DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'ISOMERASE'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1E3V_A_DXCA801 1e3v DXC

DB03619
(Deoxycholic
Acid) 		Pseudomonas
putida 		STEROID
DELTA-ISOMERASE 		PF12680
(SnoaL_2) 		12 TYR A  16
ASP A  40
PHE A  56
TYR A  57
GLY A  60
PHE A  86
VAL A  88
LEU A  99
ASP A 103
MET A 116
ALA A 118
TRP A 120
 DXC A 801
1E3V_B_DXCB801 1e3v DXC

DB03619
(Deoxycholic
Acid) 		Pseudomonas
putida 		STEROID
DELTA-ISOMERASE 		None 11 TYR B  16
ASP B  40
PHE B  56
TYR B  57
GLY B  60
PHE B  86
LEU B  99
ASP B 103
MET B 116
ALA B 118
TRP B 120
 DXC B 801
1K4T_D_TTCD990 1k4t TTC

DB01030
(Topotecan) 		;
Homo sapiens 		DNA TOPOISOMERASE I PF01028
(Topoisom_I)
PF02919
(Topoisom_I_N)
PF14370
(Topo_C_assoc)
no annotation 		5 GLU A 356
ARG A 364
LYS A 532
ASP A 533
THR A 718
 TTC D 990
1Q6I_A_FK5A301 1q6i FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Escherichia coli FKBP-TYPE
PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
FKPA 		PF00254
(FKBP_C)
PF01346
(FKBP_N) 		9 TYR A 146
ASP A 157
LEU A 166
VAL A 173
ILE A 174
TRP A 177
TYR A 200
ILE A 208
PHE A 216
 FK5 A 301
1Q6I_B_FK5B401 1q6i FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Escherichia coli FKBP-TYPE
PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
FKPA 		no annotation 10 TYR B 146
ASP B 157
ARG B 162
LEU B 166
VAL B 173
ILE B 174
TRP B 177
TYR B 200
ILE B 208
PHE B 216
 FK5 B 401
1QZR_B_CDXB901 1qzr CDX

DB00380
(Dexrazoxane) 		Saccharomyces
cerevisiae 		DNA TOPOISOMERASE II PF00204
(DNA_gyraseB)
PF02518
(HATPase_c)
no annotation 		14 HIS A  20
HIS B  20
THR B  27
THR A  27
TYR A  28
TYR B  28
ASN B 142
ASN A 142
TYR B 144
TYR A 144
LEU A 148
LEU B 148
GLN B 365
GLN A 365
 CDX B 901
1RFF_A_SPMA700 1rff SPM

DB00127
(Spermine) 		;
Homo sapiens 		TOPOISOMERASE
I-DERIVED PEPTIDE;
TYROSYL-DNA
PHOSPHODIESTERASE 1 		PF06087
(Tyr-DNA_phospho)
no annotation 		4 ASN A 591
TRP A 605
VAL A 606
TYR C 724
 SPM A 700
1RFI_A_SPMA999 1rfi SPM

DB00127
(Spermine) 		;
Homo sapiens 		TOPOISOMERASE
I-DERIVED PEPTIDE;
TYROSYL-DNA
PHOSPHODIESTERASE 1 		PF06087
(Tyr-DNA_phospho)
no annotation 		5 TRP A 590
TRP A 605
VAL A 606
PRO A 607
LYS C 724
 SPM A 999
1RR8_A_TTCA100 1rr8 TTC

DB01030
(Topotecan) 		;
Homo sapiens 		DNA TOPOISOMERASE I PF01028
(Topoisom_I)
PF02919
(Topoisom_I_N)
PF14370
(Topo_C_assoc)
no annotation 		5 GLU C 356
ARG C 364
LYS C 532
ASP C 533
THR C 718
 TTC A 100
1RRJ_B_TTCB990 1rrj TTC

DB01030
(Topotecan) 		;
Homo sapiens 		DNA TOPOISOMERASE I PF01028
(Topoisom_I)
PF02919
(Topoisom_I_N)
PF14370
(Topo_C_assoc)
no annotation 		5 GLU A 356
ARG A 364
LYS A 532
ASP A 533
THR A 718
 TTC B 990
1S14_A_NOVA1300 1s14 NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Escherichia coli TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B 		PF02518
(HATPase_c) 		12 ASN A1042
SER A1043
ASP A1045
GLU A1046
ASP A1069
ARG A1072
MET A1074
PRO A1075
ASP A1077
ILE A1090
ARG A1132
THR A1163
 NOV A1300
1S14_B_NOVB2300 1s14 NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Escherichia coli TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B 		no annotation 13 ASN B2042
SER B2043
ASP B2045
GLU B2046
ASP B2069
ARG B2072
MET B2074
PRO B2075
ASP B2077
ALA B2086
ILE B2090
ARG B2132
THR B2163
 NOV B2300
1XID_A_ASCA389 1xid ASC

DB00126
(Vitamin
C) 		Streptomyces
rubiginosus 		D-XYLOSE ISOMERASE PF01261
(AP_endonuc_2) 		10 TRP A  16
HIS A  54
PHE A  94
TRP A 137
GLU A 181
GLU A 217
HIS A 220
ASP A 245
ASP A 287
LYS A 289
 ASC A 389
1XIH_A_SORA389 1xih SOR

DB01638
(Sorbitol) 		Streptomyces
rubiginosus 		D-XYLOSE ISOMERASE PF01261
(AP_endonuc_2) 		13 TRP A  16
HIS A  54
THR A  90
PHE A  94
VAL A 135
TRP A 137
GLU A 181
LYS A 183
GLU A 217
HIS A 220
ASP A 245
ASP A 255
ASP A 287
 SOR A 389
2VN1_A_FK5A501 2vn1 FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Plasmodium
falciparum 		70 KDA
PEPTIDYLPROLYL
ISOMERASE 		PF00254
(FKBP_C)
no annotation 		17 LEU B  23
TYR A  44
PHE A  55
ASP A  56
SER B  57
PHE B  59
ASP B  60
ARG A  61
PHE A  65
VAL A  74
TRP A  78
LYS B  90
TYR A 101
CYS A 106
ILE A 110
PHE A 118
GLU B 119
 FK5 A 501
2VN1_B_FK5B501 2vn1 FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Plasmodium
falciparum 		70 KDA
PEPTIDYLPROLYL
ISOMERASE 		no annotation 10 TYR B  44
ASP B  56
ARG B  61
PHE B  65
VAL B  74
ILE B  75
TRP B  78
TYR B 101
CYS B 106
PHE B 118
 FK5 B 501
2XIN_A_SORA397 2xin SOR

DB01638
(Sorbitol) 		Actinoplanes
missouriensis 		D-XYLOSE ISOMERASE PF01261
(AP_endonuc_2) 		12 TRP A  16
HIS A  54
THR A  90
VAL A 135
TRP A 137
GLU A 181
LYS A 183
GLU A 217
HIS A 220
ASP A 245
ASP A 255
ASP A 292
 SOR A 397
2XIN_B_SORB397 2xin SOR

DB01638
(Sorbitol) 		Actinoplanes
missouriensis 		D-XYLOSE ISOMERASE None 12 TRP B  16
HIS B  54
THR B  90
VAL B 135
TRP B 137
GLU B 181
LYS B 183
GLU B 217
HIS B 220
ASP B 245
ASP B 255
ASP B 292
 SOR B 397
2XIN_C_SORC397 2xin SOR

DB01638
(Sorbitol) 		Actinoplanes
missouriensis 		D-XYLOSE ISOMERASE None 12 TRP C  16
HIS C  54
THR C  90
VAL C 135
TRP C 137
GLU C 181
LYS C 183
GLU C 217
HIS C 220
ASP C 245
ASP C 255
ASP C 292
 SOR C 397
2XIN_D_SORD397 2xin SOR

DB01638
(Sorbitol) 		Actinoplanes
missouriensis 		D-XYLOSE ISOMERASE None 12 TRP D  16
HIS D  54
THR D  90
VAL D 135
TRP D 137
GLU D 181
LYS D 183
GLU D 217
HIS D 220
ASP D 245
ASP D 255
ASP D 292
 SOR D 397
2XKK_E_MFXE1100 2xkk MFX

DB00218
(Moxifloxacin) 		Acinetobacter
baumannii;
synthetic
construct 		DNA;
TOPOISOMERASE IV 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		3 GLU C 437
SER C1084
ARG A1123
 MFX E1100
2Z77_D_NCAD200 2z77 NCA

DB02701
(Nicotinamide) 		Mycobacterium
tuberculosis 		PUTATIVE STEROID
ISOMERASE 		None 9 SER D  16
TRP D  17
TRP D  28
ASP D  40
LEU D  73
LEU D  93
LEU D  95
TYR D 113
MET D 124
 NCA D 200
3FOF_F_MFXF0 3fof MFX

DB00218
(Moxifloxacin) 		;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT A 		no annotation 3 GLY B  77
SER B  79
SER B  80
 MFX F   0
3FOF_H_MFXH0 3fof MFX

DB00218
(Moxifloxacin) 		;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT A;
DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT B 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		4 GLY A  77
SER A  79
SER A  80
ARG C 456
 MFX H   0
3IHZ_A_FK5A501 3ihz FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Plasmodium vivax 70 KDA
PEPTIDYLPROLYL
ISOMERASE, PUTATIVE 		PF00254
(FKBP_C)
no annotation 		18 TYR B  43
TYR A  43
ASP B  55
ASP A  55
ARG A  60
PHE A  64
PHE B  64
VAL A  73
ILE A  74
TRP A  77
TRP B  77
TYR A 100
TYR B 100
GLY B 106
SER B 108
ILE A 109
ILE B 109
PHE A 117
 FK5 A 501
3K9F_F_LFXF0 3k9f LFX

DB01137
(Levofloxacin)
DB01165
(Ofloxacin) 		;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT A;
DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT B 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		5 SER A  79
ARG B 117
ARG C 456
GLY C 457
GLU C 475
 LFX F   0
3K9F_H_LFXH0 3k9f LFX

DB01137
(Levofloxacin)
DB01165
(Ofloxacin) 		;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT A;
DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT B 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
no annotation 		6 SER B  79
ARG A 117
ARG D 456
GLY D 457
GLU D 474
GLU D 475
 LFX H   0
3LPS_A_NOVA901 3lps NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Xanthomonas
oryzae 		TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B 		PF00204
(DNA_gyraseB)
PF02518
(HATPase_c) 		12 ASN A  86
SER A  87
ASP A  89
GLU A  90
ASP A 113
ARG A 116
MET A 118
PRO A 119
ASP A 121
ILE A 134
ARG A 176
THR A 207
 NOV A 901
3NBR_A_ASDA129 3nbr ASD

DB01536
(4-
Androstenedione) 		Comamonas
testosteroni 		STEROID
DELTA-ISOMERASE 		PF02136
(NTF2) 		12 TYR A  14
ASN A  38
PHE A  54
SER A  58
PHE A  82
VAL A  84
PHE A  86
VAL A  95
PRO A  97
ASN A  99
MET A 112
PHE A 116
 ASD A 129
3NHX_A_ASDA126 3nhx ASD

DB01536
(4-
Androstenedione) 		Comamonas
testosteroni 		STEROID
DELTA-ISOMERASE 		PF02136
(NTF2) 		12 TYR A  14
LEU A  18
ASP A  38
PHE A  54
SER A  58
PHE A  82
PHE A  86
VAL A  95
ASN A  99
MET A 112
ALA A 114
PHE A 116
 ASD A 126
3NUV_A_ASDA126 3nuv ASD

DB01536
(4-
Androstenedione) 		Comamonas
testosteroni 		STEROID
DELTA-ISOMERASE 		PF02136
(NTF2) 		14 TYR A  14
ASN A  38
PHE A  54
SER A  58
LEU A  63
PHE A  82
VAL A  84
PHE A  86
VAL A  95
PRO A  97
ASN A  99
MET A 112
ALA A 114
PHE A 116
 ASD A 126
3NUV_B_ASDB126 3nuv ASD

DB01536
(4-
Androstenedione) 		Comamonas
testosteroni 		STEROID
DELTA-ISOMERASE 		no annotation 10 TYR B  14
ASN B  38
SER B  58
LEU B  63
PHE B  82
VAL B  84
PRO B  97
ASN B  99
MET B 112
ALA B 114
 ASD B 126
3O5R_A_FK5A1001 3o5r FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Homo sapiens PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
FKBP5 		PF00254
(FKBP_C) 		11 TYR A  57
ASP A  68
ARG A  73
PHE A  77
VAL A  86
ILE A  87
TRP A  90
TYR A 113
LYS A 121
ILE A 122
PHE A 130
 FK5 A1001
3QX3_A_EVPA1 3qx3 EVP

DB00773
(Etoposide) 		Homo sapiens DNA TOPOISOMERASE
2-BETA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF01751
(Toprim)
PF16898
(TOPRIM_C) 		5 GLY A 478
ASP A 479
ARG A 503
GLN A 778
MET A 782
 EVP A   1
3QX3_D_EVPD1 3qx3 EVP

DB00773
(Etoposide) 		;
Homo sapiens 		DNA TOPOISOMERASE
2-BETA 		no annotation 5 GLY B 478
ASP B 479
ARG B 503
GLN B 778
MET B 782
 EVP D   1
3RAE_F_LFXF101 3rae LFX

DB01137
(Levofloxacin)
DB01165
(Ofloxacin) 		;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT A;
DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT B 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		4 SER A  79
ARG C 456
GLY C 457
GLU C 474
 LFX F 101
3RAE_H_LFXH101 3rae LFX

DB01137
(Levofloxacin)
DB01165
(Ofloxacin) 		;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT A;
DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT B 		no annotation 5 SER B  79
ARG D 456
GLY D 457
GLU D 474
GLU D 475
 LFX H 101
3T8N_D_EDTD135 3t8n EDT

DB00974
(Edetic
Acid) 		Pseudomonas
putida 		STEROID
DELTA-ISOMERASE 		None 11 THR D  71
THR F  71
GLY D  72
GLY F  72
PRO F  73
PRO D  73
ARG D  75
ARG F  75
PRO D  85
PRO F  85
ASP F 100
 EDT D 135
3UF8_A_FK5A114 3uf8 FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Burkholderia
pseudomallei;
Saccharomyces
cerevisiae 		UBIQUITIN-LIKE
PROTEIN SMT3,
PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE 		PF00254
(FKBP_C)
PF11976
(Rad60-SLD) 		10 TYR A  33
ASP A  44
ARG A  49
PHE A  53
VAL A  62
ILE A  63
TRP A  66
TYR A  89
ILE A  98
PHE A 106
 FK5 A 114
3UQA_A_FK5A114 3uqa FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Burkholderia
pseudomallei;
Saccharomyces
cerevisiae 		UBIQUITIN-LIKE
PROTEIN SMT3,
PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE 		PF00254
(FKBP_C)
PF11976
(Rad60-SLD) 		10 TYR A  33
ASP A  44
ARG A  49
PHE A  53
VAL A  62
ILE A  63
TRP A  66
TYR A  89
ILE A  98
PHE A 106
 FK5 A 114
3UQB_A_FK5A114 3uqb FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Burkholderia
pseudomallei;
Saccharomyces
cerevisiae 		UBIQUITIN-LIKE
PROTEIN SMT3,
PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE 		PF00254
(FKBP_C)
PF11976
(Rad60-SLD) 		8 TYR A  33
PHE A  53
VAL A  62
ILE A  63
TRP A  66
TYR A  89
ILE A  98
PHE A 106
 FK5 A 114
3VAW_A_FK5A114 3vaw FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Burkholderia
pseudomallei;
Saccharomyces
cerevisiae 		UBIQUITIN-LIKE
PROTEIN
SMT3,PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE 		PF00254
(FKBP_C)
PF11976
(Rad60-SLD) 		11 TYR A  33
ASP A  44
ARG A  49
PHE A  53
VAL A  62
ILE A  63
TRP A  66
TYR A  89
ARG A  92
ILE A  98
PHE A 106
 FK5 A 114
3XIM_A_SORA397 3xim SOR

DB01638
(Sorbitol) 		Actinoplanes
missouriensis 		D-XYLOSE ISOMERASE PF01261
(AP_endonuc_2) 		13 TRP A  16
HIS A  54
MET A  88
THR A  90
VAL A 135
TRP A 137
GLU A 181
LYS A 183
GLU A 217
HIS A 220
ASP A 245
ASP A 255
ASP A 292
 SOR A 397
3XIM_B_SORB397 3xim SOR

DB01638
(Sorbitol) 		Actinoplanes
missouriensis 		D-XYLOSE ISOMERASE None 12 TRP B  16
HIS B  54
THR B  90
VAL B 135
TRP B 137
GLU B 181
LYS B 183
GLU B 217
HIS B 220
ASP B 245
ASP B 255
ASP B 292
 SOR B 397
3XIM_C_SORC397 3xim SOR

DB01638
(Sorbitol) 		Actinoplanes
missouriensis 		D-XYLOSE ISOMERASE None 13 TRP C  16
HIS C  54
MET C  88
THR C  90
VAL C 135
TRP C 137
GLU C 181
LYS C 183
GLU C 217
HIS C 220
ASP C 245
ASP C 255
ASP C 292
 SOR C 397
3XIM_D_SORD397 3xim SOR

DB01638
(Sorbitol) 		Actinoplanes
missouriensis 		D-XYLOSE ISOMERASE None 12 TRP D  16
HIS D  54
THR D  90
VAL D 135
TRP D 137
GLU D 181
LYS D 183
GLU D 217
HIS D 220
ASP D 245
ASP D 255
ASP D 292
 SOR D 397
4DRH_A_RAPA201 4drh RAP

DB00877
(Sirolimus) 		Homo sapiens PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
FKBP5;
SERINE/THREONINE-PRO
TEIN KINASE MTOR 		PF00254
(FKBP_C)
PF08771
(FRB_dom) 		21 TYR A  57
ASP A  68
HIS A  71
PHE A  77
GLN A  85
VAL A  86
ILE A  87
TRP A  90
TYR A 113
LYS A 121
ILE A 122
PHE A 130
LEU B2031
SER B2035
ARG B2036
PHE B2039
THR B2098
TRP B2101
ASP B2102
TYR B2105
PHE B2108
 RAP A 201
4DRH_D_RAPD201 4drh RAP

DB00877
(Sirolimus) 		Homo sapiens PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
FKBP5;
SERINE/THREONINE-PRO
TEIN KINASE MTOR 		PF08771
(FRB_dom)
no annotation 		22 TYR D  57
ASP D  68
HIS D  71
PHE D  77
GLN D  85
VAL D  86
ILE D  87
TRP D  90
TYR D 113
PRO D 120
ILE D 122
PHE D 130
GLU B2022
LEU E2031
SER E2035
ARG E2036
PHE E2039
THR E2098
TRP E2101
ASP E2102
TYR E2105
PHE E2108
 RAP D 201
4DRI_A_RAPA201 4dri RAP

DB00877
(Sirolimus) 		Homo sapiens PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
FKBP5;
SERINE/THREONINE-PRO
TEIN KINASE MTOR 		PF00254
(FKBP_C)
PF08771
(FRB_dom) 		21 TYR A  57
ASP A  68
ARG A  73
PHE A  77
GLN A  85
VAL A  86
ILE A  87
TRP A  90
TYR A 113
ILE A 122
PHE A 130
LEU B2031
GLU B2032
SER B2035
ARG B2036
PHE B2039
THR B2098
TRP B2101
ASP B2102
TYR B2105
PHE B2108
 RAP A 201
4DRJ_A_RAPA201 4drj RAP

DB00877
(Sirolimus) 		Homo sapiens PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
FKBP4;
SERINE/THREONINE-PRO
TEIN KINASE MTOR 		PF00254
(FKBP_C)
PF08771
(FRB_dom) 		19 TYR A  57
ASP A  68
PHE A  77
GLU A  85
VAL A  86
ILE A  87
TRP A  90
TYR A 113
LYS A 121
ILE A 122
PHE A 130
LEU B2031
SER B2035
PHE B2039
THR B2098
TRP B2101
ASP B2102
TYR B2105
PHE B2108
 RAP A 201
4DVO_A_SORA404 4dvo SOR

DB01638
(Sorbitol) 		Streptomyces
rubiginosus 		XYLOSE ISOMERASE PF01261
(AP_endonuc_2) 		14 TRP A  16
HIS A  54
MET A  88
THR A  90
VAL A 135
TRP A 137
GLU A 181
LYS A 183
ASN A 215
GLU A 217
HIS A 220
ASP A 245
ASP A 255
ASP A 287
 SOR A 404
4DZ2_A_FK5A200 4dz2 FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Burkholderia
pseudomallei 		PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE 		PF00254
(FKBP_C)
no annotation 		11 TYR A  33
ASP A  44
ARG A  49
PHE A  53
MET B  61
VAL A  62
ILE A  63
TRP A  66
TYR A  89
ILE A  98
PHE A 106
 FK5 A 200
4DZ2_B_FK5B200 4dz2 FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Burkholderia
pseudomallei 		PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE 		PF00254
(FKBP_C)
no annotation 		11 TYR B  33
ASP B  44
ARG B  49
PHE B  53
MET A  61
VAL B  62
ILE B  63
TRP B  66
TYR B  89
ILE B  98
PHE B 106
 FK5 B 200
4DZ3_A_FK5A201 4dz3 FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Burkholderia
pseudomallei 		PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE 		PF00254
(FKBP_C) 		10 TYR A  33
ASP A  44
ARG A  49
PHE A  53
VAL A  62
ILE A  63
TRP A  66
TYR A  89
ILE A  98
PHE A 106
 FK5 A 201
4DZ3_B_FK5B201 4dz3 FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Burkholderia
pseudomallei 		PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE 		no annotation 10 TYR B  33
ASP B  44
ARG B  49
PHE B  53
VAL B  62
ILE B  63
TRP B  66
TYR B  89
ILE B  98
PHE B 106
 FK5 B 201
4G0U_B_ASWB1301 4g0u ASW

DB00276
(Amsacrine) 		Homo sapiens DNA TOPOISOMERASE
2-BETA 		no annotation 7 ILE B 454
PRO B 455
ARG B 503
GLY B 504
ALA B 521
GLU B 522
GLN B 778
 ASW B1301
4G0U_F_ASWF101 4g0u ASW

DB00276
(Amsacrine) 		;
Homo sapiens 		DNA TOPOISOMERASE
2-BETA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF01751
(Toprim)
PF16898
(TOPRIM_C)
no annotation 		6 PRO A 455
ARG A 503
GLY A 504
ALA A 521
GLU A 522
GLN A 778
 ASW F 101
4G0V_A_MIXA1301 4g0v MIX

DB01204
(Mitoxantrone) 		Homo sapiens DNA TOPOISOMERASE
2-BETA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF01751
(Toprim)
PF16898
(TOPRIM_C) 		7 ARG A 503
GLY A 504
ILE A 506
ASN A 520
GLU A 522
GLN A 778
MET A 782
 MIX A1301
4G0V_D_MIXD101 4g0v MIX

DB01204
(Mitoxantrone) 		;
Homo sapiens 		DNA TOPOISOMERASE
2-BETA 		no annotation 6 ARG B 503
GLY B 504
ASN B 520
GLU B 522
GLN B 778
MET B 782
 MIX D 101
4JUO_F_LFXF101 4juo LFX

DB01137
(Levofloxacin)
DB01165
(Ofloxacin) 		;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT A;
DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT B;
E-SITE DNA 		PF00204
(DNA_gyraseB)
PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
PF02518
(HATPase_c)
no annotation 		4 SER A  79
ARG C 456
GLY C 457
GLU C 474
 LFX F 101
4KOE_F_TR6F101 4koe TR6

DB00685
(Trovafloxacin) 		;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT A;
DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT B;
E-SITE DNA2 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		6 SER A  79
ARG B 117
GLY C 434
ASP C 435
ARG C 456
GLY C 457
 TR6 F 101
4KOE_H_TR6H101 4koe TR6

DB00685
(Trovafloxacin) 		;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT A;
DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT B;
E-SITE DNA4 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
no annotation 		7 SER B  79
ARG A 117
GLY D 434
ASP D 435
ARG D 456
GLY D 457
GLU D 475
 TR6 H 101
4LAX_A_FK5A301 4lax FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Homo sapiens PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
FKBP4 		PF00254
(FKBP_C) 		10 TYR A  57
ASP A  68
PHE A  77
VAL A  86
ILE A  87
TRP A  90
TYR A 113
LYS A 121
ILE A 122
PHE A 130
 FK5 A 301
4NNR_A_FK5A201 4nnr FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Homo sapiens PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
FKBP2 		PF00254
(FKBP_C)
no annotation 		12 TYR A  56
ASP A  67
PRO B  71
PHE A  76
VAL A  85
ILE A  86
TRP A  89
TYR A 112
ARG A 115
LYS A 120
ILE A 121
PHE A 129
 FK5 A 201
4NNR_B_FK5B201 4nnr FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Homo sapiens PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
FKBP2 		no annotation 10 TYR B  56
ASP B  67
PHE B  76
VAL B  85
ILE B  86
TRP B  89
TYR B 112
LYS B 120
ILE B 121
PHE B 129
 FK5 B 201
4ODO_A_FK5A205 4odo FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Thermus
thermophilus 		PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
SLYD 		PF00254
(FKBP_C)
no annotation 		14 THR C  10
ARG C  12
TYR A  13
LEU A  15
ASP A  23
GLU C  26
LEU A  27
LEU A  36
ILE A  37
LEU A  40
TYR A  63
LEU A 121
PHE A 128
VAL C 133
 FK5 A 205
4ODO_B_FK5B203 4odo FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Thermus
thermophilus 		PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
SLYD 		no annotation 13 TYR B  13
LEU B  15
ASP B  23
LEU B  27
LEU B  36
ILE B  37
LEU B  40
TYR B  63
ALA C  78
GLN C  94
GLY C  98
LEU B 121
PHE B 128
 FK5 B 203
4ODO_C_FK5C204 4odo FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Thermus
thermophilus 		PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
SLYD 		PF00254
(FKBP_C)
no annotation 		13 TYR C  13
LEU C  15
ASP C  23
LEU C  27
LEU C  36
ILE C  37
LEU C  40
TYR C  63
TYR A  92
GLN A  94
GLY B  98
LEU C 121
PHE C 128
 FK5 C 204
4ODR_A_FK5A201 4odr FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Homo sapiens;
Thermus
thermophilus 		PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
SLYD,
PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
FKBP1A CHIMERA 		PF00254
(FKBP_C)
no annotation 		12 TYR A  13
LEU A  15
ASP A  23
LEU A  27
LEU A  36
ILE A  37
LEU A  40
TYR A  63
ILE A  71
ILE A  72
PHE A  80
PRO B 102
 FK5 A 201
4ODR_B_FK5B201 4odr FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Homo sapiens;
Thermus
thermophilus 		PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
SLYD,
PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
FKBP1A CHIMERA 		PF00254
(FKBP_C)
no annotation 		11 TYR B  13
LEU B  15
ASP B  23
LEU B  27
LEU B  36
ILE B  37
LEU B  40
TYR B  63
ILE B  71
PHE B  80
PRO A 102
 FK5 B 201
4QT2_A_RAPA202 4qt2 RAP

DB00877
(Sirolimus) 		Plasmodium
falciparum 		FK506-BINDING
PROTEIN (FKBP)-TYPE
PEPTIDYL-PROPYL
ISOMERASE 		PF00254
(FKBP_C) 		10 TYR A  44
ASP A  56
PHE A  65
GLU A  73
VAL A  74
ILE A  75
TRP A  78
TYR A 101
ILE A 110
PHE A 118
 RAP A 202
4QT3_A_RAPA202 4qt3 RAP

DB00877
(Sirolimus) 		Plasmodium
falciparum 		FK506-BINDING
PROTEIN (FKBP)-TYPE
PEPTIDYL-PROPYL
ISOMERASE 		PF00254
(FKBP_C) 		10 TYR A  44
ASP A  56
PHE A  65
GLU A  73
VAL A  74
ILE A  75
TRP A  78
TYR A 101
ILE A 110
PHE A 118
 RAP A 202
4TNS_A_REAA201 4tns REA

DB00755
(Tretinoin) 		Homo sapiens PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
NIMA-INTERACTING 1 		PF00639
(Rotamase) 		9 HIS A  59
LYS A  63
ARG A  68
ARG A  69
MET A 130
GLN A 131
PHE A 134
SER A 154
HIS A 157
 REA A 201
4URN_A_NOVA2000 4urn NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Staphylococcus
aureus 		DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT 		PF02518
(HATPase_c)
no annotation 		14 ASP B  35
LYS B  36
ASN A  49
SER A  50
ASP A  52
GLU A  53
ASP A  76
ARG A  79
MET A  81
PRO A  82
ILE A  96
ARG A 138
THR A 168
ASN B 186
 NOV A2000
4URN_B_NOVB2000 4urn NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Staphylococcus
aureus 		DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT 		no annotation 11 ASN B  49
SER B  50
ASP B  52
GLU B  53
ASP B  76
ARG B  79
MET B  81
PRO B  82
ILE B  96
ARG B 138
THR B 168
 NOV B2000
4URN_C_NOVC2000 4urn NOV

DB01051
(Novobiocin) 		Staphylococcus
aureus 		DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT 		no annotation 11 ASN C  49
SER C  50
ASP C  52
GLU C  53
ASP C  76
ARG C  79
MET C  81
PRO C  82
ILE C  96
ARG C 138
THR C 168
 NOV C2000
4XIA_A_SORA400 4xia SOR

DB01638
(Sorbitol) 		Arthrobacter sp.
NRRL B3728 		D-XYLOSE ISOMERASE PF01261
(AP_endonuc_2) 		13 TRP A  15
HIS A  53
MET A  87
THR A  89
VAL A 134
TRP A 136
GLU A 180
LYS A 182
GLU A 216
HIS A 219
ASP A 244
ASP A 254
ASP A 292
 SOR A 400
4XIA_B_SORB400 4xia SOR

DB01638
(Sorbitol) 		Arthrobacter sp.
NRRL B3728 		D-XYLOSE ISOMERASE None 12 TRP B  15
HIS B  53
MET B  87
THR B  89
VAL B 134
TRP B 136
GLU B 180
LYS B 182
GLU B 216
HIS B 219
ASP B 244
ASP B 292
 SOR B 400
4Z3O_F_MFXF101 4z3o MFX

DB00218
(Moxifloxacin) 		Escherichia coli;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT
B,PARE30-PARC55
FUSED TOPO IV FROM
S. PNEUMONIAE;
E-SITE DNA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		5 ARG B 456
GLY B 457
GLU B 475
SER B1079
ARG A1117
 MFX F 101
4Z3O_H_MFXH101 4z3o MFX

DB00218
(Moxifloxacin) 		Escherichia coli;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT
B,PARE30-PARC55
FUSED TOPO IV FROM
S. PNEUMONIAE;
E-SITE DNA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		3 ARG A 456
GLU A 475
SER A1079
 MFX H 101
4Z53_F_TR6F101 4z53 TR6

DB00685
(Trovafloxacin) 		Escherichia coli;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT B,DNA
TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT A;
E-SITE DNA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		6 GLY A 434
ASP A 435
ARG A 456
GLY A 457
SER A1079
ARG B1117
 TR6 F 101
4Z53_H_TR6H101 4z53 TR6

DB00685
(Trovafloxacin) 		Escherichia coli;
Streptococcus
pneumoniae 		DNA TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT B,DNA
TOPOISOMERASE 4
SUBUNIT A;
E-SITE DNA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF00986
(DNA_gyraseB_C)
PF01751
(Toprim)
no annotation 		7 GLY B 434
ASP B 435
ARG B 456
GLY B 457
GLU B 475
SER B1079
ARG A1117
 TR6 H 101
5B8I_C_FK5C201 5b8i FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Coccidioides
immitis 		CALCINEURIN SUBUNIT
B, VARIANT;
PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE;
SERINE/THREONINE-PRO
TEIN PHOSPHATASE 		PF00149
(Metallophos)
PF00254
(FKBP_C)
PF13202
(EF-hand_5)
PF13499
(EF-hand_7) 		22 TYR C  36
ASP C  56
ARG C  61
PHE C  64
VAL C  73
ILE C  74
TRP C  77
TYR C 100
PHE C 105
LEU C 108
ILE C 109
LEU B 116
PHE C 117
MET B 119
VAL B 120
ASN B 123
LEU A 361
TRP A 370
SER A 371
PRO A 373
PHE A 374
GLU A 377
 FK5 C 201
5D75_A_FK5A301 5d75 FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Homo sapiens PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
FKBP3 		PF00254
(FKBP_C) 		11 TYR A 135
ASP A 146
LEU A 162
VAL A 171
ILE A 172
TRP A 175
TYR A 198
GLN A 203
ALA A 206
ILE A 208
PHE A 216
 FK5 A 301
5GPG_A_RAPA301 5gpg RAP

DB00877
(Sirolimus) 		Homo sapiens PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
FKBP3;
SERINE/THREONINE-PRO
TEIN KINASE MTOR 		PF00254
(FKBP_C)
PF08771
(FRB_dom) 		20 TYR A 135
ASP A 146
LEU A 162
LYS A 170
VAL A 171
ILE A 172
TRP A 175
TYR A 198
ALA A 206
ILE A 208
PHE A 216
LEU B2031
SER B2035
ARG B2036
PHE B2039
THR B2098
TRP B2101
ASP B2102
TYR B2105
PHE B2108
 RAP A 301
5GWK_D_EVPD102 5gwk EVP

DB00773
(Etoposide) 		Homo sapiens;
synthetic
construct 		DNA TOPOISOMERASE
2-ALPHA 		no annotation 4 GLY B 462
ASP B 463
ARG B 487
MET B 766
 EVP D 102
5GWK_F_EVPF102 5gwk EVP

DB00773
(Etoposide) 		Homo sapiens;
synthetic
construct 		DNA TOPOISOMERASE
2-ALPHA 		PF00521
(DNA_topoisoIV)
PF01751
(Toprim)
PF16898
(TOPRIM_C)
no annotation 		5 GLY A 462
ASP A 463
ARG A 487
MET A 762
MET A 766
 EVP F 102
5HKG_A_RAPA201 5hkg RAP

DB00877
(Sirolimus) 		Homo sapiens PEPTIDYL-PROLYL
CIS-TRANS ISOMERASE
FKBP1B 		PF00254
(FKBP_C) 		13 TYR A  26
ASP A  37
PHE A  46
GLN A  53
GLU A  54
VAL A  55
ILE A  56
PHE A  59
TYR A  82
HIS A  87
VAL A  90
ILE A  91
PHE A  99
 RAP A 201
5NHA_A_SORA503 5nha SOR

DB01638
(Sorbitol) 		Piromyces sp. E2 XYLOSE ISOMERASE PF01261
(AP_endonuc_2) 		9 TRP A  50
HIS A 102
TRP A 140
TRP A 189
GLU A 233
GLU A 269
HIS A 272
ASP A 297
ASP A 340
 SOR A 503
5NHA_B_SORB503 5nha SOR

DB01638
(Sorbitol) 		Piromyces sp. E2 XYLOSE ISOMERASE None 9 TRP B  50
HIS B 102
TRP B 140
TRP B 189
GLU B 233
GLU B 269
HIS B 272
ASP B 297
ASP B 340
 SOR B 503
5NHA_C_SORC503 5nha SOR

DB01638
(Sorbitol) 		Piromyces sp. E2 XYLOSE ISOMERASE None 9 TRP C  50
HIS C 102
TRP C 140
TRP C 189
GLU C 233
GLU C 269
HIS C 272
ASP C 297
ASP C 340
 SOR C 503
5NHA_D_SORD503 5nha SOR

DB01638
(Sorbitol) 		Piromyces sp. E2 XYLOSE ISOMERASE None 9 TRP D  50
HIS D 102
TRP D 140
TRP D 189
GLU D 233
GLU D 269
HIS D 272
ASP D 297
ASP D 340
 SOR D 503
5XIM_A_SORA397 5xim SOR

DB01638
(Sorbitol) 		Actinoplanes
missouriensis 		D-XYLOSE ISOMERASE None
PF01261
(AP_endonuc_2) 		13 TRP A  16
PHE B  26
HIS A  54
THR A  90
VAL A 135
TRP A 137
GLU A 181
LYS A 183
GLU A 217
HIS A 220
ASP A 245
ASP A 255
ASP A 292
 SOR A 397
5XIM_B_SORB397 5xim SOR

DB01638
(Sorbitol) 		Actinoplanes
missouriensis 		D-XYLOSE ISOMERASE None
PF01261
(AP_endonuc_2) 		14 TRP B  16
PHE A  26
HIS B  54
MET B  88
THR B  90
VAL B 135
TRP B 137
GLU B 181
LYS B 183
GLU B 217
HIS B 220
ASP B 245
ASP B 255
ASP B 292
 SOR B 397
5XIM_C_SORC397 5xim SOR

DB01638
(Sorbitol) 		Actinoplanes
missouriensis 		D-XYLOSE ISOMERASE None 13 TRP C  16
PHE D  26
HIS C  54
THR C  90
VAL C 135
TRP C 137
GLU C 181
LYS C 183
GLU C 217
HIS C 220
ASP C 245
ASP C 255
ASP C 292
 SOR C 397
5XIM_D_SORD397 5xim SOR

DB01638
(Sorbitol) 		Actinoplanes
missouriensis 		D-XYLOSE ISOMERASE None 14 TRP D  16
PHE C  26
HIS D  54
MET D  88
THR D  90
VAL D 135
TRP D 137
GLU D 181
LYS D 183
GLU D 217
HIS D 220
ASP D 245
ASP D 255
ASP D 292
 SOR D 397
6MKE_A_FK5A201 6mke FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Naegleria fowleri PEPTIDYLPROLYL
ISOMERASE 		None
PF00254
(FKBP_C) 		12 TYR A  38
ASP A  49
ARG A  54
PHE A  58
VAL A  67
ILE A  68
TRP A  71
TYR D  94
TYR A  94
ILE D  99
ILE A 103
PHE A 111
 FK5 A 201
6MKE_B_FK5B201 6mke FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Naegleria fowleri PEPTIDYLPROLYL
ISOMERASE 		None 12 TYR B  38
ASP B  49
ARG B  54
PHE B  58
VAL B  67
ILE B  68
TRP B  71
TYR B  94
TYR C  94
ILE C  99
ILE B 103
PHE B 111
 FK5 B 201
6MKE_C_FK5C201 6mke FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Naegleria fowleri PEPTIDYLPROLYL
ISOMERASE 		None 14 TYR C  38
ASP B  49
ASP C  49
ARG C  54
PHE C  58
VAL C  67
ILE C  68
TRP C  71
TYR C  94
ILE B  99
PRO B 100
LEU B 102
ILE C 103
PHE C 111
 FK5 C 201
6MKE_D_FK5D201 6mke FK5

DB00864
(Tacrolimus) 		Naegleria fowleri PEPTIDYLPROLYL
ISOMERASE 		None
PF00254
(FKBP_C) 		14 TYR D  38
ASP D  49
ASP A  49
ARG D  54
PHE D  58
VAL D  67
ILE D  68
TRP D  71
TYR D  94
ILE A  99
PRO A 100
LEU A 102
ILE D 103
PHE D 111
 FK5 D 201