DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'RETINOL-BINDING PROTEIN'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1AQB_A_RTLA185 1aqb RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Sus scrofa RETINOL-BINDING
PROTEIN
PF00061
(Lipocalin)
10 LEU A  35
ALA A  55
VAL A  61
MET A  73
MET A  88
TYR A  90
LEU A  97
GLN A  98
HIS A 104
PHE A 135
RTL A 185
1EII_A_RTLA135 1eii RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Rattus norvegicus CELLULAR
RETINOL-BINDING
PROTEIN II
PF00061
(Lipocalin)
19 MET A  11
TYR A  20
THR A  30
ALA A  34
GLN A  39
LYS A  41
ILE A  43
THR A  52
THR A  54
SER A  56
PHE A  58
ARG A  59
TYR A  61
LEU A  63
LEU A  78
ARG A 105
TRP A 107
GLN A 109
LEU A 120
RTL A 135
1IIU_A_RTLA176 1iiu RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Gallus gallus PLASMA
RETINOL-BINDING
PROTEIN
PF00061
(Lipocalin)
11 LEU A  35
LEU A  37
ALA A  55
ALA A  57
MET A  73
MET A  88
TYR A  90
LEU A  97
GLN A  98
HIS A 104
ARG A 121
RTL A 176
1KGL_A_RTLA175 1kgl RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Rattus norvegicus CELLULAR
RETINOL-BINDING
PROTEIN TYPE I
PF00061
(Lipocalin)
19 PHE A  16
LEU A  29
ALA A  33
LEU A  36
PRO A  38
LYS A  40
ILE A  51
THR A  53
SER A  55
PHE A  57
ARG A  58
TYR A  60
MET A  62
GLY A  76
ILE A  77
TRP A 106
GLN A 108
LEU A 117
MET A 119
RTL A 175
1KQW_A_RTLA135 1kqw RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Danio rerio CELLULAR
RETINOL-BINDING
PROTEIN
PF00061
(Lipocalin)
14 PHE A  16
MET A  20
ILE A  25
GLN A  38
LYS A  40
THR A  51
THR A  53
ARG A  58
VAL A  62
LEU A  77
TRP A 106
GLN A 108
LEU A 117
ILE A 119
RTL A 135
1KT3_A_RTLA184 1kt3 RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Bos taurus PLASMA
RETINOL-BINDING
PROTEIN
PF00061
(Lipocalin)
7 LEU A  35
LEU A  37
MET A  73
MET A  88
TYR A  90
LEU A  97
GLN A  98
RTL A 184
1KT4_A_RTLA184 1kt4 RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Bos taurus PLASMA
RETINOL-BINDING
PROTEIN
PF00061
(Lipocalin)
13 LEU A  35
LEU A  37
ALA A  55
ALA A  57
VAL A  61
MET A  73
MET A  88
TYR A  90
LEU A  97
GLN A  98
HIS A 104
ARG A 121
TYR A 133
RTL A 184
1KT5_A_RTLA176 1kt5 RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Bos taurus PLASMA
RETINOL-BINDING
PROTEIN
PF00061
(Lipocalin)
13 LEU A  35
LEU A  37
PHE A  45
ALA A  55
ALA A  57
MET A  73
MET A  88
TYR A  90
LEU A  97
GLN A  98
HIS A 104
ARG A 121
TYR A 133
RTL A 176
1KT6_A_RTLA184 1kt6 RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Bos taurus PLASMA
RETINOL-BINDING
PROTEIN
PF00061
(Lipocalin)
11 LEU A  35
LEU A  37
ALA A  55
VAL A  61
MET A  73
MET A  88
TYR A  90
LEU A  97
GLN A  98
HIS A 104
ARG A 121
RTL A 184
1KT7_A_RTLA184 1kt7 RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Bos taurus PLASMA
RETINOL-BINDING
PROTEIN
PF00061
(Lipocalin)
11 LEU A  35
LEU A  37
ALA A  55
VAL A  61
MET A  73
MET A  88
TYR A  90
LEU A  97
GLN A  98
HIS A 104
ARG A 121
RTL A 184
1MX8_A_RTLA135 1mx8 RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Rattus norvegicus CELLULAR
RETINOL-BINDING
PROTEIN I, HOLO
PF00061
(Lipocalin)
14 PHE A  16
TYR A  19
LEU A  20
LEU A  29
ALA A  33
LEU A  36
PRO A  38
THR A  53
ARG A  58
TYR A  60
MET A  62
PHE A  64
ILE A  77
TRP A 106
RTL A 135
1RBP_A_RTLA183 1rbp RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Homo sapiens PLASMA
RETINOL-BINDING
PROTEIN PRECURSOR
PF00061
(Lipocalin)
13 LEU A  35
LEU A  37
ALA A  43
PHE A  45
ALA A  55
ALA A  57
VAL A  61
LEU A  63
MET A  73
MET A  88
LEU A  97
GLN A  98
HIS A 104
RTL A 183
2RCT_A_RTLA140 2rct RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Homo sapiens RETINOL-BINDING
PROTEIN II, CELLULAR
PF00061
(Lipocalin)
15 PHE A  16
MET A  20
ILE A  25
ALA A  33
GLN A  38
LYS A  40
THR A  51
THR A  53
ARG A  58
TYR A  60
VAL A  62
LEU A  77
TRP A 106
GLN A 108
LEU A 117
RTL A 140
3BSZ_E_RTLE177 3bsz RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Homo sapiens PLASMA
RETINOL-BINDING
PROTEIN
PF00061
(Lipocalin)
11 LEU E  37
ALA E  43
ALA E  57
VAL E  61
MET E  73
MET E  88
LEU E  97
GLN E  98
HIS E 104
GLN E 117
PHE E 135
RTL E 177
3BSZ_F_RTLF178 3bsz RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Homo sapiens PLASMA
RETINOL-BINDING
PROTEIN
None 11 LEU F  37
ALA F  43
PHE F  45
ALA F  55
MET F  73
MET F  88
TYR F  90
GLN F  98
HIS F 104
GLN F 117
PHE F 135
RTL F 178
4QYN_A_RTLA201 4qyn RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Homo sapiens RETINOL-BINDING
PROTEIN 2
PF00061
(Lipocalin)
13 PHE A  16
MET A  20
ILE A  25
ALA A  33
LYS A  40
THR A  51
THR A  53
TYR A  60
VAL A  62
LEU A  77
TRP A 106
GLN A 108
LEU A 117
RTL A 201
4QYN_B_RTLB201 4qyn RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Homo sapiens RETINOL-BINDING
PROTEIN 2
None 13 PHE B  16
MET B  20
ILE B  25
GLN B  38
LYS B  40
THR B  51
THR B  53
ARG B  58
LEU B  77
TRP B 106
GLN B 108
LEU B 117
LEU B 119
RTL B 201
4QZT_A_ACTA202 4qzt ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Homo sapiens RETINOL-BINDING
PROTEIN 2
PF00061
(Lipocalin)
6 TYR A  19
GLU A  72
THR A  74
LEU A  77
GLN A  97
TRP A 106
ACT A 202
4QZT_A_RTLA201 4qzt RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Homo sapiens RETINOL-BINDING
PROTEIN 2
PF00061
(Lipocalin)
15 PHE A  16
MET A  20
ILE A  25
GLN A  38
LYS A  40
THR A  51
THR A  53
TYR A  60
VAL A  62
SER A  76
LEU A  77
TRP A 106
GLN A 108
LEU A 117
LEU A 119
RTL A 201
4QZT_B_ACTB201 4qzt ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Homo sapiens RETINOL-BINDING
PROTEIN 2
None 5 TYR B  19
TYR B  60
GLU B  72
LEU B  77
GLN B  97
ACT B 201
4QZT_C_ACTC202 4qzt ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Homo sapiens RETINOL-BINDING
PROTEIN 2
None 4 GLU C  72
THR C  74
GLN C  97
TRP C 106
ACT C 202
4QZT_C_RTLC201 4qzt RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Homo sapiens RETINOL-BINDING
PROTEIN 2
None 13 PHE C  16
ILE C  25
ALA C  33
GLN C  38
LYS C  40
THR C  51
ARG C  58
TYR C  60
SER C  76
LEU C  77
TRP C 106
GLN C 108
LEU C 119
RTL C 201
4QZU_A_RTLA201 4qzu RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Homo sapiens RETINOL-BINDING
PROTEIN 2
PF00061
(Lipocalin)
13 PHE A  16
ILE A  25
ALA A  33
GLN A  38
LYS A  40
THR A  51
THR A  53
ARG A  58
VAL A  62
LEU A  77
TRP A 106
GLN A 108
LEU A 119
RTL A 201
4QZU_B_ACTB202 4qzu ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Homo sapiens RETINOL-BINDING
PROTEIN 2
None 7 TYR B  19
TYR B  60
LEU B  77
GLN B  97
ARG B 104
TRP B 106
LEU B 119
ACT B 202
4QZU_B_RTLB201 4qzu RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Homo sapiens RETINOL-BINDING
PROTEIN 2
None 13 PHE B  16
MET B  20
ALA B  33
GLN B  38
LYS B  40
THR B  53
ARG B  58
TYR B  60
LEU B  77
TRP B 106
GLN B 108
LEU B 117
LEU B 119
RTL B 201
4QZU_C_ACTC202 4qzu ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Homo sapiens RETINOL-BINDING
PROTEIN 2
None 6 TYR C  19
GLU C  72
THR C  74
GLN C  97
TRP C 106
LEU C 119
ACT C 202
4QZU_C_RTLC201 4qzu RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Homo sapiens RETINOL-BINDING
PROTEIN 2
None 15 PHE C  16
MET C  20
ILE C  25
ALA C  33
GLN C  38
LYS C  40
THR C  51
THR C  53
TYR C  60
VAL C  62
LEU C  77
TRP C 106
GLN C 108
LEU C 117
LEU C 119
RTL C 201
4QZU_D_ACTD201 4qzu ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Homo sapiens RETINOL-BINDING
PROTEIN 2
None 3 ASP D  71
HIS D  81
LYS D  83
ACT D 201
4QZU_D_ACTD202 4qzu ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Homo sapiens RETINOL-BINDING
PROTEIN 2
None
PF00061
(Lipocalin)
5 LYS A  75
ASP D  91
VAL D  92
TRP D 109
GLU D 111
ACT D 202
5H8T_A_RTLA201 5h8t RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Homo sapiens RETINOL-BINDING
PROTEIN 1
PF00061
(Lipocalin)
18 PHE A  16
TYR A  19
LEU A  20
LEU A  29
ALA A  33
LEU A  36
LYS A  40
ILE A  51
THR A  53
SER A  55
ARG A  58
TYR A  60
MET A  62
ILE A  77
TRP A 106
GLN A 108
LEU A 117
MET A 119
RTL A 201
5HBS_A_RTLA201 5hbs RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Homo sapiens RETINOL-BINDING
PROTEIN 1
PF00061
(Lipocalin)
20 PHE A  16
TYR A  19
LEU A  20
VAL A  25
LEU A  29
ALA A  33
LEU A  36
PRO A  38
LYS A  40
ILE A  51
THR A  53
SER A  55
ARG A  58
TYR A  60
MET A  62
ILE A  77
TRP A 106
GLN A 108
LEU A 117
MET A 119
RTL A 201
5LJB_A_RTLA201 5ljb RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Homo sapiens RETINOL-BINDING
PROTEIN 1
PF00061
(Lipocalin)
20 PHE A  16
TYR A  19
LEU A  20
LEU A  29
ALA A  33
LEU A  36
PRO A  38
LYS A  40
ILE A  51
THR A  53
SER A  55
PHE A  57
ARG A  58
TYR A  60
MET A  62
ILE A  77
TRP A 106
GLN A 108
LEU A 117
MET A 119
RTL A 201
5LJC_A_RTLA201 5ljc RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Homo sapiens RETINOL-BINDING
PROTEIN 1
PF00061
(Lipocalin)
19 PHE A  16
TYR A  19
LEU A  20
LEU A  29
ALA A  33
LEU A  36
PRO A  38
LYS A  40
ILE A  51
THR A  53
SER A  55
PHE A  57
ARG A  58
TYR A  60
MET A  62
ILE A  77
TRP A 106
LEU A 117
MET A 119
RTL A 201
5LJD_A_RTLA201 5ljd RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Homo sapiens RETINOL-BINDING
PROTEIN 1
PF00061
(Lipocalin)
9 LEU A  20
LEU A  36
ILE A  51
THR A  53
ILE A  77
TRP A 106
GLN A 108
LEU A 117
MET A 119
RTL A 201
5LJE_A_RTLA201 5lje RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Homo sapiens RETINOL-BINDING
PROTEIN 1
PF00061
(Lipocalin)
18 PHE A  16
LEU A  20
LEU A  29
ALA A  33
LEU A  36
PRO A  38
LEU A  40
ILE A  51
THR A  53
SER A  55
PHE A  57
ARG A  58
TYR A  60
MET A  62
ILE A  77
TRP A 106
LEU A 117
MET A 119
RTL A 201
5NU7_A_RTLA201 5nu7 RTL

DB00162
(Vitamin
A)
Homo sapiens RETINOL-BINDING
PROTEIN 4
PF00061
(Lipocalin)
8 LEU A  37
ALA A  55
VAL A  61
MET A  73
MET A  88
TYR A  90
GLN A  98
HIS A 104
RTL A 201