DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'TRANSCRIPTIONAL REGULATOR'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1JTX_A_CVIA200 1jtx CVI

DB00406
(Gentian
Violet) 		Staphylococcus
aureus 		HYPOTHETICAL
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR IN QACA
5'REGION 		None
PF00440
(TetR_C_5)
PF08360
(TetR_N) 		16 TRP A  61
THR A  89
GLU A  90
TYR A  93
ILE A  99
ILE A 100
ILE B 100
TYR A 103
GLU A 120
TYR A 123
ILE A 124
ALA A 153
ASN A 154
ASN A 157
THR A 161
PHE B 162
 CVI A 200
1QVT_A_PRLA311 1qvt PRL

DB01123
(Proflavine) 		Staphylococcus
aureus 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR QACR 		PF00440
(TetR_N)
PF08360
(TetR_C_5) 		8 LEU A  54
GLU A  57
GLU A  58
TRP A  61
THR A  89
TYR A  93
ILE A  99
TYR A 103
 PRL A 311
1QVU_A_PRLA196 1qvu PRL

DB01123
(Proflavine) 		Staphylococcus
aureus 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR QACR 		PF00440
(TetR_N)
PF08360
(TetR_C_5) 		6 LEU A  54
GLU A  58
TRP A  61
THR A  89
TYR A  93
TYR A 103
 PRL A 196
1RKW_A_PNTA225 1rkw PNT

DB00738
(Pentamidine) 		Staphylococcus
aureus 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR QACR 		PF00440
(TetR_C_5)
PF08360
(TetR_N) 		12 GLU A  57
LYS A  60
TRP A  61
GLN A  64
TYR A  82
SER A  86
THR A  89
GLU A  90
TYR A  93
TYR A 127
VAL A 156
ASN A 157
 PNT A 225
2F78_A_BEZA1001 2f78 BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Acinetobacter
baylyi 		HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR BENM 		PF03466
(LysR_substrate) 		9 LEU A 100
LEU A 104
LEU A 105
ILE A 108
PHE A 144
LEU A 159
ARG A 160
ILE A 269
TYR A 293
 BEZ A1001
2F78_A_BEZA1003 2f78 BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Acinetobacter
baylyi 		HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR BENM 		PF03466
(LysR_substrate) 		7 VAL A  97
SER A  99
ARG A 146
LEU A 147
PHE A 203
HIS A 206
THR A 267
 BEZ A1003
2F78_B_BEZB1002 2f78 BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Acinetobacter
baylyi 		HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR BENM 		None 9 LEU B 100
LEU B 104
LEU B 105
ILE B 108
PHE B 144
LEU B 159
ARG B 160
ILE B 269
TYR B 293
 BEZ B1002
2F78_B_BEZB1004 2f78 BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Acinetobacter
baylyi 		HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR BENM 		None 7 VAL B  97
SER B  99
ARG B 146
LEU B 147
PHE B 203
HIS B 206
THR B 267
 BEZ B1004
2F78_B_BEZB1005 2f78 BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Acinetobacter
baylyi 		HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR BENM 		None 4 LYS B 191
LEU B 193
LYS B 220
ASN B 222
 BEZ B1005
2F7A_A_BEZA1003 2f7a BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Acinetobacter
baylyi 		HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR BENM 		PF03466
(LysR_substrate) 		9 LEU A 100
LEU A 104
LEU A 105
ILE A 108
PHE A 144
LEU A 159
ARG A 160
ILE A 269
TYR A 293
 BEZ A1003
2F7A_B_ACTB1004 2f7a ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Acinetobacter
baylyi 		HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR BENM 		None 4 HIS B 116
PRO B 117
ASN B 118
TYR B 281
 ACT B1004
2F7A_B_BEZB1002 2f7a BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Acinetobacter
baylyi 		HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR BENM 		None 9 LEU B 100
LEU B 104
LEU B 105
ILE B 108
PHE B 144
LEU B 159
ARG B 160
ILE B 269
TYR B 293
 BEZ B1002
2F8D_A_BEZA1001 2f8d BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Acinetobacter
baylyi 		HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR BENM 		PF03466
(LysR_substrate) 		6 VAL A  97
SER A  99
ARG A 146
LEU A 147
PHE A 203
HIS A 206
 BEZ A1001
2F8D_A_BEZA1002 2f8d BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Acinetobacter
baylyi 		HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR BENM 		PF03466
(LysR_substrate) 		10 LEU A 100
GLY A 103
LEU A 104
LEU A 105
ILE A 108
PHE A 144
LEU A 159
ARG A 160
ILE A 269
TYR A 293
 BEZ A1002
2F8D_B_BEZB1003 2f8d BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Acinetobacter
baylyi 		HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR BENM 		None 10 LEU B 100
GLY B 103
LEU B 104
LEU B 105
ILE B 108
PHE B 144
LEU B 159
ARG B 160
ILE B 269
TYR B 293
 BEZ B1003
2UXO_B_TACB1211 2uxo TAC

DB00759
(Tetracycline) 		Pseudomonas
putida 		HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR TTGR 		no annotation 11 LEU B  66
HIS B  70
LEU B  92
VAL B  96
ASN B 110
LEU B 113
CYS B 137
ILE B 141
MET B 167
VAL B 171
ILE B 175
 TAC B1211
2UXP_A_CLMA1211 2uxp CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Pseudomonas
putida 		HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR TTGR 		PF00440
(TetR_C_2)
PF08361
(TetR_N) 		8 ALA A  74
GLU A  78
LEU A  92
LEU A  93
CYS A 137
ILE A 141
VAL A 171
ILE A 175
 CLM A1211
2UXP_B_CLMB1211 2uxp CLM

DB00446
(Chloramphenicol) 		Pseudomonas
putida 		HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR TTGR 		None 11 HIS B  67
HIS B  70
ALA B  74
SER B  77
GLU B  78
MET B  89
VAL B  96
CYS B 137
GLY B 140
ILE B 141
VAL B 171
 CLM B1211
3BPX_A_SALA257 3bpx SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Methanothermobact
er
thermautotrophicu
s 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR 		PF01047
(MarR)
no annotation 		8 SER A  12
ARG A  16
ALA B  34
CYS B  38
PHE B  57
THR B  63
ILE B  64
THR B  67
 SAL A 257
3BPX_B_SALB258 3bpx SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Methanothermobact
er
thermautotrophicu
s 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR 		PF01047
(MarR)
no annotation 		11 ILE B   5
PRO B   6
LYS B   8
GLY B   9
SER B  12
ARG B  16
ALA A  37
LEU A  40
ARG A  41
ARG A  44
PHE A  56
 SAL B 258
3DEU_A_SALA301 3deu SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Salmonella
enterica 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR SLYA 		PF01047
(MarR) 		6 TRP A  17
ARG A  18
ILE A  21
TRP A  35
VAL A  36
HIS A  39
 SAL A 301
3DEU_A_SALA303 3deu SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Salmonella
enterica 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR SLYA 		PF01047
(MarR) 		4 ARG A  24
VAL A 107
LYS A 110
GLU A 114
 SAL A 303
3DEU_A_SALA305 3deu SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Salmonella
enterica 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR SLYA 		PF01047
(MarR) 		7 THR A  33
VAL A  36
THR A  37
ILE A  57
ILE A  59
SER A  63
THR A  67
 SAL A 305
3DEU_B_SALB302 3deu SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Salmonella
enterica 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR SLYA 		no annotation 5 TRP B  17
ARG B  18
ILE B  21
VAL B  36
HIS B  39
 SAL B 302
3DEU_B_SALB304 3deu SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Salmonella
enterica 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR SLYA 		no annotation 4 ARG B  24
VAL B 107
LYS B 110
GLU B 114
 SAL B 304
3DEU_B_SALB306 3deu SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Salmonella
enterica 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR SLYA 		no annotation 6 THR B  33
THR B  37
ILE B  59
SER B  63
LEU B  64
THR B  67
 SAL B 306
3F8F_A_DM1A127 3f8f DM1

DB00694
(Daunorubicin) 		Lactococcus
lactis 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR, PADR-LIKE
FAMILY 		PF03551
(PadR)
no annotation 		10 MET A   8
MET B   8
ALA A  11
VAL A  15
VAL B  15
ALA A  92
PHE A  93
TRP A  96
TRP B  96
ASP B 100
 DM1 A 127
3GF2_A_SALA147 3gf2 SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Sulfurisphaera
tokodaii 		146AA LONG
HYPOTHETICAL
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR 		PF13463
(HTH_27) 		4 TYR A  37
LEU A  41
ARG A  44
TYR A 111
 SAL A 147
3KP2_A_PNNA5001 3kp2 PNN

DB01053
(Benzylpenicillin) 		Staphylococcus
epidermidis 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR TCAR 		None
PF12802
(MarR_2) 		8 ASN A  20
ASN B  20
THR A  23
LEU A  27
GLN A  31
SER A  41
HIS A  42
ARG A 110
 PNN A5001
3KP2_B_PNNB5002 3kp2 PNN

DB01053
(Benzylpenicillin) 		Staphylococcus
epidermidis 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR TCAR 		None 5 ASN B  64
ALA B  66
ALA B  67
ARG B  70
LYS B  74
 PNN B5002
3KP3_B_AICB2001 3kp3 AIC

DB00415
(Ampicillin) 		Staphylococcus
epidermidis 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR TCAR 		PF12802
(MarR_2)
no annotation 		10 GLU A  13
ASN B  20
THR B  23
LEU B  27
GLN B  31
GLU B  39
SER B  41
HIS B  42
ASN B  45
ARG B 110
 AIC B2001
3KP3_B_AICB2002 3kp3 AIC

DB00415
(Ampicillin) 		Staphylococcus
epidermidis 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR TCAR 		no annotation 3 ALA B  66
ARG B  70
LYS B  74
 AIC B2002
3KP4_A_MIIA2001 3kp4 MII

DB01603
(Meticillin) 		Staphylococcus
epidermidis 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR TCAR 		PF12802
(MarR_2)
no annotation 		9 ASN A  20
ASN B  20
THR A  23
LEU A  27
GLN A  31
ALA A  38
SER A  41
HIS A  42
ARG A 110
 MII A2001
3KP5_A_KANA2001 3kp5 KAN

DB01172
(Kanamycin) 		Staphylococcus
epidermidis 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR TCAR 		PF12802
(MarR_2)
no annotation 		13 GLU B  13
ASN B  17
VAL A  19
ASN A  20
THR A  23
GLN A  31
ALA A  38
GLU A  39
SER A  41
HIS A  42
ASN A  45
GLN A  61
ARG A 110
 KAN A2001
3KP5_B_KANB2002 3kp5 KAN

DB01172
(Kanamycin) 		Staphylococcus
epidermidis 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR TCAR 		no annotation 3 ALA B  66
ARG B  70
LYS B  74
 KAN B2002
3KP6_A_SALA3002 3kp6 SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Staphylococcus
epidermidis 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR TCAR 		PF12802
(MarR_2)
no annotation 		8 HIS A   8
LEU A  12
ILE B 130
VAL B 133
ARG B 134
VAL A 136
LEU A 137
LEU B 137
 SAL A3002
3KP6_A_SALA3005 3kp6 SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Staphylococcus
epidermidis 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR TCAR 		PF12802
(MarR_2) 		8 ASN A  20
THR A  23
LEU A  27
GLN A  31
ALA A  38
SER A  41
HIS A  42
ARG A 110
 SAL A3005
3KP6_B_SALB3001 3kp6 SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Staphylococcus
epidermidis 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR TCAR 		PF12802
(MarR_2)
no annotation 		8 GLU A  13
LYS A  14
ASN A  17
HIS B  42
ASN B  45
MET B  46
ILE B  49
LYS B  60
 SAL B3001
3KP6_B_SALB3003 3kp6 SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Staphylococcus
epidermidis 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR TCAR 		PF12802
(MarR_2)
no annotation 		6 HIS B   8
LEU B  12
ILE A 130
VAL A 133
ARG A 134
LEU A 137
 SAL B3003
3KP6_B_SALB3004 3kp6 SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Staphylococcus
epidermidis 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR TCAR 		PF12802
(MarR_2)
no annotation 		5 PHE B 125
ASP B 126
GLU B 129
LYS A 132
ILE A 139
 SAL B3004
3KP6_B_SALB3006 3kp6 SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Staphylococcus
epidermidis 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR TCAR 		PF12802
(MarR_2)
no annotation 		6 GLU B  13
LYS B  14
ASN B  17
ASN A  45
MET A  46
ILE A  49
 SAL B3006
3KP6_B_SALB3007 3kp6 SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Staphylococcus
epidermidis 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR TCAR 		no annotation 9 ASN B  20
THR B  23
ALA B  24
LEU B  27
GLN B  31
ALA B  38
SER B  41
ASN B  45
ARG B 110
 SAL B3007
3KP6_B_SALB3008 3kp6 SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Staphylococcus
epidermidis 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR TCAR 		no annotation 7 GLU B  39
HIS B  42
VAL B  43
GLN B  61
VAL B  63
ALA B  67
ARG B  71
 SAL B3008
3ZMD_A_SALA201 3zmd SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Streptomyces
coelicolor 		PUTATIVE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR 		PF12802
(MarR_2)
no annotation 		8 TRP A  18
ARG A  19
LEU A  22
ARG A  26
MET B  43
TYR B  46
GLU B  47
HIS B 120
 SAL A 201
4EJW_A_SRYA2001 4ejw SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Staphylococcus
epidermidis 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR TCAR 		PF12802
(MarR_2)
no annotation 		19 GLU B  13
ILE B  16
ASN B  17
ASN A  20
THR A  23
LEU A  27
GLN A  31
ALA A  38
GLU A  39
GLU B  39
SER A  41
HIS B  42
HIS A  42
ASN A  45
MET A  46
GLN A  61
VAL B  63
TYR A 106
ARG A 110
 SRY A2001
4EJW_B_SRYB201 4ejw SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Staphylococcus
epidermidis 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR TCAR 		no annotation 4 ALA B  66
ARG B  70
LYS B  73
LYS B  74
 SRY B 201
4EM0_B_KANB302 4em0 KAN

DB01172
(Kanamycin) 		Staphylococcus
aureus 		UNCHARACTERIZED
HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR SAR2349 		PF01047
(MarR) 		11 TYR B  52
TYR B  55
LEU B  56
THR B  59
TYR B  70
TRP B  73
LEU B  74
ARG B  77
ARG B  94
VAL B 145
GLN B 149
 KAN B 302
4EM0_B_SALB301 4em0 SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Staphylococcus
aureus 		UNCHARACTERIZED
HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR SAR2349 		PF01047
(MarR) 		4 ARG B 102
LYS B 106
ILE B 109
LYS B 123
 SAL B 301
4EM2_A_SALA501 4em2 SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Staphylococcus
aureus 		UNCHARACTERIZED
HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR SAR2349 		PF01047
(MarR) 		5 TYR A  52
LEU A  56
TYR A  70
LEU A  74
ARG A  77
 SAL A 501
4EM2_A_SALA502 4em2 SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Staphylococcus
aureus 		UNCHARACTERIZED
HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR SAR2349 		PF01047
(MarR) 		8 TYR A  55
THR A  59
LEU A  63
TRP A  73
ARG A  77
VAL A 141
VAL A 145
GLN A 149
 SAL A 502
4EM2_A_SALA503 4em2 SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Staphylococcus
aureus 		UNCHARACTERIZED
HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR SAR2349 		PF01047
(MarR) 		6 ARG A 102
LYS A 106
ILE A 109
VAL A 116
LYS A 123
LEU A 128
 SAL A 503
4EM2_A_SALA504 4em2 SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Staphylococcus
aureus 		UNCHARACTERIZED
HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR SAR2349 		PF01047
(MarR) 		8 PHE A  12
GLY A  71
LEU A  74
ILE A  75
ARG A  94
ILE A  96
THR A 100
THR A 104
 SAL A 504
4ZZD_A_RBFA201 4zzd RBF

DB00140
(Riboflavin) 		Lactococcus
lactis 		TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR, PADR-LIKE
FAMILY 		PF03551
(PadR) 		4 ALA A  11
VAL A  15
TRP A  96
ASP A 100
 RBF A 201
5NZ0_A_ZLDA301 5nz0 ZLD

DB00601
(Linezolid) 		Mycobacterium
tuberculosis 		HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR ETHR 		PF00440
(TetR_N) 		14 MET A 102
TRP A 103
GLY A 106
ILE A 107
PHE A 110
MET A 142
TRP A 145
TYR A 148
THR A 149
VAL A 152
ASN A 176
ASN A 179
LEU A 183
TRP A 207
 ZLD A 301
5X7Z_A_BHAA201 5x7z BHA

DB00233
(Aminosalicylic
Acid) 		Mycobacterium
tuberculosis 		UNCHARACTERIZED
HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR RV2887 		PF01047
(MarR) 		6 LEU A  20
ARG A  21
VAL A  24
LEU A  35
ARG A  42
VAL A 110
 BHA A 201
5X80_A_SALA201 5x80 SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Mycobacterium
tuberculosis 		UNCHARACTERIZED
HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR RV2887 		PF01047
(MarR)
no annotation 		5 PRO B   8
GLY B  10
TYR B  11
VAL A  39
ARG A  42
 SAL A 201
5X80_B_SALB203 5x80 SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Mycobacterium
tuberculosis 		UNCHARACTERIZED
HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR RV2887 		PF01047
(MarR)
no annotation 		6 PRO A   8
GLY A  10
TYR A  11
LEU B  35
ARG B  42
VAL B 110
 SAL B 203
5X80_C_SALC201 5x80 SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Mycobacterium
tuberculosis 		UNCHARACTERIZED
HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR RV2887 		no annotation 7 PRO D   8
GLY D  10
TYR D  11
ARG C  21
VAL C  39
ARG C  42
VAL C 110
 SAL C 201
5X80_D_SALD201 5x80 SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Mycobacterium
tuberculosis 		UNCHARACTERIZED
HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR RV2887 		no annotation 5 PRO C   8
GLY C  10
TYR C  11
VAL D  39
ARG D  42
 SAL D 201