DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'POL POLYPROTEIN'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1IKV_A_EFZA2000 1ikv EFZ

DB00625
(Efavirenz) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		9 LEU A 100
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 EFZ A2000
1IKW_A_EFZA2000 1ikw EFZ

DB00625
(Efavirenz) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		10 LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 EFZ A2000
1K6C_B_MK1B902 1k6c MK1

DB00224
(Indinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		22 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP B  29
ASP B  30
VAL A  32
VAL B  32
ILE A  47
GLY A  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
PRO B  81
PRO A  81
THR A  82
THR B  82
VAL B  84
 MK1 B 902
1SGU_B_MK1B2632 1sgu MK1

DB00224
(Indinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		20 ARG B   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP B  29
ASP B  30
ILE B  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  48
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
ALA A  82
ALA B  82
 MK1 B2632
1SH9_B_RITB301 1sh9 RIT

DB00503
(Ritonavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		18 ARG B   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  30
ILE A  32
ILE B  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
ILE B  50
PRO A  81
PRO B  81
ALA B  82
 RIT B 301
1T03_P_TFOP822 1t03 TFO

DB00300
(Tenofovir) 		;
Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN;
SYNTHETIC
OLIGONUCLEOTIDE
PRIMER 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb)
no annotation 		7 ASP A 110
TYR A 183
MET A 184
ASP A 185
ASP A 186
LYS A 219
HIS A 221
 TFO P 822
1T7I_A_017A200 1t7i 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		17 LEU A  23
ASP B  25
ASP A  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
ILE A  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
ILE B  50
THR A  82
THR B  82
 017 A 200
1T7J_A_478A200 1t7j 478

DB00701
(Amprenavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		18 LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  82
THR B  82
VAL A  84
 478 A 200
2AOF_C_FRDC305 2aof FRD

DB00182
(Amphetamine) 		;
Human
immunodeficiency
virus 1 		PEPTIDE INHIBITOR;
POL POLYPROTEIN 		PF00077
(RVP)
no annotation 		15 ASP A  25
GLY A  49
PRO A  81
ALA A  82
ILE A  84
LEU B 123
ASP B 125
PRO B 181
ALA B 182
ILE B 184
ASN C 304
LEU C 306
GLN C 307
SER C 308
ARG C 309
 FRD C 305
2AOH_C_FRDC305 2aoh FRD

DB00182
(Amphetamine) 		;
Human
immunodeficiency
virus 1 		PEPTIDE INHIBITOR;
POL POLYPROTEIN 		PF00077
(RVP)
no annotation 		15 LEU A  23
ASP A  25
GLY A  49
PRO A  81
ALA A  82
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 149
ALA B 182
ILE B 184
PHE C 303
ASN C 304
PRO C 306
GLN C 307
ILE C 308
 FRD C 305
2AOI_C_FRDC305 2aoi FRD

DB00182
(Amphetamine) 		;
Human
immunodeficiency
virus 1 		PEPTIDE INHIBITOR;
POL POLYPROTEIN 		PF00077
(RVP)
no annotation 		16 ASP A  25
GLY A  49
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
LEU B 123
ASP B 125
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
PRO C 302
GLY C 303
ASN C 304
LEU C 306
GLN C 307
SER C 308
 FRD C 305
2AOJ_C_FRDC305 2aoj FRD

DB00182
(Amphetamine) 		;
Human
immunodeficiency
virus 1 		PEPTIDE INHIBITOR;
POL POLYPROTEIN 		PF00077
(RVP)
no annotation 		17 LEU A  23
ASP A  25
GLY A  49
PRO A  81
VAL A  82
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
PHE C 303
ASN C 304
PRO C 306
GLN C 307
ILE C 308
 FRD C 305
2AVO_B_MK1B902 2avo MK1

DB00224
(Indinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		21 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ASP B  29
ASP B  30
VAL B  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 MK1 B 902
2AVS_B_MK1B902 2avs MK1

DB00224
(Indinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		29 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL A  32
VAL B  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  48
GLY A  49
GLY B  49
VAL B  50
VAL A  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 MK1 B 902
2AVV_A_MK1A901 2avv MK1

DB00224
(Indinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		30 TRP D   6
ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL A  32
VAL B  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 MK1 A 901
2AVV_E_MK1E902 2avv MK1

DB00224
(Indinavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN no annotation 30 ARG E   8
ARG D   8
LEU E  23
LEU D  23
ASP E  25
ASP D  25
GLY D  27
GLY E  27
ALA D  28
ALA E  28
ASP E  29
ASP D  29
ASP D  30
ASP E  30
VAL E  32
VAL D  32
ILE E  47
ILE D  47
GLY D  48
GLY E  48
GLY E  49
GLY D  49
ILE E  50
ILE D  50
PRO D  81
PRO E  81
VAL D  82
VAL E  82
ILE E  84
ILE D  84
 MK1 E 902
2B60_B_RITB100 2b60 RIT

DB00503
(Ritonavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		GAG-POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		23 ARG B   8
ARG A   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ILE B  32
ILE A  32
ILE A  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
ALA B  82
ALA A  82
ILE A  84
ILE B  84
 RIT B 100
2F80_B_017B301 2f80 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		24 LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASN A  30
ASN B  30
VAL B  32
VAL A  32
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 017 B 301
2F81_A_017A302 2f81 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		24 LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  32
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
 017 A 302
2F8G_B_017B401 2f8g 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		27 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  32
GLY A  49
VAL A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
ILE B 147
GLY B 149
VAL B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
 017 B 401
3JVY_B_017B401 3jvy 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		GAG-POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		26 LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  32
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
 017 B 401
3JW2_A_017A401 3jw2 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		GAG-POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		26 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  32
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
 017 A 401
3SM2_A_478A126 3sm2 478

DB00701
(Amprenavir) 		Murine leukemia
virus 		GAG-PRO-POL
POLYPROTEIN 		PF00077
(RVP)
no annotation 		19 ASP A  32
ASP B  32
GLY A  34
ALA B  35
ALA A  35
HIS B  37
VAL B  39
VAL A  39
VAL A  54
VAL B  54
GLY B  56
GLY A  56
ALA A  57
ALA B  57
LEU B  83
PRO B  89
TYR B  90
LEU B  92
LEU A  92
 478 A 126
3U7S_A_017A201 3u7s 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		18 ARG B   8
LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ASP B  30
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
ILE B  50
PRO B  81
LEU B  82
VAL A  84
 017 A 201
3U7S_A_017A202 3u7s 017

DB01264
(Darunavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		18 LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP B  29
ASP A  30
ASP B  30
ILE A  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
ILE B  50
PRO A  81
LEU B  82
LEU A  82
VAL B  84
 017 A 202
4IFV_A_T27A601 4ifv T27

DB08864
(Rilpivirine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		EXORIBONUCLEASE H,
P66 RT;
GAG-POL POLYPROTEIN 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		14 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
PRO A 236
TYR A 318
 T27 A 601
6ELI_A_T27A701 6eli T27

DB08864
(Rilpivirine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		GAG-POL POLYPROTEIN;
REVERSE
TRANSCRIPTASE 		no annotation 13 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 T27 A 701