DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'Aquifex aeolicus'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1C3S_A_SHHA952 1c3s SHH

DB02546
(Vorinostat) 		Aquifex aeolicus HDLP (HISTONE
DEACETYLASE-LIKE
PROTEIN) 		PF00850
(Hist_deacetyl) 		11 PRO A  22
TYR A  91
HIS A 131
HIS A 132
PHE A 141
ASP A 168
HIS A 170
PHE A 198
ASP A 258
LEU A 265
TYR A 297
 SHH A 952
2EGV_A_SAMA1300 2egv SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Aquifex aeolicus UPF0088 PROTEIN
AQ_165 		None
PF04452
(Methyltrans_RNA) 		13 GLN B 133
LEU A 161
ASN A 163
PHE A 164
VAL A 184
GLY A 185
GLY A 189
LEU A 207
LEU A 208
THR A 212
LEU A 213
THR A 215
ALA A 218
 SAM A1300
2EGV_B_SAMB1400 2egv SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Aquifex aeolicus UPF0088 PROTEIN
AQ_165 		None 12 LEU B 161
ASN B 163
PHE B 164
VAL B 184
GLY B 185
GLY B 189
LEU B 207
LEU B 208
THR B 212
LEU B 213
THR B 215
ALA B 218
 SAM B1400
2Q6H_A_CXXA801 2q6h CXX

DB01242
(Clomipramine) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER PF00209
(SNF) 		11 LEU A  25
LEU A  29
ARG A  30
VAL A  33
GLN A  34
ILE A 111
PHE A 253
PHE A 320
LEU A 400
ASP A 401
ASP A 404
 CXX A 801
2Q6H_A_CXXA802 2q6h CXX

DB01242
(Clomipramine) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER PF00209
(SNF) 		7 ILE A 178
SER A 181
ARG A 185
ARG A 193
PHE A 194
ILE A 197
PHE A 350
 CXX A 802
2Q72_A_IXXA801 2q72 IXX

DB00458
(Imipramine) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER PF00209
(SNF) 		11 LEU A  25
LEU A  29
ARG A  30
VAL A  33
GLN A  34
ILE A 111
PHE A 253
ALA A 319
LEU A 400
ASP A 401
ASP A 404
 IXX A 801
2Q72_A_IXXA802 2q72 IXX

DB00458
(Imipramine) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER PF00209
(SNF) 		6 ILE A 178
SER A 181
ARG A 185
ARG A 193
ILE A 197
PHE A 350
 IXX A 802
2QB4_A_DSMA801 2qb4 DSM

DB01151
(Desipramine) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER PF00209
(SNF) 		12 LEU A  25
LEU A  29
ARG A  30
VAL A  33
GLN A  34
ILE A 111
PHE A 253
ALA A 319
PHE A 320
LEU A 400
ASP A 401
ASP A 404
 DSM A 801
2QB4_A_DSMA802 2qb4 DSM

DB01151
(Desipramine) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER PF00209
(SNF) 		7 ILE A 178
SER A 181
ARG A 185
ARG A 193
PHE A 194
ILE A 197
PHE A 350
 DSM A 802
2QEI_A_CXXA801 2qei CXX

DB01242
(Clomipramine) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER PF00209
(SNF) 		11 LEU A  25
LEU A  29
ARG A  30
VAL A  33
GLN A  34
ILE A 111
PHE A 253
PHE A 320
LEU A 400
ASP A 401
ASP A 404
 CXX A 801
2QEI_A_CXXA802 2qei CXX

DB01242
(Clomipramine) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER PF00209
(SNF) 		6 SER A 181
ARG A 185
ARG A 193
PHE A 194
ILE A 197
PHE A 350
 CXX A 802
2QJU_A_DSMA801 2qju DSM

DB01151
(Desipramine) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER PF00209
(SNF) 		11 LEU A  25
LEU A  29
ARG A  30
GLN A  34
ILE A 111
PHE A 253
ALA A 319
PHE A 320
LEU A 400
ASP A 401
ASP A 404
 DSM A 801
2YVL_A_SAMA601 2yvl SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Aquifex aeolicus HYPOTHETICAL PROTEIN PF08704
(GCD14) 		16 THR A  72
ILE A  74
ILE A  75
GLY A  99
GLY A 101
SER A 102
ALA A 104
LEU A 105
GLU A 120
ALA A 121
VAL A 122
ASP A 148
PHE A 149
ASP A 165
VAL A 166
TYR A 172
 SAM A 601
2YVL_B_SAMB602 2yvl SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Aquifex aeolicus HYPOTHETICAL PROTEIN None 15 THR B  72
ILE B  74
ILE B  75
GLY B  99
GLY B 101
ALA B 104
LEU B 105
GLU B 120
ALA B 121
VAL B 122
ASP B 148
PHE B 149
ASP B 165
VAL B 166
TYR B 172
 SAM B 602
2YVL_C_SAMC604 2yvl SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Aquifex aeolicus HYPOTHETICAL PROTEIN None 16 THR C  72
ILE C  74
ILE C  75
GLY C  99
GLY C 101
SER C 102
ALA C 104
LEU C 105
GLU C 120
ALA C 121
VAL C 122
ASP C 148
PHE C 149
ASP C 165
VAL C 166
TYR C 172
 SAM C 604
2YVL_D_SAMD603 2yvl SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Aquifex aeolicus HYPOTHETICAL PROTEIN None 14 THR D  72
ILE D  75
GLY D  99
GLY D 101
ALA D 104
LEU D 105
GLU D 120
ALA D 121
VAL D 122
ASP D 148
PHE D 149
ASP D 165
VAL D 166
TYR D 172
 SAM D 603
3AXT_A_SAMA397 3axt SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Aquifex aeolicus PROBABLE
N(2),N(2)-DIMETHYLGU
ANOSINE TRNA
METHYLTRANSFERASE
TRM1 		PF02005
(TRM) 		12 ARG A  36
LEU A  60
ALA A  62
ILE A  65
ARG A  66
ASP A  84
ILE A  85
SER A  86
GLU A 113
ALA A 114
ASP A 132
PHE A 134
 SAM A 397
3DH0_A_SAMA220 3dh0 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Aquifex aeolicus SAM DEPENDENT
METHYLTRANSFERASE 		PF13847
(Methyltransf_31) 		20 LYS A   6
PHE A   7
LEU A  15
ARG A  20
VAL A  44
GLY A  45
GLY A  47
PHE A  50
TYR A  51
ASP A  69
VAL A  70
GLN A  71
MET A  74
SER A  95
GLU A  97
ALA A 113
PHE A 114
THR A 115
GLU A 118
LEU A 119
 SAM A 220
3DH0_B_SAMB300 3dh0 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Aquifex aeolicus SAM DEPENDENT
METHYLTRANSFERASE 		None 17 LYS B   6
PHE B   7
LEU B  15
ARG B  20
GLY B  45
GLY B  47
PHE B  50
TYR B  51
ASP B  69
VAL B  70
GLN B  71
MET B  74
GLU B  97
ALA B 113
THR B 115
GLU B 118
LEU B 119
 SAM B 300
3GWU_A_SREA801 3gwu SRE

DB01104
(Sertraline) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER PF00209
(SNF) 		12 LEU A  25
LEU A  29
ARG A  30
GLN A  34
TYR A 108
PHE A 253
ALA A 319
PHE A 320
LEU A 400
ASP A 401
ASP A 404
THR A 409
 SRE A 801
3GWV_A_RFXA801 3gwv RFX

DB00472
(Fluoxetine) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER PF00209
(SNF) 		12 LEU A  25
GLY A  26
LEU A  29
ARG A  30
GLN A  34
TYR A 108
ILE A 111
PHE A 253
ALA A 319
LEU A 400
ASP A 401
ASP A 404
 RFX A 801
3GWW_A_SFXA801 3gww SFX

DB00472
(Fluoxetine) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER PF00209
(SNF) 		12 LEU A  25
GLY A  26
LEU A  29
ARG A  30
GLN A  34
TYR A 108
ILE A 111
PHE A 253
ALA A 319
PHE A 320
ASP A 401
ASP A 404
 SFX A 801
3QWU_A_ADNA501 3qwu ADN

DB00640
(Adenosine) 		Aquifex aeolicus DNA LIGASE PF09414
(RNA_ligase) 		12 TYR A  51
ILE A  54
GLU A  75
LYS A  77
ASN A  82
ARG A  97
GLU A 129
PHE A 154
VAL A 182
VAL A 214
LYS A 216
LYS A 226
 ADN A 501
3QWU_B_ADNB501 3qwu ADN

DB00640
(Adenosine) 		Aquifex aeolicus DNA LIGASE no annotation 11 TYR B  51
ILE B  54
GLU B  75
LYS B  77
ASN B  82
ARG B  97
GLU B 129
PHE B 154
VAL B 182
VAL B 214
LYS B 216
 ADN B 501
3R2C_A_ACTA153 3r2c ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Aquifex aeolicus N UTILIZATION
SUBSTANCE PROTEIN B 		PF01029
(NusB) 		4 ASN A  24
GLY A  26
GLU A  27
LYS A  30
 ACT A 153
3R9W_A_ACTA506 3r9w ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Aquifex aeolicus GTPASE ERA PF01926
(MMR_HSR1)
PF07650
(KH_2) 		4 GLU A  64
GLU A 105
ASN A 109
PHE A 110
 ACT A 506
3R9X_B_ACTB502 3r9x ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Aquifex aeolicus RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE A 		PF00398
(RrnaAD) 		4 LYS B 130
GLU B 134
GLN B 137
TYR B 157
 ACT B 502
3VYW_A_SAMA501 3vyw SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Aquifex aeolicus MNMC2 PF05430
(Methyltransf_30) 		18 TYR A  63
TYR A  67
HIS A  68
GLY A 104
GLY A 106
LEU A 107
TYR A 109
ASN A 110
GLU A 133
LYS A 134
GLU A 135
ASP A 174
ALA A 175
ASP A 193
PHE A 195
ASN A 200
GLU A 202
LEU A 203
 SAM A 501
3VYW_B_SAMB401 3vyw SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Aquifex aeolicus MNMC2 None 16 TYR B  67
HIS B  68
GLY B 104
GLY B 106
LEU B 107
TYR B 109
ASN B 110
GLU B 133
LYS B 134
ASP B 174
ALA B 175
ASP B 193
PHE B 195
ASN B 200
GLU B 202
LEU B 203
 SAM B 401
3VYW_C_SAMC401 3vyw SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Aquifex aeolicus MNMC2 None 18 TYR C  63
TYR C  67
HIS C  68
GLY C 104
GLY C 106
LEU C 107
GLY C 108
TYR C 109
ASN C 110
GLU C 133
LYS C 134
ASP C 174
ALA C 175
ASP C 193
PHE C 195
ASN C 200
GLU C 202
LEU C 203
 SAM C 401
3VYW_D_SAMD401 3vyw SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Aquifex aeolicus MNMC2 None 17 TYR D  63
TYR D  67
HIS D  68
GLY D 104
GLY D 106
LEU D 107
TYR D 109
ASN D 110
GLU D 133
LYS D 134
ASP D 174
ALA D 175
ASP D 193
PHE D 195
ASN D 200
GLU D 202
LEU D 203
 SAM D 401
4MM4_A_8PRA603 4mm4 8PR

DB00715
(Paroxetine) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER PF00209
(SNF) 		14 TYR A  21
ASP A  24
VAL A 104
ALA A 105
TYR A 107
TYR A 108
PHE A 253
PHE A 259
SER A 355
SER A 356
GLY A 359
MET A 360
ASP A 404
THR A 408
 8PR A 603
4MM4_B_8PRB603 4mm4 8PR

DB00715
(Paroxetine) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER no annotation 15 TYR B  21
ASP B  24
VAL B 104
ALA B 105
TYR B 107
TYR B 108
VAL B 109
PHE B 253
PHE B 259
SER B 355
SER B 356
GLY B 359
MET B 360
ASP B 404
THR B 408
 8PR B 603
4MM5_A_SREA603 4mm5 SRE

DB01104
(Sertraline) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER PF00209
(SNF) 		9 ASP A  24
PRO A 101
VAL A 104
ALA A 105
TYR A 108
GLY A 256
PHE A 259
SER A 355
GLY A 359
 SRE A 603
4MM6_A_29EA603 4mm6 29E

DB00476
(Duloxetine) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER PF00209
(SNF) 		14 TYR A  21
ASP A  24
PRO A 101
VAL A 104
ALA A 105
TYR A 107
TYR A 108
PHE A 253
PHE A 259
VAL A 261
SER A 355
SER A 356
GLY A 359
THR A 408
 29E A 603
4MM7_A_29JA603 4mm7 29J

DB06700
(Desvenlafaxine) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER PF00209
(SNF) 		10 TYR A  21
ASP A  24
VAL A 104
TYR A 107
TYR A 108
PHE A 259
SER A 355
GLY A 359
ASP A 404
THR A 408
 29J A 603
4MM8_A_RFXA603 4mm8 RFX

DB00472
(Fluoxetine) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER PF00209
(SNF) 		12 TYR A  21
ASP A  24
VAL A 104
ALA A 105
TYR A 107
TYR A 108
GLY A 256
PHE A 259
SER A 356
GLY A 359
ASP A 404
THR A 408
 RFX A 603
4MM9_A_FVXA603 4mm9 FVX

DB00176
(Fluvoxamine) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER PF00209
(SNF) 		11 TYR A  21
ASP A  24
VAL A 104
ALA A 105
TYR A 107
TYR A 108
GLY A 256
PHE A 259
SER A 355
GLY A 359
ASP A 404
 FVX A 603
4MMA_A_CXXA603 4mma CXX

DB01242
(Clomipramine) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER PF00209
(SNF) 		11 TYR A  21
ASP A  24
PRO A 101
VAL A 104
ALA A 105
TYR A 108
PHE A 259
SER A 355
SER A 356
GLY A 359
THR A 408
 CXX A 603
4MMB_A_SREA603 4mmb SRE

DB01104
(Sertraline) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER PF00209
(SNF) 		9 ASP A  24
PRO A 101
VAL A 104
ALA A 105
TYR A 108
GLY A 256
PHE A 259
SER A 355
GLY A 359
 SRE A 603
4MMC_A_29JA603 4mmc 29J

DB06700
(Desvenlafaxine) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER PF00209
(SNF) 		10 TYR A  21
ASP A  24
VAL A 104
TYR A 107
TYR A 108
GLY A 256
PHE A 259
SER A 355
GLY A 359
ASP A 404
 29J A 603
4MMC_A_29JA604 4mmc 29J

DB06700
(Desvenlafaxine) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER PF00209
(SNF) 		7 ARG A  30
ILE A 111
PHE A 320
LEU A 400
ASP A 401
ASP A 404
THR A 409
 29J A 604
4MMD_A_29EA603 4mmd 29E

DB00476
(Duloxetine) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER PF00209
(SNF) 		10 TYR A  21
ASP A  24
PRO A 101
VAL A 104
ALA A 105
TYR A 108
GLY A 256
PHE A 259
SER A 356
GLY A 359
 29E A 603
4MMD_B_29EB603 4mmd 29E

DB00476
(Duloxetine) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER no annotation 12 TYR B  21
ASP B  24
PRO B 101
VAL B 104
ALA B 105
TYR B 107
TYR B 108
GLY B 256
PHE B 259
SER B 355
SER B 356
GLY B 359
 29E B 603
4MME_A_29QA603 4mme 29Q

DB00579
(Mazindol) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER PF00209
(SNF) 		9 TYR A  21
ASP A  24
VAL A 104
ALA A 105
TYR A 108
GLY A 256
PHE A 259
SER A 355
GLY A 359
 29Q A 603
4MME_B_29QB603 4mme 29Q

DB00579
(Mazindol) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER no annotation 9 TYR B  21
ASP B  24
VAL B 104
ALA B 105
TYR B 108
GLY B 256
PHE B 259
SER B 355
GLY B 359
 29Q B 603
4MMF_A_29QA603 4mmf 29Q

DB00579
(Mazindol) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER PF00209
(SNF) 		9 TYR A  21
ASP A  24
VAL A 104
ALA A 105
TYR A 108
GLY A 256
PHE A 259
SER A 355
GLY A 359
 29Q A 603
4MMF_B_29QB603 4mmf 29Q

DB00579
(Mazindol) 		Aquifex aeolicus TRANSPORTER no annotation 9 TYR B  21
ASP B  24
VAL B 104
ALA B 105
TYR B 108
GLY B 256
PHE B 259
SER B 355
GLY B 359
 29Q B 603