DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'L PROTEIN'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1FJG_A_SRYA1634 1fjg SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RIBOSOMAL RNA;
30S RIBOSOMAL
PROTEIN S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		4 LYS L  46
LYS L  47
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1634
1GYX_A_BEZA1077 1gyx BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Escherichia coli HYPOTHETICAL PROTEIN
YDCE 		None
PF01361
(Tautomerase) 		7 PRO B   1
CYS A   7
PHE A   8
ARG A  10
SER B  38
TRP A  51
TYR A  72
 BEZ A1077
1I9G_A_SAMA301 1i9g SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Mycobacterium
tuberculosis 		HYPOTHETICAL PROTEIN
RV2118C 		PF08704
(GCD14_N)
PF14801
(GCD14) 		15 ILE A  83
GLY A 107
GLY A 109
SER A 110
ALA A 112
LEU A 113
GLU A 131
GLN A 132
ARG A 133
HIS A 136
ASP A 161
LEU A 162
ASP A 178
MET A 179
VAL A 185
 SAM A 301
1NB9_A_RBFA401 1nb9 RBF

DB00140
(Riboflavin) 		Homo sapiens HYPOTHETICAL PROTEIN
FLJ11149 		PF01687
(Flavokinase) 		9 THR A  34
ILE A  53
VAL A  69
SER A  71
GLU A  86
ARG A 111
LEU A 122
ILE A 126
ASP A 129
 RBF A 401
1VE3_A_SAMA302 1ve3 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Pyrococcus
horikoshii 		HYPOTHETICAL PROTEIN
PH0226 		PF13649
(Methyltransf_25) 		16 TYR A   7
TYR A  13
TYR A  21
ARG A  24
ALA A  46
GLY A  48
ASP A  67
ILE A  68
SER A  69
ASP A  93
ALA A  94
ARG A  95
ILE A 110
SER A 112
HIS A 115
PHE A 116
 SAM A 302
1VE3_B_SAMB301 1ve3 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Pyrococcus
horikoshii 		HYPOTHETICAL PROTEIN
PH0226 		None 16 TYR B   7
TYR B  13
TYR B  21
ARG B  24
ALA B  46
GLY B  48
ASP B  67
ILE B  68
SER B  69
ASP B  93
ALA B  94
ARG B  95
ILE B 110
SER B 112
HIS B 115
PHE B 116
 SAM B 301
1WU8_A_ADNA500 1wu8 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Pyrococcus
horikoshii 		HYPOTHETICAL PROTEIN
PH0463 		PF01887
(SAM_adeno_trans)
no annotation 		9 ASP A   7
ARG A  40
HIS A  41
ASP A  68
VAL A  71
PHE B 181
ASN B 183
TYR B 212
ASN B 235
 ADN A 500
1WU8_B_ADNB501 1wu8 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Pyrococcus
horikoshii 		HYPOTHETICAL PROTEIN
PH0463 		no annotation 11 ASP B   7
ARG B  40
HIS B  41
ILE B  67
ASP B  68
PRO B  69
VAL B  71
PHE C 181
ASN C 183
TYR C 212
ASN C 235
 ADN B 501
1WU8_C_ADNC502 1wu8 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Pyrococcus
horikoshii 		HYPOTHETICAL PROTEIN
PH0463 		PF01887
(SAM_adeno_trans)
no annotation 		7 ARG C  40
HIS C  41
VAL C  71
PHE A 181
ASN A 183
TYR A 212
ASN A 235
 ADN C 502
2A15_A_NCAA1001 2a15 NCA

DB02701
(Nicotinamide) 		Mycobacterium
tuberculosis 		HYPOTHETICAL PROTEIN
RV0760C 		PF02136
(NTF2) 		11 SER A  16
TRP A  17
VAL A  20
TRP A  28
ASP A  40
ILE A  68
LEU A  73
LEU A  93
LEU A  95
TYR A 113
MET A 124
 NCA A1001
2B25_A_SAMA601 2b25 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Homo sapiens HYPOTHETICAL PROTEIN PF08704
(GCD14) 		14 THR A  84
THR A  87
GLY A 111
GLY A 113
GLY A 116
MET A 117
GLU A 135
VAL A 136
ARG A 137
HIS A 140
ASP A 173
ILE A 174
ASP A 192
MET A 193
 SAM A 601
2B25_B_SAMB602 2b25 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Homo sapiens HYPOTHETICAL PROTEIN None 15 THR B  84
THR B  87
GLY B 111
GLY B 113
SER B 114
GLY B 116
MET B 117
GLU B 135
VAL B 136
ARG B 137
HIS B 140
ASP B 173
ILE B 174
ASP B 192
MET B 193
 SAM B 602
2DTT_A_H4BA1003 2dtt H4B

DB00360
(Sapropterin) 		Pyrococcus
horikoshii 		HYPOTHETICAL PROTEIN
PH0634 		PF01242
(PTPS)
no annotation 		10 HIS A  15
HIS A  27
HIS A  29
TYR C  45
ASP C  48
PHE C  49
THR A  76
THR A  77
GLU A  78
GLU A 105
 H4B A1003
2DTT_B_H4BB1001 2dtt H4B

DB00360
(Sapropterin) 		Pyrococcus
horikoshii 		HYPOTHETICAL PROTEIN
PH0634 		PF01242
(PTPS)
no annotation 		10 ILE A   5
GLU B  24
HIS B  27
TYR A  45
ASP A  48
PHE A  49
THR B  76
THR B  77
GLU B  78
GLU B 105
 H4B B1001
2DTT_C_H4BC1002 2dtt H4B

DB00360
(Sapropterin) 		Pyrococcus
horikoshii 		HYPOTHETICAL PROTEIN
PH0634 		no annotation 6 TYR B  45
ASP B  48
PHE B  49
THR C  77
GLU C  78
GLU C 105
 H4B C1002
2DTT_D_H4BD1006 2dtt H4B

DB00360
(Sapropterin) 		Pyrococcus
horikoshii 		HYPOTHETICAL PROTEIN
PH0634 		no annotation 10 HIS D  15
HIS D  27
HIS D  29
TYR F  45
ASP F  48
PHE F  49
THR D  76
THR D  77
GLU D  78
GLU D 105
 H4B D1006
2DTT_E_H4BE1004 2dtt H4B

DB00360
(Sapropterin) 		Pyrococcus
horikoshii 		HYPOTHETICAL PROTEIN
PH0634 		no annotation 11 HIS E  15
VAL E  17
HIS E  27
HIS E  29
TYR D  45
PHE D  49
LEU D  50
THR E  76
THR E  77
GLU E  78
GLU E 105
 H4B E1004
2DTT_F_H4BF1005 2dtt H4B

DB00360
(Sapropterin) 		Pyrococcus
horikoshii 		HYPOTHETICAL PROTEIN
PH0634 		no annotation 9 ILE E   5
HIS F  29
TYR E  45
ASP E  48
PHE E  49
THR F  76
THR F  77
GLU F  78
GLU F 105
 H4B F1005
2F8L_A_SAMA400 2f8l SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Listeria
monocytogenes 		HYPOTHETICAL PROTEIN
LMO1582 		PF02384
(N6_Mtase) 		16 HIS A  95
THR A  98
ALA A 126
GLY A 128
THR A 129
ASN A 131
LEU A 132
ASP A 154
VAL A 155
ASP A 156
LEU A 159
ASP A 180
GLY A 181
ASP A 196
PRO A 198
PHE A 226
 SAM A 400
2FXD_A_DR7A102 2fxd DR7

DB01072
(Atazanavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL PROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		18 ARG A   8
ARG B   8
ILE A  10
LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
ILE B  50
PRO B  81
PHE A  82
VAL A  84
 DR7 A 102
2FXE_A_DR7A102 2fxe DR7

DB01072
(Atazanavir) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		POL PROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation 		23 ARG B   8
ARG A   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ILE B  47
GLY A  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PHE A  53
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
 DR7 A 102
2GL0_A_ADNA901 2gl0 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Pyrobaculum
aerophilum 		CONSERVED
HYPOTHETICAL PROTEIN 		PF04008
(Adenosine_kin)
no annotation 		10 ASN B  20
HIS A  27
PHE A  28
HIS A  85
TRP B  95
ILE B  97
ALA B 117
ASN B 118
VAL B 163
TYR B 165
 ADN A 901
2GL0_B_ADNB902 2gl0 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Pyrobaculum
aerophilum 		CONSERVED
HYPOTHETICAL PROTEIN 		no annotation 11 ASN C  20
HIS B  27
PHE B  28
HIS B  85
TRP C  95
ILE C  97
THR C 116
ALA C 117
ASN C 118
VAL C 163
TYR C 165
 ADN B 902
2GL0_C_ADNC903 2gl0 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Pyrobaculum
aerophilum 		CONSERVED
HYPOTHETICAL PROTEIN 		PF04008
(Adenosine_kin)
no annotation 		12 ASN A  20
HIS C  27
PHE C  28
SER C  56
HIS C  85
TRP A  95
ILE A  97
THR A 116
ALA A 117
ASN A 118
VAL A 163
TYR A 165
 ADN C 903
2GL0_D_ADND904 2gl0 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Pyrobaculum
aerophilum 		CONSERVED
HYPOTHETICAL PROTEIN 		no annotation 12 ASN E  20
HIS D  27
PHE D  28
SER D  56
HIS D  85
TRP E  95
ILE E  97
THR E 116
ALA E 117
ASN E 118
VAL E 163
TYR E 165
 ADN D 904
2GL0_E_ADNE905 2gl0 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Pyrobaculum
aerophilum 		CONSERVED
HYPOTHETICAL PROTEIN 		no annotation 11 ASN F  20
HIS E  27
PHE E  28
HIS E  85
TRP F  95
ILE F  97
THR F 116
ALA F 117
ASN F 118
VAL F 163
TYR F 165
 ADN E 905
2GL0_F_ADNF906 2gl0 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Pyrobaculum
aerophilum 		CONSERVED
HYPOTHETICAL PROTEIN 		no annotation 11 ASN D  20
HIS F  27
PHE F  28
HIS F  85
TRP D  95
ILE D  97
THR D 116
ALA D 117
ASN D 118
VAL D 163
TYR D 165
 ADN F 906
2JB7_B_ACTB1169 2jb7 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Pyrobaculum
aerophilum 		HYPOTHETICAL PROTEIN
PAE2307 		None
PF04008
(Adenosine_kin) 		3 ARG C 111
ARG B 111
ARG A 111
 ACT B1169
2NXE_A_SAMA302 2nxe SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL PROTEIN
L11
METHYLTRANSFERASE 		PF06325
(PrmA) 		15 PHE A  99
GLY A 100
THR A 107
ASP A 126
LEU A 127
GLY A 128
GLY A 130
LEU A 134
ASP A 149
ILE A 150
ASP A 151
SER A 175
ASN A 191
LEU A 192
LEU A 196
 SAM A 302
2NXE_B_SAMB303 2nxe SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL PROTEIN
L11
METHYLTRANSFERASE 		None 15 PHE B  99
GLY B 100
THR B 107
ASP B 126
LEU B 127
GLY B 128
GLY B 130
LEU B 134
ASP B 149
ILE B 150
ASP B 151
SER B 175
ASN B 191
LEU B 192
LEU B 196
 SAM B 303
2PXC_A_SAMA500 2pxc SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Murray Valley
encephalitis
virus 		GENOME POLYPROTEIN
[CONTAINS: CAPSID
PROTEIN C (CORE
PROTEIN);
ENVELOPE PROTEIN M
(MATRIX PROTEIN);
MAJOR ENVELOPE
PROTEIN E;
NON-STRUCTURAL
PROTEIN 1 (NS1);
NON-STRUCTURAL
PROTEIN 2A (NS2A);
FLAVIVIRIN PROTEASE
NS2B REGULATORY
SUBUNIT;
FLAVIVIRIN PROTEASE
NS3 CATALYTIC
SUBUNIT;
NON-STRUCTURAL
PROTEIN 4A (NS4A);
NON-STRUCTURAL
PROTEIN 4B (NS4B);
RNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE (EC
2.7.7.48) (NS5)] 		PF01728
(FtsJ) 		14 SER A  56
GLY A  58
GLY A  81
GLY A  83
GLY A  86
TRP A  87
THR A 104
LYS A 105
HIS A 110
GLU A 111
ASP A 131
VAL A 132
ASP A 146
ILE A 147
 SAM A 500
2Q6O_A_SAMA500 2q6o SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Salinispora
tropica 		HYPOTHETICAL PROTEIN PF01887
(SAM_adeno_trans) 		7 ASP A  11
VAL A  12
ALA A  18
PHE A  45
PRO A  73
THR A  75
TRP A 129
 SAM A 500
2Q6O_B_SAMB500 2q6o SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Salinispora
tropica 		HYPOTHETICAL PROTEIN None 6 ASP B  11
VAL B  12
PHE B  45
PRO B  73
THR B  75
TRP B 129
 SAM B 500
2UYQ_A_SAMA1311 2uyq SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Mycobacterium
leprae 		HYPOTHETICAL PROTEIN
ML2640 		PF04072
(LCM) 		7 ALA A 110
GLY A 112
ASP A 132
VAL A 136
ASP A 161
LEU A 162
ARG A 163
 SAM A1311
2WA2_A_SAMA1248 2wa2 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Modoc virus NON-STRUCTURAL
PROTEIN 5 		PF01728
(FtsJ) 		14 GLY A  59
GLY A  82
GLY A  84
SER A  87
TRP A  88
THR A 105
LEU A 106
HIS A 111
GLU A 112
ASP A 132
VAL A 133
THR A 134
ASP A 147
ILE A 148
 SAM A1248
2WA2_B_SAMB1267 2wa2 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Modoc virus NON-STRUCTURAL
PROTEIN 5 		None 15 SER B  57
GLY B  59
GLY B  82
GLY B  84
SER B  87
TRP B  88
THR B 105
LEU B 106
HIS B 111
GLU B 112
ASP B 132
VAL B 133
THR B 134
ASP B 147
ILE B 148
 SAM B1267
2YQZ_A_SAMA301 2yqz SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		HYPOTHETICAL PROTEIN
TTHA0223 		PF08241
(Methyltransf_11) 		17 TYR A  12
GLU A  45
GLY A  47
GLY A  49
ARG A  52
ILE A  53
LEU A  67
ASP A  68
ALA A  69
ASP A  70
ASP A  94
ALA A  95
ARG A  96
VAL A 111
HIS A 112
LEU A 113
LEU A 116
 SAM A 301
2YQZ_B_SAMB401 2yqz SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		HYPOTHETICAL PROTEIN
TTHA0223 		None 17 TYR B  12
GLU B  45
GLY B  47
GLY B  49
ARG B  52
ILE B  53
LEU B  67
ASP B  68
ALA B  69
ASP B  70
ASP B  94
ALA B  95
VAL B 111
HIS B 112
LEU B 113
LEU B 116
VAL B 117
 SAM B 401
2YVL_A_SAMA601 2yvl SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Aquifex aeolicus HYPOTHETICAL PROTEIN PF08704
(GCD14) 		16 THR A  72
ILE A  74
ILE A  75
GLY A  99
GLY A 101
SER A 102
ALA A 104
LEU A 105
GLU A 120
ALA A 121
VAL A 122
ASP A 148
PHE A 149
ASP A 165
VAL A 166
TYR A 172
 SAM A 601
2YVL_B_SAMB602 2yvl SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Aquifex aeolicus HYPOTHETICAL PROTEIN None 15 THR B  72
ILE B  74
ILE B  75
GLY B  99
GLY B 101
ALA B 104
LEU B 105
GLU B 120
ALA B 121
VAL B 122
ASP B 148
PHE B 149
ASP B 165
VAL B 166
TYR B 172
 SAM B 602
2YVL_C_SAMC604 2yvl SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Aquifex aeolicus HYPOTHETICAL PROTEIN None 16 THR C  72
ILE C  74
ILE C  75
GLY C  99
GLY C 101
SER C 102
ALA C 104
LEU C 105
GLU C 120
ALA C 121
VAL C 122
ASP C 148
PHE C 149
ASP C 165
VAL C 166
TYR C 172
 SAM C 604
2YVL_D_SAMD603 2yvl SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Aquifex aeolicus HYPOTHETICAL PROTEIN None 14 THR D  72
ILE D  75
GLY D  99
GLY D 101
ALA D 104
LEU D 105
GLU D 120
ALA D 121
VAL D 122
ASP D 148
PHE D 149
ASP D 165
VAL D 166
TYR D 172
 SAM D 603
2Z0A_A_GLYA73 2z0a GLY

DB00145
(Glycine) 		Influenza A virus NONSTRUCTURAL
PROTEIN 1 		PF00600
(Flu_NS1) 		5 GLN A  10
ALA A  60
GLN A  63
ILE A  64
ARG A  67
 GLY A  73
2Z0A_A_GLYA74 2z0a GLY

DB00145
(Glycine) 		Influenza A virus NONSTRUCTURAL
PROTEIN 1 		PF00600
(Flu_NS1) 		4 LYS A  20
LEU A  36
ARG A  37
GLN A  40
 GLY A  74
2Z0A_C_GLYC73 2z0a GLY

DB00145
(Glycine) 		Influenza A virus NONSTRUCTURAL
PROTEIN 1 		None 4 ASP C  12
ASP C  39
SER C  42
ARG C  46
 GLY C  73
2Z0A_D_GLYD73 2z0a GLY

DB00145
(Glycine) 		Influenza A virus NONSTRUCTURAL
PROTEIN 1 		None 4 ARG C  35
ASP D  39
SER D  42
ARG D  46
 GLY D  73
2ZBP_A_SAMA300 2zbp SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL PROTEIN
L11
METHYLTRANSFERASE 		PF06325
(PrmA) 		14 PHE A  99
GLY A 100
THR A 107
LEU A 127
GLY A 128
GLY A 130
LEU A 134
ASP A 149
ILE A 150
ASP A 151
SER A 175
ASN A 191
LEU A 192
LEU A 196
 SAM A 300
3C9J_B_308B101 3c9j 308

DB00915
(Amantadine) 		Influenza A virus PROTON CHANNEL
PROTEIN M2,
TRANSMEMBRANE
SEGMENT 		PF00599
(Flu_M2)
no annotation 		6 ALA A   9
SER C  10
SER A  10
SER D  10
SER B  10
ALA B  13
 308 B 101
3CJT_C_SAMC302 3cjt SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL PROTEIN
L11
METHYLTRANSFERASE 		None 14 HIS C 103
THR C 107
ASP C 126
LEU C 127
GLY C 128
VAL C 133
LEU C 134
ASP C 149
ILE C 150
ASP C 151
SER C 175
ASN C 191
LEU C 192
LEU C 196
 SAM C 302
3CJT_G_SAMG302 3cjt SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL PROTEIN
L11
METHYLTRANSFERASE 		None 14 HIS G 103
LEU G 127
GLY G 128
GLY G 130
SER G 131
VAL G 133
LEU G 134
ASP G 149
ILE G 150
ASP G 151
SER G 175
ASN G 191
LEU G 192
LEU G 196
 SAM G 302
3CJT_K_SAMK302 3cjt SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL PROTEIN
L11
METHYLTRANSFERASE 		None 13 HIS K 103
LEU K 127
GLY K 128
SER K 131
VAL K 133
LEU K 134
ASP K 149
ILE K 150
ASP K 151
SER K 175
ASN K 191
LEU K 192
LEU K 196
 SAM K 302
3CJT_O_SAMO302 3cjt SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Thermus
thermophilus 		RIBOSOMAL PROTEIN
L11
METHYLTRANSFERASE 		None 14 HIS O 103
LEU O 127
GLY O 128
GLY O 130
SER O 131
VAL O 133
LEU O 134
ASP O 149
ILE O 150
ASP O 151
SER O 175
ASN O 191
LEU O 192
LEU O 196
 SAM O 302
3I45_A_NIOA500 3i45 NIO

DB00627
(Niacin) 		Rhodospirillum
rubrum 		TWIN-ARGININE
TRANSLOCATION
PATHWAY SIGNAL
PROTEIN 		PF13458
(Peripla_BP_6) 		8 PHE A  81
SER A  83
GLU A 104
LEU A 106
TYR A 152
TYR A 154
PHE A 208
LEU A 234
 NIO A 500
3IT4_B_ACTB601 3it4 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Mycobacterium
tuberculosis 		ARGININE
BIOSYNTHESIS
BIFUNCTIONAL PROTEIN
ARGJ ALPHA CHAIN;
ARGININE
BIOSYNTHESIS
BIFUNCTIONAL PROTEIN
ARGJ BETA CHAIN 		None
PF01960
(ArgJ) 		4 LEU C 129
MET C 193
ASN B 322
ARG B 325
 ACT B 601
3IT4_C_BEZC503 3it4 BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Mycobacterium
tuberculosis 		ARGININE
BIOSYNTHESIS
BIFUNCTIONAL PROTEIN
ARGJ ALPHA CHAIN 		None 4 ARG C   9
GLN C  14
LEU C 154
HIS C 177
 BEZ C 503
3IT4_D_ACTD601 3it4 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Mycobacterium
tuberculosis 		ARGININE
BIOSYNTHESIS
BIFUNCTIONAL PROTEIN
ARGJ ALPHA CHAIN;
ARGININE
BIOSYNTHESIS
BIFUNCTIONAL PROTEIN
ARGJ BETA CHAIN 		None
PF01960
(ArgJ) 		4 LEU A 129
MET A 193
ASN D 322
ARG D 325
 ACT D 601
3J7Z_A_ERYA9000 3j7z ERY

DB00199
(Erythromycin) 		Escherichia coli;
Staphylococcus
aureus 		23S RRNA;
50S RIBOSOMAL
PROTEIN L22;
ERMCL NASCENT CHAIN 		PF00237
(Ribosomal_L22)
PF08253
(Leader_Erm) 		3 ILE a  81
PHE a  82
LYS S  90
 ERY A9000
3JAY_A_SAMA1101 3jay SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Cypovirus 1 STRUCTURAL PROTEIN
VP3 		None 13 ASN A 526
SER A 528
MET A 532
GLU A 564
GLU A 566
ASP A 589
ARG A 590
ARG A 599
VAL A 600
ASP A 616
ILE A 617
ASN A 618
GLU A 631
 SAM A1101
3JAY_A_SAMA1102 3jay SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Cypovirus 1 STRUCTURAL PROTEIN
VP3 		None 15 LYS A 838
TYR A 842
ILE A 861
GLY A 862
GLY A 863
ARG A 864
ALA A 867
ASP A 868
ASP A 882
PRO A 883
ALA A 884
PHE A 904
ILE A 922
PRO A 929
TYR A 992
 SAM A1102
3JB1_A_SAMA1101 3jb1 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Cypovirus 1 STRUCTURAL PROTEIN
VP3 		None 13 TYR A 842
ILE A 861
GLY A 862
ARG A 864
ALA A 867
ASP A 882
PRO A 883
ALA A 884
PHE A 904
ILE A 922
ALA A 923
PRO A 929
TYR A 992
 SAM A1101
3JB2_A_SAMA1101 3jb2 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Cypovirus 1 STRUCTURAL PROTEIN
VP3 		None 15 ASN A 526
SER A 528
MET A 532
GLU A 564
GLU A 566
PRO A 567
GLY A 588
ASP A 589
ARG A 590
ARG A 599
VAL A 600
ASP A 616
ILE A 617
ASN A 618
GLU A 631
 SAM A1101
3JB2_A_SAMA1102 3jb2 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Cypovirus 1 STRUCTURAL PROTEIN
VP3 		None 15 LYS A 838
TYR A 842
ILE A 861
GLY A 862
GLY A 863
ARG A 864
ALA A 867
ASP A 868
ASP A 882
PRO A 883
ALA A 884
PHE A 904
ALA A 923
VAL A 924
PRO A 929
 SAM A1102
3JB3_A_SAMA1101 3jb3 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Cypovirus 1 STRUCTURAL PROTEIN
VP3 		None 13 ASN A 526
SER A 528
MET A 532
GLU A 564
GLU A 566
ASP A 589
ARG A 590
ARG A 599
VAL A 600
ASP A 616
ILE A 617
ASN A 618
GLU A 631
 SAM A1101
3JB3_A_SAMA1102 3jb3 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Cypovirus 1 STRUCTURAL PROTEIN
VP3 		None 15 LYS A 838
TYR A 842
ILE A 861
GLY A 862
ARG A 864
ALA A 867
ASP A 868
ASP A 882
PRO A 883
ALA A 884
PHE A 904
ALA A 923
VAL A 924
ASN A 927
PRO A 929
 SAM A1102
3P97_A_SAMA263 3p97 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Dengue virus NON-STRUCTURAL
PROTEIN 5 		PF01728
(FtsJ) 		13 SER A  56
GLY A  58
GLY A  81
GLY A  83
GLY A  86
TRP A  87
THR A 104
LYS A 105
HIS A 110
ASP A 131
VAL A 132
ASP A 146
ILE A 147
 SAM A 263
3P97_C_SAMC263 3p97 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Dengue virus NON-STRUCTURAL
PROTEIN 5 		None 14 SER C  56
GLY C  58
GLY C  81
GLY C  83
GLY C  86
TRP C  87
THR C 104
LYS C 105
HIS C 110
GLU C 111
ASP C 131
VAL C 132
ASP C 146
ILE C 147
 SAM C 263
3PS9_A_SAMA670 3ps9 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli TRNA
5-METHYLAMINOMETHYL-
2-THIOURIDINE
BIOSYNTHESIS
BIFUNCTIONAL PROTEIN
MNMC 		PF01266
(DAO)
PF05430
(Methyltransf_30) 		18 PHE A  24
TYR A  28
GLU A  64
GLY A  66
GLY A  68
THR A  69
LEU A  71
ASN A  72
GLU A 101
LYS A 102
PHE A 103
ASP A 156
ILE A 157
ASP A 178
GLY A 179
PHE A 180
ASN A 185
MET A 188
 SAM A 670
3SGL_A_SAMA692 3sgl SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Yersinia pestis TRNA
5-METHYLAMINOMETHYL-
2-THIOURIDINE
BIOSYNTHESIS
BIFUNCTIONAL PROTEIN
MNMC 		PF01266
(Methyltransf_30)
PF05430
(DAO) 		14 GLU A  64
GLY A  66
GLY A  68
THR A  69
LEU A  71
ASN A  72
GLU A 101
LYS A 102
TYR A 103
ASP A 156
VAL A 157
ASP A 178
GLY A 179
PHE A 180
 SAM A 692
4CTJ_A_SAMA1263 4ctj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Dengue virus NON-STRUCTURAL
PROTEIN 5 		PF01728
(FtsJ) 		14 SER A  56
GLY A  58
GLY A  81
GLY A  83
GLY A  86
TRP A  87
THR A 104
LYS A 105
HIS A 110
GLU A 111
ASP A 131
VAL A 132
ASP A 146
ILE A 147
 SAM A1263
4CTJ_C_SAMC1263 4ctj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Dengue virus NON-STRUCTURAL
PROTEIN 5 		None 14 SER C  56
GLY C  58
GLY C  81
GLY C  83
GLY C  86
TRP C  87
THR C 104
LYS C 105
HIS C 110
GLU C 111
ASP C 131
VAL C 132
ASP C 146
ILE C 147
 SAM C1263
4DR2_A_PARA1609 4dr2 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
30S RIBOSOMAL
PROTEIN S10;
30S RIBOSOMAL
PROTEIN S9 		PF00338
(Ribosomal_S10)
PF00380
(Ribosomal_S9)
no annotation 		3 ARG J  51
SER J  59
TYR I 114
 PAR A1609
4DR3_A_SRYA1601 4dr3 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
30S RIBOSOMAL
PROTEIN S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		4 LYS L  46
LYS L  47
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1601
4DR5_A_SRYA1860 4dr5 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
30S RIBOSOMAL
PROTEIN S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		3 LYS L  46
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1860
4DR6_A_SRYA1956 4dr6 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
30S RIBOSOMAL
PROTEIN S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		3 LYS L  46
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1956
4DUZ_A_SRYA1601 4duz SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		3 LYS L  46
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1601
4DV1_A_SRYA1601 4dv1 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		3 LYS L  46
LYS L  47
PRO L  48
 SRY A1601
4DV3_A_SRYA1601 4dv3 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		4 LYS L  46
LYS L  47
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1601
4DV5_A_SRYA1601 4dv5 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		4 LYS L  46
LYS L  47
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1601
4DV7_A_SRYA1601 4dv7 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		3 LYS L  46
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1601
4JD6_A_TOYA501 4jd6 TOY

DB00684
(Tobramycin) 		Mycobacterium
tuberculosis 		ENHANCED
INTRACELLULAR
SURVIVAL PROTEIN 		PF13527
(Acetyltransf_9)
PF13530
(SCP2_2) 		9 PHE A  24
ASP A  26
ILE A  28
TRP A  36
SER A  83
VAL A  85
TYR A 126
GLU A 203
GLU A 401
 TOY A 501
4JD6_B_TOYB501 4jd6 TOY

DB00684
(Tobramycin) 		Mycobacterium
tuberculosis 		ENHANCED
INTRACELLULAR
SURVIVAL PROTEIN 		no annotation 9 PHE B  24
ASP B  26
ILE B  28
TRP B  36
SER B  83
VAL B  85
TYR B 126
GLU B 203
GLU B 401
 TOY B 501
4JI1_A_SRYA1601 4ji1 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		4 LYS L  46
LYS L  47
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1601
4JI3_A_SRYA1601 4ji3 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		4 LYS L  46
LYS L  47
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1601
4JI8_A_SRYA1601 4ji8 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		3 LYS L  46
LYS L  91
TRP L  94
 SRY A1601
4KHP_A_PARA1606 4khp PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RIBOSOMAL RNA;
30S RIBOSOMAL
PROTEIN S10;
30S RIBOSOMAL
PROTEIN S9 		PF00338
(Ribosomal_S10)
PF00380
(Ribosomal_S9)
no annotation 		3 ARG J  51
SER J  59
TYR I 114
 PAR A1606
4LF7_A_PARA1817 4lf7 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S10;
RIBOSOMAL PROTEIN S9 		PF00338
(Ribosomal_S10)
PF00380
(Ribosomal_S9)
no annotation 		3 ARG J  51
SER J  59
TYR I 114
 PAR A1817
4LF8_A_PARA1817 4lf8 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S10;
RIBOSOMAL PROTEIN S9 		PF00338
(Ribosomal_S10)
PF00380
(Ribosomal_S9)
no annotation 		3 ARG J  51
SER J  59
TYR I 114
 PAR A1817
4NXN_A_SRYA1601 4nxn SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		4 LYS L  46
LYS L  47
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1601
4QB9_A_PARA500 4qb9 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Mycolicibacterium
smegmatis 		ENHANCED
INTRACELLULAR
SURVIVAL PROTEIN 		PF13527
(Acetyltransf_9)
PF13530
(SCP2_2) 		10 PHE A  26
SER A  83
PHE A  84
THR A 119
SER A 121
GLU A 137
ASP A 290
ASP A 291
TYR A 400
GLY A 401
 PAR A 500
4QB9_B_PARB500 4qb9 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Mycolicibacterium
smegmatis 		ENHANCED
INTRACELLULAR
SURVIVAL PROTEIN 		no annotation 9 PHE B  26
SER B  83
THR B 119
SER B 121
GLU B 137
ARG B 205
ASP B 291
TYR B 400
GLY B 401
 PAR B 500
4QB9_C_PARC500 4qb9 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Mycolicibacterium
smegmatis 		ENHANCED
INTRACELLULAR
SURVIVAL PROTEIN 		no annotation 10 SER C  83
PHE C  84
THR C 119
SER C 121
TYR C 126
GLU C 137
ASP C 290
ASP C 291
TYR C 400
GLY C 401
 PAR C 500
4QB9_D_PARD500 4qb9 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Mycolicibacterium
smegmatis 		ENHANCED
INTRACELLULAR
SURVIVAL PROTEIN 		no annotation 8 PHE D  26
SER D  83
THR D 119
SER D 121
GLU D 137
ASP D 290
ASP D 291
TYR D 400
 PAR D 500
4QB9_E_PARE500 4qb9 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Mycolicibacterium
smegmatis 		ENHANCED
INTRACELLULAR
SURVIVAL PROTEIN 		no annotation 12 PHE E  26
SER E  83
PHE E  84
LEU E 118
THR E 119
SER E 121
TYR E 126
GLU E 137
ASP E 290
ASP E 291
TYR E 400
GLY E 401
 PAR E 500
4QB9_F_PARF500 4qb9 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Mycolicibacterium
smegmatis 		ENHANCED
INTRACELLULAR
SURVIVAL PROTEIN 		no annotation 11 PHE F  26
SER F  83
THR F 119
SER F 121
TYR F 126
GLU F 137
GLU F 238
ASP F 290
ASP F 291
TYR F 400
GLY F 401
 PAR F 500
5FA8_A_SAMA301 5fa8 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Sulfolobus
islandicus 		RIBOSOMAL PROTEIN
L11
METHYLTRANSFERASE,
PUTATIVE 		PF13847
(Methyltransf_31) 		15 PRO A  11
THR A  12
ASP A  34
GLY A  36
GLY A  38
ARG A  41
ILE A  42
GLU A  59
ILE A  60
ASN A  61
ARG A  64
ASN A  87
PHE A  88
PHE A 102
LEU A 104
 SAM A 301
5IAO_A_URFA301 5iao URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Mycobacterium
tuberculosis 		BIFUNCTIONAL PROTEIN
PYRR 		PF00156
(Pribosyltran) 		4 ARG A  58
ASP A 120
HIS A 177
ARG A 179
 URF A 301
5IAO_C_URFC301 5iao URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Mycobacterium
tuberculosis 		BIFUNCTIONAL PROTEIN
PYRR 		no annotation 3 ARG C  58
HIS C 177
ARG C 179
 URF C 301
5IAO_F_URFF301 5iao URF

DB00544
(Fluorouracil) 		Mycobacterium
tuberculosis 		BIFUNCTIONAL PROTEIN
PYRR 		no annotation 3 ARG F  58
HIS F 177
ARG F 179
 URF F 301
5KLA_A_ACTA1505 5kla ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Drosophila
melanogaster 		MATERNAL PROTEIN
PUMILIO 		PF00806
(PUF) 		3 HIS A1338
LYS A1339
PHE A1340
 ACT A1505
5UBB_A_SAMA301 5ubb SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Homo sapiens ALPHA N-TERMINAL
PROTEIN
METHYLTRANSFERASE 1B 		PF05891
(Methyltransf_PK) 		17 TYR A  76
MET A  86
GLY A 124
GLY A 126
ARG A 129
VAL A 130
ASP A 146
MET A 147
MET A 148
SER A 173
LEU A 174
GLN A 175
GLN A 190
TRP A 191
VAL A 192
HIS A 195
LEU A 196
 SAM A 301
5UMD_A_YMZA3801 5umd YMZ

DB00358
(Mefloquine) 		Plasmodium
falciparum 		28S RIBOSOMAL RNA;
60S RIBOSOMAL
PROTEIN L28;
60S RIBOSOMAL
PROTEIN L4 		PF00573
(Ribosomal_L4)
PF01778
(Ribosomal_L28e)
PF14374
(Ribos_L4_asso_C)
no annotation 		6 ASN 2   6
ALA 2   7
PRO 2  44
VAL 2  50
ASP F 288
TYR F 290
 YMZ A3801
5UMD_K_YMZK301 5umd YMZ

DB00358
(Mefloquine) 		Plasmodium
falciparum 		60S RIBOSOMAL
PROTEIN L13,
PUTATIVE 		PF00572
(Ribosomal_L13) 		11 LEU K  15
ILE K  42
ASN K  49
LYS K  52
TYR K  53
GLU K  55
PHE K  56
LEU K  59
ILE K  78
ARG K  81
LEU K 140
 YMZ K 301
5V02_R_657R201 5v02 657

DB00740
(Riluzole) 		Homo sapiens CALMODULIN-1;
SMALL CONDUCTANCE
CALCIUM-ACTIVATED
POTASSIUM CHANNEL
PROTEIN 2 		PF02888
(CaMBD)
PF13499
(EF-hand_7) 		10 LEU R  32
MET R  51
GLU R  54
VAL R  55
ILE R  63
MET R  71
MET R  72
ALA B 477
LEU B 480
VAL B 481
 657 R 201
6AZ3_1_PAR11801 6az3 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Leishmania
donovani 		RIBOSOMAL PROTEIN
EL18;
RRNA ALPHA 		no annotation 4 ARG P  66
ARG P 149
GLY P 152
ARG P 157
 PAR 11801
6AZ3_1_PAR11802 6az3 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Leishmania
donovani 		RIBOSOMAL PROTEIN
EL15;
RIBOSOMAL PROTEIN
UL15;
RIBOSOMAL PROTEIN
UL4;
RRNA ALPHA 		no annotation 3 LYS L   6
ARG C 109
ARG M 204
 PAR 11802
6AZ3_1_PAR11803 6az3 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Leishmania
donovani 		RIBOSOMAL PROTEIN
EL18;
RRNA ALPHA 		no annotation 3 SER P   9
LYS P  10
SER P  12
 PAR 11803
6DEB_B_MTXB302 6deb MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Campylobacter
jejuni 		BIFUNCTIONAL PROTEIN
FOLD 		no annotation 13 LEU B  93
GLN B  95
LEU B  96
PRO B  97
LYS B 104
ASP B 118
PHE B 120
THR B 140
SER B 166
ILE B 168
VAL B 169
VAL B 228
THR B 265
 MTX B 302
6DEB_B_MTXB303 6deb MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Campylobacter
jejuni 		BIFUNCTIONAL PROTEIN
FOLD 		no annotation 5 TYR B  47
LYS B  51
GLN B  95
GLY B 209
ILE B 230
 MTX B 303