DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1KLM_A_SPPA999 1klm SPP

DB00705
(Delavirdine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		11 LEU A 100
LYS A 102
VAL A 106
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 226
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
PRO A 236
TYR A 318
 SPP A 999
1LW0_A_NVPA999 1lw0 NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		10 LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 NVP A 999
1LWC_A_NVPA999 1lwc NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		11 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 NVP A 999
1LWE_A_NVPA999 1lwe NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		7 LEU A 100
VAL A 106
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
TYR A 318
 NVP A 999
1LWF_A_NVPA999 1lwf NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		9 LEU A 100
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 NVP A 999
1VRT_A_NVPA999 1vrt NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		9 LEU A 100
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 NVP A 999
3HVT_A_NVPA557 3hvt NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE
(SUBUNIT P66) 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		9 LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 319
 NVP A 557
3QIP_A_NVPA561 3qip NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		REVERSE HIV-1
REVERSE
TRANSCRIPTASE P66 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		10 LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
GLY A 190
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 NVP A 561
3V81_A_NVPA901 3v81 NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE P66
SUBUNIT 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		8 LEU A 100
LYS A 103
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 NVP A 901
3V81_C_NVPC901 3v81 NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE P66
SUBUNIT 		no annotation 8 LEU C 100
VAL C 106
VAL C 179
TYR C 181
TYR C 188
TRP C 229
LEU C 234
TYR C 318
 NVP C 901
4PUO_A_NVPA901 4puo NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE, P66
SUBUNIT 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		9 PRO A  95
LEU A 100
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 NVP A 901
4PUO_C_NVPC901 4puo NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE, P66
SUBUNIT 		no annotation 8 LEU C 100
VAL C 106
VAL C 179
TYR C 181
TYR C 188
TRP C 229
LEU C 234
TYR C 318
 NVP C 901
4PWD_A_NVPA901 4pwd NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE, P66
SUBUNIT 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		8 PRO A  95
LEU A 100
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
TRP A 229
LEU A 234
 NVP A 901
4PWD_C_NVPC901 4pwd NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE, P66
SUBUNIT 		no annotation 8 LEU C 100
VAL C 106
VAL C 179
TYR C 181
TYR C 188
TRP C 229
LEU C 234
TYR C 318
 NVP C 901
4Q0B_A_NVPA901 4q0b NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE, P66
SUBUNIT 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		8 LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
TRP A 229
LEU A 234
 NVP A 901
4Q0B_C_NVPC901 4q0b NVP

DB00238
(Nevirapine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE, P66
SUBUNIT 		no annotation 9 LEU C 100
LYS C 103
VAL C 106
VAL C 179
TYR C 181
TYR C 188
TRP C 229
LEU C 234
TYR C 318
 NVP C 901
5CYM_A_T27A601 5cym T27

DB08864
(Rilpivirine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE, P51
SUBUNIT;
HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE, P66
SUBUNIT 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		13 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 101
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 T27 A 601
5CYQ_A_T27A601 5cyq T27

DB08864
(Rilpivirine) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE, P51
SUBUNIT;
HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE, P66
SUBUNIT 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		13 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 101
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
 T27 A 601
5HP1_A_PPFA602 5hp1 PPF

DB00529
(Foscarnet) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE P66
SUBUNIT 		PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb) 		6 LYS A  65
ARG A  72
ASP A 110
GLY A 112
ASP A 113
ASP A 185
 PPF A 602
5HP1_C_PPFC601 5hp1 PPF

DB00529
(Foscarnet) 		Human
immunodeficiency
virus 1 		HIV-1 REVERSE
TRANSCRIPTASE P66
SUBUNIT 		no annotation 6 LYS C  65
ARG C  72
ASP C 110
GLY C 112
ASP C 185
LYS C 220
 PPF C 601