DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'Escherichia'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1AJ0_A_SANA561 1aj0 SAN

DB00259
(Sulfanilamide) 		Escherichia coli DIHYDROPTEROATE
SYNTHASE 		PF00809
(Pterin_bind) 		4 ARG A  63
ARG A 220
LYS A 221
HIS A 257
 SAN A 561
1AJ6_A_NOVA1 1aj6 NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Escherichia coli GYRASE PF02518
(HATPase_c) 		9 ASN A  46
GLU A  50
ASP A  73
ARG A  76
ILE A  78
PRO A  79
ALA A  90
ILE A  94
THR A 165
 NOV A   1
1AXW_A_MTXA732 1axw MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli THYMIDYLATE SYNTHASE PF00303
(Thymidylat_synt) 		12 LYS A  48
HIS A  51
ILE A  79
TRP A  83
LEU A 143
ASP A 169
LEU A 172
GLY A 173
PHE A 176
TYR A 209
VAL A 262
ALA A 263
 MTX A 732
1AXW_B_MTXB733 1axw MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli THYMIDYLATE SYNTHASE no annotation 11 LYS B  48
HIS B  51
ILE B  79
TRP B  80
TRP B  83
ASP B 169
LEU B 172
GLY B 173
PHE B 176
TYR B 209
VAL B 262
 MTX B 733
1B23_R_CYSR976 1b23 CYS

DB00151
(L-
Cysteine) 		Escherichia coli;
Thermus aquaticus 		CYSTEINYL TRNA;
ELONGATION FACTOR TU 		None
PF00009
(GTP_EFTU_D3)
PF03143
(GTP_EFTU_D2)
PF03144
(GTP_EFTU) 		4 HIS P  67
HIS P 273
ARG P 274
ASN P 285
 CYS R 976
1CLA_A_CLMA221 1cla CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli TYPE III
CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		PF00302
(CAT) 		10 THR A  94
PHE A 103
ALA A 105
PHE A 135
ASN A 146
ALA A 148
LEU A 160
VAL A 162
TYR A 168
ILE A 172
 CLM A 221
1CMA_A_SAMA105 1cma SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli PROTEIN (MET
REPRESSOR) 		None
PF01340
(MetJ) 		8 GLU B  39
ARG B  42
ARG B  43
LEU B  56
GLU B  59
HIS B  63
PHE A  65
LEU B  70
 SAM A 105
1CMA_B_SAMB105 1cma SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli PROTEIN (MET
REPRESSOR) 		None
PF01340
(MetJ) 		11 GLU A  39
ARG A  42
ARG A  43
LEU A  56
GLU A  59
HIS B  63
HIS A  63
ALA B  64
PHE B  65
GLY B  67
LEU A  70
 SAM B 105
1CMC_A_SAMA105 1cmc SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli MET REPRESSOR None
PF01340
(MetJ) 		10 GLU B  39
ARG B  43
LEU B  56
GLU B  59
HIS B  63
ALA A  64
PHE A  65
GLY A  67
LEU B  70
PRO B  71
 SAM A 105
1CMC_B_SAMB105 1cmc SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli MET REPRESSOR None
PF01340
(MetJ) 		10 GLU A  39
ARG A  42
ARG A  43
LEU A  56
GLU A  59
HIS A  63
ALA B  64
PHE B  65
GLY B  67
LEU A  70
 SAM B 105
1D8C_A_SORA4000 1d8c SOR

DB01638
(Sorbitol) 		Escherichia coli MALATE SYNTHASE G PF01274
(Malate_synthase) 		3 GLN A  61
HIS A 462
PRO A 704
 SOR A4000
1DDR_A_MTXA200 1ddr MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		14 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
LYS A  32
THR A  46
SER A  49
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 MTX A 200
1DDR_B_MTXB200 1ddr MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		no annotation 14 ILE B   5
ALA B   7
ASP B  27
LEU B  28
TRP B  30
PHE B  31
LYS B  32
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
ARG B  57
ILE B  94
TYR B 100
THR B 113
 MTX B 200
1DDS_A_MTXA201 1dds MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		13 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 MTX A 201
1DDS_B_MTXB201 1dds MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		no annotation 13 ILE B   5
ALA B   7
ASP B  27
LEU B  28
LYS B  32
SER B  49
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
ARG B  57
ILE B  94
TYR B 100
THR B 113
 MTX B 201
1DFO_A_FFOA1002 1dfo FFO

DB11596
(Levoleucovorin) 		Escherichia coli SERINE
HYDROXYMETHYLTRANSFE
RASE 		None
PF00464
(SHMT) 		20 GLU B  57
TYR B  64
TYR B  65
LEU A 121
GLY A 124
HIS A 126
LEU A 127
VAL A 133
SER A 175
ALA A 176
SER D 245
GLU D 246
GLU D 247
PHE B 257
PRO B 258
ASN A 347
SER A 355
PRO A 356
PHE A 357
ARG A 363
 FFO A1002
1DFO_B_FFOB2002 1dfo FFO

DB11596
(Levoleucovorin) 		Escherichia coli SERINE
HYDROXYMETHYLTRANSFE
RASE 		None
PF00464
(SHMT) 		17 GLU A  57
TYR A  64
TYR A  65
LEU B 121
GLY B 124
HIS B 126
LEU B 127
VAL B 133
SER B 175
ALA B 176
PHE A 257
PRO A 258
ASN B 347
SER B 355
PRO B 356
PHE B 357
ARG B 363
 FFO B2002
1DFO_C_FFOC3002 1dfo FFO

DB11596
(Levoleucovorin) 		Escherichia coli SERINE
HYDROXYMETHYLTRANSFE
RASE 		None 20 GLU D  57
TYR D  64
TYR D  65
LEU C 121
GLY C 124
HIS C 126
LEU C 127
VAL C 133
SER C 175
ALA C 176
SER B 245
GLU B 246
GLU B 247
PHE D 257
PRO D 258
ASN C 347
SER C 355
PRO C 356
PHE C 357
ARG C 363
 FFO C3002
1DFO_D_FFOD4002 1dfo FFO

DB11596
(Levoleucovorin) 		Escherichia coli SERINE
HYDROXYMETHYLTRANSFE
RASE 		None 17 GLU C  57
TYR C  64
TYR C  65
LEU D 121
GLY D 124
HIS D 126
LEU D 127
VAL D 133
SER D 175
ALA D 176
PHE C 257
PRO C 258
ASN D 347
SER D 355
PRO D 356
PHE D 357
ARG D 363
 FFO D4002
1DHI_A_MTXA161 1dhi MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		12 ILE A   5
ALA A   7
LEU A  28
LYS A  32
SER A  49
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 MTX A 161
1DHI_B_MTXB361 1dhi MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		no annotation 11 ILE B   5
ALA B   7
LEU B  28
LYS B  32
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
ARG B  57
ILE B  94
TYR B 100
THR B 113
 MTX B 361
1DHJ_A_MTXA161 1dhj MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		12 ILE A   5
ALA A   7
LEU A  28
LYS A  32
SER A  49
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 MTX A 161
1DHJ_B_MTXB361 1dhj MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		no annotation 12 ILE B   5
ALA B   7
LEU B  28
LYS B  32
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
PRO B  55
ARG B  57
ILE B  94
TYR B 100
THR B 113
 MTX B 361
1DJR_F_BEZF1305 1djr BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Escherichia coli HEAT-LABILE
ENTEROTOXIN 		None 4 TYR F  12
ARG F  13
ASN F  14
TRP F  88
 BEZ F1305
1DRA_A_MTXA161 1dra MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		13 ILE A   5
ALA A   7
GLU A  27
LEU A  28
LYS A  32
SER A  49
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 MTX A 161
1DRA_B_MTXB361 1dra MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		no annotation 12 ILE B   5
ALA B   7
GLU B  27
LEU B  28
LYS B  32
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
ARG B  57
ILE B  94
TYR B 100
THR B 113
 MTX B 361
1DRB_A_MTXA161 1drb MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		12 ILE A   5
ALA A   7
LEU A  28
LYS A  32
SER A  49
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 MTX A 161
1DRB_B_MTXB361 1drb MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		no annotation 12 ILE B   5
ALA B   7
LEU B  28
PHE B  31
LYS B  32
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
ARG B  57
ILE B  94
TYR B 100
THR B 113
 MTX B 361
1DRE_A_MTXA161 1dre MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		14 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
PHE A  31
LYS A  32
SER A  49
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
 MTX A 161
1DYI_A_FOLA161 1dyi FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		13 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 161
1DYI_B_FOLB161 1dyi FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		None 14 ILE B   5
ALA B   7
ASP B  27
LEU B  28
TRP B  30
PHE B  31
LYS B  32
THR B  46
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
ARG B  57
TYR B 100
THR B 113
 FOL B 161
1EIZ_A_SAMA301 1eiz SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli FTSJ PF01728
(FtsJ) 		15 ALA A  35
GLY A  59
PRO A  62
GLY A  63
GLY A  64
TRP A  65
ASP A  83
LEU A  84
LEU A  85
ASP A  99
PHE A 100
ARG A 101
ASP A 124
LEU A 143
LYS A 164
 SAM A 301
1EJ0_A_SAMA301 1ej0 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli FTSJ PF01728
(FtsJ) 		15 ALA A  35
GLY A  59
PRO A  62
GLY A  63
GLY A  64
TRP A  65
ASP A  83
LEU A  84
LEU A  85
ASP A  99
PHE A 100
ARG A 101
ASP A 124
LEU A 143
LYS A 164
 SAM A 301
1EQB_A_FFOA1293 1eqb FFO

DB11596
(Levoleucovorin) 		Escherichia coli SERINE
HYDROXYMETHYLTRANSFE
RASE 		None
PF00464
(SHMT) 		18 GLU B  57
TYR B  64
LEU A 121
GLY A 124
HIS A 126
LEU A 127
VAL A 133
SER A 175
ALA A 176
SER D 245
GLU D 246
GLU D 247
PHE B 257
ASN A 347
SER A 355
PRO A 356
PHE A 357
ARG A 363
 FFO A1293
1EQB_A_GLYA1292 1eqb GLY

DB00145
(Glycine) 		Escherichia coli SERINE
HYDROXYMETHYLTRANSFE
RASE 		None
PF00464
(SHMT) 		8 SER A  35
TYR B  55
PHE B  65
HIS A 126
SER A 175
HIS A 203
LYS A 229
ARG A 363
 GLY A1292
1EQB_B_FFOB2293 1eqb FFO

DB11596
(Levoleucovorin) 		Escherichia coli SERINE
HYDROXYMETHYLTRANSFE
RASE 		None
PF00464
(SHMT) 		15 GLU A  57
TYR A  64
LEU B 121
GLY B 124
HIS B 126
LEU B 127
VAL B 133
SER B 175
ALA B 176
PHE A 257
ASN B 347
SER B 355
PRO B 356
PHE B 357
ARG B 363
 FFO B2293
1EQB_B_GLYB2292 1eqb GLY

DB00145
(Glycine) 		Escherichia coli SERINE
HYDROXYMETHYLTRANSFE
RASE 		None
PF00464
(SHMT) 		8 SER B  35
TYR A  55
PHE A  65
HIS B 126
SER B 175
HIS B 203
LYS B 229
ARG B 363
 GLY B2292
1EQB_C_FFOC3293 1eqb FFO

DB11596
(Levoleucovorin) 		Escherichia coli SERINE
HYDROXYMETHYLTRANSFE
RASE 		None 18 GLU D  57
TYR D  64
LEU C 121
GLY C 124
HIS C 126
LEU C 127
VAL C 133
SER C 175
ALA C 176
SER B 245
GLU B 246
GLU B 247
PHE D 257
ASN C 347
SER C 355
PRO C 356
PHE C 357
ARG C 363
 FFO C3293
1EQB_C_GLYC3292 1eqb GLY

DB00145
(Glycine) 		Escherichia coli SERINE
HYDROXYMETHYLTRANSFE
RASE 		None 8 SER C  35
TYR D  55
PHE D  65
HIS C 126
SER C 175
HIS C 203
LYS C 229
ARG C 363
 GLY C3292
1EQB_D_FFOD4293 1eqb FFO

DB11596
(Levoleucovorin) 		Escherichia coli SERINE
HYDROXYMETHYLTRANSFE
RASE 		None 15 GLU C  57
TYR C  64
LEU D 121
GLY D 124
HIS D 126
LEU D 127
VAL D 133
SER D 175
ALA D 176
PHE C 257
ASN D 347
SER D 355
PRO D 356
PHE D 357
ARG D 363
 FFO D4293
1EQB_D_GLYD4292 1eqb GLY

DB00145
(Glycine) 		Escherichia coli SERINE
HYDROXYMETHYLTRANSFE
RASE 		None 8 SER D  35
TYR C  55
PHE C  65
HIS D 126
SER D 175
HIS D 203
LYS D 229
ARG D 363
 GLY D4292
1FXH_B_PACB1001 1fxh PAC

DB09269
(Phenylacetic
acid) 		Escherichia coli PENICILLIN ACYLASE PF01804
(Penicil_amidase) 		7 SER B   1
PHE B  24
SER B  67
ALA B  69
MET A 142
PHE A 146
ILE B 177
 PAC B1001
1FXV_B_PNNB1001 1fxv PNN

DB01053
(Benzylpenicillin) 		Escherichia coli PENICILLIN ACYLASE PF01804
(Penicil_amidase) 		7 SER B   1
PHE B  24
ALA B  69
PHE B  71
MET A 142
PHE A 146
SER A 149
 PNN B1001
1GM7_B_PNNB1577 1gm7 PNN

DB01053
(Benzylpenicillin) 		Escherichia coli PENICILLIN G ACYLASE
ALPHA SUBUNIT;
PENICILLIN G ACYLASE
BETA SUBUNIT 		PF01804
(Penicil_amidase) 		8 SER B   1
PHE B  24
SER B  67
ALA B  69
PHE B  71
MET A 142
SER A 149
ILE B 177
 PNN B1577
1GYX_A_BEZA1077 1gyx BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Escherichia coli HYPOTHETICAL PROTEIN
YDCE 		None
PF01361
(Tautomerase) 		7 PRO B   1
CYS A   7
PHE A   8
ARG A  10
SER B  38
TRP A  51
TYR A  72
 BEZ A1077
1HO5_A_ADNA1604 1ho5 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Escherichia coli 5'-NUCLEOTIDASE PF00149
(Metallophos)
PF02872
(5_nucleotid_C) 		11 ILE A 178
ASN A 180
ARG A 379
SER A 405
GLY A 407
ARG A 410
PHE A 429
ASN A 431
GLY A 458
PHE A 498
ASP A 504
 ADN A1604
1HO5_B_ADNB2604 1ho5 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Escherichia coli 5'-NUCLEOTIDASE no annotation 10 ASN B 180
ARG B 379
SER B 405
GLY B 407
ARG B 410
PHE B 429
ASN B 431
GLY B 458
PHE B 498
ASP B 504
 ADN B2604
1HTT_A_HISA450 1htt HIS

DB00117
(L-
Histidine) 		Escherichia coli HISTIDYL-TRNA
SYNTHETASE 		PF03129
(tRNA-synt_His)
PF13393
(HGTP_anticodon) 		10 GLU A  83
THR A  85
TYR A 107
ARG A 113
GLN A 127
GLU A 131
ARG A 259
TYR A 263
TYR A 264
GLY A 285
 HIS A 450
1HTT_B_HISB450 1htt HIS

DB00117
(L-
Histidine) 		Escherichia coli HISTIDYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 12 GLU B  83
THR B  85
ARG B 113
GLN B 127
GLU B 131
ARG B 259
LEU B 261
TYR B 263
TYR B 264
GLY B 285
TYR B 288
GLY B 304
 HIS B 450
1HTT_C_HISC450 1htt HIS

DB00117
(L-
Histidine) 		Escherichia coli HISTIDYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 12 GLU C  83
THR C  85
GLN C 127
GLU C 131
ARG C 259
LEU C 261
TYR C 263
TYR C 264
GLY C 285
TYR C 288
GLY C 304
ALA C 306
 HIS C 450
1HTT_D_HISD450 1htt HIS

DB00117
(L-
Histidine) 		Escherichia coli HISTIDYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 12 GLU D  83
THR D  85
ARG D 113
GLN D 127
GLU D 131
ARG D 259
LEU D 261
TYR D 263
TYR D 264
GLY D 285
GLY D 304
ALA D 306
 HIS D 450
1HZ4_A_BEZA784 1hz4 BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Escherichia coli MALT REGULATORY
PROTEIN 		PF17874
(TPR_MalT) 		6 TRP A  87
HIS A  88
LEU A 126
LEU A 129
PRO A 130
MET A 131
 BEZ A 784
1HZE_A_RBFA98 1hze RBF

DB00140
(Riboflavin) 		Escherichia coli RIBOFLAVIN SYNTHASE
ALPHA CHAIN 		PF00677
(Lum_binding)
no annotation 		9 THR B   3
ILE B   5
CYS A  48
LEU A  49
ASP A  62
LEU A  63
THR A  67
ILE A  70
LYS A  89
 RBF A  98
1HZE_B_RBFB99 1hze RBF

DB00140
(Riboflavin) 		Escherichia coli RIBOFLAVIN SYNTHASE
ALPHA CHAIN 		PF00677
(Lum_binding)
no annotation 		9 THR A   3
ILE A   5
CYS B  48
LEU B  49
ASP B  62
LEU B  63
THR B  67
ILE B  70
LYS B  89
 RBF B  99
1I18_A_RBFA98 1i18 RBF

DB00140
(Riboflavin) 		Escherichia coli RIBOFLAVIN SYNTHASE
ALPHA CHAIN 		PF00677
(Lum_binding)
no annotation 		10 PHE B   2
THR B   3
ILE B   5
CYS A  48
LEU A  49
ASP A  62
LEU A  63
THR A  67
ILE A  70
THR A  71
 RBF A  98
1I18_B_RBFB99 1i18 RBF

DB00140
(Riboflavin) 		Escherichia coli RIBOFLAVIN SYNTHASE
ALPHA CHAIN 		PF00677
(Lum_binding)
no annotation 		10 PHE A   2
THR A   3
ILE A   5
CYS B  48
LEU B  49
ASP B  62
LEU B  63
THR B  67
ILE B  70
THR B  71
 RBF B  99
1ICR_A_NIOA604 1icr NIO

DB00627
(Niacin) 		Escherichia coli OXYGEN-INSENSITIVE
NAD(P)H
NITROREDUCTASE 		PF00881
(Nitroreductase)
no annotation 		5 SER A  40
THR A  41
PHE A 124
GLU B 165
GLY B 166
 NIO A 604
1ICR_B_NIOB602 1icr NIO

DB00627
(Niacin) 		Escherichia coli OXYGEN-INSENSITIVE
NAD(P)H
NITROREDUCTASE 		PF00881
(Nitroreductase)
no annotation 		5 SER B  40
THR B  41
PHE B 124
GLU A 165
GLY A 166
 NIO B 602
1ICU_A_NIOA221 1icu NIO

DB00627
(Niacin) 		Escherichia coli OXYGEN-INSENSITIVE
NAD(P)H
NITROREDUCTASE 		PF00881
(Nitroreductase)
no annotation 		6 SER A  40
THR A  41
PHE B  70
PHE A 124
GLU B 165
GLY B 166
 NIO A 221
1ICU_B_NIOB219 1icu NIO

DB00627
(Niacin) 		Escherichia coli OXYGEN-INSENSITIVE
NAD(P)H
NITROREDUCTASE 		PF00881
(Nitroreductase)
no annotation 		6 SER B  40
THR B  41
PHE A  70
PHE B 124
GLU A 165
GLY A 166
 NIO B 219
1ICU_C_NIOC225 1icu NIO

DB00627
(Niacin) 		Escherichia coli OXYGEN-INSENSITIVE
NAD(P)H
NITROREDUCTASE 		no annotation 6 SER C  40
THR C  41
PHE D  70
PHE C 124
GLU D 165
GLY D 166
 NIO C 225
1ICU_D_NIOD223 1icu NIO

DB00627
(Niacin) 		Escherichia coli OXYGEN-INSENSITIVE
NAD(P)H
NITROREDUCTASE 		no annotation 5 SER D  40
THR D  41
PHE C  70
PHE D 124
GLY C 166
 NIO D 223
1ICV_A_NIOA704 1icv NIO

DB00627
(Niacin) 		Escherichia coli OXYGEN-INSENSITIVE
NAD(P)H
NITROREDUCTASE 		PF00881
(Nitroreductase)
no annotation 		4 SER A  40
PHE A 124
GLU B 165
GLY B 166
 NIO A 704
1ICV_B_NIOB702 1icv NIO

DB00627
(Niacin) 		Escherichia coli OXYGEN-INSENSITIVE
NAD(P)H
NITROREDUCTASE 		PF00881
(Nitroreductase)
no annotation 		5 SER B  40
THR B  41
PHE A  70
PHE B 124
GLY A 166
 NIO B 702
1ICV_C_NIOC708 1icv NIO

DB00627
(Niacin) 		Escherichia coli OXYGEN-INSENSITIVE
NAD(P)H
NITROREDUCTASE 		no annotation 5 SER C  40
THR C  41
PHE C 124
GLU D 165
GLY D 166
 NIO C 708
1ICV_D_NIOD706 1icv NIO

DB00627
(Niacin) 		Escherichia coli OXYGEN-INSENSITIVE
NAD(P)H
NITROREDUCTASE 		no annotation 5 SER D  40
THR D  41
PHE D 124
GLU C 165
GLY C 166
 NIO D 706
1JGS_A_SALA256 1jgs SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Escherichia coli MULTIPLE ANTIBIOTIC
RESISTANCE PROTEIN
MARR 		PF01047
(MarR) 		7 PRO A  57
VAL A  58
LEU A  68
THR A  72
LEU A  75
ARG A  86
VAL A  96
 SAL A 256
1JGS_A_SALA257 1jgs SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Escherichia coli MULTIPLE ANTIBIOTIC
RESISTANCE PROTEIN
MARR 		PF01047
(MarR) 		4 THR A  39
ALA A  41
GLN A  42
MET A  74
 SAL A 257
1JOL_A_FFOA161 1jol FFO

DB11596
(Levoleucovorin) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		13 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
TRP A  30
PHE A  31
LYS A  32
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
TYR A 100
THR A 113
 FFO A 161
1JOL_B_FFOB361 1jol FFO

DB11596
(Levoleucovorin) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		None 13 ILE B   5
ALA B   7
ASP B  27
LEU B  28
PHE B  31
LYS B  32
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
PRO B  55
ARG B  57
TYR B 100
THR B 113
 FFO B 361
1JOM_A_FFOA161 1jom FFO

DB11596
(Levoleucovorin) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		11 ALA A   7
GLU A  17
ASP A  27
LEU A  28
PHE A  31
LYS A  32
ILE A  50
LEU A  54
ARG A  57
TYR A 100
THR A 113
 FFO A 161
1K5Q_B_PACB559 1k5q PAC

DB09269
(Phenylacetic
acid) 		Escherichia coli PENICILLIN G ACYLASE
ALPHA SUBUNIT;
PENICILLIN G ACYLASE
BETA SUBUNIT 		PF01804
(Penicil_amidase) 		7 SER B   1
PRO B  22
ALA B  24
TYR B  31
SER B  67
ALA B  69
MET A 142
 PAC B 559
1KAR_A_HSMA502 1kar HSM

DB05381
(Histamine) 		Escherichia coli HISTIDINOL
DEHYDROGENASE 		PF00815
(Histidinol_dh)
no annotation 		9 LEU A 138
SER A 140
HIS A 262
ASP A 360
TYR A 361
HIS A 367
GLU B 414
LEU B 416
HIS B 419
 HSM A 502
1KAR_B_HSMB503 1kar HSM

DB05381
(Histamine) 		Escherichia coli HISTIDINOL
DEHYDROGENASE 		PF00815
(Histidinol_dh)
no annotation 		9 LEU B 138
SER B 140
HIS B 262
ASP B 360
TYR B 361
HIS B 367
GLU A 414
LEU A 416
HIS A 419
 HSM B 503
1KF6_A_ACTA703 1kf6 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli FUMARATE REDUCTASE
FLAVOPROTEIN 		PF00890
(FAD_binding_2)
PF02910
(Succ_DH_flav_C) 		4 PHE A 554
ASP A 556
ARG A 562
GLU A 564
 ACT A 703
1KF6_B_ACTB704 1kf6 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli FUMARATE REDUCTASE
FLAVOPROTEIN;
FUMARATE REDUCTASE
IRON-SULFUR PROTEIN 		PF00890
(FAD_binding_2)
PF02910
(Succ_DH_flav_C)
PF13085
(Fer4_8)
PF13183
(Fer2_3) 		3 GLY B  41
ASP B  45
ARG A 452
 ACT B 704
1KF6_N_ACTN803 1kf6 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli FUMARATE REDUCTASE
FLAVOPROTEIN;
FUMARATE REDUCTASE
IRON-SULFUR PROTEIN 		None 6 GLY N  41
ASP N  45
TYR N  53
TRP N  55
TRP M 448
ARG M 452
 ACT N 803
1KVL_A_CLSA371 1kvl CLS

DB00456
(Cefalotin) 		Escherichia coli BETA-LACTAMASE PF00144
(Beta-lactamase) 		10 GLY A  64
LEU A 119
GLN A 120
TYR A 150
ASN A 152
TYR A 221
ASN A 289
LYS A 315
THR A 316
GLY A 317
 CLS A 371
1MJ2_A_SAMA2200 1mj2 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli PROTEIN (METHIONINE
REPRESSOR) 		None
PF01340
(MetJ) 		12 GLU B  39
ARG B  42
ARG B  43
LEU B  56
GLU B  59
HIS B  63
HIS A  63
ALA A  64
PHE A  65
GLY A  67
LEU B  70
PRO B  71
 SAM A2200
1MJ2_A_SAMA2201 1mj2 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli PROTEIN (METHIONINE
REPRESSOR) 		None
PF01340
(MetJ) 		13 GLU A  39
ARG A  42
ARG A  43
LEU A  56
GLU A  59
ALA A  60
HIS B  63
HIS A  63
ALA B  64
PHE B  65
GLY B  67
LEU A  70
PRO A  71
 SAM A2201
1MJ2_C_SAMC1200 1mj2 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli PROTEIN (METHIONINE
REPRESSOR) 		None 13 GLU C  39
ARG C  42
ARG C  43
LEU C  56
GLU C  59
ALA C  60
HIS C  63
HIS D  63
ALA D  64
PHE D  65
GLY D  67
LEU C  70
PRO C  71
 SAM C1200
1MJ2_C_SAMC2199 1mj2 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli PROTEIN (METHIONINE
REPRESSOR) 		None 12 GLU D  39
ARG D  42
ARG D  43
LEU D  56
GLU D  59
HIS C  63
HIS D  63
ALA C  64
PHE C  65
GLY C  67
LEU D  70
PRO D  71
 SAM C2199
1MJL_A_SAMA200 1mjl SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli METHIONINE REPRESSOR
PROTEIN METJ 		None
PF01340
(MetJ) 		11 ALA A   1
GLU B  39
ARG B  42
ARG B  43
LEU B  56
GLU B  59
ALA B  60
HIS B  63
HIS A  63
PHE A  65
LEU B  70
 SAM A 200
1MJL_B_SAMB400 1mjl SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli METHIONINE REPRESSOR
PROTEIN METJ 		None
PF01340
(MetJ) 		9 GLU A  39
ARG A  43
LEU A  56
GLU A  59
HIS B  63
HIS A  63
PHE B  65
GLY B  67
LEU A  70
 SAM B 400
1MJO_A_SAMA199 1mjo SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli METHIONINE REPRESSOR None
PF01340
(MetJ) 		13 GLU A  39
ARG A  42
ARG A  43
LEU A  56
GLU A  59
ALA A  60
HIS B  63
HIS A  63
ALA B  64
PHE B  65
GLY B  67
LEU A  70
PRO A  71
 SAM A 199
1MJO_B_SAMB200 1mjo SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli METHIONINE REPRESSOR None
PF01340
(MetJ) 		13 GLU B  39
ARG B  42
ARG B  43
LEU B  56
GLU B  59
ALA B  60
HIS B  63
HIS A  63
ALA A  64
PHE A  65
GLY A  67
LEU B  70
PRO B  71
 SAM B 200
1MJO_C_SAMC200 1mjo SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli METHIONINE REPRESSOR None 12 GLU D  39
ARG D  42
ARG D  43
LEU D  56
GLU D  59
HIS C  63
HIS D  63
ALA C  64
PHE C  65
GLY C  67
LEU D  70
PRO D  71
 SAM C 200
1MJO_D_SAMD200 1mjo SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli METHIONINE REPRESSOR None 13 GLU C  39
ARG C  42
ARG C  43
LEU C  56
GLU C  59
ALA C  60
HIS C  63
HIS D  63
ALA D  64
PHE D  65
GLY D  67
LEU C  70
PRO C  71
 SAM D 200
1MJQ_A_SAMA200 1mjq SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli METHIONINE REPRESSOR None
PF01340
(MetJ) 		11 GLU A  39
ARG A  43
LEU A  56
GLU A  59
HIS B  63
HIS A  63
ALA B  64
PHE B  65
GLY B  67
LEU A  70
PRO A  71
 SAM A 200
1MJQ_B_SAMB200 1mjq SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli METHIONINE REPRESSOR None
PF01340
(MetJ) 		11 GLU A   2
GLU B  39
ARG B  43
LEU B  56
GLU B  59
HIS B  63
HIS A  63
PHE A  65
GLY A  67
LEU B  70
PRO B  71
 SAM B 200
1MJQ_C_SAMC199 1mjq SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli METHIONINE REPRESSOR None 10 GLU C  39
ARG C  43
LEU C  56
GLU C  59
HIS C  63
ALA D  64
PHE D  65
GLY D  67
LEU C  70
PRO C  71
 SAM C 199
1MJQ_D_SAMD200 1mjq SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli METHIONINE REPRESSOR None 12 GLU D  39
ARG D  43
LEU D  56
GLU D  59
ALA D  60
HIS C  63
HIS D  63
ALA C  64
PHE C  65
GLY C  67
LEU D  70
PRO D  71
 SAM D 200
1MJQ_G_SAMG199 1mjq SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli METHIONINE REPRESSOR None 10 GLU G  39
ARG G  43
GLU G  59
ALA G  60
HIS G  63
ALA H  64
PHE H  65
GLY H  67
LEU G  70
PRO G  71
 SAM G 199
1MJQ_H_SAMH200 1mjq SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli METHIONINE REPRESSOR None 10 GLU H  39
ARG H  43
LEU H  56
GLU H  59
HIS H  63
HIS G  63
PHE G  65
GLY G  67
LEU H  70
PRO H  71
 SAM H 200
1MJQ_I_SAMI199 1mjq SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli METHIONINE REPRESSOR None 11 GLU I  39
ARG I  43
LEU I  56
GLU I  59
HIS J  63
HIS I  63
ALA J  64
PHE J  65
GLY J  67
LEU I  70
PRO I  71
 SAM I 199
1MJQ_J_SAMJ200 1mjq SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli METHIONINE REPRESSOR None 12 GLU J  39
ARG J  43
LEU J  56
GLU J  59
ALA J  60
HIS J  63
HIS I  63
ALA I  64
PHE I  65
GLY I  67
LEU J  70
PRO J  71
 SAM J 200
1MSK_A_ACTA1302 1msk ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli COBALAMIN-DEPENDENT
METHIONINE SYNTHASE 		PF02965
(Met_synt_B12) 		4 GLN A 932
VAL A 934
ARG A1106
TYR A1111
 ACT A1302
1MSK_A_SAMA1301 1msk SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli COBALAMIN-DEPENDENT
METHIONINE SYNTHASE 		PF02965
(Met_synt_B12) 		10 ASP A 946
ARG A1094
GLU A1097
ARG A1134
PRO A1135
ALA A1136
TYR A1139
PRO A1140
ALA A1141
TYR A1189
 SAM A1301
1OLT_A_SAMA501 1olt SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli OXYGEN-INDEPENDENT
COPROPORPHYRINOGEN
III OXIDASE 		PF04055
(HemN_C)
PF06969
(Radical_SAM) 		13 CYS A  71
THR A 114
GLU A 145
ASP A 147
GLY A 170
GLN A 172
ARG A 184
ASP A 209
ILE A 211
PHE A 240
TYR A 242
ALA A 243
GLN A 252
 SAM A 501
1OLT_A_SAMA502 1olt SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli OXYGEN-INDEPENDENT
COPROPORPHYRINOGEN
III OXIDASE 		PF04055
(HemN_C)
PF06969
(Radical_SAM) 		9 TYR A  56
HIS A  58
GLY A 111
GLU A 145
PHE A 240
PHE A 310
GLN A 311
LEU A 321
ILE A 329
 SAM A 502
1P7L_C_SAMC685 1p7l SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli S-ADENOSYLMETHIONINE
SYNTHETASE 		None 16 HIS C  14
PRO C  15
ALA D  40
GLU D  55
GLN D  98
ASP D 101
ILE D 102
ASP D 118
ASP C 163
LYS C 165
SER C 186
THR C 227
PHE C 230
ASP C 238
LYS D 269
ILE D 302
 SAM C 685
1P7L_C_SAMC885 1p7l SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli S-ADENOSYLMETHIONINE
SYNTHETASE 		None 16 HIS D  14
PRO D  15
ALA C  40
GLU C  55
GLN C  98
ASP C 101
ILE C 102
ASP C 118
ASP D 163
LYS D 165
SER D 186
THR D 227
PHE D 230
ASP D 238
LYS C 269
ILE C 302
 SAM C 885
1P91_A_SAMA1401 1p91 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE A 		PF13847
(Methyltransf_31) 		11 LEU A  62
TYR A  67
GLY A  95
GLU A  96
GLY A  97
TYR A  99
ILE A 155
TYR A 156
PRO A 179
HIS A 183
LEU A 184
 SAM A1401
1P91_B_SAMB2401 1p91 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE A 		None 14 ARG B  58
TYR B  67
LEU B  70
GLY B  95
GLU B  96
GLY B  97
TYR B  98
TYR B  99
ILE B 155
TYR B 156
HIS B 183
LEU B 184
THR B 234
PRO B 235
 SAM B2401
1PG2_A_ADNA552 1pg2 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Escherichia coli METHIONYL-TRNA
SYNTHETASE 		PF09334
(tRNA-synt_1g) 		11 ALA A  12
HIS A  21
GLY A  23
HIS A  24
GLU A  27
GLY A 294
ASP A 296
ILE A 297
HIS A 323
TYR A 325
VAL A 326
 ADN A 552
1PK7_A_ADNA1245 1pk7 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Escherichia coli PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE 		PF01048
(PNP_UDP_1) 		9 MET A  64
ARG A  87
SER A  90
GLY A  92
GLU A 179
MET A 180
GLU A 181
SER A 203
ASP A 204
 ADN A1245
1PK7_B_ADNB1246 1pk7 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Escherichia coli PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE 		no annotation 8 ARG B  87
GLY B  92
VAL B 178
GLU B 179
MET B 180
GLU B 181
SER B 203
ILE B 206
 ADN B1246
1PK7_C_ADNC1247 1pk7 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Escherichia coli PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE 		no annotation 10 MET C  64
ARG C  87
SER C  90
GLY C  92
VAL C 178
GLU C 179
MET C 180
GLU C 181
SER C 203
ASP C 204
 ADN C1247
1PK9_A_2FAA306 1pk9 2FA

DB01073
(Fludarabine) 		Escherichia coli PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE 		PF01048
(PNP_UDP_1) 		10 MET A  64
ARG A  87
SER A  90
GLY A  92
VAL A 178
GLU A 179
MET A 180
GLU A 181
SER A 203
ASP A 204
 2FA A 306
1PK9_B_2FAB307 1pk9 2FA

DB01073
(Fludarabine) 		Escherichia coli PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE 		no annotation 9 MET B  64
ARG B  87
SER B  90
GLY B  92
GLU B 179
MET B 180
GLU B 181
SER B 203
ASP B 204
 2FA B 307
1PK9_C_2FAC308 1pk9 2FA

DB01073
(Fludarabine) 		Escherichia coli PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE 		no annotation 11 MET C  64
ARG C  87
SER C  90
GLY C  92
VAL C 178
GLU C 179
MET C 180
GLU C 181
SER C 203
ASP C 204
ILE C 206
 2FA C 308
1PKV_A_RBFA100 1pkv RBF

DB00140
(Riboflavin) 		Escherichia coli RIBOFLAVIN SYNTHASE
ALPHA CHAIN 		PF00677
(Lum_binding)
no annotation 		11 ILE B   5
VAL B   6
SER A  41
CYS A  47
CYS A  48
LEU A  49
THR A  50
MET A  64
THR A  67
ILE A  70
THR A  71
 RBF A 100
1PKV_B_RBFB101 1pkv RBF

DB00140
(Riboflavin) 		Escherichia coli RIBOFLAVIN SYNTHASE
ALPHA CHAIN 		PF00677
(Lum_binding)
no annotation 		11 ILE A   5
VAL A   6
SER B  41
CYS B  47
CYS B  48
LEU B  49
THR B  50
MET B  64
THR B  67
ILE B  70
THR B  71
 RBF B 101
1PNL_B_PACB559 1pnl PAC

DB09269
(Phenylacetic
acid) 		Escherichia coli PENICILLIN
AMIDOHYDROLASE 		PF01804
(Penicil_amidase) 		8 SER B   1
PHE B  24
SER B  67
ALA B  69
MET A 142
PHE A 146
ILE B 177
ASN B 241
 PAC B 559
1PW7_A_RABA645 1pw7 RAB

DB00194
(Vidarabine) 		Escherichia coli PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE 		PF01048
(PNP_UDP_1) 		10 MET A  64
ARG A  87
SER A  90
GLY A  92
GLU A 179
MET A 180
GLU A 181
SER A 203
ASP A 204
ILE A 206
 RAB A 645
1PW7_B_RABB646 1pw7 RAB

DB00194
(Vidarabine) 		Escherichia coli PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE 		no annotation 9 MET B  64
ARG B  87
SER B  90
GLY B  92
VAL B 178
GLU B 179
MET B 180
GLU B 181
ILE B 206
 RAB B 646
1PW7_C_RABC647 1pw7 RAB

DB00194
(Vidarabine) 		Escherichia coli PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE 		no annotation 9 MET C  64
SER C  90
VAL C 178
GLU C 179
MET C 180
GLU C 181
SER C 203
ASP C 204
ILE C 206
 RAB C 647
1Q23_A_FUAA702 1q23 FUA

DB02703
(Fusidic
Acid) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		PF00302
(CAT)
no annotation 		12 ALA B  24
ALA B  29
THR A  93
TYR A 133
PHE A 134
PHE A 144
SER A 146
PHE A 156
LEU A 158
VAL A 160
PHE A 166
HIS B 193
 FUA A 702
1Q23_B_FUAB703 1q23 FUA

DB02703
(Fusidic
Acid) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		no annotation 15 VAL C  28
ALA C  29
THR B  93
SER B 104
TYR B 133
PHE B 134
PHE B 144
SER B 146
PHE B 156
LEU B 158
VAL B 160
PHE B 166
VAL B 170
THR B 172
HIS C 193
 FUA B 703
1Q23_C_FUAC701 1q23 FUA

DB02703
(Fusidic
Acid) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		PF00302
(CAT)
no annotation 		16 ALA A  24
VAL A  28
ALA A  29
THR C  93
PHE C 102
SER C 104
TYR C 133
PHE C 134
PHE C 144
SER C 146
PHE C 156
LEU C 158
VAL C 160
PHE C 166
VAL C 170
HIS A 193
 FUA C 701
1Q23_D_FUAD705 1q23 FUA

DB02703
(Fusidic
Acid) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		no annotation 12 ALA E  29
THR D  93
SER D 104
TYR D 133
PHE D 134
PHE D 144
SER D 146
PHE D 156
LEU D 158
VAL D 160
PHE D 166
HIS E 193
 FUA D 705
1Q23_E_FUAE706 1q23 FUA

DB02703
(Fusidic
Acid) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		no annotation 14 ALA F  24
VAL F  28
ALA F  29
THR E  93
SER E 104
TYR E 133
PHE E 144
SER E 146
PHE E 156
LEU E 158
VAL E 160
PHE E 166
VAL E 170
HIS F 193
 FUA E 706
1Q23_F_FUAF704 1q23 FUA

DB02703
(Fusidic
Acid) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		no annotation 13 ALA D  29
THR F  93
SER F 104
TYR F 133
PHE F 134
PHE F 144
SER F 146
LEU F 158
VAL F 160
PHE F 166
VAL F 170
THR F 172
HIS D 193
 FUA F 704
1Q23_G_FUAG708 1q23 FUA

DB02703
(Fusidic
Acid) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		no annotation 14 VAL H  28
ALA H  29
THR G  93
SER G 104
TYR G 133
PHE G 134
PHE G 138
PHE G 144
SER G 146
PHE G 156
LEU G 158
VAL G 160
PHE G 166
HIS H 193
 FUA G 708
1Q23_H_FUAH709 1q23 FUA

DB02703
(Fusidic
Acid) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		no annotation 12 VAL I  28
ALA I  29
THR H  93
TYR H 133
PHE H 144
SER H 146
PHE H 156
LEU H 158
VAL H 160
PHE H 166
VAL H 170
HIS I 193
 FUA H 709
1Q23_I_FUAI707 1q23 FUA

DB02703
(Fusidic
Acid) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		no annotation 14 VAL G  28
ALA G  29
THR I  93
SER I 104
TYR I 133
PHE I 134
PHE I 144
SER I 146
PHE I 156
LEU I 158
VAL I 160
PHE I 166
VAL I 170
HIS G 193
 FUA I 707
1Q23_J_FUAJ711 1q23 FUA

DB02703
(Fusidic
Acid) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		no annotation 15 ALA K  24
VAL K  28
ALA K  29
THR J  93
SER J 104
TYR J 133
PHE J 134
PHE J 138
SER J 146
PHE J 156
LEU J 158
VAL J 160
PHE J 166
VAL J 170
HIS K 193
 FUA J 711
1Q23_K_FUAK712 1q23 FUA

DB02703
(Fusidic
Acid) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		no annotation 13 VAL L  28
ALA L  29
THR K  93
SER K 104
TYR K 133
PHE K 144
SER K 146
PHE K 156
LEU K 158
VAL K 160
PHE K 166
VAL K 170
HIS L 193
 FUA K 712
1Q23_L_FUAL710 1q23 FUA

DB02703
(Fusidic
Acid) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		no annotation 14 VAL J  28
ALA J  29
THR L  93
PHE L 102
SER L 104
TYR L 133
PHE L 134
SER L 146
PHE L 156
LEU L 158
VAL L 160
PHE L 166
VAL L 170
HIS J 193
 FUA L 710
1Q6I_A_FK5A301 1q6i FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Escherichia coli FKBP-TYPE
PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
FKPA 		PF00254
(FKBP_C)
PF01346
(FKBP_N) 		9 TYR A 146
ASP A 157
LEU A 166
VAL A 173
ILE A 174
TRP A 177
TYR A 200
ILE A 208
PHE A 216
 FK5 A 301
1Q6I_B_FK5B401 1q6i FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Escherichia coli FKBP-TYPE
PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
FKPA 		no annotation 10 TYR B 146
ASP B 157
ARG B 162
LEU B 166
VAL B 173
ILE B 174
TRP B 177
TYR B 200
ILE B 208
PHE B 216
 FK5 B 401
1R30_A_SAMA501 1r30 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli BIOTIN SYNTHASE PF04055
(BATS)
PF06968
(Radical_SAM) 		12 TYR A  59
PRO A  61
THR A 130
GLY A 132
ASN A 151
ASN A 153
ASP A 155
ARG A 173
ILE A 192
LEU A 224
VAL A 225
LEU A 291
 SAM A 501
1R30_B_SAMB501 1r30 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli BIOTIN SYNTHASE None 13 TYR B  59
PRO B  61
THR B 130
GLY B 132
ASN B 151
HIS B 152
ASN B 153
ASP B 155
ARG B 173
ILE B 192
LEU B 224
VAL B 225
LEU B 291
 SAM B 501
1RA2_A_FOLA161 1ra2 FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		13 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
PHE A  31
LYS A  32
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 161
1RA3_A_MTXA161 1ra3 MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		12 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
LYS A  32
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 MTX A 161
1RA8_A_FOLA161 1ra8 FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		15 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
TRP A  30
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 161
1RB2_A_FOLA161 1rb2 FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		14 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
TRP A  30
PHE A  31
LYS A  32
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 161
1RB2_B_FOLB161 1rb2 FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		None 12 ILE B   5
ALA B   7
ASP B  27
LEU B  28
TRP B  30
PHE B  31
LYS B  32
LEU B  54
ARG B  57
ILE B  94
TYR B 100
THR B 113
 FOL B 161
1RB3_A_MTXA161 1rb3 MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		10 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
LYS A  32
ILE A  50
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 MTX A 161
1RB3_B_MTXB161 1rb3 MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		no annotation 13 ILE B   5
ALA B   7
ASP B  27
LEU B  28
TRP B  30
LYS B  32
SER B  49
ILE B  50
LEU B  54
ARG B  57
ILE B  94
TYR B 100
THR B 113
 MTX B 161
1RD7_A_FOLA161 1rd7 FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		14 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
TRP A  30
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 161
1RD7_B_FOLB361 1rd7 FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		None 13 ILE B   5
ALA B   7
ASP B  27
LEU B  28
LYS B  32
THR B  46
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
ARG B  57
ILE B  94
TYR B 100
THR B 113
 FOL B 361
1RE7_A_FOLA161 1re7 FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		13 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
TRP A  30
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 161
1RE7_B_FOLB361 1re7 FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		None 13 ILE B   5
ALA B   7
ASP B  27
LEU B  28
PHE B  31
LYS B  32
ILE B  50
LEU B  54
PRO B  55
ARG B  57
ILE B  94
TYR B 100
THR B 113
 FOL B 361
1RG7_A_MTXA161 1rg7 MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		15 ILE A   5
ALA A   7
ALA A  19
ASN A  23
ASP A  27
LEU A  28
LYS A  32
THR A  46
SER A  49
ILE A  50
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 MTX A 161
1RG9_A_SAMA385 1rg9 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli S-ADENOSYLMETHIONINE
SYNTHETASE 		None
PF00438
(S-AdoMet_synt_N)
PF02772
(S-AdoMet_synt_M)
PF02773
(S-AdoMet_synt_C) 		16 HIS A  14
PRO A  15
ALA B  40
GLU B  55
GLN B  98
ASP B 101
ILE B 102
ASP B 118
ASP A 163
LYS A 165
SER A 186
THR A 227
PHE A 230
ASP A 238
LYS B 269
ILE B 302
 SAM A 385
1RG9_B_SAMB485 1rg9 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli S-ADENOSYLMETHIONINE
SYNTHETASE 		None
PF00438
(S-AdoMet_synt_N)
PF02772
(S-AdoMet_synt_M)
PF02773
(S-AdoMet_synt_C) 		16 HIS B  14
PRO B  15
ALA A  40
GLU A  55
GLN A  98
ASP A 101
ILE A 102
ASP A 118
ASP B 163
LYS B 165
SER B 186
THR B 227
PHE B 230
ASP B 238
LYS A 269
ILE A 302
 SAM B 485
1RG9_C_SAMC585 1rg9 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli S-ADENOSYLMETHIONINE
SYNTHETASE 		None 16 HIS C  14
PRO C  15
ALA D  40
GLU D  55
GLN D  98
ASP D 101
ILE D 102
ASP D 118
ASP C 163
LYS C 165
SER C 186
THR C 227
PHE C 230
ASP C 238
LYS D 269
ILE D 302
 SAM C 585
1RG9_C_SAMC685 1rg9 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli S-ADENOSYLMETHIONINE
SYNTHETASE 		None 16 HIS D  14
PRO D  15
ALA C  40
GLU C  55
GLN C  98
ASP C 101
ILE C 102
ASP C 118
ASP D 163
LYS D 165
SER D 186
THR D 227
PHE D 230
ASP D 238
LYS C 269
ILE C 302
 SAM C 685
1RH3_A_MTXA161 1rh3 MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		13 ILE A   5
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
PHE A  31
LYS A  32
SER A  49
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
 MTX A 161
1RMT_A_ADNA1501 1rmt ADN

DB00640
(Adenosine) 		Escherichia coli CLASS B ACID
PHOSPHATASE 		PF03767
(Acid_phosphat_B) 		10 ASP A  46
PHE A  56
TYR A  70
LEU A  71
TRP A  77
THR A 112
GLY A 113
ARG A 114
THR A 192
TYR A 193
 ADN A1501
1RMT_B_ADNB1502 1rmt ADN

DB00640
(Adenosine) 		Escherichia coli CLASS B ACID
PHOSPHATASE 		no annotation 7 PHE B  56
GLU B  68
TYR B  70
LEU B  71
THR B 192
TYR B 193
LYS B 194
 ADN B1502
1RMT_C_ADNC1503 1rmt ADN

DB00640
(Adenosine) 		Escherichia coli CLASS B ACID
PHOSPHATASE 		no annotation 8 ASP C  46
PHE C  56
TYR C  70
LEU C  71
TRP C  77
GLY C 113
ASP C 145
TYR C 193
 ADN C1503
1RMT_D_ADND1504 1rmt ADN

DB00640
(Adenosine) 		Escherichia coli CLASS B ACID
PHOSPHATASE 		no annotation 8 ASP D  46
PHE D  56
TYR D  70
LEU D  71
TRP D  77
ASP D 145
THR D 192
TYR D 193
 ADN D1504
1RNR_A_DAHA208 1rnr DAH

DB01235
(Levodopa) 		Escherichia coli RIBONUCLEOTIDE
REDUCTASE R1 PROTEIN 		PF00268
(Ribonuc_red_sm) 		11 ASP A  84
GLU A 115
HIS A 118
LEU A 203
GLU A 204
ARG A 207
TYR A 209
SER A 211
PHE A 212
ILE A 234
GLU A 238
 DAH A 208
1RNR_B_DAHB208 1rnr DAH

DB01235
(Levodopa) 		Escherichia coli RIBONUCLEOTIDE
REDUCTASE R1 PROTEIN 		no annotation 12 ASP B  84
GLU B 115
HIS B 118
TYR B 122
LEU B 203
GLU B 204
ARG B 207
TYR B 209
SER B 211
PHE B 212
ILE B 234
GLU B 238
 DAH B 208
1RQJ_A_RISA901 1rqj RIS

DB00884
(Risedronate) 		Escherichia coli GERANYLTRANSTRANSFER
ASE 		PF00348
(polyprenyl_synt) 		11 SER A 101
LEU A 102
ASP A 105
ASP A 111
ARG A 116
GLN A 179
LYS A 202
THR A 203
GLN A 241
ASP A 244
LYS A 258
 RIS A 901
1RQJ_B_RISB903 1rqj RIS

DB00884
(Risedronate) 		Escherichia coli GERANYLTRANSTRANSFER
ASE 		no annotation 11 SER B 101
LEU B 102
ASP B 105
ASP B 111
ARG B 116
GLN B 179
LYS B 202
THR B 203
GLN B 241
ASP B 244
LYS B 258
 RIS B 903
1RX2_A_FOLA161 1rx2 FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		14 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
PHE A  31
LYS A  32
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 161
1RX3_A_MTXA161 1rx3 MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		15 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
PHE A  31
LYS A  32
SER A  49
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 MTX A 161
1RX7_A_FOLA161 1rx7 FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		14 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 161
1RX8_A_FOLA161 1rx8 FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		14 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
PHE A  31
LYS A  32
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
PRO A  55
ARG A  57
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 161
1RXC_B_URFB2011 1rxc URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Escherichia coli URIDINE
PHOSPHORYLASE 		no annotation 8 THR B  94
GLY B  96
GLN B 166
ARG B 168
MET B 197
ILE B 220
VAL B 221
PRO B 229
 URF B2011
1RXC_C_URFC2081 1rxc URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Escherichia coli URIDINE
PHOSPHORYLASE 		no annotation 7 GLY C  96
GLN C 166
ARG C 168
MET C 197
ILE C 220
VAL C 221
PRO C 229
 URF C2081
1RXC_D_URFD2021 1rxc URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Escherichia coli URIDINE
PHOSPHORYLASE 		no annotation 7 GLY D  96
GLN D 166
ARG D 168
MET D 197
ILE D 220
VAL D 221
PRO D 229
 URF D2021
1RXC_E_URFE2031 1rxc URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Escherichia coli URIDINE
PHOSPHORYLASE 		no annotation 8 THR E  94
GLY E  96
GLN E 166
ARG E 168
MET E 197
ILE E 220
VAL E 221
PRO E 229
 URF E2031
1RXC_F_URFF2001 1rxc URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Escherichia coli URIDINE
PHOSPHORYLASE 		no annotation 7 GLY F  96
GLN F 166
ARG F 168
MET F 197
ILE F 220
VAL F 221
PRO F 229
 URF F2001
1RXC_I_URFI2041 1rxc URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Escherichia coli URIDINE
PHOSPHORYLASE 		no annotation 8 THR I  94
GLY I  96
GLN I 166
ARG I 168
MET I 197
ILE I 220
VAL I 221
PRO I 229
 URF I2041
1RXC_K_URFK2061 1rxc URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Escherichia coli URIDINE
PHOSPHORYLASE 		no annotation 8 THR K  94
GLY K  96
GLN K 166
ARG K 168
MET K 197
ILE K 220
VAL K 221
PRO K 229
 URF K2061
1RXC_L_URFL2071 1rxc URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Escherichia coli URIDINE
PHOSPHORYLASE 		no annotation 7 GLY L  96
GLN L 166
ARG L 168
MET L 197
ILE L 220
VAL L 221
PRO L 229
 URF L2071
1S14_A_NOVA1300 1s14 NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Escherichia coli TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B 		PF02518
(HATPase_c) 		12 ASN A1042
SER A1043
ASP A1045
GLU A1046
ASP A1069
ARG A1072
MET A1074
PRO A1075
ASP A1077
ILE A1090
ARG A1132
THR A1163
 NOV A1300
1S14_B_NOVB2300 1s14 NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Escherichia coli TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B 		no annotation 13 ASN B2042
SER B2043
ASP B2045
GLU B2046
ASP B2069
ARG B2072
MET B2074
PRO B2075
ASP B2077
ALA B2086
ILE B2090
ARG B2132
THR B2163
 NOV B2300
1SQ5_A_PAUA6001 1sq5 PAU

DB01783
(Pantothenic
acid) 		Escherichia coli PANTOTHENATE KINASE PF00485
(PRK) 		9 ASP A1127
LEU A1130
LYS A1145
GLY A1146
HIS A1177
LEU A1201
TYR A1240
ILE A1281
ASN A1282
 PAU A6001
1SQ5_B_PAUB6003 1sq5 PAU

DB01783
(Pantothenic
acid) 		Escherichia coli PANTOTHENATE KINASE None 10 ASP B2127
LEU B2130
LYS B2145
GLY B2146
HIS B2177
TYR B2180
LEU B2201
TYR B2240
ILE B2281
ASN B2282
 PAU B6003
1SQ5_C_PAUC6002 1sq5 PAU

DB01783
(Pantothenic
acid) 		Escherichia coli PANTOTHENATE KINASE None 9 ASP C3127
LEU C3130
LYS C3145
GLY C3146
HIS C3177
LEU C3201
TYR C3240
ILE C3281
ASN C3282
 PAU C6002
1SQ5_D_PAUD6004 1sq5 PAU

DB01783
(Pantothenic
acid) 		Escherichia coli PANTOTHENATE KINASE None 10 VAL D4097
ASP D4127
LEU D4130
LYS D4145
GLY D4146
HIS D4177
LEU D4201
TYR D4240
ILE D4281
ASN D4282
 PAU D6004
1SQF_A_SAMA430 1sqf SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli SUN PROTEIN PF01029
(NusB)
PF01189
(Methyltr_RsmB-F) 		15 CYS A 254
ALA A 256
PRO A 257
GLY A 258
GLY A 259
LYS A 260
ASP A 277
ILE A 278
ASP A 279
ARG A 282
ASP A 303
GLY A 304
ARG A 305
ASP A 322
PRO A 324
 SAM A 430
1T9U_A_CPFA5002 1t9u CPF

DB00537
(Ciprofloxacin) 		Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B 		PF00873
(ACR_tran) 		6 PHE A 664
PHE A 666
ASN A 667
ARG A 717
ASN A 719
GLN A 830
 CPF A5002
1T9W_A_NFNA6001 1t9w NFN

DB00607
(Nafcillin) 		Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B 		PF00873
(ACR_tran) 		3 SER A  96
GLY A  97
ARG A 468
 NFN A6001
1T9W_A_NFNA6002 1t9w NFN

DB00607
(Nafcillin) 		Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B 		PF00873
(ACR_tran) 		7 MET A 575
GLN A 577
ALA A 618
PHE A 664
ARG A 717
ASN A 719
GLU A 722
 NFN A6002
1TD2_A_PXLA288 1td2 PXL

DB00147
(Pyridoxal) 		Escherichia coli PYRIDOXAMINE KINASE PF08543
(Phos_pyr_kin) 		10 SER A  10
VAL A  12
ALA A  17
HIS A  44
THR A  45
GLN A  46
TYR A  83
CYS A 122
VAL A 220
ASP A 224
 PXL A 288
1TD2_B_PXLB289 1td2 PXL

DB00147
(Pyridoxal) 		Escherichia coli PYRIDOXAMINE KINASE no annotation 9 SER B  10
ALA B  17
HIS B  44
THR B  45
TYR B  83
VAL B 114
CYS B 122
VAL B 220
ASP B 224
 PXL B 289
1TDR_A_MTXA170 1tdr MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli TELLUROMETHIONYL
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		15 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
SER A  49
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 MTX A 170
1TDR_B_MTXB170 1tdr MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli TELLUROMETHIONYL
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		no annotation 10 ALA B   7
ASP B  27
LEU B  28
LYS B  32
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
ARG B  57
TYR B 100
THR B 113
 MTX B 170
1TJ2_A_ACTA2002 1tj2 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli BIFUNCTIONAL PUTA
PROTEIN 		PF01619
(Pro_dh-DNA_bdg)
PF14850
(Pro_dh) 		5 LYS A 329
ALA A 436
TYR A 552
ARG A 555
ARG A 556
 ACT A2002
1TLS_A_C2FA266 1tls C2F

DB11256
(Levomefolic
acid) 		Escherichia coli THYMIDYLATE SYNTHASE PF00303
(Thymidylat_synt) 		13 HIS A  51
SER A  54
ILE A  79
TRP A  80
TRP A  83
LEU A 143
ASP A 169
LEU A 172
GLY A 173
PHE A 176
TYR A 209
VAL A 262
ALA A 263
 C2F A 266
1TLS_B_C2FB266 1tls C2F

DB11256
(Levomefolic
acid) 		Escherichia coli THYMIDYLATE SYNTHASE None 13 HIS B  51
SER B  54
ILE B  79
TRP B  80
TRP B  83
LEU B 143
ASP B 169
LEU B 172
GLY B 173
PHE B 176
TYR B 209
VAL B 262
ALA B 263
 C2F B 266
1TSN_A_C2FA266 1tsn C2F

DB11256
(Levomefolic
acid) 		Escherichia coli THYMIDYLATE SYNTHASE PF00303
(Thymidylat_synt) 		13 HIS A  51
SER A  54
ILE A  79
TRP A  80
TRP A  83
LEU A 143
ASP A 169
LEU A 172
GLY A 173
PHE A 176
TYR A 209
VAL A 262
ALA A 263
 C2F A 266
1TUV_A_VK3A4558 1tuv VK3

DB00170
(Menadione) 		Escherichia coli PROTEIN YGIN PF03992
(ABM) 		7 TYR A  40
GLU A  64
HIS A  75
LEU A  76
TYR A  84
MET A  95
ILE A  97
 VK3 A4558
1USQ_A_CLMA1143 1usq CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli DR HEMAGGLUTININ
STRUCTURAL SUBUNIT 		PF04619
(Adhesin_Dr) 		7 PRO A  40
GLY A  42
PRO A  43
THR A  88
ILE A 111
GLY A 113
TYR A 115
 CLM A1143
1USQ_B_CLMB1143 1usq CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli DR HEMAGGLUTININ
STRUCTURAL SUBUNIT 		None 6 PRO B  40
GLY B  42
PRO B  43
ILE B 111
GLY B 113
TYR B 115
 CLM B1143
1USQ_C_CLMC1143 1usq CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli DR HEMAGGLUTININ
STRUCTURAL SUBUNIT 		None 6 PRO C  40
GLY C  42
PRO C  43
ILE C 111
GLY C 113
TYR C 115
 CLM C1143
1USQ_D_CLMD1142 1usq CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli DR HEMAGGLUTININ
STRUCTURAL SUBUNIT 		None 6 PRO D  40
GLY D  42
PRO D  43
ILE D 111
GLY D 113
TYR D 115
 CLM D1142
1USQ_E_CLME1143 1usq CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli DR HEMAGGLUTININ
STRUCTURAL SUBUNIT 		None 6 PRO E  40
GLY E  42
PRO E  43
ILE E 111
GLY E 113
TYR E 115
 CLM E1143
1USQ_F_CLMF1144 1usq CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli DR HEMAGGLUTININ
STRUCTURAL SUBUNIT 		None 7 PRO F  40
GLY F  42
PRO F  43
THR F  88
ILE F 111
GLY F 113
TYR F 115
 CLM F1144
1VIF_A_FOLA1 1vif FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF06442
(DHFR_2) 		3 GLN A  67
ILE A  68
TYR A  69
 FOL A   1
1XVA_A_ACTA294 1xva ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli GLYCINE
N-METHYLTRANSFERASE 		None
PF13649
(Methyltransf_25) 		5 ALA B  14
GLU B  15
TRP A  30
ILE A  34
LEU A 240
 ACT A 294
1XVA_A_SAMA293 1xva SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli GLYCINE
N-METHYLTRANSFERASE 		None
PF13649
(Methyltransf_25) 		13 GLU B  15
TYR A  33
THR A  37
VAL A  69
ASP A  70
SER A 139
HIS A 142
ARG A 175
GLY A 189
ILE A 202
TYR A 220
TYR A 242
TYR A 283
 SAM A 293
1XVA_B_ACTB294 1xva ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli GLYCINE
N-METHYLTRANSFERASE 		None
PF13649
(Methyltransf_25) 		6 ALA A  14
GLU A  15
TRP B  30
TYR B  33
ILE B  34
LEU B 240
 ACT B 294
1XVA_B_SAMB293 1xva SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli GLYCINE
N-METHYLTRANSFERASE 		None
PF13649
(Methyltransf_25) 		13 GLU A  15
TYR B  33
ALA B  64
ASP B  70
ASN B 138
SER B 139
HIS B 142
ARG B 175
TYR B 194
ILE B 202
TYR B 220
TYR B 242
TYR B 283
 SAM B 293
1YKI_A_NFZA1219 1yki NFZ

DB00336
(Nitrofural) 		Escherichia coli OXYGEN-INSENSITIVE
NAD(P)H
NITROREDUCTASE 		PF00881
(Nitroreductase)
no annotation 		8 THR B  41
TYR A  68
PHE A  70
ASN A  71
LYS A  74
PHE B 124
GLU A 165
GLY A 166
 NFZ A1219
1YKI_B_NFZB2219 1yki NFZ

DB00336
(Nitrofural) 		Escherichia coli OXYGEN-INSENSITIVE
NAD(P)H
NITROREDUCTASE 		PF00881
(Nitroreductase)
no annotation 		8 THR A  41
TYR B  68
PHE B  70
ASN B  71
LYS B  74
PHE A 124
GLU B 165
GLY B 166
 NFZ B2219
1YKI_C_NFZC3219 1yki NFZ

DB00336
(Nitrofural) 		Escherichia coli OXYGEN-INSENSITIVE
NAD(P)H
NITROREDUCTASE 		no annotation 8 THR D  41
TYR C  68
PHE C  70
ASN C  71
LYS C  74
PHE D 124
GLU C 165
GLY C 166
 NFZ C3219
1YKI_D_NFZD4219 1yki NFZ

DB00336
(Nitrofural) 		Escherichia coli OXYGEN-INSENSITIVE
NAD(P)H
NITROREDUCTASE 		no annotation 8 THR C  41
TYR D  68
PHE D  70
ASN D  71
LYS D  74
PHE C 124
GLU D 165
GLY D 166
 NFZ D4219
1YMX_A_CFXA1001 1ymx CFX

DB01331
(Cefoxitin) 		Escherichia coli BETA-LACTAMASE
CTX-M-9 		PF13354
(Beta-lactamase2) 		17 CYS A  69
SER A  70
LYS A  73
ASN A 104
TYR A 105
SER A 130
ASN A 132
GLU A 166
PRO A 167
ASN A 170
THR A 216
LYS A 234
THR A 235
GLY A 236
SER A 237
GLY A 238
ASP A 240
 CFX A1001
1YMX_B_CFXB1002 1ymx CFX

DB01331
(Cefoxitin) 		Escherichia coli BETA-LACTAMASE
CTX-M-9 		no annotation 17 CYS B  69
SER B  70
LYS B  73
ASN B 104
TYR B 105
SER B 130
ASN B 132
GLU B 166
PRO B 167
ASN B 170
THR B 216
LYS B 234
THR B 235
GLY B 236
SER B 237
GLY B 238
ASP B 240
 CFX B1002
1YVM_A_TMGA501 1yvm TMG

DB00730
(Thiabendazole) 		Escherichia coli METHIONINE
AMINOPEPTIDASE 		PF00557
(Peptidase_M24) 		7 CYS A  59
TYR A  62
TYR A  65
CYS A  70
HIS A  79
HIS A 178
TRP A 221
 TMG A 501
1ZLQ_A_ACTA1502 1zlq ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli NICKEL-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN 		PF00496
(SBP_bac_5) 		5 TRP A  10
PRO A  11
GLY A 219
ASN A 220
GLY A 222
 ACT A1502
1ZLQ_A_ACTA1503 1zlq ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli NICKEL-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN 		PF00496
(SBP_bac_5) 		4 LYS A  52
ARG A  68
ASP A  69
ASP A  70
 ACT A1503
1ZLQ_A_ACTA1507 1zlq ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli NICKEL-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN 		PF00496
(SBP_bac_5) 		3 GLN A 385
HIS A 395
ARG A 396
 ACT A1507
1ZLQ_A_EDTA1513 1zlq EDT

DB00974
(Edetic
Acid) 		Escherichia coli NICKEL-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN 		PF00496
(SBP_bac_5) 		9 TYR A  22
MET A  27
ARG A  97
TRP A 100
ARG A 137
TRP A 398
TYR A 402
HIS A 416
THR A 490
 EDT A1513
1ZLQ_B_ACTB1503 1zlq ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli NICKEL-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN 		None 4 TYR B 382
GLN B 385
HIS B 395
ARG B 396
 ACT B1503
1ZLQ_B_ACTB1505 1zlq ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli NICKEL-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN 		None 4 ASN B 274
LYS B 275
LYS B 276
TYR B 310
 ACT B1505
1ZLQ_B_EDTB1511 1zlq EDT

DB00974
(Edetic
Acid) 		Escherichia coli NICKEL-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN 		None 8 TYR B  22
MET B  27
ARG B  97
TRP B 100
ARG B 137
TRP B 398
TYR B 402
THR B 490
 EDT B1511
1ZP4_A_C2FA995 1zp4 C2F

DB11256
(Levomefolic
acid) 		Escherichia coli 5,10-METHYLENETETRAH
YDROFOLATE REDUCTASE 		PF02219
(MTHFR) 		9 GLN A  28
ASP A 120
GLN A 183
GLN A 219
PHE A 223
THR A 227
TYR A 275
LEU A 277
ARG A 279
 C2F A 995
1ZP4_B_C2FB996 1zp4 C2F

DB11256
(Levomefolic
acid) 		Escherichia coli 5,10-METHYLENETETRAH
YDROFOLATE REDUCTASE 		None 10 GLN B  28
ASP B 120
GLN B 183
SER B 215
GLN B 219
PHE B 223
THR B 227
TYR B 275
LEU B 277
ARG B 279
 C2F B 996
1ZP4_C_C2FC997 1zp4 C2F

DB11256
(Levomefolic
acid) 		Escherichia coli 5,10-METHYLENETETRAH
YDROFOLATE REDUCTASE 		None 10 GLN C  28
ASP C 120
GLN C 183
SER C 215
GLN C 219
PHE C 223
THR C 227
TYR C 275
LEU C 277
ARG C 279
 C2F C 997
2B82_A_ADNA1001 2b82 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Escherichia coli CLASS B ACID
PHOSPHATASE 		PF03767
(Acid_phosphat_B) 		10 PHE A  56
LYS A  60
GLU A  68
TYR A  70
LEU A  71
TRP A  77
GLY A 113
ASP A 145
THR A 192
TYR A 193
 ADN A1001
2B82_B_ADNB1002 2b82 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Escherichia coli CLASS B ACID
PHOSPHATASE 		no annotation 9 PHE B  56
LYS B  60
GLU B  68
TYR B  70
LEU B  71
TRP B  77
GLY B 113
THR B 192
TYR B 193
 ADN B1002
2B8J_A_SPMA653 2b8j SPM

DB00127
(Spermine) 		Escherichia coli CLASS B ACID
PHOSPHATASE 		PF03767
(Acid_phosphat_B) 		9 ASP A  46
PHE A  56
TRP A  57
LYS A  60
TYR A  70
GLY A 113
ASP A 145
THR A 192
TYR A 193
 SPM A 653
2B8J_B_ADNB331 2b8j ADN

DB00640
(Adenosine) 		Escherichia coli CLASS B ACID
PHOSPHATASE 		no annotation 10 ASP B  46
SER B  53
PHE B  56
TYR B  70
LEU B  71
TRP B  77
GLY B 113
ARG B 114
THR B 192
TYR B 193
 ADN B 331
2BUE_A_RIOA1201 2bue RIO

DB03615
(Ribostamycin) 		Escherichia coli AAC(6')-IB PF13523
(Acetyltransf_8) 		11 TRP A  49
GLY A  50
TYR A  65
GLU A  73
GLN A  91
TYR A  93
SER A  98
TRP A 102
TRP A 103
ASP A 115
ASP A 152
 RIO A1201
2D0K_A_FOLA1161 2d0k FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		13 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
PHE A  31
LYS A  32
ILE A  50
LEU A  54
PRO A  55
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A1161
2D0K_B_FOLB2161 2d0k FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		None 14 ILE B   5
ALA B   7
ASP B  27
LEU B  28
PHE B  31
LYS B  32
THR B  46
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
ARG B  57
ILE B  94
TYR B 100
THR B 113
 FOL B2161
2DDW_A_PXLA1003 2ddw PXL

DB00147
(Pyridoxal) 		Escherichia coli PYRIDOXINE KINASE PF08543
(Phos_pyr_kin) 		8 SER A  23
VAL A  25
VAL A  30
LEU A  54
PRO A  58
HIS A  59
TYR A  96
ASP A 233
 PXL A1003
2DDW_B_PXLB1005 2ddw PXL

DB00147
(Pyridoxal) 		Escherichia coli PYRIDOXINE KINASE no annotation 7 SER B  23
LEU B  54
THR B  57
PRO B  58
HIS B  59
GLY B 230
ASP B 233
 PXL B1005
2DR6_A_DM2A2002 2dr6 DM2

DB00445
(Epirubicin)
DB00997
(Doxorubicin) 		Escherichia coli ACRB PF00873
(ACR_tran) 		9 SER A  46
GLN A  89
SER A 134
GLN A 176
PHE A 178
GLY A 179
ILE A 277
PHE A 615
PHE A 617
 DM2 A2002
2DRC_A_MTXA161 2drc MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		13 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
LYS A  32
SER A  49
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 MTX A 161
2DRC_B_MTXB161 2drc MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		no annotation 12 ILE B   5
ALA B   7
ASP B  27
LEU B  28
LYS B  32
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
ARG B  57
ILE B  94
TYR B 100
THR B 113
 MTX B 161
2DRD_A_MIYA2001 2drd MIY

DB01017
(Minocycline) 		Escherichia coli ACRB PF00873
(ACR_tran) 		9 GLN A 176
PHE A 178
GLY A 179
GLU A 273
ASN A 274
ILE A 277
ALA A 279
VAL A 612
PHE A 615
 MIY A2001
2ECP_A_ACRA992 2ecp ACR

DB00284
(Acarbose) 		Escherichia coli MALTODEXTRIN
PHOSPHORYLASE 		PF00343
(Phosphorylase) 		10 ASN A 133
LEU A 136
TYR A 280
ASP A 283
ARG A 292
ASP A 339
HIS A 341
ARG A 569
HIS A 571
ALA A 610
 ACR A 992
2ECP_B_ACRB992 2ecp ACR

DB00284
(Acarbose) 		Escherichia coli MALTODEXTRIN
PHOSPHORYLASE 		no annotation 10 ASN B 133
LEU B 136
TYR B 280
ASP B 283
ARG B 292
ASP B 339
HIS B 341
ARG B 569
HIS B 571
ALA B 610
 ACR B 992
2FJ1_A_CTCA222 2fj1 CTC

DB09093
(Chlortetracycline) 		Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR PROTEIN
CLASS D 		PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C) 		13 HIS A  64
SER A  67
ASN A  82
PHE A  86
HIS A 100
ARG A 104
PRO A 105
THR A 112
VAL A 113
GLN A 116
LEU A 131
ILE A 134
SER A 138
 CTC A 222
2FQD_A_CUA601 2fqd CU

DB09130
(Copper) 		Escherichia coli BLUE COPPER OXIDASE
CUEO 		PF00394
(Cu-oxidase_2)
PF07731
(Cu-oxidase_3)
PF07732
(Cu-oxidase) 		4 HIS A 443
CYS A 500
HIS A 505
MET A 510
  CU A 601
2FQE_A_CUA601 2fqe CU

DB09130
(Copper) 		Escherichia coli BLUE COPPER OXIDASE
CUEO 		PF00394
(Cu-oxidase_2)
PF07731
(Cu-oxidase_3)
PF07732
(Cu-oxidase) 		4 HIS A 443
CYS A 500
HIS A 505
MET A 510
  CU A 601
2FQE_A_CUA603 2fqe CU

DB09130
(Copper) 		Escherichia coli BLUE COPPER OXIDASE
CUEO 		PF00394
(Cu-oxidase_2)
PF07731
(Cu-oxidase_3)
PF07732
(Cu-oxidase) 		4 HIS A 101
HIS A 103
HIS A 446
HIS A 448
  CU A 603
2FQF_A_CUA601 2fqf CU

DB09130
(Copper) 		Escherichia coli BLUE COPPER OXIDASE
CUEO 		PF00394
(Cu-oxidase_2)
PF07731
(Cu-oxidase_3)
PF07732
(Cu-oxidase) 		4 HIS A 443
CYS A 500
HIS A 505
MET A 510
  CU A 601
2FQF_A_CUA603 2fqf CU

DB09130
(Copper) 		Escherichia coli BLUE COPPER OXIDASE
CUEO 		PF00394
(Cu-oxidase_2)
PF07731
(Cu-oxidase_3)
PF07732
(Cu-oxidase) 		4 HIS A 101
HIS A 103
HIS A 446
HIS A 448
  CU A 603
2FQG_A_CUA601 2fqg CU

DB09130
(Copper) 		Escherichia coli BLUE COPPER OXIDASE
CUEO 		PF00394
(Cu-oxidase_2)
PF07731
(Cu-oxidase_3)
PF07732
(Cu-oxidase) 		4 HIS A 443
CYS A 500
HIS A 505
MET A 510
  CU A 601
2FQG_A_CUA603 2fqg CU

DB09130
(Copper) 		Escherichia coli BLUE COPPER OXIDASE
CUEO 		PF00394
(Cu-oxidase_2)
PF07731
(Cu-oxidase_3)
PF07732
(Cu-oxidase) 		4 HIS A 101
HIS A 103
HIS A 446
HIS A 448
  CU A 603
2HCJ_B_TACB888 2hcj TAC

DB00759
(Tetracycline) 		Escherichia coli PROTEIN CHAIN
ELONGATION FACTOR
EF-TU 		PF00009
(GTP_EFTU)
PF03143
(GTP_EFTU_D3)
PF03144
(GTP_EFTU_D2) 		4 THR A  25
SER B  65
ASP B  80
PRO B  82
 TAC B 888
2HDN_B_TACB1888 2hdn TAC

DB00759
(Tetracycline) 		Escherichia coli ELONGATION FACTOR
EF-TU 		PF00009
(GTP_EFTU)
PF03143
(GTP_EFTU_D3)
PF03144
(GTP_EFTU_D2)
no annotation 		5 THR A  25
SER B  65
SER D  65
ASP B  80
PRO B  82
 TAC B1888
2HDN_D_TACD2888 2hdn TAC

DB00759
(Tetracycline) 		Escherichia coli ELONGATION FACTOR
EF-TU 		PF00009
(GTP_EFTU)
PF03143
(GTP_EFTU_D3)
PF03144
(GTP_EFTU_D2)
no annotation 		5 THR C  25
SER B  65
SER D  65
ASP D  80
PRO D  82
 TAC D2888
2HDN_F_TACF3888 2hdn TAC

DB00759
(Tetracycline) 		Escherichia coli ELONGATION FACTOR
EF-TU 		no annotation 7 THR E  25
SER H  65
SER F  65
VAL H  67
ASP F  80
PRO F  82
LEU H 178
 TAC F3888
2HDN_H_TACH4888 2hdn TAC

DB00759
(Tetracycline) 		Escherichia coli ELONGATION FACTOR
EF-TU 		no annotation 7 THR G  25
SER H  65
SER F  65
VAL F  67
ASP H  80
PRO H  82
LEU F 178
 TAC H4888
2HDN_J_TACJ5888 2hdn TAC

DB00759
(Tetracycline) 		Escherichia coli ELONGATION FACTOR
EF-TU 		no annotation 6 THR I  25
SER L  65
SER J  65
VAL L  67
ASP J  80
PRO J  82
 TAC J5888
2HDN_L_TACL6888 2hdn TAC

DB00759
(Tetracycline) 		Escherichia coli ELONGATION FACTOR
EF-TU 		no annotation 6 THR K  25
SER L  65
SER J  65
VAL J  67
ASP L  80
PRO L  82
 TAC L6888
2JKJ_A_CLMA1141 2jkj CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli DR HEMAGGLUTININ
STRUCTURAL SUBUNIT 		PF04619
(Adhesin_Dr) 		6 PRO A  40
GLY A  42
PRO A  43
ILE A 111
GLY A 113
TYR A 115
 CLM A1141
2JKJ_B_CLMB1141 2jkj CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli DR HEMAGGLUTININ
STRUCTURAL SUBUNIT 		None 6 PRO B  40
GLY B  42
PRO B  43
ILE B 111
GLY B 113
TYR B 115
 CLM B1141
2JKJ_C_CLMC1141 2jkj CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli DR HEMAGGLUTININ
STRUCTURAL SUBUNIT 		None 6 PRO C  40
GLY C  42
PRO C  43
ILE C 111
GLY C 113
TYR C 115
 CLM C1141
2JKJ_D_CLMD1142 2jkj CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli DR HEMAGGLUTININ
STRUCTURAL SUBUNIT 		None 5 PRO D  40
PRO D  43
ILE D 111
GLY D 113
TYR D 115
 CLM D1142
2JKJ_E_CLME1141 2jkj CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli DR HEMAGGLUTININ
STRUCTURAL SUBUNIT 		None 7 PRO E  40
GLY E  42
PRO E  43
THR E  88
ILE E 111
GLY E 113
TYR E 115
 CLM E1141
2JKJ_F_CLMF1143 2jkj CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli DR HEMAGGLUTININ
STRUCTURAL SUBUNIT 		None 5 PRO F  40
PRO F  43
ILE F 111
GLY F 113
TYR F 115
 CLM F1143
2JKL_A_CLMA1144 2jkl CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli DR HEMAGGLUTININ
STRUCTURAL SUBUNIT 		PF04619
(Adhesin_Dr) 		7 PRO A  40
GLY A  42
PRO A  43
THR A  88
ILE A 111
GLY A 113
TYR A 115
 CLM A1144
2JKL_B_CLMB1144 2jkl CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli DR HEMAGGLUTININ
STRUCTURAL SUBUNIT 		None 6 PRO B  40
GLY B  42
PRO B  43
ILE B 111
GLY B 113
TYR B 115
 CLM B1144
2JKL_C_CLMC1143 2jkl CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli DR HEMAGGLUTININ
STRUCTURAL SUBUNIT 		None 7 PRO C  40
GLY C  42
PRO C  43
THR C  88
ILE C 111
GLY C 113
TYR C 115
 CLM C1143
2JKL_D_CLMD1145 2jkl CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli DR HEMAGGLUTININ
STRUCTURAL SUBUNIT 		None 7 PRO D  40
GLY D  42
PRO D  43
THR D  88
ILE D 111
GLY D 113
TYR D 115
 CLM D1145
2JKL_E_CLME1143 2jkl CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli DR HEMAGGLUTININ
STRUCTURAL SUBUNIT 		None 7 PRO E  40
GLY E  42
PRO E  43
THR E  88
ILE E 111
GLY E 113
TYR E 115
 CLM E1143
2JKL_F_CLMF1143 2jkl CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli DR HEMAGGLUTININ
STRUCTURAL SUBUNIT 		None 7 PRO F  40
GLY F  42
PRO F  43
THR F  88
ILE F 111
GLY F 113
TYR F 115
 CLM F1143
2KCE_A_D16A566 2kce D16

DB00293
(Raltitrexed) 		Escherichia coli THYMIDYLATE SYNTHASE PF00303
(Thymidylat_synt) 		15 HIS A  51
SER A  54
GLU A  58
ILE A  79
TRP A  80
TRP A  83
LEU A 143
ASP A 169
LEU A 172
GLY A 173
PHE A 176
TYR A 209
LYS A 259
VAL A 262
ALA A 263
 D16 A 566
2KCE_B_D16B568 2kce D16

DB00293
(Raltitrexed) 		Escherichia coli THYMIDYLATE SYNTHASE no annotation 13 HIS B  51
SER B  54
ILE B  79
TRP B  80
TRP B  83
LEU B 143
ASP B 169
LEU B 172
GLY B 173
PHE B 176
TYR B 209
VAL B 262
ALA B 263
 D16 B 568
2O7O_A_DXTA222 2o7o DXT

DB00254
(Doxycycline) 		Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR PROTEIN
CLASS D 		PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C) 		13 LEU A  60
HIS A  64
SER A  67
ASN A  82
PHE A  86
HIS A 100
ARG A 104
PRO A 105
THR A 112
VAL A 113
GLN A 116
ILE A 134
SER A 138
 DXT A 222
2OPX_A_DXCA1001 2opx DXC

DB03619
(Deoxycholic
Acid) 		Escherichia coli ALDEHYDE
DEHYDROGENASE A 		PF00171
(Aldedh) 		7 LEU A 100
PHE A 107
PHE A 154
ILE A 279
ASN A 286
PHE A 442
GLU A 443
 DXC A1001
2OPX_A_DXCA1002 2opx DXC

DB03619
(Deoxycholic
Acid) 		Escherichia coli ALDEHYDE
DEHYDROGENASE A 		PF00171
(Aldedh) 		3 GLY A 315
ARG A 320
TYR A 364
 DXC A1002
2OPX_A_DXCA1003 2opx DXC

DB03619
(Deoxycholic
Acid) 		Escherichia coli ALDEHYDE
DEHYDROGENASE A 		PF00171
(Aldedh) 		5 ILE A  97
LEU A 100
ASP A 275
ALA A 324
PHE A 442
 DXC A1003
2RDD_A_AICA1110 2rdd AIC

DB00415
(Ampicillin) 		Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B 		PF00873
(ACR_tran) 		4 LYS A  29
ALA A 384
PHE A 386
GLY A 387
 AIC A1110
2TCT_A_CTCA222 2tct CTC

DB09093
(Chlortetracycline) 		Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR 		PF00440
(TetR_C)
PF02909
(TetR_N) 		13 HIS A  64
SER A  67
ASN A  82
PHE A  86
HIS A 100
ARG A 104
PRO A 105
GLN A 109
THR A 112
VAL A 113
GLN A 116
ILE A 134
SER A 138
 CTC A 222
2TRT_A_TACA222 2trt TAC

DB00759
(Tetracycline) 		Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR CLASS D 		PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C) 		11 HIS A  64
SER A  67
ASN A  82
PHE A  86
HIS A 100
ARG A 104
PRO A 105
VAL A 113
GLN A 116
ILE A 134
SER A 138
 TAC A 222
2VKE_A_TACA222 2vke TAC

DB00759
(Tetracycline) 		Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR PROTEIN
CLASS D 		PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C) 		11 HIS A  64
SER A  67
ASN A  82
PHE A  86
HIS A 100
ARG A 104
PRO A 105
VAL A 113
GLN A 116
ILE A 134
SER A 138
 TAC A 222
2VQY_A_PARA1201 2vqy PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Escherichia coli AAC(6')-IB PF13523
(Acetyltransf_8) 		15 TRP A  49
GLY A  50
GLN A  64
TYR A  65
LEU A  70
GLU A  73
VAL A  75
GLN A  91
TYR A  93
SER A  98
TRP A 102
TRP A 103
ASP A 115
ASP A 152
ASP A 179
 PAR A1201
2W0Q_A_CUA801 2w0q CU

DB09130
(Copper) 		Escherichia coli COPPER AMINE OXIDASE PF01179
(Cu_amine_oxidN3)
PF02727
(Cu_amine_oxidN2)
PF02728
(Cu_amine_oxidN1)
PF07833
(Cu_amine_oxid) 		3 HIS A 524
HIS A 526
HIS A 689
  CU A 801
2W0Q_B_CUB801 2w0q CU

DB09130
(Copper) 		Escherichia coli COPPER AMINE OXIDASE None 3 HIS B 524
HIS B 526
HIS B 689
  CU B 801
2W1B_A_DXCA2034 2w1b DXC

DB03619
(Deoxycholic
Acid) 		Escherichia coli ACRIFLAVIN
RESISTANCE PROTEIN B 		PF00873
(ACR_tran) 		3 PHE A 664
SER A 715
LEU A 828
 DXC A2034
2XPV_A_MIYA1209 2xpv MIY

DB01017
(Minocycline) 		Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR PROTEIN
CLASS D 		PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C) 		13 HIS A  64
SER A  67
ASN A  82
PHE A  86
HIS A 100
ARG A 104
PRO A 105
THR A 112
VAL A 113
GLN A 116
LEU A 131
ILE A 134
SER A 138
 MIY A1209
2XPW_A_OTCA222 2xpw OTC

DB00595
(Oxytetracycline) 		Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR PROTEIN
CLASS D 		PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C) 		12 LEU A  60
HIS A  64
SER A  67
ASN A  82
PHE A  86
HIS A 100
ARG A 104
PRO A 105
VAL A 113
GLN A 116
ILE A 134
SER A 138
 OTC A 222
2XRL_A_DXTA1211 2xrl DXT

DB00254
(Doxycycline) 		Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR PROTEIN
CLASS D 		PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C) 		14 LEU A  60
HIS A  64
SER A  67
ASN A  82
PHE A  86
HIS A 100
ARG A 104
PRO A 105
THR A 112
VAL A 113
GLN A 116
LEU A 117
ILE A 134
SER A 138
 DXT A1211
2Y7H_B_SAMB530 2y7h SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli TYPE I RESTRICTION
ENZYME ECOKI M
PROTEIN 		PF02384
(HsdM_N)
PF12161
(N6_Mtase) 		15 TYR B 149
THR B 151
ILE B 156
ALA B 175
GLY B 177
THR B 178
GLY B 180
GLU B 216
ASN B 248
THR B 249
LEU B 250
ASN B 266
PRO B 268
THR B 275
PHE B 292
 SAM B 530
2Y7H_C_SAMC530 2y7h SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli TYPE I RESTRICTION
ENZYME ECOKI M
PROTEIN 		None 15 TYR C 149
THR C 151
ILE C 156
ALA C 175
GLY C 177
THR C 178
GLY C 180
GLU C 216
ASN C 248
THR C 249
LEU C 250
ASN C 266
PRO C 268
THR C 275
PHE C 292
 SAM C 530
2ZQ9_A_CLSA11 2zq9 CLS

DB00456
(Cefalotin) 		Escherichia coli BETA-LACTAMASE
TOHO-1 		PF13354
(Beta-lactamase2) 		4 GLU A 273
ARG A 275
ASN A 276
ASP A 277
 CLS A  11
3A8I_A_C2FA401 3a8i C2F

DB11256
(Levomefolic
acid) 		Escherichia coli AMINOMETHYLTRANSFERA
SE 		PF01571
(GCV_T)
PF08669
(GCV_T_C) 		14 MET A  51
TYR A  84
ASP A  97
ILE A  99
TYR A 101
VAL A 111
ASN A 113
MET A 143
PHE A 173
TYR A 188
GLU A 195
ARG A 223
MET A 232
TRP A 252
 C2F A 401
3A8I_B_C2FB401 3a8i C2F

DB11256
(Levomefolic
acid) 		Escherichia coli AMINOMETHYLTRANSFERA
SE 		None 14 MET B  51
TYR B  84
ASP B  97
ILE B  99
TYR B 101
VAL B 111
ASN B 113
PHE B 173
TYR B 188
GLU B 195
ARG B 223
MET B 232
TRP B 252
ARG B 357
 C2F B 401
3A8I_C_C2FC401 3a8i C2F

DB11256
(Levomefolic
acid) 		Escherichia coli AMINOMETHYLTRANSFERA
SE 		None 14 MET C  51
TYR C  84
ASP C  97
ILE C  99
TYR C 101
VAL C 111
ASN C 113
PHE C 173
THR C 186
TYR C 188
GLU C 195
ARG C 223
MET C 232
TRP C 252
 C2F C 401
3A8I_D_C2FD401 3a8i C2F

DB11256
(Levomefolic
acid) 		Escherichia coli AMINOMETHYLTRANSFERA
SE 		None 13 MET D  51
TYR D  84
ASP D  97
ILE D  99
TYR D 101
VAL D 111
ASN D 113
PHE D 173
TYR D 188
GLU D 195
ARG D 223
MET D 232
TRP D 252
 C2F D 401
3AOB_C_RFPC2002 3aob RFP

DB01045
(Rifampicin) 		Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B 		no annotation 12 MET C 575
GLN C 577
PHE C 617
ALA C 618
THR C 624
PHE C 664
PHE C 666
ARG C 717
ASN C 719
GLY C 720
ARG C 815
LEU C 828
 RFP C2002
3AOC_C_ERYC3402 3aoc ERY

DB00199
(Erythromycin) 		Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B 		None 15 SER C  79
THR C  91
SER C 134
SER C 135
LYS C 292
MET C 573
MET C 575
PHE C 615
PHE C 617
ILE C 626
PHE C 666
LEU C 674
ASP C 681
GLU C 683
GLU C 826
 ERY C3402
3AOD_A_MIYA2001 3aod MIY

DB01017
(Minocycline) 		Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B 		PF00873
(ACR_tran) 		8 SER A  48
PHE A 178
GLY A 179
GLU A 273
ASN A 274
ILE A 277
ALA A 279
PHE A 615
 MIY A2001
3AOD_C_RFPC2002 3aod RFP

DB01045
(Rifampicin) 		Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B 		no annotation 12 MET C 575
GLN C 577
PHE C 617
ALA C 618
THR C 624
PHE C 664
PHE C 666
ARG C 717
ASN C 719
GLY C 720
ARG C 815
LEU C 828
 RFP C2002
3CB8_A_SAMA501 3cb8 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		;
Escherichia coli 		PYRUVATE
FORMATE-LYASE
1-ACTIVATING ENZYME;
PEPTIDE SUBSTRATE
VSGYAV 		None
PF04055
(Radical_SAM) 		15 TYR A  35
HIS A  37
ASN A  38
SER A  76
GLU A  79
ASP A 104
ASN A 106
ASP A 129
LYS A 131
ARG A 166
VAL A 168
LEU A 199
TYR A 201
HIS A 202
GLY B 734
 SAM A 501
3CLA_A_CLMA221 3cla CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli TYPE III
CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		PF00302
(CAT) 		9 GLN A  92
ALA A 105
PHE A 135
ASN A 146
SER A 148
LEU A 160
VAL A 162
TYR A 168
ILE A 172
 CLM A 221
3D4S_A_TIMA401 3d4s TIM

DB00373
(Timolol) 		Escherichia virus
T4;
Homo sapiens 		BETA-2 ADRENERGIC
RECEPTOR/T4-LYSOZYME
CHIMERA 		PF00001
(7tm_1)
PF00959
(Phage_lysozyme) 		15 TRP A 109
THR A 110
ASP A 113
VAL A 114
VAL A 117
THR A 118
SER A 203
SER A 207
TRP A 286
PHE A 289
PHE A 290
ASN A 293
TYR A 308
ASN A 312
TYR A 316
 TIM A 401
3DAU_A_MTXA201 3dau MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		15 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
ALA A  29
LYS A  32
SER A  49
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 MTX A 201
3DRC_A_MTXA161 3drc MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		13 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
LYS A  32
SER A  49
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 MTX A 161
3DRC_B_MTXB361 3drc MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		no annotation 12 ILE B   5
ALA B   7
ASP B  27
LEU B  28
LYS B  32
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
ARG B  57
ILE B  94
TYR B 100
THR B 113
 MTX B 361
3DXY_A_SAMA1 3dxy SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli TRNA
(GUANINE-N(7)-)-METH
YLTRANSFERASE 		PF02390
(Methyltransf_4) 		11 GLU A  69
GLY A  71
GLY A  73
ILE A  93
GLU A  94
VAL A  95
HIS A  96
ASP A 121
ALA A 122
PHE A 142
ASP A 144
 SAM A   1
3FRQ_A_ERYA195 3frq ERY

DB00199
(Erythromycin) 		Escherichia coli REPRESSOR PROTEIN
MPHR(A) 		None
PF00440
(TetR_N) 		18 THR A  17
LYS A  21
VAL A  66
TYR A  69
LEU A  89
SER A  92
MET A  93
ASN A 102
TYR A 103
SER A 106
ARG A 122
ASN A 123
VAL A 126
HIS A 147
ILE A 150
ALA A 151
THR A 154
MET B 155
 ERY A 195
3FRQ_B_ERYB195 3frq ERY

DB00199
(Erythromycin) 		Escherichia coli REPRESSOR PROTEIN
MPHR(A) 		None
PF00440
(TetR_N) 		20 THR B  17
LEU B  20
LYS B  21
GLY B  62
VAL B  66
TYR B  69
LEU B  89
SER B  92
MET B  93
ASN B 102
TYR B 103
ILE B 105
SER B 106
ARG B 122
ASN B 123
VAL B 126
HIS B 147
ILE B 150
ALA B 151
MET A 155
 ERY B 195
3FSU_A_C2FA995 3fsu C2F

DB11256
(Levomefolic
acid) 		Escherichia coli 5,10-METHYLENETETRAH
YDROFOLATE REDUCTASE 		PF02219
(MTHFR) 		13 GLN A  28
THR A  59
ASP A 120
GLN A 183
LEU A 212
SER A 215
ASN A 216
GLN A 219
LEU A 223
THR A 227
TYR A 275
LEU A 277
ARG A 279
 C2F A 995
3FSU_E_C2FE995 3fsu C2F

DB11256
(Levomefolic
acid) 		Escherichia coli 5,10-METHYLENETETRAH
YDROFOLATE REDUCTASE 		None 11 GLN E  28
THR E  59
ASP E 120
GLN E 183
SER E 215
GLN E 219
LEU E 223
THR E 227
TYR E 275
LEU E 277
ARG E 279
 C2F E 995
3FZG_A_SAMA300 3fzg SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE PF07091
(FmrO) 		14 HIS A  83
SER A  85
THR A  86
ARG A  89
PHE A 113
GLY A 114
GLY A 116
ASP A 137
ILE A 138
LEU A 179
LYS A 180
MET A 181
VAL A 184
GLN A 188
 SAM A 300
3HLW_A_CE3A301 3hlw CE3

DB00493
(Cefotaxime) 		Escherichia coli CTX-M-9
EXTENDED-SPECTRUM
BETA-LACTAMASE 		PF13354
(Beta-lactamase2) 		16 CYS A  69
GLY A  70
LYS A  73
ASN A 104
TYR A 105
SER A 130
ASN A 132
PRO A 167
ASN A 170
THR A 216
LYS A 234
THR A 235
GLY A 236
SER A 237
GLY A 238
ASP A 240
 CE3 A 301
3HLW_A_CE3A303 3hlw CE3

DB00493
(Cefotaxime) 		Escherichia coli CTX-M-9
EXTENDED-SPECTRUM
BETA-LACTAMASE 		PF13354
(Beta-lactamase2) 		4 ASN A 104
SER A 237
SER A 274
ARG A 276
 CE3 A 303
3HLW_B_CE3B302 3hlw CE3

DB00493
(Cefotaxime) 		Escherichia coli CTX-M-9
EXTENDED-SPECTRUM
BETA-LACTAMASE 		no annotation 15 CYS B  69
GLY B  70
ASN B 104
TYR B 105
SER B 130
ASN B 132
PRO B 167
ASN B 170
THR B 216
LYS B 234
THR B 235
GLY B 236
SER B 237
GLY B 238
ASP B 240
 CE3 B 302
3HLW_B_CE3B304 3hlw CE3

DB00493
(Cefotaxime) 		Escherichia coli CTX-M-9
EXTENDED-SPECTRUM
BETA-LACTAMASE 		no annotation 5 ASN B 104
THR B 235
SER B 237
SER B 274
ARG B 276
 CE3 B 304
3HUO_A_PNNA300 3huo PNN

DB01053
(Benzylpenicillin) 		Escherichia coli CTX-M-9
EXTENDED-SPECTRUM
BETA-LACTAMASE 		PF13354
(Beta-lactamase2) 		13 CYS A  69
GLY A  70
LYS A  73
ASN A 104
SER A 130
ASN A 132
ASN A 170
LYS A 234
THR A 235
GLY A 236
SER A 237
GLY A 238
ASP A 240
 PNN A 300
3HUO_A_PNNA302 3huo PNN

DB01053
(Benzylpenicillin) 		Escherichia coli CTX-M-9
EXTENDED-SPECTRUM
BETA-LACTAMASE 		PF13354
(Beta-lactamase2) 		6 THR A  51
ARG A 191
LEU A 195
GLY A 196
ALA A 257
PRO A 258
 PNN A 302
3HUO_A_PNNA303 3huo PNN

DB01053
(Benzylpenicillin) 		Escherichia coli CTX-M-9
EXTENDED-SPECTRUM
BETA-LACTAMASE 		PF13354
(Beta-lactamase2) 		4 GLN A 188
GLN A 192
GLY A 196
HIS A 197
 PNN A 303
3HUO_A_PNNA304 3huo PNN

DB01053
(Benzylpenicillin) 		Escherichia coli CTX-M-9
EXTENDED-SPECTRUM
BETA-LACTAMASE 		PF13354
(Beta-lactamase2) 		4 GLN A  93
PRO A  94
VAL A  95
GLU A  96
 PNN A 304
3HUO_B_PNNB301 3huo PNN

DB01053
(Benzylpenicillin) 		Escherichia coli CTX-M-9
EXTENDED-SPECTRUM
BETA-LACTAMASE 		None 14 CYS B  69
GLY B  70
LYS B  73
ASN B 104
SER B 130
ASN B 132
ASN B 170
LYS B 234
THR B 235
GLY B 236
SER B 237
GLY B 238
ASP B 240
ARG B 276
 PNN B 301
3ITA_D_AICD501 3ita AIC

DB00415
(Ampicillin) 		Escherichia coli D-ALANYL-D-ALANINE
CARBOXYPEPTIDASE
DACC 		no annotation 3 PRO D 264
PHE D 271
ALA D 306
 AIC D 501
3J7Z_A_ERYA9000 3j7z ERY

DB00199
(Erythromycin) 		Escherichia coli;
Staphylococcus
aureus 		23S RRNA;
50S RIBOSOMAL
PROTEIN L22;
ERMCL NASCENT CHAIN 		PF00237
(Ribosomal_L22)
PF08253
(Leader_Erm) 		3 ILE a  81
PHE a  82
LYS S  90
 ERY A9000
3KD5_E_PPFE914 3kd5 PPF

DB00529
(Foscarnet) 		Escherichia virus
RB69 		DNA POLYMERASE PF00136
(DNA_pol_B)
PF03104
(DNA_pol_B_exo1) 		5 ASP E 411
LEU E 415
ARG E 482
LYS E 560
ASP E 623
 PPF E 914
3KVV_A_URFA254 3kvv URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Escherichia coli URIDINE
PHOSPHORYLASE 		PF01048
(PNP_UDP_1) 		6 GLY A  96
GLN A 166
ARG A 168
MET A 197
ILE A 220
VAL A 221
 URF A 254
3KVV_B_URFB254 3kvv URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Escherichia coli URIDINE
PHOSPHORYLASE 		no annotation 6 GLY B  96
GLN B 166
ARG B 168
MET B 197
ILE B 220
VAL B 221
 URF B 254
3KVV_C_URFC254 3kvv URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Escherichia coli URIDINE
PHOSPHORYLASE 		no annotation 6 GLY C  96
GLN C 166
ARG C 168
MET C 197
ILE C 220
VAL C 221
 URF C 254
3KVV_D_URFD254 3kvv URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Escherichia coli URIDINE
PHOSPHORYLASE 		no annotation 6 GLY D  96
GLN D 166
ARG D 168
MET D 197
ILE D 220
VAL D 221
 URF D 254
3KVV_E_URFE254 3kvv URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Escherichia coli URIDINE
PHOSPHORYLASE 		no annotation 6 GLY E  96
GLN E 166
ARG E 168
MET E 197
ILE E 220
VAL E 221
 URF E 254
3KVV_F_URFF254 3kvv URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Escherichia coli URIDINE
PHOSPHORYLASE 		no annotation 6 GLY F  96
GLN F 166
ARG F 168
MET F 197
ILE F 220
VAL F 221
 URF F 254
3MTE_A_SAMA220 3mte SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE PF02390
(Methyltransf_4) 		16 GLY A  32
GLY A  34
ASN A  38
ASP A  55
PRO A  56
VAL A  57
ASN A  60
ALA A  86
ALA A  87
GLU A  88
LEU A 104
TRP A 107
THR A 109
LEU A 110
SER A 195
TRP A 197
 SAM A 220
3MTE_B_SAMB220 3mte SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE None 16 GLY B  32
GLY B  34
ASN B  38
ASP B  55
PRO B  56
VAL B  57
ALA B  86
ALA B  87
GLU B  88
LEU B 104
PHE B 105
TRP B 107
THR B 109
LEU B 110
SER B 195
TRP B 197
 SAM B 220
3MZE_A_CFXA364 3mze CFX

DB01331
(Cefoxitin) 		Escherichia coli D-ALANYL-D-ALANINE
CARBOXYPEPTIDASE
DACA 		PF00768
(Peptidase_S11)
PF07943
(PBP5_C) 		15 ALA A  43
SER A  44
LYS A  47
GLY A  85
SER A  86
SER A  87
ASN A 112
LEU A 153
ARG A 198
THR A 214
GLY A 215
HIS A 216
THR A 217
PHE A 245
ARG A 248
 CFX A 364
3NYA_A_JTZA1203 3nya JTZ

DB00866
(Alprenolol) 		Escherichia virus
T4;
Homo sapiens 		BETA-2 ADRENERGIC
RECEPTOR, LYSOZYME 		PF00001
(7tm_1)
PF00959
(Phage_lysozyme) 		14 TRP A 109
THR A 110
ASP A 113
VAL A 114
VAL A 117
THR A 118
SER A 203
SER A 207
TRP A 286
PHE A 289
PHE A 290
ASN A 293
ASN A 312
TYR A 316
 JTZ A1203
3P2K_A_SAMA6735 3p2k SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE PF02390
(Methyltransf_4) 		15 GLY A  32
GLY A  34
ASN A  38
ASP A  55
PRO A  56
ALA A  86
ALA A  87
GLU A  88
LEU A 104
PHE A 105
TRP A 107
THR A 109
LEU A 110
SER A 195
TRP A 197
 SAM A6735
3P2K_B_SAMB6735 3p2k SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE None 14 GLY B  32
GLY B  34
ASN B  38
ASP B  55
PRO B  56
VAL B  57
ALA B  87
GLU B  88
LEU B 104
TRP B 107
THR B 109
LEU B 110
SER B 195
TRP B 197
 SAM B6735
3P2K_C_SAMC6735 3p2k SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE None 17 GLY C  32
GLY C  34
ASN C  38
ASP C  55
PRO C  56
VAL C  57
ASN C  60
ALA C  86
ALA C  87
GLU C  88
LEU C 104
PHE C 105
TRP C 107
THR C 109
LEU C 110
SER C 195
TRP C 197
 SAM C6735
3P2K_D_SAMD6735 3p2k SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE None
PF02390
(Methyltransf_4) 		18 GLY D  32
GLY D  34
ASN D  38
ASP D  55
PRO D  56
VAL D  57
ALA D  86
ALA D  87
GLU D  88
LEU D 104
TRP D 107
THR D 109
LEU D 110
TYR D 113
LYS A 191
SER D 195
TRP D 197
PHE A 203
 SAM D6735
3PS9_A_SAMA670 3ps9 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli TRNA
5-METHYLAMINOMETHYL-
2-THIOURIDINE
BIOSYNTHESIS
BIFUNCTIONAL PROTEIN
MNMC 		PF01266
(DAO)
PF05430
(Methyltransf_30) 		18 PHE A  24
TYR A  28
GLU A  64
GLY A  66
GLY A  68
THR A  69
LEU A  71
ASN A  72
GLU A 101
LYS A 102
PHE A 103
ASP A 156
ILE A 157
ASP A 178
GLY A 179
PHE A 180
ASN A 185
MET A 188
 SAM A 670
3Q07_A_WPPA300 3q07 WPP

DB00319
(Piperacillin) 		Escherichia coli BETA-LACTAMASE PF13354
(Beta-lactamase2) 		17 CYS A  69
GLY A  70
LYS A  73
ASN A 104
TYR A 105
SER A 130
ASN A 132
PRO A 167
THR A 168
ASN A 170
THR A 171
LYS A 234
THR A 235
GLY A 236
SER A 237
GLY A 238
ASP A 239
 WPP A 300
3Q07_B_WPPB400 3q07 WPP

DB00319
(Piperacillin) 		Escherichia coli BETA-LACTAMASE no annotation 17 CYS B  69
GLY B  70
LYS B  73
ASN B 104
TYR B 105
SER B 130
ASN B 132
PRO B 167
THR B 168
ASN B 170
THR B 171
LYS B 234
THR B 235
GLY B 236
SER B 237
GLY B 238
ASP B 239
 WPP B 400
3QL0_A_FOLA160 3ql0 FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		13 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
TRP A  30
PHE A  31
LYS A  32
ILE A  50
LEU A  54
ARG A  57
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 160
3QL3_A_FOLA161 3ql3 FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		12 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
LYS A  32
ILE A  50
ARG A  52
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 161
3RFA_A_SAMA406 3rfa SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE N 		PF04055
(Radical_SAM) 		14 PHE A 131
CYS A 132
MET A 176
GLU A 180
PRO A 181
SER A 211
SER A 213
SER A 233
HIS A 235
GLU A 278
VAL A 280
ILE A 309
TRP A 311
ASN A 312
 SAM A 406
3RFA_B_SAMB406 3rfa SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE N 		None 12 PHE B 131
CYS B 132
MET B 176
GLU B 180
PRO B 181
SER B 211
SER B 213
SER B 233
HIS B 235
VAL B 280
TRP B 311
ASN B 312
 SAM B 406
3RUM_A_CCSA375 3rum CCS

DB04339
(Carbocisteine) 		Escherichia coli MALTOSE-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN 		PF13416
(SBP_bac_8) 		4 GLN A  73
SER A  74
GLY A 374
LYS A 376
 CCS A 375
3RUN_A_CCSA165 3run CCS

DB04339
(Carbocisteine) 		Escherichia virus
T4 		LYSOZYME PF00959
(Phage_lysozyme) 		3 ASN A 163
ALA A 164
LYS A 166
 CCS A 165
3RZE_A_D7VA1201 3rze D7V

DB01142
(Doxepin) 		Escherichia virus
T4;
Homo sapiens 		HISTAMINE H1
RECEPTOR, LYSOZYME
CHIMERA 		PF00001
(7tm_1)
PF00959
(Phage_lysozyme) 		13 ASP A 107
TYR A 108
SER A 111
THR A 112
ILE A 115
TRP A 158
THR A 194
ASN A 198
TRP A 428
TYR A 431
PHE A 432
PHE A 435
TYR A 458
 D7V A1201
3TKA_A_SAMA400 3tka SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE H 		PF01795
(Methyltransf_5) 		14 THR A  31
GLY A  33
ARG A  34
GLY A  36
HIS A  37
ASP A  55
ARG A  56
ASP A  57
PHE A  79
ASP A 101
SER A 105
GLN A 108
MET A 128
GLU A 218
 SAM A 400
3U9F_A_CLMA221 3u9f CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		None
PF00302
(CAT) 		13 PHE B  25
ALA B  29
CYS B  31
THR A  93
PHE A 102
SER A 104
TYR A 133
PHE A 134
SER A 146
LEU A 158
PHE A 166
VAL A 170
HIS B 193
 CLM A 221
3U9F_B_CLMB221 3u9f CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		None 12 PHE C  25
CYS C  31
THR B  93
SER B 104
TYR B 133
PHE B 134
SER B 146
LEU B 158
VAL B 160
PHE B 166
VAL B 170
HIS C 193
 CLM B 221
3U9F_C_CLMC221 3u9f CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		None
PF00302
(CAT) 		11 PHE A  25
CYS A  31
THR C  93
PHE C 102
SER C 104
TYR C 133
PHE C 134
SER C 146
VAL C 160
PHE C 166
HIS A 193
 CLM C 221
3U9F_D_CLMD221 3u9f CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		None 12 PHE E  25
ALA E  29
CYS E  31
THR D  93
PHE D 102
SER D 104
TYR D 133
SER D 146
LEU D 158
PHE D 166
VAL D 170
HIS E 193
 CLM D 221
3U9F_E_CLME221 3u9f CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		None 13 PHE F  25
CYS F  31
THR E  93
PHE E 102
SER E 104
TYR E 133
PHE E 134
SER E 146
LEU E 158
VAL E 160
PHE E 166
VAL E 170
HIS F 193
 CLM E 221
3U9F_F_CLMF221 3u9f CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		None 10 PHE D  25
THR F  93
SER F 104
TYR F 133
PHE F 134
SER F 146
VAL F 160
PHE F 166
VAL F 170
HIS D 193
 CLM F 221
3U9F_G_CLMG221 3u9f CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		None 12 PHE H  25
ALA H  29
CYS H  31
THR G  93
PHE G 102
SER G 104
TYR G 133
SER G 146
LEU G 158
PHE G 166
VAL G 170
HIS H 193
 CLM G 221
3U9F_H_CLMH221 3u9f CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		None 12 PHE I  25
CYS I  31
THR H  93
SER H 104
TYR H 133
PHE H 134
SER H 146
LEU H 158
VAL H 160
PHE H 166
VAL H 170
HIS I 193
 CLM H 221
3U9F_I_CLMI221 3u9f CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		None 13 PHE G  25
CYS G  31
THR I  93
PHE I 102
SER I 104
TYR I 133
PHE I 144
SER I 146
LEU I 158
VAL I 160
PHE I 166
VAL I 170
HIS G 193
 CLM I 221
3U9F_J_CLMJ221 3u9f CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		None 12 CYS K  31
THR J  93
SER J 104
TYR J 133
PHE J 134
PHE J 144
SER J 146
LEU J 158
VAL J 160
PHE J 166
VAL J 170
HIS K 193
 CLM J 221
3U9F_K_CLMK221 3u9f CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		None 13 PHE L  25
CYS L  31
THR K  93
PHE K 102
SER K 104
TYR K 133
PHE K 134
SER K 146
LEU K 158
VAL K 160
PHE K 166
VAL K 170
HIS L 193
 CLM K 221
3U9F_L_CLML221 3u9f CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		None 12 PHE J  25
CYS J  31
THR L  93
PHE L 102
SER L 104
TYR L 133
PHE L 134
SER L 146
LEU L 158
VAL L 160
PHE L 166
HIS J 193
 CLM L 221
3U9F_M_CLMM221 3u9f CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		None 10 PHE N  25
CYS N  31
PHE M 102
SER M 104
TYR M 133
SER M 146
VAL M 160
PHE M 166
VAL M 170
HIS N 193
 CLM M 221
3U9F_N_CLMN221 3u9f CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		None 11 PHE O  25
THR N  93
PHE N 102
SER N 104
TYR N 133
SER N 146
LEU N 158
VAL N 160
PHE N 166
VAL N 170
HIS O 193
 CLM N 221
3U9F_O_CLMO221 3u9f CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		None 11 PHE M  25
THR O  93
PHE O 102
SER O 104
TYR O 133
PHE O 134
SER O 146
VAL O 160
PHE O 166
VAL O 170
HIS M 193
 CLM O 221
3U9F_P_CLMP221 3u9f CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		None 13 PHE R  25
ALA R  29
CYS R  31
THR P  93
PHE P 102
SER P 104
TYR P 133
SER P 146
LEU P 158
VAL P 160
PHE P 166
VAL P 170
HIS R 193
 CLM P 221
3U9F_R_CLMR221 3u9f CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		None 13 PHE S  25
CYS S  31
PHE R 102
SER R 104
TYR R 133
PHE R 134
PHE R 144
SER R 146
LEU R 158
VAL R 160
PHE R 166
VAL R 170
HIS S 193
 CLM R 221
3U9F_S_CLMS221 3u9f CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		None 12 PHE P  25
CYS P  31
THR S  93
PHE S 102
SER S 104
TYR S 133
SER S 146
LEU S 158
VAL S 160
PHE S 166
VAL S 170
HIS P 193
 CLM S 221
3V8V_A_SAMA801 3v8v SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE L 		PF01170
(THUMP)
PF02926
(Methyltrans_SAM)
PF10672
(UPF0020) 		14 PRO A 172
ILE A 173
MET A 197
GLY A 199
SER A 200
THR A 202
ASP A 262
SER A 263
ASP A 264
ASP A 290
VAL A 291
ASN A 309
PRO A 311
LEU A 325
 SAM A 801
3V8V_A_SAMA802 3v8v SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE L 		PF01170
(THUMP)
PF02926
(Methyltrans_SAM)
PF10672
(UPF0020) 		9 PHE A 546
TYR A 548
ASP A 568
MET A 569
SER A 570
TYR A 573
ASP A 597
CYS A 598
PRO A 617
 SAM A 802
3V8V_B_SAMB801 3v8v SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE L 		None 11 MET B 197
GLY B 199
ASP B 262
SER B 263
ASP B 264
ASP B 290
VAL B 291
ASN B 309
PRO B 311
TYR B 312
LEU B 325
 SAM B 801
3V8V_B_SAMB802 3v8v SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE L 		None 13 ARG B 530
PHE B 546
TYR B 548
SER B 551
ASP B 568
MET B 569
SER B 570
TYR B 573
ASP B 597
CYS B 598
ASP B 615
PRO B 617
SER B 620
 SAM B 802
3VFJ_A_ACTA410 3vfj ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli MALTOSE-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN,
C-TERMINAL FUSED BY
CYS-LYS-D-ALA-D-ALA 		PF13416
(SBP_bac_8) 		4 LYS A  15
ALA A  63
GLU A 111
LEU A 262
 ACT A 410
3VW7_A_VPXA2001 3vw7 VPX

DB09030
(Vorapaxar) 		Escherichia virus
T4;
Homo sapiens 		PROTEINASE-ACTIVATED
RECEPTOR 1, LYSOZYME 		PF00001
(7tm_1)
PF00959
(Phage_lysozyme) 		16 TYR A 183
TYR A 187
PRO A 236
LEU A 237
HIS A 255
LEU A 258
LEU A 262
PHE A 271
LEU A 332
LEU A 333
HIS A 336
TYR A 337
LEU A 340
ALA A 349
ALA A 352
TYR A 353
 VPX A2001
3ZQT_A_30ZA1920 3zqt 30Z

DB00179
(Masoprocol) 		Escherichia coli ANDROGEN RECEPTOR PF00104
(Hormone_recep) 		6 PRO A 723
GLY A 724
ASN A 727
LEU A 830
ASN A 833
GLU A 837
 30Z A1920
3ZQT_A_TESA1000 3zqt TES

DB00624
(Testosterone) 		Escherichia coli ANDROGEN RECEPTOR PF00104
(Hormone_recep) 		12 LEU A 701
LEU A 704
ASN A 705
LEU A 707
GLN A 711
MET A 742
MET A 745
VAL A 746
MET A 749
ARG A 752
THR A 877
MET A 895
 TES A1000
4ABZ_A_T1CA1209 4abz T1C

DB00560
(Tigecycline) 		Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR CLASS D 		PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C) 		14 LEU A  60
HIS A  64
SER A  67
ASN A  82
PHE A  86
HIS A 100
ARG A 104
PRO A 105
GLN A 109
THR A 112
GLN A 116
LEU A 131
ILE A 134
SER A 138
 T1C A1209
4AC0_A_MIYA1204 4ac0 MIY

DB01017
(Minocycline) 		Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR PROTEIN
CLASS B FROM
TRANSPOSON TN1 0 		PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C) 		12 HIS A  64
PHE A  67
ASN A  82
PHE A  86
HIS A 100
ARG A 104
PRO A 105
GLN A 109
THR A 112
LEU A 113
GLN A 116
LEU A 131
 MIY A1204
4AQ7_A_LEUA902 4aq7 LEU

DB00149
(L-
Leucine) 		Escherichia coli LEUCINE--TRNA LIGASE PF00133
(tRNA-synt_1)
PF08264
(tRNA-synt_1_2)
PF13603
(tRNA-synt_1) 		7 MET A  40
LEU A  41
ASP A  80
SER A 496
GLU A 532
HIS A 533
HIS A 537
 LEU A 902
4AQ7_D_LEUD902 4aq7 LEU

DB00149
(L-
Leucine) 		Escherichia coli LEUCINE--TRNA LIGASE None 9 MET D  40
LEU D  41
ASP D  80
SER D 496
TYR D 499
TYR D 527
GLU D 532
HIS D 533
HIS D 537
 LEU D 902
4ARC_A_LEUA1001 4arc LEU

DB00149
(L-
Leucine) 		Escherichia coli LEUCINE--TRNA LIGASE PF00133
(tRNA-synt_1)
PF08264
(tRNA-synt_1)
PF13603
(Anticodon_1) 		7 LEU A  41
TYR A  43
ASP A  80
SER A 496
TYR A 527
HIS A 533
HIS A 537
 LEU A1001
4AX8_A_SAMA1474 4ax8 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli WBDD PF00069
(Methyltransf_31)
PF13847
(Pkinase) 		18 TYR A  16
GLN A  17
ARG A  36
GLY A  61
ALA A  63
ILE A  81
ASP A  82
PHE A  83
GLN A  84
ASN A  87
ARG A 109
ILE A 110
GLU A 111
LEU A 128
SER A 129
VAL A 130
HIS A 133
ILE A 134
 SAM A1474
4AZS_A_SAMA1475 4azs SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli METHYLTRANSFERASE
WBDD 		PF00069
(Methyltransf_31)
PF13847
(Pkinase) 		15 TYR A  16
GLN A  17
ARG A  36
GLY A  61
ALA A  63
ASP A  82
PHE A  83
GLN A  84
ASN A  87
ARG A 109
ILE A 110
GLU A 111
LEU A 128
VAL A 130
HIS A 133
 SAM A1475
4AZT_A_SAMA1472 4azt SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli METHYLTRANSFERASE
WBDD 		PF00069
(Methyltransf_31)
PF13847
(Pkinase) 		15 TYR A  16
GLN A  17
ARG A  36
GLY A  61
ALA A  63
ASP A  82
PHE A  83
GLN A  84
ASN A  87
ARG A 109
ILE A 110
GLU A 111
LEU A 128
VAL A 130
ILE A 134
 SAM A1472
4AZV_A_SAMA1474 4azv SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli WBDD PF00069
(Methyltransf_31)
PF13847
(Pkinase) 		18 TYR A  16
GLN A  17
ARG A  36
GLY A  61
ALA A  63
ILE A  81
ASP A  82
PHE A  83
GLN A  84
ASN A  87
ARG A 109
ILE A 110
GLU A 111
LEU A 128
SER A 129
VAL A 130
HIS A 133
ILE A 134
 SAM A1474
4AZW_A_SAMA1451 4azw SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli WBDD PF00069
(Methyltransf_31)
PF13847
(Pkinase) 		14 TYR A  16
GLN A  17
ARG A  36
GLY A  61
ALA A  63
ASP A  82
PHE A  83
GLN A  84
ASN A  87
ARG A 109
ILE A 110
GLU A 111
LEU A 128
VAL A 130
 SAM A1451
4B17_A_SAMA1358 4b17 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE M 		PF01728
(FtsJ) 		13 SER A 186
SER A 188
GLY A 219
CYS A 221
PRO A 222
GLY A 223
GLY A 224
TRP A 225
ASP A 240
ASP A 260
ASP A 277
MET A 278
VAL A 279
 SAM A1358
4B3A_A_TACA222 4b3a TAC

DB00759
(Tetracycline) 		Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR PROTEIN
CLASS D 		PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C) 		12 LEU A  60
HIS A  64
SER A  67
ASN A  82
PHE A  86
ARG A 104
PRO A 105
GLN A 109
VAL A 113
GLN A 116
ILE A 134
SER A 138
 TAC A 222
4BLV_A_SAMA1281 4blv SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE J 		PF04378
(RsmJ) 		18 LEU A   2
TYR A   4
HIS A   6
LYS A  18
HIS A  19
ASP A  40
HIS A  42
GLY A  44
GLY A  99
SER A 100
GLU A 118
LEU A 119
HIS A 120
ASP A 123
ASP A 143
GLY A 144
ASP A 164
PRO A 166
 SAM A1281
4BLV_B_SAMB1281 4blv SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE J 		None 14 LYS B  18
HIS B  19
ASP B  40
HIS B  42
GLY B  44
TYR B  48
GLY B  99
SER B 100
GLU B 118
LEU B 119
HIS B 120
ASP B 143
GLY B 144
ASP B 164
 SAM B1281
4BWL_C_MN9C1297 4bwl MN9

DB00141
(N-
Acetyl-
D-
glucosamine) 		Escherichia coli N-ACETYLNEURAMINATE
LYASE 		PF00701
(DHDPS) 		10 ILE C 139
LEU C 142
THR C 167
GLY C 189
TYR C 190
ASP C 191
GLU C 192
GLY C 207
SER C 208
PHE C 252
 MN9 C1297
4CLA_A_CLMA221 4cla CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli TYPE III
CHLORAMPHENICOL
ACETYLTRANSFERASE 		PF00302
(CAT) 		11 GLN A  92
THR A  94
ALA A 105
LEU A 134
PHE A 135
ASN A 146
SER A 148
PHE A 160
VAL A 162
TYR A 168
ILE A 172
 CLM A 221
4DAJ_A_0HKA2000 4daj 0HK

DB01409
(Tiotropium) 		Escherichia virus
T4;
Rattus norvegicus 		MUSCARINIC
ACETYLCHOLINE
RECEPTOR M3,
LYSOZYME 		PF00001
(7tm_1)
PF00959
(Phage_lysozyme) 		13 ASP A 147
TYR A 148
SER A 151
ASN A 152
TRP A 199
THR A 231
ALA A 238
PHE A 239
TRP A 503
TYR A 506
ASN A 507
TYR A 529
CYS A 532
 0HK A2000
4DAJ_B_0HKB2000 4daj 0HK

DB01409
(Tiotropium) 		Escherichia virus
T4;
Rattus norvegicus 		MUSCARINIC
ACETYLCHOLINE
RECEPTOR M3,
LYSOZYME 		no annotation 15 ASP B 147
TYR B 148
SER B 151
ASN B 152
TRP B 199
LEU B 225
THR B 231
THR B 234
ALA B 238
PHE B 239
TRP B 503
TYR B 506
ASN B 507
TYR B 529
CYS B 532
 0HK B2000
4DAJ_C_0HKC2000 4daj 0HK

DB01409
(Tiotropium) 		Escherichia virus
T4;
Rattus norvegicus 		MUSCARINIC
ACETYLCHOLINE
RECEPTOR M3,
LYSOZYME 		no annotation 13 ASP C 147
TYR C 148
SER C 151
ASN C 152
TRP C 199
THR C 231
THR C 234
PHE C 239
TRP C 503
TYR C 506
ASN C 507
TYR C 529
CYS C 532
 0HK C2000
4DAJ_D_0HKD2000 4daj 0HK

DB01409
(Tiotropium) 		Escherichia virus
T4;
Rattus norvegicus 		MUSCARINIC
ACETYLCHOLINE
RECEPTOR M3,
LYSOZYME 		no annotation 13 ASP D 147
TYR D 148
SER D 151
ASN D 152
TRP D 199
THR D 231
THR D 234
PHE D 239
TRP D 503
TYR D 506
ASN D 507
TYR D 529
CYS D 532
 0HK D2000
4DCM_A_SAMA401 4dcm SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE G 		PF05175
(MTS) 		11 PHE A 208
ALA A 217
ASP A 234
GLY A 236
GLY A 238
ILE A 242
ASP A 259
GLU A 260
ASN A 289
ASN A 305
PRO A 307
 SAM A 401
4DFR_A_MTXA161 4dfr MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		14 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
LYS A  32
THR A  46
SER A  49
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 MTX A 161
4DFR_B_MTXB162 4dfr MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		no annotation 12 ILE B   5
ALA B   7
ASP B  27
LEU B  28
LYS B  32
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
ARG B  57
ILE B  94
TYR B 100
THR B 113
 MTX B 162
4DX5_B_MIYB1103 4dx5 MIY

DB01017
(Minocycline) 		Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B 		no annotation 13 SER B  48
GLN B 151
PHE B 178
GLY B 179
SER B 180
GLU B 273
ASN B 274
ASP B 276
ILE B 277
ALA B 279
VAL B 612
PHE B 615
ARG B 620
 MIY B1103
4DX7_A_DM2A1105 4dx7 DM2

DB00445
(Epirubicin)
DB00997
(Doxorubicin) 		Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B 		PF00873
(ACR_tran) 		11 MET A 575
PHE A 617
THR A 676
GLY A 679
ASP A 681
ARG A 717
ASN A 719
ARG A 815
GLU A 826
GLN A 830
MET A 862
 DM2 A1105
4DX7_A_DM2A1106 4dx7 DM2

DB00445
(Epirubicin)
DB00997
(Doxorubicin) 		Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B 		PF00873
(ACR_tran) 		11 SER A 134
MET A 575
PHE A 617
PHE A 664
PHE A 666
ASN A 667
LEU A 668
THR A 676
ALA A 677
ARG A 717
GLN A 830
 DM2 A1106
4DX7_B_DM2B1104 4dx7 DM2

DB00445
(Epirubicin)
DB00997
(Doxorubicin) 		Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B 		no annotation 8 SER B  46
GLN B  89
GLU B 130
GLN B 176
PHE B 178
ILE B 277
VAL B 612
PHE B 615
 DM2 B1104
4EF3_A_CUA1001 4ef3 CU

DB09130
(Copper) 		Escherichia coli BLUE COPPER OXIDASE
CUEO 		PF00394
(Cu-oxidase_2)
PF07731
(Cu-oxidase_3)
PF07732
(Cu-oxidase) 		4 HIS A 443
CYS A 500
HIS A 505
MET A 510
  CU A1001
4EF3_A_CUA1002 4ef3 CU

DB09130
(Copper) 		Escherichia coli BLUE COPPER OXIDASE
CUEO 		PF00394
(Cu-oxidase_2)
PF07731
(Cu-oxidase_3)
PF07732
(Cu-oxidase) 		4 HIS A 103
HIS A 141
HIS A 446
HIS A 501
  CU A1002
4EF3_A_CUA1003 4ef3 CU

DB09130
(Copper) 		Escherichia coli BLUE COPPER OXIDASE
CUEO 		PF00394
(Cu-oxidase_2)
PF07731
(Cu-oxidase_3)
PF07732
(Cu-oxidase) 		5 HIS A 101
HIS A 143
HIS A 446
HIS A 448
HIS A 499
  CU A1003
4EF3_A_CUA1004 4ef3 CU

DB09130
(Copper) 		Escherichia coli BLUE COPPER OXIDASE
CUEO 		PF00394
(Cu-oxidase_2)
PF07731
(Cu-oxidase_3)
PF07732
(Cu-oxidase) 		4 HIS A 101
HIS A 103
HIS A 446
HIS A 448
  CU A1004
4EJ1_A_FOLA201 4ej1 FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		16 ILE A   5
ALA A   7
GLU A  17
ASP A  27
LEU A  28
TRP A  30
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
4EJ1_B_FOLB201 4ej1 FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		None 14 ILE B   5
ALA B   7
GLU B  17
ASP B  27
LEU B  28
TRP B  30
PHE B  31
LYS B  32
THR B  46
ILE B  50
LEU B  54
ARG B  57
TYR B 100
THR B 113
 FOL B 201
4FHB_A_FOLA201 4fhb FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		14 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
4GCP_A_AICA401 4gcp AIC

DB00415
(Ampicillin) 		Escherichia coli OUTER MEMBRANE
PROTEIN F 		PF00267
(Porin_1) 		9 TYR A  22
TYR A  32
GLY A  33
PHE A 118
ASP A 121
TYR A 124
SER A 125
ARG A 167
ARG A 168
 AIC A 401
4GCP_B_AICB401 4gcp AIC

DB00415
(Ampicillin) 		Escherichia coli OUTER MEMBRANE
PROTEIN F 		no annotation 9 TYR B  22
TYR B  32
GLY B  33
PHE B 118
ASP B 121
TYR B 124
SER B 125
ARG B 167
ARG B 168
 AIC B 401
4GH8_A_MTXA201 4gh8 MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		15 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  28
LEU A  29
LYS A  33
SER A  50
ILE A  51
PRO A  52
ASN A  55
LEU A  58
ARG A  61
ILE A  98
TYR A 104
THR A 117
 MTX A 201
4GH8_B_MTXB201 4gh8 MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		no annotation 14 ILE B   5
ALA B   7
MET B  20
ASP B  28
LEU B  29
LYS B  33
SER B  50
ILE B  51
PRO B  52
ASN B  55
ARG B  61
ILE B  98
TYR B 104
THR B 117
 MTX B 201
4HTF_A_ACTA303 4htf ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli S-ADENOSYLMETHIONINE
-DEPENDENT
METHYLTRANSFERASE 		PF13847
(Methyltransf_31) 		3 TYR A 150
HIS A 158
ARG A 246
 ACT A 303
4HTF_A_SAMA301 4htf SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli S-ADENOSYLMETHIONINE
-DEPENDENT
METHYLTRANSFERASE 		PF13847
(Methyltransf_31) 		13 ARG A  26
GLY A  52
GLY A  53
GLY A  54
ASP A  73
LEU A  74
SER A  75
ALA A 102
GLN A 103
HIS A 119
VAL A 121
TRP A 124
VAL A 125
 SAM A 301
4HTF_B_SAMB301 4htf SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli S-ADENOSYLMETHIONINE
-DEPENDENT
METHYLTRANSFERASE 		PF13847
(Methyltransf_31) 		13 ARG B  26
GLY B  52
GLY B  53
GLY B  54
ASP B  73
LEU B  74
SER B  75
ALA B 102
GLN B 103
HIS B 119
VAL B 121
TRP B 124
VAL B 125
 SAM B 301
4I13_A_FOLA201 4i13 FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli;
Lama glama 		DIHYDROFOLATE
REDUCTASE;
PROTEIN CA1697
(NANOBODY) 		PF00186
(DHFR_1)
PF07686
(V-set) 		16 ILE A   5
ALA A   7
GLU A  17
ASP A  27
LEU A  28
TRP A  30
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
ARG B 104
THR A 113
 FOL A 201
4I1N_A_FOLA201 4i1n FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		11 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
TRP A  30
PHE A  31
LYS A  32
LEU A  54
ARG A  57
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
4IAQ_A_2GMA2001 4iaq 2GM

DB00320
(Dihydroergotamine) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		CHIMERA PROTEIN OF
HUMAN
5-HYDROXYTRYPTAMINE
RECEPTOR 1B AND E.
COLI SOLUBLE
CYTOCHROME B562 		PF00001
(7tm_1)
PF07361
(Cytochrom_B562) 		18 TRP A 125
LEU A 126
ASP A 129
ILE A 130
CYS A 133
THR A 134
VAL A 200
VAL A 201
SER A 212
ALA A 216
TRP A 327
PHE A 330
PHE A 331
MET A 337
LEU A 348
PHE A 351
ASP A 352
THR A 355
 2GM A2001
4IAR_A_ERMA2001 4iar ERM

DB00696
(Ergotamine) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		CHIMERA PROTEIN OF
HUMAN
5-HYDROXYTRYPTAMINE
RECEPTOR 1B AND E.
COLI SOLUBLE
CYTOCHROME B562 		PF00001
(7tm_1)
PF07361
(Cytochrom_B562) 		19 TRP A 125
LEU A 126
ASP A 129
ILE A 130
CYS A 133
THR A 134
VAL A 200
VAL A 201
SER A 212
ALA A 216
TRP A 327
PHE A 330
PHE A 331
SER A 334
MET A 337
LEU A 348
PHE A 351
ASP A 352
THR A 355
 ERM A2001
4IB4_A_ERMA2001 4ib4 ERM

DB00696
(Ergotamine) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		CHIMERA PROTEIN OF
HUMAN
5-HYDROXYTRYPTAMINE
RECEPTOR 2B AND E.
COLI SOLUBLE
CYTOCHROME B562 		PF00001
(7tm_1)
PF07361
(Cytochrom_B562) 		19 LEU A 132
ASP A 135
VAL A 136
SER A 139
THR A 140
VAL A 208
LEU A 209
LYS A 211
MET A 218
ALA A 225
TRP A 337
PHE A 340
PHE A 341
ASN A 344
LEU A 347
VAL A 348
GLN A 359
LEU A 362
VAL A 366
 ERM A2001
4KJJ_A_FOLA201 4kjj FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		16 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
ALA A  29
TRP A  30
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
4KJK_A_FOLA201 4kjk FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		16 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
TRP A  30
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
4KJL_A_FOLA201 4kjl FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		16 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  28
LEU A  29
TRP A  31
PHE A  32
LYS A  33
THR A  47
ILE A  51
ARG A  53
LEU A  55
ARG A  58
ILE A  95
TYR A 101
THR A 114
 FOL A 201
4KMU_C_RFPC1401 4kmu RFP

DB01045
(Rifampicin) 		Escherichia coli DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE SUBUNIT
BETA 		PF00562
(RNA_pol_Rpb2_6)
PF04560
(RNA_pol_Rpb2_7)
PF04561
(RNA_pol_Rpb2_2)
PF04563
(RNA_pol_Rpb2_1)
PF04565
(RNA_pol_Rpb2_3)
PF10385
(RNA_pol_Rpb2_45) 		14 GLN C 510
LEU C 511
GLN C 513
PHE C 514
ASP C 516
HIS C 526
ARG C 529
SER C 531
LEU C 533
ARG C 540
PRO C 564
ASN C 568
ILE C 572
ARG C 687
 RFP C1401
4KMU_H_RFPH1401 4kmu RFP

DB01045
(Rifampicin) 		Escherichia coli DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE SUBUNIT
BETA;
RNA POLYMERASE SIGMA
FACTOR RPOD 		no annotation 14 GLN H 510
GLN H 513
ASP Y 514
PHE H 514
ASP H 516
HIS H 526
ARG H 529
SER H 531
LEU H 533
ARG H 540
PRO H 564
ASN H 568
ILE H 572
ARG H 687
 RFP H1401
4LDO_A_ALEA1402 4ldo ALE

DB00668
(Epinephrine) 		Escherichia virus
T4;
Homo sapiens 		LYSOZYME, BETA-2
ADRENERGIC RECEPTOR 		PF00001
(7tm_1)
PF00959
(Phage_lysozyme) 		10 ASP A1113
VAL A1114
VAL A1117
PHE A1193
SER A1203
SER A1207
PHE A1289
ASN A1293
ASN A1312
TYR A1316
 ALE A1402
4LHM_A_AZZA510 4lhm AZZ

DB00495
(Zidovudine) 		Escherichia coli THYMIDINE
PHOSPHORYLASE 		PF00591
(Glycos_transf_3)
PF02885
(Glycos_trans_3N)
PF07831
(PYNP_C) 		11 THR A  87
LEU A 117
TYR A 168
ARG A 171
VAL A 177
ILE A 183
SER A 186
LYS A 190
PHE A 210
MET A 211
LEU A 220
 AZZ A 510
4M5M_A_DX4A401 4m5m DX4

DB00352
(Tioguanine) 		Escherichia coli 2-AMINO-4-HYDROXY-6-
HYDROXYMETHYLDIHYDRO
PTERIDINE
PYROPHOSPHOKINASE 		PF01288
(HPPK) 		8 GLY A   8
THR A  42
LEU A  45
TYR A  53
ASN A  55
TRP A  89
ARG A  92
PHE A 123
 DX4 A 401
4MJQ_A_27RA401 4mjq 27R

DB00963
(Bromfenac) 		Escherichia coli DNA POLYMERASE III
SUBUNIT BETA 		PF00712
(DNA_pol3_beta)
PF02767
(DNA_pol3_beta_2)
PF02768
(DNA_pol3_beta_3) 		5 ARG A 152
TYR A 154
THR A 172
PRO A 242
VAL A 247
 27R A 401
4MJR_A_0LAA404 4mjr 0LA

DB00821
(Carprofen) 		Escherichia coli DNA POLYMERASE III
SUBUNIT BETA 		PF00712
(DNA_pol3_beta)
PF02767
(DNA_pol3_beta_2)
PF02768
(DNA_pol3_beta_3) 		9 ARG A 152
TYR A 154
THR A 172
GLY A 174
LEU A 177
PRO A 242
VAL A 247
VAL A 360
MET A 362
 0LA A 404
4NC3_A_ERMA1202 4nc3 ERM

DB00696
(Ergotamine) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		CHIMERA PROTEIN OF
HUMAN
5-HYDROXYTRYPTAMINE
RECEPTOR 2B AND E.
COLI SOLUBLE
CYTOCHROME B562 		PF00001
(7tm_1)
PF07361
(Cytochrom_B562) 		18 LEU A 132
ASP A 135
VAL A 136
SER A 139
THR A 140
VAL A 208
LEU A 209
PHE A 217
MET A 218
ALA A 225
TRP A 337
PHE A 340
ASN A 344
LEU A 347
GLN A 359
LEU A 362
GLU A 363
VAL A 366
 ERM A1202
4NX6_A_FOLA201 4nx6 FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		16 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
TRP A  30
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
4NX7_A_FOLA202 4nx7 FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		16 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
TRP A  30
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 202
4P3Q_A_FOLA201 4p3q FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		17 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
TRP A  30
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
PRO A  55
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
4P3R_A_FOLA201 4p3r FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		15 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
TRP A  30
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
4P66_A_MTXA201 4p66 MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		11 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
LYS A  32
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 MTX A 201
4P68_A_MTXA201 4p68 MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		11 ILE A   5
MET A  20
ASP A  27
PHE A  31
LYS A  32
SER A  49
ILE A  50
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 MTX A 201
4P7N_A_GCSA701 4p7n GCS

DB01296
(Glucosamine) 		Escherichia coli POLY-BETA-1,6-N-ACET
YL-D-GLUCOSAMINE
N-DEACETYLASE 		PF14883
(GHL13) 		5 TYR A 432
ASP A 466
MET A 572
TRP A 613
TYR A 645
 GCS A 701
4P7N_A_GCSA702 4p7n GCS

DB01296
(Glucosamine) 		Escherichia coli POLY-BETA-1,6-N-ACET
YL-D-GLUCOSAMINE
N-DEACETYLASE 		PF14883
(GHL13) 		3 ASP A 472
TYR A 473
TRP A 552
 GCS A 702
4P7N_A_GCSA703 4p7n GCS

DB01296
(Glucosamine) 		Escherichia coli POLY-BETA-1,6-N-ACET
YL-D-GLUCOSAMINE
N-DEACETYLASE 		PF14883
(GHL13) 		4 LEU A 542
PHE A 553
LEU A 575
GLU A 576
 GCS A 703
4PL1_A_SAMA401 4pl1 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli DUAL-SPECIFICITY RNA
METHYLTRANSFERASE
RLMN 		PF04055
(Radical_SAM) 		11 PHE A 131
MET A 176
GLU A 180
PRO A 181
SER A 211
SER A 233
HIS A 235
GLU A 278
ILE A 309
TRP A 311
ASN A 312
 SAM A 401
4PL1_B_SAMB401 4pl1 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli DUAL-SPECIFICITY RNA
METHYLTRANSFERASE
RLMN 		None 10 CYS B 132
MET B 176
GLU B 180
PRO B 181
SER B 211
SER B 233
HIS B 235
GLU B 278
TRP B 311
ASN B 312
 SAM B 401
4PSS_A_FOLA201 4pss FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		16 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
ALA A  29
TRP A  30
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
4PST_A_FOLA201 4pst FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		15 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
TRP A  30
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
4PSY_A_FOLA201 4psy FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		14 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
ALA A  29
TRP A  30
PHE A  31
LYS A  32
ILE A  50
LEU A  54
ARG A  57
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
4PTH_A_FOLA201 4pth FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		15 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
TRP A  30
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
4PTJ_A_FOLA201 4ptj FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		15 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
TRP A  30
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
4QLE_A_FOLA201 4qle FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		13 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
4QLE_B_FOLB201 4qle FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		None 11 ILE B   5
ALA B   7
ASP B  27
LEU B  28
LYS B  32
SER B  49
ILE B  50
LEU B  54
ARG B  57
TYR B 100
THR B 113
 FOL B 201
4QLF_A_FOLA201 4qlf FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		11 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
PHE A  31
LYS A  32
ILE A  50
LEU A  54
ARG A  57
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
4QLG_A_FOLA201 4qlg FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		12 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
PHE A  31
LYS A  32
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
4QLG_B_FOLB201 4qlg FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		None 12 ILE B   5
ALA B   7
ASP B  27
LEU B  28
PHE B  31
LYS B  32
THR B  46
ILE B  50
LEU B  54
ARG B  57
TYR B 100
THR B 113
 FOL B 201
4R29_A_SAMA301 4r29 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli UNCHARACTERIZED
PROTEIN 		None 13 ARG A  89
ALA A  92
SER A  98
ARG A 107
GLY A 110
GLN A 111
GLU A 191
ALA A 195
MET A 198
GLY A 199
PHE A 202
TYR A 204
TYR A 212
 SAM A 301
4R29_B_SAMB301 4r29 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli UNCHARACTERIZED
PROTEIN 		None 12 ARG B  89
ALA B  92
SER B  98
ARG B 107
GLY B 110
GLU B 191
ALA B 195
MET B 198
GLY B 199
PHE B 202
TYR B 204
TYR B 212
 SAM B 301
4R29_C_SAMC301 4r29 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli UNCHARACTERIZED
PROTEIN 		None 13 ARG C  89
ALA C  92
SER C  98
ARG C 107
GLY C 110
GLU C 191
ALA C 195
MET C 198
GLY C 199
PHE C 202
TYR C 204
GLU C 208
TYR C 212
 SAM C 301
4R29_D_SAMD301 4r29 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli UNCHARACTERIZED
PROTEIN 		None 15 ARG D  89
ALA D  92
SER D  98
ARG D 107
GLY D 110
GLN D 111
GLU D 191
ILE D 194
ALA D 195
MET D 198
GLY D 199
PHE D 202
TYR D 204
GLU D 208
TYR D 212
 SAM D 301
4RGC_A_FOLA201 4rgc FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		12 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
PHE A  31
LYS A  32
ILE A  50
LEU A  54
ARG A  57
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
4RP8_A_ASCA501 4rp8 ASC

DB00126
(Vitamin
C) 		Escherichia coli ASCORBATE-SPECIFIC
PERMEASE IIC
COMPONENT ULAA 		PF03611
(EIIC-GAT) 		11 THR A  86
TYR A  87
HIS A 135
ILE A 136
GLN A 139
HIS A 194
GLN A 195
ASP A 314
ALA A 316
PHE A 362
MET A 410
 ASC A 501
4RP8_C_ASCC501 4rp8 ASC

DB00126
(Vitamin
C) 		Escherichia coli ASCORBATE-SPECIFIC
PERMEASE IIC
COMPONENT ULAA 		None 15 LEU C  55
SER C  59
THR C  86
TYR C  87
HIS C 135
ILE C 136
GLN C 139
HIS C 194
GLN C 195
ILE C 283
ASP C 314
ALA C 316
ILE C 358
PHE C 362
MET C 410
 ASC C 501
4RP9_A_ASCA501 4rp9 ASC

DB00126
(Vitamin
C) 		Escherichia coli ASCORBATE-SPECIFIC
PERMEASE IIC
COMPONENT ULAA 		PF03611
(EIIC-GAT) 		13 THR A  86
TYR A  87
HIS A 135
ILE A 136
GLN A 139
HIS A 194
GLN A 195
ASP A 314
CYS A 315
ALA A 316
ILE A 358
PHE A 362
MET A 410
 ASC A 501
4RTM_A_SAMA301 4rtm SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli DNA ADENINE
METHYLASE 		PF02086
(MethyltransfD12) 		16 TRP A  10
GLY A  12
GLY A  13
PHE A  35
GLY A  37
ALA A  38
SER A  40
ASP A  54
ILE A  55
ASN A  56
SER A 164
TYR A 165
ASP A 181
PRO A 183
TYR A 184
GLN A 205
 SAM A 301
4RTP_A_SAMA301 4rtp SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli DNA ADENINE
METHYLASE 		PF02086
(MethyltransfD12) 		13 TRP A  10
PHE A  35
GLY A  37
ALA A  38
SER A  40
ASP A  54
ILE A  55
ASN A  56
SER A 164
TYR A 165
ASP A 181
PRO A 183
GLN A 205
 SAM A 301
4RTR_A_SAMA301 4rtr SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli DNA ADENINE
METHYLASE 		PF02086
(MethyltransfD12) 		11 TRP A  10
GLY A  12
PHE A  35
ASP A  54
ILE A  55
ASN A  56
SER A 164
TYR A 165
ASP A 181
PRO A 183
TYR A 184
 SAM A 301
4RTS_A_SAMA301 4rts SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli DNA ADENINE
METHYLASE 		PF02086
(MethyltransfD12) 		12 TRP A  10
GLY A  12
PHE A  35
GLY A  37
ASP A  54
ILE A  55
ASN A  56
SER A 164
TYR A 165
ASP A 181
PRO A 183
TYR A 184
 SAM A 301
4S2V_A_ACTA229 4s2v ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli RNA
PYROPHOSPHOHYDROLASE 		PF00293
(NUDIX) 		3 TRP A 131
LYS A 150
ALA A 153
 ACT A 229
4U14_A_0HKA2000 4u14 0HK

DB01409
(Tiotropium) 		Escherichia virus
T4;
Rattus norvegicus 		MUSCARINIC
ACETYLCHOLINE
RECEPTOR
M3,ENDOLYSIN,MUSCARI
NIC ACETYLCHOLINE
RECEPTOR M3 		PF00001
(7tm_1)
PF00959
(Phage_lysozyme) 		16 ILE A 116
ASP A 147
TYR A 148
SER A 151
ASN A 152
TRP A 199
LEU A 225
THR A 231
ALA A 235
ALA A 238
PHE A 239
TRP A 503
TYR A 506
ASN A 507
TYR A 529
CYS A 532
 0HK A2000
4U15_A_0HKA2001 4u15 0HK

DB01409
(Tiotropium) 		Escherichia virus
T4;
Rattus norvegicus 		MUSCARINIC
ACETYLCHOLINE
RECEPTOR
M3,LYSOZYME,MUSCARIN
IC ACETYLCHOLINE
RECEPTOR M3 		PF00001
(7tm_1)
PF00959
(Phage_lysozyme) 		15 ASP A 147
TYR A 148
SER A 151
ASN A 152
TRP A 199
THR A 231
THR A 234
ALA A 235
ALA A 238
PHE A 239
TRP A 503
TYR A 506
ASN A 507
TYR A 529
CYS A 532
 0HK A2001
4U15_B_0HKB1201 4u15 0HK

DB01409
(Tiotropium) 		Escherichia virus
T4;
Rattus norvegicus 		MUSCARINIC
ACETYLCHOLINE
RECEPTOR
M3,LYSOZYME,MUSCARIN
IC ACETYLCHOLINE
RECEPTOR M3 		no annotation 16 ASP B 147
TYR B 148
SER B 151
ASN B 152
TRP B 199
LEU B 225
THR B 231
THR B 234
ALA B 235
ALA B 238
PHE B 239
TRP B 503
TYR B 506
ASN B 507
TYR B 529
CYS B 532
 0HK B1201
4U8V_B_MIYB1103 4u8v MIY

DB01017
(Minocycline) 		Escherichia coli MULTIDRUG EFFLUX
PUMP SUBUNIT ACRB 		no annotation 14 GLN B 151
LEU B 177
PHE B 178
GLY B 179
SER B 180
GLU B 273
ASN B 274
ASP B 276
ILE B 277
ALA B 279
PHE B 610
VAL B 612
PHE B 615
ARG B 620
 MIY B1103
4U8Y_B_MIYB1102 4u8y MIY

DB01017
(Minocycline) 		Escherichia coli MULTIDRUG EFFLUX
PUMP SUBUNIT ACRB 		no annotation 12 PHE B 178
GLY B 179
SER B 180
GLU B 273
ASN B 274
ASP B 276
ILE B 277
ALA B 279
PHE B 610
VAL B 612
PHE B 615
ARG B 620
 MIY B1102
4U95_B_MIYB1102 4u95 MIY

DB01017
(Minocycline) 		Escherichia coli MULTIDRUG EFFLUX
PUMP SUBUNIT ACRB 		no annotation 12 SER B  48
PHE B 178
GLY B 179
SER B 180
GLU B 273
ASN B 274
ASP B 276
ILE B 277
ALA B 279
VAL B 612
PHE B 615
ARG B 620
 MIY B1102
4UW0_A_SAMA1506 4uw0 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli WBDD PF00069
(Methyltransf_31)
PF13847
(Pkinase) 		14 TYR A  16
GLN A  17
ARG A  36
GLY A  61
ALA A  63
ASP A  82
PHE A  83
GLN A  84
ARG A 109
ILE A 110
GLU A 111
LEU A 128
VAL A 130
ILE A 134
 SAM A1506
4UY8_7_TRP71002 4uy8 TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Escherichia coli TRYPTOPHANASE PF08053
(Tna_leader) 		4 ILE 7  15
ASN 7  17
ILE 7  19
VAL 7  20
 TRP 71002
4V2G_B_CTCB222 4v2g CTC

DB09093
(Chlortetracycline) 		Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR PROTEIN
CLASS D 		None
PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C) 		14 HIS B  64
SER B  67
ASN B  82
PHE B  86
HIS B 100
ARG B 104
PRO B 105
THR B 112
VAL B 113
GLN B 116
ILE B 134
SER B 138
LEU A 170
LEU A 174
 CTC B 222
4WQ4_A_ACTA403 4wq4 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli TRNA N6-ADENOSINE
THREONYLCARBAMOYLTRA
NSFERASE 		PF00814
(Peptidase_M22) 		3 VAL A  85
LEU A  89
VAL A 325
 ACT A 403
4WQ4_B_ACTB403 4wq4 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli TRNA N6-ADENOSINE
THREONYLCARBAMOYLTRA
NSFERASE 		None 3 ARG B  49
ASP B  50
ARG B  53
 ACT B 403
4WQ5_B_ACTB404 4wq5 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli TRNA N6-ADENOSINE
THREONYLCARBAMOYLTRA
NSFERASE 		None 3 TYR B  30
ARG B  53
LYS B  54
 ACT B 404
4X5F_A_FOLA201 4x5f FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		13 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
4X5F_B_FOLB201 4x5f FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		None 13 ILE B   5
ALA B   7
ASP B  27
LEU B  28
PHE B  31
LYS B  32
THR B  46
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
ARG B  57
TYR B 100
THR B 113
 FOL B 201
4X5G_A_FOLA201 4x5g FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		13 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
4X5G_B_FOLB201 4x5g FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		None 13 ILE B   5
ALA B   7
ASP B  27
LEU B  28
LYS B  32
THR B  46
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
ARG B  57
ILE B  94
TYR B 100
THR B 113
 FOL B 201
4X5H_A_FOLA201 4x5h FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		14 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
TRP A  30
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
4X5I_A_FOLA201 4x5i FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		15 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
TRP A  30
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
4X5J_A_FOLA201 4x5j FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		13 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
TRP A  30
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
ARG A  52
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
4Z2C_F_MFXF101 4z2c MFX

DB00218
(Moxifloxacin) 		Escherichia coli;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B;
SYMMETRIZED E-SITE
DNA 		PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		4 SER B  81
ARG C 456
GLY C 457
GLU C 475
 MFX F 101
4Z2C_H_MFXH101 4z2c MFX

DB00218
(Moxifloxacin) 		Escherichia coli;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B;
SYMMETRIZED E-SITE
DNA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
no annotation 		4 SER A  81
ARG D 456
GLY D 457
GLU D 475
 MFX H 101
4Z2D_F_LFXF102 4z2d LFX

DB01137
(Levofloxacin)
DB01165
(Ofloxacin) 		Escherichia coli;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B;
SYMMETRIZED E-SITE
DNA 		PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		4 SER B  81
ARG C 456
GLY C 457
GLU C 475
 LFX F 102
4Z2D_H_LFXH101 4z2d LFX

DB01137
(Levofloxacin)
DB01165
(Ofloxacin) 		Escherichia coli;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B;
SYMMETRIZED E-SITE
DNA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
no annotation 		4 SER A  81
ARG D 456
GLY D 457
GLU D 475
 LFX H 101
4Z2E_F_TR6F101 4z2e TR6

DB00685
(Trovafloxacin) 		Escherichia coli;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B;
SYMMETRIZED E-SITE
DNA 		PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		5 SER B  81
GLY C 434
ARG C 456
GLY C 457
GLU C 475
 TR6 F 101
4Z2E_H_TR6H101 4z2e TR6

DB00685
(Trovafloxacin) 		Escherichia coli;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B;
SYMMETRIZED E-SITE
DNA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
no annotation 		5 SER A  81
GLY D 434
ARG D 456
GLY D 457
GLU D 475
 TR6 H 101
4Z3O_F_MFXF101 4z3o MFX

DB00218
(Moxifloxacin) 		Escherichia coli;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT
B,PARE30-PARC55
FUSED TOPO IV FROM
S. PNEUMONIAE;
E-SITE DNA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		5 ARG B 456
GLY B 457
GLU B 475
SER B1079
ARG A1117
 MFX F 101
4Z3O_H_MFXH101 4z3o MFX

DB00218
(Moxifloxacin) 		Escherichia coli;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT
B,PARE30-PARC55
FUSED TOPO IV FROM
S. PNEUMONIAE;
E-SITE DNA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		3 ARG A 456
GLU A 475
SER A1079
 MFX H 101
4Z53_F_TR6F101 4z53 TR6

DB00685
(Trovafloxacin) 		Escherichia coli;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT B,DNA
TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT A;
E-SITE DNA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		6 GLY A 434
ASP A 435
ARG A 456
GLY A 457
SER A1079
ARG B1117
 TR6 F 101
4Z53_H_TR6H101 4z53 TR6

DB00685
(Trovafloxacin) 		Escherichia coli;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT B,DNA
TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT A;
E-SITE DNA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		7 GLY B 434
ASP B 435
ARG B 456
GLY B 457
GLU B 475
SER B1079
ARG A1117
 TR6 H 101
4ZJL_A_ERYA1101 4zjl ERY

DB00199
(Erythromycin) 		Escherichia coli MULTIDRUG EFFLUX
PUMP SUBUNIT ACRB 		PF00873
(ACR_tran) 		17 SER A  79
ASN A  81
SER A 134
SER A 135
LYS A 292
MET A 573
MET A 575
PHE A 615
PHE A 617
GLU A 673
ASP A 681
GLU A 683
GLU A 826
LEU A 828
THR A 860
GLY A 861
MET A 862
 ERY A1101
4ZJL_D_ERYD1101 4zjl ERY

DB00199
(Erythromycin) 		Escherichia coli MULTIDRUG EFFLUX
PUMP SUBUNIT ACRB 		None 14 SER D  79
ASN D  81
SER D 134
SER D 135
LYS D 292
PHE D 615
PHE D 617
LEU D 674
ASP D 681
ASN D 719
ARG D 815
GLU D 817
GLU D 826
MET D 862
 ERY D1101
4ZJO_A_ERYA1101 4zjo ERY

DB00199
(Erythromycin) 		Escherichia coli MULTIDRUG EFFLUX
PUMP SUBUNIT ACRB 		PF00873
(ACR_tran) 		14 SER A  79
ASN A  81
SER A 134
SER A 135
LYS A 292
MET A 573
ALA A 617
ASP A 681
GLU A 683
GLU A 817
GLU A 826
LEU A 828
THR A 860
MET A 862
 ERY A1101
4ZJO_D_ERYD1101 4zjo ERY

DB00199
(Erythromycin) 		Escherichia coli MULTIDRUG EFFLUX
PUMP SUBUNIT ACRB 		None 11 TYR D  77
SER D  79
THR D  91
SER D 134
LYS D 292
ALA D 617
GLU D 673
ASP D 681
GLU D 826
THR D 860
GLY D 861
 ERY D1101
4ZJQ_A_ERYA1101 4zjq ERY

DB00199
(Erythromycin) 		Escherichia coli MULTIDRUG EFFLUX
PUMP SUBUNIT ACRB 		PF00873
(ACR_tran) 		11 SER A  79
SER A 134
LYS A 292
MET A 573
LEU A 663
GLU A 668
ASP A 676
ASN A 714
GLU A 821
GLY A 856
MET A 857
 ERY A1101
4ZJQ_D_ERYD1101 4zjq ERY

DB00199
(Erythromycin) 		Escherichia coli MULTIDRUG EFFLUX
PUMP SUBUNIT ACRB 		None 12 SER D  79
ASN D  81
THR D  91
SER D 134
LYS D 292
MET D 573
ILE D 621
PHE D 661
ASP D 676
ARG D 810
GLU D 812
GLU D 821
 ERY D1101
4ZOW_A_CLMA500 4zow CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Escherichia coli MULTIDRUG
TRANSPORTER MDFA 		PF07690
(MFS_1) 		11 TYR A  30
ASN A  33
ASP A  34
MET A  58
LEU A  62
LEU A 119
LEU A 151
LEU A 235
LEU A 236
ILE A 239
LEU A 268
 CLM A 500
4ZP0_A_DXCA500 4zp0 DXC

DB03619
(Deoxycholic
Acid) 		Escherichia coli MULTIDRUG
TRANSPORTER MDFA 		PF07690
(MFS_1) 		10 TYR A  30
ASN A  33
ASP A  34
MET A  58
LEU A  62
PRO A 154
LEU A 236
GLY A 354
GLN A 357
MET A 358
 DXC A 500
4ZUD_A_OLMA1201 4zud OLM

DB00275
(Olmesartan) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		CHIMERA PROTEIN OF
SOLUBLE CYTOCHROME
B562 AND TYPE-1
ANGIOTENSIN II
RECEPTOR 		PF00001
(7tm_1)
PF07361
(Cytochrom_B562) 		9 TYR A  35
PHE A  77
TRP A  84
VAL A 108
SER A 109
LEU A 112
ARG A 167
ILE A 288
TYR A 292
 OLM A1201
4ZVC_A_BEZA301 4zvc BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Escherichia coli DIGUANYLATE CYCLASE
DOSC 		None 8 ILE A 197
ILE B 197
LEU B 201
LEU A 201
ARG B 265
ARG A 265
LEU A 269
LEU B 269
 BEZ A 301
5CXV_A_0HKA501 5cxv 0HK

DB01409
(Tiotropium) 		Escherichia virus
T4;
Homo sapiens 		MUSCARINIC
ACETYLCHOLINE
RECEPTOR
M1,ENDOLYSIN,MUSCARI
NIC ACETYLCHOLINE
RECEPTOR M1 		PF00001
(7tm_1)
PF00959
(Phage_lysozyme) 		15 ASP A 105
TYR A 106
SER A 109
GLN A 110
TRP A 157
THR A 189
THR A 192
ALA A 193
ALA A 196
PHE A 197
TRP A 378
TYR A 381
ASN A 382
TYR A 404
CYS A 407
 0HK A 501
5DB5_A_CYSA503 5db5 CYS

DB00151
(L-
Cysteine) 		Escherichia coli CYSTEINE DESULFURASE None
PF00266
(Aminotran_5) 		8 ALA A  31
HIS B  55
HIS A 123
ASN A 175
LYS A 226
THR B 278
ARG A 359
ARG A 379
 CYS A 503
5DSG_A_0HKA1201 5dsg 0HK

DB01409
(Tiotropium) 		Escherichia virus
T4;
Homo sapiens 		MUSCARINIC
ACETYLCHOLINE
RECEPTOR
M4,ENDOLYSIN,ENDOLYS
IN,MUSCARINIC
ACETYLCHOLINE
RECEPTOR M4 		PF00001
(7tm_1)
PF00959
(Phage_lysozyme) 		15 ASP A 112
TYR A 113
SER A 116
ASN A 117
TRP A 164
LEU A 190
THR A 196
THR A 199
ALA A 203
PHE A 204
TRP A 413
TYR A 416
ASN A 417
TYR A 439
CYS A 442
 0HK A1201
5DSG_B_0HKB1201 5dsg 0HK

DB01409
(Tiotropium) 		Escherichia virus
T4;
Homo sapiens 		MUSCARINIC
ACETYLCHOLINE
RECEPTOR
M4,ENDOLYSIN,ENDOLYS
IN,MUSCARINIC
ACETYLCHOLINE
RECEPTOR M4 		no annotation 15 ASP B 112
TYR B 113
SER B 116
ASN B 117
TRP B 164
LEU B 190
THR B 196
THR B 199
ALA B 203
PHE B 204
TRP B 413
TYR B 416
ASN B 417
TYR B 439
CYS B 442
 0HK B1201
5DWK_C_ACTC207 5dwk ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli DIACYLGLYCEROL
KINASE 		None 5 GLU C  28
ALA C  30
GLU C  69
ASN C  72
GLU C  76
 ACT C 207
5E8Q_A_FOLA201 5e8q FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		15 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
TRP A  30
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
5E8Q_B_FOLB201 5e8q FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		None 14 ILE B   5
ALA B   7
ASP B  27
LEU B  28
TRP B  30
PHE B  31
LYS B  32
THR B  46
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
ARG B  57
TYR B 100
THR B 113
 FOL B 201
5EAJ_A_FOLA201 5eaj FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		14 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
5EAJ_B_FOLB201 5eaj FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		None 15 ILE B   5
ALA B   7
ASP B  27
LEU B  28
TRP B  30
PHE B  31
LYS B  32
THR B  46
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
PRO B  55
ARG B  57
TYR B 100
THR B 113
 FOL B 201
5ENT_C_MIYC901 5ent MIY

DB01017
(Minocycline) 		Escherichia coli MULTIDRUG EFFLUX
PUMP SUBUNIT
ACRB,MULTIDRUG
EFFLUX PUMP SUBUNIT
ACRB 		no annotation 9 SER C  48
GLN C 176
PHE C 178
GLY C 179
SER C 180
GLU C 273
ASN C 274
ILE C 277
ALA C 279
 MIY C 901
5G5G_A_ACTA1231 5g5g ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli PUTATIVE XANTHINE
DEHYDROGENASE YAGR
MOLYBDENUM-BINDING
SU SUBUNIT;
PUTATIVE XANTHINE
DEHYDROGENASE YAGT
IRON-SULFUR-BINDING
SUBUNIT 		PF00111
(Fer2)
PF01799
(Fer2_2)
PF00941
(CO_deh_flav_C)
PF03450
(FAD_binding_5) 		3 THR B  76
ASP B  77
ARG A 114
 ACT A1231
5G5G_B_ACTB1321 5g5g ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli PUTATIVE XANTHINE
DEHYDROGENASE YAGR
MOLYBDENUM-BINDING
SU SUBUNIT 		PF00941
(CO_deh_flav_C)
PF03450
(FAD_binding_5) 		3 THR B  62
ASP B  63
ALA B  64
 ACT B1321
5G5G_C_ACTC1740 5g5g ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli PUTATIVE XANTHINE
DEHYDROGENASE YAGS
FAD-BINDING SUBUNIT 		PF01315
(Ald_Xan_dh_C)
PF02738
(Ald_Xan_dh_C2) 		4 VAL C 320
GLU C 324
GLY C 335
LEU C 336
 ACT C1740
5G5H_A_ACTA1229 5g5h ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli PUTATIVE XANTHINE
DEHYDROGENASE YAGT
IRON-SULFUR-BINDING
SUBUNIT 		PF00111
(Fer2)
PF01799
(Fer2_2) 		4 VAL A 186
GLU A 193
THR A 195
GLU A 198
 ACT A1229
5G5H_C_ACTC1742 5g5h ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli PUTATIVE XANTHINE
DEHYDROGENASE YAGR
MOLYBDENUM-BINDING
SUBUNIT 		PF01315
(Ald_Xan_dh_C2)
PF02738
(Ald_Xan_dh_C) 		5 ASP C  93
LYS C  94
TRP C 215
THR C 218
ASP C 219
 ACT C1742
5G5H_C_ACTC1743 5g5h ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli PUTATIVE XANTHINE
DEHYDROGENASE YAGR
MOLYBDENUM-BINDING
SUBUNIT;
PUTATIVE XANTHINE
DEHYDROGENASE YAGT
IRON-SULFUR-BINDING
SUBUNIT 		PF00111
(Fer2)
PF01799
(Fer2_2)
PF01315
(Ald_Xan_dh_C2)
PF02738
(Ald_Xan_dh_C) 		5 LYS A  97
ASP A 100
PHE C 120
MET C 269
PRO C 271
 ACT C1743
5HW4_A_SAMA801 5hw4 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE I 		PF00590
(TP_methylase) 		12 ILE A  21
GLY A  94
THR A  95
ASP A 100
CYS A 123
ALA A 124
PHE A 144
TYR A 169
LEU A 198
LYS A 200
GLU A 227
VAL A 229
 SAM A 801
5HW4_B_SAMB801 5hw4 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE I 		None 11 ILE B  21
GLY B  94
ASP B 100
CYS B 123
ALA B 124
PHE B 144
TYR B 169
LEU B 198
LYS B 200
GLU B 227
VAL B 229
 SAM B 801
5HW4_C_SAMC801 5hw4 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE I 		None 12 ILE C  21
GLY C  94
THR C  95
ASP C 100
CYS C 123
ALA C 124
PHE C 144
TYR C 169
LEU C 198
LYS C 200
GLU C 227
VAL C 229
 SAM C 801
5I3C_A_AC2A301 5i3c AC2

DB00787
(Aciclovir) 		Escherichia coli PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE
DEOD-TYPE 		PF01048
(PNP_UDP_1) 		9 MET A  64
ARG A  87
SER A  90
GLY A  92
ALA A 156
VAL A 178
MET A 180
GLU A 181
ILE A 206
 AC2 A 301
5I3C_B_AC2B301 5i3c AC2

DB00787
(Aciclovir) 		Escherichia coli PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE
DEOD-TYPE 		no annotation 10 MET B  64
SER B  90
GLY B  92
ALA B 156
VAL B 178
GLU B 179
MET B 180
GLU B 181
ASP B 204
ILE B 206
 AC2 B 301
5I3C_C_AC2C301 5i3c AC2

DB00787
(Aciclovir) 		Escherichia coli PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE
DEOD-TYPE 		no annotation 11 MET C  64
SER C  90
GLY C  92
ALA C 156
VAL C 178
GLU C 179
MET C 180
GLU C 181
SER C 203
ASP C 204
ILE C 206
 AC2 C 301
5IGI_A_ZITA402 5igi ZIT

DB00207
(Azithromycin) 		Escherichia coli MACROLIDE
2'-PHOSPHOTRANSFERAS
E 		PF01636
(APH) 		18 MET A 103
ILE A 105
PRO A 112
ASP A 200
TYR A 202
VAL A 203
HIS A 205
GLU A 222
ALA A 233
ALA A 234
MET A 237
VAL A 238
LEU A 270
GLY A 273
THR A 276
TYR A 277
PHE A 280
TYR A 289
 ZIT A 402
5IGJ_A_CTYA402 5igj CTY

DB01211
(Clarithromycin) 		Escherichia coli MACROLIDE
2'-PHOSPHOTRANSFERAS
E 		PF01636
(APH) 		17 MET A 103
ILE A 105
PRO A 112
ASP A 200
TYR A 202
VAL A 203
HIS A 205
GLU A 222
ALA A 233
ALA A 234
MET A 237
VAL A 238
LEU A 270
GLY A 273
THR A 276
TYR A 277
PHE A 280
 CTY A 402
5IGP_A_ERYA402 5igp ERY

DB00199
(Erythromycin) 		Escherichia coli MACROLIDE
2'-PHOSPHOTRANSFERAS
E 		PF01636
(APH) 		16 MET A 103
ILE A 105
PRO A 112
ASP A 200
TYR A 202
VAL A 203
GLU A 222
ALA A 233
ALA A 234
MET A 237
VAL A 238
LEU A 270
GLY A 273
THR A 276
TYR A 277
PHE A 280
 ERY A 402
5IGT_A_ERYA402 5igt ERY

DB00199
(Erythromycin) 		Escherichia coli MACROLIDE
2'-PHOSPHOTRANSFERAS
E 		PF01636
(APH) 		17 MET A 103
ILE A 105
PRO A 112
ASP A 200
TYR A 202
VAL A 203
HIS A 205
GLU A 222
ALA A 233
ALA A 234
MET A 237
VAL A 238
LEU A 270
GLY A 273
THR A 276
TYR A 277
PHE A 280
 ERY A 402
5IGV_A_ZITA404 5igv ZIT

DB00207
(Azithromycin) 		Escherichia coli MACROLIDE
2'-PHOSPHOTRANSFERAS
E II 		PF01636
(APH) 		16 ILE A 103
GLY A 108
ASN A 109
TYR A 110
ASP A 200
HIS A 202
GLU A 222
ILE A 233
ARG A 237
ALA A 238
TYR A 273
SER A 276
ILE A 277
PHE A 280
TYR A 289
MET A 292
 ZIT A 404
5IGW_A_CTYA404 5igw CTY

DB01211
(Clarithromycin) 		Escherichia coli MACROLIDE
2'-PHOSPHOTRANSFERAS
E II 		PF01636
(APH) 		14 ILE A 103
GLY A 108
ASN A 109
TYR A 110
ASP A 200
HIS A 202
GLU A 222
ILE A 233
ARG A 237
SER A 276
ILE A 277
PHE A 280
TYR A 289
MET A 292
 CTY A 404
5IGY_A_ERYA403 5igy ERY

DB00199
(Erythromycin) 		Escherichia coli MACROLIDE
2'-PHOSPHOTRANSFERAS
E II 		PF01636
(APH) 		18 ILE A 103
HIS A 105
GLY A 108
ASN A 109
TYR A 110
ASP A 200
HIS A 202
GLU A 222
ILE A 233
PHE A 234
ARG A 237
ALA A 238
TYR A 273
SER A 276
ILE A 277
PHE A 280
TYR A 289
MET A 292
 ERY A 403
5IGZ_A_SPRA404 5igz SPR

DB06145
(Spiramycin) 		Escherichia coli MACROLIDE
2'-PHOSPHOTRANSFERAS
E II 		PF01636
(APH) 		21 LEU A  31
ASP A  32
ARG A  59
ILE A 103
HIS A 105
ASN A 109
TYR A 110
ARG A 162
ASP A 200
HIS A 202
GLU A 222
ARG A 237
TYR A 273
SER A 276
ILE A 277
GLU A 279
PHE A 280
VAL A 283
GLU A 288
TYR A 289
MET A 292
 SPR A 404
5IH0_A_ACTA402 5ih0 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli MACROLIDE
2'-PHOSPHOTRANSFERAS
E II 		PF01636
(APH) 		6 PHE A  33
ARG A  49
PRO A  51
ARG A  59
THR A  60
ILE A  90
 ACT A 402
5IH0_A_ERYA404 5ih0 ERY

DB00199
(Erythromycin) 		Escherichia coli MACROLIDE
2'-PHOSPHOTRANSFERAS
E II 		PF01636
(APH) 		18 ILE A 103
HIS A 105
GLY A 108
ASN A 109
TYR A 110
ASP A 200
HIS A 202
GLU A 222
ILE A 233
PHE A 234
ARG A 237
ALA A 238
TYR A 273
SER A 276
ILE A 277
PHE A 280
TYR A 289
MET A 292
 ERY A 404
5IWU_A_ACTA402 5iwu ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli MACROLIDE
2'-PHOSPHOTRANSFERAS
E II 		PF01636
(APH) 		6 PHE A  37
VAL A  47
TYR A  92
MET A 207
ILE A 218
ASP A 219
 ACT A 402
5IWU_A_ERYA404 5iwu ERY

DB00199
(Erythromycin) 		Escherichia coli MACROLIDE
2'-PHOSPHOTRANSFERAS
E II 		PF01636
(APH) 		18 ILE A 103
HIS A 105
GLY A 108
TYR A 110
ASP A 200
HIS A 202
THR A 221
GLU A 222
ILE A 233
PHE A 234
ARG A 237
ALA A 238
TYR A 273
SER A 276
ILE A 277
PHE A 280
TYR A 289
MET A 292
 ERY A 404
5J4N_A_AG2A501 5j4n AG2

DB08838
(Agmatine) 		Escherichia coli ARGININE/AGMATINE
ANTIPORTER 		PF13520
(AA_permease_2) 		6 SER A  26
GLY A 100
ASN A 101
MET A 104
ILE A 205
TRP A 293
 AG2 A 501
5J4N_B_AG2B501 5j4n AG2

DB08838
(Agmatine) 		Escherichia coli ARGININE/AGMATINE
ANTIPORTER 		no annotation 6 ILE B  23
GLY B 100
ASN B 101
MET B 104
ILE B 205
TRP B 293
 AG2 B 501
5JMN_A_FUAA1101 5jmn FUA

DB02703
(Fusidic
Acid) 		Escherichia coli MULTIDRUG EFFLUX
PUMP SUBUNIT ACRB 		PF00873
(ACR_tran) 		5 ILE A  27
LYS A 334
ILE A 337
HIS A 338
VAL A 341
 FUA A1101
5JMN_B_FUAB1101 5jmn FUA

DB02703
(Fusidic
Acid) 		Escherichia coli MULTIDRUG EFFLUX
PUMP SUBUNIT ACRB 		no annotation 5 ILE B  27
LEU B 300
LYS B 334
HIS B 338
VAL B 341
 FUA B1101
5JMN_C_FUAC1101 5jmn FUA

DB02703
(Fusidic
Acid) 		Escherichia coli MULTIDRUG EFFLUX
PUMP SUBUNIT ACRB 		no annotation 3 VAL C  32
HIS C 338
VAL C 341
 FUA C1101
5K4P_A_SORA611 5k4p SOR

DB01638
(Sorbitol) 		Escherichia coli PROBABLE
PHOSPHATIDYLETHANOLA
MINE TRANSFERASE
MCR-1 		PF00884
(Sulfatase) 		6 GLY A 282
THR A 283
SER A 284
TYR A 287
GLY A 479
ASN A 482
 SOR A 611
5KMW_A_PNNA305 5kmw PNN

DB01053
(Benzylpenicillin) 		Escherichia coli BETA-LACTAMASE
TOHO-1 		PF13354
(Beta-lactamase2) 		4 ASN A 103
PRO A 166
ASN A 169
ASP A 238
 PNN A 305
5L7I_A_VISA1202 5l7i VIS

DB08828
(Vismodegib) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		SMOOTHENED
HOMOLOG,SOLUBLE
CYTOCHROME
B562,SMOOTHENED
HOMOLOG 		PF01392
(Fz)
PF01534
(Frizzled)
PF07361
(Cytochrom_B562) 		14 ASN A 219
LEU A 221
TRP A 281
ASP A 384
VAL A 386
SER A 387
TYR A 394
ARG A 400
GLN A 477
PHE A 484
GLU A 518
ASN A 521
LEU A 522
MET A 525
 VIS A1202
5L7I_B_VISB1202 5l7i VIS

DB08828
(Vismodegib) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		SMOOTHENED
HOMOLOG,SOLUBLE
CYTOCHROME
B562,SMOOTHENED
HOMOLOG 		no annotation 14 LEU B 221
TRP B 281
ASP B 384
SER B 387
TYR B 394
ARG B 400
ASP B 473
GLN B 477
TRP B 480
PRO B 513
GLU B 518
ASN B 521
LEU B 522
MET B 525
 VIS B1202
5L8D_A_ACTA601 5l8d ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli NICKEL-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN 		PF00496
(SBP_bac_5) 		4 LYS A  52
ARG A  68
ASP A  69
ASP A  70
 ACT A 601
5L8D_A_EDTA609 5l8d EDT

DB00974
(Edetic
Acid) 		Escherichia coli NICKEL-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN 		PF00496
(SBP_bac_5) 		8 TYR A  22
MET A  27
ARG A  97
TRP A 100
ARG A 137
TRP A 398
TYR A 402
THR A 490
 EDT A 609
5L8D_B_ACTB601 5l8d ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli NICKEL-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN 		None 3 THR B 203
PRO B 225
ASP B 227
 ACT B 601
5MWU_A_ACTA601 5mwu ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli NICKEL-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN 		PF00496
(SBP_bac_5) 		4 LYS A  52
ARG A  68
ASP A  69
ASP A  70
 ACT A 601
5MWU_A_EDTA609 5mwu EDT

DB00974
(Edetic
Acid) 		Escherichia coli NICKEL-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN 		PF00496
(SBP_bac_5) 		8 TYR A  22
MET A  27
ARG A  97
TRP A 100
ARG A 137
TRP A 398
TYR A 402
THR A 490
 EDT A 609
5MWU_B_ACTB601 5mwu ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli NICKEL-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN 		None 3 THR B 203
PRO B 225
ASP B 227
 ACT B 601
5MZJ_A_TEPA2401 5mzj TEP

DB00277
(Theophylline) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		ADENOSINE RECEPTOR
A2A,SOLUBLE
CYTOCHROME
B562,ADENOSINE
RECEPTOR A2A 		PF00001
(7tm_1)
PF07361
(Cytochrom_B562) 		8 LEU A  85
PHE A 168
GLU A 169
MET A 177
LEU A 249
ASN A 253
MET A 270
ILE A 274
 TEP A2401
5MZP_A_CFFA2401 5mzp CFF

DB00201
(Caffeine) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		ADENOSINE RECEPTOR
A2A,SOLUBLE
CYTOCHROME
B562,ADENOSINE
RECEPTOR A2A 		PF00001
(7tm_1)
PF07361
(Cytochrom_B562) 		9 ILE A  66
VAL A  84
PHE A 168
GLU A 169
MET A 177
LEU A 249
ASN A 253
MET A 270
ILE A 274
 CFF A2401
5TUD_A_ERMA2001 5tud ERM

DB00696
(Ergotamine) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		5-HYDROXYTRYPTAMINE
RECEPTOR 2B,SOLUBLE
CYTOCHROME B562
CHIMERA 		PF00001
(7tm_1)
PF07361
(Cytochrom_B562) 		19 LEU A 132
ASP A 135
VAL A 136
SER A 139
THR A 140
VAL A 208
LEU A 209
LYS A 211
MET A 218
ALA A 225
PHE A 340
PHE A 341
ASN A 344
LEU A 347
VAL A 348
GLN A 359
LEU A 362
GLU A 363
VAL A 366
 ERM A2001
5TUD_D_ERMD1201 5tud ERM

DB00696
(Ergotamine) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		5-HYDROXYTRYPTAMINE
RECEPTOR 2B,SOLUBLE
CYTOCHROME B562
CHIMERA 		no annotation 18 LEU D 132
ASP D 135
VAL D 136
SER D 139
THR D 140
VAL D 208
LEU D 209
MET D 218
ALA D 225
PHE D 340
PHE D 341
ASN D 344
LEU D 347
VAL D 348
GLN D 359
LEU D 362
GLU D 363
VAL D 366
 ERM D1201
5TWJ_A_SAMA201 5twj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE H 		PF02590
(SPOUT_MTase) 		12 LEU A  72
ILE A  74
ILE A 102
GLY A 103
GLY A 107
SER A 121
LEU A 122
SER A 123
THR A 126
LEU A 127
HIS A 129
VAL A 132
 SAM A 201
5TWJ_B_SAMB201 5twj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE H 		None 10 LEU B  72
ILE B  74
ILE B 102
GLY B 103
GLY B 107
LEU B 122
SER B 123
LEU B 127
HIS B 129
VAL B 132
 SAM B 201
5TWJ_C_SAMC201 5twj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE H 		None 13 LEU C  72
ASP C  73
ILE C  74
ILE C 102
GLY C 103
GLY C 107
LEU C 108
LYS C 113
SER C 121
LEU C 122
SER C 123
LEU C 127
VAL C 132
 SAM C 201
5TWJ_D_SAMD201 5twj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE H 		None 11 LEU D  72
ASP D  73
ILE D  74
ILE D 102
GLY D 103
GLY D 107
LEU D 122
SER D 123
THR D 126
LEU D 127
VAL D 132
 SAM D 201
5UAC_C_RFPC3001 5uac RFP

DB01045
(Rifampicin) 		Escherichia coli DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE SUBUNIT
BETA 		PF00562
(RNA_pol_Rpb2_6)
PF04560
(RNA_pol_Rpb2_7)
PF04561
(RNA_pol_Rpb2_2)
PF04563
(RNA_pol_Rpb2_1)
PF04565
(RNA_pol_Rpb2_3)
PF10385
(RNA_pol_Rpb2_45) 		12 GLN C 510
GLN C 513
PHE C 514
ASP C 516
HIS C 526
ARG C 529
SER C 531
LEU C 533
ARG C 540
PRO C 564
ILE C 572
ARG C 687
 RFP C3001
5UAH_C_RFPC3001 5uah RFP

DB01045
(Rifampicin) 		Escherichia coli DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE SUBUNIT
BETA 		PF00562
(RNA_pol_Rpb2_6)
PF04560
(RNA_pol_Rpb2_7)
PF04561
(RNA_pol_Rpb2_2)
PF04563
(RNA_pol_Rpb2_1)
PF04565
(RNA_pol_Rpb2_3)
PF10385
(RNA_pol_Rpb2_45) 		13 ARG C 143
GLN C 510
LEU C 511
GLN C 513
PHE C 514
VAL C 516
ARG C 529
SER C 531
LEU C 533
ARG C 540
PRO C 564
ILE C 572
ARG C 687
 RFP C3001
5UAL_C_RFPC3001 5ual RFP

DB01045
(Rifampicin) 		Escherichia coli DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE SUBUNIT
BETA 		PF00562
(RNA_pol_Rpb2_6)
PF04560
(RNA_pol_Rpb2_7)
PF04561
(RNA_pol_Rpb2_2)
PF04563
(RNA_pol_Rpb2_1)
PF04565
(RNA_pol_Rpb2_3)
PF10385
(RNA_pol_Rpb2_45) 		11 GLN C 510
GLN C 513
PHE C 514
ASP C 516
HIS C 526
ARG C 529
LEU C 531
PRO C 564
ILE C 572
ARG C 687
GLN C 761
 RFP C3001
5UIG_A_EDTA501 5uig EDT

DB00974
(Edetic
Acid) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		ADENOSINE RECEPTOR
A2A,SOLUBLE
CYTOCHROME
B562,ADENOSINE
RECEPTOR A2A 		PF00001
(Cytochrom_B562)
PF07361
(7tm_1) 		6 ASN A  39
THR A  41
ASN A  42
ARG A 102
ILE A 292
GLU A 294
 EDT A 501
5UIH_A_8CVA201 5uih 8CV

DB00914
(Phenformin) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		no annotation 8 ILE A   5
ALA A   7
MET A  16
ASP A  27
LEU A  28
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 8CV A 201
5UJX_A_FOLA201 5ujx FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		14 ILE A   5
ALA A   7
ASP A  27
LEU A  28
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
ARG A  52
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
5UJX_B_FOLB201 5ujx FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		None 13 ILE B   5
ALA B   7
ASP B  27
LEU B  28
PHE B  31
LYS B  32
THR B  46
ILE B  50
ARG B  52
LEU B  54
ARG B  57
TYR B 100
THR B 113
 FOL B 201
5V0I_A_TRPA402 5v0i TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Escherichia coli TRYPTOPHAN--TRNA
LIGASE 		PF00579
(tRNA-synt_1b) 		9 GLY A   9
GLN A  11
VAL A  42
HIS A  45
MET A 132
ASP A 135
ILE A 136
VAL A 144
GLN A 150
 TRP A 402
5V0I_B_TRPB402 5v0i TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Escherichia coli TRYPTOPHAN--TRNA
LIGASE 		None 9 GLY B   9
GLN B  11
VAL B  42
HIS B  45
MET B 132
ASP B 135
ILE B 136
VAL B 144
GLN B 150
 TRP B 402
5XPR_A_K86A1201 5xpr K86

DB00559
(Bosentan) 		Escherichia virus
T4;
Homo sapiens 		ENDOTHELIN B
RECEPTOR,ENDOLYSIN,E
NDOTHELIN B RECEPTOR 		PF00001
(7tm_1)
PF00959
(Phage_lysozyme) 		16 HIS A 150
ASP A 154
PRO A 178
GLN A 181
LYS A 182
VAL A 185
GLU A 236
LYS A 273
LEU A 277
TYR A 281
TRP A 336
LEU A 339
HIS A 340
ARG A 343
ILE A 372
ALA A 375
 K86 A1201
5Z6F_A_FOLA201 5z6f FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		13 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
ARG A  52
ARG A  57
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
5Z6J_A_FOLA201 5z6j FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		15 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
TRP A  30
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
5Z6K_A_FOLA201 5z6k FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		15 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
TRP A  30
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
5Z6L_A_FOLA201 5z6l FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		9 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
LYS A  32
ILE A  50
PRO A  55
ARG A  57
 FOL A 201
5Z6M_A_FOLA201 5z6m FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		11 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
TRP A  30
PHE A  31
LEU A  54
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 201
6A93_A_8NUA3001 6a93 8NU

DB00734
(Risperidone) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		5-HYDROXYTRYPTAMINE
RECEPTOR 2A,SOLUBLE
CYTOCHROME B562 		PF00001
(7tm_1) 		14 SER A 131
TRP A 151
ASP A 155
SER A 159
THR A 160
ILE A 163
LEU A 228
PHE A 332
TRP A 336
PHE A 339
PHE A 340
LEU A 362
ASN A 363
TYR A 370
 8NU A3001
6A93_B_8NUB3001 6a93 8NU

DB00734
(Risperidone) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		5-HYDROXYTRYPTAMINE
RECEPTOR 2A,SOLUBLE
CYTOCHROME B562 		None 17 SER B 131
TYR B 139
TRP B 151
ASP B 155
VAL B 156
SER B 159
THR B 160
ILE B 163
LEU B 228
PHE B 332
TRP B 336
PHE B 339
PHE B 340
LEU B 362
ASN B 363
VAL B 366
TYR B 370
 8NU B3001
6A94_A_ZOTA3001 6a94 ZOT

DB09225
(Zotepine) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		5-HYDROXYTRYPTAMINE
RECEPTOR 2A,SOLUBLE
CYTOCHROME B562 		PF00001
(7tm_1) 		13 TRP A 151
ASP A 155
SER A 159
LEU A 229
VAL A 235
GLY A 238
SER A 242
PHE A 332
TRP A 336
PHE A 339
PHE A 340
ASN A 343
VAL A 366
 ZOT A3001
6A94_B_ZOTB3001 6a94 ZOT

DB09225
(Zotepine) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		5-HYDROXYTRYPTAMINE
RECEPTOR 2A,SOLUBLE
CYTOCHROME B562 		None 13 ASP B 155
VAL B 156
SER B 159
THR B 160
LEU B 229
VAL B 235
GLY B 238
SER B 242
PHE B 332
TRP B 336
PHE B 339
PHE B 340
VAL B 366
 ZOT B3001
6AJI_A_AY6A1001 6aji AY6

DB06155
(Rimonabant) 		Mycolicibacterium
smegmatis;
Escherichia virus
T4 		DRUG EXPORTERS OF
THE RND
SUPERFAMILY-LIKE
PROTEIN,ENDOLYSIN 		PF00959
(MMPL)
PF03176
(MMPL) 		13 VAL A 245
LEU A 248
ILE A 253
ILE A 319
VAL A 638
LEU A 642
ASP A 645
TYR A 646
PHE A 649
LEU A 686
VAL A 689
ALA A 690
LEU A 708
 AY6 A1001
6AK3_A_P2EA1201 6ak3 P2E

DB00917
(Dinoprostone) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		PROSTAGLANDIN E2
RECEPTOR EP3
SUBTYPE,SOLUBLE
CYTOCHROME B562 		PF00001
(7tm_1) 		16 PRO A  55
MET A  58
GLN A 103
THR A 106
THR A 107
VAL A 110
TYR A 114
MET A 137
GLY A 141
THR A 206
TRP A 207
LEU A 329
VAL A 332
ARG A 333
SER A 336
GLN A 339
 P2E A1201
6AK3_B_P2EB1201 6ak3 P2E

DB00917
(Dinoprostone) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		PROSTAGLANDIN E2
RECEPTOR EP3
SUBTYPE,SOLUBLE
CYTOCHROME B562 		None 17 PRO B  55
MET B  58
GLN B 103
THR B 106
THR B 107
VAL B 110
TYR B 114
MET B 137
GLY B 141
THR B 206
TRP B 207
TRP B 295
LEU B 329
VAL B 332
ARG B 333
SER B 336
GLN B 339
 P2E B1201
6B58_A_ACTA603 6b58 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli FUMARATE REDUCTASE
FLAVOPROTEIN SUBUNIT 		None 3 TYR A  84
ASN A 366
LEU A 405
 ACT A 603
6B58_A_ACTA606 6b58 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli FUMARATE REDUCTASE
FLAVOPROTEIN SUBUNIT 		None 5 GLU A  63
PHE A  66
ASP A  83
HIS A  87
THR A 572
 ACT A 606
6B58_A_ACTA607 6b58 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli FUMARATE REDUCTASE
FLAVOPROTEIN SUBUNIT 		None 4 GLY A  72
ARG A 287
ASN A 389
LEU A 391
 ACT A 607
6B58_A_ACTA608 6b58 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli FUMARATE REDUCTASE
FLAVOPROTEIN SUBUNIT 		None 3 GLY A 538
THR A 540
GLU A 541
 ACT A 608
6B58_A_ACTA609 6b58 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli FUMARATE REDUCTASE
FLAVOPROTEIN SUBUNIT 		None 3 HIS A 232
HIS A 355
ARG A 390
 ACT A 609
6B58_C_ACTC608 6b58 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli FUMARATE REDUCTASE
FLAVOPROTEIN SUBUNIT 		None 5 TYR C 266
LYS C 289
GLN C 292
HIS C 296
TYR C 466
 ACT C 608
6B58_C_ACTC609 6b58 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli FUMARATE REDUCTASE
FLAVOPROTEIN SUBUNIT 		None 5 PHE C  62
GLU C  63
PHE C  66
ASP C  83
HIS C  87
 ACT C 609
6B89_A_NOVA403 6b89 NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Escherichia coli LIPOPOLYSACCHARIDE
EXPORT SYSTEM
ATP-BINDING PROTEIN
LPTB 		no annotation 16 LEU A  72
HIS A  73
ALA A  76
TYR A  82
PRO A  84
GLU A  86
SER A  88
PHE A  90
PHE B  90
ARG B  91
ARG B  92
LEU B  93
ALA B 101
VAL A 102
GLN B 136
ARG A 150
 NOV A 403
6B89_B_NOVB403 6b89 NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Escherichia coli LIPOPOLYSACCHARIDE
EXPORT SYSTEM
ATP-BINDING PROTEIN
LPTB 		no annotation 17 LEU B  72
HIS B  73
ALA B  76
TYR B  82
PRO B  84
GLU B  86
SER B  88
PHE A  90
PHE B  90
ARG A  91
ARG A  92
LEU A  93
ALA A 101
VAL B 102
GLN A 104
GLN A 136
ARG B 150
 NOV B 403
6BFH_A_KANA201 6bfh KAN

DB01172
(Kanamycin) 		Escherichia coli AMINOGLYCOSIDE
ACETYLTRANSFERASE 		no annotation 11 TYR A  33
ASP A  34
TRP A  53
GLN A  73
TYR A  75
LEU A  81
GLU A  84
TYR A  85
ASP A  98
ASP A 135
GLU A 162
 KAN A 201
6BM5_A_SAMA1301 6bm5 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli METHIONINE SYNTHASE PF02965
(Met_synt_B12) 		11 ASP A 946
PRO A 949
ARG A1094
GLU A1097
ARG A1134
PRO A1135
ALA A1136
TYR A1139
PRO A1140
ALA A1141
TYR A1189
 SAM A1301
6BPL_B_PA1B605 6bpl PA1

DB01296
(Glucosamine) 		Escherichia coli LIPID A EXPORT
ATP-BINDING/PERMEASE
PROTEIN MSBA 		no annotation 3 ARG B  78
ARG B 296
ARG A 296
 PA1 B 605
6BQG_A_ERMA1201 6bqg ERM

DB00696
(Ergotamine) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		5-HYDROXYTRYPTAMINE
RECEPTOR 2C,SOLUBLE
CYTOCHROME B562 		no annotation 17 ASP A 134
VAL A 135
SER A 138
THR A 139
VAL A 208
LEU A 209
VAL A 215
GLY A 218
ALA A 222
PHE A 327
ASN A 331
SER A 334
VAL A 335
GLU A 347
LEU A 350
ASN A 351
VAL A 354
 ERM A1201
6C79_A_CE3A301 6c79 CE3

DB00493
(Cefotaxime) 		Escherichia coli BETA-LACTAMASE
TOHO-1 		no annotation 16 CYS A  69
ALA A  70
ASN A 104
TYR A 105
SER A 130
ASN A 132
PRO A 167
ASN A 170
THR A 216
LYS A 234
THR A 235
GLY A 236
SER A 237
GLY A 238
ASP A 239
ASN A 272
 CE3 A 301
6CM4_A_8NUA2001 6cm4 8NU

DB00734
(Risperidone) 		Homo sapiens;
Escherichia virus
T4 		D(2) DOPAMINE
RECEPTOR, ENDOLYSIN
CHIMERA 		PF00001
(7tm_1)
PF00959
(Phage_lysozyme) 		16 TRP A 100
PHE A 110
ASP A 114
VAL A 115
CYS A 118
THR A 119
ALA A 122
SER A 193
SER A 197
PHE A 382
TRP A 386
PHE A 389
PHE A 390
TYR A 408
THR A 412
TYR A 416
 8NU A2001
6DRX_A_H8GA1201 6drx H8G

DB00589
(Lisuride) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		5HT2B RECEPTOR, BRIL
CHIMERA 		PF00001
(Cytochrom_B562)
PF07361
(7tm_1) 		13 TRP A 131
LEU A 132
ASP A 135
VAL A 136
SER A 139
THR A 140
PHE A 217
ALA A 225
TRP A 337
PHE A 340
ASN A 344
VAL A 366
TYR A 370
 H8G A1201
6DRY_A_H8DA2001 6dry H8D

DB00353
(Methylergometrine) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		5HT2B RECEPTOR, BRIL
CHIMERA 		PF00001
(Cytochrom_B562)
PF07361
(7tm_1) 		11 ASP A 135
VAL A 136
SER A 139
THR A 140
VAL A 208
LEU A 209
ALA A 225
PHE A 340
GLN A 359
VAL A 366
TYR A 370
 H8D A2001
6DRZ_A_H8JA1206 6drz H8J

DB00247
(Methysergide) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		5HT2B RECEPTOR, BRIL
CHIMERA 		PF00001
(Cytochrom_B562)
PF07361
(7tm_1) 		13 ASP A 135
VAL A 136
SER A 139
THR A 140
VAL A 208
LEU A 209
PHE A 217
GLY A 225
PHE A 340
PHE A 341
ASN A 344
VAL A 366
TYR A 370
 H8J A1206
6EUQ_A_ACTA512 6euq ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli MULTIDRUG
TRANSPORTER MDFA 		PF07690
(MFS_1) 		4 ARG A  78
GLU A 207
LEU A 208
ASP A 211
 ACT A 512
6EUQ_A_DXCA502 6euq DXC

DB03619
(Deoxycholic
Acid) 		Escherichia coli MULTIDRUG
TRANSPORTER MDFA 		PF07690
(MFS_1) 		11 TYR A  30
ASN A  33
ASP A  34
MET A  58
LEU A  62
GLN A  69
GLY A 123
PRO A 154
LEU A 236
GLN A 357
MET A 358
 DXC A 502
6GS4_A_F9EA601 6gs4 F9E

DB01610
(Valganciclovir) 		Escherichia coli DIPEPTIDE AND
TRIPEPTIDE PERMEASE
A 		PF00854
(PTR2) 		10 TYR A  38
LYS A 130
TYR A 156
ASN A 160
SER A 163
MET A 167
PHE A 289
ASN A 325
PRO A 326
GLU A 396
 F9E A 601
6GTQ_A_ACTA204 6gtq ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli N-ACETYLTRANSFERASE None 5 LEU A  43
THR A  62
CYS A  64
THR A  91
GLY A  93
 ACT A 204
6GTQ_A_ACTA205 6gtq ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli N-ACETYLTRANSFERASE None 4 ALA A 121
ALA B 121
ALA B 124
ALA A 124
 ACT A 205
6GTQ_B_ACTB207 6gtq ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli DUF1778
DOMAIN-CONTAINING
PROTEIN;
N-ACETYLTRANSFERASE 		None 6 LEU B  43
ARG D  52
THR B  62
CYS B  64
GLY B  93
ARG B  94
 ACT B 207
6I0Y_A_TRPA3001 6i0y TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Escherichia coli 23S RIBOSOMAL RNA;
TRYPTOPHANASE OPERON
LEADER PEPTIDE 		None
PF08053
(Tna_leader) 		3 TRP 7  12
ILE 7  15
ASP 7  16
 TRP A3001
6IBL_A_H98A501 6ibl H98

DB01274
(Arformoterol) 		Escherichia coli;
Meleagris
gallopavo 		THIOREDOXIN 1,BETA-1
ADRENERGIC RECEPTOR 		PF00001
(Thioredoxin)
PF00085
(7tm_1) 		16 TRP A 117
THR A 118
ASP A 121
VAL A 122
VAL A 125
ASP A 200
PHE A 201
SER A 211
SER A 215
TRP A 303
PHE A 306
PHE A 307
ASN A 310
VAL A 326
ASN A 329
TYR A 333
 H98 A 501
6IBL_B_H98B501 6ibl H98

DB01274
(Arformoterol) 		Escherichia coli;
Meleagris
gallopavo 		THIOREDOXIN 1,BETA-1
ADRENERGIC RECEPTOR 		None 16 TRP B 117
THR B 118
ASP B 121
VAL B 122
VAL B 125
ASP B 200
PHE B 201
SER B 211
SER B 215
TRP B 303
PHE B 306
PHE B 307
ASN B 310
VAL B 326
ASN B 329
TYR B 333
 H98 B 501
6J20_A_GBQA1201 6j20 GBQ

DB00673
(Aprepitant) 		Homo sapiens;
Escherichia virus
T4 		SUBSTANCE-P
RECEPTOR,ENDOLYSIN 		PF00001
(7tm_1)
PF00959
(Phage_lysozyme) 		19 ASN A  89
ASN A 109
PRO A 112
ILE A 113
VAL A 116
GLN A 165
ILE A 182
TRP A 184
GLU A 193
TYR A 196
HIS A 197
VAL A 200
THR A 201
ILE A 204
TRP A 261
PHE A 264
HIS A 265
PHE A 268
MET A 291
 GBQ A1201
6J21_A_GBQA1201 6j21 GBQ

DB00673
(Aprepitant) 		Homo sapiens;
Escherichia virus
T4 		SUBSTANCE-P
RECEPTOR,ENDOLYSIN 		PF00001
(Phage_lysozyme)
PF00959
(7tm_1) 		16 ASN A  89
ASN A 109
PRO A 112
ILE A 113
VAL A 116
ILE A 182
TRP A 184
GLU A 193
HIS A 197
VAL A 200
THR A 201
TRP A 261
PHE A 264
HIS A 265
PHE A 268
MET A 291
 GBQ A1201
6MN4_A_AM2A301 6mn4 AM2

DB04626
(Apramycin) 		Escherichia coli AMINOGLYCOSIDE
N(3)-ACETYLTRANSFERA
SE, AAC(3)-IVA 		PF02522
(Antibiotic_NAT) 		8 TRP A  63
ASP A  67
HIS A 124
ARG A 168
HIS A 169
GLU A 185
ASP A 187
GLU A 249
 AM2 A 301
6MN4_B_AM2B301 6mn4 AM2

DB04626
(Apramycin) 		Escherichia coli AMINOGLYCOSIDE
N(3)-ACETYLTRANSFERA
SE, AAC(3)-IVA 		None 8 TRP B  63
ASP B  67
HIS B 124
ARG B 168
HIS B 169
GLU B 185
ASP B 187
GLU B 249
 AM2 B 301
6MN4_C_AM2C301 6mn4 AM2

DB04626
(Apramycin) 		Escherichia coli AMINOGLYCOSIDE
N(3)-ACETYLTRANSFERA
SE, AAC(3)-IVA 		None 8 TRP C  63
ASP C  67
HIS C 124
ARG C 168
HIS C 169
GLU C 185
ASP C 187
GLU C 249
 AM2 C 301
6MN4_D_AM2D301 6mn4 AM2

DB04626
(Apramycin) 		Escherichia coli AMINOGLYCOSIDE
N(3)-ACETYLTRANSFERA
SE, AAC(3)-IVA 		None 8 TRP D  63
ASP D  67
HIS D 124
ARG D 168
HIS D 169
GLU D 185
ASP D 187
GLU D 249
 AM2 D 301
6MN4_E_AM2E301 6mn4 AM2

DB04626
(Apramycin) 		Escherichia coli AMINOGLYCOSIDE
N(3)-ACETYLTRANSFERA
SE, AAC(3)-IVA 		None 7 TRP E  63
HIS E 124
THR E 151
ARG E 168
HIS E 169
GLU E 185
ASP E 187
 AM2 E 301
6MN4_F_AM2F301 6mn4 AM2

DB04626
(Apramycin) 		Escherichia coli AMINOGLYCOSIDE
N(3)-ACETYLTRANSFERA
SE, AAC(3)-IVA 		None 7 TRP F  63
HIS F 124
ARG F 168
HIS F 169
GLU F 185
ASP F 187
GLU F 249
 AM2 F 301
6MN5_A_LLLA301 6mn5 LLL

DB04729
(GENTAMICIN
C1A) 		Escherichia coli AMINOGLYCOSIDE
N(3)-ACETYLTRANSFERA
SE, AAC(3)-IVA 		PF02522
(Antibiotic_NAT) 		6 ASP A  67
TYR A 183
GLU A 185
ASP A 187
CYS A 190
GLU A 249
 LLL A 301
6MN5_B_LLLB301 6mn5 LLL

DB04729
(GENTAMICIN
C1A) 		Escherichia coli AMINOGLYCOSIDE
N(3)-ACETYLTRANSFERA
SE, AAC(3)-IVA 		None 7 ASP B  67
ARG B 168
TYR B 183
GLU B 185
ASP B 187
CYS B 190
GLU B 249
 LLL B 301
6MN5_C_LLLC301 6mn5 LLL

DB04729
(GENTAMICIN
C1A) 		Escherichia coli AMINOGLYCOSIDE
N(3)-ACETYLTRANSFERA
SE, AAC(3)-IVA 		None 6 ASP C  67
TYR C 183
GLU C 185
ASP C 187
CYS C 190
GLU C 249
 LLL C 301
6MN5_D_LLLD301 6mn5 LLL

DB04729
(GENTAMICIN
C1A) 		Escherichia coli AMINOGLYCOSIDE
N(3)-ACETYLTRANSFERA
SE, AAC(3)-IVA 		None 6 ASP D  67
ARG D 168
GLU D 185
ASP D 187
CYS D 190
GLU D 249
 LLL D 301
6MN5_E_LLLE301 6mn5 LLL

DB04729
(GENTAMICIN
C1A) 		Escherichia coli AMINOGLYCOSIDE
N(3)-ACETYLTRANSFERA
SE, AAC(3)-IVA 		None 7 ASP E  67
ARG E 168
TYR E 183
GLU E 185
ASP E 187
CYS E 190
GLU E 249
 LLL E 301
6MN5_F_LLLF301 6mn5 LLL

DB04729
(GENTAMICIN
C1A) 		Escherichia coli AMINOGLYCOSIDE
N(3)-ACETYLTRANSFERA
SE, AAC(3)-IVA 		None 5 ASP F  67
TYR F 183
GLU F 185
ASP F 187
CYS F 190
 LLL F 301
6MXT_A_K5YA1401 6mxt K5Y

DB00938
(Salmeterol) 		Homo sapiens;
Escherichia virus
T4 		ENDOLYSIN, BETA-2
ADRENERGIC RECEPTOR
CHIMERA 		PF00001
(Phage_lysozyme)
PF00959
(7tm_1) 		15 TRP A1109
ASP A1113
VAL A1114
VAL A1117
ASP A1192
PHE A1193
SER A1203
SER A1207
PHE A1289
ASN A1293
HIS A1296
TYR A1308
ILE A1309
ASN A1312
TYR A1316
 K5Y A1401
7DFR_A_FOLA161 7dfr FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Escherichia coli DIHYDROFOLATE
REDUCTASE 		PF00186
(DHFR_1) 		15 ILE A   5
ALA A   7
MET A  20
ASP A  27
LEU A  28
TRP A  30
PHE A  31
LYS A  32
THR A  46
ILE A  50
LEU A  54
ARG A  57
ILE A  94
TYR A 100
THR A 113
 FOL A 161