DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'TRAC'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
2FJ1_A_CTCA222 2fj1 CTC

DB09093
(Chlortetracycline) 		Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR PROTEIN
CLASS D 		PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C) 		13 HIS A  64
SER A  67
ASN A  82
PHE A  86
HIS A 100
ARG A 104
PRO A 105
THR A 112
VAL A 113
GLN A 116
LEU A 131
ILE A 134
SER A 138
 CTC A 222
2O7O_A_DXTA222 2o7o DXT

DB00254
(Doxycycline) 		Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR PROTEIN
CLASS D 		PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C) 		13 LEU A  60
HIS A  64
SER A  67
ASN A  82
PHE A  86
HIS A 100
ARG A 104
PRO A 105
THR A 112
VAL A 113
GLN A 116
ILE A 134
SER A 138
 DXT A 222
2TCT_A_CTCA222 2tct CTC

DB09093
(Chlortetracycline) 		Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR 		PF00440
(TetR_C)
PF02909
(TetR_N) 		13 HIS A  64
SER A  67
ASN A  82
PHE A  86
HIS A 100
ARG A 104
PRO A 105
GLN A 109
THR A 112
VAL A 113
GLN A 116
ILE A 134
SER A 138
 CTC A 222
2TRT_A_TACA222 2trt TAC

DB00759
(Tetracycline) 		Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR CLASS D 		PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C) 		11 HIS A  64
SER A  67
ASN A  82
PHE A  86
HIS A 100
ARG A 104
PRO A 105
VAL A 113
GLN A 116
ILE A 134
SER A 138
 TAC A 222
2VKE_A_TACA222 2vke TAC

DB00759
(Tetracycline) 		Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR PROTEIN
CLASS D 		PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C) 		11 HIS A  64
SER A  67
ASN A  82
PHE A  86
HIS A 100
ARG A 104
PRO A 105
VAL A 113
GLN A 116
ILE A 134
SER A 138
 TAC A 222
2XPV_A_MIYA1209 2xpv MIY

DB01017
(Minocycline) 		Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR PROTEIN
CLASS D 		PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C) 		13 HIS A  64
SER A  67
ASN A  82
PHE A  86
HIS A 100
ARG A 104
PRO A 105
THR A 112
VAL A 113
GLN A 116
LEU A 131
ILE A 134
SER A 138
 MIY A1209
2XPW_A_OTCA222 2xpw OTC

DB00595
(Oxytetracycline) 		Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR PROTEIN
CLASS D 		PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C) 		12 LEU A  60
HIS A  64
SER A  67
ASN A  82
PHE A  86
HIS A 100
ARG A 104
PRO A 105
VAL A 113
GLN A 116
ILE A 134
SER A 138
 OTC A 222
2XRL_A_DXTA1211 2xrl DXT

DB00254
(Doxycycline) 		Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR PROTEIN
CLASS D 		PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C) 		14 LEU A  60
HIS A  64
SER A  67
ASN A  82
PHE A  86
HIS A 100
ARG A 104
PRO A 105
THR A 112
VAL A 113
GLN A 116
LEU A 117
ILE A 134
SER A 138
 DXT A1211
4ABZ_A_T1CA1209 4abz T1C

DB00560
(Tigecycline) 		Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR CLASS D 		PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C) 		14 LEU A  60
HIS A  64
SER A  67
ASN A  82
PHE A  86
HIS A 100
ARG A 104
PRO A 105
GLN A 109
THR A 112
GLN A 116
LEU A 131
ILE A 134
SER A 138
 T1C A1209
4AC0_A_MIYA1204 4ac0 MIY

DB01017
(Minocycline) 		Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR PROTEIN
CLASS B FROM
TRANSPOSON TN1 0 		PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C) 		12 HIS A  64
PHE A  67
ASN A  82
PHE A  86
HIS A 100
ARG A 104
PRO A 105
GLN A 109
THR A 112
LEU A 113
GLN A 116
LEU A 131
 MIY A1204
4B3A_A_TACA222 4b3a TAC

DB00759
(Tetracycline) 		Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR PROTEIN
CLASS D 		PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C) 		12 LEU A  60
HIS A  64
SER A  67
ASN A  82
PHE A  86
ARG A 104
PRO A 105
GLN A 109
VAL A 113
GLN A 116
ILE A 134
SER A 138
 TAC A 222
4JD6_A_TOYA501 4jd6 TOY

DB00684
(Tobramycin) 		Mycobacterium
tuberculosis 		ENHANCED
INTRACELLULAR
SURVIVAL PROTEIN 		PF13527
(Acetyltransf_9)
PF13530
(SCP2_2) 		9 PHE A  24
ASP A  26
ILE A  28
TRP A  36
SER A  83
VAL A  85
TYR A 126
GLU A 203
GLU A 401
 TOY A 501
4JD6_B_TOYB501 4jd6 TOY

DB00684
(Tobramycin) 		Mycobacterium
tuberculosis 		ENHANCED
INTRACELLULAR
SURVIVAL PROTEIN 		no annotation 9 PHE B  24
ASP B  26
ILE B  28
TRP B  36
SER B  83
VAL B  85
TYR B 126
GLU B 203
GLU B 401
 TOY B 501
4NMY_A_VIBA401 4nmy VIB

DB00152
(Thiamine) 		Clostridioides
difficile 		ABC-TYPE TRANSPORT
SYSTEM,
EXTRACELLULAR
SOLUTE-BINDING
PROTEIN 		PF09084
(NMT1) 		11 TRP A  12
ASN A  15
TYR A  62
GLU A  64
SER A  90
TRP A 114
TRP A 158
PHE A 160
TRP A 163
TYR A 189
THR A 191
 VIB A 401
4NMY_B_VIBB401 4nmy VIB

DB00152
(Thiamine) 		Clostridioides
difficile 		ABC-TYPE TRANSPORT
SYSTEM,
EXTRACELLULAR
SOLUTE-BINDING
PROTEIN 		no annotation 10 TRP B  12
ASN B  15
TYR B  62
GLU B  64
SER B  90
TRP B 114
TRP B 158
TRP B 163
TYR B 189
THR B 191
 VIB B 401
4QB9_A_PARA500 4qb9 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Mycolicibacterium
smegmatis 		ENHANCED
INTRACELLULAR
SURVIVAL PROTEIN 		PF13527
(Acetyltransf_9)
PF13530
(SCP2_2) 		10 PHE A  26
SER A  83
PHE A  84
THR A 119
SER A 121
GLU A 137
ASP A 290
ASP A 291
TYR A 400
GLY A 401
 PAR A 500
4QB9_B_PARB500 4qb9 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Mycolicibacterium
smegmatis 		ENHANCED
INTRACELLULAR
SURVIVAL PROTEIN 		no annotation 9 PHE B  26
SER B  83
THR B 119
SER B 121
GLU B 137
ARG B 205
ASP B 291
TYR B 400
GLY B 401
 PAR B 500
4QB9_C_PARC500 4qb9 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Mycolicibacterium
smegmatis 		ENHANCED
INTRACELLULAR
SURVIVAL PROTEIN 		no annotation 10 SER C  83
PHE C  84
THR C 119
SER C 121
TYR C 126
GLU C 137
ASP C 290
ASP C 291
TYR C 400
GLY C 401
 PAR C 500
4QB9_D_PARD500 4qb9 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Mycolicibacterium
smegmatis 		ENHANCED
INTRACELLULAR
SURVIVAL PROTEIN 		no annotation 8 PHE D  26
SER D  83
THR D 119
SER D 121
GLU D 137
ASP D 290
ASP D 291
TYR D 400
 PAR D 500
4QB9_E_PARE500 4qb9 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Mycolicibacterium
smegmatis 		ENHANCED
INTRACELLULAR
SURVIVAL PROTEIN 		no annotation 12 PHE E  26
SER E  83
PHE E  84
LEU E 118
THR E 119
SER E 121
TYR E 126
GLU E 137
ASP E 290
ASP E 291
TYR E 400
GLY E 401
 PAR E 500
4QB9_F_PARF500 4qb9 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Mycolicibacterium
smegmatis 		ENHANCED
INTRACELLULAR
SURVIVAL PROTEIN 		no annotation 11 PHE F  26
SER F  83
THR F 119
SER F 121
TYR F 126
GLU F 137
GLU F 238
ASP F 290
ASP F 291
TYR F 400
GLY F 401
 PAR F 500
4V2G_B_CTCB222 4v2g CTC

DB09093
(Chlortetracycline) 		Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR PROTEIN
CLASS D 		None
PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C) 		14 HIS B  64
SER B  67
ASN B  82
PHE B  86
HIS B 100
ARG B 104
PRO B 105
THR B 112
VAL B 113
GLN B 116
ILE B 134
SER B 138
LEU A 170
LEU A 174
 CTC B 222
5M8W_A_4CHA512 5m8w 4CH

DB13154
(Parachlorophenol) 		Sulfurospirillum
multivorans 		TETRACHLOROETHENE
REDUCTIVE
DEHALOGENASE
CATALYTICALLY ACTIVE
SUBUNIT 		PF13484
(Fer4_16)
PF13486
(Dehalogenase) 		9 PHE A  38
TRP A  56
TRP A  96
TYR A 102
TYR A 246
ASN A 272
ARG A 305
TRP A 376
TYR A 382
 4CH A 512
5M8W_B_4CHB507 5m8w 4CH

DB13154
(Parachlorophenol) 		Sulfurospirillum
multivorans 		TETRACHLOROETHENE
REDUCTIVE
DEHALOGENASE
CATALYTICALLY ACTIVE
SUBUNIT 		None 9 PHE B  38
TRP B  56
TRP B  96
TYR B 102
TYR B 246
ASN B 272
ARG B 305
TRP B 376
TYR B 382
 4CH B 507
5TUI_B_CTCB405 5tui CTC

DB09093
(Chlortetracycline) 		uncultured
bacterium 		TETRACYCLINE
DESTRUCTASE TET(50) 		None 17 ASP B  47
ARG B  49
GLY B  94
PHE B  95
ARG B  96
GLU B 102
VAL B 181
LEU B 198
LEU B 205
THR B 207
GLY B 220
MET B 222
PRO B 296
GLY B 299
PHE B 344
VAL B 348
ILE B 371
 CTC B 405
6DJZ_A_GMJA301 6djz GMJ

DB00502
(Haloperidol) 		Homo sapiens SIGMA NON-OPIOID
INTRACELLULAR
RECEPTOR 1 		PF04622
(ERG2_Sigma1R) 		18 MET A  93
TYR A 103
LEU A 105
SER A 117
TYR A 120
ILE A 124
ASP A 126
PHE A 133
GLN A 135
VAL A 152
HIS A 154
THR A 160
VAL A 162
GLU A 172
THR A 181
LEU A 182
ALA A 185
TYR A 206
 GMJ A 301
6DJZ_B_GMJB301 6djz GMJ

DB00502
(Haloperidol) 		Homo sapiens SIGMA NON-OPIOID
INTRACELLULAR
RECEPTOR 1 		None 18 TRP B  89
TYR B 103
LEU B 105
SER B 117
TYR B 120
ILE B 124
ASP B 126
PHE B 133
GLN B 135
VAL B 152
HIS B 154
THR B 160
VAL B 162
TRP B 164
GLU B 172
THR B 181
LEU B 182
ALA B 185
 GMJ B 301
6DJZ_C_GMJC301 6djz GMJ

DB00502
(Haloperidol) 		Homo sapiens SIGMA NON-OPIOID
INTRACELLULAR
RECEPTOR 1 		None 18 TRP C  89
MET C  93
LEU C  95
ALA C  98
LEU C 105
SER C 117
TYR C 120
ASP C 126
PHE C 133
GLN C 135
VAL C 152
HIS C 154
VAL C 162
GLU C 172
THR C 181
LEU C 182
ALA C 185
TYR C 206
 GMJ C 301
6DK1_A_GM4A301 6dk1 GM4

DB00652
(Pentazocine) 		Homo sapiens SIGMA NON-OPIOID
INTRACELLULAR
RECEPTOR 1 		PF04622
(ERG2_Sigma1R) 		11 VAL A  84
ALA A  86
TRP A  89
MET A  93
TYR A 103
LEU A 105
TYR A 120
ASP A 126
TRP A 164
GLU A 172
ALA A 185
 GM4 A 301
6DK1_B_GM4B301 6dk1 GM4

DB00652
(Pentazocine) 		Homo sapiens SIGMA NON-OPIOID
INTRACELLULAR
RECEPTOR 1 		None 11 VAL B  84
ALA B  86
TRP B  89
TYR B 103
LEU B 105
TYR B 120
ASP B 126
TRP B 164
GLU B 172
ALA B 185
LEU B 186
 GM4 B 301
6DK1_C_GM4C301 6dk1 GM4

DB00652
(Pentazocine) 		Homo sapiens SIGMA NON-OPIOID
INTRACELLULAR
RECEPTOR 1 		None 11 VAL C  84
ALA C  86
TRP C  89
TYR C 103
LEU C 105
TYR C 120
ASP C 126
TRP C 164
GLU C 172
THR C 181
ALA C 185
 GM4 C 301