DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'Pseudomonas aeruginosa'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1DMA_A_NCAA700 1dma NCA

DB02701
(Nicotinamide)
Pseudomonas
aeruginosa
EXOTOXIN A PF09009
(Exotox-A_cataly)
7 HIS A 440
GLY A 441
TYR A 470
LEU A 477
ALA A 478
TYR A 481
GLU A 553
NCA A 700
1DMA_B_NCAB700 1dma NCA

DB02701
(Nicotinamide)
Pseudomonas
aeruginosa
EXOTOXIN A None 6 HIS B 440
GLY B 441
TYR B 470
ALA B 472
TYR B 481
GLU B 553
NCA B 700
1LQP_A_FCNA4002 1lqp FCN

DB00828
(Fosfomycin)
Pseudomonas
aeruginosa
PROBABLE FOSFOMYCIN
RESISTANCE PROTEIN
PF00903
(Glyoxalase)
no annotation
10 HIS B   7
THR B   9
TRP B  46
CYS B  48
HIS A  64
LYS A  90
SER A  94
TYR A 100
GLU A 110
ARG A 119
FCN A4002
1LQP_A_FCNA4004 1lqp FCN

DB00828
(Fosfomycin)
Pseudomonas
aeruginosa
PROBABLE FOSFOMYCIN
RESISTANCE PROTEIN
PF00903
(Glyoxalase)
no annotation
4 SER B  50
TYR A  62
LYS A  90
ARG A  93
FCN A4004
1LQP_B_FCNB4001 1lqp FCN

DB00828
(Fosfomycin)
Pseudomonas
aeruginosa
PROBABLE FOSFOMYCIN
RESISTANCE PROTEIN
PF00903
(Glyoxalase)
no annotation
10 HIS A   7
THR A   9
TRP A  46
CYS A  48
HIS B  64
LYS B  90
SER B  94
TYR B 100
GLU B 110
ARG B 119
FCN B4001
1LQP_B_FCNB4003 1lqp FCN

DB00828
(Fosfomycin)
Pseudomonas
aeruginosa
PROBABLE FOSFOMYCIN
RESISTANCE PROTEIN
PF00903
(Glyoxalase)
no annotation
4 SER A  50
TYR B  62
LYS B  90
ARG B  93
FCN B4003
1NKI_A_PPFA5001 1nki PPF

DB00529
(Foscarnet)
Pseudomonas
aeruginosa
PROBABLE FOSFOMYCIN
RESISTANCE PROTEIN
PF00903
(Glyoxalase)
no annotation
9 HIS B   7
THR B   9
CYS B  48
TYR A  62
HIS A  64
SER A  94
TYR A 100
GLU A 110
ARG A 119
PPF A5001
1NKI_B_PPFB5002 1nki PPF

DB00529
(Foscarnet)
Pseudomonas
aeruginosa
PROBABLE FOSFOMYCIN
RESISTANCE PROTEIN
PF00903
(Glyoxalase)
no annotation
9 HIS A   7
THR A   9
CYS A  48
TYR B  62
HIS B  64
SER B  94
TYR B 100
GLU B 110
ARG B 119
PPF B5002
2F9W_A_PAUA6001 2f9w PAU

DB01783
(Pantothenic
acid)
Pseudomonas
aeruginosa
PANTOTHENATE KINASE None
PF03309
(Pan_kinase)
11 ASN A   9
VAL A  55
TYR A  92
GLY A  99
ASP A 101
ARG A 102
THR A 127
ILE A 142
THR B 157
ARG B 159
THR B 180
PAU A6001
2F9W_A_PAUA6002 2f9w PAU

DB01783
(Pantothenic
acid)
Pseudomonas
aeruginosa
PANTOTHENATE KINASE None
PF03309
(Pan_kinase)
8 TYR B  92
GLY B  99
ASP B 101
ARG B 102
THR B 127
ILE B 142
ARG A 159
THR A 180
PAU A6002
2Q0I_A_BEZA990 2q0i BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid)
Pseudomonas
aeruginosa
QUINOLONE SIGNAL
RESPONSE PROTEIN
PF00753
(Lactamase_B)
8 ASP A  73
ASP A 178
GLU A 182
LEU A 193
HIS A 221
SER A 273
LEU A 277
HIS A 282
BEZ A 990
2Q0J_A_BEZA500 2q0j BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid)
Pseudomonas
aeruginosa
QUINOLONE SIGNAL
RESPONSE PROTEIN
PF00753
(Lactamase_B)
10 ASP A  73
HIS A 159
ASP A 178
GLU A 182
LEU A 193
PHE A 195
HIS A 221
SER A 273
LEU A 277
HIS A 282
BEZ A 500
2Q0J_B_BEZB500 2q0j BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid)
Pseudomonas
aeruginosa
QUINOLONE SIGNAL
RESPONSE PROTEIN
None 11 ASP B  73
HIS B  74
HIS B 159
ASP B 178
GLU B 182
LEU B 193
PHE B 195
HIS B 221
SER B 273
LEU B 277
HIS B 282
BEZ B 500
2XAT_A_CLMA301 2xat CLM

DB00446
(Chloramphenicol)
Pseudomonas
aeruginosa
XENOBIOTIC
ACETYLTRANSFERASE
PF00132
(Hexapep)
3 GLY A  11
TYR A  30
SER A  32
CLM A 301
3HGX_A_SALA102 3hgx SAL

DB00936
(Salicylic
acid)
Pseudomonas
aeruginosa
SALICYLATE
BIOSYNTHESIS PROTEIN
PCHB
PF01817
(CM_2)
7 ARG A  31
VAL A  35
MET A  57
ILE A  83
TYR A  86
ILE A  87
GLN A  90
SAL A 102
3HGX_B_SALB104 3hgx SAL

DB00936
(Salicylic
acid)
Pseudomonas
aeruginosa
SALICYLATE
BIOSYNTHESIS PROTEIN
PCHB
no annotation 9 ARG B  31
VAL B  35
ARG B  53
VAL B  54
MET B  57
ILE B  83
TYR B  86
ILE B  87
GLN B  90
SAL B 104
3R6W_A_NFZA213 3r6w NFZ

DB00336
(Nitrofural)
Pseudomonas
aeruginosa
FMN-DEPENDENT
NADH-AZOREDUCTASE 1
PF02525
(Flavodoxin_2)
no annotation
10 PHE B  60
ASN A  99
PHE A 100
VAL B 114
PHE B 120
TYR B 131
GLY A 148
PHE A 151
PHE B 173
GLU A 188
NFZ A 213
3R6W_A_NFZA214 3r6w NFZ

DB00336
(Nitrofural)
Pseudomonas
aeruginosa
FMN-DEPENDENT
NADH-AZOREDUCTASE 1
PF02525
(Flavodoxin_2)
no annotation
10 PHE A  60
ASN B  99
PHE B 100
VAL A 114
PHE A 120
TYR A 131
GLY B 148
PHE B 151
ASN B 157
PHE A 173
NFZ A 214
3REM_A_SALA301 3rem SAL

DB00936
(Salicylic
acid)
Pseudomonas
aeruginosa
SALICYLATE
BIOSYNTHESIS PROTEIN
PCHB
PF01817
(CM_2)
8 ARG A  31
VAL A  35
ARG A  53
VAL A  54
MET A  57
TYR A  86
ILE A  87
GLN A  90
SAL A 301
3REM_B_SALB301 3rem SAL

DB00936
(Salicylic
acid)
Pseudomonas
aeruginosa
SALICYLATE
BIOSYNTHESIS PROTEIN
PCHB
no annotation 8 ARG B  31
VAL B  35
ARG B  53
VAL B  54
MET B  57
TYR B  86
ILE B  87
GLN B  90
SAL B 301
3RET_A_SALA201 3ret SAL

DB00936
(Salicylic
acid)
Pseudomonas
aeruginosa
SALICYLATE
BIOSYNTHESIS PROTEIN
PCHB
PF01817
(CM_2)
no annotation
10 ILE B  17
ARG A  31
VAL A  35
ALA A  50
ARG A  53
VAL A  54
MET A  57
TYR A  86
ILE A  87
GLN A  90
SAL A 201
3RET_B_SALB201 3ret SAL

DB00936
(Salicylic
acid)
Pseudomonas
aeruginosa
SALICYLATE
BIOSYNTHESIS PROTEIN
PCHB
no annotation 9 ARG B  31
VAL B  35
ALA B  50
ARG B  53
VAL B  54
MET B  57
TYR B  86
ILE B  87
GLN B  90
SAL B 201
4C1D_A_X8ZA350 4c1d X8Z

DB01197
(Captopril)
Pseudomonas
aeruginosa
BETA-LACTAMASE CLASS
B VIM-2
PF00753
(Lactamase_B)
9 PHE A  62
TYR A  67
TRP A  87
HIS A 116
ASP A 118
HIS A 179
CYS A 198
ASN A 210
HIS A 240
X8Z A 350
4C1D_B_X8ZB350 4c1d X8Z

DB01197
(Captopril)
Pseudomonas
aeruginosa
BETA-LACTAMASE CLASS
B VIM-2
no annotation 10 PHE B  62
TYR B  67
TRP B  87
HIS B 114
HIS B 116
ASP B 118
HIS B 179
CYS B 198
ASN B 210
HIS B 240
X8Z B 350
4EBK_A_TOYA301 4ebk TOY

DB00684
(Tobramycin)
Pseudomonas
aeruginosa
AMINOGLYCOSIDE
NUCLEOTIDYLTRANSFERA
SE
PF01909
(NTP_transf_2)
no annotation
9 ASP B  40
GLU B  51
TYR B  53
ALA B  70
GLU A 122
GLU A 124
GLU A 126
ASP A 127
GLU A 130
TOY A 301
4EBK_B_TOYB302 4ebk TOY

DB00684
(Tobramycin)
Pseudomonas
aeruginosa
AMINOGLYCOSIDE
NUCLEOTIDYLTRANSFERA
SE
PF01909
(NTP_transf_2)
no annotation
9 ASP A  40
GLU A  51
TYR A  53
ALA A  70
GLU B 122
GLU B 124
GLU B 126
ASP B 127
GLU B 130
TOY B 302
4KOS_A_4KOA201 4kos 4KO

DB00274
(Cefmetazole)
Pseudomonas
aeruginosa
UNCHARACTERIZED
PROTEIN
PF00583
(Acetyltransf_1)
12 CYS A  29
PRO A  31
ARG A  49
TYR A  68
GLY A  79
ASN A  80
MET A  81
ILE A 115
PHE A 118
TYR A 128
ARG A 141
LEU A 151
4KO A 201
4KOT_A_CE3A205 4kot CE3

DB00493
(Cefotaxime)
Pseudomonas
aeruginosa
UNCHARACTERIZED
PROTEIN
PF00583
(Acetyltransf_1)
14 PHE A  27
CYS A  29
TYR A  30
PRO A  31
ARG A  49
TYR A  68
GLY A  79
ASN A  80
MET A  81
ILE A 115
PHE A 118
TYR A 128
ARG A 141
LEU A 151
CE3 A 205
4KOU_A_C04A206 4kou C04

DB00671
(Cefixime)
Pseudomonas
aeruginosa
UNCHARACTERIZED
PROTEIN
PF00583
(Acetyltransf_1)
10 PHE A  27
TYR A  30
PRO A  31
ARG A  49
TYR A  68
GLY A  79
ASN A  80
PHE A 118
ARG A 141
LEU A 151
C04 A 206
4KOU_A_C04A207 4kou C04

DB00671
(Cefixime)
Pseudomonas
aeruginosa
UNCHARACTERIZED
PROTEIN
PF00583
(Acetyltransf_1)
3 GLY A  11
GLU A  14
THR A  15
C04 A 207
4KOV_A_KOVA204 4kov KOV

DB01112
(Cefuroxime)
Pseudomonas
aeruginosa
UNCHARACTERIZED
PROTEIN
PF00583
(Acetyltransf_1)
12 TYR A  30
PRO A  31
ARG A  49
TYR A  68
GLY A  79
ASN A  80
MET A  81
ILE A 115
PHE A 118
TYR A 128
ARG A 141
LEU A 151
KOV A 204
4KOW_A_CFXA204 4kow CFX

DB01331
(Cefoxitin)
Pseudomonas
aeruginosa
UNCHARACTERIZED
PROTEIN
PF00583
(Acetyltransf_1)
12 PHE A  27
PRO A  31
ARG A  49
TYR A  68
GLY A  79
ASN A  80
MET A  81
SER A 116
PHE A 118
TYR A 128
ARG A 141
LEU A 151
CFX A 204
4KOX_A_CLSA205 4kox CLS

DB00456
(Cefalotin)
Pseudomonas
aeruginosa
UNCHARACTERIZED
PROTEIN
PF00583
(Acetyltransf_1)
11 CYS A  29
PRO A  31
ARG A  49
TYR A  68
GLY A  79
ASN A  80
MET A  81
PHE A 118
TYR A 128
ARG A 141
LEU A 151
CLS A 205
4KOY_A_CSCA214 4koy CSC

DB03313
(Cephalosporin
C)
Pseudomonas
aeruginosa
UNCHARACTERIZED
PROTEIN
PF00583
(Acetyltransf_1)
11 CYS A  29
PRO A  31
ARG A  49
TYR A  68
GLY A  79
ASN A  80
MET A  81
ILE A 115
TYR A 128
ARG A 141
LEU A 151
CSC A 214
4OAD_A_CLMA205 4oad CLM

DB00446
(Chloramphenicol)
Pseudomonas
aeruginosa
GNAT SUPERFAMILY
ACETYLTRANSFERASE
PA4794
PF00583
(Acetyltransf_1)
12 PHE A  19
PRO A  20
GLU A  25
TYR A  28
CYS A  29
MET A  82
ARG A  88
ASN A 121
ALA A 123
GLY A 124
LEU A 127
TYR A 128
CLM A 205
4OAD_A_CLMA206 4oad CLM

DB00446
(Chloramphenicol)
Pseudomonas
aeruginosa
GNAT SUPERFAMILY
ACETYLTRANSFERASE
PA4794
PF00583
(Acetyltransf_1)
4 ALA A  40
ALA A  43
ALA A  44
ALA A  47
CLM A 206
4OAE_A_CLMA207 4oae CLM

DB00446
(Chloramphenicol)
Pseudomonas
aeruginosa
GNAT SUPERFAMILY
ACETYLTRANSFERASE
PA4794
PF00583
(Acetyltransf_1)
12 PHE A  19
PRO A  20
GLU A  25
TYR A  28
ALA A  29
MET A  82
ARG A  88
ALA A  93
ASN A 121
ALA A 123
GLY A 124
LEU A 127
CLM A 207
4OAE_A_CLMA208 4oae CLM

DB00446
(Chloramphenicol)
Pseudomonas
aeruginosa
GNAT SUPERFAMILY
ACETYLTRANSFERASE
PA4794
PF00583
(Acetyltransf_1)
4 ALA A  40
ALA A  43
ALA A  44
ALA A  47
CLM A 208
4QD3_A_5AEA201 4qd3 5AE

DB00928
(Azacitidine)
Pseudomonas
aeruginosa
PEPTIDYL-TRNA
HYDROLASE
PF01195
(Pept_tRNA_hydro)
9 HIS A  22
LEU A  97
GLY A 114
HIS A 115
ASN A 116
VAL A 147
SER A 148
VAL A 151
LEU A 152
5AE A 201
4UMJ_A_BFQA1297 4umj BFQ

DB00710
(Ibandronate)
Pseudomonas
aeruginosa
GERANYLTRANSTRANSFER
ASE
PF00348
(polyprenyl_synt)
8 SER A  79
LEU A  80
ASP A  83
ASP A  89
ARG A  94
MET A 153
GLN A 157
LYS A 180
BFQ A1297
4UMJ_A_BFQA1298 4umj BFQ

DB00710
(Ibandronate)
Pseudomonas
aeruginosa
GERANYLTRANSTRANSFER
ASE
PF00348
(polyprenyl_synt)
4 ILE A 185
PHE A 218
GLN A 219
ASP A 222
BFQ A1298
4UMJ_B_BFQB1294 4umj BFQ

DB00710
(Ibandronate)
Pseudomonas
aeruginosa
GERANYLTRANSTRANSFER
ASE
no annotation 9 SER B  79
LEU B  80
ASP B  83
ASP B  89
ARG B  94
MET B 153
GLN B 157
LYS B 180
THR B 181
BFQ B1294
4XJE_A_TOYA202 4xje TOY

DB00684
(Tobramycin)
Pseudomonas
aeruginosa
AADB PF10706
(Aminoglyc_resit)
8 ASP A  44
ASP A  46
TYR A  74
ASP A  86
GLU A  88
ILE A  99
ASP A 131
TYR A 134
TOY A 202
5CFS_A_TOYA203 5cfs TOY

DB00684
(Tobramycin)
Pseudomonas
aeruginosa
AAD(2''),GENTAMICIN
2''-NUCLEOTIDYLTRANS
FERASE,GENTAMICIN
RESISTANCE PROTEIN
PF10706
(Aminoglyc_resit)
8 ASP A  44
ASP A  46
TYR A  74
ASP A  86
GLU A  88
ILE A  99
ASP A 131
TYR A 134
TOY A 203
5CFT_A_51GA204 5cft 51G

DB00798
(Gentamicin)
Pseudomonas
aeruginosa
AMINOGLYCOSIDE
NUCLEOTIDYLTRANSFERA
SE (2')-IA
PF10706
(Aminoglyc_resit)
9 ASP A  44
ASP A  46
TYR A  74
LEU A  77
ASP A  86
GLU A  88
ILE A  99
ASP A 131
TYR A 134
51G A 204
5EB3_A_UEGA202 5eb3 UEG

DB00165
(Pyridoxine)
Pseudomonas
aeruginosa
YFIR PF13689
(DUF4154)
4 LEU A 166
ILE A 169
PRO A 178
LEU A 181
UEG A 202
5N4T_A_BEZA507 5n4t BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid)
Pseudomonas
aeruginosa
BETA-LACTAMASE VIM-2 PF00753
(Lactamase_B)
3 THR A 206
HIS A 251
ASN A 254
BEZ A 507
5N4T_B_BEZB306 5n4t BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid)
Pseudomonas
aeruginosa
BETA-LACTAMASE VIM-2 None 3 HIS B 251
ASN B 254
ALA B 258
BEZ B 306
5WQP_A_NCAA302 5wqp NCA

DB02701
(Nicotinamide)
Pseudomonas
aeruginosa
PROBABLE
DEHYDROGENASE
PF00106
(adh_short)
8 SER A 135
GLN A 136
MET A 137
MET A 148
TYR A 151
HIS A 180
TRP A 183
MET A 188
NCA A 302
5WYQ_A_SAMA401 5wyq SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Pseudomonas
aeruginosa
TRNA
(GUANINE-N(1)-)-METH
YLTRANSFERASE
None
PF01746
(tRNA_m1G_MT)
17 TYR A  91
LEU A  92
PRO A  94
GLN A  95
GLY A 118
GLY A 122
SER A 137
ILE A 138
VAL A 142
LEU A 143
GLY A 145
GLY A 146
PRO A 149
ASP B 174
SER B 175
ASP B 182
HIS B 185
SAM A 401
5WYQ_B_SAMB301 5wyq SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Pseudomonas
aeruginosa
TRNA
(GUANINE-N(1)-)-METH
YLTRANSFERASE
None
PF01746
(tRNA_m1G_MT)
14 TYR B  91
LEU B  92
PRO B  94
GLN B  95
GLY B 118
SER B 137
ILE B 138
TYR B 141
LEU B 143
GLY B 145
GLY B 146
PRO B 149
ASP A 182
HIS A 185
SAM B 301
5ZHM_B_SAMB301 5zhm SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Pseudomonas
aeruginosa
TRNA
(GUANINE-N(1)-)-METH
YLTRANSFERASE
None
PF01746
(tRNA_m1G_MT)
18 TYR B  91
LEU B  92
PRO B  94
GLN B  95
GLY B 118
GLU B 121
GLY B 122
SER B 137
ILE B 138
VAL B 142
LEU B 143
GLY B 145
GLY B 146
PRO B 149
ARG A 159
SER A 175
ASP A 182
HIS A 185
SAM B 301
6FU4_A_HSMA401 6fu4 HSM

DB05381
(Histamine)
Pseudomonas
aeruginosa
PROBABLE CHEMOTAXIS
TRANSDUCER
no annotation 9 TYR A 126
TYR A 158
GLU A 170
GLU A 176
TYR A 189
TRP A 192
TYR A 208
ASP A 210
ASP A 239
HSM A 401
6FU4_B_HSMB401 6fu4 HSM

DB05381
(Histamine)
Pseudomonas
aeruginosa
PROBABLE CHEMOTAXIS
TRANSDUCER
no annotation 9 TYR B 126
TYR B 158
GLU B 170
GLU B 176
TYR B 189
TRP B 192
TYR B 208
ASP B 210
ASP B 239
HSM B 401
6FU4_C_HSMC401 6fu4 HSM

DB05381
(Histamine)
Pseudomonas
aeruginosa
PROBABLE CHEMOTAXIS
TRANSDUCER
no annotation 9 TYR C 126
TYR C 158
GLU C 170
GLU C 176
TYR C 189
TRP C 192
TYR C 208
ASP C 210
ASP C 239
HSM C 401
6FU4_D_HSMD401 6fu4 HSM

DB05381
(Histamine)
Pseudomonas
aeruginosa
PROBABLE CHEMOTAXIS
TRANSDUCER
no annotation 9 TYR D 126
TYR D 158
GLU D 170
GLU D 176
TYR D 189
TRP D 192
TYR D 208
ASP D 210
ASP D 239
HSM D 401
6MB5_A_NMYA301 6mb5 NMY

DB00452
(Framycetin)
DB00994
(Neomycin)
Pseudomonas
aeruginosa
AAC(3)-IIIB PROTEIN PF02522
(Antibiotic_NAT)
11 TYR A  65
ASP A  67
ASN A 104
TYR A 147
ASP A 171
THR A 172
HIS A 177
THR A 213
GLY A 214
ASP A 215
GLU A 223
NMY A 301
6MB7_A_PARA900 6mb7 PAR

DB01421
(Paromomycin)
Pseudomonas
aeruginosa
AAC(3)-IIIB PROTEIN PF02522
(Antibiotic_NAT)
10 TYR A  65
ASP A  67
ASN A 104
TYR A 147
THR A 172
HIS A 177
THR A 213
GLY A 214
ASP A 215
GLU A 223
PAR A 900
6MB9_A_NMYA303 6mb9 NMY

DB00452
(Framycetin)
DB00994
(Neomycin)
Pseudomonas
aeruginosa
AAC(3)-IIIB PROTEIN PF02522
(Antibiotic_NAT)
10 TYR A  65
ASP A  67
TYR A 147
ASP A 171
THR A 172
HIS A 177
THR A 213
GLY A 214
ASP A 215
GLU A 223
NMY A 303
6MB9_B_NMYB302 6mb9 NMY

DB00452
(Framycetin)
DB00994
(Neomycin)
Pseudomonas
aeruginosa
AAC(3)-IIIB PROTEIN None 10 TYR B  65
ASP B  67
TYR B 147
ASP B 171
THR B 172
HIS B 177
THR B 213
GLY B 214
ASP B 215
GLU B 223
NMY B 302
6MB9_C_NMYC302 6mb9 NMY

DB00452
(Framycetin)
DB00994
(Neomycin)
Pseudomonas
aeruginosa
AAC(3)-IIIB PROTEIN None 10 TYR C  65
ASP C  67
TYR C 147
ASP C 171
THR C 172
HIS C 177
THR C 213
GLY C 214
ASP C 215
GLU C 223
NMY C 302
6MB9_D_NMYD302 6mb9 NMY

DB00452
(Framycetin)
DB00994
(Neomycin)
Pseudomonas
aeruginosa
AAC(3)-IIIB PROTEIN None 10 TYR D  65
ASP D  67
TYR D 147
ASP D 171
THR D 172
HIS D 177
THR D 213
GLY D 214
ASP D 215
GLU D 223
NMY D 302