DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'GENOME POLYPROTEIN'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
2PXC_A_SAMA500 2pxc SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Murray Valley
encephalitis
virus 		GENOME POLYPROTEIN
[CONTAINS: CAPSID
PROTEIN C (CORE
PROTEIN);
ENVELOPE PROTEIN M
(MATRIX PROTEIN);
MAJOR ENVELOPE
PROTEIN E;
NON-STRUCTURAL
PROTEIN 1 (NS1);
NON-STRUCTURAL
PROTEIN 2A (NS2A);
FLAVIVIRIN PROTEASE
NS2B REGULATORY
SUBUNIT;
FLAVIVIRIN PROTEASE
NS3 CATALYTIC
SUBUNIT;
NON-STRUCTURAL
PROTEIN 4A (NS4A);
NON-STRUCTURAL
PROTEIN 4B (NS4B);
RNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE (EC
2.7.7.48) (NS5)] 		PF01728
(FtsJ) 		14 SER A  56
GLY A  58
GLY A  81
GLY A  83
GLY A  86
TRP A  87
THR A 104
LYS A 105
HIS A 110
GLU A 111
ASP A 131
VAL A 132
ASP A 146
ILE A 147
 SAM A 500
3KEE_A_30BA500 3kee 30B

DB06290
(Simeprevir) 		Hepacivirus C GENOME POLYPROTEIN PF02907
(Peptidase_S29) 		16 GLN A  41
PHE A  43
TYR A  56
HIS A  57
GLY A  58
ASP A  81
VAL A 132
LYS A 136
GLY A 137
SER A 139
PHE A 154
ARG A 155
ALA A 156
ALA A 157
CYS A 159
ASP A 168
 30B A 500
3KEE_B_30BB500 3kee 30B

DB06290
(Simeprevir) 		Hepacivirus C GENOME POLYPROTEIN no annotation 15 GLN B  41
PHE B  43
TYR B  56
HIS B  57
GLY B  58
ASP B  81
VAL B 132
LEU B 135
LYS B 136
GLY B 137
SER B 139
PHE B 154
ARG B 155
ALA B 156
ALA B 157
 30B B 500
3KEE_C_30BC500 3kee 30B

DB06290
(Simeprevir) 		Hepacivirus C GENOME POLYPROTEIN no annotation 16 GLN C  41
PHE C  43
TYR C  56
HIS C  57
GLY C  58
ASP C  81
VAL C 132
LEU C 135
LYS C 136
GLY C 137
SER C 139
PHE C 154
ARG C 155
ALA C 156
ALA C 157
ASP C 168
 30B C 500
3KEE_D_30BD500 3kee 30B

DB06290
(Simeprevir) 		Hepacivirus C GENOME POLYPROTEIN no annotation 16 GLN D  41
PHE D  43
TYR D  56
HIS D  57
GLY D  58
ASP D  81
VAL D 132
LEU D 135
LYS D 136
GLY D 137
SER D 139
PHE D 154
ARG D 155
ALA D 156
ALA D 157
ASP D 168
 30B D 500
5E9Q_A_SAMA301 5e9q SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Dengue virus GENOME POLYPROTEIN PF01728
(FtsJ) 		14 SER A  56
GLY A  58
GLY A  81
GLY A  83
GLY A  86
TRP A  87
THR A 104
LYS A 105
HIS A 110
GLU A 111
ASP A 131
VAL A 132
ASP A 146
ILE A 147
 SAM A 301
5E9Q_C_SAMC4000 5e9q SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Dengue virus GENOME POLYPROTEIN None 14 SER C  56
GLY C  58
GLY C  81
GLY C  83
GLY C  86
TRP C  87
THR C 104
LYS C 105
HIS C 110
GLU C 111
ASP C 131
VAL C 132
ASP C 146
ILE C 147
 SAM C4000
5EC8_A_SAMA301 5ec8 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Dengue virus GENOME POLYPROTEIN PF01728
(FtsJ) 		14 SER A  56
GLY A  58
GLY A  81
GLY A  83
GLY A  86
TRP A  87
THR A 104
LYS A 105
HIS A 110
GLU A 111
ASP A 131
VAL A 132
ASP A 146
ILE A 147
 SAM A 301
5EC8_C_SAMC4000 5ec8 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Dengue virus GENOME POLYPROTEIN None 14 SER C  56
GLY C  58
GLY C  81
GLY C  83
GLY C  86
TRP C  87
THR C 104
LYS C 105
HIS C 110
GLU C 111
ASP C 131
VAL C 132
ASP C 146
ILE C 147
 SAM C4000
5EIF_A_SAMA301 5eif SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Dengue virus GENOME POLYPROTEIN PF01728
(FtsJ) 		14 SER A  56
GLY A  58
GLY A  81
GLY A  83
GLY A  86
TRP A  87
THR A 104
LYS A 105
HIS A 110
GLU A 111
ASP A 131
VAL A 132
ASP A 146
ILE A 147
 SAM A 301
5EIF_C_SAMC4000 5eif SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Dengue virus GENOME POLYPROTEIN None 14 SER C  56
GLY C  58
GLY C  81
GLY C  83
GLY C  86
TRP C  87
THR C 104
LYS C 105
HIS C 110
GLU C 111
ASP C 131
VAL C 132
ASP C 146
ILE C 147
 SAM C4000
5KQS_A_SAMA307 5kqs SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Zika virus GENOME POLYPROTEIN PF01728
(FtsJ) 		13 SER A  56
GLY A  58
GLY A  81
GLY A  83
GLY A  86
TRP A  87
THR A 104
LYS A 105
HIS A 110
ASP A 131
VAL A 132
ASP A 146
ILE A 147
 SAM A 307
5MFX_A_ACTA701 5mfx ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Zika virus GENOME POLYPROTEIN PF00271
(Flavi_DEAD)
PF07652
(Helicase_C) 		5 ARG A 323
THR A 449
HIS A 450
ALA A 478
ASP A 481
 ACT A 701