DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'REGULATORY PROTEIN'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1HZ4_A_BEZA784 1hz4 BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid)
Escherichia coli MALT REGULATORY
PROTEIN
PF17874
(TPR_MalT)
6 TRP A  87
HIS A  88
LEU A 126
LEU A 129
PRO A 130
MET A 131
BEZ A 784
1WMQ_A_HISA2001 1wmq HIS

DB00117
(L-
Histidine)
Bacillus subtilis HUT OPERON POSITIVE
REGULATORY PROTEIN
PF09021
(HutP)
6 ARG A  88
ARG A  98
ILE A 129
GLY A 130
ALA A 131
HIS A 138
HIS A2001
1WMQ_B_HISB1001 1wmq HIS

DB00117
(L-
Histidine)
Bacillus subtilis HUT OPERON POSITIVE
REGULATORY PROTEIN
None 6 ARG B  88
ARG B  98
ILE B 129
GLY B 130
ALA B 131
HIS B 138
HIS B1001
1WPU_A_HISA2001 1wpu HIS

DB00117
(L-
Histidine)
Bacillus subtilis HUT OPERON POSITIVE
REGULATORY PROTEIN
PF09021
(HutP)
6 ARG A  88
ARG A  98
ILE A 129
GLY A 130
ALA A 131
HIS A 138
HIS A2001
1WPU_B_HISB1001 1wpu HIS

DB00117
(L-
Histidine)
Bacillus subtilis HUT OPERON POSITIVE
REGULATORY PROTEIN
None 6 ARG B  88
ARG B  98
ILE B 129
GLY B 130
ALA B 131
HIS B 138
HIS B1001
1WRQ_A_HISA2001 1wrq HIS

DB00117
(L-
Histidine)
Bacillus subtilis HUT OPERON POSITIVE
REGULATORY PROTEIN
PF09021
(HutP)
6 ARG A  88
ARG A  98
ILE A 129
GLY A 130
ALA A 131
HIS A 138
HIS A2001
1WRQ_B_HISB1001 1wrq HIS

DB00117
(L-
Histidine)
Bacillus subtilis HUT OPERON POSITIVE
REGULATORY PROTEIN
None 6 ARG B  88
ARG B  98
ILE B 129
GLY B 130
ALA B 131
HIS B 138
HIS B1001
2Y7K_A_SALA1302 2y7k SAL

DB00936
(Salicylic
acid)
Burkholderia sp.
DNT
LYSR-TYPE REGULATORY
PROTEIN
PF03466
(LysR_substrate)
11 THR A 104
ILE A 106
GLY A 107
TYR A 110
PHE A 111
GLY A 152
PHE A 167
HIS A 169
HIS A 206
PRO A 246
ILE A 273
SAL A1302
2Y7K_A_SALA1303 2y7k SAL

DB00936
(Salicylic
acid)
Burkholderia sp.
DNT
LYSR-TYPE REGULATORY
PROTEIN
PF03466
(LysR_substrate)
7 PRO A  92
SER A  95
PHE A  99
ILE A 126
PRO A 285
GLY A 286
TRP A 289
SAL A1303
2Y7K_B_SALB1304 2y7k SAL

DB00936
(Salicylic
acid)
Burkholderia sp.
DNT
LYSR-TYPE REGULATORY
PROTEIN
no annotation 10 THR B 104
ILE B 106
GLY B 107
TYR B 110
PHE B 111
PHE B 167
HIS B 169
HIS B 206
PRO B 246
ILE B 273
SAL B1304
2Y7K_B_SALB1305 2y7k SAL

DB00936
(Salicylic
acid)
Burkholderia sp.
DNT
LYSR-TYPE REGULATORY
PROTEIN
no annotation 5 SER B  95
ARG B  97
PRO B 285
GLY B 286
TRP B 289
SAL B1305
2Y7K_C_SALC1302 2y7k SAL

DB00936
(Salicylic
acid)
Burkholderia sp.
DNT
LYSR-TYPE REGULATORY
PROTEIN
no annotation 12 THR C 104
ILE C 106
GLY C 107
TYR C 110
PHE C 111
GLY C 152
PHE C 167
HIS C 169
HIS C 206
PRO C 246
ARG C 248
ILE C 273
SAL C1302
2Y7K_D_SALD1300 2y7k SAL

DB00936
(Salicylic
acid)
Burkholderia sp.
DNT
LYSR-TYPE REGULATORY
PROTEIN
no annotation 13 THR D 104
ILE D 106
GLY D 107
TYR D 110
PHE D 111
GLY D 152
LEU D 153
PHE D 167
HIS D 169
HIS D 206
PRO D 246
ARG D 248
ILE D 273
SAL D1300
2Y7P_A_SALA1000 2y7p SAL

DB00936
(Salicylic
acid)
Burkholderia sp.
DNT
LYSR-TYPE REGULATORY
PROTEIN
PF03466
(LysR_substrate)
10 THR A 104
ILE A 106
GLY A 107
TYR A 110
GLY A 152
PHE A 167
HIS A 169
HIS A 206
PRO A 246
ILE A 273
SAL A1000
2Y7P_A_SALA1001 2y7p SAL

DB00936
(Salicylic
acid)
Burkholderia sp.
DNT
LYSR-TYPE REGULATORY
PROTEIN
PF03466
(LysR_substrate)
6 MET A  90
SER A  95
ARG A  97
PRO A 285
GLY A 286
TRP A 289
SAL A1001
2Y7W_A_SALA1300 2y7w SAL

DB00936
(Salicylic
acid)
Burkholderia sp.
DNT
LYSR-TYPE REGULATORY
PROTEIN
PF03466
(LysR_substrate)
9 THR A 104
ILE A 106
GLY A 107
TYR A 110
GLY A 152
PHE A 167
HIS A 169
ARG A 248
ILE A 273
SAL A1300
2Y7W_B_SALB1300 2y7w SAL

DB00936
(Salicylic
acid)
Burkholderia sp.
DNT
LYSR-TYPE REGULATORY
PROTEIN
no annotation 10 THR B 104
ILE B 106
GLY B 107
PHE B 111
GLY B 152
HIS B 169
THR B 204
HIS B 206
PRO B 246
ILE B 273
SAL B1300
2Y7W_C_SALC1300 2y7w SAL

DB00936
(Salicylic
acid)
Burkholderia sp.
DNT
LYSR-TYPE REGULATORY
PROTEIN
no annotation 7 THR C 104
ILE C 106
GLY C 107
PHE C 111
PHE C 167
HIS C 169
ILE C 273
SAL C1300
3BOY_A_HISA1001 3boy HIS

DB00117
(L-
Histidine)
Bacillus subtilis HUT OPERON POSITIVE
REGULATORY PROTEIN
None
PF09021
(HutP)
10 TYR C  69
HIS C  73
TYR C  76
HIS C  77
ARG A  88
ARG A  98
ILE A 129
GLY A 130
ALA A 131
HIS A 138
HIS A1001
3BOY_A_HISA2001 3boy HIS

DB00117
(L-
Histidine)
Bacillus subtilis HUT OPERON POSITIVE
REGULATORY PROTEIN
None
PF09021
(HutP)
10 TYR A  69
HIS A  73
TYR A  76
HIS A  77
ARG B  88
ARG B  98
ILE B 129
GLY B 130
ALA B 131
HIS B 138
HIS A2001
3BOY_A_HISA3001 3boy HIS

DB00117
(L-
Histidine)
Bacillus subtilis HUT OPERON POSITIVE
REGULATORY PROTEIN
None
PF09021
(HutP)
10 TYR B  69
HIS B  73
TYR B  76
HIS B  77
ARG C  88
ARG C  98
ILE C 129
GLY C 130
ALA C 131
HIS C 138
HIS A3001
3NCQ_A_ACTA121 3ncq ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Archaeoglobus
fulgidus
NITROGEN REGULATORY
PROTEIN P-II
(GLNB-2)
PF00543
(P-II)
4 MET A   1
LYS A  66
ASP A  67
ASP A 109
ACT A 121
3NCQ_B_ACTB120 3ncq ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Archaeoglobus
fulgidus
NITROGEN REGULATORY
PROTEIN P-II
(GLNB-2)
None 4 MET B   1
LYS B  66
ASP B  67
ASP B 109
ACT B 120
3NCQ_C_ACTC120 3ncq ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Archaeoglobus
fulgidus
NITROGEN REGULATORY
PROTEIN P-II
(GLNB-2)
None
PF00543
(P-II)
12 LYS A   3
LYS C   3
LYS B   3
GLU C   5
GLU A   5
GLU B   5
LYS B  60
LYS A  60
LYS C  60
GLU C  62
GLU B  62
GLU A  62
ACT C 120
3VW1_B_CVIB301 3vw1 CVI

DB00406
(Gentian
Violet)
Salmonella
enterica
PUTATIVE REGULATORY
PROTEIN
None 13 TYR B  59
LEU B  66
MET B  70
THR B  85
ILE B  88
SER B  91
TYR B  92
ILE B 106
ALA B 110
LEU B 130
PHE B 155
LEU B 156
LEU B 188
CVI B 301
3VW1_D_CVID301 3vw1 CVI

DB00406
(Gentian
Violet)
Salmonella
enterica
PUTATIVE REGULATORY
PROTEIN
None 15 TYR D  59
LEU D  66
CYS D  67
MET D  70
THR D  85
ILE D  88
SER D  91
TYR D  92
ILE D 106
ALA D 110
LEU D 130
CYS D 134
VAL D 138
ASP D 152
PHE D 155
CVI D 301
5D4N_A_ACTA202 5d4n ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Thiomonas
intermedia
NITROGEN REGULATORY
PROTEIN P-II
None
PF00543
(P-II)
4 VAL B  92
VAL A 100
GLY A 101
ARG A 102
ACT A 202
5D4N_C_ACTC201 5d4n ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Thiomonas
intermedia
NITROGEN REGULATORY
PROTEIN P-II
None
PF00543
(P-II)
5 VAL A  92
VAL C 100
GLY C 101
ARG C 102
PHE C 106
ACT C 201
5VLM_A_CVIA301 5vlm CVI

DB00406
(Gentian
Violet)
[Enterobacter]
lignolyticus
REGULATORY PROTEIN
TETR
PF00440
(TetR_N)
20 MET A  67
MET A  68
GLN A  71
ALA A  86
GLY A  88
SER A  89
GLU A  90
LEU A  94
ILE A  98
TRP A 101
ARG A 102
GLN A 105
TYR A 118
TRP A 125
VAL A 159
CYS A 160
ASP A 163
TYR A 166
ASP A 175
PHE A 178
CVI A 301
5VLM_B_CVIB301 5vlm CVI

DB00406
(Gentian
Violet)
[Enterobacter]
lignolyticus
REGULATORY PROTEIN
TETR
None 20 MET B  67
MET B  68
GLN B  71
ALA B  86
GLY B  88
SER B  89
GLU B  90
LEU B  94
ILE B  98
TRP B 101
ARG B 102
GLN B 105
TYR B 118
TRP B 125
VAL B 159
CYS B 160
ASP B 163
TYR B 166
ASP B 175
PHE B 178
CVI B 301
5VLM_C_CVIC301 5vlm CVI

DB00406
(Gentian
Violet)
[Enterobacter]
lignolyticus
REGULATORY PROTEIN
TETR
None 19 MET C  67
MET C  68
GLN C  71
ALA C  86
GLY C  88
GLU C  90
LEU C  94
ILE C  98
TRP C 101
ARG C 102
GLN C 105
TYR C 118
TRP C 125
VAL C 159
CYS C 160
ASP C 163
TYR C 166
ASP C 175
PHE C 178
CVI C 301
5VLM_D_CVID301 5vlm CVI

DB00406
(Gentian
Violet)
[Enterobacter]
lignolyticus
REGULATORY PROTEIN
TETR
None 20 MET D  67
MET D  68
GLN D  71
ALA D  86
GLY D  88
GLU D  90
LEU D  94
ILE D  98
TRP D 101
ARG D 102
GLN D 105
TYR D 118
TRP D 125
VAL D 159
CYS D 160
ASP D 163
TYR D 166
ASP D 175
PHE D 178
THR D 179
CVI D 301
5VLM_E_CVIE301 5vlm CVI

DB00406
(Gentian
Violet)
[Enterobacter]
lignolyticus
REGULATORY PROTEIN
TETR
None 19 MET E  67
MET E  68
GLN E  71
ALA E  86
GLY E  88
GLU E  90
LEU E  94
ILE E  98
TRP E 101
ARG E 102
GLN E 105
TYR E 118
TRP E 125
VAL E 159
CYS E 160
ASP E 163
TYR E 166
ASP E 175
PHE E 178
CVI E 301
5VLM_F_CVIF301 5vlm CVI

DB00406
(Gentian
Violet)
[Enterobacter]
lignolyticus
REGULATORY PROTEIN
TETR
None 20 MET F  67
MET F  68
GLN F  71
ALA F  86
GLY F  88
SER F  89
GLU F  90
LEU F  94
ILE F  98
TRP F 101
ARG F 102
GLN F 105
TYR F 118
TRP F 125
VAL F 159
CYS F 160
ASP F 163
TYR F 166
ASP F 175
PHE F 178
CVI F 301
5VLM_G_CVIG301 5vlm CVI

DB00406
(Gentian
Violet)
[Enterobacter]
lignolyticus
REGULATORY PROTEIN
TETR
None 19 MET G  67
MET G  68
GLN G  71
ALA G  86
GLY G  88
GLU G  90
LEU G  94
ILE G  98
TRP G 101
ARG G 102
GLN G 105
TYR G 118
TRP G 125
VAL G 159
CYS G 160
ASP G 163
TYR G 166
ASP G 175
PHE G 178
CVI G 301
5VLM_H_CVIH301 5vlm CVI

DB00406
(Gentian
Violet)
[Enterobacter]
lignolyticus
REGULATORY PROTEIN
TETR
None 20 MET H  67
MET H  68
GLN H  71
ALA H  86
GLY H  88
SER H  89
GLU H  90
LEU H  94
ILE H  98
TRP H 101
ARG H 102
GLN H 105
TYR H 118
TRP H 125
VAL H 159
CYS H 160
ASP H 163
TYR H 166
ASP H 175
PHE H 178
CVI H 301
6IE8_A_CHDA201 6ie8 CHD

DB02659
(Cholic
Acid)
Salmonella
enterica
REGULATORY PROTEIN PF00440
(TetR_N)
13 TYR A  59
LYS A  63
LEU A  66
THR A  85
ILE A  88
TYR A  92
ALA A 110
CYS A 134
LEU A 139
MET A 140
ARG A 148
ASP A 152
LEU A 156
CHD A 201