DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'RRNA METHYLASE'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
3EEY_A_SAMA300 3eey SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Hungateiclostridi
um thermocellum 		PUTATIVE RRNA
METHYLASE 		PF06962
(rRNA_methylase) 		14 THR A  28
GLY A  30
ASN A  31
ASN A  33
ASP A  34
ASP A  52
ILE A  53
GLN A  54
GLY A  80
HIS A  81
GLN A  82
ASN A  98
LEU A 102
THR A 111
 SAM A 300
3EEY_B_SAMB300 3eey SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Hungateiclostridi
um thermocellum 		PUTATIVE RRNA
METHYLASE 		None 14 THR B  28
GLY B  30
ASN B  31
ASN B  33
ASP B  34
ASP B  52
ILE B  53
GLN B  54
GLY B  80
HIS B  81
GLN B  82
ASN B  98
LEU B 102
THR B 111
 SAM B 300
3EEY_C_SAMC300 3eey SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Hungateiclostridi
um thermocellum 		PUTATIVE RRNA
METHYLASE 		None 16 THR C  28
GLY C  30
ASN C  31
ASN C  33
ASP C  34
ASP C  52
ILE C  53
GLN C  54
GLY C  80
HIS C  81
GLN C  82
ASN C  98
LEU C 102
THR C 111
THR C 115
HIS B 194
 SAM C 300
3EEY_D_SAMD300 3eey SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Hungateiclostridi
um thermocellum 		PUTATIVE RRNA
METHYLASE 		None
PF06962
(rRNA_methylase) 		16 THR D  28
GLY D  30
ASN D  31
ASN D  33
ASP D  34
ASP D  52
ILE D  53
GLN D  54
GLY D  80
HIS D  81
GLN D  82
ASN D  98
LEU D 102
PRO D 103
THR D 111
HIS A 195
 SAM D 300
3EEY_E_SAME300 3eey SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Hungateiclostridi
um thermocellum 		PUTATIVE RRNA
METHYLASE 		None 15 THR E  28
GLY E  30
ASN E  31
ASN E  33
ASP E  34
ASP E  52
ILE E  53
GLN E  54
GLY E  80
HIS E  81
GLN E  82
ASN E  98
LEU E 102
THR E 111
THR E 115
 SAM E 300
3EEY_F_SAMF300 3eey SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Hungateiclostridi
um thermocellum 		PUTATIVE RRNA
METHYLASE 		None 14 THR F  28
GLY F  30
ASN F  33
ASP F  34
ASP F  52
ILE F  53
GLN F  54
GLY F  80
HIS F  81
GLN F  82
ASN F  98
LEU F 102
THR F 111
THR F 115
 SAM F 300
3EEY_H_SAMH300 3eey SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Hungateiclostridi
um thermocellum 		PUTATIVE RRNA
METHYLASE 		None 14 THR H  28
GLY H  30
ASN H  31
ASN H  33
ASP H  34
ASP H  52
ILE H  53
GLN H  54
GLY H  80
HIS H  81
GLN H  82
ASN H  98
LEU H 102
THR H 111
 SAM H 300
3EEY_I_SAMI300 3eey SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Hungateiclostridi
um thermocellum 		PUTATIVE RRNA
METHYLASE 		None 14 THR I  28
GLY I  30
ASN I  31
ASN I  33
ASP I  34
ASP I  52
ILE I  53
GLN I  54
GLY I  80
HIS I  81
GLN I  82
ASN I  98
LEU I 102
THR I 111
 SAM I 300
3EEY_J_SAMJ300 3eey SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Hungateiclostridi
um thermocellum 		PUTATIVE RRNA
METHYLASE 		None 14 THR J  28
GLY J  30
ASN J  31
ASN J  33
ASP J  34
ASP J  52
ILE J  53
GLN J  54
GLY J  80
HIS J  81
GLN J  82
ASN J  98
LEU J 102
THR J 111
 SAM J 300
3FZG_A_SAMA300 3fzg SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE PF07091
(FmrO) 		14 HIS A  83
SER A  85
THR A  86
ARG A  89
PHE A 113
GLY A 114
GLY A 116
ASP A 137
ILE A 138
LEU A 179
LYS A 180
MET A 181
VAL A 184
GLN A 188
 SAM A 300
3M6V_A_SAMA465 3m6v SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RRNA METHYLASE PF01189
(Methyltr_RsmF_N)
PF17125
(RsmF_methylt_CI)
PF17126
(Methyltr_RsmB-F) 		13 ALA A 109
PRO A 112
GLY A 113
GLY A 114
LYS A 115
GLU A 133
VAL A 134
ASP A 135
ARG A 138
PRO A 160
ASP A 177
PRO A 179
LEU A 211
 SAM A 465
3M6V_B_SAMB465 3m6v SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RRNA METHYLASE None 13 ALA B 109
PRO B 112
GLY B 113
GLY B 114
LYS B 115
GLU B 133
VAL B 134
ASP B 135
ARG B 138
PRO B 160
ASP B 177
PRO B 179
LEU B 211
 SAM B 465
3M6W_A_SAMA465 3m6w SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RRNA METHYLASE PF01189
(RsmF_methylt_CI)
PF17125
(Methyltr_RsmB-F)
PF17126
(Methyltr_RsmF_N) 		14 ALA A 109
PRO A 112
GLY A 113
GLY A 114
LYS A 115
GLU A 133
VAL A 134
ASP A 135
ARG A 138
PRO A 160
ASP A 177
PRO A 179
VAL A 207
LEU A 211
 SAM A 465
3MTE_A_SAMA220 3mte SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE PF02390
(Methyltransf_4) 		16 GLY A  32
GLY A  34
ASN A  38
ASP A  55
PRO A  56
VAL A  57
ASN A  60
ALA A  86
ALA A  87
GLU A  88
LEU A 104
TRP A 107
THR A 109
LEU A 110
SER A 195
TRP A 197
 SAM A 220
3MTE_B_SAMB220 3mte SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE None 16 GLY B  32
GLY B  34
ASN B  38
ASP B  55
PRO B  56
VAL B  57
ALA B  86
ALA B  87
GLU B  88
LEU B 104
PHE B 105
TRP B 107
THR B 109
LEU B 110
SER B 195
TRP B 197
 SAM B 220
3P2K_A_SAMA6735 3p2k SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE PF02390
(Methyltransf_4) 		15 GLY A  32
GLY A  34
ASN A  38
ASP A  55
PRO A  56
ALA A  86
ALA A  87
GLU A  88
LEU A 104
PHE A 105
TRP A 107
THR A 109
LEU A 110
SER A 195
TRP A 197
 SAM A6735
3P2K_B_SAMB6735 3p2k SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE None 14 GLY B  32
GLY B  34
ASN B  38
ASP B  55
PRO B  56
VAL B  57
ALA B  87
GLU B  88
LEU B 104
TRP B 107
THR B 109
LEU B 110
SER B 195
TRP B 197
 SAM B6735
3P2K_C_SAMC6735 3p2k SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE None 17 GLY C  32
GLY C  34
ASN C  38
ASP C  55
PRO C  56
VAL C  57
ASN C  60
ALA C  86
ALA C  87
GLU C  88
LEU C 104
PHE C 105
TRP C 107
THR C 109
LEU C 110
SER C 195
TRP C 197
 SAM C6735
3P2K_D_SAMD6735 3p2k SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE None
PF02390
(Methyltransf_4) 		18 GLY D  32
GLY D  34
ASN D  38
ASP D  55
PRO D  56
VAL D  57
ALA D  86
ALA D  87
GLU D  88
LEU D 104
TRP D 107
THR D 109
LEU D 110
TYR D 113
LYS A 191
SER D 195
TRP D 197
PHE A 203
 SAM D6735