DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'ALPHA-1'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
2X2I_A_QPSA1050 2x2i QPS

DB00284
(Acarbose)
Gracilariopsis
lemaneiformis
ALPHA-1,4-GLUCAN
LYASE ISOZYME 1
PF01055
(Glyco_hydro_31)
18 ASP A 239
LEU A 241
GLN A 245
PHE A 373
ASP A 412
VAL A 413
ASN A 459
TYR A 513
TRP A 551
ASP A 553
MET A 554
ARG A 649
TRP A 662
ASP A 665
PHE A 698
THR A 699
HIS A 731
HIS A 741
QPS A1050
2X2I_A_QPSA1060 2x2i QPS

DB00284
(Acarbose)
Gracilariopsis
lemaneiformis
ALPHA-1,4-GLUCAN
LYASE ISOZYME 1
PF01055
(Glyco_hydro_31)
12 THR A  24
VAL A  28
PHE A  33
SER A  34
SER A  37
THR A  39
ASN A  40
TRP A  41
VAL A 185
GLY A 190
ALA A 192
GLN A 318
QPS A1060
2X2I_B_QPSB1050 2x2i QPS

DB00284
(Acarbose)
Gracilariopsis
lemaneiformis
ALPHA-1,4-GLUCAN
LYASE ISOZYME 1
no annotation 18 ASP B 239
LEU B 241
GLN B 245
PHE B 373
ASP B 412
VAL B 413
ASN B 459
TYR B 513
TRP B 551
ASP B 553
MET B 554
ARG B 649
TRP B 662
ASP B 665
PHE B 698
THR B 699
HIS B 731
HIS B 741
QPS B1050
2X2I_B_QPSB1060 2x2i QPS

DB00284
(Acarbose)
Gracilariopsis
lemaneiformis
ALPHA-1,4-GLUCAN
LYASE ISOZYME 1
no annotation 10 THR B  24
VAL B  28
PHE B  33
SER B  34
SER B  37
ASN B  40
TRP B  41
GLY B 190
ALA B 192
GLN B 318
QPS B1060
2X2I_C_QPSC1050 2x2i QPS

DB00284
(Acarbose)
Gracilariopsis
lemaneiformis
ALPHA-1,4-GLUCAN
LYASE ISOZYME 1
no annotation 17 ASP C 239
LEU C 241
GLN C 245
PHE C 373
ASP C 412
VAL C 413
ASN C 459
TYR C 513
TRP C 551
ASP C 553
MET C 554
ARG C 649
TRP C 662
ASP C 665
PHE C 698
HIS C 731
HIS C 741
QPS C1050
2X2I_C_QPSC1060 2x2i QPS

DB00284
(Acarbose)
Gracilariopsis
lemaneiformis
ALPHA-1,4-GLUCAN
LYASE ISOZYME 1
no annotation 12 THR C  24
VAL C  28
PHE C  33
SER C  34
SER C  37
THR C  39
ASN C  40
TRP C  41
VAL C 185
GLY C 190
ALA C 192
GLN C 318
QPS C1060
2X2I_D_QPSD1050 2x2i QPS

DB00284
(Acarbose)
Gracilariopsis
lemaneiformis
ALPHA-1,4-GLUCAN
LYASE ISOZYME 1
no annotation 17 ASP D 239
LEU D 241
GLN D 245
PHE D 373
ASP D 412
VAL D 413
ASN D 459
TYR D 513
TRP D 551
ASP D 553
MET D 554
ARG D 649
TRP D 662
ASP D 665
PHE D 698
HIS D 731
HIS D 741
QPS D1050
2X2I_D_QPSD1060 2x2i QPS

DB00284
(Acarbose)
Gracilariopsis
lemaneiformis
ALPHA-1,4-GLUCAN
LYASE ISOZYME 1
no annotation 10 THR D  24
VAL D  28
PHE D  33
SER D  34
SER D  37
ASN D  40
TRP D  41
VAL D 185
GLY D 190
GLN D 318
QPS D1060
3APV_A_TP0A190 3apv TP0

DB00321
(Amitriptyline)
Homo sapiens ALPHA-1-ACID
GLYCOPROTEIN 2
PF00061
(Lipocalin)
12 TYR A  37
VAL A  41
PHE A  49
PHE A  51
LEU A  62
GLU A  64
ARG A  90
HIS A  97
ALA A  99
SER A 114
SER A 125
TYR A 127
TP0 A 190
3APV_B_TP0B190 3apv TP0

DB00321
(Amitriptyline)
Homo sapiens ALPHA-1-ACID
GLYCOPROTEIN 2
no annotation 12 PHE B  32
TYR B  37
VAL B  41
PHE B  49
PHE B  51
LEU B  62
GLU B  64
ARG B  90
HIS B  97
ALA B  99
SER B 125
TYR B 127
TP0 B 190
3APW_A_DP0A190 3apw DP0

DB00280
(Disopyramide)
Homo sapiens ALPHA-1-ACID
GLYCOPROTEIN 2
PF00061
(Lipocalin)
16 TYR A  27
PHE A  32
TYR A  37
VAL A  41
ILE A  44
PHE A  49
PHE A  51
GLU A  64
VAL A  88
ARG A  90
HIS A  97
ALA A  99
PHE A 112
SER A 114
SER A 125
TYR A 127
DP0 A 190
3APW_B_DP0B190 3apw DP0

DB00280
(Disopyramide)
Homo sapiens ALPHA-1-ACID
GLYCOPROTEIN 2
no annotation 14 VAL B  41
ILE B  44
PHE B  49
PHE B  51
LEU B  62
GLU B  64
GLN B  66
VAL B  88
ARG B  90
HIS B  97
ALA B  99
PHE B 112
SER B 125
TYR B 127
DP0 B 190
3APX_A_Z80A190 3apx Z80

DB00477
(Chlorpromazine)
Homo sapiens ALPHA-1-ACID
GLYCOPROTEIN 2
PF00061
(Lipocalin)
14 PHE A  32
VAL A  41
THR A  47
PHE A  49
PHE A  51
GLU A  64
LEU A  79
VAL A  88
ARG A  90
GLU A  92
HIS A  97
ALA A  99
PHE A 112
TYR A 127
Z80 A 190
3E22_B_LOCB700 3e22 LOC

DB01394
(Colchicine)
Bos taurus TUBULIN ALPHA-1C
CHAIN;
TUBULIN BETA-2B
CHAIN
PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C)
14 SER A 178
ALA A 180
VAL A 181
CYS B 241
LEU B 242
LEU B 248
ALA B 250
LYS B 254
LEU B 255
ASN B 258
MET B 259
ALA B 316
VAL B 318
LYS B 352
LOC B 700
3E22_D_LOCD700 3e22 LOC

DB01394
(Colchicine)
Bos taurus TUBULIN ALPHA-1C
CHAIN;
TUBULIN BETA-2B
CHAIN
no annotation 14 SER C 178
ALA C 180
VAL C 181
CYS D 241
LEU D 242
LEU D 248
ALA D 250
LYS D 254
LEU D 255
ASN D 258
MET D 259
ALA D 316
VAL D 318
LYS D 352
LOC D 700
3N23_A_OBNA1 3n23 OBN

DB01092
(Ouabain)
Sus scrofa SODIUM/POTASSIUM-TRA
NSPORTING ATPASE
SUBUNIT ALPHA-1
PF00122
(E1-E2_ATPase)
PF00689
(Cation_ATPase_C)
PF00690
(Cation_ATPase_N)
PF13246
(Cation_ATPase)
11 GLN A 111
PRO A 118
ASP A 121
ASN A 122
VAL A 322
ALA A 323
PHE A 783
PHE A 786
THR A 797
ILE A 800
ARG A 880
OBN A   1
3N23_C_OBNC1 3n23 OBN

DB01092
(Ouabain)
Sus scrofa SODIUM/POTASSIUM-TRA
NSPORTING ATPASE
SUBUNIT ALPHA-1
no annotation 11 GLN C 111
PRO C 118
ASP C 121
ASN C 122
LEU C 125
VAL C 322
ALA C 323
PHE C 783
PHE C 786
THR C 797
ARG C 880
OBN C   1
4HYT_A_OBNA1104 4hyt OBN

DB01092
(Ouabain)
Sus scrofa SODIUM/POTASSIUM-TRA
NSPORTING ATPASE
SUBUNIT ALPHA-1
PF00122
(E1-E2_ATPase)
PF00689
(Cation_ATPase_C)
PF00690
(Cation_ATPase_N)
PF13246
(Cation_ATPase)
17 GLN A 111
GLU A 117
PRO A 118
ASP A 121
ASN A 122
LEU A 125
GLU A 312
ILE A 315
GLY A 319
VAL A 322
ALA A 323
PHE A 783
PHE A 786
LEU A 793
THR A 797
ILE A 800
ARG A 880
OBN A1104
4HYT_C_OBNC2004 4hyt OBN

DB01092
(Ouabain)
Sus scrofa SODIUM/POTASSIUM-TRA
NSPORTING ATPASE
SUBUNIT ALPHA-1
no annotation 16 GLN C 111
GLU C 117
PRO C 118
ASP C 121
ASN C 122
LEU C 125
GLU C 312
ILE C 315
GLY C 319
ALA C 323
PHE C 783
PHE C 786
LEU C 793
THR C 797
ILE C 800
ARG C 880
OBN C2004
4O2B_B_LOCB503 4o2b LOC

DB01394
(Colchicine)
Bos taurus TUBULIN ALPHA-1B
CHAIN;
TUBULIN BETA-2B
CHAIN
PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C)
16 SER A 178
ALA A 180
VAL A 181
CYS B 241
LEU B 242
LEU B 248
ALA B 250
LYS B 254
LEU B 255
ASN B 258
MET B 259
THR B 314
ALA B 316
ILE B 318
LYS B 352
ILE B 378
LOC B 503
4O2B_D_LOCD503 4o2b LOC

DB01394
(Colchicine)
Bos taurus TUBULIN ALPHA-1B
CHAIN;
TUBULIN BETA-2B
CHAIN
no annotation 17 SER C 178
ALA C 180
VAL C 181
CYS D 241
LEU D 242
LEU D 248
ALA D 250
LYS D 254
LEU D 255
ASN D 258
MET D 259
THR D 314
ALA D 316
ILE D 318
LYS D 352
ALA D 354
ILE D 378
LOC D 503
4RET_A_DGXA1107 4ret DGX

DB00390
(Digoxin)
Sus scrofa SODIUM/POTASSIUM-TRA
NSPORTING ATPASE
SUBUNIT ALPHA-1
PF00122
(E1-E2_ATPase)
PF00689
(Cation_ATPase_C)
PF00690
(Cation_ATPase_N)
PF13246
(Cation_ATPase)
16 GLN A 111
ASP A 121
ASN A 122
LEU A 125
LEU A 311
GLU A 312
PHE A 316
GLY A 319
VAL A 322
ALA A 323
GLU A 327
PHE A 783
LEU A 793
THR A 797
ILE A 800
ARG A 880
DGX A1107
4RET_C_DGXC2005 4ret DGX

DB00390
(Digoxin)
Sus scrofa SODIUM/POTASSIUM-TRA
NSPORTING ATPASE
SUBUNIT ALPHA-1
no annotation 16 GLN C 111
GLU C 117
ASP C 121
ASN C 122
LEU C 125
LEU C 311
GLU C 312
GLY C 319
VAL C 322
ALA C 323
GLU C 327
PHE C 783
LEU C 793
THR C 797
ILE C 800
ARG C 880
DGX C2005
4XE5_A_OBNA1104 4xe5 OBN

DB01092
(Ouabain)
Bos taurus SODIUM/POTASSIUM-TRA
NSPORTING ATPASE
SUBUNIT ALPHA-1
PF00122
(E1-E2_ATPase)
PF00689
(Cation_ATPase_C)
PF00690
(Cation_ATPase_N)
PF00702
(Hydrolase)
PF13246
(Cation_ATPase)
18 GLN A 116
GLU A 121
GLU A 122
PRO A 123
ASP A 126
LEU A 130
GLU A 317
ILE A 320
GLY A 324
VAL A 327
ALA A 328
GLU A 332
PHE A 788
PHE A 791
THR A 802
ILE A 805
ARG A 885
ASP A 889
OBN A1104
5BMV_C_VLBC507 5bmv VLB

DB00570
(Vinblastine)
Bos taurus;
Sus scrofa
TUBULIN ALPHA-1B
CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN
PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C)
no annotation
13 LYS B 176
ASP B 179
TYR B 210
PRO B 222
TYR B 224
LEU B 227
PRO C 325
VAL C 328
ASN C 329
ILE C 332
PHE C 351
VAL C 353
ILE C 355
VLB C 507
5ITZ_B_LOCB502 5itz LOC

DB01394
(Colchicine)
Bos taurus TUBULIN ALPHA-1B
CHAIN;
TUBULIN BETA-2B
CHAIN
PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C)
15 ALA A 180
VAL A 181
CYS B 241
LEU B 242
LEU B 248
ALA B 250
LYS B 254
LEU B 255
ASN B 258
MET B 259
THR B 314
ALA B 316
ILE B 318
LYS B 352
ILE B 378
LOC B 502
5J2T_C_VLBC503 5j2t VLB

DB00570
(Vinblastine)
Bos taurus TUBULIN ALPHA-1B
CHAIN;
TUBULIN BETA-2B
CHAIN
PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C)
no annotation
21 LYS B 176
VAL B 177
ASP B 179
TYR B 210
PHE B 214
THR B 221
PRO B 222
TYR B 224
LEU B 227
LEU C 248
PRO C 325
LYS C 326
VAL C 328
ASN C 329
ILE C 332
ALA C 333
LYS C 336
PHE C 351
VAL C 353
GLY C 354
ILE C 355
VLB C 503
5JH7_B_6K9B503 5jh7 6K9

DB08871
(Eribulin)
Bos taurus TUBULIN ALPHA-1B
CHAIN;
TUBULIN BETA-2B
CHAIN
None
PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C)
18 GLN B  11
ASN B 101
VAL B 177
SER B 178
ASP B 179
THR B 180
GLU B 183
TYR B 210
PRO B 222
TYR B 224
LEU B 227
LEU C 248
VAL C 250
GLU C 254
ASN C 329
ILE C 332
LYS C 352
VAL C 353
6K9 B 503
5LRB_A_ACRA1003 5lrb ACR

DB00284
(Acarbose)
Hordeum vulgare ALPHA-1,4 GLUCAN
PHOSPHORYLASE
PF00343
(Phosphorylase)
6 GLU A 702
PHE A 744
THR A 746
TYR A 747
TYR A 900
PHE A 906
ACR A1003
5LRB_B_ACRB1003 5lrb ACR

DB00284
(Acarbose)
Hordeum vulgare ALPHA-1,4 GLUCAN
PHOSPHORYLASE
no annotation 9 GLU B 333
GLU B 702
PHE B 744
THR B 746
TYR B 747
TYR B 900
GLY B 901
TYR B 905
PHE B 906
ACR B1003
5MIO_B_LOCB502 5mio LOC

DB01394
(Colchicine)
Bos taurus;
Ovis aries
TUBULIN ALPHA-1B
CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN
PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C)
15 ALA A 180
VAL A 181
CYS B 241
LEU B 242
LEU B 248
ALA B 250
LYS B 254
LEU B 255
ASN B 258
MET B 259
THR B 314
ALA B 316
ILE B 318
LYS B 352
ILE B 378
LOC B 502
5NM5_B_LOCB502 5nm5 LOC

DB01394
(Colchicine)
Bos taurus TUBULIN ALPHA-1B
CHAIN;
TUBULIN BETA-2B
CHAIN
PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C)
18 ASN A 101
SER A 178
ALA A 180
VAL A 181
CYS B 241
LEU B 242
LEU B 248
ALA B 250
LYS B 254
LEU B 255
ASN B 258
MET B 259
THR B 314
ALA B 316
ILE B 318
LYS B 352
ALA B 354
ILE B 378
LOC B 502
5OM2_B_DXTB501 5om2 DXT

DB00254
(Doxycycline)
Homo sapiens ALPHA-1-ANTICHYMOTRY
PSIN
no annotation 9 VAL A  31
LEU A 273
ALA A 274
PHE A 277
ASP A 278
VAL B 381
HIS B 383
TRP B 386
ILE B 388
DXT B 501
5OM3_B_DXTB501 5om3 DXT

DB00254
(Doxycycline)
Homo sapiens ALPHA-1-ANTICHYMOTRY
PSIN
no annotation 6 LEU A 273
SER A 274
PHE A 277
ASP A 278
HIS B 383
TRP B 386
DXT B 501
5OM7_A_DM2A501 5om7 DM2

DB00445
(Epirubicin)
DB00997
(Doxorubicin)
Homo sapiens ALPHA-1-ANTICHYMOTRY
PSIN
no annotation 11 VAL A  31
GLN A 242
ASN A 244
GLN A 270
LEU A 273
SER A 274
PHE A 277
GLU A 278
VAL B 381
ASN B 383
TRP B 386
DM2 A 501
5XIW_B_LOCB504 5xiw LOC

DB01394
(Colchicine)
Sus scrofa TUBULIN ALPHA-1B
CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN
no annotation 17 SER A 178
ALA A 180
VAL A 181
CYS B 239
LEU B 240
LEU B 246
ALA B 248
LYS B 252
LEU B 253
ASN B 256
MET B 257
THR B 312
ALA B 314
ILE B 316
LYS B 350
ALA B 352
ILE B 368
LOC B 504
5XIW_D_LOCD503 5xiw LOC

DB01394
(Colchicine)
Sus scrofa TUBULIN ALPHA-1B
CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN
no annotation 17 SER C 178
ALA C 180
VAL C 181
CYS D 239
LEU D 240
LEU D 246
ALA D 248
LYS D 252
LEU D 253
ASN D 256
MET D 257
THR D 312
ALA D 314
ILE D 316
LYS D 350
ALA D 352
ILE D 368
LOC D 503
6D6T_D_FYPD406 6d6t FYP

DB01205
(Flumazenil)
Homo sapiens GAMMA-AMINOBUTYRIC
ACID RECEPTOR
SUBUNIT
ALPHA-1,GAMMA-AMINOB
UTYRIC ACID RECEPTOR
SUBUNIT ALPHA-1;
HUMAN GABA-A
RECEPTOR SUBUNIT
GAMMA-2
None 11 ASP E  56
TYR E  58
PHE E  77
ALA E  79
HIS D 102
THR E 142
TYR D 160
SER D 205
SER D 206
THR D 207
TYR D 210
FYP D 406
6D6U_D_FYPD410 6d6u FYP

DB01205
(Flumazenil)
Homo sapiens GAMMA-AMINOBUTYRIC
ACID RECEPTOR
SUBUNIT
ALPHA-1,GAMMA-AMINOB
UTYRIC ACID RECEPTOR
SUBUNIT ALPHA-1;
GAMMA-AMINOBUTYRIC
ACID RECEPTOR
SUBUNIT
GAMMA-2,GAMMA-AMINOB
UTYRIC ACID RECEPTOR
SUBUNIT GAMMA-2
None
PF02931
(Neur_chan_LBD)
PF02932
(Neur_chan_memb)
9 ASP E  56
TYR E  58
ALA E  79
HIS D 102
THR E 142
TYR D 160
SER D 205
SER D 206
TYR D 210
FYP D 410
6FTP_B_DM2B501 6ftp DM2

DB00445
(Epirubicin)
DB00997
(Doxorubicin)
Homo sapiens ALPHA-1-ANTICHYMOTRY
PSIN
no annotation 9 GLN A 242
LEU A 273
SER A 274
PHE A 277
GLU A 278
LEU A 280
VAL B 381
ASN B 383
TRP B 386
DM2 B 501
6HUO_D_08HD501 6huo 08H

DB00404
(Alprazolam)
Homo sapiens;
Homo sapiens;
Bos taurus
GAMMA-AMINOBUTYRIC
ACID RECEPTOR
SUBUNIT
ALPHA-1,GAMMA-AMINOB
UTYRIC ACID RECEPTOR
SUBUNIT ALPHA-1;
GAMMA-AMINOBUTYRIC
ACID RECEPTOR
SUBUNIT GAMMA-2
None
PF02931
(Neur_chan_LBD)
PF02932
(Neur_chan_memb)
8 TYR C  58
ASN C  60
PHE C  77
PHE D 100
HIS D 102
VAL D 203
SER D 205
TYR D 210
08H D 501
6HUP_B_DZPB502 6hup DZP

DB00829
(Diazepam)
Homo sapiens;
Homo sapiens;
Bos taurus
GAMMA-AMINOBUTYRIC
ACID RECEPTOR
SUBUNIT
ALPHA-1,GAMMA-AMINOB
UTYRIC ACID RECEPTOR
SUBUNIT ALPHA-1;
GAMMA-AMINOBUTYRIC
ACID RECEPTOR
SUBUNIT BETA-3
PF02931
(Neur_chan_LBD)
PF02932
(Neur_chan_memb)
11 ILE A 228
LEU A 232
PRO A 233
MET A 236
THR A 237
MET B 261
THR B 262
ASN B 265
LEU B 285
MET B 286
PHE B 289
DZP B 502
6HUP_D_DZPD2001 6hup DZP

DB00829
(Diazepam)
Homo sapiens;
Homo sapiens;
Bos taurus
GAMMA-AMINOBUTYRIC
ACID RECEPTOR
SUBUNIT
ALPHA-1,GAMMA-AMINOB
UTYRIC ACID RECEPTOR
SUBUNIT ALPHA-1;
GAMMA-AMINOBUTYRIC
ACID RECEPTOR
SUBUNIT GAMMA-2
None
PF02931
(Neur_chan_memb)
PF02932
(Neur_chan_LBD)
9 TYR C  58
ASN C  60
PHE C  77
PHE D 100
HIS D 102
TYR D 160
VAL D 203
SER D 205
TYR D 210
DZP D2001
6HUP_E_DZPE502 6hup DZP

DB00829
(Diazepam)
Homo sapiens;
Homo sapiens;
Bos taurus
GAMMA-AMINOBUTYRIC
ACID RECEPTOR
SUBUNIT
ALPHA-1,GAMMA-AMINOB
UTYRIC ACID RECEPTOR
SUBUNIT ALPHA-1;
GAMMA-AMINOBUTYRIC
ACID RECEPTOR
SUBUNIT BETA-3
None 10 LEU D 232
PRO D 233
MET D 236
MET E 261
THR E 262
ASN E 265
LEU D 269
LEU E 285
MET E 286
PHE E 289
DZP E 502