DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'PROTEIN B'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1T9U_A_CPFA5002 1t9u CPF

DB00537
(Ciprofloxacin)
Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B
PF00873
(ACR_tran)
6 PHE A 664
PHE A 666
ASN A 667
ARG A 717
ASN A 719
GLN A 830
CPF A5002
1T9W_A_NFNA6001 1t9w NFN

DB00607
(Nafcillin)
Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B
PF00873
(ACR_tran)
3 SER A  96
GLY A  97
ARG A 468
NFN A6001
1T9W_A_NFNA6002 1t9w NFN

DB00607
(Nafcillin)
Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B
PF00873
(ACR_tran)
7 MET A 575
GLN A 577
ALA A 618
PHE A 664
ARG A 717
ASN A 719
GLU A 722
NFN A6002
2RDD_A_AICA1110 2rdd AIC

DB00415
(Ampicillin)
Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B
PF00873
(ACR_tran)
4 LYS A  29
ALA A 384
PHE A 386
GLY A 387
AIC A1110
2W1B_A_DXCA2034 2w1b DXC

DB03619
(Deoxycholic
Acid)
Escherichia coli ACRIFLAVIN
RESISTANCE PROTEIN B
PF00873
(ACR_tran)
3 PHE A 664
SER A 715
LEU A 828
DXC A2034
3AOB_C_RFPC2002 3aob RFP

DB01045
(Rifampicin)
Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B
no annotation 12 MET C 575
GLN C 577
PHE C 617
ALA C 618
THR C 624
PHE C 664
PHE C 666
ARG C 717
ASN C 719
GLY C 720
ARG C 815
LEU C 828
RFP C2002
3AOC_C_ERYC3402 3aoc ERY

DB00199
(Erythromycin)
Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B
None 15 SER C  79
THR C  91
SER C 134
SER C 135
LYS C 292
MET C 573
MET C 575
PHE C 615
PHE C 617
ILE C 626
PHE C 666
LEU C 674
ASP C 681
GLU C 683
GLU C 826
ERY C3402
3AOD_A_MIYA2001 3aod MIY

DB01017
(Minocycline)
Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B
PF00873
(ACR_tran)
8 SER A  48
PHE A 178
GLY A 179
GLU A 273
ASN A 274
ILE A 277
ALA A 279
PHE A 615
MIY A2001
3AOD_C_RFPC2002 3aod RFP

DB01045
(Rifampicin)
Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B
no annotation 12 MET C 575
GLN C 577
PHE C 617
ALA C 618
THR C 624
PHE C 664
PHE C 666
ARG C 717
ASN C 719
GLY C 720
ARG C 815
LEU C 828
RFP C2002
3R2C_A_ACTA153 3r2c ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Aquifex aeolicus N UTILIZATION
SUBSTANCE PROTEIN B
PF01029
(NusB)
4 ASN A  24
GLY A  26
GLU A  27
LYS A  30
ACT A 153
4DX5_B_MIYB1103 4dx5 MIY

DB01017
(Minocycline)
Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B
no annotation 13 SER B  48
GLN B 151
PHE B 178
GLY B 179
SER B 180
GLU B 273
ASN B 274
ASP B 276
ILE B 277
ALA B 279
VAL B 612
PHE B 615
ARG B 620
MIY B1103
4DX7_A_DM2A1105 4dx7 DM2

DB00445
(Epirubicin)
DB00997
(Doxorubicin)
Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B
PF00873
(ACR_tran)
11 MET A 575
PHE A 617
THR A 676
GLY A 679
ASP A 681
ARG A 717
ASN A 719
ARG A 815
GLU A 826
GLN A 830
MET A 862
DM2 A1105
4DX7_A_DM2A1106 4dx7 DM2

DB00445
(Epirubicin)
DB00997
(Doxorubicin)
Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B
PF00873
(ACR_tran)
11 SER A 134
MET A 575
PHE A 617
PHE A 664
PHE A 666
ASN A 667
LEU A 668
THR A 676
ALA A 677
ARG A 717
GLN A 830
DM2 A1106
4DX7_B_DM2B1104 4dx7 DM2

DB00445
(Epirubicin)
DB00997
(Doxorubicin)
Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B
no annotation 8 SER B  46
GLN B  89
GLU B 130
GLN B 176
PHE B 178
ILE B 277
VAL B 612
PHE B 615
DM2 B1104