DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'CAPSID'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
2PXC_A_SAMA500 2pxc SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Murray Valley
encephalitis
virus
GENOME POLYPROTEIN
[CONTAINS: CAPSID
PROTEIN C (CORE
PROTEIN);
ENVELOPE PROTEIN M
(MATRIX PROTEIN);
MAJOR ENVELOPE
PROTEIN E;
NON-STRUCTURAL
PROTEIN 1 (NS1);
NON-STRUCTURAL
PROTEIN 2A (NS2A);
FLAVIVIRIN PROTEASE
NS2B REGULATORY
SUBUNIT;
FLAVIVIRIN PROTEASE
NS3 CATALYTIC
SUBUNIT;
NON-STRUCTURAL
PROTEIN 4A (NS4A);
NON-STRUCTURAL
PROTEIN 4B (NS4B);
RNA-DIRECTED RNA
POLYMERASE (EC
2.7.7.48) (NS5)]
PF01728
(FtsJ)
14 SER A  56
GLY A  58
GLY A  81
GLY A  83
GLY A  86
TRP A  87
THR A 104
LYS A 105
HIS A 110
GLU A 111
ASP A 131
VAL A 132
ASP A 146
ILE A 147
SAM A 500
4J4V_A_SVRA301 4j4v SVR

DB04786
(Suramin)
SFTS phlebovirus NUCLEOCAPSID PROTEIN PF05733
(Tenui_N)
11 GLY A  65
ASN A  66
LYS A  67
ARG A  95
ALA A  96
VAL A 105
GLN A 109
PRO A 127
MET A 147
PHE A 177
ILE A 181
SVR A 301
4J4V_B_SVRB301 4j4v SVR

DB04786
(Suramin)
SFTS phlebovirus NUCLEOCAPSID PROTEIN no annotation 10 GLY B  65
ASN B  66
LYS B  67
ARG B  95
ALA B  96
VAL B 105
GLN B 109
PRO B 127
MET B 147
PHE B 177
SVR B 301
4J4V_C_SVRC301 4j4v SVR

DB04786
(Suramin)
SFTS phlebovirus NUCLEOCAPSID PROTEIN no annotation 8 GLY C  65
ASN C  66
LYS C  67
ARG C  95
PRO C 127
MET C 147
PHE C 177
ILE C 181
SVR C 301
4J4V_D_SVRD301 4j4v SVR

DB04786
(Suramin)
SFTS phlebovirus NUCLEOCAPSID PROTEIN no annotation 11 GLY D  65
ASN D  66
LYS E  74
ARG D  95
ALA D  96
VAL D 105
GLN D 109
PRO D 127
MET D 147
PHE D 177
ILE D 181
SVR D 301
4J4V_E_SVRE301 4j4v SVR

DB04786
(Suramin)
SFTS phlebovirus NUCLEOCAPSID PROTEIN PF05733
(Tenui_N)
no annotation
10 GLY E  65
ASN E  66
LYS A  74
ARG E  95
ALA E  96
VAL E 105
GLN E 109
PRO E 127
MET E 147
PHE E 177
SVR E 301
5G4B_A_PZEA1268 5g4b PZE

DB00592
(Piperazine)
Aura virus CAPSID PROTEIN PF00944
(Peptidase_S3)
5 MET A 135
GLU A 136
LYS A 138
TYR A 183
TRP A 250
PZE A1268