DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'RNA LIGASE'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
4AQ7_A_LEUA902 4aq7 LEU

DB00149
(L-
Leucine) 		Escherichia coli LEUCINE--TRNA LIGASE PF00133
(tRNA-synt_1)
PF08264
(tRNA-synt_1_2)
PF13603
(tRNA-synt_1) 		7 MET A  40
LEU A  41
ASP A  80
SER A 496
GLU A 532
HIS A 533
HIS A 537
 LEU A 902
4AQ7_D_LEUD902 4aq7 LEU

DB00149
(L-
Leucine) 		Escherichia coli LEUCINE--TRNA LIGASE None 9 MET D  40
LEU D  41
ASP D  80
SER D 496
TYR D 499
TYR D 527
GLU D 532
HIS D 533
HIS D 537
 LEU D 902
4ARC_A_LEUA1001 4arc LEU

DB00149
(L-
Leucine) 		Escherichia coli LEUCINE--TRNA LIGASE PF00133
(tRNA-synt_1)
PF08264
(tRNA-synt_1)
PF13603
(Anticodon_1) 		7 LEU A  41
TYR A  43
ASP A  80
SER A 496
TYR A 527
HIS A 533
HIS A 537
 LEU A1001
4HVC_A_HFGA1602 4hvc HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Homo sapiens BIFUNCTIONAL
GLUTAMATE/PROLINE--T
RNA LIGASE 		PF00587
(HGTP_anticodon)
PF03129
(ProRS-C_1)
PF09180
(tRNA-synt_2b) 		16 HIS A1093
PHE A1097
GLU A1100
VAL A1101
PRO A1120
THR A1121
GLU A1123
ARG A1152
TRP A1169
GLU A1171
HIS A1173
PHE A1216
THR A1240
HIS A1242
SER A1272
GLY A1274
 HFG A1602
4HVC_B_HFGB1602 4hvc HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Homo sapiens BIFUNCTIONAL
GLUTAMATE/PROLINE--T
RNA LIGASE 		None 17 LEU B1087
HIS B1093
PHE B1097
GLU B1100
VAL B1101
PRO B1120
THR B1121
GLU B1123
ARG B1152
TRP B1169
GLU B1171
HIS B1173
PHE B1216
THR B1240
HIS B1242
SER B1272
GLY B1274
 HFG B1602
4K87_A_ADNA602 4k87 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Homo sapiens PROLINE--TRNA LIGASE PF00587
(tRNA-synt_2b)
PF03129
(HGTP_anticodon)
PF09180
(ProRS-C_1) 		8 ARG A 152
ARG A 163
PHE A 167
GLN A 237
GLY A 239
THR A 240
THR A 276
ARG A 278
 ADN A 602
4K88_A_HFGA602 4k88 HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Homo sapiens PROLINE--TRNA LIGASE PF00587
(ProRS-C_1)
PF03129
(tRNA-synt_2b)
PF09180
(HGTP_anticodon) 		12 PHE A  97
GLU A 100
VAL A 101
PRO A 120
THR A 121
GLU A 123
ARG A 152
TRP A 169
GLU A 171
PHE A 216
HIS A 242
SER A 272
 HFG A 602
4KR3_A_GLYA701 4kr3 GLY

DB00145
(Glycine) 		Homo sapiens GLYCINE--TRNA LIGASE PF00587
(HGTP_anticodon)
PF03129
(tRNA-synt_2b) 		6 GLU A 245
ARG A 277
GLU A 296
ARG A 410
GLU A 522
SER A 524
 GLY A 701
4OLF_A_HFGA802 4olf HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Plasmodium
falciparum 		PROLINE--TRNA LIGASE PF00587
(tRNA-synt_2b)
PF03129
(HGTP_anticodon)
PF09180
(ProRS-C_1) 		16 PHE A 335
GLU A 338
VAL A 339
PRO A 358
THR A 359
GLU A 361
ARG A 390
TRP A 407
GLU A 409
HIS A 411
PHE A 454
THR A 478
HIS A 480
SER A 508
TRP A 509
GLY A 510
 HFG A 802
4Q15_A_HFGA803 4q15 HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Plasmodium
falciparum 		PROLINE--TRNA LIGASE PF00587
(HGTP_anticodon)
PF03129
(ProRS-C_1)
PF09180
(tRNA-synt_2b) 		15 LEU A 325
PHE A 335
GLU A 338
VAL A 339
PRO A 358
THR A 359
GLU A 361
ARG A 390
TRP A 407
HIS A 411
PHE A 454
THR A 478
HIS A 480
SER A 508
GLY A 510
 HFG A 803
4Q15_B_HFGB803 4q15 HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Plasmodium
falciparum 		PROLINE--TRNA LIGASE None 15 LEU B 325
PHE B 335
GLU B 338
VAL B 339
PRO B 358
THR B 359
GLU B 361
ARG B 390
TRP B 407
GLU B 409
PHE B 454
THR B 478
HIS B 480
SER B 508
GLY B 510
 HFG B 803
4RDX_A_HISA502 4rdx HIS

DB00117
(L-
Histidine) 		Thermus
thermophilus 		HISTIDINE--TRNA
LIGASE 		PF03129
(tRNA-synt_His)
PF13393
(HGTP_anticodon) 		7 THR A  83
GLU A 130
ARG A 259
TYR A 264
GLY A 285
TYR A 288
GLY A 304
 HIS A 502
4YDQ_A_HFGA802 4ydq HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Plasmodium
falciparum 		PROLINE--TRNA LIGASE PF00587
(ProRS-C_1)
PF03129
(tRNA-synt_2b)
PF09180
(HGTP_anticodon) 		16 LEU A 325
PHE A 335
GLU A 338
VAL A 339
PRO A 358
THR A 359
GLU A 361
ARG A 390
TRP A 407
GLU A 409
HIS A 411
PHE A 454
THR A 478
HIS A 480
SER A 508
GLY A 510
 HFG A 802
4YDQ_B_HFGB802 4ydq HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Plasmodium
falciparum 		PROLINE--TRNA LIGASE None 15 PHE B 335
GLU B 338
VAL B 339
PRO B 358
THR B 359
GLU B 361
ARG B 390
TRP B 407
GLU B 409
HIS B 411
PHE B 454
THR B 478
HIS B 480
SER B 508
GLY B 510
 HFG B 802
5E3I_A_HISA502 5e3i HIS

DB00117
(L-
Histidine) 		Acinetobacter
baumannii 		HISTIDINE--TRNA
LIGASE 		PF03129
(tRNA-synt_His)
PF13393
(HGTP_anticodon) 		12 GLU A  85
THR A  87
ARG A 115
GLN A 129
GLU A 133
LEU A 263
TYR A 265
TYR A 266
GLY A 287
TYR A 290
GLY A 309
ALA A 311
 HIS A 502
5E3I_B_HISB502 5e3i HIS

DB00117
(L-
Histidine) 		Acinetobacter
baumannii 		HISTIDINE--TRNA
LIGASE 		None 11 GLU B  85
THR B  87
ARG B 115
GLN B 129
GLU B 133
TYR B 265
TYR B 266
GLY B 287
TYR B 290
GLY B 309
ALA B 311
 HIS B 502
5IFU_A_GBMA801 5ifu GBM

DB01016
(Glyburide) 		Plasmodium
falciparum 		PROLINE--TRNA LIGASE PF00587
(tRNA-synt_2b)
PF03129
(HGTP_anticodon)
PF09180
(ProRS-C_1) 		13 PHE A 262
TYR A 266
ILE A 276
TYR A 285
LEU A 287
GLU A 404
THR A 513
ARG A 514
ILE A 516
GLY A 517
ILE A 520
MET A 521
TYR A 746
 GBM A 801
5IFU_B_GBMB801 5ifu GBM

DB01016
(Glyburide) 		Plasmodium
falciparum 		PROLINE--TRNA LIGASE no annotation 9 TYR B 266
ILE B 276
TYR B 285
LEU B 287
GLU B 404
THR B 513
ARG B 514
ILE B 516
GLY B 517
 GBM B 801
5V0I_A_TRPA402 5v0i TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Escherichia coli TRYPTOPHAN--TRNA
LIGASE 		PF00579
(tRNA-synt_1b) 		9 GLY A   9
GLN A  11
VAL A  42
HIS A  45
MET A 132
ASP A 135
ILE A 136
VAL A 144
GLN A 150
 TRP A 402
5V0I_B_TRPB402 5v0i TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Escherichia coli TRYPTOPHAN--TRNA
LIGASE 		None 9 GLY B   9
GLN B  11
VAL B  42
HIS B  45
MET B 132
ASP B 135
ILE B 136
VAL B 144
GLN B 150
 TRP B 402
6BNI_A_ADNA602 6bni ADN

DB00640
(Adenosine) 		Cryptosporidium
parvum 		LYSINE--TRNA LIGASE no annotation 10 ASN A 293
ARG A 295
GLU A 297
HIS A 303
PHE A 307
ALA A 309
GLU A 464
GLY A 520
ARG A 523
ILE A 534
 ADN A 602
6BNI_B_ADNB602 6bni ADN

DB00640
(Adenosine) 		Cryptosporidium
parvum 		LYSINE--TRNA LIGASE no annotation 10 ASN B 293
ARG B 295
GLU B 297
HIS B 303
PHE B 307
ALA B 309
GLU B 464
GLY B 520
ARG B 523
ILE B 534
 ADN B 602