DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'ALPHA CHAIN'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1HZE_A_RBFA98 1hze RBF

DB00140
(Riboflavin) 		Escherichia coli RIBOFLAVIN SYNTHASE
ALPHA CHAIN 		PF00677
(Lum_binding)
no annotation 		9 THR B   3
ILE B   5
CYS A  48
LEU A  49
ASP A  62
LEU A  63
THR A  67
ILE A  70
LYS A  89
 RBF A  98
1HZE_B_RBFB99 1hze RBF

DB00140
(Riboflavin) 		Escherichia coli RIBOFLAVIN SYNTHASE
ALPHA CHAIN 		PF00677
(Lum_binding)
no annotation 		9 THR A   3
ILE A   5
CYS B  48
LEU B  49
ASP B  62
LEU B  63
THR B  67
ILE B  70
LYS B  89
 RBF B  99
1I18_A_RBFA98 1i18 RBF

DB00140
(Riboflavin) 		Escherichia coli RIBOFLAVIN SYNTHASE
ALPHA CHAIN 		PF00677
(Lum_binding)
no annotation 		10 PHE B   2
THR B   3
ILE B   5
CYS A  48
LEU A  49
ASP A  62
LEU A  63
THR A  67
ILE A  70
THR A  71
 RBF A  98
1I18_B_RBFB99 1i18 RBF

DB00140
(Riboflavin) 		Escherichia coli RIBOFLAVIN SYNTHASE
ALPHA CHAIN 		PF00677
(Lum_binding)
no annotation 		10 PHE A   2
THR A   3
ILE A   5
CYS B  48
LEU B  49
ASP B  62
LEU B  63
THR B  67
ILE B  70
THR B  71
 RBF B  99
1IWH_A_PEMA501 1iwh PEM

DB01393
(Bezafibrate) 		Equus caballus HEMOGLOBIN ALPHA
CHAIN 		PF00042
(Globin) 		6 ALA A  57
LYS A  60
LYS A  61
ASP A  64
ALA A  65
LEU A  83
 PEM A 501
1MT1_A_AG2A7005 1mt1 AG2

DB08838
(Agmatine) 		Methanocaldococcu
s jannaschii 		PYRUVOYL-DEPENDENT
ARGININE
DECARBOXYLASE ALPHA
CHAIN;
PYRUVOYL-DEPENDENT
ARGININE
DECARBOXYLASE BETA
CHAIN 		PF01862
(PvlArgDC)
no annotation 		6 LEU A  31
ASP A  35
LEU A  38
ILE F  54
GLU F 109
ARG F 134
 AG2 A7005
1MT1_B_AG2B7001 1mt1 AG2

DB08838
(Agmatine) 		Methanocaldococcu
s jannaschii 		PYRUVOYL-DEPENDENT
ARGININE
DECARBOXYLASE ALPHA
CHAIN;
PYRUVOYL-DEPENDENT
ARGININE
DECARBOXYLASE BETA
CHAIN 		PF01862
(PvlArgDC)
no annotation 		6 LEU C  31
ASP C  35
LEU C  38
ILE B  54
GLU B 109
ARG B 134
 AG2 B7001
1MT1_C_AG2C7004 1mt1 AG2

DB08838
(Agmatine) 		Methanocaldococcu
s jannaschii 		PYRUVOYL-DEPENDENT
ARGININE
DECARBOXYLASE ALPHA
CHAIN;
PYRUVOYL-DEPENDENT
ARGININE
DECARBOXYLASE BETA
CHAIN 		no annotation 6 LEU E  31
ASP E  35
LEU E  38
ALA D  76
LEU D 106
GLU D 109
 AG2 C7004
1MT1_G_AG2G7003 1mt1 AG2

DB08838
(Agmatine) 		Methanocaldococcu
s jannaschii 		PYRUVOYL-DEPENDENT
ARGININE
DECARBOXYLASE ALPHA
CHAIN;
PYRUVOYL-DEPENDENT
ARGININE
DECARBOXYLASE BETA
CHAIN 		no annotation 6 LEU G  31
ASP G  35
LEU G  38
GLY G  44
ILE J  54
ARG J 134
 AG2 G7003
1MT1_K_AG2K7002 1mt1 AG2

DB08838
(Agmatine) 		Methanocaldococcu
s jannaschii 		PYRUVOYL-DEPENDENT
ARGININE
DECARBOXYLASE ALPHA
CHAIN;
PYRUVOYL-DEPENDENT
ARGININE
DECARBOXYLASE BETA
CHAIN 		no annotation 7 LEU K  31
ASP K  35
LEU K  38
GLY K  44
ILE H  54
GLU H 109
ARG H 134
 AG2 K7002
1N13_B_AG2B7011 1n13 AG2

DB08838
(Agmatine) 		Methanocaldococcu
s jannaschii 		PYRUVOYL-DEPENDENT
ARGININE
DECARBOXYLASE ALPHA
CHAIN;
PYRUVOYL-DEPENDENT
ARGININE
DECARBOXYLASE BETA
CHAIN 		PF01862
(PvlArgDC)
no annotation 		5 LEU C  31
ASP C  35
LEU C  38
GLU B 109
ARG B 134
 AG2 B7011
1N13_D_AG2D7015 1n13 AG2

DB08838
(Agmatine) 		Methanocaldococcu
s jannaschii 		PYRUVOYL-DEPENDENT
ARGININE
DECARBOXYLASE ALPHA
CHAIN;
PYRUVOYL-DEPENDENT
ARGININE
DECARBOXYLASE BETA
CHAIN 		no annotation 7 LEU E  31
ASP E  35
LEU E  38
GLY E  44
LEU D 106
GLU D 109
ARG D 134
 AG2 D7015
1N13_F_AG2F7016 1n13 AG2

DB08838
(Agmatine) 		Methanocaldococcu
s jannaschii 		PYRUVOYL-DEPENDENT
ARGININE
DECARBOXYLASE ALPHA
CHAIN;
PYRUVOYL-DEPENDENT
ARGININE
DECARBOXYLASE BETA
CHAIN 		PF01862
(PvlArgDC)
no annotation 		8 LEU A  31
ASP A  35
LEU A  38
GLY A  44
ILE F  54
MET F 108
GLU F 109
ARG F 134
 AG2 F7016
1N13_H_AG2H7012 1n13 AG2

DB08838
(Agmatine) 		Methanocaldococcu
s jannaschii 		PYRUVOYL-DEPENDENT
ARGININE
DECARBOXYLASE ALPHA
CHAIN;
PYRUVOYL-DEPENDENT
ARGININE
DECARBOXYLASE BETA
CHAIN 		no annotation 6 LEU K  31
ASP K  35
LEU K  38
GLY K  44
GLU H 109
ARG H 134
 AG2 H7012
1N13_J_AG2J7013 1n13 AG2

DB08838
(Agmatine) 		Methanocaldococcu
s jannaschii 		PYRUVOYL-DEPENDENT
ARGININE
DECARBOXYLASE ALPHA
CHAIN;
PYRUVOYL-DEPENDENT
ARGININE
DECARBOXYLASE BETA
CHAIN 		no annotation 7 LEU G  31
ASP G  35
LEU G  38
GLY G  44
MET J 108
GLU J 109
ARG J 134
 AG2 J7013
1N13_L_AG2L7014 1n13 AG2

DB08838
(Agmatine) 		Methanocaldococcu
s jannaschii 		PYRUVOYL-DEPENDENT
ARGININE
DECARBOXYLASE ALPHA
CHAIN;
PYRUVOYL-DEPENDENT
ARGININE
DECARBOXYLASE BETA
CHAIN 		no annotation 7 LEU I  31
ASP I  35
LEU I  38
ILE L  54
MET L 108
GLU L 109
ARG L 134
 AG2 L7014
1PKV_A_RBFA100 1pkv RBF

DB00140
(Riboflavin) 		Escherichia coli RIBOFLAVIN SYNTHASE
ALPHA CHAIN 		PF00677
(Lum_binding)
no annotation 		11 ILE B   5
VAL B   6
SER A  41
CYS A  47
CYS A  48
LEU A  49
THR A  50
MET A  64
THR A  67
ILE A  70
THR A  71
 RBF A 100
1PKV_B_RBFB101 1pkv RBF

DB00140
(Riboflavin) 		Escherichia coli RIBOFLAVIN SYNTHASE
ALPHA CHAIN 		PF00677
(Lum_binding)
no annotation 		11 ILE A   5
VAL A   6
SER B  41
CYS B  47
CYS B  48
LEU B  49
THR B  50
MET B  64
THR B  67
ILE B  70
THR B  71
 RBF B 101
1SA1_B_PODB700 1sa1 POD

DB01179
(Podofilox) 		Bos taurus TUBULIN ALPHA CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN 		PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C) 		12 VAL A 181
CYS B 241
LEU B 242
ALA B 250
LYS B 254
LEU B 255
ASN B 258
MET B 259
ALA B 316
VAL B 318
LYS B 352
ALA B 354
 POD B 700
1SA1_D_PODD701 1sa1 POD

DB01179
(Podofilox) 		Bos taurus TUBULIN ALPHA CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN 		no annotation 12 VAL C 181
CYS D 241
LEU D 242
ALA D 250
LYS D 254
LEU D 255
ASN D 258
MET D 259
ALA D 316
VAL D 318
LYS D 352
ALA D 354
 POD D 701
1Z2B_C_VLBC800 1z2b VLB

DB00570
(Vinblastine) 		Bos taurus TUBULIN ALPHA CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN 		PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C)
no annotation 		13 LYS B 176
VAL B 177
ASP B 179
TYR B 210
THR B 221
PRO B 222
TYR B 224
LEU B 227
PRO C 325
VAL C 328
ASN C 329
VAL C 353
ILE C 355
 VLB C 800
3IT4_B_ACTB601 3it4 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Mycobacterium
tuberculosis 		ARGININE
BIOSYNTHESIS
BIFUNCTIONAL PROTEIN
ARGJ ALPHA CHAIN;
ARGININE
BIOSYNTHESIS
BIFUNCTIONAL PROTEIN
ARGJ BETA CHAIN 		None
PF01960
(ArgJ) 		4 LEU C 129
MET C 193
ASN B 322
ARG B 325
 ACT B 601
3IT4_C_BEZC503 3it4 BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid) 		Mycobacterium
tuberculosis 		ARGININE
BIOSYNTHESIS
BIFUNCTIONAL PROTEIN
ARGJ ALPHA CHAIN 		None 4 ARG C   9
GLN C  14
LEU C 154
HIS C 177
 BEZ C 503
3IT4_D_ACTD601 3it4 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Mycobacterium
tuberculosis 		ARGININE
BIOSYNTHESIS
BIFUNCTIONAL PROTEIN
ARGJ ALPHA CHAIN;
ARGININE
BIOSYNTHESIS
BIFUNCTIONAL PROTEIN
ARGJ BETA CHAIN 		None
PF01960
(ArgJ) 		4 LEU A 129
MET A 193
ASN D 322
ARG D 325
 ACT D 601
3P73_A_ACTA275 3p73 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Gallus gallus MHC RFP-Y CLASS I
ALPHA CHAIN 		PF00129
(C1-set)
PF07654
(MHC_I) 		3 ILE A 106
VAL A 162
ARG A 166
 ACT A 275
3P73_A_ACTA276 3p73 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Gallus gallus MHC RFP-Y CLASS I
ALPHA CHAIN 		PF00129
(C1-set)
PF07654
(MHC_I) 		5 TRP A  74
ARG A  82
THR A 139
ARG A 142
TRP A 143
 ACT A 276
3TEH_A_DAHA351 3teh DAH

DB01235
(Levodopa) 		Thermus
thermophilus 		PHENYLALANYL-TRNA
SYNTHETASE ALPHA
CHAIN 		PF01409
(tRNA-synt_2d) 		9 TRP A 149
HIS A 178
SER A 180
ARG A 204
GLN A 218
GLU A 220
VAL A 261
ALA A 314
GLY A 316
 DAH A 351
3UPR_A_1KXA277 3upr 1KX

DB01048
(Abacavir) 		;
Homo sapiens 		HLA CLASS I
HISTOCOMPATIBILITY
ANTIGEN, B-57 ALPHA
CHAIN;
PEP-V 		PF00129
(MHC_I)
PF07654
(C1-set)
no annotation 		14 ILE P   3
TYR P   5
LEU P   7
VAL P   9
TYR A   9
TYR A  74
ILE A  95
VAL A  97
TYR A  99
ASP A 114
SER A 116
TYR A 123
ILE A 124
TRP A 147
 1KX A 277
3UPR_C_1KXC277 3upr 1KX

DB01048
(Abacavir) 		;
Homo sapiens 		HLA CLASS I
HISTOCOMPATIBILITY
ANTIGEN, B-57 ALPHA
CHAIN;
PEP-V 		no annotation 13 ILE Q   3
LEU Q   7
VAL Q   9
TYR C   9
TYR C  74
ILE C  95
VAL C  97
TYR C  99
ASP C 114
SER C 116
TYR C 123
ILE C 124
TRP C 147
 1KX C 277
3UT5_B_LOCB502 3ut5 LOC

DB01394
(Colchicine) 		Ovis aries TUBULIN ALPHA CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN 		PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C) 		14 ALA A 180
VAL A 181
CYS B 241
LEU B 242
ALA B 250
LYS B 254
LEU B 255
ASN B 258
MET B 259
THR B 314
ALA B 316
ILE B 318
LYS B 352
ILE B 378
 LOC B 502
3UT5_D_LOCD502 3ut5 LOC

DB01394
(Colchicine) 		Ovis aries TUBULIN ALPHA CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN 		no annotation 14 ALA C 180
VAL C 181
CYS D 241
LEU D 242
GLN D 247
ALA D 250
LYS D 254
LEU D 255
ASN D 258
MET D 259
ALA D 316
LYS D 352
ALA D 354
ILE D 378
 LOC D 502
3VRI_A_1KXA301 3vri 1KX

DB01048
(Abacavir) 		Homo sapiens 10-MER PEPTIDE;
HLA CLASS I
HISTOCOMPATIBILITY
ANTIGEN, B-57 ALPHA
CHAIN 		PF00129
(MHC_I)
PF07654
(C1-set)
no annotation 		10 TYR A   9
ILE C  10
TYR A  74
VAL A  97
TYR A  99
ASP A 114
SER A 116
TYR A 123
ILE A 124
TRP A 147
 1KX A 301
3VRJ_A_1KXA301 3vrj 1KX

DB01048
(Abacavir) 		Homo sapiens 10-MER PEPTIDE;
HLA CLASS I
HISTOCOMPATIBILITY
ANTIGEN, B-57 ALPHA
CHAIN 		PF00129
(MHC_I)
PF07654
(C1-set)
no annotation 		12 THR C   3
TYR A   9
ILE C  10
TYR A  74
ILE A  95
VAL A  97
TYR A  99
ASP A 114
SER A 116
TYR A 123
ILE A 124
TRP A 147
 1KX A 301
4EB6_C_VLBC503 4eb6 VLB

DB00570
(Vinblastine) 		Ovis aries TUBULIN ALPHA CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN 		PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C)
no annotation 		12 VAL B 177
ASP B 179
TYR B 210
THR B 221
PRO B 222
TYR B 224
PRO C 325
ASN C 329
ILE C 332
LYS C 336
VAL C 353
ILE C 355
 VLB C 503
4X1I_B_LOCB502 4x1i LOC

DB01394
(Colchicine) 		Ovis aries TUBULIN ALPHA CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN 		PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C) 		15 SER A 178
ALA A 180
VAL A 181
CYS B 241
LEU B 248
ALA B 250
LYS B 254
LEU B 255
ASN B 258
MET B 259
THR B 314
ALA B 316
VAL B 318
LYS B 352
ALA B 354
 LOC B 502
4X1I_D_LOCD502 4x1i LOC

DB01394
(Colchicine) 		Ovis aries TUBULIN ALPHA CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN 		no annotation 14 ALA C 180
VAL C 181
CYS D 241
LEU D 242
LEU D 248
LYS D 254
LEU D 255
ASN D 258
MET D 259
THR D 314
ALA D 316
LYS D 352
ALA D 354
ILE D 378
 LOC D 502
4X1K_B_LOCB502 4x1k LOC

DB01394
(Colchicine) 		Ovis aries TUBULIN ALPHA CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN 		PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C) 		12 SER A 178
VAL A 181
CYS B 241
LEU B 242
LEU B 248
ALA B 250
LYS B 254
LEU B 255
ASN B 258
THR B 314
LYS B 352
ALA B 354
 LOC B 502
4X1K_D_LOCD502 4x1k LOC

DB01394
(Colchicine) 		Ovis aries TUBULIN ALPHA CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN 		no annotation 17 ASN C 101
SER C 178
ALA C 180
VAL C 181
CYS D 241
LEU D 242
LEU D 248
LYS D 254
LEU D 255
ASN D 258
MET D 259
THR D 314
ALA D 316
VAL D 318
LYS D 352
ALA D 354
ILE D 378
 LOC D 502
4X1Y_B_LOCB502 4x1y LOC

DB01394
(Colchicine) 		Ovis aries TUBULIN ALPHA CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN 		PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C) 		15 ALA A 180
VAL A 181
CYS B 241
LEU B 242
LEU B 248
ALA B 250
LYS B 254
LEU B 255
ASN B 258
MET B 259
THR B 314
ALA B 316
VAL B 318
LYS B 352
ILE B 378
 LOC B 502
4X1Y_D_LOCD502 4x1y LOC

DB01394
(Colchicine) 		Ovis aries TUBULIN ALPHA CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN 		no annotation 16 SER C 178
ALA C 180
VAL C 181
CYS D 241
LEU D 242
LEU D 248
LYS D 254
LEU D 255
ASN D 258
MET D 259
THR D 314
ALA D 316
VAL D 318
LYS D 352
ALA D 354
ILE D 378
 LOC D 502
4X20_B_LOCB502 4x20 LOC

DB01394
(Colchicine) 		Ovis aries TUBULIN ALPHA CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN 		PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C) 		16 SER A 178
VAL A 181
CYS B 241
LEU B 242
LEU B 248
ALA B 250
LYS B 254
LEU B 255
ASN B 258
MET B 259
THR B 314
ALA B 316
VAL B 318
LYS B 352
ALA B 354
ILE B 378
 LOC B 502
4X20_D_LOCD502 4x20 LOC

DB01394
(Colchicine) 		Ovis aries TUBULIN ALPHA CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN 		no annotation 14 SER C 178
ALA C 180
VAL C 181
LEU D 242
LEU D 248
LYS D 254
LEU D 255
ASN D 258
MET D 259
THR D 314
ALA D 316
VAL D 318
LYS D 352
ILE D 378
 LOC D 502
5EYP_B_LOCB502 5eyp LOC

DB01394
(Colchicine) 		Ovis aries TUBULIN ALPHA CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN 		PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C) 		17 SER A 178
ALA A 180
VAL A 181
CYS B 241
LEU B 242
LEU B 248
ALA B 250
LYS B 254
LEU B 255
ASN B 258
MET B 259
THR B 314
ALA B 316
ILE B 318
LYS B 352
ALA B 354
ILE B 378
 LOC B 502
5J6H_A_NCAA402 5j6h NCA

DB02701
(Nicotinamide) 		Mus musculus H-2 CLASS I
HISTOCOMPATIBILITY
ANTIGEN, Q10 ALPHA
CHAIN 		PF00129
(MHC_I)
PF07654
(C1-set) 		3 PRO A  47
ARG A  48
GLU A  53
 NCA A 402
5U1R_A_DIFA303 5u1r DIF

DB00586
(Diclofenac) 		Homo sapiens MAIT T-CELL RECEPTOR
ALPHA CHAIN;
MAIT T-CELL RECEPTOR
BETA CHAIN;
MAJOR
HISTOCOMPATIBILITY
COMPLEX CLASS
I-RELATED GENE
PROTEIN 		PF00129
(MHC_I)
PF07654
(C1-set)
PF07686
(V-set)
PF09291
(DUF1968)
no annotation 		11 LEU A   5
TYR A   7
ARG A   9
SER A  24
TYR A  62
LEU A  66
TRP A  69
TYR B  95
GLU G  99
TRP A 156
TRP A 164
 DIF A 303
5U1R_C_DIFC305 5u1r DIF

DB00586
(Diclofenac) 		Homo sapiens MAIT T-CELL RECEPTOR
ALPHA CHAIN;
MAIT T-CELL RECEPTOR
BETA CHAIN;
MAJOR
HISTOCOMPATIBILITY
COMPLEX CLASS
I-RELATED GENE
PROTEIN 		PF07654
(C1-set)
PF07686
(V-set)
no annotation 		11 TYR C   7
ARG C   9
SER C  24
LYS C  43
TYR C  62
LEU C  65
LEU C  66
TYR D  95
GLU E  99
TRP C 156
TRP C 164
 DIF C 305
5U98_A_1KXA301 5u98 1KX

DB01048
(Abacavir) 		Homo sapiens HLA CLASS I
HISTOCOMPATIBILITY
ANTIGEN, B-57 ALPHA
CHAIN;
VAL-THR-THR-ASP-ILE-
GLN-VAL-LYS-VAL 		PF00129
(MHC_I)
PF07654
(C1-set)
no annotation 		13 THR C   3
VAL C   7
TYR A   9
VAL C   9
TYR A  74
ILE A  95
VAL A  97
TYR A  99
ASP A 114
SER A 116
TYR A 123
ILE A 124
TRP A 147
 1KX A 301
5U98_D_1KXD301 5u98 1KX

DB01048
(Abacavir) 		Homo sapiens HLA CLASS I
HISTOCOMPATIBILITY
ANTIGEN, B-57 ALPHA
CHAIN;
VAL-THR-THR-ASP-ILE-
GLN-VAL-LYS-VAL 		no annotation 13 THR F   3
VAL F   7
TYR D   9
VAL F   9
TYR D  74
ILE D  95
VAL D  97
TYR D  99
ASP D 114
SER D 116
TYR D 123
ILE D 124
TRP D 147
 1KX D 301