DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'Sus scrofa'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1AQB_A_RTLA185 1aqb RTL

DB00162
(Vitamin
A) 		Sus scrofa RETINOL-BINDING
PROTEIN 		PF00061
(Lipocalin) 		10 LEU A  35
ALA A  55
VAL A  61
MET A  73
MET A  88
TYR A  90
LEU A  97
GLN A  98
HIS A 104
PHE A 135
 RTL A 185
1DZM_A_BZMA600 1dzm BZM

DB00676
(Benzyl
Benzoate) 		Sus scrofa ODORANT-BINDING
PROTEIN 		PF00061
(Lipocalin) 		8 ILE A  21
MET A  39
VAL A  80
ASN A  86
ASN A 102
MET A 114
GLY A 116
LEU A 118
 BZM A 600
1DZM_B_BZMB600 1dzm BZM

DB00676
(Benzyl
Benzoate) 		Sus scrofa ODORANT-BINDING
PROTEIN 		None 9 ILE B  21
MET B  39
VAL B  80
TYR B  82
ASN B  86
ASN B 102
MET B 114
GLY B 116
LEU B 118
 BZM B 600
1E06_A_IPBA600 1e06 IPB

DB02513
(Thymol) 		Sus scrofa ODORANT-BINDING
PROTEIN 		PF00061
(Lipocalin) 		6 VAL A  37
MET A  39
VAL A  80
ASN A  86
ILE A 100
ASN A 102
 IPB A 600
1E06_B_IPBB600 1e06 IPB

DB02513
(Thymol) 		Sus scrofa ODORANT-BINDING
PROTEIN 		None 4 ILE B  21
MET B  39
VAL B  80
GLY B 116
 IPB B 600
1H7X_A_URFA1033 1h7x URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Sus scrofa DIHYDROPYRIMIDINE
DEHYDROGENASE 		PF01180
(DHO_dh)
PF07992
(Pyr_redox_2)
PF14691
(Fer4_20)
PF14697
(Fer4_21) 		6 ASN A 609
ILE A 613
ASN A 668
SER A 670
ASN A 736
THR A 737
 URF A1033
1H7X_B_URFB1033 1h7x URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Sus scrofa DIHYDROPYRIMIDINE
DEHYDROGENASE 		no annotation 6 ASN B 609
ILE B 613
ASN B 668
SER B 670
ASN B 736
THR B 737
 URF B1033
1H7X_C_URFC1033 1h7x URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Sus scrofa DIHYDROPYRIMIDINE
DEHYDROGENASE 		no annotation 6 ASN C 609
ILE C 613
ASN C 668
SER C 670
ASN C 736
THR C 737
 URF C1033
1H7X_D_URFD1033 1h7x URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Sus scrofa DIHYDROPYRIMIDINE
DEHYDROGENASE 		no annotation 6 ASN D 609
ILE D 613
ASN D 668
SER D 670
ASN D 736
THR D 737
 URF D1033
1IA0_B_TXLB502 1ia0 TXL

DB01248
(Docetaxel) 		Sus scrofa TUBULIN BETA CHAIN PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C) 		14 VAL B  23
ASP B  26
LEU B 217
ASP B 226
HIS B 229
SER B 236
PHE B 272
THR B 276
ARG B 278
ARG B 320
PRO B 360
ARG B 369
GLY B 370
LEU B 371
 TXL B 502
1JS3_A_142A701 1js3 142

DB00190
(Carbidopa) 		Sus scrofa DOPA DECARBOXYLASE PF00282
(Pyridoxal_deC)
no annotation 		9 TRP A  71
TYR A  79
PHE A  80
THR A  82
ILE B 101
HIS A 192
THR A 246
HIS A 302
LYS A 303
 142 A 701
1JS3_B_142B702 1js3 142

DB00190
(Carbidopa) 		Sus scrofa DOPA DECARBOXYLASE PF00282
(Pyridoxal_deC)
no annotation 		9 TRP B  71
TYR B  79
PHE B  80
THR B  82
ILE A 101
HIS B 192
THR B 246
HIS B 302
LYS B 303
 142 B 702
1KIF_A_BEZA349 1kif BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Sus scrofa D-AMINO ACID OXIDASE PF01266
(DAO) 		5 TYR A 224
TYR A 228
ILE A 230
ARG A 283
GLY A 313
 BEZ A 349
1KIF_B_BEZB349 1kif BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Sus scrofa D-AMINO ACID OXIDASE None 5 TYR B 224
TYR B 228
ILE B 230
ARG B 283
GLY B 313
 BEZ B 349
1KIF_C_BEZC349 1kif BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Sus scrofa D-AMINO ACID OXIDASE None 5 TYR C 224
TYR C 228
ILE C 230
ARG C 283
GLY C 313
 BEZ C 349
1KIF_D_BEZD349 1kif BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Sus scrofa D-AMINO ACID OXIDASE None 5 TYR D 224
TYR D 228
ILE D 230
ARG D 283
GLY D 313
 BEZ D 349
1KIF_E_BEZE349 1kif BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Sus scrofa D-AMINO ACID OXIDASE None 5 TYR E 224
TYR E 228
ILE E 230
ARG E 283
GLY E 313
 BEZ E 349
1KIF_F_BEZF349 1kif BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Sus scrofa D-AMINO ACID OXIDASE None 5 TYR F 224
TYR F 228
ILE F 230
ARG F 283
GLY F 313
 BEZ F 349
1KIF_G_BEZG349 1kif BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Sus scrofa D-AMINO ACID OXIDASE None 5 TYR G 224
TYR G 228
ILE G 230
ARG G 283
GLY G 313
 BEZ G 349
1KIF_H_BEZH349 1kif BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Sus scrofa D-AMINO ACID OXIDASE None 5 TYR H 224
TYR H 228
ILE H 230
ARG H 283
GLY H 313
 BEZ H 349
1TUB_B_TXLB501 1tub TXL

DB01248
(Docetaxel) 		Sus scrofa TUBULIN PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C) 		14 VAL B  23
ASP B  26
LEU B 217
ASP B 226
HIS B 229
SER B 236
PHE B 272
THR B 276
ARG B 278
ARG B 320
PRO B 360
ARG B 369
GLY B 370
LEU B 371
 TXL B 501
1VE9_A_BEZA352 1ve9 BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Sus scrofa D-AMINO ACID OXIDASE PF01266
(DAO) 		5 TYR A 224
TYR A 228
ILE A 230
ARG A 283
GLY A 313
 BEZ A 352
1VE9_B_BEZB1352 1ve9 BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Sus scrofa D-AMINO ACID OXIDASE None 4 TYR B 224
TYR B 228
ILE B 230
ARG B 283
 BEZ B1352
2AZY_A_CHDA237 2azy CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Sus scrofa PHOSPHOLIPASE A2,
MAJOR ISOENZYME 		PF00068
(Phospholip_A2_1) 		11 ARG A   6
ILE A   9
ILE A  13
HIS A  17
MET A  20
ASP A  21
TYR A  25
GLY A  30
LEU A  41
PHE A 106
TYR A 111
 CHD A 237
2HXF_B_TA1B601 2hxf TA1

DB01229
(Paclitaxel) 		Sus scrofa TUBULIN BETA CHAIN PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C) 		14 VAL B  23
ASP B  26
GLU B  27
LEU B 217
HIS B 229
LEU B 230
SER B 236
PHE B 272
LEU B 275
THR B 276
ARG B 278
PRO B 360
ARG B 369
GLY B 370
 TA1 B 601
2HXH_B_TA1B601 2hxh TA1

DB01229
(Paclitaxel) 		Sus scrofa TUBULIN BETA CHAIN PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C) 		14 VAL B  23
ASP B  26
GLU B  27
LEU B 217
HIS B 229
LEU B 230
SER B 236
PHE B 272
LEU B 275
THR B 276
ARG B 278
PRO B 360
ARG B 369
GLY B 370
 TA1 B 601
3J6G_B_TA1B502 3j6g TA1

DB01229
(Paclitaxel) 		Sus scrofa TUBULIN BETA CHAIN PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C) 		10 VAL B  23
ASP B  26
HIS B 229
LEU B 230
SER B 236
PHE B 272
THR B 276
GLN B 281
ARG B 369
LEU B 371
 TA1 B 502
3J6G_D_TA1D502 3j6g TA1

DB01229
(Paclitaxel) 		Sus scrofa TUBULIN BETA CHAIN no annotation 10 VAL D  23
ASP D  26
HIS D 229
LEU D 230
SER D 236
PHE D 272
THR D 276
GLN D 281
ARG D 369
LEU D 371
 TA1 D 502
3J6G_F_TA1F502 3j6g TA1

DB01229
(Paclitaxel) 		Sus scrofa TUBULIN BETA CHAIN no annotation 10 VAL F  23
ASP F  26
HIS F 229
LEU F 230
SER F 236
PHE F 272
THR F 276
GLN F 281
ARG F 369
LEU F 371
 TA1 F 502
3J6G_H_TA1H502 3j6g TA1

DB01229
(Paclitaxel) 		Sus scrofa TUBULIN BETA CHAIN no annotation 10 VAL H  23
ASP H  26
HIS H 229
LEU H 230
SER H 236
PHE H 272
THR H 276
GLN H 281
ARG H 369
LEU H 371
 TA1 H 502
3J6G_J_TA1J502 3j6g TA1

DB01229
(Paclitaxel) 		Sus scrofa TUBULIN BETA CHAIN no annotation 10 VAL J  23
ASP J  26
HIS J 229
LEU J 230
SER J 236
PHE J 272
THR J 276
GLN J 281
ARG J 369
LEU J 371
 TA1 J 502
3J6G_L_TA1L502 3j6g TA1

DB01229
(Paclitaxel) 		Sus scrofa TUBULIN BETA CHAIN no annotation 10 VAL L  23
ASP L  26
HIS L 229
LEU L 230
SER L 236
PHE L 272
THR L 276
GLN L 281
ARG L 369
LEU L 371
 TA1 L 502
3J6G_N_TA1N502 3j6g TA1

DB01229
(Paclitaxel) 		Sus scrofa TUBULIN BETA CHAIN no annotation 10 VAL N  23
ASP N  26
HIS N 229
LEU N 230
SER N 236
PHE N 272
THR N 276
GLN N 281
ARG N 369
LEU N 371
 TA1 N 502
3J6G_P_TA1P502 3j6g TA1

DB01229
(Paclitaxel) 		Sus scrofa TUBULIN BETA CHAIN no annotation 10 VAL P  23
ASP P  26
HIS P 229
LEU P 230
SER P 236
PHE P 272
THR P 276
GLN P 281
ARG P 369
LEU P 371
 TA1 P 502
3J6G_R_TA1R502 3j6g TA1

DB01229
(Paclitaxel) 		Sus scrofa TUBULIN BETA CHAIN no annotation 10 VAL R  23
ASP R  26
HIS R 229
LEU R 230
SER R 236
PHE R 272
THR R 276
GLN R 281
ARG R 369
LEU R 371
 TA1 R 502
3J6P_B_TA1B502 3j6p TA1

DB01229
(Paclitaxel) 		Sus scrofa TUBULIN BETA CHAIN PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C) 		13 VAL B  23
ASP B  26
GLU B  27
LEU B 217
HIS B 229
LEU B 230
SER B 236
PHE B 272
THR B 276
ARG B 278
PRO B 360
GLY B 370
LEU B 371
 TA1 B 502
3N23_A_OBNA1 3n23 OBN

DB01092
(Ouabain) 		Sus scrofa SODIUM/POTASSIUM-TRA
NSPORTING ATPASE
SUBUNIT ALPHA-1 		PF00122
(E1-E2_ATPase)
PF00689
(Cation_ATPase_C)
PF00690
(Cation_ATPase_N)
PF13246
(Cation_ATPase) 		11 GLN A 111
PRO A 118
ASP A 121
ASN A 122
VAL A 322
ALA A 323
PHE A 783
PHE A 786
THR A 797
ILE A 800
ARG A 880
 OBN A   1
3N23_C_OBNC1 3n23 OBN

DB01092
(Ouabain) 		Sus scrofa SODIUM/POTASSIUM-TRA
NSPORTING ATPASE
SUBUNIT ALPHA-1 		no annotation 11 GLN C 111
PRO C 118
ASP C 121
ASN C 122
LEU C 125
VAL C 322
ALA C 323
PHE C 783
PHE C 786
THR C 797
ARG C 880
 OBN C   1
3SFE_C_TMGC1 3sfe TMG

DB00730
(Thiabendazole) 		Sus scrofa SUCCINATE
DEHYDROGENASE
CYTOCHROME B560
SUBUNIT,
MITOCHONDRIAL;
SUCCINATE
DEHYDROGENASE
[UBIQUINONE]
IRON-SULFUR SUBUNIT,
MITOCHONDRIAL 		PF01127
(Sdh_cyt)
PF13085
(Fer2_3)
PF13534
(Fer4_17) 		8 TRP C  35
MET C  39
SER C  42
ILE C  43
ARG C  46
PRO B 169
HIS B 216
ILE B 218
 TMG C   1
4HYT_A_OBNA1104 4hyt OBN

DB01092
(Ouabain) 		Sus scrofa SODIUM/POTASSIUM-TRA
NSPORTING ATPASE
SUBUNIT ALPHA-1 		PF00122
(E1-E2_ATPase)
PF00689
(Cation_ATPase_C)
PF00690
(Cation_ATPase_N)
PF13246
(Cation_ATPase) 		17 GLN A 111
GLU A 117
PRO A 118
ASP A 121
ASN A 122
LEU A 125
GLU A 312
ILE A 315
GLY A 319
VAL A 322
ALA A 323
PHE A 783
PHE A 786
LEU A 793
THR A 797
ILE A 800
ARG A 880
 OBN A1104
4HYT_C_OBNC2004 4hyt OBN

DB01092
(Ouabain) 		Sus scrofa SODIUM/POTASSIUM-TRA
NSPORTING ATPASE
SUBUNIT ALPHA-1 		no annotation 16 GLN C 111
GLU C 117
PRO C 118
ASP C 121
ASN C 122
LEU C 125
GLU C 312
ILE C 315
GLY C 319
ALA C 323
PHE C 783
PHE C 786
LEU C 793
THR C 797
ILE C 800
ARG C 880
 OBN C2004
4RET_A_DGXA1107 4ret DGX

DB00390
(Digoxin) 		Sus scrofa SODIUM/POTASSIUM-TRA
NSPORTING ATPASE
SUBUNIT ALPHA-1 		PF00122
(E1-E2_ATPase)
PF00689
(Cation_ATPase_C)
PF00690
(Cation_ATPase_N)
PF13246
(Cation_ATPase) 		16 GLN A 111
ASP A 121
ASN A 122
LEU A 125
LEU A 311
GLU A 312
PHE A 316
GLY A 319
VAL A 322
ALA A 323
GLU A 327
PHE A 783
LEU A 793
THR A 797
ILE A 800
ARG A 880
 DGX A1107
4RET_C_DGXC2005 4ret DGX

DB00390
(Digoxin) 		Sus scrofa SODIUM/POTASSIUM-TRA
NSPORTING ATPASE
SUBUNIT ALPHA-1 		no annotation 16 GLN C 111
GLU C 117
ASP C 121
ASN C 122
LEU C 125
LEU C 311
GLU C 312
GLY C 319
VAL C 322
ALA C 323
GLU C 327
PHE C 783
LEU C 793
THR C 797
ILE C 800
ARG C 880
 DGX C2005
5BMV_C_VLBC507 5bmv VLB

DB00570
(Vinblastine) 		Bos taurus;
Sus scrofa 		TUBULIN ALPHA-1B
CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN 		PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C)
no annotation 		13 LYS B 176
ASP B 179
TYR B 210
PRO B 222
TYR B 224
LEU B 227
PRO C 325
VAL C 328
ASN C 329
ILE C 332
PHE C 351
VAL C 353
ILE C 355
 VLB C 507
5MM4_B_TA1B501 5mm4 TA1

DB01229
(Paclitaxel) 		Sus scrofa TUBULIN BETA CHAIN no annotation 10 VAL B  23
GLU B  27
LEU B 219
HIS B 229
ALA B 233
SER B 236
PHE B 272
THR B 276
PRO B 360
LEU B 371
 TA1 B 501
5OGC_B_TA1B601 5ogc TA1

DB01229
(Paclitaxel) 		Sus scrofa TUBULIN BETA CHAIN no annotation 14 VAL B  23
ASP B  26
GLU B  27
LEU B 217
HIS B 229
LEU B 230
SER B 236
PHE B 272
THR B 276
ARG B 278
PRO B 360
ARG B 369
GLY B 370
LEU B 371
 TA1 B 601
5SYE_B_TA1B502 5sye TA1

DB01229
(Paclitaxel) 		Sus scrofa TUBULIN BETA CHAIN PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C) 		14 GLU B  22
VAL B  23
ASP B  26
LEU B 217
ASP B 226
HIS B 229
ALA B 233
SER B 236
ARG B 278
GLN B 281
ARG B 320
PRO B 360
ARG B 369
GLY B 370
 TA1 B 502
5SYF_B_TA1B502 5syf TA1

DB01229
(Paclitaxel) 		Sus scrofa TUBULIN BETA CHAIN PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C) 		12 VAL B  23
ASP B  26
LEU B 217
ASP B 226
HIS B 229
ALA B 233
SER B 236
ARG B 278
GLN B 281
PRO B 360
ARG B 369
LEU B 371
 TA1 B 502
5XIW_B_LOCB504 5xiw LOC

DB01394
(Colchicine) 		Sus scrofa TUBULIN ALPHA-1B
CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN 		no annotation 17 SER A 178
ALA A 180
VAL A 181
CYS B 239
LEU B 240
LEU B 246
ALA B 248
LYS B 252
LEU B 253
ASN B 256
MET B 257
THR B 312
ALA B 314
ILE B 316
LYS B 350
ALA B 352
ILE B 368
 LOC B 504
5XIW_D_LOCD503 5xiw LOC

DB01394
(Colchicine) 		Sus scrofa TUBULIN ALPHA-1B
CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN 		no annotation 17 SER C 178
ALA C 180
VAL C 181
CYS D 239
LEU D 240
LEU D 246
ALA D 248
LYS D 252
LEU D 253
ASN D 256
MET D 257
THR D 312
ALA D 314
ILE D 316
LYS D 350
ALA D 352
ILE D 368
 LOC D 503
6B0C_D_TA1D502 6b0c TA1

DB01229
(Paclitaxel) 		Sus scrofa TUBULIN BETA CHAIN no annotation 14 VAL D  23
GLU D  27
LEU D 215
ASP D 224
HIS D 227
LEU D 228
ALA D 231
SER D 234
LEU D 273
THR D 274
ARG D 276
PRO D 358
GLY D 360
LEU D 361
 TA1 D 502
6B0I_B_TA1B502 6b0i TA1

DB01229
(Paclitaxel) 		Sus scrofa TUBULIN BETA CHAIN no annotation 13 VAL B  23
ASP B  26
LEU B 215
ASP B 224
HIS B 227
LEU B 228
ALA B 231
SER B 234
ARG B 276
PRO B 358
ARG B 359
GLY B 360
LEU B 361
 TA1 B 502
6B0L_B_TA1B502 6b0l TA1

DB01229
(Paclitaxel) 		Sus scrofa TUBULIN BETA CHAIN no annotation 13 VAL B  23
ASP B  26
LEU B 215
ASP B 224
HIS B 227
LEU B 228
SER B 234
THR B 274
ARG B 276
PRO B 358
ARG B 359
GLY B 360
LEU B 361
 TA1 B 502
6EW0_B_TA1B501 6ew0 TA1

DB01229
(Paclitaxel) 		Sus scrofa TUBULIN BETA CHAIN no annotation 17 VAL B  23
ASP B  26
GLU B  27
LEU B 215
LEU B 217
HIS B 227
LEU B 228
ALA B 231
SER B 234
LEU B 273
THR B 274
ARG B 276
GLN B 279
ARG B 318
PRO B 358
ARG B 359
LEU B 361
 TA1 B 501
6EW0_D_TA1D501 6ew0 TA1

DB01229
(Paclitaxel) 		Sus scrofa TUBULIN BETA CHAIN no annotation 17 VAL D  23
ASP D  26
GLU D  27
LEU D 215
LEU D 217
HIS D 227
LEU D 228
ALA D 231
SER D 234
LEU D 273
THR D 274
ARG D 276
GLN D 279
ARG D 318
PRO D 358
ARG D 359
LEU D 361
 TA1 D 501
6EW0_F_TA1F502 6ew0 TA1

DB01229
(Paclitaxel) 		Sus scrofa TUBULIN BETA CHAIN no annotation 17 VAL F  23
ASP F  26
GLU F  27
LEU F 215
LEU F 217
ASP F 224
HIS F 227
LEU F 228
ALA F 231
SER F 234
LEU F 273
THR F 274
ARG F 276
GLN F 279
PRO F 358
ARG F 359
LEU F 361
 TA1 F 502
6EW0_G_TA1G501 6ew0 TA1

DB01229
(Paclitaxel) 		Sus scrofa TUBULIN BETA CHAIN no annotation 18 VAL G  23
ASP G  26
GLU G  27
LEU G 215
LEU G 217
HIS G 227
LEU G 228
ALA G 231
SER G 234
PHE G 270
LEU G 273
THR G 274
ARG G 276
GLN G 279
ARG G 318
PRO G 358
ARG G 359
LEU G 361
 TA1 G 501
6EW0_H_TA1H501 6ew0 TA1

DB01229
(Paclitaxel) 		Sus scrofa TUBULIN BETA CHAIN no annotation 17 VAL H  23
ASP H  26
GLU H  27
LEU H 215
LEU H 217
HIS H 227
LEU H 228
ALA H 231
SER H 234
LEU H 273
THR H 274
ARG H 276
GLN H 279
ARG H 318
PRO H 358
ARG H 359
LEU H 361
 TA1 H 501
6EW0_I_TA1I501 6ew0 TA1

DB01229
(Paclitaxel) 		Sus scrofa TUBULIN BETA CHAIN no annotation 17 VAL I  23
ASP I  26
GLU I  27
LEU I 215
LEU I 217
HIS I 227
LEU I 228
ALA I 231
SER I 234
LEU I 273
THR I 274
ARG I 276
GLN I 279
ARG I 318
PRO I 358
ARG I 359
LEU I 361
 TA1 I 501