DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO '16S RRNA'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
3FZG_A_SAMA300 3fzg SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE PF07091
(FmrO) 		14 HIS A  83
SER A  85
THR A  86
ARG A  89
PHE A 113
GLY A 114
GLY A 116
ASP A 137
ILE A 138
LEU A 179
LYS A 180
MET A 181
VAL A 184
GLN A 188
 SAM A 300
3MTE_A_SAMA220 3mte SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE PF02390
(Methyltransf_4) 		16 GLY A  32
GLY A  34
ASN A  38
ASP A  55
PRO A  56
VAL A  57
ASN A  60
ALA A  86
ALA A  87
GLU A  88
LEU A 104
TRP A 107
THR A 109
LEU A 110
SER A 195
TRP A 197
 SAM A 220
3MTE_B_SAMB220 3mte SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE None 16 GLY B  32
GLY B  34
ASN B  38
ASP B  55
PRO B  56
VAL B  57
ALA B  86
ALA B  87
GLU B  88
LEU B 104
PHE B 105
TRP B 107
THR B 109
LEU B 110
SER B 195
TRP B 197
 SAM B 220
3P2K_A_SAMA6735 3p2k SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE PF02390
(Methyltransf_4) 		15 GLY A  32
GLY A  34
ASN A  38
ASP A  55
PRO A  56
ALA A  86
ALA A  87
GLU A  88
LEU A 104
PHE A 105
TRP A 107
THR A 109
LEU A 110
SER A 195
TRP A 197
 SAM A6735
3P2K_B_SAMB6735 3p2k SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE None 14 GLY B  32
GLY B  34
ASN B  38
ASP B  55
PRO B  56
VAL B  57
ALA B  87
GLU B  88
LEU B 104
TRP B 107
THR B 109
LEU B 110
SER B 195
TRP B 197
 SAM B6735
3P2K_C_SAMC6735 3p2k SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE None 17 GLY C  32
GLY C  34
ASN C  38
ASP C  55
PRO C  56
VAL C  57
ASN C  60
ALA C  86
ALA C  87
GLU C  88
LEU C 104
PHE C 105
TRP C 107
THR C 109
LEU C 110
SER C 195
TRP C 197
 SAM C6735
3P2K_D_SAMD6735 3p2k SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Escherichia coli 16S RRNA METHYLASE None
PF02390
(Methyltransf_4) 		18 GLY D  32
GLY D  34
ASN D  38
ASP D  55
PRO D  56
VAL D  57
ALA D  86
ALA D  87
GLU D  88
LEU D 104
TRP D 107
THR D 109
LEU D 110
TYR D 113
LYS A 191
SER D 195
TRP D 197
PHE A 203
 SAM D6735
4DR2_A_PARA1609 4dr2 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
30S RIBOSOMAL
PROTEIN S10;
30S RIBOSOMAL
PROTEIN S9 		PF00338
(Ribosomal_S10)
PF00380
(Ribosomal_S9)
no annotation 		3 ARG J  51
SER J  59
TYR I 114
 PAR A1609
4DR3_A_SRYA1601 4dr3 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
30S RIBOSOMAL
PROTEIN S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		4 LYS L  46
LYS L  47
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1601
4DR5_A_SRYA1860 4dr5 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
30S RIBOSOMAL
PROTEIN S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		3 LYS L  46
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1860
4DR6_A_SRYA1956 4dr6 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
30S RIBOSOMAL
PROTEIN S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		3 LYS L  46
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1956
4DUZ_A_SRYA1601 4duz SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		3 LYS L  46
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1601
4DV1_A_SRYA1601 4dv1 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		3 LYS L  46
LYS L  47
PRO L  48
 SRY A1601
4DV3_A_SRYA1601 4dv3 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		4 LYS L  46
LYS L  47
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1601
4DV5_A_SRYA1601 4dv5 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		4 LYS L  46
LYS L  47
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1601
4DV7_A_SRYA1601 4dv7 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		3 LYS L  46
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1601
4JI1_A_SRYA1601 4ji1 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		4 LYS L  46
LYS L  47
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1601
4JI3_A_SRYA1601 4ji3 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		4 LYS L  46
LYS L  47
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1601
4JI8_A_SRYA1601 4ji8 SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		3 LYS L  46
LYS L  91
TRP L  94
 SRY A1601
4LF7_A_PARA1817 4lf7 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S10;
RIBOSOMAL PROTEIN S9 		PF00338
(Ribosomal_S10)
PF00380
(Ribosomal_S9)
no annotation 		3 ARG J  51
SER J  59
TYR I 114
 PAR A1817
4LF8_A_PARA1817 4lf8 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S10;
RIBOSOMAL PROTEIN S9 		PF00338
(Ribosomal_S10)
PF00380
(Ribosomal_S9)
no annotation 		3 ARG J  51
SER J  59
TYR I 114
 PAR A1817
4NXN_A_SRYA1601 4nxn SRY

DB01082
(Streptomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S12 		PF00164
(Ribosom_S12_S23)
no annotation 		4 LYS L  46
LYS L  47
PRO L  48
LYS L  91
 SRY A1601
5BW4_A_SAMA301 5bw4 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Catenulispora
acidiphila 		16S RRNA
(ADENINE(1408)-N(1))
-METHYLTRANSFERASE 		None 12 GLY A  38
GLY A  40
THR A  44
ASP A  61
PRO A  62
ARG A  66
ILE A  93
GLU A  94
LEU A 110
TRP A 113
LYS A 115
LEU A 116
 SAM A 301
5BW4_B_SAMB301 5bw4 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Catenulispora
acidiphila 		16S RRNA
(ADENINE(1408)-N(1))
-METHYLTRANSFERASE 		None 15 GLY B  38
GLY B  40
ASP B  61
PRO B  62
ALA B  63
ARG B  66
ALA B  92
ILE B  93
GLU B  94
LEU B 110
TRP B 113
LYS B 115
LEU B 116
SER B 201
ALA B 204
 SAM B 301