DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'STRUCTURAL PROTEIN'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
2PXC_A_SAMA500 2pxc SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Murray Valley
encephalitis
virus
GENOME POLYPROTEIN
[CONTAINS: CAPSID
PROTEIN C (CORE
PROTEIN);
ENVELOPE PROTEIN M
(MATRIX PROTEIN);
MAJOR ENVELOPE
PROTEIN E;
NON-STRUCTURAL
PROTEIN 1 (NS1);
NON-STRUCTURAL
PROTEIN 2A (NS2A);
FLAVIVIRIN PROTEASE
NS2B REGULATORY
SUBUNIT;
FLAVIVIRIN PROTEASE
NS3 CATALYTIC
SUBUNIT;
NON-STRUCTURAL
PROTEIN 4A (NS4A);
NON-STRUCTURAL
PROTEIN 4B (NS4B);
RNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE (EC
2.7.7.48) (NS5)]
PF01728
(FtsJ)
14 SER A  56
GLY A  58
GLY A  81
GLY A  83
GLY A  86
TRP A  87
THR A 104
LYS A 105
HIS A 110
GLU A 111
ASP A 131
VAL A 132
ASP A 146
ILE A 147
SAM A 500
2WA2_A_SAMA1248 2wa2 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Modoc virus NON-STRUCTURAL
PROTEIN 5
PF01728
(FtsJ)
14 GLY A  59
GLY A  82
GLY A  84
SER A  87
TRP A  88
THR A 105
LEU A 106
HIS A 111
GLU A 112
ASP A 132
VAL A 133
THR A 134
ASP A 147
ILE A 148
SAM A1248
2WA2_B_SAMB1267 2wa2 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Modoc virus NON-STRUCTURAL
PROTEIN 5
None 15 SER B  57
GLY B  59
GLY B  82
GLY B  84
SER B  87
TRP B  88
THR B 105
LEU B 106
HIS B 111
GLU B 112
ASP B 132
VAL B 133
THR B 134
ASP B 147
ILE B 148
SAM B1267
2Z0A_A_GLYA73 2z0a GLY

DB00145
(Glycine)
Influenza A virus NONSTRUCTURAL
PROTEIN 1
PF00600
(Flu_NS1)
5 GLN A  10
ALA A  60
GLN A  63
ILE A  64
ARG A  67
GLY A  73
2Z0A_A_GLYA74 2z0a GLY

DB00145
(Glycine)
Influenza A virus NONSTRUCTURAL
PROTEIN 1
PF00600
(Flu_NS1)
4 LYS A  20
LEU A  36
ARG A  37
GLN A  40
GLY A  74
2Z0A_C_GLYC73 2z0a GLY

DB00145
(Glycine)
Influenza A virus NONSTRUCTURAL
PROTEIN 1
None 4 ASP C  12
ASP C  39
SER C  42
ARG C  46
GLY C  73
2Z0A_D_GLYD73 2z0a GLY

DB00145
(Glycine)
Influenza A virus NONSTRUCTURAL
PROTEIN 1
None 4 ARG C  35
ASP D  39
SER D  42
ARG D  46
GLY D  73
3JAY_A_SAMA1101 3jay SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Cypovirus 1 STRUCTURAL PROTEIN
VP3
None 13 ASN A 526
SER A 528
MET A 532
GLU A 564
GLU A 566
ASP A 589
ARG A 590
ARG A 599
VAL A 600
ASP A 616
ILE A 617
ASN A 618
GLU A 631
SAM A1101
3JAY_A_SAMA1102 3jay SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Cypovirus 1 STRUCTURAL PROTEIN
VP3
None 15 LYS A 838
TYR A 842
ILE A 861
GLY A 862
GLY A 863
ARG A 864
ALA A 867
ASP A 868
ASP A 882
PRO A 883
ALA A 884
PHE A 904
ILE A 922
PRO A 929
TYR A 992
SAM A1102
3JB1_A_SAMA1101 3jb1 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Cypovirus 1 STRUCTURAL PROTEIN
VP3
None 13 TYR A 842
ILE A 861
GLY A 862
ARG A 864
ALA A 867
ASP A 882
PRO A 883
ALA A 884
PHE A 904
ILE A 922
ALA A 923
PRO A 929
TYR A 992
SAM A1101
3JB2_A_SAMA1101 3jb2 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Cypovirus 1 STRUCTURAL PROTEIN
VP3
None 15 ASN A 526
SER A 528
MET A 532
GLU A 564
GLU A 566
PRO A 567
GLY A 588
ASP A 589
ARG A 590
ARG A 599
VAL A 600
ASP A 616
ILE A 617
ASN A 618
GLU A 631
SAM A1101
3JB2_A_SAMA1102 3jb2 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Cypovirus 1 STRUCTURAL PROTEIN
VP3
None 15 LYS A 838
TYR A 842
ILE A 861
GLY A 862
GLY A 863
ARG A 864
ALA A 867
ASP A 868
ASP A 882
PRO A 883
ALA A 884
PHE A 904
ALA A 923
VAL A 924
PRO A 929
SAM A1102
3JB3_A_SAMA1101 3jb3 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Cypovirus 1 STRUCTURAL PROTEIN
VP3
None 13 ASN A 526
SER A 528
MET A 532
GLU A 564
GLU A 566
ASP A 589
ARG A 590
ARG A 599
VAL A 600
ASP A 616
ILE A 617
ASN A 618
GLU A 631
SAM A1101
3JB3_A_SAMA1102 3jb3 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Cypovirus 1 STRUCTURAL PROTEIN
VP3
None 15 LYS A 838
TYR A 842
ILE A 861
GLY A 862
ARG A 864
ALA A 867
ASP A 868
ASP A 882
PRO A 883
ALA A 884
PHE A 904
ALA A 923
VAL A 924
ASN A 927
PRO A 929
SAM A1102
3P97_A_SAMA263 3p97 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Dengue virus NON-STRUCTURAL
PROTEIN 5
PF01728
(FtsJ)
13 SER A  56
GLY A  58
GLY A  81
GLY A  83
GLY A  86
TRP A  87
THR A 104
LYS A 105
HIS A 110
ASP A 131
VAL A 132
ASP A 146
ILE A 147
SAM A 263
3P97_C_SAMC263 3p97 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Dengue virus NON-STRUCTURAL
PROTEIN 5
None 14 SER C  56
GLY C  58
GLY C  81
GLY C  83
GLY C  86
TRP C  87
THR C 104
LYS C 105
HIS C 110
GLU C 111
ASP C 131
VAL C 132
ASP C 146
ILE C 147
SAM C 263
4CTJ_A_SAMA1263 4ctj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Dengue virus NON-STRUCTURAL
PROTEIN 5
PF01728
(FtsJ)
14 SER A  56
GLY A  58
GLY A  81
GLY A  83
GLY A  86
TRP A  87
THR A 104
LYS A 105
HIS A 110
GLU A 111
ASP A 131
VAL A 132
ASP A 146
ILE A 147
SAM A1263
4CTJ_C_SAMC1263 4ctj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Dengue virus NON-STRUCTURAL
PROTEIN 5
None 14 SER C  56
GLY C  58
GLY C  81
GLY C  83
GLY C  86
TRP C  87
THR C 104
LYS C 105
HIS C 110
GLU C 111
ASP C 131
VAL C 132
ASP C 146
ILE C 147
SAM C1263