DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'PHOSPHODIESTERASE'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1RFF_A_SPMA700 1rff SPM

DB00127
(Spermine) 		;
Homo sapiens 		TOPOISOMERASE
I-DERIVED PEPTIDE;
TYROSYL-DNA
PHOSPHODIESTERASE 1 		PF06087
(Tyr-DNA_phospho)
no annotation 		4 ASN A 591
TRP A 605
VAL A 606
TYR C 724
 SPM A 700
1RFF_B_SPMB700 1rff SPM

DB00127
(Spermine) 		Homo sapiens TYROSYL-DNA
PHOSPHODIESTERASE 1 		no annotation 4 ASN B 591
ASN B 603
TRP B 605
PRO B 607
 SPM B 700
1RFI_A_SPMA999 1rfi SPM

DB00127
(Spermine) 		;
Homo sapiens 		TOPOISOMERASE
I-DERIVED PEPTIDE;
TYROSYL-DNA
PHOSPHODIESTERASE 1 		PF06087
(Tyr-DNA_phospho)
no annotation 		5 TRP A 590
TRP A 605
VAL A 606
PRO A 607
LYS C 724
 SPM A 999
1RG1_A_SPMA999 1rg1 SPM

DB00127
(Spermine) 		Homo sapiens TYROSYL-DNA
PHOSPHODIESTERASE 1 		PF06087
(Tyr-DNA_phospho) 		3 TRP A 605
VAL A 606
PRO A 607
 SPM A 999
1RG2_A_SPMA999 1rg2 SPM

DB00127
(Spermine) 		Homo sapiens TYROSYL-DNA
PHOSPHODIESTERASE 1 		PF06087
(Tyr-DNA_phospho) 		5 TRP A 590
ASN A 591
TRP A 605
VAL A 606
PRO A 607
 SPM A 999
1RGU_A_SPMA999 1rgu SPM

DB00127
(Spermine) 		Homo sapiens TYROSYL-DNA
PHOSPHODIESTERASE 1 		PF06087
(Tyr-DNA_phospho) 		5 TRP A 590
ASN A 591
TRP A 605
VAL A 606
PRO A 607
 SPM A 999
1RH0_A_SPMA999 1rh0 SPM

DB00127
(Spermine) 		Homo sapiens TYROSYL-DNA
PHOSPHODIESTERASE 1 		PF06087
(Tyr-DNA_phospho) 		3 TRP A 605
VAL A 606
PRO A 607
 SPM A 999
1TBF_A_VIAA501 1tbf VIA

DB00203
(Sildenafil) 		Homo sapiens CGMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 		PF00233
(PDEase_I) 		9 TYR A 612
LEU A 725
LEU A 765
VAL A 782
ALA A 783
LEU A 804
MET A 816
GLN A 817
PHE A 820
 VIA A 501
1UDT_A_VIAA1000 1udt VIA

DB00203
(Sildenafil) 		Homo sapiens CGMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 		PF00233
(PDEase_I) 		12 TYR A 612
HIS A 613
ASN A 661
TYR A 664
ALA A 767
ILE A 768
VAL A 782
ALA A 783
LEU A 804
MET A 816
GLN A 817
PHE A 820
 VIA A1000
1UDU_A_CIAA1003 1udu CIA

DB00820
(Tadalafil) 		Homo sapiens CGMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 		PF00233
(PDEase_I) 		11 TYR A 612
SER A 663
ILE A 778
VAL A 782
ALA A 783
PHE A 786
LEU A 804
ILE A 813
MET A 816
GLN A 817
PHE A 820
 CIA A1003
1UDU_B_CIAB2003 1udu CIA

DB00820
(Tadalafil) 		Homo sapiens CGMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 		no annotation 12 TYR B 612
ALA B 767
ILE B 768
GLN B 775
ILE B 778
VAL B 782
ALA B 783
PHE B 786
LEU B 804
MET B 816
GLN B 817
PHE B 820
 CIA B2003
1UHO_A_VDNA1000 1uho VDN

DB00862
(Vardenafil) 		Homo sapiens CGMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 		PF00233
(PDEase_I) 		10 TYR A 612
HIS A 613
TYR A 664
ALA A 783
PHE A 786
LEU A 804
MET A 816
GLN A 817
GLY A 819
PHE A 820
 VDN A1000
1XLX_A_CIOA101 1xlx CIO

DB03849
(Cilomilast) 		Homo sapiens CAMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 4B 		PF00233
(PDEase_I) 		12 TYR A 233
HIS A 234
HIS A 278
MET A 347
LEU A 393
ASN A 395
THR A 407
ILE A 410
MET A 411
SER A 442
GLN A 443
PHE A 446
 CIO A 101
1XLX_B_CIOB102 1xlx CIO

DB03849
(Cilomilast) 		Homo sapiens CAMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 4B 		no annotation 13 TYR B 233
HIS B 234
HIS B 278
MET B 347
ASN B 395
THR B 407
ILE B 410
MET B 411
PHE B 414
MET B 431
SER B 442
GLN B 443
PHE B 446
 CIO B 102
1XMU_A_ROFA101 1xmu ROF

DB01656
(Roflumilast) 		Homo sapiens CAMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 4B 		PF00233
(PDEase_I) 		17 TYR A 233
HIS A 234
MET A 347
ASP A 392
LEU A 393
ASN A 395
PRO A 396
TYR A 403
TRP A 406
THR A 407
ILE A 410
MET A 411
PHE A 414
MET A 431
SER A 442
GLN A 443
PHE A 446
 ROF A 101
1XMU_B_ROFB102 1xmu ROF

DB01656
(Roflumilast) 		Homo sapiens CAMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 4B 		PF00233
(PDEase_I) 		17 TYR B 233
HIS B 234
MET B 347
ASP B 392
LEU B 393
ASN B 395
PRO B 396
TYR B 403
TRP B 406
THR B 407
ILE B 410
MET B 411
PHE B 414
MET B 431
SER B 442
GLN B 443
PHE B 446
 ROF B 102
1XOM_A_CIOA603 1xom CIO

DB03849
(Cilomilast) 		Homo sapiens CAMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 4D 		PF00233
(PDEase_I) 		14 TYR A 159
HIS A 160
MET A 273
ASP A 318
LEU A 319
ASN A 321
THR A 333
ILE A 336
MET A 337
PHE A 340
MET A 357
SER A 368
GLN A 369
PHE A 372
 CIO A 603
1XOM_B_CIOB601 1xom CIO

DB03849
(Cilomilast) 		Homo sapiens CAMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 4D 		no annotation 13 TYR B 159
HIS B 160
MET B 273
LEU B 319
ASN B 321
THR B 333
ILE B 336
MET B 337
PHE B 340
MET B 357
SER B 368
GLN B 369
PHE B 372
 CIO B 601
1XOQ_A_ROFA502 1xoq ROF

DB01656
(Roflumilast) 		Homo sapiens CAMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 4D 		PF00233
(PDEase_I) 		15 TYR A 159
HIS A 160
MET A 273
ASP A 318
LEU A 319
ASN A 321
PRO A 322
TYR A 329
TRP A 332
THR A 333
ILE A 336
MET A 357
SER A 368
GLN A 369
PHE A 372
 ROF A 502
1XOQ_B_ROFB501 1xoq ROF

DB01656
(Roflumilast) 		Homo sapiens CAMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 4D 		None 15 TYR B 159
HIS B 160
MET B 273
ASP B 318
LEU B 319
ASN B 321
PRO B 322
TYR B 329
TRP B 332
THR B 333
ILE B 336
MET B 357
SER B 368
GLN B 369
PHE B 372
 ROF B 501
1XOS_A_VIAA1 1xos VIA

DB00203
(Sildenafil) 		Homo sapiens CAMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 4B 		PF00233
(PDEase_I) 		14 TYR A 233
HIS A 234
MET A 347
ASP A 392
LEU A 393
ASN A 395
ILE A 410
MET A 411
PHE A 414
SER A 429
MET A 431
GLN A 443
PHE A 446
ILE A 450
 VIA A   1
1XOT_A_VDNA101 1xot VDN

DB00862
(Vardenafil) 		Homo sapiens CAMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 4B 		PF00233
(PDEase_I) 		14 TYR A 233
HIS A 234
MET A 347
ASP A 392
LEU A 393
ASN A 395
ILE A 410
MET A 411
SER A 429
MET A 431
SER A 442
GLN A 443
PHE A 446
ILE A 450
 VDN A 101
1XOT_B_VDNB102 1xot VDN

DB00862
(Vardenafil) 		Homo sapiens CAMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 4B 		no annotation 12 TYR B 233
HIS B 234
MET B 347
LEU B 393
ASN B 395
ILE B 410
MET B 411
SER B 429
MET B 431
SER B 442
GLN B 443
PHE B 446
 VDN B 102
1XOZ_A_CIAA501 1xoz CIA

DB00820
(Tadalafil) 		Homo sapiens CGMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 		PF00233
(PDEase_I) 		12 TYR A 612
ALA A 767
ILE A 768
GLN A 775
ILE A 778
VAL A 782
PHE A 786
LEU A 804
ILE A 813
MET A 816
GLN A 817
PHE A 820
 CIA A 501
1XP0_A_VDNA201 1xp0 VDN

DB00862
(Vardenafil) 		Homo sapiens CGMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 		PF00233
(PDEase_I) 		10 TYR A 612
LEU A 765
ALA A 767
ILE A 768
VAL A 782
ALA A 783
LEU A 804
MET A 816
GLN A 817
PHE A 820
 VDN A 201
2H42_A_VIAA901 2h42 VIA

DB00203
(Sildenafil) 		Homo sapiens CGMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 		PF00233
(PDEase_I) 		11 TYR A 612
HIS A 613
ASN A 661
ALA A 767
ILE A 768
VAL A 782
PHE A 786
LEU A 804
ILE A 813
GLN A 817
PHE A 820
 VIA A 901
2H42_B_VIAB902 2h42 VIA

DB00203
(Sildenafil) 		Homo sapiens CGMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 		no annotation 12 TYR B 612
HIS B 613
ASN B 661
ALA B 767
ILE B 768
VAL B 782
ALA B 783
LEU B 804
ILE B 813
MET B 816
GLN B 817
PHE B 820
 VIA B 902
2H42_C_VIAC903 2h42 VIA

DB00203
(Sildenafil) 		Homo sapiens CGMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 		no annotation 15 TYR C 612
ASN C 661
ILE C 665
LEU C 725
LEU C 765
ALA C 767
ILE C 768
VAL C 782
ALA C 783
PHE C 786
LEU C 804
ILE C 813
MET C 816
GLN C 817
PHE C 820
 VIA C 903
2WEY_A_EV1A1771 2wey EV1

DB01113
(Papaverine) 		Homo sapiens CAMP AND
CAMP-INHIBITED CGMP
3', 5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 		PF00233
(PDEase_I) 		12 TYR A 524
HIS A 525
LEU A 635
LEU A 675
VAL A 678
ILE A 692
TYR A 693
GLU A 695
PHE A 696
MET A 713
GLN A 726
PHE A 729
 EV1 A1771
2WEY_B_EV1B1771 2wey EV1

DB01113
(Papaverine) 		Homo sapiens CAMP AND
CAMP-INHIBITED CGMP
3', 5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 		no annotation 8 LEU B 635
VAL B 678
ILE B 692
TYR B 693
PHE B 696
MET B 713
GLN B 726
PHE B 729
 EV1 B1771
3B2R_A_VDNA1 3b2r VDN

DB00862
(Vardenafil) 		Homo sapiens CGMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 		PF00233
(PDEase_I) 		13 TYR A 612
HIS A 613
CYS A 677
ILE A 680
LEU A 765
ALA A 767
ILE A 768
VAL A 782
PHE A 786
ILE A 813
MET A 816
GLN A 817
PHE A 820
 VDN A   1
3B2R_B_VDNB1 3b2r VDN

DB00862
(Vardenafil) 		Homo sapiens CGMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 		no annotation 11 TYR B 612
HIS B 613
ILE B 680
LEU B 765
ALA B 767
ILE B 768
VAL B 782
ILE B 813
MET B 816
GLN B 817
PHE B 820
 VDN B   1
3G4L_A_ROFA901 3g4l ROF

DB01656
(Roflumilast) 		Homo sapiens CAMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 4D 		PF00233
(PDEase_I) 		15 TYR A 325
HIS A 326
MET A 439
ASP A 484
LEU A 485
ASN A 487
PRO A 488
TYR A 495
TRP A 498
THR A 499
ILE A 502
MET A 523
SER A 534
GLN A 535
PHE A 538
 ROF A 901
3G4L_B_ROFB902 3g4l ROF

DB01656
(Roflumilast) 		Homo sapiens CAMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 4D 		None 14 TYR B 325
HIS B 326
MET B 439
ASP B 484
LEU B 485
ASN B 487
PRO B 488
TRP B 498
THR B 499
ILE B 502
MET B 503
MET B 523
GLN B 535
PHE B 538
 ROF B 902
3G4L_C_ROFC903 3g4l ROF

DB01656
(Roflumilast) 		Homo sapiens CAMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 4D 		None 15 TYR C 325
HIS C 326
MET C 439
ASP C 484
LEU C 485
ASN C 487
PRO C 488
TYR C 495
TRP C 498
THR C 499
ILE C 502
MET C 523
SER C 534
GLN C 535
PHE C 538
 ROF C 903
3G4L_D_ROFD904 3g4l ROF

DB01656
(Roflumilast) 		Homo sapiens CAMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 4D 		None 15 TYR D 325
HIS D 326
MET D 439
ASP D 484
LEU D 485
ASN D 487
PRO D 488
TRP D 498
THR D 499
ILE D 502
MET D 503
MET D 523
SER D 534
GLN D 535
PHE D 538
 ROF D 904
3IAK_A_EV1A415 3iak EV1

DB01113
(Papaverine) 		Homo sapiens CAMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 4D 		PF00233
(PDEase_I) 		9 TYR A 159
MET A 273
ASN A 321
ILE A 336
PHE A 340
MET A 357
GLN A 369
PHE A 372
ILE A 376
 EV1 A 415
3JWQ_A_VIAA901 3jwq VIA

DB00203
(Sildenafil) 		Homo sapiens CGMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE
CATALYTIC DOMAIN,
CONE CGMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE
SUBUNIT ALPHA
CHIMERA 		PF00233
(PDEase_I) 		9 TYR A 612
HIS A 613
LEU A 725
VAL A 782
MET A 804
LEU A 813
GLN A 817
PHE A 820
VAL A 824
 VIA A 901
3JWQ_B_VIAB901 3jwq VIA

DB00203
(Sildenafil) 		Homo sapiens CGMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE
CATALYTIC DOMAIN,
CONE CGMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE
SUBUNIT ALPHA
CHIMERA 		no annotation 11 TYR B 612
HIS B 613
ASN B 661
LEU B 725
ALA B 767
VAL B 782
THR C 795
MET B 804
LEU B 813
GLN B 817
PHE B 820
 VIA B 901
3JWQ_C_VIAC901 3jwq VIA

DB00203
(Sildenafil) 		Homo sapiens CGMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE
CATALYTIC DOMAIN,
CONE CGMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE
SUBUNIT ALPHA
CHIMERA 		no annotation 7 TYR C 612
HIS C 613
MET C 804
LEU C 813
GLN C 817
PHE C 820
VAL C 824
 VIA C 901
3JWQ_D_VIAD901 3jwq VIA

DB00203
(Sildenafil) 		Homo sapiens CGMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE
CATALYTIC DOMAIN,
CONE CGMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE
SUBUNIT ALPHA
CHIMERA 		PF00233
(PDEase_I)
no annotation 		11 TYR D 612
HIS D 613
LEU D 725
ALA D 767
PHE D 786
ARG A 794
GLN A 798
MET D 804
LEU D 813
GLN D 817
PHE D 820
 VIA D 901
3TVX_A_PNXA902 3tvx PNX

DB00806
(Pentoxifylline) 		Homo sapiens CAMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 4A 		PF00233
(PDEase_I) 		9 TYR A 371
LEU A 531
ASN A 533
PRO A 534
THR A 545
ILE A 548
MET A 569
GLN A 581
PHE A 584
 PNX A 902
3TVX_B_PNXB902 3tvx PNX

DB00806
(Pentoxifylline) 		Homo sapiens CAMP-SPECIFIC
3',5'-CYCLIC
PHOSPHODIESTERASE 4A 		no annotation 7 TYR B 371
ASN B 533
ILE B 548
PHE B 552
MET B 569
GLN B 581
PHE B 584
 PNX B 902
4I90_A_ACTA500 4i90 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Staphylococcus
aureus 		1-PHOSPHATIDYLINOSIT
OL PHOSPHODIESTERASE 		PF00388
(PI-PLC-X) 		3 LYS A 113
ARG A 166
TRP A 185
 ACT A 500
4I90_A_ACTA501 4i90 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Staphylococcus
aureus 		1-PHOSPHATIDYLINOSIT
OL PHOSPHODIESTERASE 		PF00388
(PI-PLC-X) 		5 LEU A  37
LYS A  38
ASP A  39
LYS A  42
HIS A  86
 ACT A 501
5DLV_A_5D5A930 5dlv 5D5

DB08834
(Tauroursodeoxycholic
acid) 		Rattus norvegicus ECTONUCLEOTIDE
PYROPHOSPHATASE/PHOS
PHODIESTERASE FAMILY
MEMBER 2 		PF01033
(Somatomedin_B)
PF01223
(Endonuclease_NS)
PF01663
(Somatomedin_B) 		18 LEU A  78
SER A  81
TYR A  82
ASP A 171
THR A 209
PHE A 210
LEU A 213
LYS A 248
PHE A 249
HIS A 251
TRP A 254
PRO A 258
TRP A 260
ILE A 261
PHE A 274
TRP A 275
ARG A 284
TYR A 306
 5D5 A 930
5DLV_B_5D5B927 5dlv 5D5

DB08834
(Tauroursodeoxycholic
acid) 		Rattus norvegicus ECTONUCLEOTIDE
PYROPHOSPHATASE/PHOS
PHODIESTERASE FAMILY
MEMBER 2 		None
PF01033
(Somatomedin_B)
PF01223
(Endonuclease_NS)
PF01663
(Somatomedin_B) 		20 LEU B  78
SER B  81
TYR B  82
ASP B 171
LYS A 183
THR B 209
PHE B 210
LEU B 213
LYS B 248
PHE B 249
HIS B 251
TRP B 254
PRO B 258
TRP B 260
ILE B 261
PHE B 274
TRP B 275
VAL B 277
ARG B 284
TYR B 306
 5D5 B 927
5DLW_A_5D5A905 5dlw 5D5

DB08834
(Tauroursodeoxycholic
acid) 		Rattus norvegicus ECTONUCLEOTIDE
PYROPHOSPHATASE/PHOS
PHODIESTERASE FAMILY
MEMBER 2 		PF01033
(Endonuclease_NS)
PF01223
(Somatomedin_B)
PF01663
(Phosphodiest) 		13 LEU A  78
SER A  81
TYR A  82
PHE A 210
ARG A 246
LYS A 248
PHE A 249
HIS A 251
TRP A 254
TRP A 260
PHE A 274
VAL A 277
TYR A 306
 5D5 A 905