DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'PSI'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1AQ7_B_AG2B4 1aq7 AG2

DB08838
(Agmatine) 		Bos taurus;
Microcystis
aeruginosa 		AERUGINOSIN 98-B;
TRYPSIN 		PF00089
(Trypsin)
no annotation 		8 HIS A  57
ASP A 189
SER A 190
GLN A 192
SER A 195
VAL A 213
GLY A 216
GLY A 226
 AG2 B   4
1ETR_H_MITH1 1etr MIT

DB00278
(Argatroban) 		Bos taurus EPSILON-THROMBIN PF00089
(Trypsin) 		12 HIS H  57
TYR H  60
TRP H  60
LEU H  99
ASP H 189
GLU H 192
SER H 195
VAL H 213
TRP H 215
GLY H 216
CYS H 220
GLY H 226
 MIT H   1
1RL8_A_RITA9001 1rl8 RIT

DB00503
(Ritonavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation 		24 ARG B   8
ARG A   8
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL A  32
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
ALA B  82
ALA A  82
ILE A  84
ILE B  84
 RIT A9001
1SDT_B_MK1B902 1sdt MK1

DB00224
(Indinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation 		22 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ILE A  47
GLY A  48
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
 MK1 B 902
1SDU_B_MK1B902 1sdu MK1

DB00224
(Indinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation 		24 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ALA A  28
ILE A  47
GLY A  48
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ARG B 108
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
 MK1 B 902
1SDV_B_MK1B902 1sdv MK1

DB00224
(Indinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation 		21 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ALA A  28
ILE A  47
GLY A  48
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
ILE A  84
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
ILE B 184
 MK1 B 902
1T3R_A_017A1200 1t3r 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation 		21 ARG B   8
LEU B  23
LEU A  23
ASP B  25
ASP A  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
ILE A  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE B  84
 017 A1200
1TNL_A_TPAA900 1tnl TPA

DB00752
(Tranylcypromine) 		Bos taurus TRYPSIN PF00089
(Trypsin) 		6 ASP A 189
SER A 190
SER A 195
VAL A 213
GLY A 216
GLY A 226
 TPA A 900
2OTV_A_NCAA1301 2otv NCA

DB02701
(Nicotinamide) 		Bos taurus CATIONIC TRYPSIN PF00089
(Trypsin) 		6 ASP A 193
SER A 194
SER A 199
VAL A 217
GLY A 220
GLY A 232
 NCA A1301
2PXC_A_SAMA500 2pxc SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Murray Valley
encephalitis
virus 		GENOME POLYPROTEIN
[CONTAINS: CAPSID
PROTEIN C (CORE
PROTEIN);
ENVELOPE PROTEIN M
(MATRIX PROTEIN);
MAJOR ENVELOPE
PROTEIN E;
NON-STRUCTURAL
PROTEIN 1 (NS1);
NON-STRUCTURAL
PROTEIN 2A (NS2A);
FLAVIVIRIN PROTEASE
NS2B REGULATORY
SUBUNIT;
FLAVIVIRIN PROTEASE
NS3 CATALYTIC
SUBUNIT;
NON-STRUCTURAL
PROTEIN 4A (NS4A);
NON-STRUCTURAL
PROTEIN 4B (NS4B);
RNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE (EC
2.7.7.48) (NS5)] 		PF01728
(FtsJ) 		14 SER A  56
GLY A  58
GLY A  81
GLY A  83
GLY A  86
TRP A  87
THR A 104
LYS A 105
HIS A 110
GLU A 111
ASP A 131
VAL A 132
ASP A 146
ILE A 147
 SAM A 500
2PYM_A_1UNA1001 2pym 1UN

DB00220
(Nelfinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation 		29 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASN A  30
ASN B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
THR B  80
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 1UN A1001
2PYN_A_1UNA1001 2pyn 1UN

DB00220
(Nelfinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation 		29 ARG B   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASN A  30
ASN B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
THR B  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 1UN A1001
2Q63_A_1UNA1001 2q63 1UN

DB00220
(Nelfinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation 		30 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASN A  30
ASN B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
THR B  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 1UN A1001
2Q64_B_1UNB1001 2q64 1UN

DB00220
(Nelfinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation 		30 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASN A  30
ASN B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
THR B  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 1UN B1001
2QAK_A_1UNA1001 2qak 1UN

DB00220
(Nelfinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation 		30 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASN A  30
ASN B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
THR B  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 1UN A1001
2QHC_B_AB1B9001 2qhc AB1

DB01601
(Lopinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation 		23 ARG B   8
ARG A   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 AB1 B9001
2RKF_A_AB1A501 2rkf AB1

DB01601
(Lopinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation 		25 ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
ILE B  32
ILE A  32
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
ALA B  82
ALA A  82
ILE A  84
ILE B  84
 AB1 A 501
2RKG_B_AB1B501 2rkg AB1

DB01601
(Lopinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation 		24 LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
ILE B  32
ILE A  32
VAL A  48
VAL B  48
GLY A  50
GLY B  50
ILE B  51
ILE A  51
PRO B  82
PRO A  82
ILE A  85
ILE B  85
 AB1 B 501
3AI8_A_HNQA255 3ai8 HNQ

DB01422
(Nitroxoline) 		Homo sapiens CATHEPSIN B PF00112
(Peptidase_C1) 		7 GLN A  23
GLY A  27
HIS A 110
HIS A 111
CYS A 119
HIS A 199
TRP A 221
 HNQ A 255
3AI8_B_HNQB255 3ai8 HNQ

DB01422
(Nitroxoline) 		Homo sapiens CATHEPSIN B no annotation 6 GLN B  23
GLY B  27
HIS B 110
HIS B 111
CYS B 119
TRP B 221
 HNQ B 255
3BVB_B_017B401 3bvb 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		PROTEASE
(RETROPEPSIN) 		PF00077
(RVP)
no annotation 		26 ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASN B  25
ASN A  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 017 B 401
3GY3_A_PNTA246 3gy3 PNT

DB00738
(Pentamidine) 		Bos taurus CATIONIC TRYPSIN PF00089
(Trypsin) 		11 HIS A  57
LEU A  99
GLN A 175
ASP A 189
SER A 190
GLN A 192
SER A 195
TRP A 215
GLY A 216
CYS A 220
GLY A 226
 PNT A 246
3PRS_A_RITA1001 3prs RIT

DB00503
(Ritonavir) 		Cryphonectria
parasitica 		ENDOTHIAPEPSIN PF00026
(Asp) 		22 ILE A  10
ASP A  11
ASP A  15
ALA A  16
ASP A  33
ASP A  35
GLY A  37
ILE A  77
TYR A  79
GLY A  80
ASP A  81
ASP A 119
LEU A 125
THR A 135
PHE A 194
ILE A 217
ASP A 219
THR A 222
THR A 223
TYR A 226
ILE A 300
ILE A 304
 RIT A1001
3PWW_A_ROCA1001 3pww ROC

DB01232
(Saquinavir) 		Cryphonectria
parasitica 		ENDOTHIAPEPSIN PF00026
(Asp) 		20 ILE A  10
ASP A  15
ASP A  33
ASP A  35
GLY A  37
SER A  38
ILE A  77
TYR A  79
GLY A  80
ASP A  81
SER A  83
PHE A 116
LEU A 125
PHE A 194
ILE A 217
ASP A 219
THR A 222
THR A 223
TYR A 226
ILE A 304
 ROC A1001
3Q70_A_RITA2001 3q70 RIT

DB00503
(Ritonavir) 		Candida albicans CANDIDAPEPSIN-2 PF00026
(Asp) 		18 THR A  13
ILE A  30
ASP A  32
GLY A  34
SER A  35
ILE A  82
TYR A  84
GLY A  85
SER A  88
ILE A 119
ASP A 120
ASN A 131
GLU A 193
ASP A 218
THR A 221
THR A 222
TYR A 225
ILE A 305
 RIT A2001
3QEL_B_QELB1 3qel QEL

DB08954
(Ifenprodil) 		Rattus
norvegicus;
Xenopus laevis 		GLUTAMATE [NMDA]
RECEPTOR SUBUNIT
EPSILON-2;
NMDA GLUTAMATE
RECEPTOR SUBUNIT 		PF01094
(ANF_receptor) 		11 ALA B 107
TYR A 109
GLN B 110
THR A 110
ILE B 111
PHE B 114
ARG A 115
LEU A 135
THR B 174
PRO B 177
GLU B 236
 QEL B   1
3QEL_D_QELD2 3qel QEL

DB08954
(Ifenprodil) 		Rattus
norvegicus;
Xenopus laevis 		GLUTAMATE [NMDA]
RECEPTOR SUBUNIT
EPSILON-2;
NMDA GLUTAMATE
RECEPTOR SUBUNIT 		no annotation 14 PRO D  78
ALA D 107
TYR C 109
GLN D 110
THR C 110
ILE D 111
PHE C 113
PHE D 114
ARG C 115
LEU C 135
THR D 174
PHE D 176
PRO D 177
GLU D 236
 QEL D   2
3RXF_A_4APA9 3rxf 4AP

DB06637
(Dalfampridine) 		Bos taurus CATIONIC TRYPSIN PF00089
(Trypsin) 		6 SER A 190
SER A 195
VAL A 209
TRP A 211
GLY A 212
GLY A 222
 4AP A   9
3RXH_A_HSMA7 3rxh HSM

DB05381
(Histamine) 		Bos taurus CATIONIC TRYPSIN PF00089
(Trypsin) 		5 ASP A 189
SER A 190
SER A 195
VAL A 209
GLY A 222
 HSM A   7
4J4V_A_SVRA301 4j4v SVR

DB04786
(Suramin) 		SFTS phlebovirus NUCLEOCAPSID PROTEIN PF05733
(Tenui_N) 		11 GLY A  65
ASN A  66
LYS A  67
ARG A  95
ALA A  96
VAL A 105
GLN A 109
PRO A 127
MET A 147
PHE A 177
ILE A 181
 SVR A 301
4J4V_B_SVRB301 4j4v SVR

DB04786
(Suramin) 		SFTS phlebovirus NUCLEOCAPSID PROTEIN no annotation 10 GLY B  65
ASN B  66
LYS B  67
ARG B  95
ALA B  96
VAL B 105
GLN B 109
PRO B 127
MET B 147
PHE B 177
 SVR B 301
4J4V_C_SVRC301 4j4v SVR

DB04786
(Suramin) 		SFTS phlebovirus NUCLEOCAPSID PROTEIN no annotation 8 GLY C  65
ASN C  66
LYS C  67
ARG C  95
PRO C 127
MET C 147
PHE C 177
ILE C 181
 SVR C 301
4J4V_D_SVRD301 4j4v SVR

DB04786
(Suramin) 		SFTS phlebovirus NUCLEOCAPSID PROTEIN no annotation 11 GLY D  65
ASN D  66
LYS E  74
ARG D  95
ALA D  96
VAL D 105
GLN D 109
PRO D 127
MET D 147
PHE D 177
ILE D 181
 SVR D 301
4J4V_E_SVRE301 4j4v SVR

DB04786
(Suramin) 		SFTS phlebovirus NUCLEOCAPSID PROTEIN PF05733
(Tenui_N)
no annotation 		10 GLY E  65
ASN E  66
LYS A  74
ARG E  95
ALA E  96
VAL E 105
GLN E 109
PRO E 127
MET E 147
PHE E 177
 SVR E 301
4L9I_A_8PRA601 4l9i 8PR

DB00715
(Paroxetine) 		Bos taurus RHODOPSIN KINASE PF00069
(Pkinase)
PF00615
(RGS) 		7 VAL A 201
ALA A 214
LEU A 218
MET A 264
MET A 267
ASP A 271
LEU A 321
 8PR A 601
4L9I_B_8PRB601 4l9i 8PR

DB00715
(Paroxetine) 		Bos taurus RHODOPSIN KINASE no annotation 8 GLY B 196
VAL B 201
ALA B 214
LYS B 216
MET B 264
MET B 267
ASP B 271
LEU B 321
 8PR B 601
4WBO_A_ANWA601 4wbo ANW

DB01025
(Amlexanox) 		Bos taurus RHODOPSIN KINASE PF00069
(Pkinase)
PF00615
(RGS) 		7 LEU A 193
ALA A 214
MET A 264
ILE A 266
LEU A 321
VAL A 476
ALA A 478
 ANW A 601
4WBO_B_ANWB601 4wbo ANW

DB01025
(Amlexanox) 		Bos taurus RHODOPSIN KINASE None 8 LEU B 193
ALA B 214
MET B 264
ILE B 266
ASN B 268
LEU B 321
SER B 331
ALA B 478
 ANW B 601
4WBO_C_ANWC601 4wbo ANW

DB01025
(Amlexanox) 		Bos taurus RHODOPSIN KINASE None 6 ARG C 191
LEU C 193
ALA C 214
MET C 264
MET C 267
LEU C 321
 ANW C 601
4WBO_D_ANWD601 4wbo ANW

DB01025
(Amlexanox) 		Bos taurus RHODOPSIN KINASE None 8 LEU D 193
ALA D 214
VAL D 248
MET D 264
GLY D 270
LEU D 321
SER D 331
ALA D 478
 ANW D 601
4Y4D_A_CFFA411 4y4d CFF

DB00201
(Caffeine) 		Cryphonectria
parasitica 		ENDOTHIAPEPSIN PF00026
(Asp) 		6 LEU A  13
ASP A  15
LEU A 224
PHE A 280
ILE A 283
PHE A 291
 CFF A 411
4Y4J_A_LNRA412 4y4j LNR

DB00368
(Norepinephrine) 		Cryphonectria
parasitica 		ENDOTHIAPEPSIN PF00026
(Asp) 		9 ASP A  33
ASP A  35
TYR A  79
ASP A  81
SER A  83
SER A 115
PHE A 116
ASP A 119
LEU A 125
 LNR A 412
5G4B_A_PZEA1268 5g4b PZE

DB00592
(Piperazine) 		Aura virus CAPSID PROTEIN PF00944
(Peptidase_S3) 		5 MET A 135
GLU A 136
LYS A 138
TYR A 183
TRP A 250
 PZE A1268
5OM2_B_DXTB501 5om2 DXT

DB00254
(Doxycycline) 		Homo sapiens ALPHA-1-ANTICHYMOTRY
PSIN 		no annotation 9 VAL A  31
LEU A 273
ALA A 274
PHE A 277
ASP A 278
VAL B 381
HIS B 383
TRP B 386
ILE B 388
 DXT B 501
5OM3_B_DXTB501 5om3 DXT

DB00254
(Doxycycline) 		Homo sapiens ALPHA-1-ANTICHYMOTRY
PSIN 		no annotation 6 LEU A 273
SER A 274
PHE A 277
ASP A 278
HIS B 383
TRP B 386
 DXT B 501
5OM7_A_DM2A501 5om7 DM2

DB00445
(Epirubicin)
DB00997
(Doxorubicin) 		Homo sapiens ALPHA-1-ANTICHYMOTRY
PSIN 		no annotation 11 VAL A  31
GLN A 242
ASN A 244
GLN A 270
LEU A 273
SER A 274
PHE A 277
GLU A 278
VAL B 381
ASN B 383
TRP B 386
 DM2 A 501
6ECE_C_DVAC3010 6ece DVA

DB00161
(L-
Valine) 		Streptomyces
tsusimaensis;
synthetic
construct 		VLM2;
DODECADEPSIPEPTIDE 		None
PF00975
(Thioesterase) 		3 ALA A2501
PHE A2513
GLN A2568
 DVA C3010
6ECF_I_DVAI3010 6ecf DVA

DB00161
(L-
Valine) 		Streptomyces
tsusimaensis;
synthetic
construct 		VLM2;
DODECADEPSIPEPTIDE 		None 3 PHE B2513
ARG B2545
ALA B2626
 DVA I3010
6EID_A_EDTA1111 6eid EDT

DB00974
(Edetic
Acid) 		Chlamydomonas
reinhardtii 		ARCHAEAL-TYPE OPSIN
2 		PF01036
(Bac_rhodopsin) 		4 GLN A  49
ASN A  53
PHE A  98
TYR A 243
 EDT A1111
6FTP_B_DM2B501 6ftp DM2

DB00445
(Epirubicin)
DB00997
(Doxorubicin) 		Homo sapiens ALPHA-1-ANTICHYMOTRY
PSIN 		no annotation 9 GLN A 242
LEU A 273
SER A 274
PHE A 277
GLU A 278
LEU A 280
VAL B 381
ASN B 383
TRP B 386
 DM2 B 501