DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'GAG-POL POLYPROTEIN'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
2B60_B_RITB100 2b60 RIT

DB00503
(Ritonavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
GAG-POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation
23 ARG B   8
ARG A   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ILE B  32
ILE A  32
ILE A  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
ALA B  82
ALA A  82
ILE A  84
ILE B  84
RIT B 100
3JVY_B_017B401 3jvy 017

DB01264
(Darunavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
GAG-POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation
26 LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  32
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
017 B 401
3JW2_A_017A401 3jw2 017

DB01264
(Darunavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
GAG-POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation
26 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  32
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
017 A 401
4IFV_A_T27A601 4ifv T27

DB08864
(Rilpivirine)
Human
immunodeficiency
virus 1
EXORIBONUCLEASE H,
P66 RT;
GAG-POL POLYPROTEIN
PF00075
(RNase_H)
PF00078
(RVT_1)
PF06815
(RVT_connect)
PF06817
(RVT_thumb)
14 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
PRO A 236
TYR A 318
T27 A 601
6ELI_A_T27A701 6eli T27

DB08864
(Rilpivirine)
Human
immunodeficiency
virus 1
GAG-POL POLYPROTEIN;
REVERSE
TRANSCRIPTASE
no annotation 13 PRO A  95
LEU A 100
LYS A 103
VAL A 106
GLU B 138
VAL A 179
TYR A 181
TYR A 188
PRO A 225
PHE A 227
TRP A 229
LEU A 234
TYR A 318
T27 A 701