DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'EPSIN'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1RL8_A_RITA9001 1rl8 RIT

DB00503
(Ritonavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation
24 ARG B   8
ARG A   8
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL A  32
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
ALA B  82
ALA A  82
ILE A  84
ILE B  84
RIT A9001
1SDT_B_MK1B902 1sdt MK1

DB00224
(Indinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation
22 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ILE A  47
GLY A  48
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
MK1 B 902
1SDU_B_MK1B902 1sdu MK1

DB00224
(Indinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation
24 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ALA A  28
ILE A  47
GLY A  48
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ARG B 108
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
MK1 B 902
1SDV_B_MK1B902 1sdv MK1

DB00224
(Indinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation
21 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ALA A  28
ILE A  47
GLY A  48
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
ILE A  84
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
ILE B 184
MK1 B 902
1T3R_A_017A1200 1t3r 017

DB01264
(Darunavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation
21 ARG B   8
LEU B  23
LEU A  23
ASP B  25
ASP A  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ASP B  30
VAL B  32
ILE A  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE B  84
017 A1200
2PYM_A_1UNA1001 2pym 1UN

DB00220
(Nelfinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation
29 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASN A  30
ASN B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
THR B  80
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
1UN A1001
2PYN_A_1UNA1001 2pyn 1UN

DB00220
(Nelfinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation
29 ARG B   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASN A  30
ASN B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
THR B  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
1UN A1001
2Q63_A_1UNA1001 2q63 1UN

DB00220
(Nelfinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation
30 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASN A  30
ASN B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
THR B  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
1UN A1001
2Q64_B_1UNB1001 2q64 1UN

DB00220
(Nelfinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation
30 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASN A  30
ASN B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
THR B  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
1UN B1001
2QAK_A_1UNA1001 2qak 1UN

DB00220
(Nelfinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation
30 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASN A  30
ASN B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
THR B  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
1UN A1001
2QHC_B_AB1B9001 2qhc AB1

DB01601
(Lopinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation
23 ARG B   8
ARG A   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
AB1 B9001
2RKF_A_AB1A501 2rkf AB1

DB01601
(Lopinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation
25 ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
ILE B  32
ILE A  32
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
ALA B  82
ALA A  82
ILE A  84
ILE B  84
AB1 A 501
2RKG_B_AB1B501 2rkg AB1

DB01601
(Lopinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation
24 LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
ILE B  32
ILE A  32
VAL A  48
VAL B  48
GLY A  50
GLY B  50
ILE B  51
ILE A  51
PRO B  82
PRO A  82
ILE A  85
ILE B  85
AB1 B 501
3AI8_A_HNQA255 3ai8 HNQ

DB01422
(Nitroxoline)
Homo sapiens CATHEPSIN B PF00112
(Peptidase_C1)
7 GLN A  23
GLY A  27
HIS A 110
HIS A 111
CYS A 119
HIS A 199
TRP A 221
HNQ A 255
3AI8_B_HNQB255 3ai8 HNQ

DB01422
(Nitroxoline)
Homo sapiens CATHEPSIN B no annotation 6 GLN B  23
GLY B  27
HIS B 110
HIS B 111
CYS B 119
TRP B 221
HNQ B 255
3BVB_B_017B401 3bvb 017

DB01264
(Darunavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE
(RETROPEPSIN)
PF00077
(RVP)
no annotation
26 ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASN B  25
ASN A  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
017 B 401
3PRS_A_RITA1001 3prs RIT

DB00503
(Ritonavir)
Cryphonectria
parasitica
ENDOTHIAPEPSIN PF00026
(Asp)
22 ILE A  10
ASP A  11
ASP A  15
ALA A  16
ASP A  33
ASP A  35
GLY A  37
ILE A  77
TYR A  79
GLY A  80
ASP A  81
ASP A 119
LEU A 125
THR A 135
PHE A 194
ILE A 217
ASP A 219
THR A 222
THR A 223
TYR A 226
ILE A 300
ILE A 304
RIT A1001
3PWW_A_ROCA1001 3pww ROC

DB01232
(Saquinavir)
Cryphonectria
parasitica
ENDOTHIAPEPSIN PF00026
(Asp)
20 ILE A  10
ASP A  15
ASP A  33
ASP A  35
GLY A  37
SER A  38
ILE A  77
TYR A  79
GLY A  80
ASP A  81
SER A  83
PHE A 116
LEU A 125
PHE A 194
ILE A 217
ASP A 219
THR A 222
THR A 223
TYR A 226
ILE A 304
ROC A1001
3Q70_A_RITA2001 3q70 RIT

DB00503
(Ritonavir)
Candida albicans CANDIDAPEPSIN-2 PF00026
(Asp)
18 THR A  13
ILE A  30
ASP A  32
GLY A  34
SER A  35
ILE A  82
TYR A  84
GLY A  85
SER A  88
ILE A 119
ASP A 120
ASN A 131
GLU A 193
ASP A 218
THR A 221
THR A 222
TYR A 225
ILE A 305
RIT A2001
4Y4D_A_CFFA411 4y4d CFF

DB00201
(Caffeine)
Cryphonectria
parasitica
ENDOTHIAPEPSIN PF00026
(Asp)
6 LEU A  13
ASP A  15
LEU A 224
PHE A 280
ILE A 283
PHE A 291
CFF A 411
4Y4J_A_LNRA412 4y4j LNR

DB00368
(Norepinephrine)
Cryphonectria
parasitica
ENDOTHIAPEPSIN PF00026
(Asp)
9 ASP A  33
ASP A  35
TYR A  79
ASP A  81
SER A  83
SER A 115
PHE A 116
ASP A 119
LEU A 125
LNR A 412