DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'LYASE'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1F9G_A_ASCA950 1f9g ASC

DB00126
(Vitamin
C)
Streptococcus
pneumoniae
HYALURONATE LYASE PF02278
(Lyase_8)
PF02884
(Lyase_8_C)
PF08124
(Lyase_8_N)
7 ARG A 243
ASN A 290
TRP A 292
TYR A 408
ARG A 462
ARG A 466
ASN A 580
ASC A 950
1GXS_A_BEZA601 1gxs BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid)
Sorghum bicolor P-(S)-HYDROXYMANDELO
NITRILE LYASE CHAIN
A;
P-(S)-HYDROXYMANDELO
NITRILE LYASE CHAIN
B
PF00450
(Peptidase_S10)
7 GLY A  62
PRO A  64
ASP A 126
SER A 158
HIS A 160
TRP B 330
ALA B 333
BEZ A 601
1GXS_C_BEZC602 1gxs BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid)
Sorghum bicolor P-(S)-HYDROXYMANDELO
NITRILE LYASE CHAIN
A;
P-(S)-HYDROXYMANDELO
NITRILE LYASE CHAIN
B
None 9 GLY C  62
PRO C  64
ASP C 126
SER C 158
HIS C 160
MET C 228
TRP C 270
TRP D 330
ALA D 333
BEZ C 602
2X2I_A_QPSA1050 2x2i QPS

DB00284
(Acarbose)
Gracilariopsis
lemaneiformis
ALPHA-1,4-GLUCAN
LYASE ISOZYME 1
PF01055
(Glyco_hydro_31)
18 ASP A 239
LEU A 241
GLN A 245
PHE A 373
ASP A 412
VAL A 413
ASN A 459
TYR A 513
TRP A 551
ASP A 553
MET A 554
ARG A 649
TRP A 662
ASP A 665
PHE A 698
THR A 699
HIS A 731
HIS A 741
QPS A1050
2X2I_A_QPSA1060 2x2i QPS

DB00284
(Acarbose)
Gracilariopsis
lemaneiformis
ALPHA-1,4-GLUCAN
LYASE ISOZYME 1
PF01055
(Glyco_hydro_31)
12 THR A  24
VAL A  28
PHE A  33
SER A  34
SER A  37
THR A  39
ASN A  40
TRP A  41
VAL A 185
GLY A 190
ALA A 192
GLN A 318
QPS A1060
2X2I_B_QPSB1050 2x2i QPS

DB00284
(Acarbose)
Gracilariopsis
lemaneiformis
ALPHA-1,4-GLUCAN
LYASE ISOZYME 1
no annotation 18 ASP B 239
LEU B 241
GLN B 245
PHE B 373
ASP B 412
VAL B 413
ASN B 459
TYR B 513
TRP B 551
ASP B 553
MET B 554
ARG B 649
TRP B 662
ASP B 665
PHE B 698
THR B 699
HIS B 731
HIS B 741
QPS B1050
2X2I_B_QPSB1060 2x2i QPS

DB00284
(Acarbose)
Gracilariopsis
lemaneiformis
ALPHA-1,4-GLUCAN
LYASE ISOZYME 1
no annotation 10 THR B  24
VAL B  28
PHE B  33
SER B  34
SER B  37
ASN B  40
TRP B  41
GLY B 190
ALA B 192
GLN B 318
QPS B1060
2X2I_C_QPSC1050 2x2i QPS

DB00284
(Acarbose)
Gracilariopsis
lemaneiformis
ALPHA-1,4-GLUCAN
LYASE ISOZYME 1
no annotation 17 ASP C 239
LEU C 241
GLN C 245
PHE C 373
ASP C 412
VAL C 413
ASN C 459
TYR C 513
TRP C 551
ASP C 553
MET C 554
ARG C 649
TRP C 662
ASP C 665
PHE C 698
HIS C 731
HIS C 741
QPS C1050
2X2I_C_QPSC1060 2x2i QPS

DB00284
(Acarbose)
Gracilariopsis
lemaneiformis
ALPHA-1,4-GLUCAN
LYASE ISOZYME 1
no annotation 12 THR C  24
VAL C  28
PHE C  33
SER C  34
SER C  37
THR C  39
ASN C  40
TRP C  41
VAL C 185
GLY C 190
ALA C 192
GLN C 318
QPS C1060
2X2I_D_QPSD1050 2x2i QPS

DB00284
(Acarbose)
Gracilariopsis
lemaneiformis
ALPHA-1,4-GLUCAN
LYASE ISOZYME 1
no annotation 17 ASP D 239
LEU D 241
GLN D 245
PHE D 373
ASP D 412
VAL D 413
ASN D 459
TYR D 513
TRP D 551
ASP D 553
MET D 554
ARG D 649
TRP D 662
ASP D 665
PHE D 698
HIS D 731
HIS D 741
QPS D1050
2X2I_D_QPSD1060 2x2i QPS

DB00284
(Acarbose)
Gracilariopsis
lemaneiformis
ALPHA-1,4-GLUCAN
LYASE ISOZYME 1
no annotation 10 THR D  24
VAL D  28
PHE D  33
SER D  34
SER D  37
ASN D  40
TRP D  41
VAL D 185
GLY D 190
GLN D 318
QPS D1060
2XRZ_A_ACTA1467 2xrz ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Methanosarcina
mazei
DEOXYRIBODIPYRIMIDIN
E PHOTOLYASE
None
PF00875
(DNA_photolyase)
5 ARG A 121
ASP A 320
GLU B 390
LYS B 394
ILE A 400
ACT A1467
2XRZ_A_ACTA1468 2xrz ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Methanosarcina
mazei
DEOXYRIBODIPYRIMIDIN
E PHOTOLYASE
PF00875
(DNA_photolyase)
5 LYS A 383
LYS A 384
GLU A 387
THR A 437
TYR A 442
ACT A1468
2XRZ_A_ACTA1469 2xrz ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Methanosarcina
mazei
DEOXYRIBODIPYRIMIDIN
E PHOTOLYASE
PF00875
(DNA_photolyase)
4 GLN A  77
GLU A  80
LEU A 200
SER A 201
ACT A1469
2XRZ_A_ACTA1470 2xrz ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Methanosarcina
mazei
DEOXYRIBODIPYRIMIDIN
E PHOTOLYASE
PF00875
(DNA_photolyase)
5 ARG A 256
ALA A 297
ASP A 300
GLU A 301
TRP A 305
ACT A1470
2XRZ_B_ACTB1463 2xrz ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Methanosarcina
mazei
DEOXYRIBODIPYRIMIDIN
E PHOTOLYASE
None 7 GLN B  16
VAL B  21
ILE B  43
ALA B  47
VAL B  49
GLY B 111
THR B 112
ACT B1463
2XRZ_B_ACTB1464 2xrz ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Methanosarcina
mazei
DEOXYRIBODIPYRIMIDIN
E PHOTOLYASE
None 4 LYS B 383
GLU B 387
THR B 437
TYR B 442
ACT B1464
2Z2P_A_DOLA2002 2z2p DOL

DB01764
(Dalfopristin)
Staphylococcus
aureus
VIRGINIAMYCIN B
LYASE
no annotation 5 LYS A  34
TRP A 243
SER A 266
GLU A 268
CYS A 285
DOL A2002
2Z2P_B_DOLB2003 2z2p DOL

DB01764
(Dalfopristin)
Staphylococcus
aureus
VIRGINIAMYCIN B
LYASE
no annotation 10 LYS B  34
PRO A 108
ASN A 109
ASN A 152
THR A 168
GLU A 169
TRP B 243
GLY B 244
SER B 266
GLU B 268
DOL B2003
3CB8_A_SAMA501 3cb8 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
;
Escherichia coli
PYRUVATE
FORMATE-LYASE
1-ACTIVATING ENZYME;
PEPTIDE SUBSTRATE
VSGYAV
None
PF04055
(Radical_SAM)
15 TYR A  35
HIS A  37
ASN A  38
SER A  76
GLU A  79
ASP A 104
ASN A 106
ASP A 129
LYS A 131
ARG A 166
VAL A 168
LEU A 199
TYR A 201
HIS A 202
GLY B 734
SAM A 501
3RUK_A_AERA601 3ruk AER

DB05812
(Abiraterone)
Homo sapiens STEROID
17-ALPHA-HYDROXYLASE
/17,20 LYASE
PF00067
(p450)
12 ALA A 113
PHE A 114
TYR A 201
ASN A 202
ILE A 205
LEU A 209
ASP A 298
ALA A 302
THR A 306
VAL A 366
CYS A 442
VAL A 482
AER A 601
3RUK_B_AERB601 3ruk AER

DB05812
(Abiraterone)
Homo sapiens STEROID
17-ALPHA-HYDROXYLASE
/17,20 LYASE
no annotation 13 ALA B 113
PHE B 114
TYR B 201
ASN B 202
ILE B 205
ILE B 206
LEU B 209
ASP B 298
GLY B 301
ALA B 302
THR B 306
VAL B 482
VAL B 483
AER B 601
3RUK_C_AERC601 3ruk AER

DB05812
(Abiraterone)
Homo sapiens STEROID
17-ALPHA-HYDROXYLASE
/17,20 LYASE
no annotation 9 ALA C 113
PHE C 114
TYR C 201
ASN C 202
ILE C 205
ARG C 239
ASP C 298
GLU C 305
THR C 306
AER C 601
3RUK_D_AERD601 3ruk AER

DB05812
(Abiraterone)
Homo sapiens STEROID
17-ALPHA-HYDROXYLASE
/17,20 LYASE
no annotation 11 ALA D 113
PHE D 114
TYR D 201
ASN D 202
ILE D 205
ARG D 239
ASP D 298
GLY D 301
ALA D 302
THR D 306
VAL D 366
AER D 601
4BWL_C_MN9C1297 4bwl MN9

DB00141
(N-
Acetyl-
D-
glucosamine)
Escherichia coli N-ACETYLNEURAMINATE
LYASE
PF00701
(DHDPS)
10 ILE C 139
LEU C 142
THR C 167
GLY C 189
TYR C 190
ASP C 191
GLU C 192
GLY C 207
SER C 208
PHE C 252
MN9 C1297
4KYK_B_IMNB300 4kyk IMN

DB00328
(Indomethacin)
Mus musculus LACTOYLGLUTATHIONE
LYASE
PF00903
(Glyoxalase)
no annotation
12 PHE A  63
ALA A  65
MET A  66
PHE A  68
LEU A  70
PHE A  93
LYS B 151
GLY B 156
LYS B 157
MET B 158
LEU B 161
PHE B 163
IMN B 300
4NKV_A_AERA601 4nkv AER

DB05812
(Abiraterone)
Homo sapiens STEROID
17-ALPHA-HYDROXYLASE
/17,20 LYASE
PF00067
(p450)
17 LEU A 105
ALA A 113
PHE A 114
TYR A 201
ASN A 202
ILE A 205
ILE A 206
LEU A 209
ARG A 239
ASP A 298
GLY A 301
ALA A 302
GLU A 305
THR A 306
VAL A 366
VAL A 482
VAL A 483
AER A 601
4NKV_B_AERB601 4nkv AER

DB05812
(Abiraterone)
Homo sapiens STEROID
17-ALPHA-HYDROXYLASE
/17,20 LYASE
no annotation 17 LEU B 105
ALA B 113
PHE B 114
TYR B 201
ASN B 202
ILE B 205
ILE B 206
LEU B 209
ARG B 239
ASP B 298
GLY B 301
ALA B 302
GLU B 305
THR B 306
VAL B 366
VAL B 482
VAL B 483
AER B 601
4NKV_C_AERC601 4nkv AER

DB05812
(Abiraterone)
Homo sapiens STEROID
17-ALPHA-HYDROXYLASE
/17,20 LYASE
no annotation 18 LEU C 105
ALA C 113
PHE C 114
TYR C 201
ASN C 202
ILE C 205
ILE C 206
LEU C 209
ARG C 239
ASP C 298
GLY C 301
ALA C 302
GLU C 305
THR C 306
VAL C 366
ALA C 367
VAL C 482
VAL C 483
AER C 601
4NKV_D_AERD601 4nkv AER

DB05812
(Abiraterone)
Homo sapiens STEROID
17-ALPHA-HYDROXYLASE
/17,20 LYASE
no annotation 17 LEU D 105
ALA D 113
PHE D 114
TYR D 201
ASN D 202
ILE D 205
ILE D 206
ARG D 239
GLY D 297
ASP D 298
GLY D 301
ALA D 302
GLU D 305
THR D 306
VAL D 366
VAL D 482
VAL D 483
AER D 601
4NKX_A_STRA601 4nkx STR

DB00396
(Progesterone)
Homo sapiens STEROID
17-ALPHA-HYDROXYLASE
/17,20 LYASE
PF00067
(p450)
18 LEU A 105
ALA A 113
PHE A 114
ASN A 202
ILE A 205
ILE A 206
LEU A 209
ARG A 239
ASP A 298
GLY A 301
ALA A 302
GLU A 305
THR A 306
VAL A 366
ALA A 367
ILE A 371
VAL A 482
VAL A 483
STR A 601
4NKX_B_STRB601 4nkx STR

DB00396
(Progesterone)
Homo sapiens STEROID
17-ALPHA-HYDROXYLASE
/17,20 LYASE
no annotation 17 LEU B 105
ALA B 113
PHE B 114
ASN B 202
ILE B 205
ILE B 206
LEU B 209
ASP B 298
GLY B 301
ALA B 302
GLU B 305
THR B 306
VAL B 366
ALA B 367
ILE B 371
VAL B 482
VAL B 483
STR B 601
4NKX_C_STRC601 4nkx STR

DB00396
(Progesterone)
Homo sapiens STEROID
17-ALPHA-HYDROXYLASE
/17,20 LYASE
no annotation 17 LEU C 105
ALA C 113
PHE C 114
ASN C 202
ILE C 205
ILE C 206
ARG C 239
ASP C 298
GLY C 301
ALA C 302
GLU C 305
THR C 306
VAL C 366
ALA C 367
ILE C 371
VAL C 482
VAL C 483
STR C 601
4NKX_D_STRD601 4nkx STR

DB00396
(Progesterone)
Homo sapiens STEROID
17-ALPHA-HYDROXYLASE
/17,20 LYASE
no annotation 17 LEU D 105
ALA D 113
PHE D 114
ASN D 202
ILE D 205
ILE D 206
ARG D 239
ASP D 298
GLY D 301
ALA D 302
GLU D 305
THR D 306
VAL D 366
ALA D 367
ILE D 371
VAL D 482
VAL D 483
STR D 601
4WOZ_B_MN9B401 4woz MN9

DB00141
(N-
Acetyl-
D-
glucosamine)
Clostridioides
difficile
N-ACETYLNEURAMINATE
LYASE
None
PF00701
(DHDPS)
6 SER B 158
LEU B 159
ASP B 160
TYR B 182
LEU B 183
THR A 254
MN9 B 401
4WOZ_F_MN9F401 4woz MN9

DB00141
(N-
Acetyl-
D-
glucosamine)
Clostridioides
difficile
N-ACETYLNEURAMINATE
LYASE
None 5 LEU F 159
ASP F 160
TYR F 182
LEU F 183
THR H 254
MN9 F 401
5E4D_A_BEZA201 5e4d BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid)
Davallia
tyermannii
HYDROXYNITRILE LYASE None 9 VAL A  48
VAL A  52
PHE A  71
TYR A 101
ILE A 108
PHE A 111
TYR A 117
TRP A 138
LEU A 160
BEZ A 201
5E4D_B_BEZB201 5e4d BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid)
Davallia
tyermannii
HYDROXYNITRILE LYASE None 11 VAL B  48
VAL B  51
VAL B  52
PHE B  71
TYR B 101
ILE B 103
ILE B 108
PHE B 111
TYR B 117
TRP B 138
LEU B 160
BEZ B 201
5E4D_B_BEZB202 5e4d BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid)
Davallia
tyermannii
HYDROXYNITRILE LYASE None 7 ARG B  14
LEU B  17
MET B 100
VAL A 118
VAL B 118
THR B 141
THR A 141
BEZ B 202
5E4D_B_BEZB203 5e4d BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid)
Davallia
tyermannii
HYDROXYNITRILE LYASE None 4 VAL B  51
ALA B  76
ILE B 108
THR B 109
BEZ B 203
5W4Z_A_RBFA502 5w4z RBF

DB00140
(Riboflavin)
Herbiconiux RIBOFLAVIN LYASE no annotation 17 PHE A  14
ASN A  16
GLN A  18
ASP A  21
SER A  22
ALA A  61
ALA A  63
GLY A 142
PHE A 248
GLY A 250
ALA A 283
PHE A 318
SER A 340
GLN A 343
VAL A 364
ARG A 365
THR A 395
RBF A 502
5W4Z_B_RBFB502 5w4z RBF

DB00140
(Riboflavin)
Herbiconiux RIBOFLAVIN LYASE no annotation 16 PHE B  14
ASN B  16
GLN B  18
ASP B  21
SER B  22
ALA B  61
ALA B  63
GLY B 142
GLY B 250
ALA B 283
PHE B 318
SER B 340
GLN B 343
VAL B 364
THR B 366
THR B 395
RBF B 502