DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'Thermococcus kodakarensis'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
3WDM_A_ADNA901 3wdm ADN

DB00640
(Adenosine)
Thermococcus
kodakarensis
4-PHOSPHOPANTOATE--B
ETA-ALANINE LIGASE
PF02006
(PPS_PS)
9 ALA A  36
ARG A  39
GLY A  40
LEU A 161
ASP A 181
LEU A 182
ASN A 183
ASN A 199
ILE A 200
ADN A 901
3WDM_B_ADNB301 3wdm ADN

DB00640
(Adenosine)
Thermococcus
kodakarensis
4-PHOSPHOPANTOATE--B
ETA-ALANINE LIGASE
no annotation 10 ALA B  36
ARG B  39
GLY B  40
LEU B  83
LEU B 161
ASP B 181
LEU B 182
ASN B 183
ASN B 199
ILE B 200
ADN B 301
3WDM_C_ADNC301 3wdm ADN

DB00640
(Adenosine)
Thermococcus
kodakarensis
4-PHOSPHOPANTOATE--B
ETA-ALANINE LIGASE
no annotation 9 ALA C  36
GLY C  40
LEU C  83
LEU C 161
ASP C 181
LEU C 182
ASN C 183
ASN C 199
ILE C 200
ADN C 301
3WDM_D_ADND301 3wdm ADN

DB00640
(Adenosine)
Thermococcus
kodakarensis
4-PHOSPHOPANTOATE--B
ETA-ALANINE LIGASE
no annotation 10 ALA D  36
ARG D  39
GLY D  40
LEU D  83
LEU D 161
ASP D 181
LEU D 182
ASN D 183
ASN D 199
ILE D 200
ADN D 301
5E72_A_SAMA400 5e72 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Thermococcus
kodakarensis
N2,
N2-DIMETHYLGUANOSINE
TRNA
METHYLTRANSFERASE
PF01170
(THUMP)
PF02926
(UPF0020)
16 ILE A 163
ASP A 185
PHE A 187
GLY A 189
GLY A 192
ILE A 193
ASP A 208
ILE A 209
ARG A 210
MET A 213
ASP A 235
ALA A 236
THR A 253
ASP A 254
PRO A 256
LEU A 271
SAM A 400
5GSM_A_GCSA801 5gsm GCS

DB01296
(Glucosamine)
Thermococcus
kodakarensis
EXO-BETA-D-GLUCOSAMI
NIDASE
PF02449
(Glyco_hydro_42)
14 TYR A  53
CYS A 101
GLY A 102
GLU A 103
ASP A 178
GLU A 179
LEU A 278
GLU A 306
TRP A 308
PHE A 311
GLU A 347
LEU A 352
TYR A 379
TRP A 398
GCS A 801
5GSM_B_GCSB801 5gsm GCS

DB01296
(Glucosamine)
Thermococcus
kodakarensis
EXO-BETA-D-GLUCOSAMI
NIDASE
no annotation 14 TYR B  53
CYS B 101
GLY B 102
GLU B 103
ASP B 178
GLU B 179
LEU B 278
GLU B 306
TRP B 308
PHE B 311
GLU B 347
LEU B 352
TYR B 379
TRP B 398
GCS B 801
6EMU_A_SAMA501 6emu SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Thermococcus
kodakarensis
TRNA
(GUANINE(9)-/ADENINE
(9)-N1)-METHYLTRANSF
ERASE
PF04252
(RNA_Me_trans)
13 LEU A 181
PRO A 183
TRP A 184
ILE A 201
GLY A 202
ILE A 204
ASP A 206
THR A 214
THR A 215
ILE A 234
VAL A 243
ASP A 245
ILE A 250
SAM A 501
6EMU_B_SAMB301 6emu SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Thermococcus
kodakarensis
TRNA
(GUANINE(9)-/ADENINE
(9)-N1)-METHYLTRANSF
ERASE
None 13 LEU B 181
PRO B 183
TRP B 184
ILE B 201
GLY B 202
ILE B 204
THR B 214
THR B 215
ILE B 234
VAL B 240
VAL B 243
ASP B 245
ILE B 250
SAM B 301
6EMU_C_SAMC301 6emu SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Thermococcus
kodakarensis
TRNA
(GUANINE(9)-/ADENINE
(9)-N1)-METHYLTRANSF
ERASE
None 14 LEU C 181
PRO C 183
TRP C 184
ILE C 201
GLY C 202
ILE C 204
ASP C 206
THR C 214
THR C 215
ILE C 234
VAL C 240
VAL C 243
ASP C 245
ILE C 250
SAM C 301