DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'Staphylococcus aureus'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1FFY_A_MRCA1993 1ffy MRC

DB00410
(Mupirocin) 		Staphylococcus
aureus 		ISOLEUCYL-TRNA
SYNTHETASE 		PF00133
(tRNA-synt_1)
PF06827
(zf-FPG_IleRS)
PF08264
(Anticodon_1) 		18 PRO A  56
PRO A  57
HIS A  64
GLY A  66
HIS A  67
ASN A  70
TRP A 528
SER A 531
GLU A 554
GLY A 555
ASP A 557
GLN A 558
TRP A 562
HIS A 585
PHE A 587
VAL A 588
MET A 596
LYS A 598
 MRC A1993
1GHM_A_CEDA1 1ghm CED

DB04133
(Degraded
Cephaloridine) 		Staphylococcus
aureus 		BETA-LACTAMASE PF13354
(Beta-lactamase2) 		14 ALA A  69
SER A  70
LYS A  73
TYR A 105
SER A 130
ASN A 132
ILE A 167
GLN A 170
LYS A 234
SER A 235
GLY A 236
GLN A 237
ILE A 239
ARG A 244
 CED A   1
1JTX_A_CVIA200 1jtx CVI

DB00406
(Gentian
Violet) 		Staphylococcus
aureus 		HYPOTHETICAL
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR IN QACA
5'REGION 		None
PF00440
(TetR_C_5)
PF08360
(TetR_N) 		16 TRP A  61
THR A  89
GLU A  90
TYR A  93
ILE A  99
ILE A 100
ILE B 100
TYR A 103
GLU A 120
TYR A 123
ILE A 124
ALA A 153
ASN A 154
ASN A 157
THR A 161
PHE B 162
 CVI A 200
1KNY_A_KANA558 1kny KAN

DB01172
(Kanamycin) 		Staphylococcus
aureus 		KANAMYCIN
NUCLEOTIDYLTRANSFERA
SE 		PF07827
(KNTase_C)
no annotation 		7 GLU B  67
GLU B  76
SER A  94
ASP A  95
GLU A 141
GLU A 142
GLU A 145
 KAN A 558
1KNY_B_KANB559 1kny KAN

DB01172
(Kanamycin) 		Staphylococcus
aureus 		KANAMYCIN
NUCLEOTIDYLTRANSFERA
SE 		PF07827
(KNTase_C)
no annotation 		8 GLU A  67
LYS A  74
GLU A  76
SER B  94
ASP B  95
GLU B 141
GLU B 142
GLU B 145
 KAN B 559
1NYR_A_THRA1004 1nyr THR

DB00156
(L-
Threonine) 		Staphylococcus
aureus 		THREONYL-TRNA
SYNTHETASE 1 		PF00587
(HGTP_anticodon)
PF02824
(tRNA_SAD)
PF03129
(TGS)
PF07973
(tRNA-synt_2b) 		10 MET A 334
CYS A 336
MET A 363
ARG A 365
LEU A 383
ASP A 385
HIS A 387
TYR A 468
GLN A 490
HIS A 517
 THR A1004
1NYR_B_THRB2004 1nyr THR

DB00156
(L-
Threonine) 		Staphylococcus
aureus 		THREONYL-TRNA
SYNTHETASE 1 		None 10 MET B 334
CYS B 336
MET B 363
ARG B 365
LEU B 383
ASP B 385
HIS B 387
TYR B 468
GLN B 490
HIS B 517
 THR B2004
1QU2_A_MRCA1993 1qu2 MRC

DB00410
(Mupirocin) 		Staphylococcus
aureus 		ISOLEUCYL-TRNA
SYNTHETASE 		PF00133
(tRNA-synt_1)
PF06827
(zf-FPG_IleRS)
PF08264
(Anticodon_1) 		15 PRO A  56
HIS A  64
GLY A  66
HIS A  67
SER A 531
GLU A 554
GLY A 555
ASP A 557
GLN A 558
TRP A 562
HIS A 585
PHE A 587
VAL A 588
MET A 596
LYS A 598
 MRC A1993
1QU3_A_MRCA993 1qu3 MRC

DB00410
(Mupirocin) 		Staphylococcus
aureus 		ISOLEUCYL-TRNA
SYNTHETASE 		PF00133
(tRNA-synt_1)
PF08264
(Anticodon_1) 		16 HIS A  64
GLY A  66
HIS A  67
ASN A  70
SER A 531
GLU A 554
ASP A 557
GLN A 558
TRP A 562
HIS A 585
PHE A 587
VAL A 588
LYS A 595
SER A 597
LYS A 598
VAL A 603
 MRC A 993
1QVT_A_PRLA311 1qvt PRL

DB01123
(Proflavine) 		Staphylococcus
aureus 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR QACR 		PF00440
(TetR_N)
PF08360
(TetR_C_5) 		8 LEU A  54
GLU A  57
GLU A  58
TRP A  61
THR A  89
TYR A  93
ILE A  99
TYR A 103
 PRL A 311
1QVU_A_PRLA196 1qvu PRL

DB01123
(Proflavine) 		Staphylococcus
aureus 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR QACR 		PF00440
(TetR_N)
PF08360
(TetR_C_5) 		6 LEU A  54
GLU A  58
TRP A  61
THR A  89
TYR A  93
TYR A 103
 PRL A 196
1RKW_A_PNTA225 1rkw PNT

DB00738
(Pentamidine) 		Staphylococcus
aureus 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR QACR 		PF00440
(TetR_C_5)
PF08360
(TetR_N) 		12 GLU A  57
LYS A  60
TRP A  61
GLN A  64
TYR A  82
SER A  86
THR A  89
GLU A  90
TYR A  93
TYR A 127
VAL A 156
ASN A 157
 PNT A 225
1TV8_A_SAMA1501 1tv8 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Staphylococcus
aureus 		MOLYBDENUM COFACTOR
BIOSYNTHESIS PROTEIN
A 		PF04055
(Radical_SAM)
PF06463
(Mob_synth_C) 		7 TYR A  30
THR A  73
GLU A  76
THR A 102
SER A 126
VAL A 167
MET A 197
 SAM A1501
1TV8_B_SAMB2501 1tv8 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Staphylococcus
aureus 		MOLYBDENUM COFACTOR
BIOSYNTHESIS PROTEIN
A 		None 7 TYR B  30
THR B  73
GLU B  76
THR B 102
SER B 126
VAL B 167
MET B 197
 SAM B2501
2FB2_A_SAMA501 2fb2 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Staphylococcus
aureus 		MOLYBDENUM COFACTOR
BIOSYNTHESIS PROTEIN
A 		PF04055
(Radical_SAM)
PF06463
(Mob_synth_C) 		8 TYR A  30
CYS A  31
THR A  73
GLU A  76
THR A 102
SER A 126
VAL A 167
MET A 197
 SAM A 501
2FB2_B_SAMB501 2fb2 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Staphylococcus
aureus 		MOLYBDENUM COFACTOR
BIOSYNTHESIS PROTEIN
A 		None 7 TYR B  30
THR B  73
GLU B  76
THR B 102
SER B 126
VAL B 167
MET B 197
 SAM B 501
2W9G_A_TOPA1159 2w9g TOP

DB00440
(Trimethoprim) 		Staphylococcus
aureus 		DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		10 LEU A   5
ALA A   7
LEU A  20
ASP A  27
LEU A  28
VAL A  31
SER A  49
ILE A  50
PHE A  92
THR A 111
 TOP A1159
2W9H_A_TOPA1160 2w9h TOP

DB00440
(Trimethoprim) 		Staphylococcus
aureus 		DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		10 LEU A   5
ALA A   7
LEU A  20
ASP A  27
LEU A  28
VAL A  31
SER A  49
ILE A  50
PHE A  92
THR A 111
 TOP A1160
2W9S_A_TOPA1160 2w9s TOP

DB00440
(Trimethoprim) 		Staphylococcus
aureus 		DIHYDROFOLATE
REDUCTASE TYPE 1
FROM TN4003 		PF00186
(DHFR_1) 		11 ILE A   5
ALA A   7
LEU A  20
ASP A  27
LEU A  28
ILE A  31
SER A  49
ILE A  50
PHE A  92
TYR A  98
THR A 111
 TOP A1160
2W9S_B_TOPB1160 2w9s TOP

DB00440
(Trimethoprim) 		Staphylococcus
aureus 		DIHYDROFOLATE
REDUCTASE TYPE 1
FROM TN4003 		no annotation 11 ILE B   5
ALA B   7
LEU B  20
ASP B  27
LEU B  28
ILE B  31
SER B  49
ILE B  50
PHE B  92
TYR B  98
THR B 111
 TOP B1160
2W9S_C_TOPC1160 2w9s TOP

DB00440
(Trimethoprim) 		Staphylococcus
aureus 		DIHYDROFOLATE
REDUCTASE TYPE 1
FROM TN4003 		no annotation 10 ILE C   5
ALA C   7
LEU C  20
ASP C  27
ILE C  31
SER C  49
ILE C  50
PHE C  92
TYR C  98
THR C 111
 TOP C1160
2W9S_D_TOPD1158 2w9s TOP

DB00440
(Trimethoprim) 		Staphylococcus
aureus 		DIHYDROFOLATE
REDUCTASE TYPE 1
FROM TN4003 		no annotation 10 ILE D   5
ALA D   7
LEU D  20
ASP D  27
LEU D  28
ILE D  31
SER D  49
PHE D  92
TYR D  98
THR D 111
 TOP D1158
2W9S_E_TOPE1160 2w9s TOP

DB00440
(Trimethoprim) 		Staphylococcus
aureus 		DIHYDROFOLATE
REDUCTASE TYPE 1
FROM TN4003 		no annotation 8 ILE E   5
ALA E   7
LEU E  20
ASP E  27
ILE E  31
PHE E  92
TYR E  98
THR E 111
 TOP E1160
2W9S_F_TOPF1159 2w9s TOP

DB00440
(Trimethoprim) 		Staphylococcus
aureus 		DIHYDROFOLATE
REDUCTASE TYPE 1
FROM TN4003 		no annotation 10 ILE F   5
ALA F   7
LEU F  20
ASP F  27
LEU F  28
ILE F  31
SER F  49
PHE F  92
TYR F  98
THR F 111
 TOP F1159
2XCT_G_CPFG1020 2xct CPF

DB00537
(Ciprofloxacin) 		Staphylococcus
aureus;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
B, DNA GYRASE
SUBUNIT A 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		3 ARG B 458
GLY B 459
SER B1084
 CPF G1020
2XCT_H_CPFH1020 2xct CPF

DB00537
(Ciprofloxacin) 		Staphylococcus
aureus;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
B, DNA GYRASE
SUBUNIT A 		no annotation 3 ARG D 458
GLU D 477
SER D1084
 CPF H1020
2XCT_X_CPFX1020 2xct CPF

DB00537
(Ciprofloxacin) 		Staphylococcus
aureus;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
B, DNA GYRASE
SUBUNIT A 		no annotation 4 ARG S 458
GLY S 459
GLU S 477
SER U1084
 CPF X1020
2Z2P_A_DOLA2002 2z2p DOL

DB01764
(Dalfopristin) 		Staphylococcus
aureus 		VIRGINIAMYCIN B
LYASE 		no annotation 5 LYS A  34
TRP A 243
SER A 266
GLU A 268
CYS A 285
 DOL A2002
2Z2P_B_DOLB2003 2z2p DOL

DB01764
(Dalfopristin) 		Staphylococcus
aureus 		VIRGINIAMYCIN B
LYASE 		no annotation 10 LYS B  34
PRO A 108
ASN A 109
ASN A 152
THR A 168
GLU A 169
TRP B 243
GLY B 244
SER B 266
GLU B 268
 DOL B2003
3FRB_X_TOPX300 3frb TOP

DB00440
(Trimethoprim) 		Staphylococcus
aureus 		DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		11 LEU X   5
ALA X   7
LEU X  20
ASP X  27
LEU X  28
VAL X  31
SER X  49
ILE X  50
PHE X  92
TYR X  98
THR X 111
 TOP X 300
3FRE_X_TOPX300 3fre TOP

DB00440
(Trimethoprim) 		Staphylococcus
aureus 		DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		9 ALA X   7
LEU X  20
ASP X  27
LEU X  28
VAL X  31
SER X  49
ILE X  50
PHE X  92
THR X 111
 TOP X 300
3J7Z_A_ERYA9000 3j7z ERY

DB00199
(Erythromycin) 		Escherichia coli;
Staphylococcus
aureus 		23S RRNA;
50S RIBOSOMAL
PROTEIN L22;
ERMCL NASCENT CHAIN 		PF00237
(Ribosomal_L22)
PF08253
(Leader_Erm) 		3 ILE a  81
PHE a  82
LYS S  90
 ERY A9000
3P5N_A_RBFA190 3p5n RBF

DB00140
(Riboflavin) 		Staphylococcus
aureus 		RIBOFLAVIN UPTAKE
PROTEIN 		PF12822
(ECF_trnsprt) 		16 LYS A  32
TYR A  41
LEU A  42
THR A  43
ASN A  74
ASP A  81
GLY A  84
ALA A  87
ASN A  88
ALA A  91
LEU A 127
ASN A 131
LEU A 138
PHE A 163
ASN A 164
LYS A 167
 RBF A 190
3P5N_B_RBFB190 3p5n RBF

DB00140
(Riboflavin) 		Staphylococcus
aureus 		RIBOFLAVIN UPTAKE
PROTEIN 		no annotation 16 LYS B  32
TYR B  41
LEU B  42
THR B  43
ASN B  74
ASP B  81
GLY B  84
ALA B  87
ASN B  88
ALA B  91
LEU B 127
ASN B 131
LEU B 138
PHE B 163
ASN B 164
LYS B 167
 RBF B 190
3PGY_A_GLYA510 3pgy GLY

DB00145
(Glycine) 		Staphylococcus
aureus 		SERINE
HYDROXYMETHYLTRANSFE
RASE 		None
PF00464
(SHMT) 		6 GLU A  27
ILE A  29
GLU A  32
PHE A  34
ASN B  49
ALA A 363
 GLY A 510
3PGY_B_GLYB509 3pgy GLY

DB00145
(Glycine) 		Staphylococcus
aureus 		SERINE
HYDROXYMETHYLTRANSFE
RASE 		None 4 PHE B  34
THR B 366
LEU B 410
TYR B 411
 GLY B 509
3PGY_B_GLYB511 3pgy GLY

DB00145
(Glycine) 		Staphylococcus
aureus 		SERINE
HYDROXYMETHYLTRANSFE
RASE 		None 5 SER B 334
GLU B 391
LEU B 394
GLN B 395
LYS B 398
 GLY B 511
4C5L_A_UEGA300 4c5l UEG

DB00165
(Pyridoxine) 		Staphylococcus
aureus 		PHOSPHOMETHYLPYRIMID
INE KINASE 		PF08543
(Phos_pyr_kin) 		11 GLY A  11
ASP A  13
ALA A  18
GLY A  19
VAL A  42
MET A  80
VAL A 107
CYS A 110
LYS A 111
HIS A 210
CYS A 214
 UEG A 300
4C5L_B_PXLB300 4c5l PXL

DB00147
(Pyridoxal) 		Staphylococcus
aureus 		PHOSPHOMETHYLPYRIMID
INE KINASE 		no annotation 9 GLY B  11
ASP B  13
ALA B  18
GLY B  19
VAL B  42
MET B  80
VAL B 107
HIS B 210
CYS B 214
 PXL B 300
4C5L_C_UEGC300 4c5l UEG

DB00165
(Pyridoxine) 		Staphylococcus
aureus 		PHOSPHOMETHYLPYRIMID
INE KINASE 		no annotation 10 GLY C  11
ASP C  13
ALA C  18
GLY C  19
VAL C  42
MET C  80
VAL C 107
CYS C 110
HIS C 210
CYS C 214
 UEG C 300
4C5L_D_UEGD300 4c5l UEG

DB00165
(Pyridoxine) 		Staphylococcus
aureus 		PHOSPHOMETHYLPYRIMID
INE KINASE 		no annotation 10 GLY D  11
ASP D  13
ALA D  18
GLY D  19
VAL D  42
MET D  80
VAL D 107
CYS D 110
HIS D 210
CYS D 214
 UEG D 300
4C5N_A_PXLA300 4c5n PXL

DB00147
(Pyridoxal) 		Staphylococcus
aureus 		PHOSPHOMETHYLPYRIMID
INE KINASE 		PF08543
(Phos_pyr_kin) 		7 GLY A  11
ASP A  13
GLY A  19
VAL A  42
MET A  80
HIS A 210
CYS A 214
 PXL A 300
4C5N_B_PXLB300 4c5n PXL

DB00147
(Pyridoxal) 		Staphylococcus
aureus 		PHOSPHOMETHYLPYRIMID
INE KINASE 		no annotation 10 GLY B  11
ASP B  13
ALA B  18
GLY B  19
VAL B  42
HIS B  51
MET B  80
VAL B 107
HIS B 210
CYS B 214
 PXL B 300
4C5N_C_PXLC300 4c5n PXL

DB00147
(Pyridoxal) 		Staphylococcus
aureus 		PHOSPHOMETHYLPYRIMID
INE KINASE 		no annotation 8 GLY C  11
ASP C  13
GLY C  19
VAL C  42
MET C  80
VAL C 107
HIS C 210
CYS C 214
 PXL C 300
4C5N_D_UEGD300 4c5n UEG

DB00165
(Pyridoxine) 		Staphylococcus
aureus 		PHOSPHOMETHYLPYRIMID
INE KINASE 		no annotation 10 GLY D  11
ASP D  13
ALA D  18
GLY D  19
VAL D  42
MET D  80
VAL D 107
CYS D 110
HIS D 210
CYS D 214
 UEG D 300
4EM0_B_KANB302 4em0 KAN

DB01172
(Kanamycin) 		Staphylococcus
aureus 		UNCHARACTERIZED
HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR SAR2349 		PF01047
(MarR) 		11 TYR B  52
TYR B  55
LEU B  56
THR B  59
TYR B  70
TRP B  73
LEU B  74
ARG B  77
ARG B  94
VAL B 145
GLN B 149
 KAN B 302
4EM0_B_SALB301 4em0 SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Staphylococcus
aureus 		UNCHARACTERIZED
HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR SAR2349 		PF01047
(MarR) 		4 ARG B 102
LYS B 106
ILE B 109
LYS B 123
 SAL B 301
4EM2_A_SALA501 4em2 SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Staphylococcus
aureus 		UNCHARACTERIZED
HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR SAR2349 		PF01047
(MarR) 		5 TYR A  52
LEU A  56
TYR A  70
LEU A  74
ARG A  77
 SAL A 501
4EM2_A_SALA502 4em2 SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Staphylococcus
aureus 		UNCHARACTERIZED
HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR SAR2349 		PF01047
(MarR) 		8 TYR A  55
THR A  59
LEU A  63
TRP A  73
ARG A  77
VAL A 141
VAL A 145
GLN A 149
 SAL A 502
4EM2_A_SALA503 4em2 SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Staphylococcus
aureus 		UNCHARACTERIZED
HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR SAR2349 		PF01047
(MarR) 		6 ARG A 102
LYS A 106
ILE A 109
VAL A 116
LYS A 123
LEU A 128
 SAL A 503
4EM2_A_SALA504 4em2 SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Staphylococcus
aureus 		UNCHARACTERIZED
HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR SAR2349 		PF01047
(MarR) 		8 PHE A  12
GLY A  71
LEU A  74
ILE A  75
ARG A  94
ILE A  96
THR A 100
THR A 104
 SAL A 504
4FAK_A_SAMA201 4fak SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Staphylococcus
aureus 		RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE H 		PF02590
(SPOUT_MTase) 		10 LEU A  76
ILE A  78
ILE A 107
GLY A 108
GLY A 112
PHE A 127
SER A 128
THR A 131
PHE A 132
MET A 137
 SAM A 201
4I90_A_ACTA500 4i90 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Staphylococcus
aureus 		1-PHOSPHATIDYLINOSIT
OL PHOSPHODIESTERASE 		PF00388
(PI-PLC-X) 		3 LYS A 113
ARG A 166
TRP A 185
 ACT A 500
4I90_A_ACTA501 4i90 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Staphylococcus
aureus 		1-PHOSPHATIDYLINOSIT
OL PHOSPHODIESTERASE 		PF00388
(PI-PLC-X) 		5 LEU A  37
LYS A  38
ASP A  39
LYS A  42
HIS A  86
 ACT A 501
4URN_A_NOVA2000 4urn NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Staphylococcus
aureus 		DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT 		PF02518
(HATPase_c)
no annotation 		14 ASP B  35
LYS B  36
ASN A  49
SER A  50
ASP A  52
GLU A  53
ASP A  76
ARG A  79
MET A  81
PRO A  82
ILE A  96
ARG A 138
THR A 168
ASN B 186
 NOV A2000
4URN_B_NOVB2000 4urn NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Staphylococcus
aureus 		DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT 		no annotation 11 ASN B  49
SER B  50
ASP B  52
GLU B  53
ASP B  76
ARG B  79
MET B  81
PRO B  82
ILE B  96
ARG B 138
THR B 168
 NOV B2000
4URN_C_NOVC2000 4urn NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Staphylococcus
aureus 		DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT 		no annotation 11 ASN C  49
SER C  50
ASP C  52
GLU C  53
ASP C  76
ARG C  79
MET C  81
PRO C  82
ILE C  96
ARG C 138
THR C 168
 NOV C2000
4URO_A_NOVA2000 4uro NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Staphylococcus
aureus 		DNA GYRASE SUBUNIT B PF02518
(HATPase_c)
no annotation 		15 ASN A  54
SER A  55
ASP A  57
GLU A  58
ASP A  81
ARG A  84
ILE A  86
PRO A  87
ASP A  89
GLN A  91
ILE A 102
SER A 128
ARG A 144
THR A 173
ARG D 200
 NOV A2000
4URO_B_NOVB2000 4uro NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Staphylococcus
aureus 		DNA GYRASE SUBUNIT B no annotation 13 ASN B  54
SER B  55
ASP B  57
GLU B  58
ASP B  81
ARG B  84
ILE B  86
PRO B  87
ASP B  89
GLN B  91
ILE B 102
SER B 128
ARG B 144
 NOV B2000
4URO_C_NOVC2000 4uro NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Staphylococcus
aureus 		DNA GYRASE SUBUNIT B no annotation 14 ASN C  54
ASP C  57
GLU C  58
ASP C  81
ARG C  84
ILE C  86
PRO C  87
ASP C  89
GLN C  91
ALA C  98
ILE C 102
SER C 128
ARG C 144
THR C 173
 NOV C2000
4URO_D_NOVD2000 4uro NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Staphylococcus
aureus 		DNA GYRASE SUBUNIT B no annotation 12 ASN D  54
SER D  55
GLU D  58
ASP D  81
ARG D  84
ILE D  86
PRO D  87
ASP D  89
ILE D 102
SER D 128
ARG D 144
THR D 173
 NOV D2000
5CDN_G_EVPG2101 5cdn EVP

DB00773
(Etoposide) 		Staphylococcus
aureus;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B,DNA GYRASE SUBUNIT
B 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		6 SER A  84
GLU A  88
GLY B 436
ASP B 437
ARG B 458
GLY B 459
 EVP G2101
5CDN_N_EVPN2101 5cdn EVP

DB00773
(Etoposide) 		Staphylococcus
aureus;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B,DNA GYRASE SUBUNIT
B 		no annotation 6 SER R  84
GLU R  88
GLY S 436
ASP S 437
ARG S 458
GLY S 459
 EVP N2101
5CDN_O_EVPO2101 5cdn EVP

DB00773
(Etoposide) 		Staphylococcus
aureus;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B,DNA GYRASE SUBUNIT
B 		no annotation 6 SER C  84
GLU C  88
GLY D 436
ASP D 437
ARG D 458
GLY D 459
 EVP O2101
5CDN_P_EVPP2101 5cdn EVP

DB00773
(Etoposide) 		Staphylococcus
aureus;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B,DNA GYRASE SUBUNIT
B 		no annotation 6 SER T  84
GLU T  88
GLY U 436
ASP U 437
ARG U 458
GLY U 459
 EVP P2101
5CDP_H_EVPH2101 5cdp EVP

DB00773
(Etoposide) 		Staphylococcus
aureus;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT B 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		6 SER A  84
GLU A  88
GLY B 436
ASP B 437
ARG B 458
GLY B 459
 EVP H2101
5CDQ_E_MFXE2101 5cdq MFX

DB00218
(Moxifloxacin) 		Staphylococcus
aureus;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B,DNA GYRASE SUBUNIT
B 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		5 SER A  84
ARG C 122
ARG B 458
GLY B 459
GLU B 477
 MFX E2101
5CDQ_F_MFXF2101 5cdq MFX

DB00218
(Moxifloxacin) 		Staphylococcus
aureus;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B,DNA GYRASE SUBUNIT
B 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
no annotation 		6 SER C  84
ARG A 122
ASP D 437
ARG D 458
GLY D 459
GLU D 477
 MFX F2101
5CDQ_V_MFXV2101 5cdq MFX

DB00218
(Moxifloxacin) 		Staphylococcus
aureus;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B,DNA GYRASE SUBUNIT
B 		no annotation 5 SER R  84
ARG T 122
ARG S 458
GLY S 459
GLU S 477
 MFX V2101
5CDQ_W_MFXW2101 5cdq MFX

DB00218
(Moxifloxacin) 		Staphylococcus
aureus;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B,DNA GYRASE SUBUNIT
B 		no annotation 5 SER T  84
ARG R 122
ASP U 437
ARG U 458
GLU U 477
 MFX W2101
5IQB_A_KANA600 5iqb KAN

DB01172
(Kanamycin) 		Staphylococcus
aureus 		BIFUNCTIONAL AAC/APH PF01636
(APH) 		12 ASP A 374
SER A 376
ASN A 378
ASP A 396
TYR A 408
GLU A 411
SER A 413
GLU A 415
GLU A 416
GLU A 445
TYR A 448
GLU A 451
 KAN A 600
5IQB_B_KANB600 5iqb KAN

DB01172
(Kanamycin) 		Staphylococcus
aureus 		BIFUNCTIONAL AAC/APH no annotation 11 ASP B 374
SER B 376
ASN B 378
ASP B 396
TYR B 408
GLU B 411
GLU B 415
GLU B 416
GLU B 445
TYR B 448
GLU B 451
 KAN B 600
5IQB_C_KANC600 5iqb KAN

DB01172
(Kanamycin) 		Staphylococcus
aureus 		BIFUNCTIONAL AAC/APH no annotation 11 ASP C 374
SER C 376
ASN C 378
ASP C 396
TYR C 408
GLU C 411
GLU C 415
GLU C 416
GLU C 445
TYR C 448
GLU C 451
 KAN C 600
5IQB_D_KAND600 5iqb KAN

DB01172
(Kanamycin) 		Staphylococcus
aureus 		BIFUNCTIONAL AAC/APH no annotation 12 ASP D 374
SER D 376
ASN D 378
ASP D 396
TYR D 408
GLU D 411
SER D 413
GLU D 415
GLU D 416
GLU D 445
TYR D 448
GLU D 451
 KAN D 600
5IQC_A_51GA600 5iqc 51G

DB00798
(Gentamicin) 		Staphylococcus
aureus 		BIFUNCTIONAL AAC/APH PF01636
(APH) 		10 ASP A 374
SER A 376
ASP A 396
TYR A 408
GLU A 411
GLU A 415
GLU A 416
GLU A 445
TYR A 448
GLU A 451
 51G A 600
5IQC_B_51GB600 5iqc 51G

DB00798
(Gentamicin) 		Staphylococcus
aureus 		BIFUNCTIONAL AAC/APH no annotation 10 ASP B 374
SER B 376
ASP B 396
TYR B 408
GLU B 411
GLU B 415
GLU B 416
GLU B 445
TYR B 448
GLU B 451
 51G B 600
5IQC_C_51GC600 5iqc 51G

DB00798
(Gentamicin) 		Staphylococcus
aureus 		BIFUNCTIONAL AAC/APH no annotation 10 ASP C 374
SER C 376
ASP C 396
TYR C 408
GLU C 411
GLU C 415
GLU C 416
GLU C 445
TYR C 448
GLU C 451
 51G C 600
5IQC_D_51GD600 5iqc 51G

DB00798
(Gentamicin) 		Staphylococcus
aureus 		BIFUNCTIONAL AAC/APH no annotation 10 ASP D 374
SER D 376
ASP D 396
TYR D 408
GLU D 411
GLU D 415
GLU D 416
GLU D 445
TYR D 448
GLU D 451
 51G D 600
5IQD_A_RIOA600 5iqd RIO

DB03615
(Ribostamycin) 		Staphylococcus
aureus 		BIFUNCTIONAL AAC/APH PF01636
(APH) 		11 ASP A 374
SER A 376
TYR A 408
GLU A 411
SER A 413
GLU A 415
GLU A 416
VAL A 444
GLU A 445
TYR A 448
GLU A 451
 RIO A 600
5IQD_B_RIOB600 5iqd RIO

DB03615
(Ribostamycin) 		Staphylococcus
aureus 		BIFUNCTIONAL AAC/APH None 11 ASP B 374
SER B 376
TYR B 408
GLU B 411
SER B 413
GLU B 415
GLU B 416
VAL B 444
GLU B 445
TYR B 448
GLU B 451
 RIO B 600
5IQD_C_RIOC600 5iqd RIO

DB03615
(Ribostamycin) 		Staphylococcus
aureus 		BIFUNCTIONAL AAC/APH None 12 ASP C 374
SER C 376
ASN C 378
TYR C 408
GLU C 411
SER C 413
GLU C 415
GLU C 416
VAL C 444
GLU C 445
TYR C 448
GLU C 451
 RIO C 600
5IQD_D_RIOD600 5iqd RIO

DB03615
(Ribostamycin) 		Staphylococcus
aureus 		BIFUNCTIONAL AAC/APH None 11 ASP D 374
SER D 376
TYR D 408
GLU D 411
SER D 413
GLU D 415
GLU D 416
VAL D 444
GLU D 445
TYR D 448
GLU D 451
 RIO D 600
5IQE_A_NMYA600 5iqe NMY

DB00452
(Framycetin)
DB00994
(Neomycin) 		Staphylococcus
aureus 		BIFUNCTIONAL AAC/APH PF01636
(APH) 		11 ASP A 374
SER A 376
ASP A 396
TYR A 408
GLU A 411
SER A 413
GLU A 415
GLU A 416
GLU A 445
TYR A 448
GLU A 451
 NMY A 600
5IQE_B_NMYB600 5iqe NMY

DB00452
(Framycetin)
DB00994
(Neomycin) 		Staphylococcus
aureus 		BIFUNCTIONAL AAC/APH no annotation 10 ASP B 374
SER B 376
ASP B 396
TYR B 408
GLU B 411
GLU B 415
GLU B 416
GLU B 445
TYR B 448
GLU B 451
 NMY B 600
5IQE_C_NMYC600 5iqe NMY

DB00452
(Framycetin)
DB00994
(Neomycin) 		Staphylococcus
aureus 		BIFUNCTIONAL AAC/APH no annotation 12 ASP C 374
SER C 376
ASN C 378
ASP C 396
TYR C 408
GLU C 411
SER C 413
GLU C 415
GLU C 416
GLU C 445
TYR C 448
GLU C 451
 NMY C 600
5IQE_D_NMYD600 5iqe NMY

DB00452
(Framycetin)
DB00994
(Neomycin) 		Staphylococcus
aureus 		BIFUNCTIONAL AAC/APH no annotation 12 ASP D 374
SER D 376
ASN D 378
ASP D 396
TYR D 408
GLU D 411
SER D 413
GLU D 415
GLU D 416
GLU D 445
TYR D 448
GLU D 451
 NMY D 600
5IQG_A_51GA600 5iqg 51G

DB00798
(Gentamicin) 		Staphylococcus
aureus 		BIFUNCTIONAL AAC/APH PF01636
(APH) 		10 ASP A 374
SER A 376
ASP A 396
TYR A 408
GLU A 411
GLU A 415
GLU A 416
GLU A 445
TYR A 448
GLU A 451
 51G A 600
5IQG_B_51GB600 5iqg 51G

DB00798
(Gentamicin) 		Staphylococcus
aureus 		BIFUNCTIONAL AAC/APH no annotation 10 ASP B 374
SER B 376
ASP B 396
TYR B 408
GLU B 411
GLU B 415
GLU B 416
GLU B 445
TYR B 448
GLU B 451
 51G B 600
5IQG_C_51GC600 5iqg 51G

DB00798
(Gentamicin) 		Staphylococcus
aureus 		BIFUNCTIONAL AAC/APH no annotation 10 ASP C 374
SER C 376
ASP C 396
TYR C 408
GLU C 411
GLU C 415
GLU C 416
GLU C 445
TYR C 448
GLU C 451
 51G C 600
5IQG_D_51GD600 5iqg 51G

DB00798
(Gentamicin) 		Staphylococcus
aureus 		BIFUNCTIONAL AAC/APH no annotation 10 ASP D 374
SER D 376
ASP D 396
TYR D 408
GLU D 411
GLU D 415
GLU D 416
GLU D 445
TYR D 448
GLU D 451
 51G D 600
6C5U_A_RIOA600 6c5u RIO

DB03615
(Ribostamycin) 		Staphylococcus
aureus 		BIFUNCTIONAL AAC/APH PF01636
(APH) 		10 ASP A 374
SER A 376
ASN A 378
TYR A 408
GLU A 411
SER A 413
GLU A 415
GLU A 416
GLU A 445
TYR A 448
 RIO A 600
6C5U_B_RIOB600 6c5u RIO

DB03615
(Ribostamycin) 		Staphylococcus
aureus 		BIFUNCTIONAL AAC/APH None 9 ASP B 374
SER B 376
TYR B 408
GLU B 411
SER B 413
GLU B 415
GLU B 416
GLU B 445
TYR B 448
 RIO B 600
6C5U_D_RIOD600 6c5u RIO

DB03615
(Ribostamycin) 		Staphylococcus
aureus 		BIFUNCTIONAL AAC/APH None 10 ASP D 374
SER D 376
ASN D 378
TYR D 408
GLU D 411
SER D 413
GLU D 415
GLU D 416
GLU D 445
TYR D 448
 RIO D 600
6CGD_A_AKNA600 6cgd AKN

DB00479
(Amikacin) 		Staphylococcus
aureus 		BIFUNCTIONAL AAC/APH no annotation 10 GLY A 211
TYR A 212
ASP A 374
ASP A 396
TYR A 408
GLU A 411
VAL A 444
GLU A 445
TYR A 448
GLU A 451
 AKN A 600
6CGD_D_AKND600 6cgd AKN

DB00479
(Amikacin) 		Staphylococcus
aureus 		BIFUNCTIONAL AAC/APH no annotation 11 ASP D 374
SER D 376
ASN D 378
HIS D 379
ASP D 396
TYR D 408
GLU D 411
GLU D 415
GLU D 416
TYR D 448
GLU D 451
 AKN D 600
6CGG_B_84GB600 6cgg 84G

DB06696
(Arbekacin) 		Staphylococcus
aureus 		BIFUNCTIONAL AAC/APH None 10 ASP B 374
SER B 376
ASN B 378
HIS B 379
TYR B 408
GLU B 411
GLU B 415
GLU B 416
GLU B 445
GLU B 451
 84G B 600
6CGG_D_84GD600 6cgg 84G

DB06696
(Arbekacin) 		Staphylococcus
aureus 		BIFUNCTIONAL AAC/APH None 11 ASP D 374
SER D 376
ASN D 378
HIS D 379
TYR D 408
GLU D 411
GLU D 415
GLU D 416
GLU D 445
TYR D 448
GLU D 451
 84G D 600
6H3D_A_DHIA601 6h3d DHI

DB00117
(L-
Histidine) 		Staphylococcus
aureus 		DUF2338
DOMAIN-CONTAINING
PROTEIN 		None 5 TYR A 240
ASN A 285
TYR A 286
ARG A 316
PHE A 337
 DHI A 601