DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'RIBONUCLEASE'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1DY5_A_ACTA600 1dy5 ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Bos taurus RIBONUCLEASE A PF00074
(RnaseA)
4 HIS A  12
VAL A  43
ASN A  44
THR A  45
ACT A 600
1DY5_B_ACTB602 1dy5 ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Bos taurus RIBONUCLEASE A None 4 SER B  21
TYR B  25
GLN B  28
MET B  29
ACT B 602
1N3Z_A_ADNA126 1n3z ADN

DB00640
(Adenosine)
Bos taurus RIBONUCLEASE,
SEMINAL
PF00074
(RnaseA)
9 ALA A   4
LYS A   7
CYS A  65
ASN A  67
GLN A  69
ASN A  71
ALA A 109
VAL A 118
HIS A 119
ADN A 126
2HND_A_NVPA999 2hnd NVP

DB00238
(Nevirapine)
Human
immunodeficiency
virus 1
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H
PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb)
10 LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
NVP A 999
2HNY_A_NVPA999 2hny NVP

DB00238
(Nevirapine)
Human
immunodeficiency
virus 1
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H
PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb)
10 LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
NVP A 999
2ZD1_A_T27A557 2zd1 T27

DB08864
(Rilpivirine)
Human
immunodeficiency
virus 1
P51 RT;
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H
PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb)
14 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 101
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
T27 A 557
2ZE2_A_T27A556 2ze2 T27

DB08864
(Rilpivirine)
Human
immunodeficiency
virus 1
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H
PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb)
10 PRO A  95
ILE A 100
ASN A 103
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
T27 A 556
3BGR_A_T27A556 3bgr T27

DB08864
(Rilpivirine)
Human
immunodeficiency
virus 1
P51 RT;
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H
PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb)
11 LEU A 100
ASN A 103
GLU B 138
VAL A 179
CYS A 181
TYR A 183
TYR A 188
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
T27 A 556
3LP0_A_NVPA701 3lp0 NVP

DB00238
(Nevirapine)
Human
immunodeficiency
virus 1
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H
PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb)
9 LEU A 100
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
NVP A 701
3LP1_A_NVPA701 3lp1 NVP

DB00238
(Nevirapine)
Human
immunodeficiency
virus 1
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H
PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb)
10 LEU A 100
ASN A 103
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
NVP A 701
3M8P_A_65BA562 3m8p 65B

DB06414
(Etravirine)
Human
immunodeficiency
virus 1
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H;
P51 RT
PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_thumb)
PF06815
(RVT_1)
PF06817
(RVT_connect)
PF00078
(RVT_thumb)
PF06815
(RVT_1)
PF06817
(RVT_connect)
11 LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
65B A 562
3QLH_A_T27A555 3qlh T27

DB08864
(Rilpivirine)
Human
immunodeficiency
virus 1
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H
PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb)
12 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 101
LYS A 103
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
PHE A 227
TRP A 229
PRO A 236
TYR A 318
T27 A 555
4B3O_A_EFZA1557 4b3o EFZ

DB00625
(Efavirenz)
Human
immunodeficiency
virus 1
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H
PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb)
9 LEU A 100
LYS A 101
LYS A 103
VAL A 106
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
LEU A 234
TYR A 318
EFZ A1557
4B3Q_A_NVPA999 4b3q NVP

DB00238
(Nevirapine)
Human
immunodeficiency
virus 1
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H
PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb)
7 LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
TYR A 181
TYR A 188
LEU A 234
TYR A 318
NVP A 999
4G1Q_A_T27A601 4g1q T27

DB08864
(Rilpivirine)
Human
immunodeficiency
virus 1
P51 RT;
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H
PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb)
15 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 101
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
PRO A 236
TYR A 318
T27 A 601
4ICL_A_T27A601 4icl T27

DB08864
(Rilpivirine)
Human
immunodeficiency
virus 1
P51 RT;
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H
PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb)
14 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 101
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
T27 A 601
4ID5_A_T27A601 4id5 T27

DB08864
(Rilpivirine)
Human
immunodeficiency
virus 1
P51 RT;
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H
PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb)
14 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
PRO A 236
TYR A 318
T27 A 601
4IDK_A_T27A601 4idk T27

DB08864
(Rilpivirine)
Human
immunodeficiency
virus 1
P51 RT;
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H
PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb)
14 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 101
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
T27 A 601
4IFV_A_T27A601 4ifv T27

DB08864
(Rilpivirine)
Human
immunodeficiency
virus 1
EXORIBONUCLEASE H,
P66 RT;
GAG-POL POLYPROTEIN
PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb)
14 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
PRO A 236
TYR A 318
T27 A 601
4IFY_A_T27A601 4ify T27

DB08864
(Rilpivirine)
Human
immunodeficiency
virus 1
P51 RT;
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H
PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb)
14 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
PRO A 236
TYR A 318
T27 A 601
4IG3_A_T27A601 4ig3 T27

DB08864
(Rilpivirine)
Human
immunodeficiency
virus 1
P51 RT;
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H
PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb)
14 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
PRO A 236
TYR A 318
T27 A 601
4KFB_A_T27A607 4kfb T27

DB08864
(Rilpivirine)
Human
immunodeficiency
virus 1
P51 RT;
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H,
EXORIBONUCLEA P66 RT
PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb)
14 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
PRO A 236
TYR A 318
T27 A 607
5HBM_A_NVPA601 5hbm NVP

DB00238
(Nevirapine)
Human
immunodeficiency
virus 1
REVERSE
TRANSCRIPTASE/RIBONU
CLEASE H
PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb)
11 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
NVP A 601
5NFJ_A_SAMA501 5nfj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Homo sapiens MITOCHONDRIAL
RIBONUCLEASE P
PROTEIN 1
PF01746
(tRNA_m1G_MT)
14 LEU A 290
THR A 291
ALA A 292
ILE A 309
GLY A 310
ASP A 314
THR A 321
SER A 322
LEU A 336
LEU A 338
ASN A 350
LEU A 351
LEU A 353
MET A 356
SAM A 501
5NFJ_B_SAMB501 5nfj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Homo sapiens MITOCHONDRIAL
RIBONUCLEASE P
PROTEIN 1
None 12 LEU B 290
ALA B 292
ILE B 309
GLY B 310
ASP B 314
THR B 321
SER B 322
LEU B 336
LEU B 338
ASN B 350
LEU B 351
MET B 356
SAM B 501
5NFJ_C_SAMC501 5nfj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Homo sapiens MITOCHONDRIAL
RIBONUCLEASE P
PROTEIN 1
None 12 LEU C 290
ALA C 292
ILE C 309
GLY C 310
ASP C 314
THR C 321
SER C 322
LEU C 336
LEU C 338
ASN C 350
LEU C 351
MET C 356
SAM C 501