DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'Human immunodeficiency virus'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1C6Y_B_MK1B524 1c6y MK1

DB00224
(Indinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEIN (PROTEASE) PF00077
(RVP)
no annotation 		24 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ALA A  28
VAL A  32
ILE A  47
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
THR A  82
ILE A  84
ASP B 225
GLY B 227
ALA B 228
ASP B 229
ASP B 230
VAL B 232
ILE B 247
GLY B 249
ILE B 250
THR B 280
PRO B 281
THR B 282
ILE B 284
 MK1 B 524
1C6Z_B_ROCB505 1c6z ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEIN (PROTEASE) PF00077
(RVP)
no annotation 		27 ARG A   8
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  32
ILE A  47
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
THR A  82
ILE A  84
ARG B 208
ASP B 225
GLY B 227
ALA B 228
ASP B 229
ASP B 230
VAL B 232
ILE B 247
GLY B 249
ILE B 250
THR B 280
PRO B 281
THR B 282
ILE B 284
 ROC B 505
1D4S_A_TPVA201 1d4s TPV

DB00932
(Tipranavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEIN (HIV-1
PROTEASE) 		PF00077
(RVP)
no annotation 		18 ARG B   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  32
ILE A  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
PRO A  81
PHE B  82
PHE A  82
VAL B  84
 TPV A 201
1D4Y_A_TPVA501 1d4y TPV

DB00932
(Tipranavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEIN (HIV-1
PROTEASE) 		PF00077
(RVP)
no annotation 		18 ARG A   8
ARG B   8
LEU B  23
LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ILE A  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
ILE B  50
VAL A  82
VAL B  82
ILE B  84
 TPV A 501
1FB7_A_ROCA100 1fb7 ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP) 		12 ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  48
GLY A  49
ILE A  50
THR A  80
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
 ROC A 100
1FK9_A_EFZA999 1fk9 EFZ

DB00625
(Efavirenz) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 RT, A-CHAIN PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		10 LEU A 100
LYS A 101
LYS A 103
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
LEU A 234
TYR A 318
 EFZ A 999
1FKO_A_EFZA999 1fko EFZ

DB00625
(Efavirenz) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 RT, A-CHAIN PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		10 LEU A 100
ASN A 103
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 EFZ A 999
1FKP_A_NVPA999 1fkp NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 RT, A-CHAIN PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		11 PRO A  95
LEU A 100
ASN A 103
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 NVP A 999
1HPV_B_478B200 1hpv 478

DB00701
(Amprenavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		18 LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 478 B 200
1HSG_B_MK1B902 1hsg MK1

DB00224
(Indinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		23 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP B  29
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE B  47
ILE A  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 MK1 B 902
1HSH_A_MK1A401 1hsh MK1

DB00224
(Indinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 2 		HIV-II PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		21 ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ILE A  32
ILE B  32
VAL A  47
VAL B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
ILE B  82
ILE A  82
ILE A  84
ILE B  84
 MK1 A 401
1HSH_C_MK1C402 1hsh MK1

DB00224
(Indinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 2 		HIV-II PROTEASE no annotation 20 ARG D   8
ARG C   8
ASP D  25
ASP C  25
GLY C  27
ALA C  28
ALA D  28
ASP C  29
ASP C  30
ILE C  32
GLY C  49
GLY D  49
ILE C  50
ILE D  50
PRO C  81
PRO D  81
ILE C  82
ILE D  82
ILE C  84
ILE D  84
 MK1 C 402
1HXB_A_ROCA100 1hxb ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		31 ARG B   8
ARG A   8
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL A  32
VAL B  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  48
GLY B  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
THR B  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 ROC A 100
1HXW_B_RITB301 1hxw RIT

DB00503
(Ritonavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		20 ARG B   8
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
GLY A  27
ALA B  28
ASP A  29
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
 RIT B 301
1IKV_A_EFZA2000 1ikv EFZ

DB00625
(Efavirenz) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		9 LEU A 100
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 EFZ A2000
1IKW_A_EFZA2000 1ikw EFZ

DB00625
(Efavirenz) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		10 LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 EFZ A2000
1JKH_A_EFZA999 1jkh EFZ

DB00625
(Efavirenz) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 RT, A-CHAIN;
HIV-1 RT, B-CHAIN 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		11 LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
CYS A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 EFZ A 999
1JLB_A_NVPA999 1jlb NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 RT A-CHAIN PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		8 LEU A 100
VAL A 106
CYS A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 NVP A 999
1JLF_A_NVPA999 1jlf NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 RT A-CHAIN;
HIV-1 RT B-CHAIN 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		8 LEU A 100
VAL A 106
GLU B 138
TYR A 181
CYS A 188
GLY A 190
TRP A 229
TYR A 318
 NVP A 999
1K6C_B_MK1B902 1k6c MK1

DB00224
(Indinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		22 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP B  29
ASP B  30
VAL A  32
VAL B  32
ILE A  47
GLY A  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
PRO B  81
PRO A  81
THR A  82
THR B  82
VAL B  84
 MK1 B 902
1KLM_A_SPPA999 1klm SPP

DB00705
(Delavirdine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		11 LEU A 100
LYS A 102
VAL A 106
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 226
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
PRO A 236
TYR A 318
 SPP A 999
1LW0_A_NVPA999 1lw0 NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		10 LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 NVP A 999
1LWC_A_NVPA999 1lwc NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		11 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 NVP A 999
1LWE_A_NVPA999 1lwe NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		7 LEU A 100
VAL A 106
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
TYR A 318
 NVP A 999
1LWF_A_NVPA999 1lwf NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		9 LEU A 100
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 NVP A 999
1MUI_B_AB1B100 1mui AB1

DB01601
(Lopinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		23 ARG B   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 AB1 B 100
1N49_B_RITB301 1n49 RIT

DB00503
(Ritonavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		18 ARG B   8
ASN A  25
ASN B  25
GLY B  27
ALA B  28
ASP A  29
ASP B  30
VAL B  32
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
ALA A  82
ILE A  84
ILE B  84
 RIT B 301
1N49_D_RITD401 1n49 RIT

DB00503
(Ritonavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE no annotation 17 ARG C   8
ASN D  25
ASN C  25
GLY C  27
ALA C  28
ASP D  29
ASP C  30
VAL C  32
ILE C  47
GLY D  49
GLY C  49
ILE D  50
ILE C  50
PRO C  81
PRO D  81
ILE D  84
ILE C  84
 RIT D 401
1OHR_A_1UNA201 1ohr 1UN

DB00220
(Nelfinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		ASPARTYLPROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		20 LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL B  32
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
ILE B  50
THR A  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 1UN A 201
1RL8_A_RITA9001 1rl8 RIT

DB00503
(Ritonavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation 		24 ARG B   8
ARG A   8
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL A  32
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
ALA B  82
ALA A  82
ILE A  84
ILE B  84
 RIT A9001
1RV7_B_AB1B1001 1rv7 AB1

DB01601
(Lopinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		11 LEU B  23
ASN A  25
ALA A  28
ILE A  50
THR A  80
THR B  80
PRO A  81
PRO B  81
ALA B  82
VAL A  84
VAL B  84
 AB1 B1001
1S1U_A_NVPA999 1s1u NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		REVERSE
TRANSCRIPTASE 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		10 ILE A 100
LYS A 103
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 NVP A 999
1S1X_A_NVPA999 1s1x NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		REVERSE
TRANSCRIPTASE 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		8 LEU A 100
VAL A 106
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 NVP A 999
1SDT_B_MK1B902 1sdt MK1

DB00224
(Indinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation 		22 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ILE A  47
GLY A  48
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
 MK1 B 902
1SDU_B_MK1B902 1sdu MK1

DB00224
(Indinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation 		24 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ALA A  28
ILE A  47
GLY A  48
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ARG B 108
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
 MK1 B 902
1SDV_B_MK1B902 1sdv MK1

DB00224
(Indinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation 		21 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ALA A  28
ILE A  47
GLY A  48
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
ILE A  84
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
ILE B 184
 MK1 B 902
1SGU_B_MK1B2632 1sgu MK1

DB00224
(Indinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		20 ARG B   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP B  29
ASP B  30
ILE B  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  48
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
ALA A  82
ALA B  82
 MK1 B2632
1SH9_B_RITB301 1sh9 RIT

DB00503
(Ritonavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		18 ARG B   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  30
ILE A  32
ILE B  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
ILE B  50
PRO A  81
PRO B  81
ALA B  82
 RIT B 301
1SV5_A_65BA600 1sv5 65B

DB06414
(Etravirine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		REVERSE
TRANSCRIPTASE 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_thumb)
PF06815
(RVT_1)
PF06817
(RVT_connect) 		10 LEU A 100
LYS A 101
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 65B A 600
1T03_P_TFOP822 1t03 TFO

DB00300
(Tenofovir) 		;
Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN;
SYNTHETIC
OLIGONUCLEOTIDE
PRIMER 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb)
no annotation 		7 ASP A 110
TYR A 183
MET A 184
ASP A 185
ASP A 186
LYS A 219
HIS A 221
 TFO P 822
1T3R_A_017A1200 1t3r 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation 		21 ARG B   8
LEU B  23
LEU A  23
ASP B  25
ASP A  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
ILE A  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE B  84
 017 A1200
1T7I_A_017A200 1t7i 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		17 LEU A  23
ASP B  25
ASP A  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
ILE A  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
ILE B  50
THR A  82
THR B  82
 017 A 200
1T7J_A_478A200 1t7j 478

DB00701
(Amprenavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		18 LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  82
THR B  82
VAL A  84
 478 A 200
1VRT_A_NVPA999 1vrt NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		9 LEU A 100
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 NVP A 999
2AOF_C_FRDC305 2aof FRD

DB00182
(Amphetamine) 		;
Human
immunodeficiency
virus 1 		PEPTIDE INHIBITOR;
POL POLYPROTEIN 		PF00077
(RVP)
no annotation 		15 ASP A  25
GLY A  49
PRO A  81
ALA A  82
ILE A  84
LEU B 123
ASP B 125
PRO B 181
ALA B 182
ILE B 184
ASN C 304
LEU C 306
GLN C 307
SER C 308
ARG C 309
 FRD C 305
2AOH_C_FRDC305 2aoh FRD

DB00182
(Amphetamine) 		;
Human
immunodeficiency
virus 1 		PEPTIDE INHIBITOR;
POL POLYPROTEIN 		PF00077
(RVP)
no annotation 		15 LEU A  23
ASP A  25
GLY A  49
PRO A  81
ALA A  82
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 149
ALA B 182
ILE B 184
PHE C 303
ASN C 304
PRO C 306
GLN C 307
ILE C 308
 FRD C 305
2AOI_C_FRDC305 2aoi FRD

DB00182
(Amphetamine) 		;
Human
immunodeficiency
virus 1 		PEPTIDE INHIBITOR;
POL POLYPROTEIN 		PF00077
(RVP)
no annotation 		16 ASP A  25
GLY A  49
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
LEU B 123
ASP B 125
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
PRO C 302
GLY C 303
ASN C 304
LEU C 306
GLN C 307
SER C 308
 FRD C 305
2AOJ_C_FRDC305 2aoj FRD

DB00182
(Amphetamine) 		;
Human
immunodeficiency
virus 1 		PEPTIDE INHIBITOR;
POL POLYPROTEIN 		PF00077
(RVP)
no annotation 		17 LEU A  23
ASP A  25
GLY A  49
PRO A  81
VAL A  82
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
PHE C 303
ASN C 304
PRO C 306
GLN C 307
ILE C 308
 FRD C 305
2AQU_B_DR7B300 2aqu DR7

DB01072
(Atazanavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		21 ARG B   8
ARG A   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 DR7 B 300
2AVO_B_MK1B902 2avo MK1

DB00224
(Indinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		21 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ASP B  29
ASP B  30
VAL B  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 MK1 B 902
2AVS_B_MK1B902 2avs MK1

DB00224
(Indinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		29 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL A  32
VAL B  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  48
GLY A  49
GLY B  49
VAL B  50
VAL A  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 MK1 B 902
2AVV_A_MK1A901 2avv MK1

DB00224
(Indinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		30 TRP D   6
ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL A  32
VAL B  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 MK1 A 901
2AVV_E_MK1E902 2avv MK1

DB00224
(Indinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN no annotation 30 ARG E   8
ARG D   8
LEU E  23
LEU D  23
ASP E  25
ASP D  25
GLY D  27
GLY E  27
ALA D  28
ALA E  28
ASP E  29
ASP D  29
ASP D  30
ASP E  30
VAL E  32
VAL D  32
ILE E  47
ILE D  47
GLY D  48
GLY E  48
GLY E  49
GLY D  49
ILE E  50
ILE D  50
PRO D  81
PRO E  81
VAL D  82
VAL E  82
ILE E  84
ILE D  84
 MK1 E 902
2B60_B_RITB100 2b60 RIT

DB00503
(Ritonavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		GAG-POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		23 ARG B   8
ARG A   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ILE B  32
ILE A  32
ILE A  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
ALA B  82
ALA A  82
ILE A  84
ILE B  84
 RIT B 100
2B7Z_B_MK1B200 2b7z MK1

DB00224
(Indinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		26 ARG B   8
ARG A   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
ILE B  32
ILE A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
ALA B  82
ALA A  82
VAL A  84
VAL B  84
 MK1 B 200
2BPX_B_MK1B902 2bpx MK1

DB00224
(Indinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		20 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP B  29
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 MK1 B 902
2F80_B_017B301 2f80 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		24 LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASN A  30
ASN B  30
VAL B  32
VAL A  32
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 017 B 301
2F81_A_017A302 2f81 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		24 LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  32
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
 017 A 302
2F8G_B_017B401 2f8g 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		27 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  32
GLY A  49
VAL A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
ILE B 147
GLY B 149
VAL B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
 017 B 401
2FXD_A_DR7A102 2fxd DR7

DB01072
(Atazanavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL PROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		18 ARG A   8
ARG B   8
ILE A  10
LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
ILE B  50
PRO B  81
PHE A  82
VAL A  84
 DR7 A 102
2FXE_A_DR7A102 2fxe DR7

DB01072
(Atazanavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL PROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		23 ARG B   8
ARG A   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ILE B  47
GLY A  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PHE A  53
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 DR7 A 102
2HND_A_NVPA999 2hnd NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		10 LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 NVP A 999
2HNY_A_NVPA999 2hny NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		10 LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 NVP A 999
2HS1_A_017A201 2hs1 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		27 ARG A   8
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ILE A  32
ILE A  47
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
ILE B 132
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
 017 A 201
2HS1_B_017B203 2hs1 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE no annotation 7 GLU B 135
TRP B 142
PRO B 144
MET B 146
LYS B 155
ARG B 157
GLY B 178
 017 B 203
2HS2_A_017A201 2hs2 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		25 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
 017 A 201
2HS2_B_017B203 2hs2 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE no annotation 6 TRP B 142
PRO B 144
LEU B 146
LYS B 155
ARG B 157
GLY B 178
 017 B 203
2IDW_B_017B401 2idw 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		20 LEU A  23
ASP A  25
ALA A  28
ASP A  30
VAL A  32
ILE A  47
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
ALA A  82
ILE A  84
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
GLY B 149
ILE B 150
ILE B 184
 017 B 401
2IEN_B_017B402 2ien 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		26 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  32
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
 017 B 402
2IEO_A_017A402 2ieo 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		25 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  32
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
VAL B 184
 017 A 402
2NMY_A_ROCA401 2nmy ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		27 ARG A   8
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ILE A  47
GLY A  49
ILE A  50
THR A  80
PRO A  81
ILE A  84
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
ILE B 147
GLY B 148
GLY B 149
ILE B 150
THR B 180
PRO B 181
ALA B 182
ILE B 184
 ROC A 401
2NMZ_B_ROCB401 2nmz ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		29 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  32
ILE A  47
GLY A  49
ILE A  50
THR A  80
PRO A  81
ALA A  82
ILE A  84
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
THR B 180
PRO B 181
ALA B 182
ILE B 184
 ROC B 401
2NNK_A_ROCA401 2nnk ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		28 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  32
ILE A  47
GLY A  49
ILE A  50
THR A  80
PRO A  81
VAL A  82
VAL A  84
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ASP B 129
ASP B 130
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
THR B 180
PRO B 181
VAL B 182
VAL B 184
 ROC A 401
2NNP_A_ROCA401 2nnp ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		22 ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ILE A  47
GLY A  49
ILE A  50
THR A  80
PRO A  81
VAL A  82
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
ALA B 128
VAL B 132
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
VAL B 184
 ROC A 401
2O4K_A_DR7A301 2o4k DR7

DB01072
(Atazanavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		28 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
VAL B  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  48
GLY B  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PHE B  53
PHE A  53
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 DR7 A 301
2O4L_A_TPVA403 2o4l TPV

DB00932
(Tipranavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		27 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
VAL B  50
VAL A  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 TPV A 403
2O4N_A_TPVA300 2o4n TPV

DB00932
(Tipranavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		20 ARG A   8
ARG B   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ILE A  32
ILE B  32
ILE A  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
LEU B  82
LEU A  82
 TPV A 300
2O4P_A_TPVA300 2o4p TPV

DB00932
(Tipranavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		20 ARG A   8
ARG B   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL B  32
ILE A  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE B  84
 TPV A 300
2O4S_A_AB1A400 2o4s AB1

DB01601
(Lopinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		27 ARG B   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL A  32
VAL B  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  48
GLY B  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 AB1 A 400
2PYM_A_1UNA1001 2pym 1UN

DB00220
(Nelfinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation 		29 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASN A  30
ASN B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
THR B  80
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 1UN A1001
2PYN_A_1UNA1001 2pyn 1UN

DB00220
(Nelfinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation 		29 ARG B   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASN A  30
ASN B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
THR B  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 1UN A1001
2Q5K_A_AB1A201 2q5k AB1

DB01601
(Lopinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		21 ARG B   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
ILE B  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
 AB1 A 201
2Q63_A_1UNA1001 2q63 1UN

DB00220
(Nelfinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation 		30 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASN A  30
ASN B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
THR B  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 1UN A1001
2Q64_B_1UNB1001 2q64 1UN

DB00220
(Nelfinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation 		30 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASN A  30
ASN B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
THR B  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 1UN B1001
2QAK_A_1UNA1001 2qak 1UN

DB00220
(Nelfinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation 		30 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASN A  30
ASN B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
THR B  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 1UN A1001
2QHC_B_AB1B9001 2qhc AB1

DB01601
(Lopinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation 		23 ARG B   8
ARG A   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 AB1 B9001
2R5P_B_MK1B902 2r5p MK1

DB00224
(Indinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		24 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL A  32
VAL B  32
ILE B  47
ILE A  47
GLY A  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 MK1 B 902
2R5P_D_MK1D902 2r5p MK1

DB00224
(Indinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE no annotation 25 ARG D   8
ARG C   8
LEU C  23
ASP D  25
ASP C  25
GLY D  27
ALA D  28
ASP D  29
ASP C  30
ASP D  30
VAL C  32
VAL D  32
ILE D  47
ILE C  47
GLY C  48
GLY D  49
GLY C  49
ILE D  50
ILE C  50
PRO D  81
PRO C  81
VAL D  82
VAL C  82
ILE D  84
ILE C  84
 MK1 D 902
2R5Q_B_1UNB900 2r5q 1UN

DB00220
(Nelfinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		20 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ASP B  29
ASP B  30
ILE A  47
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE B  84
ILE A  84
 1UN B 900
2R5Q_D_1UND900 2r5q 1UN

DB00220
(Nelfinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE no annotation 19 ARG C   8
LEU C  23
ASP D  25
ASP C  25
GLY D  27
ALA D  28
ASP D  29
ASP D  30
ILE C  47
ILE D  47
GLY D  49
GLY C  49
ILE D  50
ILE C  50
PRO C  81
PRO D  81
VAL C  82
ILE D  84
ILE C  84
 1UN D 900
2RKF_A_AB1A501 2rkf AB1

DB01601
(Lopinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation 		25 ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
ILE B  32
ILE A  32
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
ALA B  82
ALA A  82
ILE A  84
ILE B  84
 AB1 A 501
2RKG_B_AB1B501 2rkg AB1

DB01601
(Lopinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation 		24 LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
ILE B  32
ILE A  32
VAL A  48
VAL B  48
GLY A  50
GLY B  50
ILE B  51
ILE A  51
PRO B  82
PRO A  82
ILE A  85
ILE B  85
 AB1 B 501
2Z54_A_AB1A200 2z54 AB1

DB01601
(Lopinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		24 ARG B   8
ARG A   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 AB1 A 200
2ZD1_A_T27A557 2zd1 T27

DB08864
(Rilpivirine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		P51 RT;
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		14 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 101
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 T27 A 557
2ZE2_A_T27A556 2ze2 T27

DB08864
(Rilpivirine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		10 PRO A  95
ILE A 100
ASN A 103
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 T27 A 556
3BGR_A_T27A556 3bgr T27

DB08864
(Rilpivirine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		P51 RT;
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		11 LEU A 100
ASN A 103
GLU B 138
VAL A 179
CYS A 181
TYR A 183
TYR A 188
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 T27 A 556
3BVB_B_017B401 3bvb 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE
(RETROPEPSIN) 		PF00077
(RVP)
no annotation 		26 ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASN B  25
ASN A  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 017 B 401
3CYW_A_017A201 3cyw 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		24 LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 017 A 201
3CYX_A_ROCA201 3cyx ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		31 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY B  48
GLY A  49
GLY B  49
VAL B  50
VAL A  50
THR A  80
THR B  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 ROC A 201
3D1X_A_ROCA201 3d1x ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		27 ARG B   8
ARG A   8
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
THR B  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 ROC A 201
3D1Y_A_ROCA201 3d1y ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		21 ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ILE A  47
GLY A  49
ILE A  50
THR A  80
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
 ROC A 201
3D1Z_B_017B201 3d1z 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		26 ARG B   8
ARG A   8
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 017 B 201
3D20_A_017A201 3d20 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		26 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  32
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
 017 A 201
3EBZ_B_017B201 3ebz 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 2 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		22 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ALA A  28
ASP A  30
ILE A  32
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
ILE A  82
ILE A  84
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
ILE B 132
VAL B 147
GLY B 149
ILE B 150
ILE B 182
 017 B 201
3EKP_B_478B200 3ekp 478

DB00701
(Amprenavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		18 LEU B  23
LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
ALA B  82
ILE A  84
ILE B  84
 478 B 200
3EKP_C_478C200 3ekp 478

DB00701
(Amprenavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE no annotation 20 LEU C  23
LEU D  23
ASP D  25
ASP C  25
GLY D  27
ALA C  28
ALA D  28
ASP D  30
ASP C  30
VAL C  32
VAL D  32
ILE D  47
GLY D  49
GLY C  49
ILE C  50
ILE D  50
PRO C  81
ALA C  82
ILE D  84
ILE C  84
 478 C 200
3EKQ_A_ROCA100 3ekq ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		22 ARG B   8
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL B  32
ILE B  47
ILE A  47
VAL A  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
PRO B  81
PRO A  81
THR A  82
ILE A  84
ILE B  84
 ROC A 100
3EKT_B_017B200 3ekt 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		18 LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
ILE B  50
PRO B  81
ALA B  82
ILE B  84
 017 B 200
3EKT_D_017D200 3ekt 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE no annotation 22 LEU C  23
LEU D  23
ASP D  25
ASP C  25
GLY C  27
GLY D  27
ALA C  28
ALA D  28
ASP D  29
ASP C  29
ASP C  30
ASP D  30
VAL C  32
VAL D  32
GLY D  49
GLY C  49
ILE D  50
ILE C  50
PRO D  81
PRO C  81
ILE D  84
ILE C  84
 017 D 200
3EKV_A_478A200 3ekv 478

DB00701
(Amprenavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		19 LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
ILE B  50
PRO B  81
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 478 A 200
3EKW_B_DR7B100 3ekw DR7

DB01072
(Atazanavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		23 ARG B   8
ARG A   8
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ILE B  47
ILE A  47
VAL B  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
ALA B  82
ALA A  82
ILE A  84
ILE B  84
 DR7 B 100
3EKX_B_1UNB201 3ekx 1UN

DB00220
(Nelfinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		22 ARG B   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
PRO B  81
PRO A  81
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 1UN B 201
3EKY_A_DR7A100 3eky DR7

DB01072
(Atazanavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		19 ARG B   8
ARG A   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL B  82
VAL A  82
ILE A  84
ILE B  84
 DR7 A 100
3EL0_A_1UNA201 3el0 1UN

DB00220
(Nelfinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		17 LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL B  32
ILE B  47
GLY B  49
ILE B  50
THR A  80
PRO A  81
PRO B  81
ALA B  82
ILE A  84
ILE B  84
 1UN A 201
3EL1_A_DR7A100 3el1 DR7

DB01072
(Atazanavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		23 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
VAL B  32
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 DR7 A 100
3EL4_A_ROCA100 3el4 ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		21 ARG B   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL B  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
PRO A  81
PRO B  81
THR A  82
THR B  82
VAL A  84
 ROC A 100
3EL5_B_1UNB201 3el5 1UN

DB00220
(Nelfinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		22 LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR B  80
PRO B  81
PRO A  81
THR A  82
THR B  82
VAL B  84
 1UN B 201
3EL9_A_DR7A100 3el9 DR7

DB01072
(Atazanavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		18 ARG B   8
ARG A   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
ILE B  50
PRO A  81
PRO B  81
THR A  82
THR B  82
 DR7 A 100
3EM3_B_478B200 3em3 478

DB00701
(Amprenavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		20 LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
LEU A  50
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 478 B 200
3EM4_A_DR7A100 3em4 DR7

DB01072
(Atazanavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		20 ARG A   8
ARG B   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ILE A  47
GLY B  49
GLY A  49
LEU A  50
LEU B  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 DR7 A 100
3EM4_V_DR7V100 3em4 DR7

DB01072
(Atazanavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE no annotation 21 ARG U   8
ARG V   8
ASP U  25
ASP V  25
GLY U  27
ALA U  28
ASP V  29
ASP U  29
ILE V  47
ILE U  47
GLY V  48
GLY V  49
GLY U  49
LEU U  50
LEU V  50
PRO U  81
PRO V  81
VAL U  82
VAL V  82
ILE U  84
ILE V  84
 DR7 V 100
3EM6_A_017A200 3em6 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		20 ARG B   8
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
LEU A  50
LEU B  50
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE B  84
 017 A 200
3GGU_B_017B201 3ggu 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		22 ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL A  32
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
THR A  82
THR B  82
VAL A  84
 017 B 201
3HVT_A_NVPA557 3hvt NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE
(SUBUNIT P66) 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		9 LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 319
 NVP A 557
3JVY_B_017B401 3jvy 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		GAG-POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		26 LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  32
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
 017 B 401
3JW2_A_017A401 3jw2 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		GAG-POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		26 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  32
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
 017 A 401
3K4V_B_ROCB201 3k4v ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		32 TRP C   6
ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY B  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
THR B  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 ROC B 201
3K4V_D_ROCD201 3k4v ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		31 ARG D   8
ARG C   8
LEU C  23
LEU D  23
ASP D  25
ASP C  25
GLY C  27
GLY D  27
ALA C  28
ALA D  28
ASP D  29
ASP C  29
ASP C  30
ASP D  30
VAL C  32
VAL D  32
ILE D  47
ILE C  47
GLY C  48
GLY D  49
GLY C  49
ILE D  50
ILE C  50
THR D  80
THR C  80
PRO D  81
PRO C  81
VAL D  82
VAL C  82
ILE D  84
ILE C  84
 ROC D 201
3LP0_A_NVPA701 3lp0 NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		9 LEU A 100
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 NVP A 701
3LP1_A_NVPA701 3lp1 NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		10 LEU A 100
ASN A 103
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 NVP A 701
3LZS_A_017A200 3lzs 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		25 ARG B   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 017 A 200
3LZU_A_017A200 3lzu 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		24 LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 017 A 200
3LZV_A_017A200 3lzv 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		21 ARG B   8
LEU A  23
ASP B  25
ASP A  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASN A  30
ASN B  30
VAL B  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
ILE B  50
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE B  84
 017 A 200
3M8P_A_65BA562 3m8p 65B

DB06414
(Etravirine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H;
P51 RT 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_thumb)
PF06815
(RVT_1)
PF06817
(RVT_connect)
PF00078
(RVT_thumb)
PF06815
(RVT_1)
PF06817
(RVT_connect) 		11 LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 65B A 562
3MEC_A_65BA561 3mec 65B

DB06414
(Etravirine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		P51 REVERSE
TRANSCRIPTASE;
P66 REVERSE
TRANSCRIPTASE 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_thumb)
PF06815
(RVT_1)
PF06817
(RVT_connect)
PF00078
(RVT_thumb)
PF06815
(RVT_1)
PF06817
(RVT_connect) 		13 LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
PRO A 236
TYR A 318
 65B A 561
3MED_A_65BA561 3med 65B

DB06414
(Etravirine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		P51 REVERSE
TRANSCRIPTASE;
P66 REVERSE
TRANSCRIPTASE 		PF00075
(RVT_thumb)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RNase_H)
PF00078
(RVT_connect)
PF06815
(RVT_thumb)
PF06817
(RVT_1) 		12 LEU A 100
ASN A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 65B A 561
3MEE_A_T27A561 3mee T27

DB08864
(Rilpivirine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		P51 REVERSE
TRANSCRIPTASE;
P66 REVERSE
TRANSCRIPTASE 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		13 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 101
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 T27 A 561
3MEG_A_T27A561 3meg T27

DB08864
(Rilpivirine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		P51 REVERSE
TRANSCRIPTASE;
P66 REVERSE
TRANSCRIPTASE 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		13 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 101
ASN A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 T27 A 561
3MWS_B_017B201 3mws 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		27 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  32
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
 017 B 201
3N3I_A_ROCA201 3n3i ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP) 		18 ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ILE A  47
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ARG A1008
ASP A1025
ALA A1028
ASP A1030
ILE A1047
GLY A1049
ILE A1050
VAL A1082
 ROC A 201
3NDT_A_ROCA101 3ndt ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		30 TRP C   6
ARG B   9
ARG A   9
LEU A  24
LEU B  24
ASP A  26
ASP B  26
GLY A  28
GLY B  28
ALA B  29
ALA A  29
ASP B  30
ASP A  30
ASP B  31
ASP A  31
VAL A  33
ILE B  48
ILE A  48
GLY A  50
GLY B  50
ILE B  51
ILE A  51
THR A  81
THR B  81
PRO B  82
PRO A  82
VAL A  83
VAL B  83
ILE A  85
ILE B  85
 ROC A 101
3NDT_D_ROCD100 3ndt ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE no annotation 28 ARG D   8
ARG C   8
LEU C  23
LEU D  23
ASP D  25
ASP C  25
GLY C  27
GLY D  27
ALA C  28
ALA D  28
ASP D  29
ASP C  29
ASP C  30
ASP D  30
VAL D  32
ILE C  47
GLY D  49
GLY C  49
ILE D  50
ILE C  50
THR D  80
THR C  80
PRO D  81
PRO C  81
VAL D  82
VAL C  82
ILE D  84
ILE C  84
 ROC D 100
3NDU_A_ROCA101 3ndu ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		29 TRP C   6
ARG B   9
ARG A   9
LEU A  24
LEU B  24
ASP A  26
ASP B  26
GLY A  28
GLY B  28
ALA B  29
ALA A  29
ASP B  30
ASP A  30
ASP B  31
ASP A  31
ILE B  48
ILE A  48
GLY A  50
GLY B  50
ILE B  51
ILE A  51
THR A  81
THR B  81
PRO B  82
PRO A  82
VAL A  83
VAL B  83
ILE A  85
ILE B  85
 ROC A 101
3NDU_D_ROCD100 3ndu ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE no annotation 29 ARG D   8
ARG C   8
LEU C  23
LEU D  23
ASP D  25
ASP C  25
GLY C  27
GLY D  27
ALA D  28
ASP D  29
ASP C  29
ASP C  30
ASP D  30
VAL C  32
VAL D  32
ILE D  47
ILE C  47
GLY D  49
GLY C  49
ILE D  50
ILE C  50
THR D  80
THR C  80
PRO D  81
PRO C  81
VAL D  82
VAL C  82
ILE D  84
ILE C  84
 ROC D 100
3NDW_A_RITA100 3ndw RIT

DB00503
(Ritonavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		22 ARG B   8
ARG A   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP A  30
VAL A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 RIT A 100
3NDX_A_RITA100 3ndx RIT

DB00503
(Ritonavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		23 ARG B   8
ARG A   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 RIT A 100
3NU3_B_478B401 3nu3 478

DB00701
(Amprenavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		24 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  30
VAL A  32
ILE A  47
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 130
VAL B 132
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
ILE B 184
 478 B 401
3NU4_B_478B401 3nu4 478

DB00701
(Amprenavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		18 ASP A  25
ALA A  28
ASP A  30
ILE A  32
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 130
ILE B 132
GLY B 149
ILE B 150
ILE B 184
 478 B 401
3NU5_B_478B401 3nu5 478

DB00701
(Amprenavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		25 LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  30
VAL A  32
ILE A  47
GLY A  49
VAL A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 130
VAL B 132
ILE B 147
GLY B 149
VAL B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
 478 B 401
3NU6_B_478B401 3nu6 478

DB00701
(Amprenavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		20 LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
ILE B  50
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE B  84
ILE A  84
 478 B 401
3NU9_A_478A401 3nu9 478

DB00701
(Amprenavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		18 ASP A  25
ALA A  28
ASP A  30
VAL A  32
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 130
VAL B 132
GLY B 149
ILE B 150
VAL B 182
VAL B 184
 478 A 401
3NUJ_B_478B401 3nuj 478

DB00701
(Amprenavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		19 LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
ILE B  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE B  84
ILE A  84
 478 B 401
3NUO_B_478B478 3nuo 478

DB00701
(Amprenavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		18 LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
ILE A  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
ILE B  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE B  84
ILE A  84
 478 B 478
3OXC_A_ROCA401 3oxc ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		29 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  32
ILE A  47
GLY A  49
ILE A  50
THR A  80
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
THR B 180
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
 ROC A 401
3OXV_A_478A200 3oxv 478

DB00701
(Amprenavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP) 		6 GLU A  35
TRP A  42
PRO A  44
LYS A  55
ARG A  57
GLY A  78
 478 A 200
3OXV_B_478B200 3oxv 478

DB00701
(Amprenavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		19 LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA A  28
ALA B  28
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
VAL A  50
VAL B  50
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE B  84
ILE A  84
 478 B 200
3OXV_C_478C200 3oxv 478

DB00701
(Amprenavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE no annotation 20 ARG D   8
LEU C  23
ASP D  25
ASP C  25
GLY C  27
ALA D  28
ALA C  28
ASP D  30
ASP C  30
VAL C  32
VAL D  32
ILE D  47
GLY D  49
GLY C  49
VAL D  50
VAL C  50
PRO D  81
VAL D  82
ILE C  84
ILE D  84
 478 C 200
3OXW_B_017B200 3oxw 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		20 LEU B  23
LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA A  28
ALA B  28
ASP A  29
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
VAL A  50
VAL B  50
PRO B  81
VAL A  82
ILE B  84
 017 B 200
3OXW_D_017D200 3oxw 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE no annotation 20 LEU C  23
LEU D  23
ASP D  25
ASP C  25
GLY C  27
ALA D  28
ALA C  28
ASP C  29
ASP D  30
ASP C  30
VAL D  32
ILE C  47
GLY D  49
GLY C  49
VAL D  50
VAL C  50
PRO D  81
VAL C  82
VAL D  82
ILE D  84
 017 D 200
3OXX_A_DR7A100 3oxx DR7

DB01072
(Atazanavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		24 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
VAL A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
VAL B  50
VAL A  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 DR7 A 100
3OXX_C_DR7C100 3oxx DR7

DB01072
(Atazanavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE no annotation 23 ARG D   8
ARG C   8
LEU C  23
LEU D  23
ASP D  25
ASP C  25
GLY C  27
ALA C  28
ALA D  28
ASP D  29
ASP C  29
ILE D  47
ILE C  47
GLY D  49
GLY C  49
VAL C  50
VAL D  50
PRO D  81
PRO C  81
VAL D  82
VAL C  82
ILE D  84
ILE C  84
 DR7 C 100
3OY4_B_017B200 3oy4 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		21 ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP B  29
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
 017 B 200
3PWM_B_017B402 3pwm 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		25 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  32
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
 017 B 402
3PWR_A_ROCA401 3pwr ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		29 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  32
ILE A  47
GLY A  49
ILE A  50
THR A  80
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
 ROC A 401
3QIP_A_NVPA561 3qip NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		REVERSE HIV-1
REVERSE
TRANSCRIPTASE P66 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		10 LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 NVP A 561
3QLH_A_T27A555 3qlh T27

DB08864
(Rilpivirine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		12 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 101
LYS A 103
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
PHE A 227
TRP A 229
PRO A 236
TYR A 318
 T27 A 555
3S43_A_478A401 3s43 478

DB00701
(Amprenavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP) 		19 ASP A  25
ALA A  28
ASP A  30
ILE A  32
VAL A  47
GLY A  49
ILE A  50
ILE A  82
ILE A  84
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 130
ILE B 132
VAL B 147
GLY B 149
ILE B 150
ILE B 184
 478 A 401
3S45_B_478B201 3s45 478

DB00701
(Amprenavir) 		Human
immunodeficiency
virus 2 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		20 LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP B  29
ASP A  30
ASP B  30
ILE A  32
ILE B  32
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
ILE B  82
ILE A  82
ILE A  84
ILE B  84
 478 B 201
3S53_A_017A201 3s53 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		20 ARG B   8
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ASP B  30
ILE A  32
ILE B  32
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
ILE B  50
PRO B  81
ILE B  82
ILE A  82
ILE B  84
 017 A 201
3S53_B_017B203 3s53 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE no annotation 5 TRP B  42
PRO B  44
LYS B  55
ARG B  57
GLY B  78
 017 B 203
3S54_B_017B201 3s54 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		27 ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
ILE B  32
ILE A  32
VAL A  47
VAL B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
ILE A  82
ILE B  82
ILE A  84
ILE B  84
 017 B 201
3S56_A_ROCA201 3s56 ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		21 ARG B   8
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ASP B  30
ILE A  32
VAL A  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
ILE B  50
THR A  80
PRO A  81
PRO B  81
ILE B  82
ILE A  82
ILE B  84
 ROC A 201
3S56_B_ROCB203 3s56 ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE no annotation 7 ARG B   8
LEU B  10
GLU B  21
LEU B  23
GLU B  34
PRO B  81
ILE B  82
 ROC B 203
3SO9_A_017A100 3so9 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		21 LEU B  23
ASN A  25
ASN B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
LEU B  76
THR A  80
PRO B  81
THR B  82
VAL B  84
 017 A 100
3SPK_A_TPVA100 3spk TPV

DB00932
(Tipranavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		18 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASN A  25
ASN B  25
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ILE A  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
THR A  82
THR B  82
 TPV A 100
3SPK_B_TPVB100 3spk TPV

DB00932
(Tipranavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		21 ARG B   8
ARG A   8
LEU B  23
LEU A  23
ASN A  25
ASN B  25
ALA B  28
ALA A  28
ASP B  29
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
THR A  82
THR B  82
 TPV B 100
3T3C_A_017A201 3t3c 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		17 ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE B  47
GLY B  49
ILE A  50
ILE B  50
PRO B  81
ALA B  82
VAL B  84
 017 A 201
3TKG_B_ROCB801 3tkg ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		29 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
ILE A  47
ILE B  47
GLY B  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
THR B  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 ROC B 801
3TKG_C_ROCC901 3tkg ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE no annotation 28 ARG D   8
ARG C   8
LEU D  23
ASP D  25
ASP C  25
GLY C  27
GLY D  27
ALA C  28
ALA D  28
ASP D  29
ASP C  29
ASP C  30
ASP D  30
VAL D  32
ILE D  47
ILE C  47
GLY D  49
GLY C  49
ILE D  50
ILE C  50
THR D  80
THR C  80
PRO D  81
PRO C  81
VAL D  82
VAL C  82
ILE D  84
ILE C  84
 ROC C 901
3TKW_B_017B401 3tkw 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		27 ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 017 B 401
3TL9_A_ROCA401 3tl9 ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		31 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY B  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
THR B  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 ROC A 401
3TTP_A_017A201 3ttp 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		20 ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP A  30
ASP B  30
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
LEU B  82
LEU A  82
ILE A  84
ILE B  84
 017 A 201
3U7S_A_017A201 3u7s 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		18 ARG B   8
LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ASP B  30
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
ILE B  50
PRO B  81
LEU B  82
VAL A  84
 017 A 201
3U7S_A_017A202 3u7s 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		18 LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP B  29
ASP A  30
ASP B  30
ILE A  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
ILE B  50
PRO A  81
LEU B  82
LEU A  82
VAL B  84
 017 A 202
3UCB_A_017A201 3ucb 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		27 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASN A  30
ASN B  30
ILE A  32
ILE B  32
VAL B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
VAL A  84
VAL B  84
 017 A 201
3UCB_B_017B202 3ucb 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE no annotation 7 TRP B  42
PRO B  44
MET B  46
LYS B  55
ARG B  57
GLY B  78
PRO B  79
 017 B 202
3V81_A_NVPA901 3v81 NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE P66
SUBUNIT 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		8 LEU A 100
LYS A 103
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 NVP A 901
3V81_C_NVPC901 3v81 NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE P66
SUBUNIT 		no annotation 8 LEU C 100
VAL C 106
VAL C 179
TYR C 181
TYR C 188
TRP C 229
LEU C 234
TYR C 318
 NVP C 901
4B3O_A_EFZA1557 4b3o EFZ

DB00625
(Efavirenz) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		9 LEU A 100
LYS A 101
LYS A 103
VAL A 106
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
LEU A 234
TYR A 318
 EFZ A1557
4B3Q_A_NVPA999 4b3q NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		7 LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
TYR A 181
TYR A 188
LEU A 234
TYR A 318
 NVP A 999
4DQB_B_017B101 4dqb 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		ASPARTYL PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		22 ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
 017 B 101
4DQC_A_017A101 4dqc 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		ASPARTYL PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		19 ARG A   8
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP B  29
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
 017 A 101
4DQE_B_017B101 4dqe 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		ASPARTYL PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		21 ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP B  29
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
 017 B 101
4DQF_B_017B101 4dqf 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		ASPARTYL PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		22 ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL A  32
ILE A  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 017 B 101
4DQH_B_017B101 4dqh 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		WILD-TYPE HIV-1
PROTEASE DIMER 		PF00077
(RVP)
no annotation 		21 ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP B  29
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
 017 B 101
4EYR_B_RITB301 4eyr RIT

DB00503
(Ritonavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		15 ARG B   8
LEU A  23
ASN A  25
ASN B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
VAL A  32
ILE A  50
PRO B  81
THR A  82
THR B  82
 RIT B 301
4G1Q_A_T27A601 4g1q T27

DB08864
(Rilpivirine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		P51 RT;
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		15 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 101
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
PRO A 236
TYR A 318
 T27 A 601
4HLA_A_017A200 4hla 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		23 ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 017 A 200
4ICL_A_T27A601 4icl T27

DB08864
(Rilpivirine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		P51 RT;
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		14 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 101
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 T27 A 601
4ID5_A_T27A601 4id5 T27

DB08864
(Rilpivirine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		P51 RT;
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		14 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
PRO A 236
TYR A 318
 T27 A 601
4IDK_A_T27A601 4idk T27

DB08864
(Rilpivirine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		P51 RT;
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		14 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 101
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 T27 A 601
4IFV_A_T27A601 4ifv T27

DB08864
(Rilpivirine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		EXORIBONUCLEASE H,
P66 RT;
GAG-POL POLYPROTEIN 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		14 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
PRO A 236
TYR A 318
 T27 A 601
4IFY_A_T27A601 4ify T27

DB08864
(Rilpivirine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		P51 RT;
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		14 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
PRO A 236
TYR A 318
 T27 A 601
4IG3_A_T27A601 4ig3 T27

DB08864
(Rilpivirine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		P51 RT;
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		14 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
PRO A 236
TYR A 318
 T27 A 601
4J5J_B_478B401 4j5j 478

DB00701
(Amprenavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		18 LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASN A  30
GLY A  49
ILE A  50
VAL A  82
ASP B 125
ALA B 128
ASN B 130
ILE B 132
VAL B 147
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
VAL B 184
 478 B 401
4J5J_B_478B402 4j5j 478

DB00701
(Amprenavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE no annotation 5 TRP B 142
PRO B 144
LYS B 155
ARG B 157
PRO B 179
 478 B 402
4JEC_B_478B401 4jec 478

DB00701
(Amprenavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		28 LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  32
ILE A  47
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
LEU B 176
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
 478 B 401
4KFB_A_T27A607 4kfb T27

DB08864
(Rilpivirine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		P51 RT;
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H,
EXORIBONUCLEA P66 RT 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		14 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
PRO A 236
TYR A 318
 T27 A 607
4L1A_A_AB1A101 4l1a AB1

DB01601
(Lopinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		MDR769 HIV-1
PROTEASE 		PF00077
(RVP) 		17 ARG B   8
ARG A   8
ASN A  25
ASN B  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP A  30
GLY B  48
ILE A  50
THR A  80
PRO A  81
PRO B  81
THR A  82
THR B  82
VAL A  84
 AB1 A 101
4LAJ_B_ACAB512 4laj ACA

DB00513
(Aminocaproic
Acid) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 YU2 GP120
ENVELOPE
GLYCOPROTEIN 		PF00516
(GP120)
no annotation 		6 ASP B  57
PRO B 214
HIS B 216
ARG B 252
ARG A 440
GLY A 441
 ACA B 512
4LL3_A_017A201 4ll3 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		18 LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP B  29
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE B  84
ILE A  84
 017 A 201
4LL3_A_017A202 4ll3 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		19 ARG B   8
LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
PRO B  81
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 017 A 202
4NJT_B_017B101 4njt 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		21 LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP B  29
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
THR A  82
THR B  82
ILE A  84
 017 B 101
4NJT_D_017D101 4njt 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE no annotation 20 LEU C  23
LEU D  23
ASP D  25
ASP C  25
GLY D  27
ALA C  28
ALA D  28
ASP D  29
ASP D  30
ASP C  30
VAL C  32
VAL D  32
ILE C  47
GLY C  49
ILE C  50
ILE D  50
PRO C  81
THR D  82
THR C  82
ILE C  84
 017 D 101
4NJU_A_TPVA500 4nju TPV

DB00932
(Tipranavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		22 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
THR A  82
THR B  82
ILE B  84
 TPV A 500
4NJU_C_TPVC500 4nju TPV

DB00932
(Tipranavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE no annotation 22 ARG D   8
ARG C   8
LEU C  23
LEU D  23
ASP D  25
ASP C  25
ALA C  28
ALA D  28
ASP C  29
ASP C  30
VAL C  32
VAL D  32
ILE C  47
GLY D  49
GLY C  49
ILE D  50
ILE C  50
PRO D  81
PRO C  81
THR D  82
THR C  82
ILE D  84
 TPV C 500
4NJV_A_RITA500 4njv RIT

DB00503
(Ritonavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		23 ARG B   8
ARG A   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
THR A  82
THR B  82
ILE A  84
ILE B  84
 RIT A 500
4NJV_D_RITD500 4njv RIT

DB00503
(Ritonavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE no annotation 24 ARG D   8
ARG C   8
ASP D  25
ASP C  25
GLY C  27
GLY D  27
ALA D  28
ASP D  29
ASP C  29
ASP D  30
VAL C  32
VAL D  32
ILE D  47
ILE C  47
GLY D  49
GLY C  49
ILE D  50
ILE C  50
PRO D  81
PRO C  81
THR D  82
THR C  82
ILE D  84
ILE C  84
 RIT D 500
4NPT_A_017A401 4npt 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP) 		9 ASN A  25
ALA A  28
ILE A  47
GLY A  48
ILE A  50
MET A  54
THR A  80
ILE A  82
VAL A  84
 017 A 401
4PUO_A_NVPA901 4puo NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE, P66
SUBUNIT 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		9 PRO A  95
LEU A 100
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 NVP A 901
4PUO_C_NVPC901 4puo NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE, P66
SUBUNIT 		no annotation 8 LEU C 100
VAL C 106
VAL C 179
TYR C 181
TYR C 188
TRP C 229
LEU C 234
TYR C 318
 NVP C 901
4PWD_A_NVPA901 4pwd NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE, P66
SUBUNIT 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		8 PRO A  95
LEU A 100
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
TRP A 229
LEU A 234
 NVP A 901
4PWD_C_NVPC901 4pwd NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE, P66
SUBUNIT 		no annotation 8 LEU C 100
VAL C 106
VAL C 179
TYR C 181
TYR C 188
TRP C 229
LEU C 234
TYR C 318
 NVP C 901
4Q0B_A_NVPA901 4q0b NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE, P66
SUBUNIT 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		8 LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
TRP A 229
LEU A 234
 NVP A 901
4Q0B_C_NVPC901 4q0b NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE, P66
SUBUNIT 		no annotation 9 LEU C 100
LYS C 103
VAL C 106
VAL C 179
TYR C 181
TYR C 188
TRP C 229
LEU C 234
TYR C 318
 NVP C 901
4Q1W_A_017A104 4q1w 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		ASPARTYL PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		19 ARG B   8
LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
ILE B  50
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE B  84
 017 A 104
4Q1X_A_017A101 4q1x 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		ASPARTYL PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		23 ARG B   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  30
ASP A  30
ILE B  32
ILE A  32
ILE B  47
ILE A  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE B  84
 017 A 101
4Q1Y_A_017A106 4q1y 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		ASPARTYL PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		22 ARG B   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  30
ASP A  30
ILE B  32
ILE A  32
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE B  84
 017 A 106
4Q5M_A_ROCA1101 4q5m ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP) 		27 ARG A   8
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASN A  30
VAL A  32
ILE A  47
GLY A  49
ILE A  50
THR A  80
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ARG A1008
ASP A1025
GLY A1027
ASP A1029
ASN A1030
VAL A1032
ILE A1047
GLY A1049
ILE A1050
THR A1080
PRO A1081
VAL A1082
ILE A1084
 ROC A1101
4QGI_A_ROCA101 4qgi ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		22 ARG B   8
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL B  32
ILE B  47
ILE A  47
THR A  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE B  84
 ROC A 101
4RVJ_B_478B101 4rvj 478

DB00701
(Amprenavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		20 LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
THR A  82
ILE A  84
ILE B  84
 478 B 101
4RVJ_D_478D101 4rvj 478

DB00701
(Amprenavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE no annotation 20 LEU C  23
LEU D  23
ASP D  25
ASP C  25
GLY D  27
ALA C  28
ALA D  28
ASP D  30
ASP C  30
VAL C  32
VAL D  32
ILE C  47
GLY D  49
GLY C  49
ILE C  50
ILE D  50
PRO C  81
THR C  82
ILE D  84
ILE C  84
 478 D 101
4Y1D_D_DVAD5 4y1d DVA

DB00161
(L-
Valine) 		Human
immunodeficiency
virus 1;
synthetic
construct 		CYCLIC HEXAPEPTIDE
CYC[NDPOPPKID];
INTEGRASE 		None
PF00665
(rve) 		3 LYS D   1
ASN D   4
GLU A 170
 DVA D   5
4YOA_A_017A100 4yoa 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP) 		6 ASN A  25
ASP A  29
THR A  80
PRO A  81
THR A  82
VAL A  84
 017 A 100
5CYM_A_T27A601 5cym T27

DB08864
(Rilpivirine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE, P51
SUBUNIT;
HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE, P66
SUBUNIT 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		13 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 101
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 T27 A 601
5CYQ_A_T27A601 5cyq T27

DB08864
(Rilpivirine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE, P51
SUBUNIT;
HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE, P66
SUBUNIT 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		13 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 101
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 T27 A 601
5E5J_A_017A201 5e5j 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		27 ARG B   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
ILE B  32
ILE A  32
VAL A  47
VAL B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
LEU B  76
PRO B  81
ILE A  82
ILE B  82
ILE A  84
ILE B  84
 017 A 201
5E5K_B_017B201 5e5k 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		27 ARG B   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
ILE B  32
ILE A  32
VAL A  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
LEU B  76
PRO B  81
PRO A  81
ILE A  82
ILE B  82
ILE A  84
ILE B  84
 017 B 201
5HBM_A_NVPA601 5hbm NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		11 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 NVP A 601
5HP1_A_PPFA602 5hp1 PPF

DB00529
(Foscarnet) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE P66
SUBUNIT 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		6 LYS A  65
ARG A  72
ASP A 110
GLY A 112
ASP A 113
ASP A 185
 PPF A 602
5HP1_C_PPFC601 5hp1 PPF

DB00529
(Foscarnet) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE P66
SUBUNIT 		no annotation 6 LYS C  65
ARG C  72
ASP C 110
GLY C 112
ASP C 185
LYS C 220
 PPF C 601
5KQX_A_ROCA101 5kqx ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE E35D-SQV PF00077
(RVP)
no annotation 		21 ARG B   8
LEU B  23
ASN A  25
ASN B  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL B  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
ILE A  84
ILE B  84
 ROC A 101
5KQY_B_017B101 5kqy 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE E35D-DRV PF00077
(RVP)
no annotation 		19 ARG A   8
LEU A  23
ASN A  25
ASN B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP B  29
ASP A  30
ASP B  30
VAL A  32
ILE A  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
 017 B 101
5KR0_A_478A101 5kr0 478

DB00701
(Amprenavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE E35D-APV PF00077
(RVP)
no annotation 		18 LEU B  23
ASN A  25
ASN B  25
GLY B  27
ALA A  28
ALA B  28
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
ILE A  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
 478 A 101
5KR1_B_017B101 5kr1 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PR5-DRV PF00077
(RVP)
no annotation 		18 ARG A   8
LEU A  23
ASN A  25
ASN B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP B  29
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
ILE A  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
VAL A  82
ILE A  84
 017 B 101
5KR2_A_ROCA101 5kr2 ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PR5-SQV PF00077
(RVP)
no annotation 		20 ARG B   8
LEU B  23
ASN A  25
ASN B  25
ALA A  28
ALA B  28
ASP A  29
ASP A  30
ASP B  30
ILE A  47
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL B  82
ILE B  84
 ROC A 101
5KR2_C_ROCC101 5kr2 ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PR5-SQV no annotation 18 ARG D   8
LEU D  23
ASN D  25
ASN C  25
ALA C  28
ASP C  29
ASP C  30
ILE D  47
ILE C  47
GLY D  49
GLY C  49
ILE D  50
ILE C  50
THR C  80
PRO C  81
PRO D  81
VAL D  82
ILE D  84
 ROC C 101
5NVP_A_ACAA18 5nvp ACA

DB00513
(Aminocaproic
Acid) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		ENVELOPE
GLYCOPROTEIN,GP41 		no annotation 16 SER A  15
LYS A  16
LYS A  17
LYS A  19
ASN A  20
GLU A  21
GLN A  22
GLU A  23
LEU A  24
LEU A  25
GLU A  26
LEU A  27
LYS A  29
TRP A  30
LEU A  33
TRP A  34
 ACA A  18
5NWU_A_ACAA18 5nwu ACA

DB00513
(Aminocaproic
Acid) 		Human
immunodeficiency
virus 1;
unidentified 		WTFP-TAG,GP41 no annotation 15 ALA A  13
GLY A  14
SER A  15
LYS A  16
LYS A  17
LYS A  19
ASN A  20
GLU A  21
GLN A  22
GLU A  23
LEU A  24
LEU A  25
GLU A  26
LEU A  27
TRP A  30
 ACA A  18
5NWV_A_ACAA18 5nwv ACA

DB00513
(Aminocaproic
Acid) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		SCRFP-TAG,GP41 no annotation 19 LEU A  11
GLY A  14
SER A  15
LYS A  16
LYS A  17
LYS A  19
ASN A  20
GLU A  21
GLN A  22
GLU A  23
LEU A  24
LEU A  25
GLU A  26
LEU A  27
ASP A  28
TRP A  30
ALA A  31
LEU A  33
TRP A  34
 ACA A  18
5NWW_A_ACAA18 5nww ACA

DB00513
(Aminocaproic
Acid) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		SCRFP-TAG,GP41 no annotation 15 GLY A  14
SER A  15
LYS A  16
LYS A  17
LYS A  19
ASN A  20
GLN A  22
GLU A  23
LEU A  24
LEU A  25
GLU A  26
LEU A  27
LYS A  29
TRP A  30
SER A  32
 ACA A  18
5T2Z_B_017B201 5t2z 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		24 LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
SER A  82
SER B  82
ILE A  84
ILE B  84
 017 B 201
5T8H_B_478B401 5t8h 478

DB00701
(Amprenavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation 		28 LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ILE A  32
VAL A  47
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
ILE A  82
ILE A  84
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
ILE B 132
VAL B 147
GLY B 149
ILE B 150
LEU B 176
PRO B 181
ILE B 182
ILE B 184
 478 B 401
6BSG_A_EFZA601 6bsg EFZ

DB00625
(Efavirenz) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		REVERSE
TRANSCRIPTASE P66
SUBUNIT 		no annotation 10 LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 EFZ A 601
6BSH_A_EFZA601 6bsh EFZ

DB00625
(Efavirenz) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		REVERSE
TRANSCRIPTASE P51
SUBUNIT;
REVERSE
TRANSCRIPTASE P66
SUBUNIT 		no annotation 11 LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 EFZ A 601
6BSI_A_EFZA601 6bsi EFZ

DB00625
(Efavirenz) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		REVERSE
TRANSCRIPTASE P66
SUBUNIT 		no annotation 10 LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 EFZ A 601
6BSJ_A_EFZA601 6bsj EFZ

DB00625
(Efavirenz) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		REVERSE
TRANSCRIPTASE P66
SUBUNIT 		no annotation 10 LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 EFZ A 601
6DGX_A_017A101 6dgx 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE None
PF00077
(RVP) 		28 ARG B   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE B  47
ILE A  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
LEU B  76
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 017 A 101
6DH0_A_017A101 6dh0 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE None
PF00077
(RVP) 		28 ARG B   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE B  47
ILE A  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
LEU B  76
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
VAL A  84
VAL B  84
 017 A 101
6DH3_A_017A101 6dh3 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE None
PF00077
(RVP) 		26 ARG B   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
LEU B  76
PRO B  81
PRO A  81
ILE A  82
ILE B  82
ILE A  84
ILE B  84
 017 A 101
6DH6_A_017A104 6dh6 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE None
PF00077
(RVP) 		27 ARG B   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
VAL B  50
VAL A  50
LEU B  76
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 017 A 104
6DIF_B_TPVB201 6dif TPV

DB00932
(Tipranavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE None
PF00077
(RVP) 		27 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 TPV B 201
6DIL_B_TPVB201 6dil TPV

DB00932
(Tipranavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE None
PF00077
(RVP) 		27 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 TPV B 201
6DJ1_B_AB1B201 6dj1 AB1

DB01601
(Lopinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE None
PF00077
(RVP) 		27 ARG B   8
ARG A   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL A  32
VAL B  32
ILE B  47
GLY A  48
GLY B  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 AB1 B 201
6DJ2_B_AB1B201 6dj2 AB1

DB01601
(Lopinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 PROTEASE None
PF00077
(RVP) 		22 ARG B   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE B  47
ILE A  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
 AB1 B 201
6ELI_A_T27A701 6eli T27

DB08864
(Rilpivirine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		GAG-POL POLYPROTEIN;
REVERSE
TRANSCRIPTASE 		no annotation 13 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 T27 A 701
6G9I_B_CXXB707 6g9i CXX

DB01242
(Clomipramine) 		Human
immunodeficiency
virus 1;
Zaire ebolavirus 		ENVELOPE
GLYCOPROTEIN,ENVELOP
E GLYCOPROTEIN 		no annotation 7 ILE A  38
LEU A  43
VAL A  66
LEU A 184
LEU A 186
MET B 548
LEU B 558
 CXX B 707