DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'CYTOCHROME B'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1KB9_A_PCFA514 1kb9 PCF

DB09114
(Colfosceril
palmitate) 		Saccharomyces
cerevisiae 		CYTOCHROME B;
CYTOCHROME C1, HEME
PROTEIN;
UBIQUINOL-CYTOCHROME
C REDUCTASE COMPLEX
CORE PROTEIN I;
UBIQUINOL-CYTOCHROME
C REDUCTASE
IRON-SULFUR SUBUNIT 		PF00032
(Cytochrome_B)
PF00033
(Cytochrom_B_C)
PF00355
(UCR_TM)
PF02921
(Rieske)
PF00675
(Peptidase_M16_C)
PF05193
(Peptidase_M16)
PF02167
(Cytochrom_C1) 		8 VAL E  60
MET E  63
SER E  67
HIS C 222
ILE C 226
PHE C 227
LYS D 291
SER A 450
 PCF A 514
3SFE_C_TMGC1 3sfe TMG

DB00730
(Thiabendazole) 		Sus scrofa SUCCINATE
DEHYDROGENASE
CYTOCHROME B560
SUBUNIT,
MITOCHONDRIAL;
SUCCINATE
DEHYDROGENASE
[UBIQUINONE]
IRON-SULFUR SUBUNIT,
MITOCHONDRIAL 		PF01127
(Sdh_cyt)
PF13085
(Fer2_3)
PF13534
(Fer4_17) 		8 TRP C  35
MET C  39
SER C  42
ILE C  43
ARG C  46
PRO B 169
HIS B 216
ILE B 218
 TMG C   1
4IAQ_A_2GMA2001 4iaq 2GM

DB00320
(Dihydroergotamine) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		CHIMERA PROTEIN OF
HUMAN
5-HYDROXYTRYPTAMINE
RECEPTOR 1B AND E.
COLI SOLUBLE
CYTOCHROME B562 		PF00001
(7tm_1)
PF07361
(Cytochrom_B562) 		18 TRP A 125
LEU A 126
ASP A 129
ILE A 130
CYS A 133
THR A 134
VAL A 200
VAL A 201
SER A 212
ALA A 216
TRP A 327
PHE A 330
PHE A 331
MET A 337
LEU A 348
PHE A 351
ASP A 352
THR A 355
 2GM A2001
4IAR_A_ERMA2001 4iar ERM

DB00696
(Ergotamine) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		CHIMERA PROTEIN OF
HUMAN
5-HYDROXYTRYPTAMINE
RECEPTOR 1B AND E.
COLI SOLUBLE
CYTOCHROME B562 		PF00001
(7tm_1)
PF07361
(Cytochrom_B562) 		19 TRP A 125
LEU A 126
ASP A 129
ILE A 130
CYS A 133
THR A 134
VAL A 200
VAL A 201
SER A 212
ALA A 216
TRP A 327
PHE A 330
PHE A 331
SER A 334
MET A 337
LEU A 348
PHE A 351
ASP A 352
THR A 355
 ERM A2001
4IB4_A_ERMA2001 4ib4 ERM

DB00696
(Ergotamine) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		CHIMERA PROTEIN OF
HUMAN
5-HYDROXYTRYPTAMINE
RECEPTOR 2B AND E.
COLI SOLUBLE
CYTOCHROME B562 		PF00001
(7tm_1)
PF07361
(Cytochrom_B562) 		19 LEU A 132
ASP A 135
VAL A 136
SER A 139
THR A 140
VAL A 208
LEU A 209
LYS A 211
MET A 218
ALA A 225
TRP A 337
PHE A 340
PHE A 341
ASN A 344
LEU A 347
VAL A 348
GLN A 359
LEU A 362
VAL A 366
 ERM A2001
4NC3_A_ERMA1202 4nc3 ERM

DB00696
(Ergotamine) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		CHIMERA PROTEIN OF
HUMAN
5-HYDROXYTRYPTAMINE
RECEPTOR 2B AND E.
COLI SOLUBLE
CYTOCHROME B562 		PF00001
(7tm_1)
PF07361
(Cytochrom_B562) 		18 LEU A 132
ASP A 135
VAL A 136
SER A 139
THR A 140
VAL A 208
LEU A 209
PHE A 217
MET A 218
ALA A 225
TRP A 337
PHE A 340
ASN A 344
LEU A 347
GLN A 359
LEU A 362
GLU A 363
VAL A 366
 ERM A1202
4PD4_C_AOQC4003 4pd4 AOQ

DB01117
(Atovaquone) 		Saccharomyces
cerevisiae 		CYTOCHROME B PF00032
(Cytochrom_B_C)
PF00033
(Cytochrome_B) 		12 PHE C 129
GLY C 143
VAL C 146
ILE C 147
ILE C 269
PRO C 271
LEU C 275
PHE C 278
TYR C 279
LEU C 282
MET C 295
ILE C 299
 AOQ C4003
4ZUD_A_OLMA1201 4zud OLM

DB00275
(Olmesartan) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		CHIMERA PROTEIN OF
SOLUBLE CYTOCHROME
B562 AND TYPE-1
ANGIOTENSIN II
RECEPTOR 		PF00001
(7tm_1)
PF07361
(Cytochrom_B562) 		9 TYR A  35
PHE A  77
TRP A  84
VAL A 108
SER A 109
LEU A 112
ARG A 167
ILE A 288
TYR A 292
 OLM A1201
5KKZ_A_ASCA1004 5kkz ASC

DB00126
(Vitamin
C) 		Rhodobacter
sphaeroides 		CYTOCHROME B;
UBIQUINOL-CYTOCHROME
C REDUCTASE
IRON-SULFUR SUBUNIT 		None
PF00032
(Cytochrom_B_C)
PF00033
(Cytochrome_B) 		6 HIS G 152
HIS A 291
VAL A 293
TYR A 302
ARG A 306
GLN A 384
 ASC A1004
5KKZ_E_ASCE1004 5kkz ASC

DB00126
(Vitamin
C) 		Rhodobacter
sphaeroides 		CYTOCHROME B;
UBIQUINOL-CYTOCHROME
C REDUCTASE
IRON-SULFUR SUBUNIT 		None
PF00355
(UCR_Fe-S_N)
PF10399
(Rieske) 		7 HIS C 152
HIS E 291
ILE E 292
VAL E 293
TYR E 302
ARG E 306
GLN E 384
 ASC E1004
5KKZ_K_ASCK1004 5kkz ASC

DB00126
(Vitamin
C) 		Rhodobacter
sphaeroides 		CYTOCHROME B;
UBIQUINOL-CYTOCHROME
C REDUCTASE
IRON-SULFUR SUBUNIT 		None 7 HIS Q 152
HIS K 291
ILE K 292
VAL K 293
TYR K 302
ARG K 306
GLN K 384
 ASC K1004
5KKZ_O_ASCO1004 5kkz ASC

DB00126
(Vitamin
C) 		Rhodobacter
sphaeroides 		CYTOCHROME B;
UBIQUINOL-CYTOCHROME
C REDUCTASE
IRON-SULFUR SUBUNIT 		None 7 HIS M 152
HIS O 291
ILE O 292
VAL O 293
TYR O 302
ARG O 306
GLN O 384
 ASC O1004
5L7I_A_VISA1202 5l7i VIS

DB08828
(Vismodegib) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		SMOOTHENED
HOMOLOG,SOLUBLE
CYTOCHROME
B562,SMOOTHENED
HOMOLOG 		PF01392
(Fz)
PF01534
(Frizzled)
PF07361
(Cytochrom_B562) 		14 ASN A 219
LEU A 221
TRP A 281
ASP A 384
VAL A 386
SER A 387
TYR A 394
ARG A 400
GLN A 477
PHE A 484
GLU A 518
ASN A 521
LEU A 522
MET A 525
 VIS A1202
5L7I_B_VISB1202 5l7i VIS

DB08828
(Vismodegib) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		SMOOTHENED
HOMOLOG,SOLUBLE
CYTOCHROME
B562,SMOOTHENED
HOMOLOG 		no annotation 14 LEU B 221
TRP B 281
ASP B 384
SER B 387
TYR B 394
ARG B 400
ASP B 473
GLN B 477
TRP B 480
PRO B 513
GLU B 518
ASN B 521
LEU B 522
MET B 525
 VIS B1202
5MZJ_A_TEPA2401 5mzj TEP

DB00277
(Theophylline) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		ADENOSINE RECEPTOR
A2A,SOLUBLE
CYTOCHROME
B562,ADENOSINE
RECEPTOR A2A 		PF00001
(7tm_1)
PF07361
(Cytochrom_B562) 		8 LEU A  85
PHE A 168
GLU A 169
MET A 177
LEU A 249
ASN A 253
MET A 270
ILE A 274
 TEP A2401
5MZP_A_CFFA2401 5mzp CFF

DB00201
(Caffeine) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		ADENOSINE RECEPTOR
A2A,SOLUBLE
CYTOCHROME
B562,ADENOSINE
RECEPTOR A2A 		PF00001
(7tm_1)
PF07361
(Cytochrom_B562) 		9 ILE A  66
VAL A  84
PHE A 168
GLU A 169
MET A 177
LEU A 249
ASN A 253
MET A 270
ILE A 274
 CFF A2401
5TUD_A_ERMA2001 5tud ERM

DB00696
(Ergotamine) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		5-HYDROXYTRYPTAMINE
RECEPTOR 2B,SOLUBLE
CYTOCHROME B562
CHIMERA 		PF00001
(7tm_1)
PF07361
(Cytochrom_B562) 		19 LEU A 132
ASP A 135
VAL A 136
SER A 139
THR A 140
VAL A 208
LEU A 209
LYS A 211
MET A 218
ALA A 225
PHE A 340
PHE A 341
ASN A 344
LEU A 347
VAL A 348
GLN A 359
LEU A 362
GLU A 363
VAL A 366
 ERM A2001
5TUD_D_ERMD1201 5tud ERM

DB00696
(Ergotamine) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		5-HYDROXYTRYPTAMINE
RECEPTOR 2B,SOLUBLE
CYTOCHROME B562
CHIMERA 		no annotation 18 LEU D 132
ASP D 135
VAL D 136
SER D 139
THR D 140
VAL D 208
LEU D 209
MET D 218
ALA D 225
PHE D 340
PHE D 341
ASN D 344
LEU D 347
VAL D 348
GLN D 359
LEU D 362
GLU D 363
VAL D 366
 ERM D1201
5UIG_A_EDTA501 5uig EDT

DB00974
(Edetic
Acid) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		ADENOSINE RECEPTOR
A2A,SOLUBLE
CYTOCHROME
B562,ADENOSINE
RECEPTOR A2A 		PF00001
(Cytochrom_B562)
PF07361
(7tm_1) 		6 ASN A  39
THR A  41
ASN A  42
ARG A 102
ILE A 292
GLU A 294
 EDT A 501
5ZLG_A_ASCA404 5zlg ASC

DB00126
(Vitamin
C) 		Homo sapiens CYTOCHROME B
REDUCTASE 1 		PF03188
(Cytochrom_B561) 		4 PHE A  47
HIS A 108
LYS A 181
PHE A 184
 ASC A 404
5ZLG_A_ASCA405 5zlg ASC

DB00126
(Vitamin
C) 		Homo sapiens CYTOCHROME B
REDUCTASE 1 		PF03188
(Cytochrom_B561) 		4 LYS A  79
LYS A  83
ARG A 152
MET A 156
 ASC A 405
6A93_A_8NUA3001 6a93 8NU

DB00734
(Risperidone) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		5-HYDROXYTRYPTAMINE
RECEPTOR 2A,SOLUBLE
CYTOCHROME B562 		PF00001
(7tm_1) 		14 SER A 131
TRP A 151
ASP A 155
SER A 159
THR A 160
ILE A 163
LEU A 228
PHE A 332
TRP A 336
PHE A 339
PHE A 340
LEU A 362
ASN A 363
TYR A 370
 8NU A3001
6A93_B_8NUB3001 6a93 8NU

DB00734
(Risperidone) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		5-HYDROXYTRYPTAMINE
RECEPTOR 2A,SOLUBLE
CYTOCHROME B562 		None 17 SER B 131
TYR B 139
TRP B 151
ASP B 155
VAL B 156
SER B 159
THR B 160
ILE B 163
LEU B 228
PHE B 332
TRP B 336
PHE B 339
PHE B 340
LEU B 362
ASN B 363
VAL B 366
TYR B 370
 8NU B3001
6A94_A_ZOTA3001 6a94 ZOT

DB09225
(Zotepine) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		5-HYDROXYTRYPTAMINE
RECEPTOR 2A,SOLUBLE
CYTOCHROME B562 		PF00001
(7tm_1) 		13 TRP A 151
ASP A 155
SER A 159
LEU A 229
VAL A 235
GLY A 238
SER A 242
PHE A 332
TRP A 336
PHE A 339
PHE A 340
ASN A 343
VAL A 366
 ZOT A3001
6A94_B_ZOTB3001 6a94 ZOT

DB09225
(Zotepine) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		5-HYDROXYTRYPTAMINE
RECEPTOR 2A,SOLUBLE
CYTOCHROME B562 		None 13 ASP B 155
VAL B 156
SER B 159
THR B 160
LEU B 229
VAL B 235
GLY B 238
SER B 242
PHE B 332
TRP B 336
PHE B 339
PHE B 340
VAL B 366
 ZOT B3001
6AK3_A_P2EA1201 6ak3 P2E

DB00917
(Dinoprostone) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		PROSTAGLANDIN E2
RECEPTOR EP3
SUBTYPE,SOLUBLE
CYTOCHROME B562 		PF00001
(7tm_1) 		16 PRO A  55
MET A  58
GLN A 103
THR A 106
THR A 107
VAL A 110
TYR A 114
MET A 137
GLY A 141
THR A 206
TRP A 207
LEU A 329
VAL A 332
ARG A 333
SER A 336
GLN A 339
 P2E A1201
6AK3_B_P2EB1201 6ak3 P2E

DB00917
(Dinoprostone) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		PROSTAGLANDIN E2
RECEPTOR EP3
SUBTYPE,SOLUBLE
CYTOCHROME B562 		None 17 PRO B  55
MET B  58
GLN B 103
THR B 106
THR B 107
VAL B 110
TYR B 114
MET B 137
GLY B 141
THR B 206
TRP B 207
TRP B 295
LEU B 329
VAL B 332
ARG B 333
SER B 336
GLN B 339
 P2E B1201
6BQG_A_ERMA1201 6bqg ERM

DB00696
(Ergotamine) 		Escherichia coli;
Homo sapiens 		5-HYDROXYTRYPTAMINE
RECEPTOR 2C,SOLUBLE
CYTOCHROME B562 		no annotation 17 ASP A 134
VAL A 135
SER A 138
THR A 139
VAL A 208
LEU A 209
VAL A 215
GLY A 218
ALA A 222
PHE A 327
ASN A 331
SER A 334
VAL A 335
GLU A 347
LEU A 350
ASN A 351
VAL A 354
 ERM A1201
6GIQ_I_PCFI101 6giq PCF

DB09114
(Colfosceril
palmitate) 		Saccharomyces
cerevisiae 		CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 1,
MITOCHONDRIAL;
CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 9;
CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT
RIESKE,
MITOCHONDRIAL 		PF00115
(Peptidase_M16)
PF00675
(Peptidase_M16_C)
PF05193
(COX1)
PF00355
(COX4)
PF02921
(UCR_TM)
PF02936
(Rieske)
PF05365
(UCR_UQCRX_QCR9) 		9 ASN I  14
VAL I  18
ILE I  21
TYR E  57
GLY E  64
SER E  68
ASP A 428
SER A 453
MET A 455
 PCF I 101
6GIQ_T_PCFT101 6giq PCF

DB09114
(Colfosceril
palmitate) 		Saccharomyces
cerevisiae 		CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 1,
MITOCHONDRIAL;
CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 9;
CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT
RIESKE,
MITOCHONDRIAL 		None 8 ASN T  14
VAL T  18
TYR P  57
GLY P  64
SER P  68
ASP L 428
SER L 453
MET L 455
 PCF T 101
6HU9_C_PCFC607 6hu9 PCF

DB09114
(Colfosceril
palmitate) 		Saccharomyces
cerevisiae 		CYTOCHROME B;
CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 7;
CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 8 		PF00032
(COX3)
PF00033
(Cytochrom_B_C)
PF00510
(Cytochrome_B)
PF02238
(UCR_14kD)
PF02271
(COX7a)
PF02935
(UcrQ)
PF02939
(COX7C) 		13 TRP C  29
LEU G  41
GLN H  55
GLU G  82
PHE C  94
MET C  97
ALA C  98
TYR C 102
TYR C 103
THR C 317
PHE C 326
PHE C 327
VAL C 330
 PCF C 607
6HU9_H_PCFH604 6hu9 PCF

DB09114
(Colfosceril
palmitate) 		Saccharomyces
cerevisiae 		CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 8;
CYTOCHROME C OXIDASE
POLYPEPTIDE 5A,
MITOCHONDRIAL 		PF00355
(COX4)
PF02921
(UCR_TM)
PF02936
(Rieske)
PF02935
(UcrQ)
PF02939
(COX7C) 		8 GLY H  39
PHE H  41
HIS H  42
VAL H  45
GLY e  90
SER e  93
ALA e  96
LYS e  97
 PCF H 604
6HU9_I_PCFI101 6hu9 PCF

DB09114
(Colfosceril
palmitate) 		Saccharomyces
cerevisiae 		CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 1,
MITOCHONDRIAL;
CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 9;
CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT
RIESKE,
MITOCHONDRIAL 		PF00115
(Peptidase_M16)
PF00675
(Peptidase_M16_C)
PF05193
(COX1)
PF00355
(COX4)
PF02921
(UCR_TM)
PF02936
(Rieske)
PF05365
(UCR_UQCRX_QCR9) 		11 ASN I  14
VAL I  18
TYR E  57
VAL E  60
GLY E  64
SER E  68
ALA E  71
TRP A 427
ASP A 428
SER A 453
MET A 455
 PCF I 101
6HU9_N_PCFN606 6hu9 PCF

DB09114
(Colfosceril
palmitate) 		Saccharomyces
cerevisiae 		CYTOCHROME B;
CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 7;
CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 8 		None 16 TRP N  29
LEU R  41
GLN S  55
VAL S  59
GLU R  82
PHE N  94
MET N  95
MET N  97
ALA N  98
TYR N 102
TYR N 103
THR N 317
PHE N 327
VAL N 330
VAL N 334
TYR N 359
 PCF N 606
6HU9_S_PCFS603 6hu9 PCF

DB09114
(Colfosceril
palmitate) 		Saccharomyces
cerevisiae 		CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 8;
CYTOCHROME C OXIDASE
POLYPEPTIDE 5A,
MITOCHONDRIAL 		None 7 GLN S  38
GLY S  39
PHE S  41
HIS S  42
VAL S  45
SER q  93
LYS q  97
 PCF S 603
6HU9_T_PCFT101 6hu9 PCF

DB09114
(Colfosceril
palmitate) 		Saccharomyces
cerevisiae 		CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 1,
MITOCHONDRIAL;
CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 9;
CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT
RIESKE,
MITOCHONDRIAL 		None 10 ASN T  14
VAL T  18
TYR P  57
VAL P  60
GLY P  64
SER P  68
ALA P  71
ASP L 428
SER L 453
MET L 455
 PCF T 101