  95
ARG A  96
VAL A 111
HIS A 112
LEU A 113
LEU A 116
 SAM A 301
2YQZ_B_SAMB401 2yqz SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		HYPOTHETICAL PROTEIN
TTHA0223 		None 17 TYR B  12
GLU B  45
GLY B  47
GLY B  49
ARG B  52
ILE B  53
LEU B  67
ASP B  68
ALA B  69
ASP B  70
ASP B  94
ALA B  95
VAL B 111
HIS B 112
LEU B 113
LEU B 116
VAL B 117
 SAM B 401
2Z0Y_A_SAMA300 2z0y SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		PUTATIVE
UNCHARACTERIZED
PROTEIN TTHA0657 		PF04452
(Methyltrans_RNA) 		9 ALA A 158
VAL A 160
VAL A 180
GLY A 181
GLY A 185
LEU A 204
ILE A 208
LEU A 209
ALA A 214
 SAM A 300
2Z0Y_B_SAMB400 2z0y SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		PUTATIVE
UNCHARACTERIZED
PROTEIN TTHA0657 		None 9 ALA B 158
VAL B 160
VAL B 180
GLY B 181
GLY B 185
LEU B 204
ILE B 208
LEU B 209
ALA B 214
 SAM B 400
2ZBP_A_SAMA300 2zbp SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL PROTEIN
L11
METHYLTRANSFERASE 		PF06325
(PrmA) 		14 PHE A  99
GLY A 100
THR A 107
LEU A 127
GLY A 128
GLY A 130
LEU A 134
ASP A 149
ILE A 150
ASP A 151
SER A 175
ASN A 191
LEU A 192
LEU A 196
 SAM A 300
2ZIF_A_SAMA298 2zif SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		PUTATIVE
MODIFICATION
METHYLASE 		PF01555
(N6_N4_Mtase) 		13 ASP A  28
ALA A  29
SER A  47
PRO A  49
PRO A 219
PHE A 220
PHE A 243
GLY A 245
THR A 246
THR A 248
GLU A 264
LEU A 265
VAL A 266
 SAM A 298
2ZIF_B_SAMB298 2zif SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		PUTATIVE
MODIFICATION
METHYLASE 		None 15 ASP B  28
ALA B  29
SER B  47
PRO B  49
ALA B 218
PRO B 219
PHE B 220
PHE B 243
GLY B 245
THR B 246
THR B 248
GLU B 264
LEU B 265
VAL B 266
TYR B 269
 SAM B 298
2ZUL_A_SAMA376 2zul SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		PROBABLE RIBOSOMAL
RNA SMALL SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE 		PF05175
(MTS) 		15 TYR A   8
PHE A 207
SER A 216
GLY A 241
GLY A 243
ALA A 246
LEU A 247
GLU A 262
ASP A 263
ASP A 288
VAL A 289
ASN A 305
PRO A 307
VAL A 318
PHE A 322
 SAM A 376
3APT_B_ACTB311 3apt ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Thermus
thermophilus 		METHYLENETETRAHYDROF
OLATE REDUCTASE 		None 9 GLU B  18
HIS B  77
LEU B 104
ASP B 109
PRO B 110
ALA B 147
ILE B 178
HIS B 270
TYR B 272
 ACT B 311
3BVD_A_CUA803 3bvd CU

DB09130
(Copper) 		Thermus
thermophilus 		CYTOCHROME C OXIDASE
SUBUNIT 1 		PF00115
(COX1) 		3 HIS A 233
HIS A 282
HIS A 283
  CU A 803
3CJT_C_SAMC302 3cjt SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL PROTEIN
L11
METHYLTRANSFERASE 		None 14 HIS C 103
THR C 107
ASP C 126
LEU C 127
GLY C 128
VAL C 133
LEU C 134
ASP C 149
ILE C 150
ASP C 151
SER C 175
ASN C 191
LEU C 192
LEU C 196
 SAM C 302
3CJT_G_SAMG302 3cjt SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL PROTEIN
L11
METHYLTRANSFERASE 		None 14 HIS G 103
LEU G 127
GLY G 128
GLY G 130
SER G 131
VAL G 133
LEU G 134
ASP G 149
ILE G 150
ASP G 151
SER G 175
ASN G 191
LEU G 192
LEU G 196
 SAM G 302
3CJT_K_SAMK302 3cjt SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL PROTEIN
L11
METHYLTRANSFERASE 		None 13 HIS K 103
LEU K 127
GLY K 128
SER K 131
VAL K 133
LEU K 134
ASP K 149
ILE K 150
ASP K 151
SER K 175
ASN K 191
LEU K 192
LEU K 196
 SAM K 302
3CJT_O_SAMO302 3cjt SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL PROTEIN
L11
METHYLTRANSFERASE 		None 14 HIS O 103
LEU O 127
GLY O 128
GLY O 130
SER O 131
VAL O 133
LEU O 134
ASP O 149
ILE O 150
ASP O 151
SER O 175
ASN O 191
LEU O 192
LEU O 196
 SAM O 302
3DMF_A_SAMA388 3dmf SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		PROBABLE RIBOSOMAL
RNA SMALL SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE 		PF05175
(MTS) 		14 TYR A   8
PHE A 207
SER A 216
GLY A 241
GLY A 243
ALA A 246
GLU A 262
ASP A 263
ASP A 288
VAL A 289
ASN A 305
PRO A 307
VAL A 318
PHE A 322
 SAM A 388
3DMH_A_SAMA384 3dmh SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		PROBABLE RIBOSOMAL
RNA SMALL SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE 		PF05175
(MTS) 		15 TYR A   8
PHE A 207
SER A 216
GLY A 241
GLY A 243
ALA A 246
LEU A 247
GLU A 262
ASP A 263
ASP A 288
VAL A 289
ASN A 305
PRO A 307
VAL A 318
PHE A 322
 SAM A 384
3FUU_A_ADNA0 3fuu ADN

DB00640
(Adenosine) 		Thermus
thermophilus 		DIMETHYLADENOSINE
TRANSFERASE 		PF00398
(RrnaAD) 		14 PHE A  25
GLN A  27
VAL A  53
GLY A  54
GLY A  56
GLU A  75
LYS A  76
ASP A  77
LEU A  80
ASP A  99
ALA A 100
PRO A 119
HIS A 121
ILE A 122
 ADN A   0
3G88_A_SAMA303 3g88 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE G 		PF02527
(GidB) 		11 GLY A  88
GLY A  90
PHE A  93
ASP A 111
ALA A 112
THR A 113
ARG A 138
ALA A 139
GLU A 140
ARG A 158
ALA A 159
 SAM A 303
3G88_B_SAMB303 3g88 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE G 		None 11 GLY B  88
GLY B  90
PHE B  93
ASP B 111
ALA B 112
THR B 113
ARG B 138
ALA B 139
GLU B 140
ARG B 158
ALA B 159
 SAM B 303
3G89_A_SAMA303 3g89 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE G 		PF02527
(GidB) 		12 GLY A  88
GLY A  90
PHE A  93
ASP A 111
ALA A 112
THR A 113
LYS A 116
ARG A 138
ALA A 139
GLU A 140
ARG A 158
ALA A 159
 SAM A 303
3G89_B_SAMB303 3g89 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE G 		None 11 GLY B  88
GLY B  90
PHE B  93
ASP B 111
ALA B 112
THR B 113
ARG B 138
ALA B 139
GLU B 140
ARG B 158
ALA B 159
 SAM B 303
3G8B_A_SAMA303 3g8b SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE G 		PF02527
(GidB) 		12 GLY A  88
GLY A  90
PHE A  93
ASP A 111
ALA A 112
THR A 113
LYS A 116
ARG A 138
ALA A 139
GLU A 140
ARG A 158
ALA A 159
 SAM A 303
3G8B_B_SAMB303 3g8b SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE G 		None 12 GLY B  88
GLY B  90
PHE B  93
ASP B 111
ALA B 112
THR B 113
LYS B 116
ARG B 138
ALA B 139
GLU B 140
ARG B 158
ALA B 159
 SAM B 303
3M6V_A_SAMA465 3m6v SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RRNA METHYLASE PF01189
(Methyltr_RsmF_N)
PF17125
(RsmF_methylt_CI)
PF17126
(Methyltr_RsmB-F) 		13 ALA A 109
PRO A 112
GLY A 113
GLY A 114
LYS A 115
GLU A 133
VAL A 134
ASP A 135
ARG A 138
PRO A 160
ASP A 177
PRO A 179
LEU A 211
 SAM A 465
3M6V_B_SAMB465 3m6v SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RRNA METHYLASE None 13 ALA B 109
PRO B 112
GLY B 113
GLY B 114
LYS B 115
GLU B 133
VAL B 134
ASP B 135
ARG B 138
PRO B 160
ASP B 177
PRO B 179
LEU B 211
 SAM B 465
3M6W_A_SAMA465 3m6w SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RRNA METHYLASE PF01189
(RsmF_methylt_CI)
PF17125
(Methyltr_RsmB-F)
PF17126
(Methyltr_RsmF_N) 		14 ALA A 109
PRO A 112
GLY A 113
GLY A 114
LYS A 115
GLU A 133
VAL A 134
ASP A 135
ARG A 138
PRO A 160
ASP A 177
PRO A 179
VAL A 207
LEU A 211
 SAM A 465
3S33_A_CUA803 3s33 CU

DB09130
(Copper) 		Thermus
thermophilus 		CYTOCHROME C OXIDASE
SUBUNIT 1 		PF00115
(COX1) 		3 HIS A 233
HIS A 282
HIS A 283
  CU A 803
3S38_A_CUA803 3s38 CU

DB09130
(Copper) 		Thermus
thermophilus 		CYTOCHROME C OXIDASE
SUBUNIT 1 		PF00115
(COX1) 		3 HIS A 233
HIS A 282
HIS A 283
  CU A 803
3S39_A_CUA803 3s39 CU

DB09130
(Copper) 		Thermus
thermophilus 		CYTOCHROME C OXIDASE
SUBUNIT 1 		PF00115
(COX1) 		3 HIS A 233
HIS A 282
HIS A 283
  CU A 803
3S3A_A_CUA803 3s3a CU

DB09130
(Copper) 		Thermus
thermophilus 		CYTOCHROME C OXIDASE
SUBUNIT 1 		PF00115
(COX1) 		3 HIS A 233
HIS A 282
HIS A 283
  CU A 803
3S3B_A_CUA803 3s3b CU

DB09130
(Copper) 		Thermus
thermophilus 		CYTOCHROME C OXIDASE
SUBUNIT 1 		PF00115
(COX1) 		3 HIS A 233
HIS A 282
HIS A 283
  CU A 803
3S3C_A_CUA803 3s3c CU

DB09130
(Copper) 		Thermus
thermophilus 		CYTOCHROME C OXIDASE
SUBUNIT 1 		PF00115
(COX1) 		3 HIS A 233
HIS A 282
HIS A 283
  CU A 803
3S3D_A_CUA803 3s3d CU

DB09130
(Copper) 		Thermus
thermophilus 		CYTOCHROME C OXIDASE
SUBUNIT 1 		PF00115
(COX1) 		3 HIS A 233
HIS A 282
HIS A 283
  CU A 803
3TEH_A_DAHA351 3teh DAH

DB01235
(Levodopa) 		Thermus
thermophilus 		PHENYLALANYL-TRNA
SYNTHETASE ALPHA
CHAIN 		PF01409
(tRNA-synt_2d) 		9 TRP A 149
HIS A 178
SER A 180
ARG A 204
GLN A 218
GLU A 220
VAL A 261
ALA A 314
GLY A 316
 DAH A 351
3TEH_B_DAHB786 3teh DAH

DB01235
(Levodopa) 		Thermus
thermophilus 		PHENYLALANYL-TRNA
SYNTHETASE BETA
CHAIN 		PF01409
(tRNA-synt_2d)
PF01588
(tRNA_bind)
PF03147
(FDX-ACB)
PF03483
(B3_4)
PF03484
(B5) 		7 PRO B 259
HIS B 261
LEU B 286
GLY B 315
GLU B 334
ALA B 356
PHE B 360
 DAH B 786
3ZOF_A_HQEA200 3zof HQE

DB09526
(Hydroquinone) 		Thermus
thermophilus 		FLAVOREDOXIN PF01613
(Flavin_Reduct) 		5 TYR A  17
VAL A  38
TRP A  39
ARG A  58
HIS A 131
 HQE A 200
3ZOF_B_HQEB200 3zof HQE

DB09526
(Hydroquinone) 		Thermus
thermophilus 		FLAVOREDOXIN no annotation 5 TYR B  17
VAL B  38
TRP B  39
ARG B  58
HIS B 131
 HQE B 200
4DMG_A_SAMA401 4dmg SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		PUTATIVE
UNCHARACTERIZED
PROTEIN TTHA1493 		PF02475
(Met_10) 		12 GLN A 193
TYR A 198
ARG A 205
TYR A 222
TYR A 224
ASP A 243
LYS A 244
ASP A 245
GLU A 269
ALA A 270
ASP A 287
PRO A 289
 SAM A 401
4DMG_B_SAMB401 4dmg SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		PUTATIVE
UNCHARACTERIZED
PROTEIN TTHA1493 		None 11 TYR B 198
ARG B 205
TYR B 222
TYR B 224
ASP B 243
LYS B 244
ASP B 245
GLU B 269
ALA B 270
ASP B 287
PRO B 289
 SAM B 401
4DR2_A_PARA1609 4dr2 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
30S RIBOSOMAL
PROTEIN S10;
30S RIBOSOMAL
PROTEIN S9 		PF00338
(Ribosomal_S10)
PF00380
(Ribosomal_S9)
no annotation 		3 ARG J  51
SER J  59
TYR I 114
 PAR A1609
4DR3_A_SRYA1601 4dr3 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
30S RIBOSOMAL
PROTEIN S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		4 LYS L  46
LYS L  47
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1601
4DR5_A_SRYA1860 4dr5 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
30S RIBOSOMAL
PROTEIN S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		3 LYS L  46
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1860
4DR6_A_SRYA1956 4dr6 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
30S RIBOSOMAL
PROTEIN S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		3 LYS L  46
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1956
4DUZ_A_SRYA1601 4duz SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		3 LYS L  46
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1601
4DV1_A_SRYA1601 4dv1 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		3 LYS L  46
LYS L  47
PRO L  48
 SRY A1601
4DV3_A_SRYA1601 4dv3 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		4 LYS L  46
LYS L  47
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1601
4DV5_A_SRYA1601 4dv5 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		4 LYS L  46
LYS L  47
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1601
4DV7_A_SRYA1601 4dv7 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		3 LYS L  46
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1601
4JI1_A_SRYA1601 4ji1 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		4 LYS L  46
LYS L  47
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1601
4JI3_A_SRYA1601 4ji3 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		4 LYS L  46
LYS L  47
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1601
4JI8_A_SRYA1601 4ji8 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		3 LYS L  46
LYS L  91
TRP L  94
 SRY A1601
4KHP_A_PARA1606 4khp PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RIBOSOMAL RNA;
30S RIBOSOMAL
PROTEIN S10;
30S RIBOSOMAL
PROTEIN S9 		PF00338
(Ribosomal_S10)
PF00380
(Ribosomal_S9)
no annotation 		3 ARG J  51
SER J  59
TYR I 114
 PAR A1606
4LF7_A_PARA1817 4lf7 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S10;
RIBOSOMAL PROTEIN S9 		PF00338
(Ribosomal_S10)
PF00380
(Ribosomal_S9)
no annotation 		3 ARG J  51
SER J  59
TYR I 114
 PAR A1817
4LF8_A_PARA1817 4lf8 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S10;
RIBOSOMAL PROTEIN S9 		PF00338
(Ribosomal_S10)
PF00380
(Ribosomal_S9)
no annotation 		3 ARG J  51
SER J  59
TYR I 114
 PAR A1817
4NXN_A_SRYA1601 4nxn SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		4 LYS L  46
LYS L  47
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1601
4ODO_A_FK5A205 4odo FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Thermus
thermophilus 		PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
SLYD 		PF00254
(FKBP_C)
no annotation 		14 THR C  10
ARG C  12
TYR A  13
LEU A  15
ASP A  23
GLU C  26
LEU A  27
LEU A  36
ILE A  37
LEU A  40
TYR A  63
LEU A 121
PHE A 128
VAL C 133
 FK5 A 205
4ODO_B_FK5B203 4odo FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Thermus
thermophilus 		PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
SLYD 		no annotation 13 TYR B  13
LEU B  15
ASP B  23
LEU B  27
LEU B  36
ILE B  37
LEU B  40
TYR B  63
ALA C  78
GLN C  94
GLY C  98
LEU B 121
PHE B 128
 FK5 B 203
4ODO_C_FK5C204 4odo FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Thermus
thermophilus 		PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
SLYD 		PF00254
(FKBP_C)
no annotation 		13 TYR C  13
LEU C  15
ASP C  23
LEU C  27
LEU C  36
ILE C  37
LEU C  40
TYR C  63
TYR A  92
GLN A  94
GLY B  98
LEU C 121
PHE C 128
 FK5 C 204
4ODR_A_FK5A201 4odr FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Homo sapiens;
Thermus
thermophilus 		PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
SLYD,
PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
FKBP1A CHIMERA 		PF00254
(FKBP_C)
no annotation 		12 TYR A  13
LEU A  15
ASP A  23
LEU A  27
LEU A  36
ILE A  37
LEU A  40
TYR A  63
ILE A  71
ILE A  72
PHE A  80
PRO B 102
 FK5 A 201
4ODR_B_FK5B201 4odr FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Homo sapiens;
Thermus
thermophilus 		PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
SLYD,
PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
FKBP1A CHIMERA 		PF00254
(FKBP_C)
no annotation 		11 TYR B  13
LEU B  15
ASP B  23
LEU B  27
LEU B  36
ILE B  37
LEU B  40
TYR B  63
ILE B  71
PHE B  80
PRO A 102
 FK5 B 201
4RDX_A_HISA502 4rdx HIS

DB00117
(L-
Histidine) 		Thermus
thermophilus 		HISTIDINE--TRNA
LIGASE 		PF03129
(tRNA-synt_His)
PF13393
(HGTP_anticodon) 		7 THR A  83
GLU A 130
ARG A 259
TYR A 264
GLY A 285
TYR A 288
GLY A 304
 HIS A 502
4X3M_A_ADNA301 4x3m ADN

DB00640
(Adenosine) 		Thermus
thermophilus 		RNA 2'-O RIBOSE
METHYLTRANSFERASE 		PF00588
(SpoU_methylase) 		9 PRO A 188
LEU A 207
GLY A 208
GLU A 210
ILE A 228
MET A 230
SER A 236
VAL A 239
THR A 242
 ADN A 301
4X3M_B_ADNB301 4x3m ADN

DB00640
(Adenosine) 		Thermus
thermophilus 		RNA 2'-O RIBOSE
METHYLTRANSFERASE 		no annotation 9 PRO B 188
LEU B 207
GLY B 208
ILE B 228
MET B 230
SER B 236
LEU B 237
VAL B 239
THR B 242
 ADN B 301
5C0O_E_SAME301 5c0o SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		TRNA
(ADENINE(58)-N(1))-M
ETHYLTRANSFERASE
TRMI 		PF08704
(GCD14) 		14 ALA E  74
PRO E  76
THR E  77
GLY E 101
GLY E 103
GLY E 106
LEU E 107
GLU E 125
ALA E 126
ARG E 127
HIS E 130
GLU E 155
ASP E 170
LEU E 171
 SAM E 301
5C0O_F_SAMF301 5c0o SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		TRNA
(ADENINE(58)-N(1))-M
ETHYLTRANSFERASE
TRMI 		None 12 PRO F  76
THR F  77
GLY F 103
GLY F 105
GLY F 106
LEU F 107
GLU F 125
ALA F 126
HIS F 130
LYS F 153
ASP F 170
LEU F 171
 SAM F 301
5C0O_G_SAMG301 5c0o SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		TRNA
(ADENINE(58)-N(1))-M
ETHYLTRANSFERASE
TRMI 		None 15 ALA G  74
PRO G  76
THR G  77
GLY G 101
GLY G 103
GLY G 106
LEU G 107
GLU G 125
ALA G 126
ARG G 127
HIS G 130
LYS G 153
GLU G 155
ASP G 170
LEU G 171
 SAM G 301
5C0O_H_SAMH301 5c0o SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		TRNA
(ADENINE(58)-N(1))-M
ETHYLTRANSFERASE
TRMI 		None 17 ALA H  74
PRO H  76
THR H  77
GLY H 101
GLY H 103
SER H 104
GLY H 105
GLY H 106
LEU H 107
GLU H 125
ARG H 127
HIS H 130
LYS H 153
LEU H 154
GLU H 155
ASP H 170
LEU H 171
 SAM H 301
5VOO_A_C2FA3001 5voo C2F

DB11256
(Levomefolic
acid) 		Thermus
thermophilus 		5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE HOMOCYSTEINE
S-METHYLTRANSFERASE 		None
PF00809
(Pterin_bind) 		18 GLU A 373
ARG A 374
ASN A 376
GLY A 379
LYS A 381
ASP A 411
THR C 417
ASP A 443
ASN A 464
VAL A 490
LEU A 492
ASP A 531
GLY A 570
SER A 572
ASN A 573
PHE A 576
ARG A 583
ILE A 603
 C2F A3001
5VOO_B_C2FB702 5voo C2F

DB11256
(Levomefolic
acid) 		Thermus
thermophilus 		5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE HOMOCYSTEINE
S-METHYLTRANSFERASE 		None 17 GLU B 373
ARG B 374
ASN B 376
GLY B 379
LYS B 381
ASP B 411
ASP B 443
ASN B 464
VAL B 490
LEU B 492
ASP B 531
GLY B 570
SER B 572
ASN B 573
PHE B 576
ARG B 583
ILE B 603
 C2F B 702
5VOO_C_C2FC702 5voo C2F

DB11256
(Levomefolic
acid) 		Thermus
thermophilus 		5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE HOMOCYSTEINE
S-METHYLTRANSFERASE 		None
PF00809
(Pterin_bind) 		18 GLU C 373
ARG C 374
ASN C 376
GLY C 379
LYS C 381
ASP C 411
THR A 417
ASP C 443
ASN C 464
VAL C 490
LEU C 492
ASP C 531
GLY C 570
SER C 572
ASN C 573
PHE C 576
ARG C 583
ILE C 603
 C2F C 702
5VOO_D_C2FD3001 5voo C2F

DB11256
(Levomefolic
acid) 		Thermus
thermophilus 		5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE HOMOCYSTEINE
S-METHYLTRANSFERASE 		None 17 GLU D 373
ASN D 376
GLY D 379
LYS D 381
ASP D 411
MET D 441
ASP D 443
ASN D 464
VAL D 490
LEU D 492
ASP D 531
GLY D 570
SER D 572
ASN D 573
PHE D 576
ARG D 583
ILE D 603
 C2F D3001
5VOO_E_C2FE3001 5voo C2F

DB11256
(Levomefolic
acid) 		Thermus
thermophilus 		5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE HOMOCYSTEINE
S-METHYLTRANSFERASE 		None 17 GLU E 373
ARG E 374
ASN E 376
GLY E 379
LYS E 381
ASP E 411
MET E 441
ASP E 443
ASN E 464
VAL E 490
LEU E 492
ASP E 531
GLY E 570
SER E 572
ASN E 573
ARG E 583
ILE E 603
 C2F E3001
5VOO_F_C2FF3001 5voo C2F

DB11256
(Levomefolic
acid) 		Thermus
thermophilus 		5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE HOMOCYSTEINE
S-METHYLTRANSFERASE 		None 16 GLU F 373
ASN F 376
GLY F 379
LYS F 381
ASP F 411
ASP F 443
ASN F 464
VAL F 490
LEU F 492
ASP F 531
GLY F 570
SER F 572
ASN F 573
PHE F 576
ARG F 583
ILE F 603
 C2F F3001
5VOP_A_C2FA3001 5vop C2F

DB11256
(Levomefolic
acid) 		Thermus
thermophilus 		5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE HOMOCYSTEINE
S-METHYLTRANSFERASE 		PF00809
(Pterin_bind) 		15 GLU A 373
ASN A 376
GLY A 379
ASP A 411
ASP A 443
ASN A 464
VAL A 490
LEU A 492
ASP A 531
VAL A 568
GLY A 570
SER A 572
ASN A 573
ARG A 583
ILE A 603
 C2F A3001
5VOP_B_C2FB3001 5vop C2F

DB11256
(Levomefolic
acid) 		Thermus
thermophilus 		5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE HOMOCYSTEINE
S-METHYLTRANSFERASE 		None 15 GLU B 373
ASN B 376
GLY B 379
LYS B 381
ASP B 411
ASP B 443
ASN B 464
VAL B 490
LEU B 492
ASP B 531
GLY B 570
SER B 572
ASN B 573
ARG B 583
ILE B 603
 C2F B3001