DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'PERIPLASMIC PROTEIN'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1NNF_A_EDTA400 1nnf EDT

DB00974
(Edetic
Acid)
Haemophilus
influenzae
IRON-UTILIZATION
PERIPLASMIC PROTEIN
PF01547
(SBP_bac_1)
11 GLN A   9
GLU A  57
ARG A 101
SER A 139
ALA A 141
LYS A 174
ASN A 175
ASN A 193
TYR A 195
TYR A 196
ARG A 262
EDT A 400
1ZLQ_A_ACTA1502 1zlq ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Escherichia coli NICKEL-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN
PF00496
(SBP_bac_5)
5 TRP A  10
PRO A  11
GLY A 219
ASN A 220
GLY A 222
ACT A1502
1ZLQ_A_ACTA1503 1zlq ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Escherichia coli NICKEL-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN
PF00496
(SBP_bac_5)
4 LYS A  52
ARG A  68
ASP A  69
ASP A  70
ACT A1503
1ZLQ_A_ACTA1507 1zlq ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Escherichia coli NICKEL-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN
PF00496
(SBP_bac_5)
3 GLN A 385
HIS A 395
ARG A 396
ACT A1507
1ZLQ_A_EDTA1513 1zlq EDT

DB00974
(Edetic
Acid)
Escherichia coli NICKEL-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN
PF00496
(SBP_bac_5)
9 TYR A  22
MET A  27
ARG A  97
TRP A 100
ARG A 137
TRP A 398
TYR A 402
HIS A 416
THR A 490
EDT A1513
1ZLQ_B_ACTB1503 1zlq ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Escherichia coli NICKEL-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN
None 4 TYR B 382
GLN B 385
HIS B 395
ARG B 396
ACT B1503
1ZLQ_B_ACTB1505 1zlq ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Escherichia coli NICKEL-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN
None 4 ASN B 274
LYS B 275
LYS B 276
TYR B 310
ACT B1505
1ZLQ_B_EDTB1511 1zlq EDT

DB00974
(Edetic
Acid)
Escherichia coli NICKEL-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN
None 8 TYR B  22
MET B  27
ARG B  97
TRP B 100
ARG B 137
TRP B 398
TYR B 402
THR B 490
EDT B1511
3JYR_A_ACRA371 3jyr ACR

DB00284
(Acarbose)
Salmonella
enterica
MALTOSE-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN
PF13416
(SBP_bac_8)
19 ASN A  12
ASP A  14
LYS A  15
LYS A  42
GLU A  44
GLU A  45
TRP A  62
ALA A  63
ASP A  65
ARG A  66
GLU A 111
GLU A 153
PRO A 154
TYR A 155
TRP A 230
MET A 330
TRP A 340
TYR A 341
ARG A 344
ACR A 371
3RUM_A_CCSA375 3rum CCS

DB04339
(Carbocisteine)
Escherichia coli MALTOSE-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN
PF13416
(SBP_bac_8)
4 GLN A  73
SER A  74
GLY A 374
LYS A 376
CCS A 375
3VFJ_A_ACTA410 3vfj ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Escherichia coli MALTOSE-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN,
C-TERMINAL FUSED BY
CYS-LYS-D-ALA-D-ALA
PF13416
(SBP_bac_8)
4 LYS A  15
ALA A  63
GLU A 111
LEU A 262
ACT A 410
5L8D_A_ACTA601 5l8d ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Escherichia coli NICKEL-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN
PF00496
(SBP_bac_5)
4 LYS A  52
ARG A  68
ASP A  69
ASP A  70
ACT A 601
5L8D_A_EDTA609 5l8d EDT

DB00974
(Edetic
Acid)
Escherichia coli NICKEL-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN
PF00496
(SBP_bac_5)
8 TYR A  22
MET A  27
ARG A  97
TRP A 100
ARG A 137
TRP A 398
TYR A 402
THR A 490
EDT A 609
5L8D_B_ACTB601 5l8d ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Escherichia coli NICKEL-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN
None 3 THR B 203
PRO B 225
ASP B 227
ACT B 601
5MWU_A_ACTA601 5mwu ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Escherichia coli NICKEL-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN
PF00496
(SBP_bac_5)
4 LYS A  52
ARG A  68
ASP A  69
ASP A  70
ACT A 601
5MWU_A_EDTA609 5mwu EDT

DB00974
(Edetic
Acid)
Escherichia coli NICKEL-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN
PF00496
(SBP_bac_5)
8 TYR A  22
MET A  27
ARG A  97
TRP A 100
ARG A 137
TRP A 398
TYR A 402
THR A 490
EDT A 609
5MWU_B_ACTB601 5mwu ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Escherichia coli NICKEL-BINDING
PERIPLASMIC PROTEIN
None 3 THR B 203
PRO B 225
ASP B 227
ACT B 601