DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'TRAH'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1Q8J_A_C2FA801 1q8j C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Thermotoga
maritima
5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE S-HOMOCYSTEINE
METHYLTRANSFERASE
PF00809
(Pterin_bind)
PF02574
(S-methyl_trans)
13 GLU A 320
ASN A 323
ARG A 327
ASP A 390
ASN A 411
ILE A 435
ASP A 473
GLY A 505
SER A 507
ASN A 508
PHE A 511
ARG A 516
ILE A 536
C2F A 801
1Q8J_B_C2FB802 1q8j C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Thermotoga
maritima
5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE S-HOMOCYSTEINE
METHYLTRANSFERASE
None 13 GLU B 320
ASN B 323
GLY B 326
ASP B 390
ASN B 411
SER B 412
ILE B 435
ASP B 473
GLY B 505
SER B 507
ASN B 508
ARG B 516
ILE B 536
C2F B 802
1U1J_A_C2FA773 1u1j C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Arabidopsis
thaliana
5-METHYLTETRAHYDROPT
EROYLTRIGLUTAMATE--H
OMOCYSTEINE
METHYLTRANSFERASE
PF01717
(Meth_synt_1)
PF08267
(Meth_synt_2)
8 ARG A  15
LYS A  18
ASN A 116
HIS A 118
SER A 517
ARG A 521
VAL A 523
TRP A 567
C2F A 773
1XPG_A_C2FA1882 1xpg C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Thermotoga
maritima
5-METHYLTETRAHYDROPT
EROYLTRIGLUTAMATE--H
OMOCYSTEINE
METHYLTRANSFERASE
PF01717
(Meth_synt_2)
PF08267
(Meth_synt_1)
9 LYS A  18
LYS A 104
ASN A 109
ASP A 467
SER A 489
ARG A 493
CYS A 494
TRP A 539
GLU A 583
C2F A1882
1XPG_B_C2FB1883 1xpg C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Thermotoga
maritima
5-METHYLTETRAHYDROPT
EROYLTRIGLUTAMATE--H
OMOCYSTEINE
METHYLTRANSFERASE
None 10 ARG B  15
LYS B  18
LYS B 104
THR B 466
TRP B 486
SER B 489
ARG B 493
CYS B 494
TRP B 539
GLU B 583
C2F B1883
1XR2_A_C2FA1200 1xr2 C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Thermotoga
maritima
5-METHYLTETRAHYDROPT
EROYLTRIGLUTAMATE--H
OMOCYSTEINE
METHYLTRANSFERASE
PF01717
(Meth_synt_2)
PF08267
(Meth_synt_1)
9 ARG A  15
LYS A  18
LYS A 104
SER A 489
ARG A 493
CYS A 494
TRP A 539
PRO A 579
GLU A 583
C2F A1200
1XR2_B_C2FB1201 1xr2 C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Thermotoga
maritima
5-METHYLTETRAHYDROPT
EROYLTRIGLUTAMATE--H
OMOCYSTEINE
METHYLTRANSFERASE
None 8 LYS B  18
LYS B 104
THR B 466
TRP B 486
SER B 489
ARG B 493
TRP B 539
GLU B 583
C2F B1201
1ZP4_A_C2FA995 1zp4 C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Escherichia coli 5,10-METHYLENETETRAH
YDROFOLATE REDUCTASE
PF02219
(MTHFR)
9 GLN A  28
ASP A 120
GLN A 183
GLN A 219
PHE A 223
THR A 227
TYR A 275
LEU A 277
ARG A 279
C2F A 995
1ZP4_B_C2FB996 1zp4 C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Escherichia coli 5,10-METHYLENETETRAH
YDROFOLATE REDUCTASE
None 10 GLN B  28
ASP B 120
GLN B 183
SER B 215
GLN B 219
PHE B 223
THR B 227
TYR B 275
LEU B 277
ARG B 279
C2F B 996
1ZP4_C_C2FC997 1zp4 C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Escherichia coli 5,10-METHYLENETETRAH
YDROFOLATE REDUCTASE
None 10 GLN C  28
ASP C 120
GLN C 183
SER C 215
GLN C 219
PHE C 223
THR C 227
TYR C 275
LEU C 277
ARG C 279
C2F C 997
2E7F_A_C2FA3000 2e7f C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Moorella
thermoacetica
5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE CORRINOID/IRON
SULFUR PROTEIN
METHYLTRANSFERASE
PF00809
(Pterin_bind)
14 GLU A   6
MET A  11
PHE A  12
ASP A  75
ASN A  96
ILE A 120
LEU A 122
ASP A 160
GLY A 196
SER A 198
ASN A 199
GLN A 202
ARG A 207
ILE A 227
C2F A3000
2E7F_B_C2FB4000 2e7f C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Moorella
thermoacetica
5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE CORRINOID/IRON
SULFUR PROTEIN
METHYLTRANSFERASE
None 14 GLU B   6
MET B  11
PHE B  12
ASP B  75
ASN B  96
ILE B 120
LEU B 122
ASP B 160
GLY B 196
SER B 198
ASN B 199
GLN B 202
ARG B 207
ILE B 227
C2F B4000
2OGY_A_C2FA3000 2ogy C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Moorella
thermoacetica
5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE CORRINOID/IRON
SULFUR PROTEIN
METHYLTRANSFERASE
PF00809
(Pterin_bind)
13 GLU A   6
MET A  11
PHE A  12
ASP A  75
ASN A  96
ILE A 120
LEU A 122
ASP A 160
GLY A 196
SER A 198
GLN A 202
ARG A 207
ILE A 227
C2F A3000
2OGY_B_C2FB4000 2ogy C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Moorella
thermoacetica
5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE CORRINOID/IRON
SULFUR PROTEIN
METHYLTRANSFERASE
None 13 GLU B   6
MET B  11
PHE B  12
ASP B  75
ASN B  96
ILE B 120
LEU B 122
ASP B 160
GLY B 196
SER B 198
GLN B 202
ARG B 207
ILE B 227
C2F B4000
2YCJ_A_C2FA3000 2ycj C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Carboxydothermus
hydrogenoformans
5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE CORRINOID/IRON
SULFUR PROTEIN
METHYLTRANSFERASE
PF00809
(Pterin_bind)
13 MET A  12
PHE A  13
ASP A  76
ASN A  97
ILE A 121
LEU A 123
ASP A 161
GLY A 197
SER A 199
ASN A 200
GLN A 203
ARG A 208
ILE A 228
C2F A3000
3APT_B_ACTB311 3apt ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Thermus
thermophilus
METHYLENETETRAHYDROF
OLATE REDUCTASE
None 9 GLU B  18
HIS B  77
LEU B 104
ASP B 109
PRO B 110
ALA B 147
ILE B 178
HIS B 270
TYR B 272
ACT B 311
3FSU_A_C2FA995 3fsu C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Escherichia coli 5,10-METHYLENETETRAH
YDROFOLATE REDUCTASE
PF02219
(MTHFR)
13 GLN A  28
THR A  59
ASP A 120
GLN A 183
LEU A 212
SER A 215
ASN A 216
GLN A 219
LEU A 223
THR A 227
TYR A 275
LEU A 277
ARG A 279
C2F A 995
3FSU_E_C2FE995 3fsu C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Escherichia coli 5,10-METHYLENETETRAH
YDROFOLATE REDUCTASE
None 11 GLN E  28
THR E  59
ASP E 120
GLN E 183
SER E 215
GLN E 219
LEU E 223
THR E 227
TYR E 275
LEU E 277
ARG E 279
C2F E 995
3K13_A_THHA642 3k13 THH

DB11256
(Levomefolic
acid)
Bacteroides
thetaiotaomicron
5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE-HOMOCYSTEINE
METHYLTRANSFERASE
PF00809
(Pterin_bind)
15 GLU A 358
ASN A 361
GLY A 364
ARG A 366
ASP A 431
ASN A 452
VAL A 478
ASP A 519
GLY A 558
SER A 560
ASN A 561
PHE A 564
ARG A 567
ARG A 573
ILE A 593
THH A 642
3K13_B_THHB643 3k13 THH

DB11256
(Levomefolic
acid)
Bacteroides
thetaiotaomicron
5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE-HOMOCYSTEINE
METHYLTRANSFERASE
None 14 GLU B 358
ASN B 361
GLY B 364
ARG B 366
ASP B 431
ASN B 452
VAL B 478
ASP B 519
GLY B 558
SER B 560
ASN B 561
ARG B 567
ARG B 573
ILE B 593
THH B 643
3K13_C_THHC643 3k13 THH

DB11256
(Levomefolic
acid)
Bacteroides
thetaiotaomicron
5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE-HOMOCYSTEINE
METHYLTRANSFERASE
None 15 GLU C 358
ASN C 361
GLY C 364
ARG C 366
ASP C 431
ASN C 452
VAL C 478
ASP C 519
GLY C 558
SER C 560
ASN C 561
PHE C 564
ARG C 567
ARG C 573
ILE C 593
THH C 643
4DJE_A_C2FA300 4dje C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Moorella
thermoacetica
5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE CORRINOID/IRON
SULFUR PROTEIN
METHYLTRANSFERASE
PF00809
(Pterin_bind)
14 GLU A   6
ASN A   9
MET A  11
PHE A  12
ASP A  75
ASN A  96
LEU A 122
ASP A 160
GLY A 196
SER A 198
ASN A 199
GLN A 202
ARG A 207
ILE A 227
C2F A 300
4DJE_B_C2FB302 4dje C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Moorella
thermoacetica
5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE CORRINOID/IRON
SULFUR PROTEIN
METHYLTRANSFERASE
None 12 GLU B   6
MET B  11
PHE B  12
ASP B  43
ASP B  75
ASN B  96
ASP B 160
GLY B 196
SER B 198
ASN B 199
GLN B 202
ARG B 207
C2F B 302
4DJF_A_C2FA300 4djf C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Moorella
thermoacetica
5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE CORRINOID/IRON
SULFUR PROTEIN
METHYLTRANSFERASE
PF00809
(Pterin_bind)
14 GLU A   6
ASN A   9
MET A  11
PHE A  12
ASP A  75
ASN A  96
ILE A 120
ASP A 160
GLY A 196
SER A 198
ASN A 199
GLN A 202
ARG A 207
ILE A 227
C2F A 300
4DJF_B_C2FB300 4djf C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Moorella
thermoacetica
5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE CORRINOID/IRON
SULFUR PROTEIN
METHYLTRANSFERASE
None 14 GLU B   6
MET B  11
PHE B  12
ASP B  43
ASP B  75
ASN B  96
ILE B 120
LEU B 122
ASP B 160
GLY B 196
SER B 198
ASN B 199
GLN B 202
ARG B 207
C2F B 300
4IOM_A_FOLA608 4iom FOL

DB00158
(Folic
Acid)
Moorella
thermoacetica
FORMATE--TETRAHYDROF
OLATE LIGASE
PF01268
(FTHFS)
7 ALA A 383
PRO A 385
GLU A 389
LEU A 392
TYR A 396
LEU A 408
TRP A 412
FOL A 608
4JJK_A_FOLA601 4jjk FOL

DB00158
(Folic
Acid)
Moorella
thermoacetica
FORMATE--TETRAHYDROF
OLATE LIGASE
PF01268
(FTHFS)
8 ASN A 382
ALA A 383
PRO A 385
GLU A 389
LEU A 392
TYR A 396
LEU A 408
TRP A 412
FOL A 601
4L64_A_C2FA802 4l64 C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Candida albicans 5-METHYLTETRAHYDROPT
EROYLTRIGLUTAMATE--H
OMOCYSTEINE
METHYLTRANSFERASE
PF01717
(Meth_synt_1)
PF08267
(Meth_synt_2)
7 LYS A  19
TRP A 523
SER A 526
TYR A 527
ARG A 530
VAL A 532
TRP A 576
C2F A 802
4L65_A_C2FA802 4l65 C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Candida albicans 5-METHYLTETRAHYDROPT
EROYLTRIGLUTAMATE--H
OMOCYSTEINE
METHYLTRANSFERASE
PF01717
(Meth_synt_1)
PF08267
(Meth_synt_2)
9 LYS A  19
ASN A 126
ASP A 504
SER A 526
TYR A 527
ARG A 530
TYR A 531
VAL A 532
TRP A 576
C2F A 802
4L6H_A_MTXA803 4l6h MTX

DB00563
(Methotrexate)
Candida albicans 5-METHYLTETRAHYDROPT
EROYLTRIGLUTAMATE--H
OMOCYSTEINE
METHYLTRANSFERASE
PF01717
(Meth_synt_2)
PF08267
(Meth_synt_1)
10 LYS A  19
ASP A 504
TRP A 523
SER A 526
TYR A 527
ARG A 530
TYR A 531
VAL A 532
PRO A 535
TRP A 576
MTX A 803
5TJY_A_BEZA304 5tjy BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid)
Mycobacterium
tuberculosis
4-HYDROXY-TETRAHYDRO
DIPICOLINATE
REDUCTASE
PF01113
(DapB_N)
PF05173
(DapB_C)
3 MET A  59
GLU A  82
ARG A  83
BEZ A 304
5TJZ_A_BEZA302 5tjz BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid)
Mycobacterium
tuberculosis
4-HYDROXY-TETRAHYDRO
DIPICOLINATE
REDUCTASE
PF01113
(DapB_N)
PF05173
(DapB_C)
3 MET A  59
GLU A  82
ARG A  83
BEZ A 302
5VOO_A_C2FA3001 5voo C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Thermus
thermophilus
5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE HOMOCYSTEINE
S-METHYLTRANSFERASE
None
PF00809
(Pterin_bind)
18 GLU A 373
ARG A 374
ASN A 376
GLY A 379
LYS A 381
ASP A 411
THR C 417
ASP A 443
ASN A 464
VAL A 490
LEU A 492
ASP A 531
GLY A 570
SER A 572
ASN A 573
PHE A 576
ARG A 583
ILE A 603
C2F A3001
5VOO_B_C2FB702 5voo C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Thermus
thermophilus
5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE HOMOCYSTEINE
S-METHYLTRANSFERASE
None 17 GLU B 373
ARG B 374
ASN B 376
GLY B 379
LYS B 381
ASP B 411
ASP B 443
ASN B 464
VAL B 490
LEU B 492
ASP B 531
GLY B 570
SER B 572
ASN B 573
PHE B 576
ARG B 583
ILE B 603
C2F B 702
5VOO_C_C2FC702 5voo C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Thermus
thermophilus
5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE HOMOCYSTEINE
S-METHYLTRANSFERASE
None
PF00809
(Pterin_bind)
18 GLU C 373
ARG C 374
ASN C 376
GLY C 379
LYS C 381
ASP C 411
THR A 417
ASP C 443
ASN C 464
VAL C 490
LEU C 492
ASP C 531
GLY C 570
SER C 572
ASN C 573
PHE C 576
ARG C 583
ILE C 603
C2F C 702
5VOO_D_C2FD3001 5voo C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Thermus
thermophilus
5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE HOMOCYSTEINE
S-METHYLTRANSFERASE
None 17 GLU D 373
ASN D 376
GLY D 379
LYS D 381
ASP D 411
MET D 441
ASP D 443
ASN D 464
VAL D 490
LEU D 492
ASP D 531
GLY D 570
SER D 572
ASN D 573
PHE D 576
ARG D 583
ILE D 603
C2F D3001
5VOO_E_C2FE3001 5voo C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Thermus
thermophilus
5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE HOMOCYSTEINE
S-METHYLTRANSFERASE
None 17 GLU E 373
ARG E 374
ASN E 376
GLY E 379
LYS E 381
ASP E 411
MET E 441
ASP E 443
ASN E 464
VAL E 490
LEU E 492
ASP E 531
GLY E 570
SER E 572
ASN E 573
ARG E 583
ILE E 603
C2F E3001
5VOO_F_C2FF3001 5voo C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Thermus
thermophilus
5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE HOMOCYSTEINE
S-METHYLTRANSFERASE
None 16 GLU F 373
ASN F 376
GLY F 379
LYS F 381
ASP F 411
ASP F 443
ASN F 464
VAL F 490
LEU F 492
ASP F 531
GLY F 570
SER F 572
ASN F 573
PHE F 576
ARG F 583
ILE F 603
C2F F3001
5VOP_A_C2FA3001 5vop C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Thermus
thermophilus
5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE HOMOCYSTEINE
S-METHYLTRANSFERASE
PF00809
(Pterin_bind)
15 GLU A 373
ASN A 376
GLY A 379
ASP A 411
ASP A 443
ASN A 464
VAL A 490
LEU A 492
ASP A 531
VAL A 568
GLY A 570
SER A 572
ASN A 573
ARG A 583
ILE A 603
C2F A3001
5VOP_B_C2FB3001 5vop C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Thermus
thermophilus
5-METHYLTETRAHYDROFO
LATE HOMOCYSTEINE
S-METHYLTRANSFERASE
None 15 GLU B 373
ASN B 376
GLY B 379
LYS B 381
ASP B 411
ASP B 443
ASN B 464
VAL B 490
LEU B 492
ASP B 531
GLY B 570
SER B 572
ASN B 573
ARG B 583
ILE B 603
C2F B3001