DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'NA '

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1FFY_A_MRCA1993 1ffy MRC

DB00410
(Mupirocin) 		Staphylococcus
aureus 		ISOLEUCYL-TRNA
SYNTHETASE 		PF00133
(tRNA-synt_1)
PF06827
(zf-FPG_IleRS)
PF08264
(Anticodon_1) 		18 PRO A  56
PRO A  57
HIS A  64
GLY A  66
HIS A  67
ASN A  70
TRP A 528
SER A 531
GLU A 554
GLY A 555
ASP A 557
GLN A 558
TRP A 562
HIS A 585
PHE A 587
VAL A 588
MET A 596
LYS A 598
 MRC A1993
1HTT_A_HISA450 1htt HIS

DB00117
(L-
Histidine) 		Escherichia coli HISTIDYL-TRNA
SYNTHETASE 		PF03129
(tRNA-synt_His)
PF13393
(HGTP_anticodon) 		10 GLU A  83
THR A  85
TYR A 107
ARG A 113
GLN A 127
GLU A 131
ARG A 259
TYR A 263
TYR A 264
GLY A 285
 HIS A 450
1HTT_B_HISB450 1htt HIS

DB00117
(L-
Histidine) 		Escherichia coli HISTIDYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 12 GLU B  83
THR B  85
ARG B 113
GLN B 127
GLU B 131
ARG B 259
LEU B 261
TYR B 263
TYR B 264
GLY B 285
TYR B 288
GLY B 304
 HIS B 450
1HTT_C_HISC450 1htt HIS

DB00117
(L-
Histidine) 		Escherichia coli HISTIDYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 12 GLU C  83
THR C  85
GLN C 127
GLU C 131
ARG C 259
LEU C 261
TYR C 263
TYR C 264
GLY C 285
TYR C 288
GLY C 304
ALA C 306
 HIS C 450
1HTT_D_HISD450 1htt HIS

DB00117
(L-
Histidine) 		Escherichia coli HISTIDYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 12 GLU D  83
THR D  85
ARG D 113
GLN D 127
GLU D 131
ARG D 259
LEU D 261
TYR D 263
TYR D 264
GLY D 285
GLY D 304
ALA D 306
 HIS D 450
1I6V_C_RFPC1640 1i6v RFP

DB01045
(Rifampicin) 		Thermus aquaticus DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE 		PF00562
(RNA_pol_Rpb2_6)
PF04560
(RNA_pol_Rpb2_7)
PF04561
(RNA_pol_Rpb2_2)
PF04563
(RNA_pol_Rpb2_1)
PF04565
(RNA_pol_Rpb2_3)
PF10385
(RNA_pol_Rpb2_45) 		12 ARG C 134
GLN C 390
LEU C 391
GLN C 393
PHE C 394
ASP C 396
ARG C 405
HIS C 406
ARG C 409
SER C 411
GLU C 445
ILE C 452
 RFP C1640
1J7K_A_ACTA701 1j7k ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Thermotoga
maritima 		HOLLIDAY JUNCTION
DNA HELICASE RUVB 		PF05491
(RuvB_C)
PF05496
(RuvB_N) 		4 GLY A 278
LEU A 279
GLY A 313
ARG A 314
 ACT A 701
1JZS_A_MRCA1301 1jzs MRC

DB00410
(Mupirocin) 		Thermus
thermophilus 		ISOLEUCYL-TRNA
SYNTHETASE 		PF00133
(tRNA-synt_1)
PF08264
(Anticodon_1) 		11 GLY A  45
PRO A  46
HIS A  54
HIS A  57
SER A 521
GLU A 550
GLY A 551
ASP A 553
GLN A 554
LEU A 583
ILE A 584
 MRC A1301
1K4T_D_TTCD990 1k4t TTC

DB01030
(Topotecan) 		;
Homo sapiens 		DNA TOPOISOMERASE I PF01028
(Topoisom_I)
PF02919
(Topoisom_I_N)
PF14370
(Topo_C_assoc)
no annotation 		5 GLU A 356
ARG A 364
LYS A 532
ASP A 533
THR A 718
 TTC D 990
1KIJ_A_NOVA400 1kij NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Thermus
thermophilus 		DNA GYRASE SUBUNIT B PF00204
(DNA_gyraseB)
PF02518
(HATPase_c)
no annotation 		16 ILE B  10
ASN A  45
ASP A  48
GLU A  49
ASP A  72
ARG A  75
ILE A  77
PRO A  78
ASP A  80
ILE A  93
LYS A 102
PHE A 103
LYS A 109
VAL A 117
ARG A 135
THR A 166
 NOV A 400
1KIJ_B_NOVB444 1kij NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Thermus
thermophilus 		DNA GYRASE SUBUNIT B PF00204
(DNA_gyraseB)
PF02518
(HATPase_c)
no annotation 		16 ILE A  10
ASN B  45
ASP B  48
GLU B  49
ASP B  72
ARG B  75
ILE B  77
PRO B  78
ASP B  80
ILE B  93
TYR B  94
PHE B 103
VAL B 117
ALA B 119
ARG B 135
THR B 166
 NOV B 444
1NT2_A_SAMA301 1nt2 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Archaeoglobus
fulgidus 		FIBRILLARIN-LIKE
PRE-RRNA PROCESSING
PROTEIN 		PF01269
(Fibrillarin) 		15 LYS A  42
TYR A  63
GLY A  65
ALA A  67
SER A  68
THR A  70
THR A  71
GLU A  88
TYR A  89
SER A  90
ASP A 113
ALA A 114
ASP A 133
ILE A 134
GLN A 136
 SAM A 301
1NYR_A_THRA1004 1nyr THR

DB00156
(L-
Threonine) 		Staphylococcus
aureus 		THREONYL-TRNA
SYNTHETASE 1 		PF00587
(HGTP_anticodon)
PF02824
(tRNA_SAD)
PF03129
(TGS)
PF07973
(tRNA-synt_2b) 		10 MET A 334
CYS A 336
MET A 363
ARG A 365
LEU A 383
ASP A 385
HIS A 387
TYR A 468
GLN A 490
HIS A 517
 THR A1004
1NYR_B_THRB2004 1nyr THR

DB00156
(L-
Threonine) 		Staphylococcus
aureus 		THREONYL-TRNA
SYNTHETASE 1 		None 10 MET B 334
CYS B 336
MET B 363
ARG B 365
LEU B 383
ASP B 385
HIS B 387
TYR B 468
GLN B 490
HIS B 517
 THR B2004
1P91_A_SAMA1401 1p91 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE A 		PF13847
(Methyltransf_31) 		11 LEU A  62
TYR A  67
GLY A  95
GLU A  96
GLY A  97
TYR A  99
ILE A 155
TYR A 156
PRO A 179
HIS A 183
LEU A 184
 SAM A1401
1P91_B_SAMB2401 1p91 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE A 		None 14 ARG B  58
TYR B  67
LEU B  70
GLY B  95
GLU B  96
GLY B  97
TYR B  98
TYR B  99
ILE B 155
TYR B 156
HIS B 183
LEU B 184
THR B 234
PRO B 235
 SAM B2401
1PG2_A_ADNA552 1pg2 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Escherichia coli METHIONYL-TRNA
SYNTHETASE 		PF09334
(tRNA-synt_1g) 		11 ALA A  12
HIS A  21
GLY A  23
HIS A  24
GLU A  27
GLY A 294
ASP A 296
ILE A 297
HIS A 323
TYR A 325
VAL A 326
 ADN A 552
1QU2_A_MRCA1993 1qu2 MRC

DB00410
(Mupirocin) 		Staphylococcus
aureus 		ISOLEUCYL-TRNA
SYNTHETASE 		PF00133
(tRNA-synt_1)
PF06827
(zf-FPG_IleRS)
PF08264
(Anticodon_1) 		15 PRO A  56
HIS A  64
GLY A  66
HIS A  67
SER A 531
GLU A 554
GLY A 555
ASP A 557
GLN A 558
TRP A 562
HIS A 585
PHE A 587
VAL A 588
MET A 596
LYS A 598
 MRC A1993
1QU3_A_MRCA993 1qu3 MRC

DB00410
(Mupirocin) 		Staphylococcus
aureus 		ISOLEUCYL-TRNA
SYNTHETASE 		PF00133
(tRNA-synt_1)
PF08264
(Anticodon_1) 		16 HIS A  64
GLY A  66
HIS A  67
ASN A  70
SER A 531
GLU A 554
ASP A 557
GLN A 558
TRP A 562
HIS A 585
PHE A 587
VAL A 588
LYS A 595
SER A 597
LYS A 598
VAL A 603
 MRC A 993
1QZR_B_CDXB901 1qzr CDX

DB00380
(Dexrazoxane) 		Saccharomyces
cerevisiae 		DNA TOPOISOMERASE II PF00204
(DNA_gyraseB)
PF02518
(HATPase_c)
no annotation 		14 HIS A  20
HIS B  20
THR B  27
THR A  27
TYR A  28
TYR B  28
ASN B 142
ASN A 142
TYR B 144
TYR A 144
LEU A 148
LEU B 148
GLN B 365
GLN A 365
 CDX B 901
1RFF_A_SPMA700 1rff SPM

DB00127
(Spermine) 		;
Homo sapiens 		TOPOISOMERASE
I-DERIVED PEPTIDE;
TYROSYL-DNA
PHOSPHODIESTERASE 1 		PF06087
(Tyr-DNA_phospho)
no annotation 		4 ASN A 591
TRP A 605
VAL A 606
TYR C 724
 SPM A 700
1RFF_B_SPMB700 1rff SPM

DB00127
(Spermine) 		Homo sapiens TYROSYL-DNA
PHOSPHODIESTERASE 1 		no annotation 4 ASN B 591
ASN B 603
TRP B 605
PRO B 607
 SPM B 700
1RFI_A_SPMA999 1rfi SPM

DB00127
(Spermine) 		;
Homo sapiens 		TOPOISOMERASE
I-DERIVED PEPTIDE;
TYROSYL-DNA
PHOSPHODIESTERASE 1 		PF06087
(Tyr-DNA_phospho)
no annotation 		5 TRP A 590
TRP A 605
VAL A 606
PRO A 607
LYS C 724
 SPM A 999
1RG1_A_SPMA999 1rg1 SPM

DB00127
(Spermine) 		Homo sapiens TYROSYL-DNA
PHOSPHODIESTERASE 1 		PF06087
(Tyr-DNA_phospho) 		3 TRP A 605
VAL A 606
PRO A 607
 SPM A 999
1RG2_A_SPMA999 1rg2 SPM

DB00127
(Spermine) 		Homo sapiens TYROSYL-DNA
PHOSPHODIESTERASE 1 		PF06087
(Tyr-DNA_phospho) 		5 TRP A 590
ASN A 591
TRP A 605
VAL A 606
PRO A 607
 SPM A 999
1RGU_A_SPMA999 1rgu SPM

DB00127
(Spermine) 		Homo sapiens TYROSYL-DNA
PHOSPHODIESTERASE 1 		PF06087
(Tyr-DNA_phospho) 		5 TRP A 590
ASN A 591
TRP A 605
VAL A 606
PRO A 607
 SPM A 999
1RH0_A_SPMA999 1rh0 SPM

DB00127
(Spermine) 		Homo sapiens TYROSYL-DNA
PHOSPHODIESTERASE 1 		PF06087
(Tyr-DNA_phospho) 		3 TRP A 605
VAL A 606
PRO A 607
 SPM A 999
1RI4_A_SAMA299 1ri4 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Encephalitozoon
cuniculi 		MRNA CAPPING ENZYME PF03291
(Pox_MCEL) 		13 LYS A  54
GLY A  72
GLY A  74
ASP A  94
ILE A  95
ALA A  96
ASP A 122
SER A 123
TYR A 124
GLN A 140
PHE A 141
SER A 142
TYR A 145
 SAM A 299
1RR8_A_TTCA100 1rr8 TTC

DB01030
(Topotecan) 		;
Homo sapiens 		DNA TOPOISOMERASE I PF01028
(Topoisom_I)
PF02919
(Topoisom_I_N)
PF14370
(Topo_C_assoc)
no annotation 		5 GLU C 356
ARG C 364
LYS C 532
ASP C 533
THR C 718
 TTC A 100
1RRJ_B_TTCB990 1rrj TTC

DB01030
(Topotecan) 		;
Homo sapiens 		DNA TOPOISOMERASE I PF01028
(Topoisom_I)
PF02919
(Topoisom_I_N)
PF14370
(Topo_C_assoc)
no annotation 		5 GLU A 356
ARG A 364
LYS A 532
ASP A 533
THR A 718
 TTC B 990
1UAK_A_SAMA301 1uak SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Haemophilus
influenzae 		TRNA
(GUANINE-N(1)-)-METH
YLTRANSFERASE 		PF01746
(tRNA_m1G_MT) 		13 TYR A  86
LEU A  87
SER A  88
PRO A  89
GLN A  90
GLY A 113
SER A 132
ILE A 133
VAL A 137
LEU A 138
GLY A 140
GLY A 141
PRO A 144
 SAM A 301
1V2X_A_SAMA400 1v2x SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		TRNA (GM18)
METHYLTRANSFERASE 		PF00588
(SpoU_methylas_C)
PF12105
(SpoU_methylase) 		13 THR A  99
LEU A 101
PHE A 121
GLY A 122
TRP A 126
GLY A 127
LYS A 141
ILE A 142
MET A 144
SER A 150
LEU A 151
VAL A 153
ALA A 156
 SAM A 400
1X7P_A_SAMA301 1x7p SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Streptomyces
viridochromogenes 		RRNA
METHYLTRANSFERASE 		None
PF00588
(SpoU_methylase) 		11 ARG B 145
THR A 210
GLU A 212
GLY A 232
GLY A 237
ILE A 252
MET A 254
SER A 260
LEU A 261
ALA A 263
ALA A 266
 SAM A 301
1X7P_B_SAMB302 1x7p SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Streptomyces
viridochromogenes 		RRNA
METHYLTRANSFERASE 		None
PF00588
(SpoU_methylase) 		10 ARG A 145
THR B 210
ASP B 211
GLU B 212
GLY B 232
GLY B 237
ILE B 252
MET B 254
LEU B 261
ALA B 266
 SAM B 302
1YNN_C_RFPC1120 1ynn RFP

DB01045
(Rifampicin) 		Thermus aquaticus DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE BETA
CHAIN 		PF00562
(RNA_pol_Rpb2_6)
PF04560
(RNA_pol_Rpb2_7)
PF04561
(RNA_pol_Rpb2_2)
PF04563
(RNA_pol_Rpb2_1)
PF04565
(RNA_pol_Rpb2_3)
PF10385
(RNA_pol_Rpb2_45) 		12 ARG C 134
GLN C 390
GLN C 393
PHE C 394
ASP C 396
ARG C 405
HIS C 406
ARG C 409
SER C 411
LEU C 413
PRO C 444
ILE C 452
 RFP C1120
2A68_C_RBTC8001 2a68 RBT

DB00615
(Rifabutin) 		Thermus
thermophilus 		DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE BETA
CHAIN;
RNA POLYMERASE SIGMA
FACTOR RPOD 		PF00140
(Sigma70_r1_2)
PF00562
(RNA_pol_Rpb2_6)
PF04539
(Sigma70_r3)
PF04542
(Sigma70_r2)
PF04545
(Sigma70_r4)
PF04560
(RNA_pol_Rpb2_7)
PF04561
(RNA_pol_Rpb2_2)
PF04563
(RNA_pol_Rpb2_1)
PF04565
(RNA_pol_Rpb2_3)
PF10385
(RNA_pol_Rpb2_45) 		11 ARG C 134
ASP F 323
GLN C 390
GLN C 393
PHE C 394
ASP C 396
HIS C 406
ARG C 409
SER C 411
PRO C 444
ILE C 452
 RBT C8001
2A68_M_RBTM8002 2a68 RBT

DB00615
(Rifabutin) 		Thermus
thermophilus 		DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE BETA
CHAIN;
RNA POLYMERASE SIGMA
FACTOR RPOD 		no annotation 13 ARG M 134
ASP P 323
LYS P 325
GLN M 390
GLN M 393
PHE M 394
ASP M 396
HIS M 406
ARG M 409
SER M 411
PRO M 444
ILE M 452
ASN M 563
 RBT M8002
2A69_C_RPTC8001 2a69 RPT

DB01201
(Rifapentine) 		Thermus
thermophilus 		DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE BETA
CHAIN;
RNA POLYMERASE SIGMA
FACTOR RPOD 		PF00140
(Sigma70_r1_2)
PF00562
(RNA_pol_Rpb2_6)
PF04539
(Sigma70_r3)
PF04542
(Sigma70_r2)
PF04545
(Sigma70_r4)
PF04560
(RNA_pol_Rpb2_7)
PF04561
(RNA_pol_Rpb2_2)
PF04563
(RNA_pol_Rpb2_1)
PF04565
(RNA_pol_Rpb2_3)
PF10385
(RNA_pol_Rpb2_45) 		11 ARG C 134
ASP F 323
GLN C 390
GLN C 393
PHE C 394
ASP C 396
HIS C 406
ARG C 409
SER C 411
PRO C 444
ILE C 452
 RPT C8001
2A69_M_RPTM8002 2a69 RPT

DB01201
(Rifapentine) 		Thermus
thermophilus 		DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE BETA
CHAIN 		no annotation 14 ARG M 134
GLN M 390
GLN M 393
PHE M 394
ASP M 396
ARG M 405
HIS M 406
ARG M 409
SER M 411
PRO M 444
ILE M 452
ASN M 563
MET M1000
GLU M1002
 RPT M8002
2AKE_A_TRPA479 2ake TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Homo sapiens TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		PF00579
(tRNA-synt_1b) 		13 TYR A 159
THR A 160
GLY A 161
GLY A 163
GLN A 194
THR A 196
GLU A 199
LYS A 200
GLN A 284
ILE A 307
CYS A 309
GLN A 313
PHE A 317
 TRP A 479
2AZX_A_TRPA601 2azx TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Homo sapiens TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		PF00579
(tRNA-synt_1b) 		12 TYR A 159
THR A 160
GLY A 161
GLY A 163
GLN A 194
THR A 196
GLU A 199
GLN A 284
ILE A 307
CYS A 309
GLN A 313
PHE A 317
 TRP A 601
2AZX_A_TRPA602 2azx TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Homo sapiens TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		PF00579
(tRNA-synt_1b) 		8 LEU A 174
ILE A 178
PHE A 406
GLU A 408
LEU A 441
ILE A 442
HIS A 445
ARG A 448
 TRP A 602
2AZX_B_TRPB603 2azx TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Homo sapiens TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 12 TYR B 159
THR B 160
GLY B 161
GLY B 163
GLN B 194
THR B 196
GLU B 199
GLN B 284
ILE B 307
CYS B 309
GLN B 313
PHE B 317
 TRP B 603
2BTE_A_LEUA1894 2bte LEU

DB00149
(L-
Leucine) 		Thermus
thermophilus 		AMINOACYL-TRNA
SYNTHETASE 		PF00133
(tRNA-synt_1_2)
PF08264
(tRNA-synt_1)
PF13603
(Anticodon_1)
PF14795
(tRNA-synt_1) 		8 MET A  40
TYR A  43
ASP A  80
SER A 504
TYR A 507
TYR A 535
HIS A 541
HIS A 545
 LEU A1894
2BTE_D_LEUD1893 2bte LEU

DB00149
(L-
Leucine) 		Thermus
thermophilus 		AMINOACYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 8 MET D  40
TYR D  43
ASP D  80
SER D 504
TYR D 507
TYR D 535
HIS D 541
HIS D 545
 LEU D1893
2BYT_A_LEUA1301 2byt LEU

DB00149
(L-
Leucine) 		Thermus
thermophilus 		LEUCYL-TRNA
SYNTHETASE 		PF00133
(Anticodon_1)
PF08264
(tRNA-synt_1_2)
PF13603
(tRNA-synt_1)
PF14795
(Leucyl-specific) 		7 MET A  40
TYR A  43
ASP A  80
TYR A 507
TYR A 535
HIS A 541
HIS A 545
 LEU A1301
2BYT_D_LEUD1601 2byt LEU

DB00149
(L-
Leucine) 		Thermus
thermophilus 		LEUCYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 7 MET D  40
TYR D  43
ASP D  80
TYR D 507
TYR D 535
HIS D 541
HIS D 545
 LEU D1601
2DR2_A_TRPA479 2dr2 TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Homo sapiens TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		PF00579
(tRNA-synt_1b) 		11 TYR A 159
GLY A 161
GLY A 163
GLN A 194
THR A 196
GLU A 199
GLN A 284
ILE A 307
CYS A 309
GLN A 313
PHE A 317
 TRP A 479
2EJT_A_SAMA501 2ejt SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Pyrococcus
horikoshii 		N(2),N(2)-DIMETHYLGU
ANOSINE TRNA
METHYLTRANSFERASE 		PF02005
(TRM) 		15 ARG A  36
ASP A  53
LEU A  55
ALA A  57
ILE A  60
ARG A  61
ASN A  77
ASP A  78
ILE A  79
SER A  80
ASP A 120
ALA A 121
ASP A 138
PHE A 140
PHE A 146
 SAM A 501
2HMA_A_SAMA375 2hma SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Streptococcus
pneumoniae 		PROBABLE TRNA
(5-METHYLAMINOMETHYL
-2-THIOURIDYLATE)-ME
THYLTRANSFERASE 		PF03054
(tRNA_Me_trans) 		11 GLY A  12
SER A  14
SER A  19
ASP A 100
ASN A 104
LYS A 108
THR A 126
GLY A 127
HIS A 128
GLN A 152
PHE A 155
 SAM A 375
2NYU_A_SAMA201 2nyu SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Homo sapiens PUTATIVE RIBOSOMAL
RNA
METHYLTRANSFERASE 2 		PF01728
(FtsJ) 		16 SER A   6
GLY A  30
ALA A  32
PRO A  33
GLY A  34
ALA A  35
TRP A  36
ASP A  62
LEU A  63
LEU A  64
ASP A  79
VAL A  80
ASP A 104
MET A 105
LEU A 123
LYS A 144
 SAM A 201
2NYU_B_SAMB201 2nyu SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Homo sapiens PUTATIVE RIBOSOMAL
RNA
METHYLTRANSFERASE 2 		None 17 SER B   6
GLY B  30
ALA B  32
PRO B  33
GLY B  34
ALA B  35
TRP B  36
ASP B  62
LEU B  63
LEU B  64
ASP B  79
VAL B  80
THR B  81
ASP B 104
MET B 105
LEU B 123
LYS B 144
 SAM B 201
2PLW_A_SAMA203 2plw SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Plasmodium
falciparum 		RIBOSOMAL RNA
METHYLTRANSFERASE,
PUTATIVE 		PF01728
(FtsJ) 		15 ALA A   6
GLY A  30
TYR A  32
PRO A  33
GLY A  34
SER A  35
TRP A  36
ASP A  55
LYS A  56
LYS A  57
GLU A  71
ILE A  72
ASP A 113
ALA A 114
LEU A 132
 SAM A 203
2PXC_A_SAMA500 2pxc SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Murray Valley
encephalitis
virus 		GENOME POLYPROTEIN
[CONTAINS: CAPSID
PROTEIN C (CORE
PROTEIN);
ENVELOPE PROTEIN M
(MATRIX PROTEIN);
MAJOR ENVELOPE
PROTEIN E;
NON-STRUCTURAL
PROTEIN 1 (NS1);
NON-STRUCTURAL
PROTEIN 2A (NS2A);
FLAVIVIRIN PROTEASE
NS2B REGULATORY
SUBUNIT;
FLAVIVIRIN PROTEASE
NS3 CATALYTIC
SUBUNIT;
NON-STRUCTURAL
PROTEIN 4A (NS4A);
NON-STRUCTURAL
PROTEIN 4B (NS4B);
RNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE (EC
2.7.7.48) (NS5)] 		PF01728
(FtsJ) 		14 SER A  56
GLY A  58
GLY A  81
GLY A  83
GLY A  86
TRP A  87
THR A 104
LYS A 105
HIS A 110
GLU A 111
ASP A 131
VAL A 132
ASP A 146
ILE A 147
 SAM A 500
2V0G_A_LEUA1887 2v0g LEU

DB00149
(L-
Leucine) 		Thermus
thermophilus 		AMINOACYL-TRNA
SYNTHETASE 		PF00133
(tRNA-synt_1)
PF08264
(Anticodon_1)
PF13603
(Leucyl-specific)
PF14795
(tRNA-synt_1) 		8 MET A  40
TYR A  43
ASP A  80
SER A 504
TYR A 507
TYR A 535
HIS A 541
HIS A 545
 LEU A1887
2V0G_D_LEUD1883 2v0g LEU

DB00149
(L-
Leucine) 		Thermus
thermophilus 		AMINOACYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 5 TYR D  43
ASP D  80
TYR D 507
TYR D 535
HIS D 541
 LEU D1883
2VDV_E_SAME1287 2vdv SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Saccharomyces
cerevisiae 		TRNA
(GUANINE-N(7)-)-METH
YLTRANSFERASE 		PF02390
(Methyltransf_4) 		12 GLY E 103
GLY E 105
GLU E 126
ILE E 127
ARG E 128
ASN E 161
ALA E 162
CYS E 181
PHE E 182
ASP E 184
THR E 259
GLU E 261
 SAM E1287
2VDV_F_SAMF1287 2vdv SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Saccharomyces
cerevisiae 		TRNA
(GUANINE-N(7)-)-METH
YLTRANSFERASE 		None 11 GLY F 103
GLY F 105
GLU F 126
ILE F 127
ARG F 128
ASN F 161
ALA F 162
PHE F 182
ASP F 184
THR F 259
GLU F 261
 SAM F1287
2X1L_A_ADNA601 2x1l ADN

DB00640
(Adenosine) 		Mycolicibacterium
smegmatis 		METHIONYL-TRNA
SYNTHETASE 		PF09334
(tRNA-synt_1g) 		11 ALA A  10
ALA A  12
HIS A  19
GLY A  21
HIS A  22
GLU A  25
GLY A 263
ASP A 265
ILE A 266
HIS A 292
TRP A 294
 ADN A 601
2X1L_B_ADNB601 2x1l ADN

DB00640
(Adenosine) 		Mycolicibacterium
smegmatis 		METHIONYL-TRNA
SYNTHETASE 		no annotation 12 ALA B  10
ALA B  12
HIS B  19
GLY B  21
HIS B  22
GLU B  25
GLY B 263
ASP B 265
ILE B 266
HIS B 292
TRP B 294
LEU B 295
 ADN B 601
2X1L_C_ADNC601 2x1l ADN

DB00640
(Adenosine) 		Mycolicibacterium
smegmatis 		METHIONYL-TRNA
SYNTHETASE 		no annotation 11 ALA C  10
ALA C  12
HIS C  19
GLY C  21
HIS C  22
GLU C  25
GLY C 263
ASP C 265
ILE C 266
HIS C 292
TRP C 294
 ADN C 601
2XCT_G_CPFG1020 2xct CPF

DB00537
(Ciprofloxacin) 		Staphylococcus
aureus;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
B, DNA GYRASE
SUBUNIT A 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		3 ARG B 458
GLY B 459
SER B1084
 CPF G1020
2XCT_H_CPFH1020 2xct CPF

DB00537
(Ciprofloxacin) 		Staphylococcus
aureus;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
B, DNA GYRASE
SUBUNIT A 		no annotation 3 ARG D 458
GLU D 477
SER D1084
 CPF H1020
2XCT_X_CPFX1020 2xct CPF

DB00537
(Ciprofloxacin) 		Staphylococcus
aureus;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
B, DNA GYRASE
SUBUNIT A 		no annotation 4 ARG S 458
GLY S 459
GLU S 477
SER U1084
 CPF X1020
2ZT7_A_GLYA1300 2zt7 GLY

DB00145
(Glycine) 		Homo sapiens GLYCYL-TRNA
SYNTHETASE 		PF00587
(HGTP_anticodon)
PF03129
(tRNA-synt_2b) 		7 GLU A 245
ARG A 277
GLU A 296
TYR A 386
ARG A 410
GLU A 522
SER A 524
 GLY A1300
2ZUL_A_SAMA376 2zul SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		PROBABLE RIBOSOMAL
RNA SMALL SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE 		PF05175
(MTS) 		15 TYR A   8
PHE A 207
SER A 216
GLY A 241
GLY A 243
ALA A 246
LEU A 247
GLU A 262
ASP A 263
ASP A 288
VAL A 289
ASN A 305
PRO A 307
VAL A 318
PHE A 322
 SAM A 376
3AV6_A_SAMA1 3av6 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Mus musculus DNA
(CYTOSINE-5)-METHYLT
RANSFERASE 1 		PF00145
(BAH)
PF01426
(zf-CXXC)
PF02008
(BAH)
PF12047
(DNMT1-RFD) 		14 PHE A1148
GLY A1150
GLY A1153
LEU A1154
GLU A1171
MET A1172
TRP A1173
ASP A1193
CYS A1194
PRO A1228
LEU A1250
ASN A1580
ALA A1581
VAL A1582
 SAM A   1
3AXT_A_SAMA397 3axt SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Aquifex aeolicus PROBABLE
N(2),N(2)-DIMETHYLGU
ANOSINE TRNA
METHYLTRANSFERASE
TRM1 		PF02005
(TRM) 		12 ARG A  36
LEU A  60
ALA A  62
ILE A  65
ARG A  66
ASP A  84
ILE A  85
SER A  86
GLU A 113
ALA A 114
ASP A 132
PHE A 134
 SAM A 397
3AXZ_A_ADNA401 3axz ADN

DB00640
(Adenosine) 		Haemophilus
influenzae 		TRNA
(GUANINE-N(1)-)-METH
YLTRANSFERASE 		PF01746
(tRNA_m1G_MT) 		12 TYR A  86
LEU A  87
SER A  88
PRO A  89
GLY A 113
GLY A 117
SER A 132
ILE A 133
LEU A 138
GLY A 140
GLY A 141
PRO A 144
 ADN A 401
3CKK_A_SAMA301 3ckk SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Homo sapiens TRNA
(GUANINE-N(7)-)-METH
YLTRANSFERASE 		PF02390
(Methyltransf_4) 		12 GLY A  54
GLY A  56
GLU A  77
ILE A  78
ARG A  79
ASN A 110
ALA A 111
MET A 112
LEU A 130
ASP A 133
THR A 208
GLU A 210
 SAM A 301
3DMF_A_SAMA388 3dmf SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		PROBABLE RIBOSOMAL
RNA SMALL SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE 		PF05175
(MTS) 		14 TYR A   8
PHE A 207
SER A 216
GLY A 241
GLY A 243
ALA A 246
GLU A 262
ASP A 263
ASP A 288
VAL A 289
ASN A 305
PRO A 307
VAL A 318
PHE A 322
 SAM A 388
3DMH_A_SAMA384 3dmh SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		PROBABLE RIBOSOMAL
RNA SMALL SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE 		PF05175
(MTS) 		15 TYR A   8
PHE A 207
SER A 216
GLY A 241
GLY A 243
ALA A 246
LEU A 247
GLU A 262
ASP A 263
ASP A 288
VAL A 289
ASN A 305
PRO A 307
VAL A 318
PHE A 322
 SAM A 384
3DOU_A_SAMA1 3dou SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermoplasma
volcanium 		RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE J 		PF01728
(FtsJ) 		15 ALA A  22
GLY A  46
SER A  48
PRO A  49
GLY A  50
GLY A  51
TRP A  52
ASP A  67
LEU A  68
GLN A  69
ASP A  83
ILE A  84
ASP A 111
ALA A 112
LYS A 151
 SAM A   1
3DXY_A_SAMA1 3dxy SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli TRNA
(GUANINE-N(7)-)-METH
YLTRANSFERASE 		PF02390
(Methyltransf_4) 		11 GLU A  69
GLY A  71
GLY A  73
ILE A  93
GLU A  94
VAL A  95
HIS A  96
ASP A 121
ALA A 122
PHE A 142
ASP A 144
 SAM A   1
3EEY_A_SAMA300 3eey SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Hungateiclostridi
um thermocellum 		PUTATIVE RRNA
METHYLASE 		PF06962
(rRNA_methylase) 		14 THR A  28
GLY A  30
ASN A  31
ASN A  33
ASP A  34
ASP A  52
ILE A  53
GLN A  54
GLY A  80
HIS A  81
GLN A  82
ASN A  98
LEU A 102
THR A 111
 SAM A 300
3EEY_B_SAMB300 3eey SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Hungateiclostridi
um thermocellum 		PUTATIVE RRNA
METHYLASE 		None 14 THR B  28
GLY B  30
ASN B  31
ASN B  33
ASP B  34
ASP B  52
ILE B  53
GLN B  54
GLY B  80
HIS B  81
GLN B  82
ASN B  98
LEU B 102
THR B 111
 SAM B 300
3EEY_C_SAMC300 3eey SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Hungateiclostridi
um thermocellum 		PUTATIVE RRNA
METHYLASE 		None 16 THR C  28
GLY C  30
ASN C  31
ASN C  33
ASP C  34
ASP C  52
ILE C  53
GLN C  54
GLY C  80
HIS C  81
GLN C  82
ASN C  98
LEU C 102
THR C 111
THR C 115
HIS B 194
 SAM C 300
3EEY_D_SAMD300 3eey SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Hungateiclostridi
um thermocellum 		PUTATIVE RRNA
METHYLASE 		None
PF06962
(rRNA_methylase) 		16 THR D  28
GLY D  30
ASN D  31
ASN D  33
ASP D  34
ASP D  52
ILE D  53
GLN D  54
GLY D  80
HIS D  81
GLN D  82
ASN D  98
LEU D 102
PRO D 103
THR D 111
HIS A 195
 SAM D 300
3EEY_E_SAME300 3eey SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Hungateiclostridi
um thermocellum 		PUTATIVE RRNA
METHYLASE 		None 15 THR E  28
GLY E  30
ASN E  31
ASN E  33
ASP E  34
ASP E  52
ILE E  53
GLN E  54
GLY E  80
HIS E  81
GLN E  82
ASN E  98
LEU E 102
THR E 111
THR E 115
 SAM E 300
3EEY_F_SAMF300 3eey SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Hungateiclostridi
um thermocellum 		PUTATIVE RRNA
METHYLASE 		None 14 THR F  28
GLY F  30
ASN F  33
ASP F  34
ASP F  52
ILE F  53
GLN F  54
GLY F  80
HIS F  81
GLN F  82
ASN F  98
LEU F 102
THR F 111
THR F 115
 SAM F 300
3EEY_H_SAMH300 3eey SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Hungateiclostridi
um thermocellum 		PUTATIVE RRNA
METHYLASE 		None 14 THR H  28
GLY H  30
ASN H  31
ASN H  33
ASP H  34
ASP H  52
ILE H  53
GLN H  54
GLY H  80
HIS H  81
GLN H  82
ASN H  98
LEU H 102
THR H 111
 SAM H 300
3EEY_I_SAMI300 3eey SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Hungateiclostridi
um thermocellum 		PUTATIVE RRNA
METHYLASE 		None 14 THR I  28
GLY I  30
ASN I  31
ASN I  33
ASP I  34
ASP I  52
ILE I  53
GLN I  54
GLY I  80
HIS I  81
GLN I  82
ASN I  98
LEU I 102
THR I 111
 SAM I 300
3EEY_J_SAMJ300 3eey SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Hungateiclostridi
um thermocellum 		PUTATIVE RRNA
METHYLASE 		None 14 THR J  28
GLY J  30
ASN J  31
ASN J  33
ASP J  34
ASP J  52
ILE J  53
GLN J  54
GLY J  80
HIS J  81
GLN J  82
ASN J  98
LEU J 102
THR J 111
 SAM J 300
3FHJ_A_TRPA1001 3fhj TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Geobacillus
stearothermophilu
s 		TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		PF00579
(tRNA-synt_1b) 		10 GLY A   7
GLN A   9
VAL A  40
HIS A  43
MET A 129
ASP A 132
ILE A 133
VAL A 141
VAL A 143
GLN A 147
 TRP A1001
3FHJ_B_TRPB1001 3fhj TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Geobacillus
stearothermophilu
s 		TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 10 GLY B   7
GLN B   9
VAL B  40
HIS B  43
MET B 129
ASP B 132
ILE B 133
VAL B 141
VAL B 143
GLN B 147
 TRP B1001
3FHJ_C_TRPC1001 3fhj TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Geobacillus
stearothermophilu
s 		TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 10 GLY C   7
GLN C   9
VAL C  40
HIS C  43
MET C 129
ASP C 132
ILE C 133
VAL C 141
VAL C 143
GLN C 147
 TRP C1001
3FHJ_D_TRPD1001 3fhj TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Geobacillus
stearothermophilu
s 		TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 9 GLY D   7
VAL D  40
HIS D  43
MET D 129
ASP D 132
ILE D 133
VAL D 141
VAL D 143
GLN D 147
 TRP D1001
3FHJ_E_TRPE1001 3fhj TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Geobacillus
stearothermophilu
s 		TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 10 GLY E   7
GLN E   9
VAL E  40
HIS E  43
MET E 129
ASP E 132
ILE E 133
VAL E 141
VAL E 143
GLN E 147
 TRP E1001
3FHJ_F_TRPF1001 3fhj TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Geobacillus
stearothermophilu
s 		TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 9 GLY F   7
VAL F  40
HIS F  43
MET F 129
ASP F 132
ILE F 133
VAL F 141
VAL F 143
GLN F 147
 TRP F1001
3FI0_A_TRPA1001 3fi0 TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Geobacillus
stearothermophilu
s 		TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		PF00579
(tRNA-synt_1b) 		9 GLY A   7
GLN A   9
VAL A  40
HIS A  43
ASP A 132
ILE A 133
VAL A 141
VAL A 143
GLN A 147
 TRP A1001
3FI0_B_TRPB1001 3fi0 TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Geobacillus
stearothermophilu
s 		TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 8 GLY B   7
VAL B  40
HIS B  43
ASP B 132
ILE B 133
VAL B 141
VAL B 143
GLN B 147
 TRP B1001
3FI0_C_TRPC1001 3fi0 TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Geobacillus
stearothermophilu
s 		TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 9 GLY C   7
GLN C   9
VAL C  40
HIS C  43
ASP C 132
ILE C 133
VAL C 141
VAL C 143
GLN C 147
 TRP C1001
3FI0_D_TRPD1001 3fi0 TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Geobacillus
stearothermophilu
s 		TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 9 GLY D   7
GLN D   9
VAL D  40
HIS D  43
ASP D 132
ILE D 133
VAL D 141
VAL D 143
GLN D 147
 TRP D1001
3FI0_E_TRPE1001 3fi0 TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Geobacillus
stearothermophilu
s 		TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 7 GLY E   7
VAL E  40
HIS E  43
ASP E 132
ILE E 133
VAL E 141
GLN E 147
 TRP E1001
3FI0_F_TRPF1001 3fi0 TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Geobacillus
stearothermophilu
s 		TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 9 GLY F   7
GLN F   9
VAL F  40
HIS F  43
ASP F 132
ILE F 133
VAL F 141
VAL F 143
GLN F 147
 TRP F1001
3FI0_G_TRPG1001 3fi0 TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Geobacillus
stearothermophilu
s 		TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 8 GLY G   7
VAL G  40
HIS G  43
ASP G 132
ILE G 133
VAL G 141
VAL G 143
GLN G 147
 TRP G1001
3FI0_H_TRPH1001 3fi0 TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Geobacillus
stearothermophilu
s 		TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 9 GLY H   7
GLN H   9
VAL H  40
HIS H  43
ASP H 132
ILE H 133
VAL H 141
VAL H 143
GLN H 147
 TRP H1001
3FI0_I_TRPI1001 3fi0 TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Geobacillus
stearothermophilu
s 		TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 8 GLY I   7
VAL I  40
HIS I  43
ASP I 132
ILE I 133
VAL I 141
VAL I 143
GLN I 147
 TRP I1001
3FI0_J_TRPJ1001 3fi0 TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Geobacillus
stearothermophilu
s 		TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 9 GLY J   7
GLN J   9
VAL J  40
HIS J  43
ASP J 132
ILE J 133
VAL J 141
VAL J 143
GLN J 147
 TRP J1001
3FI0_K_TRPK1001 3fi0 TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Geobacillus
stearothermophilu
s 		TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 9 GLY K   7
GLN K   9
VAL K  40
HIS K  43
ASP K 132
ILE K 133
VAL K 141
VAL K 143
GLN K 147
 TRP K1001
3FI0_L_TRPL1001 3fi0 TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Geobacillus
stearothermophilu
s 		TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 9 GLY L   7
GLN L   9
VAL L  40
HIS L  43
ASP L 132
ILE L 133
VAL L 141
VAL L 143
GLN L 147
 TRP L1001
3FI0_M_TRPM1001 3fi0 TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Geobacillus
stearothermophilu
s 		TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 9 GLY M   7
GLN M   9
VAL M  40
HIS M  43
ASP M 132
ILE M 133
VAL M 141
VAL M 143
GLN M 147
 TRP M1001
3FI0_N_TRPN1001 3fi0 TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Geobacillus
stearothermophilu
s 		TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 9 GLY N   7
GLN N   9
VAL N  40
HIS N  43
ASP N 132
ILE N 133
VAL N 141
VAL N 143
GLN N 147
 TRP N1001
3FI0_O_TRPO1001 3fi0 TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Geobacillus
stearothermophilu
s 		TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 9 GLY O   7
GLN O   9
VAL O  40
HIS O  43
ASP O 132
ILE O 133
VAL O 141
VAL O 143
GLN O 147
 TRP O1001
3FI0_P_TRPP1001 3fi0 TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Geobacillus
stearothermophilu
s 		TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 7 GLY P   7
GLN P   9
VAL P  40
HIS P  43
ASP P 132
ILE P 133
GLN P 147
 TRP P1001
3FI0_Q_TRPQ1001 3fi0 TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Geobacillus
stearothermophilu
s 		TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 8 GLY Q   7
GLN Q   9
VAL Q  40
HIS Q  43
ASP Q 132
ILE Q 133
VAL Q 141
VAL Q 143
 TRP Q1001
3FI0_R_TRPR1001 3fi0 TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Geobacillus
stearothermophilu
s 		TRYPTOPHANYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 9 GLY R   7
GLN R   9
VAL R  40
HIS R  43
ASP R 132
ILE R 133
VAL R 141
VAL R 143
GLN R 147
 TRP R1001
3FOF_F_MFXF0 3fof MFX

DB00218
(Moxifloxacin) 		;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT A 		no annotation 3 GLY B  77
SER B  79
SER B  80
 MFX F   0
3FOF_H_MFXH0 3fof MFX

DB00218
(Moxifloxacin) 		;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT A;
DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT B 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		4 GLY A  77
SER A  79
SER A  80
ARG C 456
 MFX H   0
3FZG_A_SAMA300 3fzg SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE PF07091
(FmrO) 		14 HIS A  83
SER A  85
THR A  86
ARG A  89
PHE A 113
GLY A 114
GLY A 116
ASP A 137
ILE A 138
LEU A 179
LYS A 180
MET A 181
VAL A 184
GLN A 188
 SAM A 300
3G88_A_SAMA303 3g88 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE G 		PF02527
(GidB) 		11 GLY A  88
GLY A  90
PHE A  93
ASP A 111
ALA A 112
THR A 113
ARG A 138
ALA A 139
GLU A 140
ARG A 158
ALA A 159
 SAM A 303
3G88_B_SAMB303 3g88 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE G 		None 11 GLY B  88
GLY B  90
PHE B  93
ASP B 111
ALA B 112
THR B 113
ARG B 138
ALA B 139
GLU B 140
ARG B 158
ALA B 159
 SAM B 303
3G89_A_SAMA303 3g89 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE G 		PF02527
(GidB) 		12 GLY A  88
GLY A  90
PHE A  93
ASP A 111
ALA A 112
THR A 113
LYS A 116
ARG A 138
ALA A 139
GLU A 140
ARG A 158
ALA A 159
 SAM A 303
3G89_B_SAMB303 3g89 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE G 		None 11 GLY B  88
GLY B  90
PHE B  93
ASP B 111
ALA B 112
THR B 113
ARG B 138
ALA B 139
GLU B 140
ARG B 158
ALA B 159
 SAM B 303
3G8B_A_SAMA303 3g8b SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE G 		PF02527
(GidB) 		12 GLY A  88
GLY A  90
PHE A  93
ASP A 111
ALA A 112
THR A 113
LYS A 116
ARG A 138
ALA A 139
GLU A 140
ARG A 158
ALA A 159
 SAM A 303
3G8B_B_SAMB303 3g8b SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE G 		None 12 GLY B  88
GLY B  90
PHE B  93
ASP B 111
ALA B 112
THR B 113
LYS B 116
ARG B 138
ALA B 139
GLU B 140
ARG B 158
ALA B 159
 SAM B 303
3GYQ_A_SAMA270 3gyq SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Streptomyces
cyaneus 		RRNA
(ADENOSINE-2'-O-)-ME
THYLTRANSFERASE 		None
PF00588
(SpoU_methylase)
PF04705
(TSNR_N) 		12 ARG B 135
ARG B 165
LEU A 195
LYS A 196
ALA A 197
GLY A 218
LYS A 221
ILE A 238
MET A 240
SER A 246
LEU A 247
SER A 252
 SAM A 270
3GYQ_B_SAMB270 3gyq SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Streptomyces
cyaneus 		RRNA
(ADENOSINE-2'-O-)-ME
THYLTRANSFERASE 		None
PF00588
(SpoU_methylase)
PF04705
(TSNR_N) 		13 ARG A 135
ARG A 165
LEU B 195
LYS B 196
ALA B 197
GLY B 218
LYS B 221
ILE B 238
MET B 240
SER B 246
LEU B 247
VAL B 249
SER B 252
 SAM B 270
3ID5_B_SAMB301 3id5 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Saccharolobus
solfataricus 		FIBRILLARIN-LIKE
RRNA/TRNA
2'-O-METHYLTRANSFERA
SE 		PF01269
(Fibrillarin) 		11 LYS B  60
TYR B  82
GLY B  84
THR B  90
GLU B 108
PHE B 109
ASP B 133
ALA B 134
ASP B 153
ILE B 154
GLN B 156
 SAM B 301
3ID5_F_SAMF301 3id5 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Saccharolobus
solfataricus 		FIBRILLARIN-LIKE
RRNA/TRNA
2'-O-METHYLTRANSFERA
SE 		None 11 LYS F  60
TYR F  82
GLY F  84
THR F  90
GLU F 108
PHE F 109
ASP F 133
ALA F 134
ASP F 153
ILE F 154
GLN F 156
 SAM F 301
3ID6_C_SAMC301 3id6 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Saccharolobus
solfataricus 		FIBRILLARIN-LIKE
RRNA/TRNA
2'-O-METHYLTRANSFERA
SE 		PF01269
(Fibrillarin) 		12 TYR C  82
GLY C  84
ALA C  86
THR C  90
GLU C 108
PHE C 109
SER C 110
ASP C 133
ALA C 134
ASP C 153
ILE C 154
GLN C 156
 SAM C 301
3K9F_F_LFXF0 3k9f LFX

DB01137
(Levofloxacin)
DB01165
(Ofloxacin) 		;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT A;
DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT B 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		5 SER A  79
ARG B 117
ARG C 456
GLY C 457
GLU C 475
 LFX F   0
3K9F_H_LFXH0 3k9f LFX

DB01137
(Levofloxacin)
DB01165
(Ofloxacin) 		;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT A;
DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT B 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
no annotation 		6 SER B  79
ARG A 117
ARG D 456
GLY D 457
GLU D 474
GLU D 475
 LFX H   0
3KD5_E_PPFE914 3kd5 PPF

DB00529
(Foscarnet) 		Escherichia virus
RB69 		DNA POLYMERASE PF00136
(DNA_pol_B)
PF03104
(DNA_pol_B_exo1) 		5 ASP E 411
LEU E 415
ARG E 482
LYS E 560
ASP E 623
 PPF E 914
3KW2_A_ADNA300 3kw2 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Porphyromonas
gingivalis 		PROBABLE R-RNA
METHYLTRANSFERASE 		PF04452
(Methyltrans_RNA) 		11 ALA A 164
VAL A 166
ARG A 178
ILE A 195
GLY A 196
ASP A 200
SER A 218
LEU A 219
LEU A 224
THR A 226
ALA A 229
 ADN A 300
3KW2_B_ADNB300 3kw2 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Porphyromonas
gingivalis 		PROBABLE R-RNA
METHYLTRANSFERASE 		no annotation 11 ALA B 164
VAL B 166
ARG B 178
ILE B 195
GLY B 196
ASP B 200
SER B 218
LEU B 219
LEU B 224
THR B 226
ALA B 229
 ADN B 300
3M6V_A_SAMA465 3m6v SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RRNA METHYLASE PF01189
(Methyltr_RsmF_N)
PF17125
(RsmF_methylt_CI)
PF17126
(Methyltr_RsmB-F) 		13 ALA A 109
PRO A 112
GLY A 113
GLY A 114
LYS A 115
GLU A 133
VAL A 134
ASP A 135
ARG A 138
PRO A 160
ASP A 177
PRO A 179
LEU A 211
 SAM A 465
3M6V_B_SAMB465 3m6v SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RRNA METHYLASE None 13 ALA B 109
PRO B 112
GLY B 113
GLY B 114
LYS B 115
GLU B 133
VAL B 134
ASP B 135
ARG B 138
PRO B 160
ASP B 177
PRO B 179
LEU B 211
 SAM B 465
3M6W_A_SAMA465 3m6w SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RRNA METHYLASE PF01189
(RsmF_methylt_CI)
PF17125
(Methyltr_RsmB-F)
PF17126
(Methyltr_RsmF_N) 		14 ALA A 109
PRO A 112
GLY A 113
GLY A 114
LYS A 115
GLU A 133
VAL A 134
ASP A 135
ARG A 138
PRO A 160
ASP A 177
PRO A 179
VAL A 207
LEU A 211
 SAM A 465
3MTE_A_SAMA220 3mte SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE PF02390
(Methyltransf_4) 		16 GLY A  32
GLY A  34
ASN A  38
ASP A  55
PRO A  56
VAL A  57
ASN A  60
ALA A  86
ALA A  87
GLU A  88
LEU A 104
TRP A 107
THR A 109
LEU A 110
SER A 195
TRP A 197
 SAM A 220
3MTE_B_SAMB220 3mte SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE None 16 GLY B  32
GLY B  34
ASN B  38
ASP B  55
PRO B  56
VAL B  57
ALA B  86
ALA B  87
GLU B  88
LEU B 104
PHE B 105
TRP B 107
THR B 109
LEU B 110
SER B 195
TRP B 197
 SAM B 220
3NAI_A_URFA521 3nai URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Norwalk virus RNA DEPENDENT RNA
POLYMERASE 		PF00680
(RdRP_1) 		5 ARG A 185
ASP A 245
ASP A 346
ASP A 347
ARG A 395
 URF A 521
3NAI_B_URFB521 3nai URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Norwalk virus RNA DEPENDENT RNA
POLYMERASE 		no annotation 4 ARG B 185
ASP B 245
ASP B 346
ASP B 347
 URF B 521
3NAI_C_URFC521 3nai URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Norwalk virus RNA DEPENDENT RNA
POLYMERASE 		no annotation 5 ARG C 185
ASP C 245
ASP C 346
ASP C 347
ARG C 395
 URF C 521
3NK7_A_SAMA770 3nk7 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Streptomyces
actuosus 		23S RRNA
METHYLTRANSFERASE 		None
PF00588
(SpoU_methylase)
PF04705
(TSNR_N) 		14 ASN A 129
ARG B 135
ARG B 165
LEU A 195
THR A 197
GLY A 218
GLU A 220
GLY A 223
ILE A 238
MET A 240
SER A 246
ASN A 248
VAL A 249
SER A 252
 SAM A 770
3NK7_B_SAMB770 3nk7 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Streptomyces
actuosus 		23S RRNA
METHYLTRANSFERASE 		None
PF00588
(SpoU_methylase)
PF04705
(TSNR_N) 		15 ASN B 129
ARG A 135
ARG A 165
LEU B 195
PHE B 217
GLY B 218
GLU B 220
GLY B 223
ILE B 238
MET B 240
SER B 246
LEU B 247
ASN B 248
VAL B 249
SER B 252
 SAM B 770
3NMU_F_SAMF228 3nmu SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Pyrococcus
furiosus 		FIBRILLARIN-LIKE
RRNA/TRNA
2'-O-METHYLTRANSFERA
SE;
NOP5/NOP56 RELATED
PROTEIN 		PF01269
(Fibrillarin)
PF01798
(Nop) 		12 LYS F  57
GLY F  81
ALA F  83
GLU F 105
PHE F 106
SER F 107
ASP F 130
ALA F 131
ASP F 150
GLN F 153
GLU A 352
TYR A 353
 SAM F 228
3NMU_J_SAMJ228 3nmu SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Pyrococcus
furiosus 		FIBRILLARIN-LIKE
RRNA/TRNA
2'-O-METHYLTRANSFERA
SE;
NOP5/NOP56 RELATED
PROTEIN 		None 11 LYS J  57
GLY J  81
ALA J  83
ILE J 104
GLU J 105
PHE J 106
ALA J 131
ASP J 150
GLN J 153
GLU B 352
TYR B 353
 SAM J 228
3NVK_I_SAMI228 3nvk SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Pyrococcus
furiosus 		FIBRILLARIN-LIKE
RRNA/TRNA
2'-O-METHYLTRANSFERA
SE;
NOP5/NOP56 RELATED
PROTEIN 		PF01269
(Fibrillarin)
PF01798
(Nop) 		15 LYS I  57
GLY I  81
ALA I  83
THR I  87
ILE I 104
GLU I 105
PHE I 106
ASP I 130
ALA I 131
ASP I 150
VAL I 151
GLN I 153
GLU I 216
GLU A 352
TYR A 353
 SAM I 228
3NVK_J_SAMJ228 3nvk SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Pyrococcus
furiosus 		FIBRILLARIN-LIKE
RRNA/TRNA
2'-O-METHYLTRANSFERA
SE;
NOP5/NOP56 RELATED
PROTEIN 		None 12 LYS J  57
GLY J  81
ALA J  83
GLU J 105
PHE J 106
ASP J 130
ALA J 131
ASP J 150
VAL J 151
GLN J 153
GLU F 352
TYR F 353
 SAM J 228
3P2K_A_SAMA6735 3p2k SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE PF02390
(Methyltransf_4) 		15 GLY A  32
GLY A  34
ASN A  38
ASP A  55
PRO A  56
ALA A  86
ALA A  87
GLU A  88
LEU A 104
PHE A 105
TRP A 107
THR A 109
LEU A 110
SER A 195
TRP A 197
 SAM A6735
3P2K_B_SAMB6735 3p2k SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE None 14 GLY B  32
GLY B  34
ASN B  38
ASP B  55
PRO B  56
VAL B  57
ALA B  87
GLU B  88
LEU B 104
TRP B 107
THR B 109
LEU B 110
SER B 195
TRP B 197
 SAM B6735
3P2K_C_SAMC6735 3p2k SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE None 17 GLY C  32
GLY C  34
ASN C  38
ASP C  55
PRO C  56
VAL C  57
ASN C  60
ALA C  86
ALA C  87
GLU C  88
LEU C 104
PHE C 105
TRP C 107
THR C 109
LEU C 110
SER C 195
TRP C 197
 SAM C6735
3P2K_D_SAMD6735 3p2k SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE None
PF02390
(Methyltransf_4) 		18 GLY D  32
GLY D  34
ASN D  38
ASP D  55
PRO D  56
VAL D  57
ALA D  86
ALA D  87
GLU D  88
LEU D 104
TRP D 107
THR D 109
LEU D 110
TYR D 113
LYS A 191
SER D 195
TRP D 197
PHE A 203
 SAM D6735
3PGL_A_RZXA257 3pgl RZX

DB01129
(Rabeprazole) 		Homo sapiens CARBOXY-TERMINAL
DOMAIN RNA
POLYMERASE II
POLYPEPTIDE A SMALL
PHOSPHATASE 1 		PF03031
(NIF) 		7 ASP A  98
PHE A 106
VAL A 118
ILE A 120
SER A 154
TYR A 158
ARG A 178
 RZX A 257
3PS9_A_SAMA670 3ps9 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli TRNA
5-METHYLAMINOMETHYL-
2-THIOURIDINE
BIOSYNTHESIS
BIFUNCTIONAL PROTEIN
MNMC 		PF01266
(DAO)
PF05430
(Methyltransf_30) 		18 PHE A  24
TYR A  28
GLU A  64
GLY A  66
GLY A  68
THR A  69
LEU A  71
ASN A  72
GLU A 101
LYS A 102
PHE A 103
ASP A 156
ILE A 157
ASP A 178
GLY A 179
PHE A 180
ASN A 185
MET A 188
 SAM A 670
3Q87_B_SAMB300 3q87 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Encephalitozoon
cuniculi 		N6 ADENINE SPECIFIC
DNA METHYLASE 		PF05175
(MTS) 		12 TYR B   4
THR B  10
GLY B  31
SER B  33
ILE B  37
ASP B  51
LEU B  52
ASN B  53
ASP B  69
LEU B  70
ASN B  85
PRO B  87
 SAM B 300
3QWU_A_ADNA501 3qwu ADN

DB00640
(Adenosine) 		Aquifex aeolicus DNA LIGASE PF09414
(RNA_ligase) 		12 TYR A  51
ILE A  54
GLU A  75
LYS A  77
ASN A  82
ARG A  97
GLU A 129
PHE A 154
VAL A 182
VAL A 214
LYS A 216
LYS A 226
 ADN A 501
3QWU_B_ADNB501 3qwu ADN

DB00640
(Adenosine) 		Aquifex aeolicus DNA LIGASE no annotation 11 TYR B  51
ILE B  54
GLU B  75
LYS B  77
ASN B  82
ARG B  97
GLU B 129
PHE B 154
VAL B 182
VAL B 214
LYS B 216
 ADN B 501
3QX3_A_EVPA1 3qx3 EVP

DB00773
(Etoposide) 		Homo sapiens DNA TOPOISOMERASE
2-BETA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF01751
(Toprim)
PF16898
(TOPRIM_C) 		5 GLY A 478
ASP A 479
ARG A 503
GLN A 778
MET A 782
 EVP A   1
3QX3_D_EVPD1 3qx3 EVP

DB00773
(Etoposide) 		;
Homo sapiens 		DNA TOPOISOMERASE
2-BETA 		no annotation 5 GLY B 478
ASP B 479
ARG B 503
GLN B 778
MET B 782
 EVP D   1
3R9X_B_ACTB502 3r9x ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Aquifex aeolicus RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE A 		PF00398
(RrnaAD) 		4 LYS B 130
GLU B 134
GLN B 137
TYR B 157
 ACT B 502
3RAE_F_LFXF101 3rae LFX

DB01137
(Levofloxacin)
DB01165
(Ofloxacin) 		;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT A;
DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT B 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		4 SER A  79
ARG C 456
GLY C 457
GLU C 474
 LFX F 101
3RAE_H_LFXH101 3rae LFX

DB01137
(Levofloxacin)
DB01165
(Ofloxacin) 		;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT A;
DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT B 		no annotation 5 SER B  79
ARG D 456
GLY D 457
GLU D 474
GLU D 475
 LFX H 101
3RFA_A_SAMA406 3rfa SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE N 		PF04055
(Radical_SAM) 		14 PHE A 131
CYS A 132
MET A 176
GLU A 180
PRO A 181
SER A 211
SER A 213
SER A 233
HIS A 235
GLU A 278
VAL A 280
ILE A 309
TRP A 311
ASN A 312
 SAM A 406
3RFA_B_SAMB406 3rfa SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE N 		None 12 PHE B 131
CYS B 132
MET B 176
GLU B 180
PRO B 181
SER B 211
SER B 213
SER B 233
HIS B 235
VAL B 280
TRP B 311
ASN B 312
 SAM B 406
3RGL_A_GLYA301 3rgl GLY

DB00145
(Glycine) 		Campylobacter
jejuni 		GLYCYL-TRNA
SYNTHETASE ALPHA
SUBUNIT 		PF02091
(tRNA-synt_2e) 		8 ALA A  31
GLY A  32
THR A  33
ARG A  58
GLN A  76
GLN A  78
GLU A 156
THR A 158
 GLY A 301
3SFU_A_RBVA601 3sfu RBV

DB00811
(Ribavirin) 		Norwalk virus RNA POLYMERASE PF00680
(RdRP_1) 		9 ASP A 250
SER A 303
THR A 308
THR A 309
ASN A 312
TYR A 344
GLY A 345
ASP A 346
ASP A 347
 RBV A 601
3SFU_B_RBVB601 3sfu RBV

DB00811
(Ribavirin) 		Norwalk virus RNA POLYMERASE no annotation 9 ASP B 250
THR B 309
ASN B 312
TYR B 344
GLY B 345
ASP B 346
ASP B 347
LEU B 394
ARG B 395
 RBV B 601
3SFU_C_RBVC601 3sfu RBV

DB00811
(Ribavirin) 		Norwalk virus RNA POLYMERASE no annotation 11 LYS C 169
ARG C 185
LEU C 187
ASP C 250
LEU C 301
SER C 303
THR C 308
THR C 309
ASN C 312
GLY C 345
ASP C 346
 RBV C 601
3SGL_A_SAMA692 3sgl SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Yersinia pestis TRNA
5-METHYLAMINOMETHYL-
2-THIOURIDINE
BIOSYNTHESIS
BIFUNCTIONAL PROTEIN
MNMC 		PF01266
(Methyltransf_30)
PF05430
(DAO) 		14 GLU A  64
GLY A  66
GLY A  68
THR A  69
LEU A  71
ASN A  72
GLU A 101
LYS A 102
TYR A 103
ASP A 156
VAL A 157
ASP A 178
GLY A 179
PHE A 180
 SAM A 692
3TEG_A_DAHA416 3teg DAH

DB01235
(Levodopa) 		Homo sapiens PHENYLALANYL-TRNA
SYNTHETASE,
MITOCHONDRIAL 		PF01409
(tRNA-synt_2d)
PF03147
(FDX-ACB) 		13 HIS A 119
SER A 121
GLN A 124
ARG A 143
GLN A 157
GLU A 159
PHE A 232
PHE A 234
THR A 235
GLY A 254
GLY A 256
ALA A 275
GLY A 277
 DAH A 416
3TEH_A_DAHA351 3teh DAH

DB01235
(Levodopa) 		Thermus
thermophilus 		PHENYLALANYL-TRNA
SYNTHETASE ALPHA
CHAIN 		PF01409
(tRNA-synt_2d) 		9 TRP A 149
HIS A 178
SER A 180
ARG A 204
GLN A 218
GLU A 220
VAL A 261
ALA A 314
GLY A 316
 DAH A 351
3TEH_B_DAHB786 3teh DAH

DB01235
(Levodopa) 		Thermus
thermophilus 		PHENYLALANYL-TRNA
SYNTHETASE BETA
CHAIN 		PF01409
(tRNA-synt_2d)
PF01588
(tRNA_bind)
PF03147
(FDX-ACB)
PF03483
(B3_4)
PF03484
(B5) 		7 PRO B 259
HIS B 261
LEU B 286
GLY B 315
GLU B 334
ALA B 356
PHE B 360
 DAH B 786
3TKA_A_SAMA400 3tka SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE H 		PF01795
(Methyltransf_5) 		14 THR A  31
GLY A  33
ARG A  34
GLY A  36
HIS A  37
ASP A  55
ARG A  56
ASP A  57
PHE A  79
ASP A 101
SER A 105
GLN A 108
MET A 128
GLU A 218
 SAM A 400
3TM4_A_SAMA401 3tm4 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Pyrococcus
furiosus 		TRNA (GUANINE
N2-)-METHYLTRANSFERA
SE TRM14 		PF01170
(THUMP)
PF02926
(UPF0020) 		17 HIS A 198
ALA A 200
HIS A 201
LEU A 202
MET A 225
GLY A 227
SER A 228
THR A 230
GLU A 248
LYS A 249
TYR A 250
HIS A 253
ASP A 276
ALA A 277
ASN A 293
PRO A 295
LEU A 309
 SAM A 401
3TM4_B_SAMB401 3tm4 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Pyrococcus
furiosus 		TRNA (GUANINE
N2-)-METHYLTRANSFERA
SE TRM14 		None 17 HIS B 198
ALA B 200
HIS B 201
LEU B 202
MET B 225
GLY B 227
SER B 228
THR B 230
GLU B 248
LYS B 249
TYR B 250
HIS B 253
ASP B 276
ALA B 277
ASN B 293
PRO B 295
LEU B 309
 SAM B 401
3UFG_B_LEUB289 3ufg LEU

DB00149
(L-
Leucine) 		Campylobacter
jejuni 		GLYCYL-TRNA
SYNTHETASE ALPHA
SUBUNIT 		None 3 PHE B  34
SER B 117
SER B 119
 LEU B 289
3UR0_B_SVRB516 3ur0 SVR

DB04786
(Suramin) 		Norwalk virus RNA-DEPENDENT RNA
POLYMERASE 		no annotation 7 PRO B  38
GLY B  40
ALA B  41
TRP B  42
ALA B 409
ASP B 412
ARG B 413
 SVR B 516
3UR0_C_SVRC516 3ur0 SVR

DB04786
(Suramin) 		Norwalk virus RNA-DEPENDENT RNA
POLYMERASE 		no annotation 9 PRO C  38
GLY C  40
ALA C  41
TRP C  42
LYS C 171
ALA C 409
ASP C 412
ARG C 413
LEU C 416
 SVR C 516
3UR0_C_SVRC517 3ur0 SVR

DB04786
(Suramin) 		Norwalk virus RNA-DEPENDENT RNA
POLYMERASE 		no annotation 11 TRP C  42
GLN C  66
LYS C  68
GLU C 168
VAL C 170
LYS C 171
LYS C 174
LYS C 180
ARG C 182
ARG C 245
ARG C 392
 SVR C 517
3V8V_A_SAMA801 3v8v SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE L 		PF01170
(THUMP)
PF02926
(Methyltrans_SAM)
PF10672
(UPF0020) 		14 PRO A 172
ILE A 173
MET A 197
GLY A 199
SER A 200
THR A 202
ASP A 262
SER A 263
ASP A 264
ASP A 290
VAL A 291
ASN A 309
PRO A 311
LEU A 325
 SAM A 801
3V8V_A_SAMA802 3v8v SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE L 		PF01170
(THUMP)
PF02926
(Methyltrans_SAM)
PF10672
(UPF0020) 		9 PHE A 546
TYR A 548
ASP A 568
MET A 569
SER A 570
TYR A 573
ASP A 597
CYS A 598
PRO A 617
 SAM A 802
3V8V_B_SAMB801 3v8v SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE L 		None 11 MET B 197
GLY B 199
ASP B 262
SER B 263
ASP B 264
ASP B 290
VAL B 291
ASN B 309
PRO B 311
TYR B 312
LEU B 325
 SAM B 801
3V8V_B_SAMB802 3v8v SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE L 		None 13 ARG B 530
PHE B 546
TYR B 548
SER B 551
ASP B 568
MET B 569
SER B 570
TYR B 573
ASP B 597
CYS B 598
ASP B 615
PRO B 617
SER B 620
 SAM B 802
4AQ7_A_LEUA902 4aq7 LEU

DB00149
(L-
Leucine) 		Escherichia coli LEUCINE--TRNA LIGASE PF00133
(tRNA-synt_1)
PF08264
(tRNA-synt_1_2)
PF13603
(tRNA-synt_1) 		7 MET A  40
LEU A  41
ASP A  80
SER A 496
GLU A 532
HIS A 533
HIS A 537
 LEU A 902
4AQ7_D_LEUD902 4aq7 LEU

DB00149
(L-
Leucine) 		Escherichia coli LEUCINE--TRNA LIGASE None 9 MET D  40
LEU D  41
ASP D  80
SER D 496
TYR D 499
TYR D 527
GLU D 532
HIS D 533
HIS D 537
 LEU D 902
4ARC_A_LEUA1001 4arc LEU

DB00149
(L-
Leucine) 		Escherichia coli LEUCINE--TRNA LIGASE PF00133
(tRNA-synt_1)
PF08264
(tRNA-synt_1)
PF13603
(Anticodon_1) 		7 LEU A  41
TYR A  43
ASP A  80
SER A 496
TYR A 527
HIS A 533
HIS A 537
 LEU A1001
4B17_A_SAMA1358 4b17 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE M 		PF01728
(FtsJ) 		13 SER A 186
SER A 188
GLY A 219
CYS A 221
PRO A 222
GLY A 223
GLY A 224
TRP A 225
ASP A 240
ASP A 260
ASP A 277
MET A 278
VAL A 279
 SAM A1358
4BLV_A_SAMA1281 4blv SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE J 		PF04378
(RsmJ) 		18 LEU A   2
TYR A   4
HIS A   6
LYS A  18
HIS A  19
ASP A  40
HIS A  42
GLY A  44
GLY A  99
SER A 100
GLU A 118
LEU A 119
HIS A 120
ASP A 123
ASP A 143
GLY A 144
ASP A 164
PRO A 166
 SAM A1281
4BLV_B_SAMB1281 4blv SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE J 		None 14 LYS B  18
HIS B  19
ASP B  40
HIS B  42
GLY B  44
TYR B  48
GLY B  99
SER B 100
GLU B 118
LEU B 119
HIS B 120
ASP B 143
GLY B 144
ASP B 164
 SAM B1281
4DCM_A_SAMA401 4dcm SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE G 		PF05175
(MTS) 		11 PHE A 208
ALA A 217
ASP A 234
GLY A 236
GLY A 238
ILE A 242
ASP A 259
GLU A 260
ASN A 289
ASN A 305
PRO A 307
 SAM A 401
4DF3_A_SAMA301 4df3 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Aeropyrum pernix FIBRILLARIN-LIKE
RRNA/TRNA
2'-O-METHYLTRANSFERA
SE 		PF01269
(Fibrillarin) 		15 LYS A  61
TYR A  83
GLY A  85
ALA A  87
THR A  90
THR A  91
GLU A 109
PHE A 110
ALA A 111
VAL A 114
ASP A 134
ALA A 135
ASP A 154
VAL A 155
GLN A 157
 SAM A 301
4DF3_B_SAMB301 4df3 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Aeropyrum pernix FIBRILLARIN-LIKE
RRNA/TRNA
2'-O-METHYLTRANSFERA
SE 		None 15 LYS B  61
TYR B  83
GLY B  85
ALA B  87
THR B  90
THR B  91
GLU B 109
PHE B 110
ALA B 111
VAL B 114
ASP B 134
ALA B 135
ASP B 154
VAL B 155
GLN B 157
 SAM B 301
4FAK_A_SAMA201 4fak SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Staphylococcus
aureus 		RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE H 		PF02590
(SPOUT_MTase) 		10 LEU A  76
ILE A  78
ILE A 107
GLY A 108
GLY A 112
PHE A 127
SER A 128
THR A 131
PHE A 132
MET A 137
 SAM A 201
4G0U_B_ASWB1301 4g0u ASW

DB00276
(Amsacrine) 		Homo sapiens DNA TOPOISOMERASE
2-BETA 		no annotation 7 ILE B 454
PRO B 455
ARG B 503
GLY B 504
ALA B 521
GLU B 522
GLN B 778
 ASW B1301
4G0U_F_ASWF101 4g0u ASW

DB00276
(Amsacrine) 		;
Homo sapiens 		DNA TOPOISOMERASE
2-BETA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF01751
(Toprim)
PF16898
(TOPRIM_C)
no annotation 		6 PRO A 455
ARG A 503
GLY A 504
ALA A 521
GLU A 522
GLN A 778
 ASW F 101
4G0V_A_MIXA1301 4g0v MIX

DB01204
(Mitoxantrone) 		Homo sapiens DNA TOPOISOMERASE
2-BETA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF01751
(Toprim)
PF16898
(TOPRIM_C) 		7 ARG A 503
GLY A 504
ILE A 506
ASN A 520
GLU A 522
GLN A 778
MET A 782
 MIX A1301
4G0V_D_MIXD101 4g0v MIX

DB01204
(Mitoxantrone) 		;
Homo sapiens 		DNA TOPOISOMERASE
2-BETA 		no annotation 6 ARG B 503
GLY B 504
ASN B 520
GLU B 522
GLN B 778
MET B 782
 MIX D 101
4HVC_A_HFGA1602 4hvc HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Homo sapiens BIFUNCTIONAL
GLUTAMATE/PROLINE--T
RNA LIGASE 		PF00587
(HGTP_anticodon)
PF03129
(ProRS-C_1)
PF09180
(tRNA-synt_2b) 		16 HIS A1093
PHE A1097
GLU A1100
VAL A1101
PRO A1120
THR A1121
GLU A1123
ARG A1152
TRP A1169
GLU A1171
HIS A1173
PHE A1216
THR A1240
HIS A1242
SER A1272
GLY A1274
 HFG A1602
4HVC_B_HFGB1602 4hvc HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Homo sapiens BIFUNCTIONAL
GLUTAMATE/PROLINE--T
RNA LIGASE 		None 17 LEU B1087
HIS B1093
PHE B1097
GLU B1100
VAL B1101
PRO B1120
THR B1121
GLU B1123
ARG B1152
TRP B1169
GLU B1171
HIS B1173
PHE B1216
THR B1240
HIS B1242
SER B1272
GLY B1274
 HFG B1602
4JTP_A_ASCA802 4jtp ASC

DB00126
(Vitamin
C) 		Momordica
balsamina 		RRNA N-GLYCOSIDASE PF00161
(RIP) 		5 TYR A  70
ILE A  71
ASN A 110
TYR A 111
ILE A 155
 ASC A 802
4JUO_F_LFXF101 4juo LFX

DB01137
(Levofloxacin)
DB01165
(Ofloxacin) 		;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT A;
DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT B;
E-SITE DNA 		PF00204
(DNA_gyraseB)
PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
PF02518
(HATPase_c)
no annotation 		4 SER A  79
ARG C 456
GLY C 457
GLU C 474
 LFX F 101
4K4Y_A_ACTA502 4k4y ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Enterovirus B RNA-DEPENDENT RNA
POLYMERASE 		PF00680
(RdRP_1) 		5 LYS A  96
LEU A  97
GLU A  98
LEU A 138
LYS A 142
 ACT A 502
4K4Y_E_ACTE503 4k4y ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Enterovirus B RNA-DEPENDENT RNA
POLYMERASE 		None 4 LYS E  96
LEU E  97
GLU E  98
LEU E 138
 ACT E 503
4K4Y_I_ACTI503 4k4y ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Enterovirus B RNA-DEPENDENT RNA
POLYMERASE 		None 5 LYS I  96
LEU I  97
GLU I  98
LEU I 138
LYS I 142
 ACT I 503
4K50_A_ACTA502 4k50 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Rhinovirus A RNA POLYMERASE
3D-POL 		PF00680
(RdRP_1) 		3 ARG A 163
LYS A 164
LYS A 167
 ACT A 502
4K50_A_ACTA503 4k50 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Rhinovirus A RNA POLYMERASE
3D-POL 		PF00680
(RdRP_1) 		4 LYS A 336
ASP A 338
MET A 339
PHE A 362
 ACT A 503
4K50_A_ACTA505 4k50 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Rhinovirus A RNA POLYMERASE
3D-POL 		PF00680
(RdRP_1) 		3 CYS A  68
ASN A  71
LYS A 348
 ACT A 505
4K50_A_ACTA506 4k50 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Rhinovirus A RNA POLYMERASE
3D-POL 		PF00680
(RdRP_1) 		3 VAL A 121
GLY A 124
LYS A 126
 ACT A 506
4K50_B_ACTB701 4k50 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		;
Rhinovirus A 		RNA (33-MER);
RNA POLYMERASE
3D-POL 		None
PF00680
(RdRP_1) 		3 HIS A 199
GLY A 291
ILE A 294
 ACT B 701
4K50_E_ACTE501 4k50 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Rhinovirus A RNA POLYMERASE
3D-POL 		None 4 CYS E 212
THR E 216
PHE E 217
LYS E 220
 ACT E 501
4K50_E_ACTE502 4k50 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Rhinovirus A RNA POLYMERASE
3D-POL 		None 3 ARG E 163
LYS E 164
LYS E 167
 ACT E 502
4K50_E_ACTE503 4k50 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Rhinovirus A RNA POLYMERASE
3D-POL 		None 4 MET E 154
SER E 179
LEU E 267
CYS E 289
 ACT E 503
4K50_E_ACTE504 4k50 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Rhinovirus A RNA POLYMERASE
3D-POL 		None 3 VAL E 121
GLY E 124
LYS E 126
 ACT E 504
4K50_F_ACTF701 4k50 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		;
Rhinovirus A 		RNA (33-MER);
RNA POLYMERASE
3D-POL 		None 4 PHE E 195
HIS E 199
GLY E 291
ILE E 294
 ACT F 701
4K50_I_ACTI501 4k50 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Rhinovirus A RNA POLYMERASE
3D-POL 		None 4 LYS I 336
ASP I 338
MET I 339
PHE I 362
 ACT I 501
4K50_I_ACTI504 4k50 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Rhinovirus A RNA POLYMERASE
3D-POL 		None 3 VAL I 121
GLY I 124
LYS I 126
 ACT I 504
4K50_I_ACTI506 4k50 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Rhinovirus A RNA POLYMERASE
3D-POL 		None 3 ARG I 163
LYS I 164
LYS I 167
 ACT I 506
4K50_I_ACTI507 4k50 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Rhinovirus A RNA POLYMERASE
3D-POL 		None 3 LYS I 405
PRO I 406
SER I 407
 ACT I 507
4K50_J_ACTJ701 4k50 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		;
Rhinovirus A 		RNA (33-MER);
RNA POLYMERASE
3D-POL 		None 3 HIS I 199
GLY I 291
ILE I 294
 ACT J 701
4K50_M_ACTM501 4k50 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Rhinovirus A RNA POLYMERASE
3D-POL 		None 4 MET M 154
SER M 179
LEU M 267
CYS M 289
 ACT M 501
4K50_M_ACTM502 4k50 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Rhinovirus A RNA POLYMERASE
3D-POL 		None 4 CYS M 212
THR M 216
PHE M 217
LYS M 220
 ACT M 502
4K50_M_ACTM503 4k50 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Rhinovirus A RNA POLYMERASE
3D-POL 		None 4 PHE M 195
HIS M 199
GLY M 291
ILE M 294
 ACT M 503
4K87_A_ADNA602 4k87 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Homo sapiens PROLINE--TRNA LIGASE PF00587
(tRNA-synt_2b)
PF03129
(HGTP_anticodon)
PF09180
(ProRS-C_1) 		8 ARG A 152
ARG A 163
PHE A 167
GLN A 237
GLY A 239
THR A 240
THR A 276
ARG A 278
 ADN A 602
4K88_A_HFGA602 4k88 HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Homo sapiens PROLINE--TRNA LIGASE PF00587
(ProRS-C_1)
PF03129
(tRNA-synt_2b)
PF09180
(HGTP_anticodon) 		12 PHE A  97
GLU A 100
VAL A 101
PRO A 120
THR A 121
GLU A 123
ARG A 152
TRP A 169
GLU A 171
PHE A 216
HIS A 242
SER A 272
 HFG A 602
4KMU_C_RFPC1401 4kmu RFP

DB01045
(Rifampicin) 		Escherichia coli DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE SUBUNIT
BETA 		PF00562
(RNA_pol_Rpb2_6)
PF04560
(RNA_pol_Rpb2_7)
PF04561
(RNA_pol_Rpb2_2)
PF04563
(RNA_pol_Rpb2_1)
PF04565
(RNA_pol_Rpb2_3)
PF10385
(RNA_pol_Rpb2_45) 		14 GLN C 510
LEU C 511
GLN C 513
PHE C 514
ASP C 516
HIS C 526
ARG C 529
SER C 531
LEU C 533
ARG C 540
PRO C 564
ASN C 568
ILE C 572
ARG C 687
 RFP C1401
4KMU_H_RFPH1401 4kmu RFP

DB01045
(Rifampicin) 		Escherichia coli DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE SUBUNIT
BETA;
RNA POLYMERASE SIGMA
FACTOR RPOD 		no annotation 14 GLN H 510
GLN H 513
ASP Y 514
PHE H 514
ASP H 516
HIS H 526
ARG H 529
SER H 531
LEU H 533
ARG H 540
PRO H 564
ASN H 568
ILE H 572
ARG H 687
 RFP H1401
4KOE_F_TR6F101 4koe TR6

DB00685
(Trovafloxacin) 		;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT A;
DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT B;
E-SITE DNA2 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		6 SER A  79
ARG B 117
GLY C 434
ASP C 435
ARG C 456
GLY C 457
 TR6 F 101
4KOE_H_TR6H101 4koe TR6

DB00685
(Trovafloxacin) 		;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT A;
DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT B;
E-SITE DNA4 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
no annotation 		7 SER B  79
ARG A 117
GLY D 434
ASP D 435
ARG D 456
GLY D 457
GLU D 475
 TR6 H 101
4KR3_A_GLYA701 4kr3 GLY

DB00145
(Glycine) 		Homo sapiens GLYCINE--TRNA LIGASE PF00587
(HGTP_anticodon)
PF03129
(tRNA-synt_2b) 		6 GLU A 245
ARG A 277
GLU A 296
ARG A 410
GLU A 522
SER A 524
 GLY A 701
4M6T_A_SAMA201 4m6t SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Homo sapiens RNA POLYMERASE
II-ASSOCIATED FACTOR
1 HOMOLOG, LINKER,
RNA
POLYMERASE-ASSOCIATE
D PROTEIN LEO1 		PF03985
(Leo1)
PF04004
(Paf1) 		4 ILE A  30
VAL A  42
VAL A  44
ARG A 169
 SAM A 201
4MJQ_A_27RA401 4mjq 27R

DB00963
(Bromfenac) 		Escherichia coli DNA POLYMERASE III
SUBUNIT BETA 		PF00712
(DNA_pol3_beta)
PF02767
(DNA_pol3_beta_2)
PF02768
(DNA_pol3_beta_3) 		5 ARG A 152
TYR A 154
THR A 172
PRO A 242
VAL A 247
 27R A 401
4MJR_A_0LAA404 4mjr 0LA

DB00821
(Carprofen) 		Escherichia coli DNA POLYMERASE III
SUBUNIT BETA 		PF00712
(DNA_pol3_beta)
PF02767
(DNA_pol3_beta_2)
PF02768
(DNA_pol3_beta_3) 		9 ARG A 152
TYR A 154
THR A 172
GLY A 174
LEU A 177
PRO A 242
VAL A 247
VAL A 360
MET A 362
 0LA A 404
4N48_A_SAMA601 4n48 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Homo sapiens CAP-SPECIFIC MRNA
(NUCLEOSIDE-2'-O-)-M
ETHYLTRANSFERASE 1 		PF01728
(FtsJ) 		17 ASN A 234
ALA A 236
CYS A 277
GLY A 279
PRO A 280
GLY A 281
GLY A 282
PHE A 283
THR A 301
LEU A 302
ASN A 306
ASP A 335
ILE A 336
THR A 337
ASP A 364
GLY A 365
LEU A 383
 SAM A 601
4N48_B_SAMB601 4n48 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Homo sapiens CAP-SPECIFIC MRNA
(NUCLEOSIDE-2'-O-)-M
ETHYLTRANSFERASE 1 		None 17 ASN B 234
ALA B 236
CYS B 277
GLY B 279
PRO B 280
GLY B 281
GLY B 282
PHE B 283
THR B 301
LEU B 302
ASN B 306
ASP B 335
ILE B 336
THR B 337
ASP B 364
GLY B 365
LEU B 383
 SAM B 601
4N49_A_SAMA601 4n49 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Homo sapiens CAP-SPECIFIC MRNA
(NUCLEOSIDE-2'-O-)-M
ETHYLTRANSFERASE 1 		PF01728
(FtsJ) 		16 ASN A 234
ALA A 236
CYS A 277
GLY A 279
PRO A 280
GLY A 281
GLY A 282
PHE A 283
THR A 301
LEU A 302
ASN A 306
ASP A 335
ILE A 336
THR A 337
ASP A 364
LEU A 383
 SAM A 601
4O0O_A_URFA303 4o0o URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Momordica
balsamina 		RRNA N-GLYCOSIDASE PF00161
(RIP) 		5 TYR A  70
ASN A 110
TYR A 111
ILE A 155
ARG A 163
 URF A 303
4O8J_A_ADNA401 4o8j ADN

DB00640
(Adenosine) 		Pyrococcus
horikoshii 		RNA 3'-TERMINAL
PHOSPHATE CYCLASE 		PF01137
(RTC)
PF05189
(RTC_insert) 		12 GLN A  14
ARG A  17
LEU A  97
GLN A 100
PRO A 127
PRO A 128
TYR A 131
ASP A 250
PHE A 283
ASP A 286
GLN A 287
HIS A 307
 ADN A 401
4O8J_B_ADNB401 4o8j ADN

DB00640
(Adenosine) 		Pyrococcus
horikoshii 		RNA 3'-TERMINAL
PHOSPHATE CYCLASE 		no annotation 12 GLN B  14
ARG B  17
LEU B  97
GLN B 100
PRO B 127
PRO B 128
TYR B 131
ASP B 250
PHE B 283
ASP B 286
GLN B 287
HIS B 307
 ADN B 401
4OLF_A_HFGA802 4olf HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Plasmodium
falciparum 		PROLINE--TRNA LIGASE PF00587
(tRNA-synt_2b)
PF03129
(HGTP_anticodon)
PF09180
(ProRS-C_1) 		16 PHE A 335
GLU A 338
VAL A 339
PRO A 358
THR A 359
GLU A 361
ARG A 390
TRP A 407
GLU A 409
HIS A 411
PHE A 454
THR A 478
HIS A 480
SER A 508
TRP A 509
GLY A 510
 HFG A 802
4PL1_A_SAMA401 4pl1 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli DUAL-SPECIFICITY RNA
METHYLTRANSFERASE
RLMN 		PF04055
(Radical_SAM) 		11 PHE A 131
MET A 176
GLU A 180
PRO A 181
SER A 211
SER A 233
HIS A 235
GLU A 278
ILE A 309
TRP A 311
ASN A 312
 SAM A 401
4PL1_B_SAMB401 4pl1 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli DUAL-SPECIFICITY RNA
METHYLTRANSFERASE
RLMN 		None 10 CYS B 132
MET B 176
GLU B 180
PRO B 181
SER B 211
SER B 233
HIS B 235
GLU B 278
TRP B 311
ASN B 312
 SAM B 401
4POO_A_SAMA301 4poo SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Bacillus subtilis PUTATIVE RNA
METHYLASE 		PF06962
(rRNA_methylase) 		14 THR A  28
GLY A  30
ASN A  31
HIS A  33
ASP A  34
ASP A  52
ILE A  53
GLN A  54
SER A  79
HIS A  80
ASN A 101
LEU A 105
THR A 114
SER A 118
 SAM A 301
4POO_B_SAMB301 4poo SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Bacillus subtilis PUTATIVE RNA
METHYLASE 		None 12 THR B  28
GLY B  30
ASN B  31
HIS B  33
ASP B  34
ASP B  52
ILE B  53
GLN B  54
SER B  79
HIS B  80
ASN B 101
SER B 118
 SAM B 301
4Q15_A_HFGA803 4q15 HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Plasmodium
falciparum 		PROLINE--TRNA LIGASE PF00587
(HGTP_anticodon)
PF03129
(ProRS-C_1)
PF09180
(tRNA-synt_2b) 		15 LEU A 325
PHE A 335
GLU A 338
VAL A 339
PRO A 358
THR A 359
GLU A 361
ARG A 390
TRP A 407
HIS A 411
PHE A 454
THR A 478
HIS A 480
SER A 508
GLY A 510
 HFG A 803
4Q15_B_HFGB803 4q15 HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Plasmodium
falciparum 		PROLINE--TRNA LIGASE None 15 LEU B 325
PHE B 335
GLU B 338
VAL B 339
PRO B 358
THR B 359
GLU B 361
ARG B 390
TRP B 407
GLU B 409
PHE B 454
THR B 478
HIS B 480
SER B 508
GLY B 510
 HFG B 803
4QD3_A_5AEA201 4qd3 5AE

DB00928
(Azacitidine) 		Pseudomonas
aeruginosa 		PEPTIDYL-TRNA
HYDROLASE 		PF01195
(Pept_tRNA_hydro) 		9 HIS A  22
LEU A  97
GLY A 114
HIS A 115
ASN A 116
VAL A 147
SER A 148
VAL A 151
LEU A 152
 5AE A 201
4RDX_A_HISA502 4rdx HIS

DB00117
(L-
Histidine) 		Thermus
thermophilus 		HISTIDINE--TRNA
LIGASE 		PF03129
(tRNA-synt_His)
PF13393
(HGTP_anticodon) 		7 THR A  83
GLU A 130
ARG A 259
TYR A 264
GLY A 285
TYR A 288
GLY A 304
 HIS A 502
4RTM_A_SAMA301 4rtm SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli DNA ADENINE
METHYLASE 		PF02086
(MethyltransfD12) 		16 TRP A  10
GLY A  12
GLY A  13
PHE A  35
GLY A  37
ALA A  38
SER A  40
ASP A  54
ILE A  55
ASN A  56
SER A 164
TYR A 165
ASP A 181
PRO A 183
TYR A 184
GLN A 205
 SAM A 301
4RTP_A_SAMA301 4rtp SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli DNA ADENINE
METHYLASE 		PF02086
(MethyltransfD12) 		13 TRP A  10
PHE A  35
GLY A  37
ALA A  38
SER A  40
ASP A  54
ILE A  55
ASN A  56
SER A 164
TYR A 165
ASP A 181
PRO A 183
GLN A 205
 SAM A 301
4RTR_A_SAMA301 4rtr SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli DNA ADENINE
METHYLASE 		PF02086
(MethyltransfD12) 		11 TRP A  10
GLY A  12
PHE A  35
ASP A  54
ILE A  55
ASN A  56
SER A 164
TYR A 165
ASP A 181
PRO A 183
TYR A 184
 SAM A 301
4RTS_A_SAMA301 4rts SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli DNA ADENINE
METHYLASE 		PF02086
(MethyltransfD12) 		12 TRP A  10
GLY A  12
PHE A  35
GLY A  37
ASP A  54
ILE A  55
ASN A  56
SER A 164
TYR A 165
ASP A 181
PRO A 183
TYR A 184
 SAM A 301
4S2V_A_ACTA229 4s2v ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli RNA
PYROPHOSPHOHYDROLASE 		PF00293
(NUDIX) 		3 TRP A 131
LYS A 150
ALA A 153
 ACT A 229
4UCI_A_ADNA2414 4uci ADN

DB00640
(Adenosine) 		Human
metapneumovirus 		RNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE L 		no annotation 6 GLU A1781
PHE A1782
ARG A1785
PHE A1788
TYR A1818
HIS A1819
 ADN A2414
4UCI_A_SAMA2409 4uci SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Human
metapneumovirus 		RNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE L 		None 16 SER A1668
THR A1670
GLY A1696
GLU A1697
GLY A1698
GLY A1700
ASN A1701
TRP A1702
SER A1719
LEU A1720
ASP A1725
ASP A1755
ALA A1756
ASP A1779
ALA A1780
LYS A1817
 SAM A2409
4UCI_B_ADNB2415 4uci ADN

DB00640
(Adenosine) 		Human
metapneumovirus 		RNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE L 		no annotation 7 GLU B1781
PHE B1782
ARG B1785
PHE B1788
LYS B1817
TYR B1818
HIS B1819
 ADN B2415
4UCI_B_SAMB2409 4uci SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Human
metapneumovirus 		RNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE L 		None 16 SER B1668
THR B1670
GLY B1696
GLU B1697
GLY B1698
GLY B1700
ASN B1701
TRP B1702
SER B1719
LEU B1720
ASP B1725
ASP B1755
ALA B1756
ASP B1779
ALA B1780
LYS B1817
 SAM B2409
4UCK_A_SAMA2409 4uck SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Human
metapneumovirus 		RNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE L 		None 15 SER A1668
THR A1670
GLY A1696
GLU A1697
GLY A1698
GLY A1700
ASN A1701
TRP A1702
SER A1719
LEU A1720
ASP A1755
ALA A1756
THR A1757
ASP A1779
ALA A1780
 SAM A2409
4UCK_B_SAMB2409 4uck SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Human
metapneumovirus 		RNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE L 		None 18 SER B1668
THR B1670
GLY B1696
GLU B1697
GLY B1698
GLY B1700
ASN B1701
TRP B1702
SER B1719
LEU B1720
ASP B1722
ASP B1725
ASP B1755
ALA B1756
THR B1757
ASP B1779
ALA B1780
LYS B1817
 SAM B2409
4URN_A_NOVA2000 4urn NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Staphylococcus
aureus 		DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT 		PF02518
(HATPase_c)
no annotation 		14 ASP B  35
LYS B  36
ASN A  49
SER A  50
ASP A  52
GLU A  53
ASP A  76
ARG A  79
MET A  81
PRO A  82
ILE A  96
ARG A 138
THR A 168
ASN B 186
 NOV A2000
4URN_B_NOVB2000 4urn NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Staphylococcus
aureus 		DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT 		no annotation 11 ASN B  49
SER B  50
ASP B  52
GLU B  53
ASP B  76
ARG B  79
MET B  81
PRO B  82
ILE B  96
ARG B 138
THR B 168
 NOV B2000
4URN_C_NOVC2000 4urn NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Staphylococcus
aureus 		DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT 		no annotation 11 ASN C  49
SER C  50
ASP C  52
GLU C  53
ASP C  76
ARG C  79
MET C  81
PRO C  82
ILE C  96
ARG C 138
THR C 168
 NOV C2000
4URO_A_NOVA2000 4uro NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Staphylococcus
aureus 		DNA GYRASE SUBUNIT B PF02518
(HATPase_c)
no annotation 		15 ASN A  54
SER A  55
ASP A  57
GLU A  58
ASP A  81
ARG A  84
ILE A  86
PRO A  87
ASP A  89
GLN A  91
ILE A 102
SER A 128
ARG A 144
THR A 173
ARG D 200
 NOV A2000
4URO_B_NOVB2000 4uro NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Staphylococcus
aureus 		DNA GYRASE SUBUNIT B no annotation 13 ASN B  54
SER B  55
ASP B  57
GLU B  58
ASP B  81
ARG B  84
ILE B  86
PRO B  87
ASP B  89
GLN B  91
ILE B 102
SER B 128
ARG B 144
 NOV B2000
4URO_C_NOVC2000 4uro NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Staphylococcus
aureus 		DNA GYRASE SUBUNIT B no annotation 14 ASN C  54
ASP C  57
GLU C  58
ASP C  81
ARG C  84
ILE C  86
PRO C  87
ASP C  89
GLN C  91
ALA C  98
ILE C 102
SER C 128
ARG C 144
THR C 173
 NOV C2000
4URO_D_NOVD2000 4uro NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Staphylococcus
aureus 		DNA GYRASE SUBUNIT B no annotation 12 ASN D  54
SER D  55
GLU D  58
ASP D  81
ARG D  84
ILE D  86
PRO D  87
ASP D  89
ILE D 102
SER D 128
ARG D 144
THR D 173
 NOV D2000
4WQ4_A_ACTA403 4wq4 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli TRNA N6-ADENOSINE
THREONYLCARBAMOYLTRA
NSFERASE 		PF00814
(Peptidase_M22) 		3 VAL A  85
LEU A  89
VAL A 325
 ACT A 403
4WQ4_B_ACTB403 4wq4 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli TRNA N6-ADENOSINE
THREONYLCARBAMOYLTRA
NSFERASE 		None 3 ARG B  49
ASP B  50
ARG B  53
 ACT B 403
4WQ5_B_ACTB404 4wq5 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Escherichia coli TRNA N6-ADENOSINE
THREONYLCARBAMOYLTRA
NSFERASE 		None 3 TYR B  30
ARG B  53
LYS B  54
 ACT B 404
4WRY_A_URFA302 4wry URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Mycobacterium
tuberculosis 		URACIL-DNA
GLYCOSYLASE 		PF03167
(UDG) 		8 GLY A  66
GLN A  67
TYR A  70
SER A  80
PHE A  81
SER A  93
ASN A 127
HIS A 191
 URF A 302
4WRZ_A_URFA302 4wrz URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Mycobacterium
tuberculosis 		URACIL-DNA
GLYCOSYLASE 		PF03167
(UDG) 		8 GLY A  66
GLN A  67
TYR A  70
SER A  80
PHE A  81
SER A  93
ASN A 127
HIS A 191
 URF A 302
4WS0_A_URFA301 4ws0 URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Mycobacterium
tuberculosis 		URACIL-DNA
GLYCOSYLASE 		PF03167
(UDG) 		7 GLY A  66
GLN A  67
TYR A  70
SER A  80
PHE A  81
ASN A 127
HIS A 191
 URF A 301
4WS1_A_URFA301 4ws1 URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Mycobacterium
tuberculosis 		URACIL-DNA
GLYCOSYLASE 		PF03167
(UDG) 		8 GLY A  66
GLN A  67
TYR A  70
SER A  80
PHE A  81
SER A  93
ASN A 127
HIS A 191
 URF A 301
4WZM_A_ACTA503 4wzm ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Foot-and-mouth
disease virus 		RNA DEPENDENT RNA
POLYMERASE 		PF00680
(RdRP_1) 		4 ASP A 238
ASP A 240
ASP A 339
ALA A 367
 ACT A 503
4X3M_A_ADNA301 4x3m ADN

DB00640
(Adenosine) 		Thermus
thermophilus 		RNA 2'-O RIBOSE
METHYLTRANSFERASE 		PF00588
(SpoU_methylase) 		9 PRO A 188
LEU A 207
GLY A 208
GLU A 210
ILE A 228
MET A 230
SER A 236
VAL A 239
THR A 242
 ADN A 301
4X3M_B_ADNB301 4x3m ADN

DB00640
(Adenosine) 		Thermus
thermophilus 		RNA 2'-O RIBOSE
METHYLTRANSFERASE 		no annotation 9 PRO B 188
LEU B 207
GLY B 208
ILE B 228
MET B 230
SER B 236
LEU B 237
VAL B 239
THR B 242
 ADN B 301
4YDQ_A_HFGA802 4ydq HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Plasmodium
falciparum 		PROLINE--TRNA LIGASE PF00587
(ProRS-C_1)
PF03129
(tRNA-synt_2b)
PF09180
(HGTP_anticodon) 		16 LEU A 325
PHE A 335
GLU A 338
VAL A 339
PRO A 358
THR A 359
GLU A 361
ARG A 390
TRP A 407
GLU A 409
HIS A 411
PHE A 454
THR A 478
HIS A 480
SER A 508
GLY A 510
 HFG A 802
4YDQ_B_HFGB802 4ydq HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Plasmodium
falciparum 		PROLINE--TRNA LIGASE None 15 PHE B 335
GLU B 338
VAL B 339
PRO B 358
THR B 359
GLU B 361
ARG B 390
TRP B 407
GLU B 409
HIS B 411
PHE B 454
THR B 478
HIS B 480
SER B 508
GLY B 510
 HFG B 802
4YVG_A_SAMA301 4yvg SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Haemophilus
influenzae 		TRNA
(GUANINE-N(1)-)-METH
YLTRANSFERASE 		PF01746
(tRNA_m1G_MT) 		14 TYR A  86
LEU A  87
SER A  88
PRO A  89
GLN A  90
GLY A 113
GLU A 116
GLY A 117
SER A 132
ILE A 133
LEU A 138
GLY A 140
GLY A 141
PRO A 144
 SAM A 301
4Z2C_F_MFXF101 4z2c MFX

DB00218
(Moxifloxacin) 		Escherichia coli;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B;
SYMMETRIZED E-SITE
DNA 		PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		4 SER B  81
ARG C 456
GLY C 457
GLU C 475
 MFX F 101
4Z2C_H_MFXH101 4z2c MFX

DB00218
(Moxifloxacin) 		Escherichia coli;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B;
SYMMETRIZED E-SITE
DNA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
no annotation 		4 SER A  81
ARG D 456
GLY D 457
GLU D 475
 MFX H 101
4Z2D_F_LFXF102 4z2d LFX

DB01137
(Levofloxacin)
DB01165
(Ofloxacin) 		Escherichia coli;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B;
SYMMETRIZED E-SITE
DNA 		PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		4 SER B  81
ARG C 456
GLY C 457
GLU C 475
 LFX F 102
4Z2D_H_LFXH101 4z2d LFX

DB01137
(Levofloxacin)
DB01165
(Ofloxacin) 		Escherichia coli;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B;
SYMMETRIZED E-SITE
DNA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
no annotation 		4 SER A  81
ARG D 456
GLY D 457
GLU D 475
 LFX H 101
4Z2E_F_TR6F101 4z2e TR6

DB00685
(Trovafloxacin) 		Escherichia coli;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B;
SYMMETRIZED E-SITE
DNA 		PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		5 SER B  81
GLY C 434
ARG C 456
GLY C 457
GLU C 475
 TR6 F 101
4Z2E_H_TR6H101 4z2e TR6

DB00685
(Trovafloxacin) 		Escherichia coli;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B;
SYMMETRIZED E-SITE
DNA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
no annotation 		5 SER A  81
GLY D 434
ARG D 456
GLY D 457
GLU D 475
 TR6 H 101
4Z3O_F_MFXF101 4z3o MFX

DB00218
(Moxifloxacin) 		Escherichia coli;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT
B,PARE30-PARC55
FUSED TOPO IV FROM
S. PNEUMONIAE;
E-SITE DNA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		5 ARG B 456
GLY B 457
GLU B 475
SER B1079
ARG A1117
 MFX F 101
4Z3O_H_MFXH101 4z3o MFX

DB00218
(Moxifloxacin) 		Escherichia coli;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT
B,PARE30-PARC55
FUSED TOPO IV FROM
S. PNEUMONIAE;
E-SITE DNA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		3 ARG A 456
GLU A 475
SER A1079
 MFX H 101
4Z53_F_TR6F101 4z53 TR6

DB00685
(Trovafloxacin) 		Escherichia coli;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT B,DNA
TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT A;
E-SITE DNA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		6 GLY A 434
ASP A 435
ARG A 456
GLY A 457
SER A1079
ARG B1117
 TR6 F 101
4Z53_H_TR6H101 4z53 TR6

DB00685
(Trovafloxacin) 		Escherichia coli;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT B,DNA
TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT A;
E-SITE DNA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		7 GLY B 434
ASP B 435
ARG B 456
GLY B 457
GLU B 475
SER B1079
ARG A1117
 TR6 H 101
5BS8_G_MFXG101 5bs8 MFX

DB00218
(Moxifloxacin) 		Mycobacterium
tuberculosis;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B;
DNA SUBSTRATE 24-MER
TTACGTGCATAGTCATTCAT
GACC 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
no annotation 		7 ALA C  90
ARG A 128
ASP D 461
ARG D 482
GLY D 483
THR D 500
GLU D 501
 MFX G 101
5BS8_H_MFXH101 5bs8 MFX

DB00218
(Moxifloxacin) 		Mycobacterium
tuberculosis;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B;
DNA SUBSTRATE 24-MER
GGTCATGAATGACTATGCAC
GTAA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		7 ALA A  90
ARG C 128
ASP B 461
ARG B 482
GLY B 483
THR B 500
GLU B 501
 MFX H 101
5BTA_G_MFXG101 5bta MFX

DB00218
(Moxifloxacin) 		Mycobacterium
tuberculosis;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B;
DNA SUBSTRATE 24-MER
TTACGTGCATAGTCATTCAT
GACC 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
no annotation 		7 SER C  90
ARG A 128
ASP D 461
ARG D 482
GLY D 483
THR D 500
GLU D 501
 MFX G 101
5BTA_H_MFXH101 5bta MFX

DB00218
(Moxifloxacin) 		Mycobacterium
tuberculosis;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B;
DNA SUBSTRATE 24-MER
GGTCATGAATGACTATGCAC
GTAA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		6 SER A  90
ARG C 128
ARG B 482
GLY B 483
THR B 500
GLU B 501
 MFX H 101
5BTC_G_CPFG101 5btc CPF

DB00537
(Ciprofloxacin) 		Mycobacterium
tuberculosis;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B;
DNA SUBSTRATE 24-MER
TTACGTGCATAGTCATTCAT
GACC 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
no annotation 		6 SER C  90
ARG A 128
ARG D 482
GLY D 483
THR D 500
GLU D 501
 CPF G 101
5BTC_G_CPFG102 5btc CPF

DB00537
(Ciprofloxacin) 		Mycobacterium
tuberculosis;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B;
DNA SUBSTRATE 24-MER
TTACGTGCATAGTCATTCAT
GACC 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		6 SER A  90
ARG C 128
ARG B 482
GLY B 483
THR B 500
GLU B 501
 CPF G 102
5BTD_E_GFNE101 5btd GFN

DB01044
(Gatifloxacin) 		Mycobacterium
tuberculosis;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B;
DNA SUBSTRATE 24-MER
GGTCATGAATGACTATGCAC
GTAA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		7 ALA A  90
ARG C 128
ASP B 461
ARG B 482
GLY B 483
THR B 500
GLU B 501
 GFN E 101
5BTD_G_GFNG101 5btd GFN

DB01044
(Gatifloxacin) 		Mycobacterium
tuberculosis;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B;
DNA SUBSTRATE 24-MER
TTACGTGCATAGTCATTCAT
GACC 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
no annotation 		7 ALA C  90
ARG A 128
ASP D 461
ARG D 482
GLY D 483
THR D 500
GLU D 501
 GFN G 101
5BTF_F_GFNF101 5btf GFN

DB01044
(Gatifloxacin) 		Mycobacterium
tuberculosis;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B;
DNA SUBSTRATE 24-MER
TTACGTGCATAGTCATTCAT
GACC 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		7 SER A  90
ARG C 128
ASP B 461
ARG B 482
GLY B 483
THR B 500
GLU B 501
 GFN F 101
5BTF_G_GFNG101 5btf GFN

DB01044
(Gatifloxacin) 		Mycobacterium
tuberculosis;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B;
DNA SUBSTRATE 24-MER
TTACGTGCATAGTCATTCAT
GACC 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
no annotation 		7 SER C  90
ARG A 128
ASP D 461
ARG D 482
GLY D 483
THR D 500
GLU D 501
 GFN G 101
5BTG_E_LFXE101 5btg LFX

DB01137
(Levofloxacin)
DB01165
(Ofloxacin) 		Mycobacterium
tuberculosis;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B;
DNA SUBSTRATE 24-MER
GGTCATGAATGACTATGCAC
GTAA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		6 ALA A  90
ARG C 128
ARG B 482
GLY B 483
THR B 500
GLU B 501
 LFX E 101
5BTG_F_LFXF101 5btg LFX

DB01137
(Levofloxacin)
DB01165
(Ofloxacin) 		Mycobacterium
tuberculosis;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B;
DNA SUBSTRATE 24-MER
TTACGTGCATAGTCATTCAT
GACC 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
no annotation 		7 ALA C  90
ARG A 128
ASP D 461
ARG D 482
GLY D 483
THR D 500
GLU D 501
 LFX F 101
5BTI_E_LFXE101 5bti LFX

DB01137
(Levofloxacin)
DB01165
(Ofloxacin) 		Mycobacterium
tuberculosis;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B;
DNA SUBSTRATE 24-MER
GGTCATGAATGACTATGCAC
GTAA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		5 SER A  90
ARG B 482
GLY B 483
THR B 500
GLU B 501
 LFX E 101
5BTI_F_LFXF101 5bti LFX

DB01137
(Levofloxacin)
DB01165
(Ofloxacin) 		Mycobacterium
tuberculosis;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B;
DNA SUBSTRATE 24-MER
TTACGTGCATAGTCATTCAT
GACC 		no annotation 5 SER C  90
ARG D 482
GLY D 483
THR D 500
GLU D 501
 LFX F 101
5BW4_A_SAMA301 5bw4 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Catenulispora
acidiphila 		16S RRNA
(ADENINE(1408)-N(1))
-METHYLTRANSFERASE 		None 12 GLY A  38
GLY A  40
THR A  44
ASP A  61
PRO A  62
ARG A  66
ILE A  93
GLU A  94
LEU A 110
TRP A 113
LYS A 115
LEU A 116
 SAM A 301
5BW4_B_SAMB301 5bw4 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Catenulispora
acidiphila 		16S RRNA
(ADENINE(1408)-N(1))
-METHYLTRANSFERASE 		None 15 GLY B  38
GLY B  40
ASP B  61
PRO B  62
ALA B  63
ARG B  66
ALA B  92
ILE B  93
GLU B  94
LEU B 110
TRP B 113
LYS B 115
LEU B 116
SER B 201
ALA B 204
 SAM B 301
5C0O_E_SAME301 5c0o SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		TRNA
(ADENINE(58)-N(1))-M
ETHYLTRANSFERASE
TRMI 		PF08704
(GCD14) 		14 ALA E  74
PRO E  76
THR E  77
GLY E 101
GLY E 103
GLY E 106
LEU E 107
GLU E 125
ALA E 126
ARG E 127
HIS E 130
GLU E 155
ASP E 170
LEU E 171
 SAM E 301
5C0O_F_SAMF301 5c0o SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		TRNA
(ADENINE(58)-N(1))-M
ETHYLTRANSFERASE
TRMI 		None 12 PRO F  76
THR F  77
GLY F 103
GLY F 105
GLY F 106
LEU F 107
GLU F 125
ALA F 126
HIS F 130
LYS F 153
ASP F 170
LEU F 171
 SAM F 301
5C0O_G_SAMG301 5c0o SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		TRNA
(ADENINE(58)-N(1))-M
ETHYLTRANSFERASE
TRMI 		None 15 ALA G  74
PRO G  76
THR G  77
GLY G 101
GLY G 103
GLY G 106
LEU G 107
GLU G 125
ALA G 126
ARG G 127
HIS G 130
LYS G 153
GLU G 155
ASP G 170
LEU G 171
 SAM G 301
5C0O_H_SAMH301 5c0o SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		TRNA
(ADENINE(58)-N(1))-M
ETHYLTRANSFERASE
TRMI 		None 17 ALA H  74
PRO H  76
THR H  77
GLY H 101
GLY H 103
SER H 104
GLY H 105
GLY H 106
LEU H 107
GLU H 125
ARG H 127
HIS H 130
LYS H 153
LEU H 154
GLU H 155
ASP H 170
LEU H 171
 SAM H 301
5CDN_G_EVPG2101 5cdn EVP

DB00773
(Etoposide) 		Staphylococcus
aureus;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B,DNA GYRASE SUBUNIT
B 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		6 SER A  84
GLU A  88
GLY B 436
ASP B 437
ARG B 458
GLY B 459
 EVP G2101
5CDN_N_EVPN2101 5cdn EVP

DB00773
(Etoposide) 		Staphylococcus
aureus;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B,DNA GYRASE SUBUNIT
B 		no annotation 6 SER R  84
GLU R  88
GLY S 436
ASP S 437
ARG S 458
GLY S 459
 EVP N2101
5CDN_O_EVPO2101 5cdn EVP

DB00773
(Etoposide) 		Staphylococcus
aureus;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B,DNA GYRASE SUBUNIT
B 		no annotation 6 SER C  84
GLU C  88
GLY D 436
ASP D 437
ARG D 458
GLY D 459
 EVP O2101
5CDN_P_EVPP2101 5cdn EVP

DB00773
(Etoposide) 		Staphylococcus
aureus;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B,DNA GYRASE SUBUNIT
B 		no annotation 6 SER T  84
GLU T  88
GLY U 436
ASP U 437
ARG U 458
GLY U 459
 EVP P2101
5CDP_H_EVPH2101 5cdp EVP

DB00773
(Etoposide) 		Staphylococcus
aureus;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT B 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		6 SER A  84
GLU A  88
GLY B 436
ASP B 437
ARG B 458
GLY B 459
 EVP H2101
5CDQ_E_MFXE2101 5cdq MFX

DB00218
(Moxifloxacin) 		Staphylococcus
aureus;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B,DNA GYRASE SUBUNIT
B 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		5 SER A  84
ARG C 122
ARG B 458
GLY B 459
GLU B 477
 MFX E2101
5CDQ_F_MFXF2101 5cdq MFX

DB00218
(Moxifloxacin) 		Staphylococcus
aureus;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B,DNA GYRASE SUBUNIT
B 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
no annotation 		6 SER C  84
ARG A 122
ASP D 437
ARG D 458
GLY D 459
GLU D 477
 MFX F2101
5CDQ_V_MFXV2101 5cdq MFX

DB00218
(Moxifloxacin) 		Staphylococcus
aureus;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B,DNA GYRASE SUBUNIT
B 		no annotation 5 SER R  84
ARG T 122
ARG S 458
GLY S 459
GLU S 477
 MFX V2101
5CDQ_W_MFXW2101 5cdq MFX

DB00218
(Moxifloxacin) 		Staphylococcus
aureus;
synthetic
construct 		DNA GYRASE SUBUNIT
A;
DNA GYRASE SUBUNIT
B,DNA GYRASE SUBUNIT
B 		no annotation 5 SER T  84
ARG R 122
ASP U 437
ARG U 458
GLU U 477
 MFX W2101
5E3I_A_HISA502 5e3i HIS

DB00117
(L-
Histidine) 		Acinetobacter
baumannii 		HISTIDINE--TRNA
LIGASE 		PF03129
(tRNA-synt_His)
PF13393
(HGTP_anticodon) 		12 GLU A  85
THR A  87
ARG A 115
GLN A 129
GLU A 133
LEU A 263
TYR A 265
TYR A 266
GLY A 287
TYR A 290
GLY A 309
ALA A 311
 HIS A 502
5E3I_B_HISB502 5e3i HIS

DB00117
(L-
Histidine) 		Acinetobacter
baumannii 		HISTIDINE--TRNA
LIGASE 		None 11 GLU B  85
THR B  87
ARG B 115
GLN B 129
GLU B 133
TYR B 265
TYR B 266
GLY B 287
TYR B 290
GLY B 309
ALA B 311
 HIS B 502
5E72_A_SAMA400 5e72 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermococcus
kodakarensis 		N2,
N2-DIMETHYLGUANOSINE
TRNA
METHYLTRANSFERASE 		PF01170
(THUMP)
PF02926
(UPF0020) 		16 ILE A 163
ASP A 185
PHE A 187
GLY A 189
GLY A 192
ILE A 193
ASP A 208
ILE A 209
ARG A 210
MET A 213
ASP A 235
ALA A 236
THR A 253
ASP A 254
PRO A 256
LEU A 271
 SAM A 400
5EHG_A_SAMA301 5ehg SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Dengue virus RNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE NS5 		PF01728
(FtsJ) 		14 SER A  56
GLY A  58
GLY A  81
GLY A  83
GLY A  86
TRP A  87
THR A 104
LYS A 105
HIS A 110
GLU A 111
ASP A 131
VAL A 132
ASP A 146
ILE A 147
 SAM A 301
5EHG_C_SAMC4001 5ehg SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Dengue virus RNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE NS5 		None 14 SER C  56
GLY C  58
GLY C  81
GLY C  83
GLY C  86
TRP C  87
THR C 104
LYS C 105
HIS C 110
GLU C 111
ASP C 131
VAL C 132
ASP C 146
ILE C 147
 SAM C4001
5ERG_B_SAMB401 5erg SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Saccharomyces
cerevisiae 		TRNA
(ADENINE(58)-N(1))-M
ETHYLTRANSFERASE
CATALYTIC SUBUNIT
TRM61 		PF08704
(GCD14) 		19 GLN B  92
ILE B  93
VAL B  94
GLY B 118
GLY B 120
SER B 121
GLY B 122
SER B 123
PHE B 124
GLU B 139
PHE B 140
HIS B 141
ARG B 144
ASP B 168
VAL B 169
CYS B 170
ASP B 203
LEU B 204
PRO B 205
 SAM B 401
5F9Z_A_HFGA702 5f9z HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Cryptosporidium
parvum 		AMINOACYL-TRNA
SYNTHETASE 		PF00587
(HGTP_anticodon)
PF03129
(ProRS-C_1)
PF09180
(tRNA-synt_2b) 		16 LEU A 266
GLU A 274
GLY A 275
GLU A 279
VAL A 280
PRO A 299
THR A 300
GLU A 302
ARG A 331
TRP A 348
GLU A 350
PHE A 395
THR A 419
HIS A 421
SER A 449
GLY A 451
 HFG A 702
5F9Z_B_HFGB703 5f9z HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Cryptosporidium
parvum 		AMINOACYL-TRNA
SYNTHETASE 		None 16 LEU B 266
PHE B 276
SER B 277
GLU B 279
VAL B 280
PRO B 299
THR B 300
GLU B 302
ARG B 331
TRP B 348
GLU B 350
PHE B 395
THR B 419
HIS B 421
SER B 449
GLY B 451
 HFG B 703
5FXT_A_0LAA1376 5fxt 0LA

DB00821
(Carprofen) 		Helicobacter
pylori 		DNA POLYMERASE III
SUBUNIT BETA 		PF00712
(DNA_pol3_beta)
PF02767
(DNA_pol3_beta_2)
PF02768
(DNA_pol3_beta_3) 		7 LYS A 152
LEU A 155
THR A 174
PRO A 244
ILE A 249
LEU A 369
MET A 371
 0LA A1376
5G48_A_1FLA1375 5g48 1FL

DB00861
(Diflunisal) 		Helicobacter
pylori 		DNA POLYMERASE III
SUBUNIT BETA 		PF00712
(DNA_pol3_beta)
PF02767
(DNA_pol3_beta_2)
PF02768
(DNA_pol3_beta_3) 		8 THR A 173
THR A 175
LEU A 178
PRO A 243
ILE A 248
PRO A 347
LEU A 368
MET A 370
 1FL A1375
5G48_B_1FLB1375 5g48 1FL

DB00861
(Diflunisal) 		Helicobacter
pylori 		DNA POLYMERASE III
SUBUNIT BETA 		no annotation 9 LEU B 154
THR B 173
THR B 175
LEU B 178
PRO B 243
ILE B 248
PRO B 347
LEU B 368
MET B 370
 1FL B1375
5GWK_D_EVPD102 5gwk EVP

DB00773
(Etoposide) 		Homo sapiens;
synthetic
construct 		DNA TOPOISOMERASE
2-ALPHA 		no annotation 4 GLY B 462
ASP B 463
ARG B 487
MET B 766
 EVP D 102
5GWK_F_EVPF102 5gwk EVP

DB00773
(Etoposide) 		Homo sapiens;
synthetic
construct 		DNA TOPOISOMERASE
2-ALPHA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF01751
(Toprim)
PF16898
(TOPRIM_C)
no annotation 		5 GLY A 462
ASP A 463
ARG A 487
MET A 762
MET A 766
 EVP F 102
5HFJ_A_SAMA301 5hfj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Helicobacter
pylori 		ADENINE SPECIFIC DNA
METHYLTRANSFERASE
(DPNA) 		PF01555
(N6_N4_Mtase) 		14 ASP A   8
ALA A   9
ASP A  29
PRO A  31
LYS A 165
LYS A 167
PHE A 195
GLY A 197
SER A 198
THR A 200
GLU A 216
SER A 217
GLU A 218
TYR A 221
 SAM A 301
5HFJ_B_SAMB301 5hfj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Helicobacter
pylori 		ADENINE SPECIFIC DNA
METHYLTRANSFERASE
(DPNA) 		None 14 ASP B   8
ALA B   9
ASP B  29
PRO B  31
HIS B 168
THR B 170
GLN B 171
PHE B 195
GLY B 197
SER B 198
THR B 200
GLU B 216
SER B 217
TYR B 221
 SAM B 301
5HFJ_C_SAMC301 5hfj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Helicobacter
pylori 		ADENINE SPECIFIC DNA
METHYLTRANSFERASE
(DPNA) 		None 16 ASP C   8
ALA C   9
ASP C  29
PRO C  31
HIS C 168
THR C 170
GLN C 171
LYS C 172
PHE C 195
GLY C 197
SER C 198
THR C 200
GLU C 216
SER C 217
GLU C 218
TYR C 221
 SAM C 301
5HFJ_D_SAMD301 5hfj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Helicobacter
pylori 		ADENINE SPECIFIC DNA
METHYLTRANSFERASE
(DPNA) 		None 12 ASP D   8
ALA D   9
ASP D  29
PRO D  31
PHE D 195
GLY D 197
SER D 198
THR D 200
GLU D 216
SER D 217
GLU D 218
TYR D 221
 SAM D 301
5HFJ_E_SAME301 5hfj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Helicobacter
pylori 		ADENINE SPECIFIC DNA
METHYLTRANSFERASE
(DPNA) 		None 12 ASP E   8
ALA E   9
ASP E  29
PRO E 169
LYS E 172
PHE E 195
GLY E 197
SER E 198
THR E 200
GLU E 216
SER E 217
TYR E 221
 SAM E 301
5HFJ_F_SAMF301 5hfj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Helicobacter
pylori 		ADENINE SPECIFIC DNA
METHYLTRANSFERASE
(DPNA) 		None 12 ASP F   8
ALA F   9
ASP F  29
PRO F  31
THR F 170
GLN F 171
PHE F 195
GLY F 197
SER F 198
GLU F 216
SER F 217
TYR F 221
 SAM F 301
5HFJ_G_SAMG301 5hfj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Helicobacter
pylori 		ADENINE SPECIFIC DNA
METHYLTRANSFERASE
(DPNA) 		None 16 ASP G   8
ALA G   9
ASP G  29
PRO G  31
HIS G 168
THR G 170
GLN G 171
LYS G 172
PHE G 195
GLY G 197
SER G 198
THR G 200
GLU G 216
SER G 217
GLU G 218
TYR G 221
 SAM G 301
5HFJ_H_SAMH301 5hfj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Helicobacter
pylori 		ADENINE SPECIFIC DNA
METHYLTRANSFERASE
(DPNA) 		None 14 ASP H   8
ALA H   9
ASP H  29
PRO H  31
THR H 170
GLN H 171
LYS H 172
PHE H 195
GLY H 197
SER H 198
THR H 200
GLU H 216
SER H 217
TYR H 221
 SAM H 301
5HJI_A_ADNA401 5hji ADN

DB00640
(Adenosine) 		Pyrococcus abyssi TRNA
(GUANINE(37)-N1)-MET
HYLTRANSFERASE TRM5A 		PF02475
(Met_10) 		11 LEU A 131
TYR A 132
ARG A 133
PHE A 191
GLY A 193
GLU A 213
ILE A 214
ASN A 215
ASP A 243
VAL A 244
PRO A 262
 ADN A 401
5HW4_A_SAMA801 5hw4 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE I 		PF00590
(TP_methylase) 		12 ILE A  21
GLY A  94
THR A  95
ASP A 100
CYS A 123
ALA A 124
PHE A 144
TYR A 169
LEU A 198
LYS A 200
GLU A 227
VAL A 229
 SAM A 801
5HW4_B_SAMB801 5hw4 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE I 		None 11 ILE B  21
GLY B  94
ASP B 100
CYS B 123
ALA B 124
PHE B 144
TYR B 169
LEU B 198
LYS B 200
GLU B 227
VAL B 229
 SAM B 801
5HW4_C_SAMC801 5hw4 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE I 		None 12 ILE C  21
GLY C  94
THR C  95
ASP C 100
CYS C 123
ALA C 124
PHE C 144
TYR C 169
LEU C 198
LYS C 200
GLU C 227
VAL C 229
 SAM C 801
5IFU_A_GBMA801 5ifu GBM

DB01016
(Glyburide) 		Plasmodium
falciparum 		PROLINE--TRNA LIGASE PF00587
(tRNA-synt_2b)
PF03129
(HGTP_anticodon)
PF09180
(ProRS-C_1) 		13 PHE A 262
TYR A 266
ILE A 276
TYR A 285
LEU A 287
GLU A 404
THR A 513
ARG A 514
ILE A 516
GLY A 517
ILE A 520
MET A 521
TYR A 746
 GBM A 801
5IFU_B_GBMB801 5ifu GBM

DB01016
(Glyburide) 		Plasmodium
falciparum 		PROLINE--TRNA LIGASE no annotation 9 TYR B 266
ILE B 276
TYR B 285
LEU B 287
GLU B 404
THR B 513
ARG B 514
ILE B 516
GLY B 517
 GBM B 801
5L0Z_A_SAMA304 5l0z SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Sinorhizobium
meliloti 		PROBABLE RNA
METHYLTRANSFERASE,
TRMH FAMILY 		PF00588
(SpoU_sub_bind)
PF08032
(SpoU_methylase) 		12 THR A 212
LEU A 214
GLY A 235
GLY A 240
ARG A 254
ILE A 255
GLN A 257
ASP A 262
SER A 263
LEU A 264
LEU A 266
ALA A 269
 SAM A 304
5L0Z_B_SAMB304 5l0z SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Sinorhizobium
meliloti 		PROBABLE RNA
METHYLTRANSFERASE,
TRMH FAMILY 		None 10 THR B 212
LEU B 214
GLY B 235
GLY B 240
ILE B 255
GLN B 257
SER B 263
LEU B 264
LEU B 266
ALA B 269
 SAM B 304
5NR3_A_95EA401 5nr3 95E

DB00330
(Ethambutol) 		Homo sapiens DNA
(CYTOSINE-5)-METHYLT
RANSFERASE 3B 		PF00855
(PWWP) 		7 ILE A 233
PHE A 236
TRP A 239
TRP A 263
ASP A 266
LYS A 268
SER A 297
 95E A 401
5NR3_B_95EB401 5nr3 95E

DB00330
(Ethambutol) 		Homo sapiens DNA
(CYTOSINE-5)-METHYLT
RANSFERASE 3B 		None 4 TRP B 239
TRP B 263
ASP B 266
SER B 297
 95E B 401
5NZW_A_9F2A1102 5nzw 9F2

DB01212
(Ceftriaxone) 		Homo sapiens DNA CROSS-LINK
REPAIR 1A PROTEIN 		PF07522
(DRMBL)
PF12706
(Lactamase_B_2) 		10 HIS A 732
HIS A 734
ASP A 736
HIS A 737
HIS A 793
ASP A 815
TYR A 841
TYR A 879
THR A 962
HIS A 994
 9F2 A1102
5NZX_A_9F2A1102 5nzx 9F2

DB01212
(Ceftriaxone) 		Homo sapiens DNA CROSS-LINK
REPAIR 1A PROTEIN 		PF07522
(DRMBL)
PF12706
(Lactamase_B_2) 		8 ASN A 938
PHE A 939
ARG A 960
THR A 962
GLN A 979
LYS A 981
ILE A 986
GLY A 988
 9F2 A1102
5NZY_A_CE3A1102 5nzy CE3

DB00493
(Cefotaxime) 		Homo sapiens DNA CROSS-LINK
REPAIR 1A PROTEIN 		PF07522
(DRMBL)
PF12706
(Lactamase_B_2) 		7 ASN A 938
PHE A 939
ARG A 960
THR A 962
GLN A 979
ILE A 986
GLY A 988
 CE3 A1102
5NZY_A_CE3A1103 5nzy CE3

DB00493
(Cefotaxime) 		Homo sapiens DNA CROSS-LINK
REPAIR 1A PROTEIN 		PF07522
(DRMBL)
PF12706
(Lactamase_B_2) 		8 THR A 700
PRO A 702
TYR A 704
GLN A 718
ASP A 736
VAL A1018
GLY A1019
ARG A1024
 CE3 A1103
5O96_A_SAMA501 5o96 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Legionella
pneumophila 		RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE E 		None
PF04452
(Methyltrans_RNA) 		11 GLN B 143
LEU A 173
PRO A 175
GLU A 198
GLY A 200
SER A 218
LEU A 219
VAL A 223
ARG A 225
THR A 226
ALA A 229
 SAM A 501
5O96_B_SAMB501 5o96 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Legionella
pneumophila 		RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE E 		None
PF04452
(Methyltrans_RNA) 		9 ARG A   4
LEU B 173
PRO B 175
ILE B 195
GLY B 196
GLY B 200
LEU B 219
LEU B 224
ALA B 229
 SAM B 501
5O96_C_SAMC501 5o96 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Legionella
pneumophila 		RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE E 		None 7 LEU C 173
GLY C 196
GLY C 200
SER C 218
LEU C 224
THR C 226
ALA C 229
 SAM C 501
5O96_D_SAMD501 5o96 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Legionella
pneumophila 		RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE E 		None 10 ARG C   4
LEU D 173
HIS D 174
ILE D 195
GLY D 196
GLU D 198
GLY D 200
VAL D 223
LEU D 224
ALA D 229
 SAM D 501
5O96_E_SAME501 5o96 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Legionella
pneumophila 		RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE E 		None 9 GLN F 143
LEU E 173
HIS E 174
PRO E 175
GLY E 196
SER E 218
VAL E 223
LEU E 224
ARG E 225
 SAM E 501
5O96_F_SAMF501 5o96 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Legionella
pneumophila 		RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE E 		None 10 GLN E 143
LEU F 173
PRO F 175
GLY F 196
GLU F 198
GLY F 200
VAL F 223
LEU F 224
ARG F 225
ALA F 229
 SAM F 501
5O96_G_SAMG501 5o96 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Legionella
pneumophila 		RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE E 		None 11 LEU G 173
GLY G 196
GLU G 198
GLY G 200
SER G 218
LEU G 219
VAL G 223
ARG G 225
THR G 226
GLU G 227
ALA G 229
 SAM G 501
5O96_H_SAMH501 5o96 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Legionella
pneumophila 		RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE E 		None 10 ARG G   4
LEU H 173
PRO H 175
GLY H 196
GLY H 200
LEU H 219
VAL H 223
LEU H 224
THR H 226
ALA H 229
 SAM H 501
5Q1S_A_AWYA1103 5q1s AWY

DB06594
(Agomelatine) 		Homo sapiens DNA CROSS-LINK
REPAIR 1A PROTEIN 		PF07522
(DRMBL)
PF12706
(Lactamase_B_2) 		6 LYS A 831
VAL A1004
LYS A1008
ILE A1012
LYS A1035
TYR A1040
 AWY A1103
5TWJ_A_SAMA201 5twj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE H 		PF02590
(SPOUT_MTase) 		12 LEU A  72
ILE A  74
ILE A 102
GLY A 103
GLY A 107
SER A 121
LEU A 122
SER A 123
THR A 126
LEU A 127
HIS A 129
VAL A 132
 SAM A 201
5TWJ_B_SAMB201 5twj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE H 		None 10 LEU B  72
ILE B  74
ILE B 102
GLY B 103
GLY B 107
LEU B 122
SER B 123
LEU B 127
HIS B 129
VAL B 132
 SAM B 201
5TWJ_C_SAMC201 5twj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE H 		None 13 LEU C  72
ASP C  73
ILE C  74
ILE C 102
GLY C 103
GLY C 107
LEU C 108
LYS C 113
SER C 121
LEU C 122
SER C 123
LEU C 127
VAL C 132
 SAM C 201
5TWJ_D_SAMD201 5twj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli RIBOSOMAL RNA LARGE
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE H 		None 11 LEU D  72
ASP D  73
ILE D  74
ILE D 102
GLY D 103
GLY D 107
LEU D 122
SER D 123
THR D 126
LEU D 127
VAL D 132
 SAM D 201
5UAC_C_RFPC3001 5uac RFP

DB01045
(Rifampicin) 		Escherichia coli DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE SUBUNIT
BETA 		PF00562
(RNA_pol_Rpb2_6)
PF04560
(RNA_pol_Rpb2_7)
PF04561
(RNA_pol_Rpb2_2)
PF04563
(RNA_pol_Rpb2_1)
PF04565
(RNA_pol_Rpb2_3)
PF10385
(RNA_pol_Rpb2_45) 		12 GLN C 510
GLN C 513
PHE C 514
ASP C 516
HIS C 526
ARG C 529
SER C 531
LEU C 533
ARG C 540
PRO C 564
ILE C 572
ARG C 687
 RFP C3001
5UAH_C_RFPC3001 5uah RFP

DB01045
(Rifampicin) 		Escherichia coli DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE SUBUNIT
BETA 		PF00562
(RNA_pol_Rpb2_6)
PF04560
(RNA_pol_Rpb2_7)
PF04561
(RNA_pol_Rpb2_2)
PF04563
(RNA_pol_Rpb2_1)
PF04565
(RNA_pol_Rpb2_3)
PF10385
(RNA_pol_Rpb2_45) 		13 ARG C 143
GLN C 510
LEU C 511
GLN C 513
PHE C 514
VAL C 516
ARG C 529
SER C 531
LEU C 533
ARG C 540
PRO C 564
ILE C 572
ARG C 687
 RFP C3001
5UAL_C_RFPC3001 5ual RFP

DB01045
(Rifampicin) 		Escherichia coli DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE SUBUNIT
BETA 		PF00562
(RNA_pol_Rpb2_6)
PF04560
(RNA_pol_Rpb2_7)
PF04561
(RNA_pol_Rpb2_2)
PF04563
(RNA_pol_Rpb2_1)
PF04565
(RNA_pol_Rpb2_3)
PF10385
(RNA_pol_Rpb2_45) 		11 GLN C 510
GLN C 513
PHE C 514
ASP C 516
HIS C 526
ARG C 529
LEU C 531
PRO C 564
ILE C 572
ARG C 687
GLN C 761
 RFP C3001
5UH6_C_RFPC1201 5uh6 RFP

DB01045
(Rifampicin) 		Mycobacterium
tuberculosis 		DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE SUBUNIT
BETA;
RNA POLYMERASE SIGMA
FACTOR SIGA 		PF00140
(Sigma70_r1_2)
PF00562
(RNA_pol_Rpb2_6)
PF04539
(Sigma70_r3)
PF04542
(Sigma70_r2)
PF04545
(Sigma70_r4)
PF04560
(RNA_pol_Rpb2_7)
PF04561
(RNA_pol_Rpb2_2)
PF04563
(RNA_pol_Rpb2_1)
PF04565
(RNA_pol_Rpb2_3)
PF10385
(RNA_pol_Rpb2_45) 		17 ARG C 173
ASP F 429
GLN C 435
LEU C 436
GLN C 438
PHE C 439
ASP C 441
HIS C 451
ARG C 454
SER C 456
LEU C 458
ARG C 465
PRO C 489
ASN C 493
ILE C 497
ARG C 613
HIS C 680
 RFP C1201
5UHB_C_RFPC1201 5uhb RFP

DB01045
(Rifampicin) 		Mycobacterium
tuberculosis 		DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE SUBUNIT
BETA 		PF00562
(RNA_pol_Rpb2_6)
PF04560
(RNA_pol_Rpb2_7)
PF04561
(RNA_pol_Rpb2_2)
PF04563
(RNA_pol_Rpb2_1)
PF04565
(RNA_pol_Rpb2_3)
PF10385
(RNA_pol_Rpb2_45) 		15 GLN C 435
LEU C 436
GLN C 438
PHE C 439
ASP C 441
HIS C 451
ARG C 454
SER C 456
LEU C 458
ARG C 465
PRO C 489
ASN C 493
ILE C 497
ARG C 613
HIS C 680
 RFP C1201
5UHC_C_RFPC1201 5uhc RFP

DB01045
(Rifampicin) 		Mycobacterium
tuberculosis 		DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE SUBUNIT
BETA;
RNA POLYMERASE SIGMA
FACTOR SIGA 		PF00140
(Sigma70_r1_2)
PF00562
(RNA_pol_Rpb2_6)
PF04539
(Sigma70_r3)
PF04542
(Sigma70_r2)
PF04545
(Sigma70_r4)
PF04560
(RNA_pol_Rpb2_7)
PF04561
(RNA_pol_Rpb2_2)
PF04563
(RNA_pol_Rpb2_1)
PF04565
(RNA_pol_Rpb2_3)
PF10385
(RNA_pol_Rpb2_45) 		17 ASP F 429
GLU F 430
GLN C 435
LEU C 436
GLN C 438
PHE C 439
ASP C 441
HIS C 451
ARG C 454
SER C 456
LEU C 458
ARG C 465
PRO C 489
ASN C 493
ILE C 497
ARG C 613
HIS C 680
 RFP C1201
5UHD_C_RFPC1201 5uhd RFP

DB01045
(Rifampicin) 		Mycobacterium
tuberculosis 		DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE SUBUNIT
BETA 		PF00562
(RNA_pol_Rpb2_6)
PF04560
(RNA_pol_Rpb2_7)
PF04561
(RNA_pol_Rpb2_2)
PF04563
(RNA_pol_Rpb2_1)
PF04565
(RNA_pol_Rpb2_3)
PF10385
(RNA_pol_Rpb2_45) 		16 ARG C 173
GLN C 435
LEU C 436
GLN C 438
PHE C 439
ASP C 441
HIS C 451
ARG C 454
SER C 456
LEU C 458
ARG C 465
PRO C 489
ASN C 493
ILE C 497
ARG C 613
HIS C 680
 RFP C1201
5UHG_C_RFPC1201 5uhg RFP

DB01045
(Rifampicin) 		Mycobacterium
tuberculosis 		DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE SUBUNIT
BETA 		PF00562
(RNA_pol_Rpb2_6)
PF04560
(RNA_pol_Rpb2_7)
PF04561
(RNA_pol_Rpb2_2)
PF04563
(RNA_pol_Rpb2_1)
PF04565
(RNA_pol_Rpb2_3)
PF10385
(RNA_pol_Rpb2_45) 		16 ARG C 173
GLN C 435
LEU C 436
GLN C 438
PHE C 439
ASP C 441
HIS C 451
ARG C 454
SER C 456
LEU C 458
ARG C 465
PRO C 489
ASN C 493
ILE C 497
ARG C 613
HIS C 680
 RFP C1201
5V0I_A_TRPA402 5v0i TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Escherichia coli TRYPTOPHAN--TRNA
LIGASE 		PF00579
(tRNA-synt_1b) 		9 GLY A   9
GLN A  11
VAL A  42
HIS A  45
MET A 132
ASP A 135
ILE A 136
VAL A 144
GLN A 150
 TRP A 402
5V0I_B_TRPB402 5v0i TRP

DB00150
(L-
Tryptophan) 		Escherichia coli TRYPTOPHAN--TRNA
LIGASE 		None 9 GLY B   9
GLN B  11
VAL B  42
HIS B  45
MET B 132
ASP B 135
ILE B 136
VAL B 144
GLN B 150
 TRP B 402
5VM8_B_SAMB301 5vm8 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Neisseria
gonorrhoeae 		RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE E 		None 10 MET B 169
VAL B 191
GLY B 192
GLY B 196
TRP B 197
LEU B 215
ILE B 219
LEU B 220
THR B 222
ALA B 225
 SAM B 301
5WY0_A_SAMA800 5wy0 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Homo sapiens SMALL RNA
2'-O-METHYLTRANSFERA
SE 		PF13489
(Methyltransf_23) 		13 TYR A   6
GLY A  25
GLY A  27
ASP A  48
ILE A  49
ASN A  50
LYS A  53
SER A  84
VAL A  85
ILE A 101
LEU A 103
HIS A 106
LEU A 107
 SAM A 800
5WYQ_A_SAMA401 5wyq SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Pseudomonas
aeruginosa 		TRNA
(GUANINE-N(1)-)-METH
YLTRANSFERASE 		None
PF01746
(tRNA_m1G_MT) 		17 TYR A  91
LEU A  92
PRO A  94
GLN A  95
GLY A 118
GLY A 122
SER A 137
ILE A 138
VAL A 142
LEU A 143
GLY A 145
GLY A 146
PRO A 149
ASP B 174
SER B 175
ASP B 182
HIS B 185
 SAM A 401
5WYQ_B_SAMB301 5wyq SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Pseudomonas
aeruginosa 		TRNA
(GUANINE-N(1)-)-METH
YLTRANSFERASE 		None
PF01746
(tRNA_m1G_MT) 		14 TYR B  91
LEU B  92
PRO B  94
GLN B  95
GLY B 118
SER B 137
ILE B 138
TYR B 141
LEU B 143
GLY B 145
GLY B 146
PRO B 149
ASP A 182
HIS A 185
 SAM B 301
5X6Y_A_SAMA901 5x6y SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Rice dwarf virus MRNA CAPPING ENZYME
P5 		None 11 VAL A 209
GLY A 210
GLU A 230
LYS A 231
SER A 232
ASP A 471
ALA A 472
SER A 488
LEU A 489
ASN A 491
ASN A 494
 SAM A 901
5X6Y_A_SAMA902 5x6y SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Rice dwarf virus MRNA CAPPING ENZYME
P5 		None 15 LEU A 269
TYR A 285
GLY A 287
PRO A 290
ALA A 291
HIS A 293
ASP A 308
PRO A 309
LYS A 310
GLU A 333
PHE A 334
ASP A 359
THR A 360
VAL A 362
PHE A 369
 SAM A 902
5X6Y_B_SAMB901 5x6y SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Rice dwarf virus MRNA CAPPING ENZYME
P5 		None 10 VAL B 209
GLY B 210
GLU B 230
LYS B 231
ASP B 471
ALA B 472
SER B 488
LEU B 489
ASN B 491
ASN B 494
 SAM B 901
5X6Y_C_SAMC901 5x6y SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Rice dwarf virus MRNA CAPPING ENZYME
P5 		None 11 VAL C 209
GLY C 210
GLU C 230
LYS C 231
SER C 232
ASP C 471
ALA C 472
SER C 488
LEU C 489
ASN C 491
ASN C 494
 SAM C 901
5X6Y_C_SAMC902 5x6y SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Rice dwarf virus MRNA CAPPING ENZYME
P5 		None 13 LEU C 269
TYR C 285
GLY C 287
PRO C 290
ALA C 291
HIS C 293
ASP C 308
PRO C 309
LYS C 310
GLU C 333
PHE C 334
ASP C 359
THR C 360
 SAM C 902
5XIO_A_HFGA801 5xio HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Cryptosporidium
parvum 		PROLINE-TRNA
SYNTHETASE CLASS II
AARS (YBAK RNA
BINDING DOMAIN PLUS
TRNA SYNTHETASE) 		PF00587
(ProRS-C_1)
PF03129
(tRNA-synt_2b)
PF09180
(HGTP_anticodon) 		15 PHE A 307
GLU A 310
VAL A 311
PRO A 330
THR A 331
GLU A 333
ARG A 362
TRP A 379
GLU A 381
HIS A 383
PHE A 426
THR A 450
HIS A 452
SER A 480
GLY A 482
 HFG A 801
5XIO_B_HFGB802 5xio HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Cryptosporidium
parvum 		PROLINE-TRNA
SYNTHETASE CLASS II
AARS (YBAK RNA
BINDING DOMAIN PLUS
TRNA SYNTHETASE) 		None 13 PHE B 307
GLU B 310
VAL B 311
PRO B 330
THR B 331
GLU B 333
ARG B 362
TRP B 379
GLU B 381
HIS B 383
PHE B 426
THR B 450
HIS B 452
 HFG B 802
5XIP_A_HFGA1003 5xip HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Eimeria tenella PROLYL-TRNA
SYNTHETASE, PUTATIVE 		PF00587
(ProRS-C_1)
PF03129
(tRNA-synt_2b)
PF09180
(HGTP_anticodon) 		15 LEU A 325
PHE A 335
GLU A 338
VAL A 339
PRO A 358
THR A 359
GLU A 361
ARG A 390
TRP A 407
HIS A 411
PHE A 454
THR A 478
HIS A 480
SER A 508
GLY A 510
 HFG A1003
5XIP_B_HFGB1003 5xip HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Eimeria tenella PROLYL-TRNA
SYNTHETASE, PUTATIVE 		None 12 PHE B 335
GLU B 338
VAL B 339
PRO B 358
THR B 359
GLU B 361
ARG B 390
TRP B 407
HIS B 411
PHE B 454
THR B 478
HIS B 480
 HFG B1003
5XIP_C_HFGC1003 5xip HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Eimeria tenella PROLYL-TRNA
SYNTHETASE, PUTATIVE 		None 14 LEU C 325
GLU C 338
VAL C 339
PRO C 358
THR C 359
GLU C 361
ARG C 390
TRP C 407
GLU C 409
HIS C 411
PHE C 454
THR C 478
HIS C 480
GLY C 510
 HFG C1003
5XIP_D_HFGD1003 5xip HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Eimeria tenella PROLYL-TRNA
SYNTHETASE, PUTATIVE 		None 13 LEU D 325
GLU D 338
VAL D 339
PRO D 358
THR D 359
GLU D 361
ARG D 390
TRP D 407
GLU D 409
PHE D 454
THR D 478
HIS D 480
TRP D 509
 HFG D1003
5XIQ_A_HFGA1002 5xiq HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Toxoplasma gondii PROLYL-TRNA
SYNTHETASE (PRORS) 		PF00587
(HGTP_anticodon)
PF03129
(ProRS-C_1)
PF09180
(tRNA-synt_2b) 		16 LEU A 405
PHE A 415
GLU A 418
VAL A 419
PRO A 438
THR A 439
GLU A 441
ARG A 470
TRP A 487
GLU A 489
HIS A 491
PHE A 534
THR A 558
HIS A 560
SER A 588
GLY A 590
 HFG A1002
5XIQ_B_HFGB1002 5xiq HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Toxoplasma gondii PROLYL-TRNA
SYNTHETASE (PRORS) 		None 15 LEU B 405
PHE B 415
GLU B 418
VAL B 419
PRO B 438
THR B 439
GLU B 441
ARG B 470
TRP B 487
GLU B 489
HIS B 491
PHE B 534
THR B 558
HIS B 560
SER B 588
 HFG B1002
5XIQ_C_HFGC1002 5xiq HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Toxoplasma gondii PROLYL-TRNA
SYNTHETASE (PRORS) 		None 14 PHE C 415
GLU C 418
VAL C 419
PRO C 438
THR C 439
GLU C 441
ARG C 470
TRP C 487
GLU C 489
HIS C 491
PHE C 534
THR C 558
HIS C 560
SER C 588
 HFG C1002
5XIQ_D_HFGD1002 5xiq HFG

DB04866
(Halofuginone) 		Toxoplasma gondii PROLYL-TRNA
SYNTHETASE (PRORS) 		None 15 LEU D 405
PHE D 415
GLU D 418
VAL D 419
PRO D 438
THR D 439
GLU D 441
ARG D 470
TRP D 487
GLU D 489
HIS D 491
PHE D 534
THR D 558
HIS D 560
GLY D 590
 HFG D1002
5Y9A_A_AR3A201 5y9a AR3

DB00987
(Cytarabine) 		Acinetobacter
baumannii 		PEPTIDYL-TRNA
HYDROLASE 		PF01195
(Pept_tRNA_hydro) 		6 ALA A  18
GLN A  19
TRP A  27
LYS A 152
GLN A 158
ASP A 162
 AR3 A 201
5ZHM_B_SAMB301 5zhm SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Pseudomonas
aeruginosa 		TRNA
(GUANINE-N(1)-)-METH
YLTRANSFERASE 		None
PF01746
(tRNA_m1G_MT) 		18 TYR B  91
LEU B  92
PRO B  94
GLN B  95
GLY B 118
GLU B 121
GLY B 122
SER B 137
ILE B 138
VAL B 142
LEU B 143
GLY B 145
GLY B 146
PRO B 149
ARG A 159
SER A 175
ASP A 182
HIS A 185
 SAM B 301
6AZ3_1_PAR11801 6az3 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Leishmania
donovani 		RIBOSOMAL PROTEIN
EL18;
RRNA ALPHA 		no annotation 4 ARG P  66
ARG P 149
GLY P 152
ARG P 157
 PAR 11801
6AZ3_1_PAR11802 6az3 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Leishmania
donovani 		RIBOSOMAL PROTEIN
EL15;
RIBOSOMAL PROTEIN
UL15;
RIBOSOMAL PROTEIN
UL4;
RRNA ALPHA 		no annotation 3 LYS L   6
ARG C 109
ARG M 204
 PAR 11802
6AZ3_1_PAR11803 6az3 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Leishmania
donovani 		RIBOSOMAL PROTEIN
EL18;
RRNA ALPHA 		no annotation 3 SER P   9
LYS P  10
SER P  12
 PAR 11803
6BNI_A_ADNA602 6bni ADN

DB00640
(Adenosine) 		Cryptosporidium
parvum 		LYSINE--TRNA LIGASE no annotation 10 ASN A 293
ARG A 295
GLU A 297
HIS A 303
PHE A 307
ALA A 309
GLU A 464
GLY A 520
ARG A 523
ILE A 534
 ADN A 602
6BNI_B_ADNB602 6bni ADN

DB00640
(Adenosine) 		Cryptosporidium
parvum 		LYSINE--TRNA LIGASE no annotation 10 ASN B 293
ARG B 295
GLU B 297
HIS B 303
PHE B 307
ALA B 309
GLU B 464
GLY B 520
ARG B 523
ILE B 534
 ADN B 602
6BZO_C_FI8C1201 6bzo FI8

DB08874
(Fidaxomicin) 		Mycobacterium
tuberculosis 		DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE SUBUNIT
BETA;
DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE SUBUNIT
BETA';
RNA POLYMERASE SIGMA
FACTOR SIGA;
RNA
POLYMERASE-BINDING
PROTEIN RBPA 		PF00140
(Sigma70_r1_2)
PF04539
(Sigma70_r3)
PF04542
(Sigma70_r2)
PF04545
(Sigma70_r4)
PF00562
(RNA_pol_Rpb2_7)
PF04560
(RNA_pol_Rpb2_3)
PF04561
(RNA_pol_Rpb2_45)
PF04565
(RNA_pol_Rpb2_6)
PF10385
(RNA_pol_Rpb2_2)
PF00623
(RNA_pol_Rpb1_3)
PF04983
(RNA_pol_Rpb1_5)
PF04997
(RNA_pol_Rpb1_4)
PF04998
(RNA_pol_Rpb1_2)
PF05000
(RNA_pol_Rpb1_1)
PF13397
(RbpA) 		28 ARG J  10
VAL J  14
ARG D  84
LYS D  86
ARG D  89
GLU D 323
LEU D 324
PRO D 326
SER D 338
ARG D 412
GLN D 415
LEU F 423
ASP F 424
GLN F 434
VAL F 445
MET C1051
ILE C1052
THR C1053
GLN C1054
ASP C1094
THR C1096
VAL C1097
VAL C1100
LYS C1101
GLU C1119
SER C1120
VAL C1123
GLU C1127
 FI8 C1201
6C06_D_FI8D1404 6c06 FI8

DB08874
(Fidaxomicin) 		Mycobacterium
tuberculosis 		DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE SUBUNIT
BETA;
DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE SUBUNIT
BETA';
RNA POLYMERASE SIGMA
FACTOR SIGA;
RNA
POLYMERASE-BINDING
PROTEIN RBPA 		PF00140
(Sigma70_r1_2)
PF04539
(Sigma70_r3)
PF04542
(Sigma70_r2)
PF04545
(Sigma70_r4)
PF00562
(RNA_pol_Rpb2_7)
PF04560
(RNA_pol_Rpb2_3)
PF04561
(RNA_pol_Rpb2_45)
PF04565
(RNA_pol_Rpb2_6)
PF10385
(RNA_pol_Rpb2_2)
PF00623
(RNA_pol_Rpb1_3)
PF04983
(RNA_pol_Rpb1_2)
PF04997
(RNA_pol_Rpb1_4)
PF04998
(RNA_pol_Rpb1_5)
PF05000
(RNA_pol_Rpb1_1)
PF13397
(RbpA) 		13 ARG J  10
ARG D  84
LYS D  86
ARG D 412
GLN F 434
ILE C1052
THR C1053
GLN C1054
THR C1096
ARG C1099
LYS C1101
GLU C1119
SER C1120
 FI8 D1404
6EMU_A_SAMA501 6emu SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermococcus
kodakarensis 		TRNA
(GUANINE(9)-/ADENINE
(9)-N1)-METHYLTRANSF
ERASE 		PF04252
(RNA_Me_trans) 		13 LEU A 181
PRO A 183
TRP A 184
ILE A 201
GLY A 202
ILE A 204
ASP A 206
THR A 214
THR A 215
ILE A 234
VAL A 243
ASP A 245
ILE A 250
 SAM A 501
6EMU_B_SAMB301 6emu SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermococcus
kodakarensis 		TRNA
(GUANINE(9)-/ADENINE
(9)-N1)-METHYLTRANSF
ERASE 		None 13 LEU B 181
PRO B 183
TRP B 184
ILE B 201
GLY B 202
ILE B 204
THR B 214
THR B 215
ILE B 234
VAL B 240
VAL B 243
ASP B 245
ILE B 250
 SAM B 301
6EMU_C_SAMC301 6emu SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermococcus
kodakarensis 		TRNA
(GUANINE(9)-/ADENINE
(9)-N1)-METHYLTRANSF
ERASE 		None 14 LEU C 181
PRO C 183
TRP C 184
ILE C 201
GLY C 202
ILE C 204
ASP C 206
THR C 214
THR C 215
ILE C 234
VAL C 240
VAL C 243
ASP C 245
ILE C 250
 SAM C 301
6FBV_D_FI8D1904 6fbv FI8

DB08874
(Fidaxomicin) 		Mycobacterium
tuberculosis 		DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE SUBUNIT
BETA;
DNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE SUBUNIT
BETA';
RNA POLYMERASE SIGMA
FACTOR SIGA 		PF00140
(Sigma70_r1_2)
PF00562
(RNA_pol_Rpb2_45)
PF04560
(RNA_pol_Rpb2_7)
PF04561
(RNA_pol_Rpb2_2)
PF04565
(RNA_pol_Rpb2_3)
PF10385
(RNA_pol_Rpb2_6)
PF00623
(RNA_pol_Rpb1_2)
PF04983
(RNA_pol_Rpb1_3)
PF04997
(RNA_pol_Rpb1_5)
PF04998
(RNA_pol_Rpb1_4)
PF05000
(RNA_pol_Rpb1_1) 		18 ASP D  57
ARG D  84
LYS D  86
ARG D  89
GLU D 323
VAL D 328
ARG D 412
GLN D 415
LEU F 423
ASP F 424
MET C1051
ILE C1052
GLN C1054
THR C1096
VAL C1097
LYS C1101
GLU C1119
SER C1120
 FI8 D1904
6HAU_B_ACTB502 6hau ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Saimiriine
gammaherpesvirus
2 		MRNA EXPORT FACTOR
ICP27 HOMOLOG 		None
PF05459
(Herpes_UL69) 		4 LEU A 156
TYR B 341
ARG B 370
ASP B 373
 ACT B 502
6IFT_A_SAMA301 6ift SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Bacillus subtilis RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE A 		PF00398
(RrnaAD) 		17 GLN A  28
PHE A  30
LEU A  31
GLU A  54
ILE A  55
GLY A  56
GLY A  58
ALA A  61
GLU A  77
ILE A  78
ASP A  79
LEU A  82
ASP A 102
VAL A 103
ASN A 127
PRO A 129
TYR A 131
 SAM A 301