DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'COMP'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1KB9_A_PCFA514 1kb9 PCF

DB09114
(Colfosceril
palmitate) 		Saccharomyces
cerevisiae 		CYTOCHROME B;
CYTOCHROME C1, HEME
PROTEIN;
UBIQUINOL-CYTOCHROME
C REDUCTASE COMPLEX
CORE PROTEIN I;
UBIQUINOL-CYTOCHROME
C REDUCTASE
IRON-SULFUR SUBUNIT 		PF00032
(Cytochrome_B)
PF00033
(Cytochrom_B_C)
PF00355
(UCR_TM)
PF02921
(Rieske)
PF00675
(Peptidase_M16_C)
PF05193
(Peptidase_M16)
PF02167
(Cytochrom_C1) 		8 VAL E  60
MET E  63
SER E  67
HIS C 222
ILE C 226
PHE C 227
LYS D 291
SER A 450
 PCF A 514
2F16_2_BO221405 2f16 BO2

DB00188
(Bortezomib) 		Saccharomyces
cerevisiae 		PROTEASOME COMPONENT
PRE3;
PROTEASOME COMPONENT
PUP1 		PF00227
(Proteasome)
no annotation 		13 THR 2   1
THR 2  20
THR 2  21
THR 2  22
ALA 2  27
LYS 2  33
ARG 2  45
SER 2  46
GLY 2  47
ALA 2  49
HIS V 114
SER V 118
SER 2 168
 BO2 21405
2F16_H_BO2H1400 2f16 BO2

DB00188
(Bortezomib) 		Saccharomyces
cerevisiae 		PROTEASOME COMPONENT
PUP1;
PROTEASOME COMPONENT
PUP3 		PF00227
(Proteasome)
PF12465
(Pr_beta_C) 		11 THR H   1
SER H  20
GLN H  22
ALA H  27
LYS H  33
ALA H  46
GLY H  47
THR H  48
ALA H  49
ASP I 114
CYS I 118
 BO2 H1400
2F16_K_BO2K1402 2f16 BO2

DB00188
(Bortezomib) 		Saccharomyces
cerevisiae 		PROTEASOME COMPONENT
C5;
PROTEASOME COMPONENT
PRE2 		PF00227
(Proteasome) 		10 THR K   1
ALA K  20
THR K  21
ALA K  22
ALA K  27
VAL K  31
LYS K  33
GLY K  47
ALA K  49
ASP L 114
 BO2 K1402
2F16_N_BO2N1404 2f16 BO2

DB00188
(Bortezomib) 		Saccharomyces
cerevisiae 		PROTEASOME COMPONENT
PRE3;
PROTEASOME COMPONENT
PUP1 		PF00227
(Proteasome)
PF12465
(Pr_beta_C)
no annotation 		13 THR N   1
THR N  20
THR N  21
THR N  22
ALA N  27
LYS N  33
ARG N  45
SER N  46
GLY N  47
ALA N  49
HIS H 114
SER H 118
SER N 168
 BO2 N1404
2F16_V_BO2V1401 2f16 BO2

DB00188
(Bortezomib) 		Saccharomyces
cerevisiae 		PROTEASOME COMPONENT
PUP1;
PROTEASOME COMPONENT
PUP3 		no annotation 11 THR V   1
SER V  20
GLN V  22
ALA V  27
LYS V  33
ALA V  46
GLY V  47
THR V  48
ALA V  49
ASP W 114
CYS W 118
 BO2 V1401
2F16_Y_BO2Y1403 2f16 BO2

DB00188
(Bortezomib) 		Saccharomyces
cerevisiae 		PROTEASOME COMPONENT
C5;
PROTEASOME COMPONENT
PRE2 		no annotation 10 THR Y   1
ALA Y  20
THR Y  21
ALA Y  22
ALA Y  27
VAL Y  31
LYS Y  33
GLY Y  47
ALA Y  49
ASP Z 114
 BO2 Y1403
3MG0_2_BO221405 3mg0 BO2

DB00188
(Bortezomib) 		Saccharomyces
cerevisiae 		PROTEASOME COMPONENT
PRE3;
PROTEASOME COMPONENT
PUP1 		PF00227
(Proteasome)
no annotation 		12 THR 2   1
THR 2  20
THR 2  21
THR 2  22
ALA 2  27
LYS 2  33
SER 2  46
GLY 2  47
ALA 2  49
HIS V 114
SER V 118
SER 2 168
 BO2 21405
3MG0_H_BO2H1400 3mg0 BO2

DB00188
(Bortezomib) 		Saccharomyces
cerevisiae 		PROTEASOME COMPONENT
PUP1;
PROTEASOME COMPONENT
PUP3 		PF00227
(Proteasome)
PF12465
(Pr_beta_C) 		11 THR H   1
SER H  20
THR H  21
GLN H  22
LYS H  33
ALA H  46
GLY H  47
THR H  48
ALA H  49
ASP I 114
CYS I 118
 BO2 H1400
3MG0_K_BO2K1402 3mg0 BO2

DB00188
(Bortezomib) 		Saccharomyces
cerevisiae 		PROTEASOME COMPONENT
C5;
PROTEASOME COMPONENT
PRE2 		PF00227
(Proteasome) 		11 THR K   1
ALA K  20
THR K  21
ALA K  27
VAL K  31
LYS K  33
ALA K  46
GLY K  47
ALA K  49
ASP L 114
SER K 129
 BO2 K1402
3MG0_N_BO2N1404 3mg0 BO2

DB00188
(Bortezomib) 		Saccharomyces
cerevisiae 		PROTEASOME COMPONENT
PRE3;
PROTEASOME COMPONENT
PUP1 		PF00227
(Proteasome)
PF12465
(Pr_beta_C)
no annotation 		13 THR N   1
THR N  20
THR N  21
THR N  22
ALA N  27
LYS N  33
ARG N  45
SER N  46
GLY N  47
ALA N  49
HIS H 114
SER H 118
SER N 168
 BO2 N1404
3MG0_V_BO2V1401 3mg0 BO2

DB00188
(Bortezomib) 		Saccharomyces
cerevisiae 		PROTEASOME COMPONENT
PUP1;
PROTEASOME COMPONENT
PUP3 		no annotation 11 THR V   1
SER V  20
GLN V  22
ALA V  27
LYS V  33
ALA V  46
GLY V  47
THR V  48
ALA V  49
ASP W 114
CYS W 118
 BO2 V1401
3MG0_Y_BO2Y1403 3mg0 BO2

DB00188
(Bortezomib) 		Saccharomyces
cerevisiae 		PROTEASOME COMPONENT
C5;
PROTEASOME COMPONENT
PRE2 		no annotation 12 THR Y   1
ALA Y  20
THR Y  21
ALA Y  22
ALA Y  27
VAL Y  31
LYS Y  33
ALA Y  46
GLY Y  47
ALA Y  49
ASP Z 114
SER Y 129
 BO2 Y1403
3R75_A_BEZA701 3r75 BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Burkholderia lata ANTHRANILATE/PARA-AM
INOBENZOATE
SYNTHASES COMPONENT
I 		PF00117
(Chorismate_bind)
PF00425
(GATase) 		12 GLU A 201
ILE A 216
SER A 217
GLY A 218
THR A 219
GLU A 244
HIS A 279
ARG A 352
SER A 368
THR A 369
GLU A 382
LYS A 386
 BEZ A 701
3R75_B_BEZB701 3r75 BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Burkholderia lata ANTHRANILATE/PARA-AM
INOBENZOATE
SYNTHASES COMPONENT
I 		None 12 GLU B 201
ILE B 216
SER B 217
GLY B 218
THR B 219
GLU B 244
HIS B 279
ARG B 352
SER B 368
THR B 369
GLU B 382
LYS B 386
 BEZ B 701
3R76_A_BEZA701 3r76 BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Burkholderia lata ANTHRANILATE/PARA-AM
INOBENZOATE
SYNTHASES COMPONENT
I 		PF00117
(Chorismate_bind)
PF00425
(GATase) 		11 GLU A 201
ILE A 216
SER A 217
GLY A 218
THR A 219
GLU A 244
HIS A 279
ARG A 352
THR A 369
GLU A 382
LYS A 386
 BEZ A 701
3R76_B_BEZB701 3r76 BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Burkholderia lata ANTHRANILATE/PARA-AM
INOBENZOATE
SYNTHASES COMPONENT
I 		None 11 GLU B 201
ILE B 216
SER B 217
GLY B 218
THR B 219
GLU B 244
HIS B 279
ARG B 352
THR B 369
GLU B 382
LYS B 386
 BEZ B 701
3U52_A_CUA515 3u52 CU

DB09130
(Copper) 		Pseudomonas
stutzeri 		PHENOL HYDROXYLASE
COMPONENT PHL;
PHENOL HYDROXYLASE
COMPONENT PHN 		PF02332
(Phenol_Hydrox)
PF02332
(YHS)
PF04945
(Phenol_Hydrox) 		3 ILE C  13
HIS A 155
HIS A 494
  CU A 515
3UPR_A_1KXA277 3upr 1KX

DB01048
(Abacavir) 		;
Homo sapiens 		HLA CLASS I
HISTOCOMPATIBILITY
ANTIGEN, B-57 ALPHA
CHAIN;
PEP-V 		PF00129
(MHC_I)
PF07654
(C1-set)
no annotation 		14 ILE P   3
TYR P   5
LEU P   7
VAL P   9
TYR A   9
TYR A  74
ILE A  95
VAL A  97
TYR A  99
ASP A 114
SER A 116
TYR A 123
ILE A 124
TRP A 147
 1KX A 277
3UPR_C_1KXC277 3upr 1KX

DB01048
(Abacavir) 		;
Homo sapiens 		HLA CLASS I
HISTOCOMPATIBILITY
ANTIGEN, B-57 ALPHA
CHAIN;
PEP-V 		no annotation 13 ILE Q   3
LEU Q   7
VAL Q   9
TYR C   9
TYR C  74
ILE C  95
VAL C  97
TYR C  99
ASP C 114
SER C 116
TYR C 123
ILE C 124
TRP C 147
 1KX C 277
3VRI_A_1KXA301 3vri 1KX

DB01048
(Abacavir) 		Homo sapiens 10-MER PEPTIDE;
HLA CLASS I
HISTOCOMPATIBILITY
ANTIGEN, B-57 ALPHA
CHAIN 		PF00129
(MHC_I)
PF07654
(C1-set)
no annotation 		10 TYR A   9
ILE C  10
TYR A  74
VAL A  97
TYR A  99
ASP A 114
SER A 116
TYR A 123
ILE A 124
TRP A 147
 1KX A 301
3VRJ_A_1KXA301 3vrj 1KX

DB01048
(Abacavir) 		Homo sapiens 10-MER PEPTIDE;
HLA CLASS I
HISTOCOMPATIBILITY
ANTIGEN, B-57 ALPHA
CHAIN 		PF00129
(MHC_I)
PF07654
(C1-set)
no annotation 		12 THR C   3
TYR A   9
ILE C  10
TYR A  74
ILE A  95
VAL A  97
TYR A  99
ASP A 114
SER A 116
TYR A 123
ILE A 124
TRP A 147
 1KX A 301
4EVR_A_BEZA401 4evr BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Rhodopseudomonas
palustris 		PUTATIVE ABC
TRANSPORTER SUBUNIT,
SUBSTRATE-BINDING
COMPONENT 		PF13458
(Peripla_BP_6) 		11 TYR A  46
LEU A  49
VAL A 107
SER A 109
ASN A 130
PHE A 150
TYR A 178
ALA A 180
PHE A 230
SER A 232
PHE A 257
 BEZ A 401
4RP8_A_ASCA501 4rp8 ASC

DB00126
(Vitamin
C) 		Escherichia coli ASCORBATE-SPECIFIC
PERMEASE IIC
COMPONENT ULAA 		PF03611
(EIIC-GAT) 		11 THR A  86
TYR A  87
HIS A 135
ILE A 136
GLN A 139
HIS A 194
GLN A 195
ASP A 314
ALA A 316
PHE A 362
MET A 410
 ASC A 501
4RP8_C_ASCC501 4rp8 ASC

DB00126
(Vitamin
C) 		Escherichia coli ASCORBATE-SPECIFIC
PERMEASE IIC
COMPONENT ULAA 		None 15 LEU C  55
SER C  59
THR C  86
TYR C  87
HIS C 135
ILE C 136
GLN C 139
HIS C 194
GLN C 195
ILE C 283
ASP C 314
ALA C 316
ILE C 358
PHE C 362
MET C 410
 ASC C 501
4RP9_A_ASCA501 4rp9 ASC

DB00126
(Vitamin
C) 		Escherichia coli ASCORBATE-SPECIFIC
PERMEASE IIC
COMPONENT ULAA 		PF03611
(EIIC-GAT) 		13 THR A  86
TYR A  87
HIS A 135
ILE A 136
GLN A 139
HIS A 194
GLN A 195
ASP A 314
CYS A 315
ALA A 316
ILE A 358
PHE A 362
MET A 410
 ASC A 501
4WW7_A_ACTA302 4ww7 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Saccharomyces
cerevisiae 		EKC/KEOPS COMPLEX
SUBUNIT BUD32 		PF06293
(Kdo) 		5 PRO A 114
MET A 128
HIS A 129
LEU A 137
TRP A 176
 ACT A 302
4WW7_A_ACTA303 4ww7 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Saccharomyces
cerevisiae 		EKC/KEOPS COMPLEX
SUBUNIT BUD32 		PF06293
(Kdo) 		4 LEU A 191
VAL A 192
GLU A 193
ARG A 246
 ACT A 303
4WW7_A_ACTA305 4ww7 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Saccharomyces
cerevisiae 		EKC/KEOPS COMPLEX
SUBUNIT BUD32 		PF06293
(Kdo) 		6 LEU A 199
LEU A 202
GLU A 203
ASN A 218
ILE A 221
MET A 222
 ACT A 305
5DV4_A_NMYA601 5dv4 NMY

DB00452
(Framycetin)
DB00994
(Neomycin) 		Homo sapiens CCR4-NOT
TRANSCRIPTION
COMPLEX SUBUNIT
6-LIKE 		PF03372
(Exo_endo_phos) 		15 LEU A 206
TYR A 207
GLU A 240
ASN A 325
HIS A 360
TRP A 363
PRO A 365
LYS A 371
ASP A 410
ASN A 412
LEU A 414
ASN A 479
PHE A 484
ILE A 488
HIS A 529
 NMY A 601
5J6H_A_NCAA402 5j6h NCA

DB02701
(Nicotinamide) 		Mus musculus H-2 CLASS I
HISTOCOMPATIBILITY
ANTIGEN, Q10 ALPHA
CHAIN 		PF00129
(MHC_I)
PF07654
(C1-set) 		3 PRO A  47
ARG A  48
GLU A  53
 NCA A 402
5U1R_A_DIFA303 5u1r DIF

DB00586
(Diclofenac) 		Homo sapiens MAIT T-CELL RECEPTOR
ALPHA CHAIN;
MAIT T-CELL RECEPTOR
BETA CHAIN;
MAJOR
HISTOCOMPATIBILITY
COMPLEX CLASS
I-RELATED GENE
PROTEIN 		PF00129
(MHC_I)
PF07654
(C1-set)
PF07686
(V-set)
PF09291
(DUF1968)
no annotation 		11 LEU A   5
TYR A   7
ARG A   9
SER A  24
TYR A  62
LEU A  66
TRP A  69
TYR B  95
GLU G  99
TRP A 156
TRP A 164
 DIF A 303
5U1R_C_DIFC305 5u1r DIF

DB00586
(Diclofenac) 		Homo sapiens MAIT T-CELL RECEPTOR
ALPHA CHAIN;
MAIT T-CELL RECEPTOR
BETA CHAIN;
MAJOR
HISTOCOMPATIBILITY
COMPLEX CLASS
I-RELATED GENE
PROTEIN 		PF07654
(C1-set)
PF07686
(V-set)
no annotation 		11 TYR C   7
ARG C   9
SER C  24
LYS C  43
TYR C  62
LEU C  65
LEU C  66
TYR D  95
GLU E  99
TRP C 156
TRP C 164
 DIF C 305
5U98_A_1KXA301 5u98 1KX

DB01048
(Abacavir) 		Homo sapiens HLA CLASS I
HISTOCOMPATIBILITY
ANTIGEN, B-57 ALPHA
CHAIN;
VAL-THR-THR-ASP-ILE-
GLN-VAL-LYS-VAL 		PF00129
(MHC_I)
PF07654
(C1-set)
no annotation 		13 THR C   3
VAL C   7
TYR A   9
VAL C   9
TYR A  74
ILE A  95
VAL A  97
TYR A  99
ASP A 114
SER A 116
TYR A 123
ILE A 124
TRP A 147
 1KX A 301
5U98_D_1KXD301 5u98 1KX

DB01048
(Abacavir) 		Homo sapiens HLA CLASS I
HISTOCOMPATIBILITY
ANTIGEN, B-57 ALPHA
CHAIN;
VAL-THR-THR-ASP-ILE-
GLN-VAL-LYS-VAL 		no annotation 13 THR F   3
VAL F   7
TYR D   9
VAL F   9
TYR D  74
ILE D  95
VAL D  97
TYR D  99
ASP D 114
SER D 116
TYR D 123
ILE D 124
TRP D 147
 1KX D 301
6GIQ_I_PCFI101 6giq PCF

DB09114
(Colfosceril
palmitate) 		Saccharomyces
cerevisiae 		CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 1,
MITOCHONDRIAL;
CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 9;
CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT
RIESKE,
MITOCHONDRIAL 		PF00115
(Peptidase_M16)
PF00675
(Peptidase_M16_C)
PF05193
(COX1)
PF00355
(COX4)
PF02921
(UCR_TM)
PF02936
(Rieske)
PF05365
(UCR_UQCRX_QCR9) 		9 ASN I  14
VAL I  18
ILE I  21
TYR E  57
GLY E  64
SER E  68
ASP A 428
SER A 453
MET A 455
 PCF I 101
6GIQ_T_PCFT101 6giq PCF

DB09114
(Colfosceril
palmitate) 		Saccharomyces
cerevisiae 		CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 1,
MITOCHONDRIAL;
CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 9;
CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT
RIESKE,
MITOCHONDRIAL 		None 8 ASN T  14
VAL T  18
TYR P  57
GLY P  64
SER P  68
ASP L 428
SER L 453
MET L 455
 PCF T 101
6HU9_C_PCFC607 6hu9 PCF

DB09114
(Colfosceril
palmitate) 		Saccharomyces
cerevisiae 		CYTOCHROME B;
CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 7;
CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 8 		PF00032
(COX3)
PF00033
(Cytochrom_B_C)
PF00510
(Cytochrome_B)
PF02238
(UCR_14kD)
PF02271
(COX7a)
PF02935
(UcrQ)
PF02939
(COX7C) 		13 TRP C  29
LEU G  41
GLN H  55
GLU G  82
PHE C  94
MET C  97
ALA C  98
TYR C 102
TYR C 103
THR C 317
PHE C 326
PHE C 327
VAL C 330
 PCF C 607
6HU9_H_PCFH604 6hu9 PCF

DB09114
(Colfosceril
palmitate) 		Saccharomyces
cerevisiae 		CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 8;
CYTOCHROME C OXIDASE
POLYPEPTIDE 5A,
MITOCHONDRIAL 		PF00355
(COX4)
PF02921
(UCR_TM)
PF02936
(Rieske)
PF02935
(UcrQ)
PF02939
(COX7C) 		8 GLY H  39
PHE H  41
HIS H  42
VAL H  45
GLY e  90
SER e  93
ALA e  96
LYS e  97
 PCF H 604
6HU9_I_PCFI101 6hu9 PCF

DB09114
(Colfosceril
palmitate) 		Saccharomyces
cerevisiae 		CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 1,
MITOCHONDRIAL;
CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 9;
CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT
RIESKE,
MITOCHONDRIAL 		PF00115
(Peptidase_M16)
PF00675
(Peptidase_M16_C)
PF05193
(COX1)
PF00355
(COX4)
PF02921
(UCR_TM)
PF02936
(Rieske)
PF05365
(UCR_UQCRX_QCR9) 		11 ASN I  14
VAL I  18
TYR E  57
VAL E  60
GLY E  64
SER E  68
ALA E  71
TRP A 427
ASP A 428
SER A 453
MET A 455
 PCF I 101
6HU9_N_PCFN606 6hu9 PCF

DB09114
(Colfosceril
palmitate) 		Saccharomyces
cerevisiae 		CYTOCHROME B;
CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 7;
CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 8 		None 16 TRP N  29
LEU R  41
GLN S  55
VAL S  59
GLU R  82
PHE N  94
MET N  95
MET N  97
ALA N  98
TYR N 102
TYR N 103
THR N 317
PHE N 327
VAL N 330
VAL N 334
TYR N 359
 PCF N 606
6HU9_S_PCFS603 6hu9 PCF

DB09114
(Colfosceril
palmitate) 		Saccharomyces
cerevisiae 		CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 8;
CYTOCHROME C OXIDASE
POLYPEPTIDE 5A,
MITOCHONDRIAL 		None 7 GLN S  38
GLY S  39
PHE S  41
HIS S  42
VAL S  45
SER q  93
LYS q  97
 PCF S 603
6HU9_T_PCFT101 6hu9 PCF

DB09114
(Colfosceril
palmitate) 		Saccharomyces
cerevisiae 		CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 1,
MITOCHONDRIAL;
CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT 9;
CYTOCHROME B-C1
COMPLEX SUBUNIT
RIESKE,
MITOCHONDRIAL 		None 10 ASN T  14
VAL T  18
TYR P  57
VAL P  60
GLY P  64
SER P  68
ALA P  71
ASP L 428
SER L 453
MET L 455
 PCF T 101