DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'PROTEIN L'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
2BYO_A_LNLA1216 2byo LNL

DB00132
(Alpha-
Linolenic
Acid) 		Mycobacterium
tuberculosis 		LIPOPROTEIN LPPX PF07161
(LppX_LprAFG) 		5 LEU A  69
ILE A 106
LEU A 109
SER A 110
ARG A 113
 LNL A1216
2BYO_A_LNLA1217 2byo LNL

DB00132
(Alpha-
Linolenic
Acid) 		Mycobacterium
tuberculosis 		LIPOPROTEIN LPPX PF07161
(LppX_LprAFG) 		4 VAL A  87
LEU A 159
ILE A 193
LEU A 195
 LNL A1217
2F8L_A_SAMA400 2f8l SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Listeria
monocytogenes 		HYPOTHETICAL PROTEIN
LMO1582 		PF02384
(N6_Mtase) 		16 HIS A  95
THR A  98
ALA A 126
GLY A 128
THR A 129
ASN A 131
LEU A 132
ASP A 154
VAL A 155
ASP A 156
LEU A 159
ASP A 180
GLY A 181
ASP A 196
PRO A 198
PHE A 226
 SAM A 400
2NXE_A_SAMA302 2nxe SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL PROTEIN
L11
METHYLTRANSFERASE 		PF06325
(PrmA) 		15 PHE A  99
GLY A 100
THR A 107
ASP A 126
LEU A 127
GLY A 128
GLY A 130
LEU A 134
ASP A 149
ILE A 150
ASP A 151
SER A 175
ASN A 191
LEU A 192
LEU A 196
 SAM A 302
2NXE_B_SAMB303 2nxe SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL PROTEIN
L11
METHYLTRANSFERASE 		None 15 PHE B  99
GLY B 100
THR B 107
ASP B 126
LEU B 127
GLY B 128
GLY B 130
LEU B 134
ASP B 149
ILE B 150
ASP B 151
SER B 175
ASN B 191
LEU B 192
LEU B 196
 SAM B 303
2ZBP_A_SAMA300 2zbp SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL PROTEIN
L11
METHYLTRANSFERASE 		PF06325
(PrmA) 		14 PHE A  99
GLY A 100
THR A 107
LEU A 127
GLY A 128
GLY A 130
LEU A 134
ASP A 149
ILE A 150
ASP A 151
SER A 175
ASN A 191
LEU A 192
LEU A 196
 SAM A 300
3CJT_C_SAMC302 3cjt SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL PROTEIN
L11
METHYLTRANSFERASE 		None 14 HIS C 103
THR C 107
ASP C 126
LEU C 127
GLY C 128
VAL C 133
LEU C 134
ASP C 149
ILE C 150
ASP C 151
SER C 175
ASN C 191
LEU C 192
LEU C 196
 SAM C 302
3CJT_G_SAMG302 3cjt SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL PROTEIN
L11
METHYLTRANSFERASE 		None 14 HIS G 103
LEU G 127
GLY G 128
GLY G 130
SER G 131
VAL G 133
LEU G 134
ASP G 149
ILE G 150
ASP G 151
SER G 175
ASN G 191
LEU G 192
LEU G 196
 SAM G 302
3CJT_K_SAMK302 3cjt SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL PROTEIN
L11
METHYLTRANSFERASE 		None 13 HIS K 103
LEU K 127
GLY K 128
SER K 131
VAL K 133
LEU K 134
ASP K 149
ILE K 150
ASP K 151
SER K 175
ASN K 191
LEU K 192
LEU K 196
 SAM K 302
3CJT_O_SAMO302 3cjt SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL PROTEIN
L11
METHYLTRANSFERASE 		None 14 HIS O 103
LEU O 127
GLY O 128
GLY O 130
SER O 131
VAL O 133
LEU O 134
ASP O 149
ILE O 150
ASP O 151
SER O 175
ASN O 191
LEU O 192
LEU O 196
 SAM O 302
3J7Z_A_ERYA9000 3j7z ERY

DB00199
(Erythromycin) 		Escherichia coli;
Staphylococcus
aureus 		23S RRNA;
50S RIBOSOMAL
PROTEIN L22;
ERMCL NASCENT CHAIN 		PF00237
(Ribosomal_L22)
PF08253
(Leader_Erm) 		3 ILE a  81
PHE a  82
LYS S  90
 ERY A9000
3TPX_C_ACTC207 3tpx ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Homo sapiens E3 UBIQUITIN-PROTEIN
LIGASE MDM2 		None 4 LYS C  31
PRO C  32
LEU C  33
ASN C 106
 ACT C 207
3TPX_E_ACTE204 3tpx ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Homo sapiens E3 UBIQUITIN-PROTEIN
LIGASE MDM2 		None 3 LYS E  31
PRO E  32
LEU E  33
 ACT E 204
4M6T_A_SAMA201 4m6t SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Homo sapiens RNA POLYMERASE
II-ASSOCIATED FACTOR
1 HOMOLOG, LINKER,
RNA
POLYMERASE-ASSOCIATE
D PROTEIN LEO1 		PF03985
(Leo1)
PF04004
(Paf1) 		4 ILE A  30
VAL A  42
VAL A  44
ARG A 169
 SAM A 201
5DPD_A_SAMA601 5dpd SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Rickettsia
prowazekii 		PROTEIN LYSINE
METHYLTRANSFERASE 1 		PF10119
(Methyltransf_31)
PF13847
(MethyTransf_Reg) 		13 TYR A  48
GLU A  77
GLY A  79
ASP A 102
LEU A 103
SER A 104
GLN A 107
SER A 129
ILE A 130
HIS A 146
VAL A 148
VAL A 152
VAL A 156
 SAM A 601
5DPD_B_SAMB601 5dpd SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Rickettsia
prowazekii 		PROTEIN LYSINE
METHYLTRANSFERASE 1 		None 12 TYR B  48
GLY B  79
ASP B 102
LEU B 103
SER B 104
GLN B 107
SER B 129
ILE B 130
VAL B 148
TRP B 151
VAL B 152
VAL B 156
 SAM B 601
5FA8_A_SAMA301 5fa8 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Sulfolobus
islandicus 		RIBOSOMAL PROTEIN
L11
METHYLTRANSFERASE,
PUTATIVE 		PF13847
(Methyltransf_31) 		15 PRO A  11
THR A  12
ASP A  34
GLY A  36
GLY A  38
ARG A  41
ILE A  42
GLU A  59
ILE A  60
ASN A  61
ARG A  64
ASN A  87
PHE A  88
PHE A 102
LEU A 104
 SAM A 301
5UMD_A_YMZA3801 5umd YMZ

DB00358
(Mefloquine) 		Plasmodium
falciparum 		28S RIBOSOMAL RNA;
60S RIBOSOMAL
PROTEIN L28;
60S RIBOSOMAL
PROTEIN L4 		PF00573
(Ribosomal_L4)
PF01778
(Ribosomal_L28e)
PF14374
(Ribos_L4_asso_C)
no annotation 		6 ASN 2   6
ALA 2   7
PRO 2  44
VAL 2  50
ASP F 288
TYR F 290
 YMZ A3801
5UMD_K_YMZK301 5umd YMZ

DB00358
(Mefloquine) 		Plasmodium
falciparum 		60S RIBOSOMAL
PROTEIN L13,
PUTATIVE 		PF00572
(Ribosomal_L13) 		11 LEU K  15
ILE K  42
ASN K  49
LYS K  52
TYR K  53
GLU K  55
PHE K  56
LEU K  59
ILE K  78
ARG K  81
LEU K 140
 YMZ K 301
6B89_A_NOVA403 6b89 NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Escherichia coli LIPOPOLYSACCHARIDE
EXPORT SYSTEM
ATP-BINDING PROTEIN
LPTB 		no annotation 16 LEU A  72
HIS A  73
ALA A  76
TYR A  82
PRO A  84
GLU A  86
SER A  88
PHE A  90
PHE B  90
ARG B  91
ARG B  92
LEU B  93
ALA B 101
VAL A 102
GLN B 136
ARG A 150
 NOV A 403
6B89_B_NOVB403 6b89 NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Escherichia coli LIPOPOLYSACCHARIDE
EXPORT SYSTEM
ATP-BINDING PROTEIN
LPTB 		no annotation 17 LEU B  72
HIS B  73
ALA B  76
TYR B  82
PRO B  84
GLU B  86
SER B  88
PHE A  90
PHE B  90
ARG A  91
ARG A  92
LEU A  93
ALA A 101
VAL B 102
GLN A 104
GLN A 136
ARG B 150
 NOV B 403