DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'RETINOIC ACID RECEPTOR'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1FBY_A_9CRA500 1fby 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		PF00104
(Hormone_recep) 		13 ILE A 268
CYS A 269
ALA A 271
ALA A 272
GLN A 275
PHE A 313
ARG A 316
LEU A 326
ALA A 327
VAL A 342
ILE A 345
CYS A 432
HIS A 435
 9CR A 500
1FBY_B_9CRB1500 1fby 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		no annotation 13 ILE B1268
CYS B1269
ALA B1271
ALA B1272
GLN B1275
PHE B1313
ARG B1316
LEU B1326
ALA B1327
VAL B1342
ILE B1345
CYS B1432
HIS B1435
 9CR B1500
1FM6_A_9CRA501 1fm6 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		PF00104
(Hormone_recep) 		14 ILE A 268
ALA A 271
ALA A 272
GLN A 275
TRP A 305
PHE A 313
ARG A 316
LEU A 326
ALA A 327
VAL A 342
ILE A 345
CYS A 432
HIS A 435
LEU A 436
 9CR A 501
1FM6_U_9CRU502 1fm6 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		no annotation 12 ALA U 271
ALA U 272
TRP U 305
PHE U 313
ARG U 316
LEU U 326
ALA U 327
VAL U 342
ILE U 345
CYS U 432
HIS U 435
LEU U 436
 9CR U 502
1FM9_A_9CRA201 1fm9 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		PF00104
(Hormone_recep) 		15 ILE A 268
ALA A 271
ALA A 272
GLN A 275
TRP A 305
LEU A 309
PHE A 313
ARG A 316
LEU A 326
ALA A 327
VAL A 342
ILE A 345
CYS A 432
HIS A 435
LEU A 436
 9CR A 201
1G5Y_B_9CRB501 1g5y 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		no annotation 14 ILE B 268
ALA B 272
GLN B 275
LEU B 276
TRP B 305
LEU B 309
PHE B 313
ARG B 316
LEU B 326
ALA B 327
PHE B 438
PHE B 439
LEU B 441
ILE B 442
 9CR B 501
1G5Y_C_9CRC502 1g5y 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		no annotation 10 ALA C 272
LEU C 309
SER C 312
PHE C 313
ARG C 316
LEU C 326
ALA C 327
PHE C 438
PHE C 439
ILE C 442
 9CR C 502
1K74_A_9CRA463 1k74 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		PF00104
(Hormone_recep) 		15 ILE A 268
ALA A 271
ALA A 272
GLN A 275
TRP A 305
LEU A 309
PHE A 313
ARG A 316
LEU A 326
ALA A 327
VAL A 342
ILE A 345
CYS A 432
HIS A 435
LEU A 436
 9CR A 463
1XDK_A_9CRA500 1xdk 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Mus musculus RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		PF00104
(Hormone_recep) 		14 ILE A 273
ALA A 276
GLN A 280
TRP A 310
ASN A 311
PHE A 318
ARG A 321
LEU A 331
ALA A 332
VAL A 347
ILE A 350
CYS A 437
HIS A 440
LEU A 441
 9CR A 500
1XDK_B_9CRB600 1xdk 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Mus musculus RETINOIC ACID
RECEPTOR, BETA 		PF00104
(Hormone_recep) 		15 PHE B 221
LEU B 224
ALA B 225
CYS B 228
LEU B 259
LEU B 262
ILE B 263
ILE B 266
ARG B 269
PHE B 279
SER B 280
PHE B 295
LEU B 298
ARG B 387
LEU B 407
 9CR B 600
1XDK_E_9CRE1500 1xdk 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Mus musculus RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		no annotation 14 ILE E 273
ALA E 276
ALA E 277
GLN E 280
TRP E 310
ASN E 311
PHE E 318
ARG E 321
LEU E 331
ALA E 332
VAL E 347
CYS E 437
HIS E 440
LEU E 441
 9CR E1500
1XDK_F_9CRF1600 1xdk 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Mus musculus RETINOIC ACID
RECEPTOR, BETA 		no annotation 15 PHE F 221
LEU F 224
ALA F 225
CYS F 228
LEU F 259
LEU F 262
ILE F 263
ILE F 266
ARG F 269
PHE F 279
SER F 280
PHE F 295
LEU F 298
ARG F 387
LEU F 407
 9CR F1600
1XLS_A_9CRA801 1xls 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		PF00104
(Hormone_recep) 		14 ILE A 268
ALA A 271
ALA A 272
GLN A 275
TRP A 305
LEU A 309
PHE A 313
ARG A 316
LEU A 326
ALA A 327
VAL A 342
CYS A 432
HIS A 435
LEU A 436
 9CR A 801
1XLS_B_9CRB802 1xls 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		no annotation 14 ILE B 268
ALA B 271
ALA B 272
GLN B 275
TRP B 305
LEU B 309
PHE B 313
ARG B 316
LEU B 326
ALA B 327
VAL B 342
CYS B 432
HIS B 435
LEU B 436
 9CR B 802
1XLS_C_9CRC803 1xls 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		no annotation 14 ILE C 268
ALA C 271
ALA C 272
GLN C 275
TRP C 305
LEU C 309
PHE C 313
ARG C 316
LEU C 326
ALA C 327
VAL C 342
CYS C 432
HIS C 435
LEU C 436
 9CR C 803
1XLS_D_9CRD804 1xls 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		no annotation 14 ILE D 268
ALA D 271
ALA D 272
GLN D 275
TRP D 305
LEU D 309
PHE D 313
ARG D 316
LEU D 326
ALA D 327
VAL D 342
CYS D 432
HIS D 435
LEU D 436
 9CR D 804
2ACL_A_REAA502 2acl REA

DB00755
(Tretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		PF00104
(Hormone_recep)
no annotation 		12 ALA A 271
ALA A 272
GLN A 275
ASN A 306
LEU A 309
PHE A 313
ARG A 316
LEU A 326
ALA A 327
ILE A 345
CYS A 432
LEU E 436
 REA A 502
2ACL_C_REAC503 2acl REA

DB00755
(Tretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		no annotation 10 ILE C 268
ALA C 271
ALA C 272
GLN C 275
ASN C 306
PHE C 313
ARG C 316
ALA C 327
ILE C 345
CYS C 432
 REA C 503
2ACL_E_REAE504 2acl REA

DB00755
(Tretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		no annotation 11 ILE E 268
ALA E 271
ALA E 272
GLN E 275
ASN E 306
LEU E 309
PHE E 313
ARG E 316
ALA E 327
ILE E 345
CYS E 432
 REA E 504
2ACL_G_REAG501 2acl REA

DB00755
(Tretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		no annotation 13 ILE G 268
ALA G 271
ALA G 272
GLN G 275
ASN G 306
LEU G 309
ILE G 310
PHE G 313
ARG G 316
LEU G 326
ALA G 327
CYS G 432
LEU C 436
 REA G 501
2LBD_A_REAA500 2lbd REA

DB00755
(Tretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR GAMMA 		PF00104
(Hormone_recep) 		12 PHE A 230
LYS A 236
CYS A 237
LEU A 271
MET A 272
ARG A 274
ILE A 275
ARG A 278
PHE A 288
SER A 289
GLY A 393
LEU A 400
 REA A 500
3A9E_B_REAB1 3a9e REA

DB00755
(Tretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR ALPHA 		PF00104
(Hormone_recep) 		11 PHE B 228
SER B 232
CYS B 235
LEU B 269
ILE B 273
ARG B 276
PHE B 286
SER B 287
PHE B 302
VAL B 395
LEU B 398
 REA B   1
3DZU_A_9CRA7223 3dzu 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		PF00104
(Hormone_recep)
PF00105
(zf-C4) 		13 ILE A 268
ALA A 271
GLN A 275
ASN A 306
ILE A 310
PHE A 313
ARG A 316
LEU A 326
VAL A 342
ILE A 345
CYS A 432
HIS A 435
LEU A 436
 9CR A7223
3DZY_A_9CRA463 3dzy 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		PF00104
(Hormone_recep)
PF00105
(zf-C4) 		13 ILE A 268
ALA A 271
GLN A 275
ASN A 306
SER A 312
PHE A 313
ARG A 316
LEU A 326
ALA A 327
VAL A 342
CYS A 432
HIS A 435
LEU A 436
 9CR A 463
3E00_A_9CRA7223 3e00 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		PF00104
(Hormone_recep)
PF00105
(zf-C4) 		13 ILE A 268
ALA A 271
ALA A 272
GLN A 275
TRP A 305
ASN A 306
PHE A 313
ARG A 316
ALA A 327
VAL A 342
ILE A 345
CYS A 432
HIS A 435
 9CR A7223
3FAL_A_REAA501 3fal REA

DB00755
(Tretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		PF00104
(Hormone_recep) 		10 ILE A 268
ALA A 271
ALA A 272
GLN A 275
PHE A 313
ARG A 316
ALA A 327
VAL A 342
ILE A 345
CYS A 432
 REA A 501
3FAL_C_REAC501 3fal REA

DB00755
(Tretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		no annotation 10 ILE C 268
ALA C 271
ALA C 272
GLN C 275
PHE C 313
ARG C 316
LEU C 326
ALA C 327
ILE C 345
CYS C 432
 REA C 501
3FC6_A_REAA501 3fc6 REA

DB00755
(Tretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		PF00104
(Hormone_recep) 		11 ILE A 268
ALA A 271
ALA A 272
GLN A 275
TRP A 305
PHE A 313
ARG A 316
LEU A 326
ALA A 327
ILE A 345
CYS A 432
 REA A 501
3FC6_C_REAC501 3fc6 REA

DB00755
(Tretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		no annotation 14 VAL C 265
CYS C 269
ALA C 271
ALA C 272
GLN C 275
ASN C 306
LEU C 309
PHE C 313
ARG C 316
LEU C 326
ALA C 327
VAL C 342
ILE C 345
CYS C 432
 REA C 501
3H0A_A_9RAA500 3h0a 9RA

DB00307
(Bexarotene) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		PF00104
(Hormone_recep) 		15 ILE A 268
ALA A 271
ALA A 272
GLN A 275
TRP A 305
LEU A 309
PHE A 313
ARG A 316
LEU A 326
ALA A 327
VAL A 342
ILE A 345
CYS A 432
HIS A 435
LEU A 436
 9RA A 500
3LBD_A_9CRA424 3lbd 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR GAMMA 		PF00104
(Hormone_recep) 		14 PHE A 230
ALA A 234
LEU A 268
LEU A 271
MET A 272
ILE A 275
ARG A 278
PHE A 288
SER A 289
PHE A 304
GLY A 393
ALA A 397
LEU A 400
ILE A 412
 9CR A 424
3OAP_A_9CRA500 3oap 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		PF00104
(Hormone_recep) 		14 ILE A 268
ALA A 271
ALA A 272
GLN A 275
LEU A 309
PHE A 313
ARG A 316
LEU A 326
ALA A 327
VAL A 342
ILE A 345
CYS A 432
HIS A 435
LEU A 436
 9CR A 500
3UVV_B_9CRB501 3uvv 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		PF00104
(Hormone_recep) 		12 ILE B 268
ALA B 271
ALA B 272
GLN B 275
LEU B 309
PHE B 313
ARG B 316
ALA B 327
VAL B 342
ILE B 345
CYS B 432
LEU B 436
 9CR B 501
4DM8_A_REAA501 4dm8 REA

DB00755
(Tretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR BETA 		PF00104
(Hormone_recep) 		11 PHE A 230
CYS A 237
LEU A 268
LEU A 271
ILE A 272
ARG A 278
PHE A 288
SER A 289
LEU A 307
LEU A 400
ILE A 412
 REA A 501
4DM8_B_REAB1501 4dm8 REA

DB00755
(Tretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR BETA 		no annotation 14 PHE B1201
PHE B1230
LEU B1233
ALA B1234
LEU B1268
LEU B1271
ILE B1272
ARG B1278
PHE B1288
SER B1289
PHE B1304
LEU B1307
GLY B1393
LEU B1400
 REA B1501
4K6I_A_9RAA500 4k6i 9RA

DB00307
(Bexarotene) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		PF00104
(Hormone_recep) 		14 ILE A 268
ALA A 271
ALA A 272
GLN A 275
LEU A 309
ILE A 310
PHE A 313
ARG A 316
LEU A 326
ALA A 327
ILE A 345
VAL A 349
CYS A 432
HIS A 435
 9RA A 500
4NQA_A_9CRA501 4nqa 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		PF00104
(Hormone_recep)
PF00105
(zf-C4) 		11 ILE A 268
ALA A 272
GLN A 275
PHE A 313
ARG A 316
LEU A 326
ALA A 327
VAL A 342
CYS A 432
HIS A 435
LEU A 436
 9CR A 501
4NQA_H_9CRH501 4nqa 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		no annotation 12 ILE H 268
ALA H 271
ALA H 272
GLN H 275
PHE H 313
ARG H 316
LEU H 326
ALA H 327
ILE H 345
CYS H 432
HIS H 435
LEU H 436
 9CR H 501
5JI0_A_9CRA501 5ji0 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		PF00104
(Hormone_recep) 		11 ILE A 268
GLN A 275
TRP A 305
LEU A 309
PHE A 313
ARG A 316
LEU A 326
ALA A 327
VAL A 342
CYS A 432
LEU A 436
 9CR A 501
5M24_A_9CRA501 5m24 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR GAMMA 		PF00104
(Hormone_recep) 		14 TRP A 227
PHE A 230
ALA A 234
LEU A 268
LEU A 271
MET A 272
ILE A 275
ARG A 278
PHE A 288
SER A 289
PHE A 304
GLY A 393
LEU A 400
ILE A 412
 9CR A 501
5UAN_A_9CRA503 5uan 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		no annotation 13 ILE A 268
ALA A 271
ALA A 272
GLN A 275
TRP A 305
LEU A 309
PHE A 313
ARG A 316
LEU A 326
ALA A 327
VAL A 342
CYS A 432
LEU A 436
 9CR A 503
5UAN_B_REAB503 5uan REA

DB00755
(Tretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR BETA 		no annotation 13 PHE B 221
ALA B 225
CYS B 228
LEU B 259
LEU B 262
ILE B 263
ILE B 266
PHE B 279
SER B 280
PHE B 295
LEU B 298
VAL B 388
LEU B 391
 REA B 503
5Z12_B_9CRB501 5z12 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		no annotation 15 ILE B 268
ALA B 271
ALA B 272
GLN B 275
TRP B 305
LEU B 309
PHE B 313
ARG B 316
LEU B 326
ALA B 327
VAL B 342
ILE B 345
CYS B 432
HIS B 435
LEU B 436
 9CR B 501
5Z12_C_9CRC501 5z12 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		no annotation 13 ILE C 268
ALA C 271
ALA C 272
GLN C 275
TRP C 305
PHE C 313
ARG C 316
LEU C 326
ALA C 327
VAL C 342
ILE C 345
CYS C 432
LEU C 436
 9CR C 501
6A5Y_D_9CRD501 6a5y 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		PF00104
(Hormone_recep) 		15 ILE D 268
ALA D 271
ALA D 272
GLN D 275
TRP D 305
ASN D 306
PHE D 313
ARG D 316
LEU D 326
ALA D 327
VAL D 342
ILE D 345
CYS D 432
HIS D 435
LEU D 436
 9CR D 501
6A5Z_D_9CRD501 6a5z 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		PF00104
(Hormone_recep) 		13 ILE D 268
ALA D 271
ALA D 272
GLN D 275
ILE D 310
PHE D 313
ARG D 316
LEU D 326
ALA D 327
ILE D 345
CYS D 432
HIS D 435
LEU D 436
 9CR D 501
6A5Z_L_9CRL501 6a5z 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		None 14 ILE L 268
ALA L 271
ALA L 272
GLN L 275
TRP L 305
ILE L 310
PHE L 313
ARG L 316
LEU L 326
ALA L 327
ILE L 345
CYS L 432
HIS L 435
LEU L 436
 9CR L 501
6A60_D_9CRD501 6a60 9CR

DB00523
(Alitretinoin) 		Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA 		PF00104
(Hormone_recep) 		14 ILE D 268
ALA D 271
ALA D 272
GLN D 275
LEU D 309
ILE D 310
PHE D 313
ARG D 316
LEU D 326
ALA D 327
ILE D 345
CYS D 432
HIS D 435
LEU D 436
 9CR D 501
6EU9_B_REAB601 6eu9 REA

DB00755
(Tretinoin) 		Platynereis
dumerilii 		RETINOIC ACID
RECEPTOR 		no annotation 10 ARG B 355
VAL B 356
LEU B 359
SER B 360
LEU B 394
PHE B 414
GLY B 428
GLY B 519
ARG B 522
VAL B 523
 REA B 601
6EU9_D_READ601 6eu9 REA

DB00755
(Tretinoin) 		Platynereis
dumerilii 		RETINOIC ACID
RECEPTOR 		no annotation 7 VAL D 356
LEU D 394
PHE D 414
LEU D 420
GLY D 428
LEU D 433
GLY D 519
 REA D 601