DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'Pyrococcus'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1JG2_A_ADNA500 1jg2 ADN

DB00640
(Adenosine)
Pyrococcus
furiosus
PROTEIN-L-ISOASPARTA
TE
O-METHYLTRANSFERASE
PF01135
(PCMT)
13 GLN A  72
GLY A  99
GLY A 101
GLU A 121
ARG A 122
ILE A 123
LEU A 126
ASP A 148
GLY A 149
THR A 165
ALA A 166
VAL A 219
LEU A 221
ADN A 500
1JG3_A_ADNA500 1jg3 ADN

DB00640
(Adenosine)
Pyrococcus
furiosus
PROTEIN-L-ISOASPARTA
TE
O-METHYLTRANSFERASE
PF01135
(PCMT)
11 GLN A  72
GLY A  99
GLY A 101
GLU A 121
ARG A 122
ILE A 123
LEU A 126
ASP A 148
GLY A 149
THR A 165
LEU A 221
ADN A 500
1JG3_B_ADNB550 1jg3 ADN

DB00640
(Adenosine)
Pyrococcus
furiosus
PROTEIN-L-ISOASPARTA
TE
O-METHYLTRANSFERASE
no annotation 11 GLN B  72
GLY B  99
GLY B 101
GLU B 121
ARG B 122
ILE B 123
LEU B 126
ASP B 148
GLY B 149
THR B 165
LEU B 221
ADN B 550
1JG4_A_SAMA500 1jg4 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Pyrococcus
furiosus
PROTEIN-L-ISOASPARTA
TE
O-METHYLTRANSFERASE
PF01135
(PCMT)
20 GLN A  72
THR A  73
VAL A  74
SER A  75
GLU A  97
GLY A  99
GLY A 101
SER A 102
TRP A 104
ASN A 105
GLU A 121
ARG A 122
ILE A 123
LEU A 126
ASP A 148
GLY A 149
THR A 165
ALA A 166
VAL A 219
LEU A 221
SAM A 500
1MXD_A_ACRA732 1mxd ACR

DB00284
(Acarbose)
Pyrococcus woesei ALPHA AMYLASE PF00128
(Alpha-amylase)
PF09154
(DUF1939)
9 GLY A   9
LYS A 241
PRO A 278
GLU A 307
GLY A 308
GLY A 338
GLY A 339
ASP A 358
ARG A 361
ACR A 732
1MXD_A_ACRA733 1mxd ACR

DB00284
(Acarbose)
Pyrococcus woesei ALPHA AMYLASE PF00128
(Alpha-amylase)
PF09154
(DUF1939)
6 SER A 132
THR A 140
ASN A 142
LEU A 144
ASP A 145
TRP A 171
ACR A 733
1MXD_A_ACRA734 1mxd ACR

DB00284
(Acarbose)
Pyrococcus woesei ALPHA AMYLASE PF00128
(Alpha-amylase)
PF09154
(DUF1939)
6 ASN A 328
TRP A 331
HIS A 390
TYR A 392
GLY A 394
TRP A 399
ACR A 734
1MXD_A_ACRA735 1mxd ACR

DB00284
(Acarbose)
Pyrococcus woesei ALPHA AMYLASE PF00128
(Alpha-amylase)
PF09154
(DUF1939)
12 TRP A  18
TYR A  62
HIS A 111
PHE A 159
ARG A 196
ASP A 198
TYR A 199
LYS A 201
GLU A 222
TRP A 224
HIS A 288
ASP A 289
ACR A 735
1MXG_A_ACRA442 1mxg ACR

DB00284
(Acarbose)
Pyrococcus woesei ALPHA AMYLASE PF00128
(Alpha-amylase)
PF09154
(DUF1939)
11 GLY A   9
LYS A 241
PRO A 278
PHE A 279
GLU A 307
GLY A 308
GLN A 309
GLY A 338
GLY A 339
ASP A 358
ARG A 361
ACR A 442
1MXG_A_ACRA443 1mxg ACR

DB00284
(Acarbose)
Pyrococcus woesei ALPHA AMYLASE PF00128
(Alpha-amylase)
PF09154
(DUF1939)
8 SER A 132
THR A 140
ASN A 142
LEU A 144
ASP A 145
GLU A 150
LYS A 169
TRP A 171
ACR A 443
1MXG_A_ACRA444 1mxg ACR

DB00284
(Acarbose)
Pyrococcus woesei ALPHA AMYLASE PF00128
(Alpha-amylase)
PF09154
(DUF1939)
7 TYR A   3
ASN A 328
TRP A 331
HIS A 390
TYR A 392
GLY A 394
TRP A 399
ACR A 444
1VE3_A_SAMA302 1ve3 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Pyrococcus
horikoshii
HYPOTHETICAL PROTEIN
PH0226
PF13649
(Methyltransf_25)
16 TYR A   7
TYR A  13
TYR A  21
ARG A  24
ALA A  46
GLY A  48
ASP A  67
ILE A  68
SER A  69
ASP A  93
ALA A  94
ARG A  95
ILE A 110
SER A 112
HIS A 115
PHE A 116
SAM A 302
1VE3_B_SAMB301 1ve3 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Pyrococcus
horikoshii
HYPOTHETICAL PROTEIN
PH0226
None 16 TYR B   7
TYR B  13
TYR B  21
ARG B  24
ALA B  46
GLY B  48
ASP B  67
ILE B  68
SER B  69
ASP B  93
ALA B  94
ARG B  95
ILE B 110
SER B 112
HIS B 115
PHE B 116
SAM B 301
1WU8_A_ADNA500 1wu8 ADN

DB00640
(Adenosine)
Pyrococcus
horikoshii
HYPOTHETICAL PROTEIN
PH0463
PF01887
(SAM_adeno_trans)
no annotation
9 ASP A   7
ARG A  40
HIS A  41
ASP A  68
VAL A  71
PHE B 181
ASN B 183
TYR B 212
ASN B 235
ADN A 500
1WU8_B_ADNB501 1wu8 ADN

DB00640
(Adenosine)
Pyrococcus
horikoshii
HYPOTHETICAL PROTEIN
PH0463
no annotation 11 ASP B   7
ARG B  40
HIS B  41
ILE B  67
ASP B  68
PRO B  69
VAL B  71
PHE C 181
ASN C 183
TYR C 212
ASN C 235
ADN B 501
1WU8_C_ADNC502 1wu8 ADN

DB00640
(Adenosine)
Pyrococcus
horikoshii
HYPOTHETICAL PROTEIN
PH0463
PF01887
(SAM_adeno_trans)
no annotation
7 ARG C  40
HIS C  41
VAL C  71
PHE A 181
ASN A 183
TYR A 212
ASN A 235
ADN C 502
2DTT_A_H4BA1003 2dtt H4B

DB00360
(Sapropterin)
Pyrococcus
horikoshii
HYPOTHETICAL PROTEIN
PH0634
PF01242
(PTPS)
no annotation
10 HIS A  15
HIS A  27
HIS A  29
TYR C  45
ASP C  48
PHE C  49
THR A  76
THR A  77
GLU A  78
GLU A 105
H4B A1003
2DTT_B_H4BB1001 2dtt H4B

DB00360
(Sapropterin)
Pyrococcus
horikoshii
HYPOTHETICAL PROTEIN
PH0634
PF01242
(PTPS)
no annotation
10 ILE A   5
GLU B  24
HIS B  27
TYR A  45
ASP A  48
PHE A  49
THR B  76
THR B  77
GLU B  78
GLU B 105
H4B B1001
2DTT_C_H4BC1002 2dtt H4B

DB00360
(Sapropterin)
Pyrococcus
horikoshii
HYPOTHETICAL PROTEIN
PH0634
no annotation 6 TYR B  45
ASP B  48
PHE B  49
THR C  77
GLU C  78
GLU C 105
H4B C1002
2DTT_D_H4BD1006 2dtt H4B

DB00360
(Sapropterin)
Pyrococcus
horikoshii
HYPOTHETICAL PROTEIN
PH0634
no annotation 10 HIS D  15
HIS D  27
HIS D  29
TYR F  45
ASP F  48
PHE F  49
THR D  76
THR D  77
GLU D  78
GLU D 105
H4B D1006
2DTT_E_H4BE1004 2dtt H4B

DB00360
(Sapropterin)
Pyrococcus
horikoshii
HYPOTHETICAL PROTEIN
PH0634
no annotation 11 HIS E  15
VAL E  17
HIS E  27
HIS E  29
TYR D  45
PHE D  49
LEU D  50
THR E  76
THR E  77
GLU E  78
GLU E 105
H4B E1004
2DTT_F_H4BF1005 2dtt H4B

DB00360
(Sapropterin)
Pyrococcus
horikoshii
HYPOTHETICAL PROTEIN
PH0634
no annotation 9 ILE E   5
HIS F  29
TYR E  45
ASP E  48
PHE E  49
THR F  76
THR F  77
GLU F  78
GLU F 105
H4B F1005
2EJF_A_ADNA2001 2ejf ADN

DB00640
(Adenosine)
Pyrococcus
horikoshii
235AA LONG
HYPOTHETICAL
BIOTIN--[ACETYL-COA-
CARBOXYLASE] LIGASE
PF02237
(BPL_C)
PF03099
(BPL_LplA_LipB)
7 ARG A  51
TRP A  53
GLU A  54
ALA A 111
ASN A 131
PRO A 137
ALA A 140
ADN A2001
2EJF_B_ADNB2002 2ejf ADN

DB00640
(Adenosine)
Pyrococcus
horikoshii
235AA LONG
HYPOTHETICAL
BIOTIN--[ACETYL-COA-
CARBOXYLASE] LIGASE
no annotation 6 ARG B  51
TRP B  53
GLU B  54
ASN B 131
PRO B 137
ALA B 140
ADN B2002
2EJG_A_ADNA1501 2ejg ADN

DB00640
(Adenosine)
Pyrococcus
horikoshii
235AA LONG
HYPOTHETICAL
BIOTIN--[ACETYL-COA-
CARBOXYLASE] LIGASE
PF02237
(BPL_C)
PF03099
(BPL_LplA_LipB)
7 ARG A  51
TRP A  53
GLU A  54
LYS A 111
ASN A 131
PRO A 137
ALA A 140
ADN A1501
2EJG_B_ADNB1502 2ejg ADN

DB00640
(Adenosine)
Pyrococcus
horikoshii
235AA LONG
HYPOTHETICAL
BIOTIN--[ACETYL-COA-
CARBOXYLASE] LIGASE
no annotation 7 ARG B  51
TRP B  53
GLU B  54
LYS B 111
ASN B 131
PRO B 137
ALA B 140
ADN B1502
2EJT_A_SAMA501 2ejt SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Pyrococcus
horikoshii
N(2),N(2)-DIMETHYLGU
ANOSINE TRNA
METHYLTRANSFERASE
PF02005
(TRM)
15 ARG A  36
ASP A  53
LEU A  55
ALA A  57
ILE A  60
ARG A  61
ASN A  77
ASP A  78
ILE A  79
SER A  80
ASP A 120
ALA A 121
ASP A 138
PHE A 140
PHE A 146
SAM A 501
2R6V_A_NCAA174 2r6v NCA

DB02701
(Nicotinamide)
Pyrococcus
horikoshii
UNCHARACTERIZED
PROTEIN PH0856
PF01613
(Flavin_Reduct)
6 HIS A  -7
TYR A   8
ASP A  29
TRP A  30
ARG A  49
HIS A 124
NCA A 174
2YY8_B_SAMB500 2yy8 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Pyrococcus
horikoshii
UPF0106 PROTEIN
PH0461
None
PF01994
(Trm56)
11 HIS A  20
LEU B  80
MET B  82
VAL B 108
GLY B 109
LYS B 112
VAL B 113
ILE B 127
HIS B 132
GLU B 134
ALA B 137
SAM B 500
2YZQ_A_SAMA6075 2yzq SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Pyrococcus
horikoshii
PUTATIVE
UNCHARACTERIZED
PROTEIN PH1780
PF00571
(CBS)
13 MET A 158
ILE A 172
ASP A 174
THR A 176
ASP A 177
ARG A 180
THR A 228
VAL A 231
ILE A 232
ILE A 252
GLU A 253
GLN A 254
PRO A 256
SAM A6075
2ZGW_A_ADNA1301 2zgw ADN

DB00640
(Adenosine)
Pyrococcus
horikoshii
BIOTIN--[ACETYL-COA-
CARBOXYLASE] LIGASE
PF02237
(BPL_C)
PF03099
(BPL_LplA_LipB)
7 ARG A  51
TRP A  53
GLU A  54
ALA A 111
ASN A 131
PRO A 137
ALA A 140
ADN A1301
2ZGW_B_ADNB1302 2zgw ADN

DB00640
(Adenosine)
Pyrococcus
horikoshii
BIOTIN--[ACETYL-COA-
CARBOXYLASE] LIGASE
no annotation 6 TRP B  53
GLU B  54
ALA B 111
ASN B 131
PRO B 137
ALA B 140
ADN B1302
3A25_A_SAMA279 3a25 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Pyrococcus
horikoshii
UNCHARACTERIZED
PROTEIN PH0793
PF02475
(Met_10)
15 MET A 107
SER A 109
ASN A 112
ARG A 116
PHE A 133
GLY A 135
HIS A 138
ILE A 154
GLU A 155
LYS A 156
ASP A 157
THR A 160
ASP A 183
ASN A 184
PHE A 207
SAM A 279
3MB5_A_SAMA301 3mb5 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Pyrococcus abyssi SAM-DEPENDENT
METHYLTRANSFERASE
PF08704
(GCD14)
PF14801
(GCD14_N)
16 ILE A  76
VAL A  77
GLY A 101
GLY A 103
SER A 104
ALA A 106
LEU A 107
GLU A 125
ILE A 126
ARG A 127
ASP A 153
ILE A 154
TYR A 155
ASP A 169
LEU A 170
PRO A 171
SAM A 301
3NMU_F_SAMF228 3nmu SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Pyrococcus
furiosus
FIBRILLARIN-LIKE
RRNA/TRNA
2'-O-METHYLTRANSFERA
SE;
NOP5/NOP56 RELATED
PROTEIN
PF01269
(Fibrillarin)
PF01798
(Nop)
12 LYS F  57
GLY F  81
ALA F  83
GLU F 105
PHE F 106
SER F 107
ASP F 130
ALA F 131
ASP F 150
GLN F 153
GLU A 352
TYR A 353
SAM F 228
3NMU_J_SAMJ228 3nmu SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Pyrococcus
furiosus
FIBRILLARIN-LIKE
RRNA/TRNA
2'-O-METHYLTRANSFERA
SE;
NOP5/NOP56 RELATED
PROTEIN
None 11 LYS J  57
GLY J  81
ALA J  83
ILE J 104
GLU J 105
PHE J 106
ALA J 131
ASP J 150
GLN J 153
GLU B 352
TYR B 353
SAM J 228
3NVK_I_SAMI228 3nvk SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Pyrococcus
furiosus
FIBRILLARIN-LIKE
RRNA/TRNA
2'-O-METHYLTRANSFERA
SE;
NOP5/NOP56 RELATED
PROTEIN
PF01269
(Fibrillarin)
PF01798
(Nop)
15 LYS I  57
GLY I  81
ALA I  83
THR I  87
ILE I 104
GLU I 105
PHE I 106
ASP I 130
ALA I 131
ASP I 150
VAL I 151
GLN I 153
GLU I 216
GLU A 352
TYR A 353
SAM I 228
3NVK_J_SAMJ228 3nvk SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Pyrococcus
furiosus
FIBRILLARIN-LIKE
RRNA/TRNA
2'-O-METHYLTRANSFERA
SE;
NOP5/NOP56 RELATED
PROTEIN
None 12 LYS J  57
GLY J  81
ALA J  83
GLU J 105
PHE J 106
ASP J 130
ALA J 131
ASP J 150
VAL J 151
GLN J 153
GLU F 352
TYR F 353
SAM J 228
3TM4_A_SAMA401 3tm4 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Pyrococcus
furiosus
TRNA (GUANINE
N2-)-METHYLTRANSFERA
SE TRM14
PF01170
(THUMP)
PF02926
(UPF0020)
17 HIS A 198
ALA A 200
HIS A 201
LEU A 202
MET A 225
GLY A 227
SER A 228
THR A 230
GLU A 248
LYS A 249
TYR A 250
HIS A 253
ASP A 276
ALA A 277
ASN A 293
PRO A 295
LEU A 309
SAM A 401
3TM4_B_SAMB401 3tm4 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Pyrococcus
furiosus
TRNA (GUANINE
N2-)-METHYLTRANSFERA
SE TRM14
None 17 HIS B 198
ALA B 200
HIS B 201
LEU B 202
MET B 225
GLY B 227
SER B 228
THR B 230
GLU B 248
LYS B 249
TYR B 250
HIS B 253
ASP B 276
ALA B 277
ASN B 293
PRO B 295
LEU B 309
SAM B 401
3ZOD_A_HQEA1173 3zod HQE

DB09526
(Hydroquinone)
Pyrococcus
horikoshii
FMN-BINDING PROTEIN PF01613
(Flavin_Reduct)
7 HIS A  -7
TYR A   8
ASP A  29
TRP A  30
ARG A  49
HIS A 124
HIS A 155
HQE A1173
4O8J_A_ADNA401 4o8j ADN

DB00640
(Adenosine)
Pyrococcus
horikoshii
RNA 3'-TERMINAL
PHOSPHATE CYCLASE
PF01137
(RTC)
PF05189
(RTC_insert)
12 GLN A  14
ARG A  17
LEU A  97
GLN A 100
PRO A 127
PRO A 128
TYR A 131
ASP A 250
PHE A 283
ASP A 286
GLN A 287
HIS A 307
ADN A 401
4O8J_B_ADNB401 4o8j ADN

DB00640
(Adenosine)
Pyrococcus
horikoshii
RNA 3'-TERMINAL
PHOSPHATE CYCLASE
no annotation 12 GLN B  14
ARG B  17
LEU B  97
GLN B 100
PRO B 127
PRO B 128
TYR B 131
ASP B 250
PHE B 283
ASP B 286
GLN B 287
HIS B 307
ADN B 401
4S0V_A_SUVA2001 4s0v SUV

DB09034
(Suvorexant)
Homo sapiens;
Pyrococcus abyssi
HUMAN OREXIN
RECEPTOR TYPE 2
FUSION PROTEIN TO P.
ABYSII GLYCOGEN
SYNTHASE
PF00001
(7tm_1)
PF00534
(Glycos_transf_1)
17 THR A 111
VAL A 114
TRP A 120
ILE A 130
PRO A 131
GLN A 134
THR A 135
VAL A 138
GLN A 187
GLU A 212
HIS A 224
TYR A 317
ILE A 320
ASN A 324
HIS A 350
VAL A 353
TYR A 354
SUV A2001
4ZJ8_A_SUVA2001 4zj8 SUV

DB09034
(Suvorexant)
Homo sapiens;
Pyrococcus abyssi
HUMAN OX1R FUSION
PROTEIN TO P.ABYSII
GLYCOGEN SYNTHASE
PF00001
(7tm_1)
PF00534
(Glycos_transf_1)
18 ALA A 102
SER A 103
VAL A 106
TRP A 112
ILE A 122
PRO A 123
GLN A 126
VAL A 130
GLN A 179
MET A 183
GLU A 204
HIS A 216
PHE A 219
ILE A 314
ASN A 318
HIS A 344
VAL A 347
TYR A 348
SUV A2001
5HJI_A_ADNA401 5hji ADN

DB00640
(Adenosine)
Pyrococcus abyssi TRNA
(GUANINE(37)-N1)-MET
HYLTRANSFERASE TRM5A
PF02475
(Met_10)
11 LEU A 131
TYR A 132
ARG A 133
PHE A 191
GLY A 193
GLU A 213
ILE A 214
ASN A 215
ASP A 243
VAL A 244
PRO A 262
ADN A 401
5ZVG_A_SAMA401 5zvg SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Pyrococcus
horikoshii
389AA LONG
HYPOTHETICAL
NUCLEOLAR PROTEIN
PF01189
(PUA)
PF01472
(Methyltr_RsmB-F)
15 ALA A 209
PRO A 212
GLY A 214
LYS A 215
ASP A 233
LYS A 234
SER A 235
ARG A 238
ASP A 260
ALA A 261
ARG A 262
ASP A 277
PRO A 279
TYR A 304
PHE A 308
SAM A 401
5ZVG_B_SAMB401 5zvg SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Pyrococcus
horikoshii
389AA LONG
HYPOTHETICAL
NUCLEOLAR PROTEIN
None 15 ALA B 209
PRO B 212
GLY B 214
LYS B 215
ASP B 233
LYS B 234
SER B 235
ARG B 238
ASP B 260
ALA B 261
ARG B 262
ASP B 277
PRO B 279
TYR B 304
PHE B 308
SAM B 401
6BXL_A_SAMA401 6bxl SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Pyrococcus
horikoshii
2-(3-AMINO-3-CARBOXY
PROPYL)HISTIDINE
SYNTHASE
PF01866
(Diphthamide_syn)
12 TYR A  56
LEU A 161
GLY A 162
HIS A 184
SER A 236
LYS A 238
GLN A 241
ASP A 268
CYS A 287
ARG A 289
VAL A 290
ASP A 293
SAM A 401
6BXL_B_SAMB401 6bxl SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Pyrococcus
horikoshii
2-(3-AMINO-3-CARBOXY
PROPYL)HISTIDINE
SYNTHASE
None 12 TYR B  56
LEU B 161
GLY B 162
HIS B 184
SER B 236
LYS B 238
GLN B 241
VAL B 269
CYS B 287
ARG B 289
VAL B 290
ASP B 293
SAM B 401
6HLO_A_GBQA1501 6hlo GBQ

DB00673
(Aprepitant)
Homo sapiens;
Pyrococcus abyssi
SUBSTANCE-P
RECEPTOR,GLGA
GLYCOGEN
SYNTHASE,SUBSTANCE-P
RECEPTOR
PF00001
(7tm_1)
PF00534
(Glycos_transf_1)
21 MET A  81
ASN A  89
ASN A 109
PRO A 112
ILE A 113
ILE A 116
GLN A 165
ILE A 182
TRP A 184
GLU A 193
TYR A 196
HIS A 197
VAL A 200
THR A 201
ILE A 204
TRP A 261
PHE A 264
HIS A 265
PHE A 268
MET A 291
MET A 295
GBQ A1501
6HLP_A_GAWA1501 6hlp GAW

DB09048
(Netupitant)
Homo sapiens;
Pyrococcus abyssi
SUBSTANCE-P
RECEPTOR,SUBSTANCE-P
RECEPTOR
PF00001
(7tm_1)
PF00534
(Glycos_transf_1)
17 ASN A  89
ASN A 109
PRO A 112
ILE A 113
ILE A 116
GLN A 165
HIS A 197
VAL A 200
THR A 201
ILE A 204
TRP A 261
PHE A 264
HIS A 265
PHE A 268
PRO A 271
TYR A 272
MET A 295
GAW A1501