DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'TETRACYCLINE'

List of Binding Interfaces

(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
2FJ1_A_CTCA222 2fj1 CTC

DB09093
(Chlortetracycline)
Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR PROTEIN
CLASS D
PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C)
13 HIS A  64
SER A  67
ASN A  82
PHE A  86
HIS A 100
ARG A 104
PRO A 105
THR A 112
VAL A 113
GLN A 116
LEU A 131
ILE A 134
SER A 138
CTC A 222
2HCJ_B_TACB888 2hcj TAC

DB00759
(Tetracycline)
Escherichia coli PROTEIN CHAIN
ELONGATION FACTOR
EF-TU
PF00009
(GTP_EFTU)
PF03143
(GTP_EFTU_D3)
PF03144
(GTP_EFTU_D2)
4 THR A  25
SER B  65
ASP B  80
PRO B  82
TAC B 888
2HDN_B_TACB1888 2hdn TAC

DB00759
(Tetracycline)
Escherichia coli ELONGATION FACTOR
EF-TU
PF00009
(GTP_EFTU)
PF03143
(GTP_EFTU_D3)
PF03144
(GTP_EFTU_D2)
no annotation
5 THR A  25
SER B  65
SER D  65
ASP B  80
PRO B  82
TAC B1888
2HDN_D_TACD2888 2hdn TAC

DB00759
(Tetracycline)
Escherichia coli ELONGATION FACTOR
EF-TU
PF00009
(GTP_EFTU)
PF03143
(GTP_EFTU_D3)
PF03144
(GTP_EFTU_D2)
no annotation
5 THR C  25
SER B  65
SER D  65
ASP D  80
PRO D  82
TAC D2888
2HDN_F_TACF3888 2hdn TAC

DB00759
(Tetracycline)
Escherichia coli ELONGATION FACTOR
EF-TU
no annotation 7 THR E  25
SER H  65
SER F  65
VAL H  67
ASP F  80
PRO F  82
LEU H 178
TAC F3888
2HDN_H_TACH4888 2hdn TAC

DB00759
(Tetracycline)
Escherichia coli ELONGATION FACTOR
EF-TU
no annotation 7 THR G  25
SER H  65
SER F  65
VAL F  67
ASP H  80
PRO H  82
LEU F 178
TAC H4888
2HDN_J_TACJ5888 2hdn TAC

DB00759
(Tetracycline)
Escherichia coli ELONGATION FACTOR
EF-TU
no annotation 6 THR I  25
SER L  65
SER J  65
VAL L  67
ASP J  80
PRO J  82
TAC J5888
2HDN_L_TACL6888 2hdn TAC

DB00759
(Tetracycline)
Escherichia coli ELONGATION FACTOR
EF-TU
no annotation 6 THR K  25
SER L  65
SER J  65
VAL J  67
ASP L  80
PRO L  82
TAC L6888
2TCT_A_CTCA222 2tct CTC

DB09093
(Chlortetracycline)
Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR
PF00440
(TetR_C)
PF02909
(TetR_N)
13 HIS A  64
SER A  67
ASN A  82
PHE A  86
HIS A 100
ARG A 104
PRO A 105
GLN A 109
THR A 112
VAL A 113
GLN A 116
ILE A 134
SER A 138
CTC A 222
2TRT_A_TACA222 2trt TAC

DB00759
(Tetracycline)
Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR CLASS D
PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C)
11 HIS A  64
SER A  67
ASN A  82
PHE A  86
HIS A 100
ARG A 104
PRO A 105
VAL A 113
GLN A 116
ILE A 134
SER A 138
TAC A 222
2UXO_B_TACB1211 2uxo TAC

DB00759
(Tetracycline)
Pseudomonas
putida
HTH-TYPE
TRANSCRIPTIONAL
REGULATOR TTGR
no annotation 11 LEU B  66
HIS B  70
LEU B  92
VAL B  96
ASN B 110
LEU B 113
CYS B 137
ILE B 141
MET B 167
VAL B 171
ILE B 175
TAC B1211
2VKE_A_TACA222 2vke TAC

DB00759
(Tetracycline)
Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR PROTEIN
CLASS D
PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C)
11 HIS A  64
SER A  67
ASN A  82
PHE A  86
HIS A 100
ARG A 104
PRO A 105
VAL A 113
GLN A 116
ILE A 134
SER A 138
TAC A 222
2XPW_A_OTCA222 2xpw OTC

DB00595
(Oxytetracycline)
Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR PROTEIN
CLASS D
PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C)
12 LEU A  60
HIS A  64
SER A  67
ASN A  82
PHE A  86
HIS A 100
ARG A 104
PRO A 105
VAL A 113
GLN A 116
ILE A 134
SER A 138
OTC A 222
2Y6R_A_CTCA1385 2y6r CTC

DB09093
(Chlortetracycline)
Bacteroides
thetaiotaomicron
TETX2 PROTEIN PF01494
(FAD_binding_3)
10 ASP A  61
GLN A 192
ARG A 213
MET A 215
PHE A 224
ASN A 226
GLY A 236
PRO A 318
GLY A 321
MET A 375
CTC A1385
2Y6R_B_CTCB1385 2y6r CTC

DB09093
(Chlortetracycline)
Bacteroides
thetaiotaomicron
TETX2 PROTEIN None 8 GLN B 192
ARG B 213
MET B 215
PHE B 224
GLY B 236
PRO B 318
GLY B 321
MET B 375
CTC B1385
2Y6R_C_CTCC1385 2y6r CTC

DB09093
(Chlortetracycline)
Bacteroides
thetaiotaomicron
TETX2 PROTEIN None 12 ASP C  61
ASN C 190
GLN C 192
ARG C 213
MET C 215
PHE C 224
HIS C 234
GLY C 236
SER C 238
PRO C 318
GLY C 321
MET C 375
CTC C1385
2Y6R_D_CTCD1385 2y6r CTC

DB09093
(Chlortetracycline)
Bacteroides
thetaiotaomicron
TETX2 PROTEIN None 10 ASP D  61
GLN D 192
ARG D 213
MET D 215
PHE D 224
HIS D 234
GLY D 236
SER D 238
PRO D 318
MET D 375
CTC D1385
3Q5P_A_TACA7101 3q5p TAC

DB00759
(Tetracycline)
Bacillus subtilis MULTIDRUG-EFFLUX
TRANSPORTER 1
REGULATOR
PF06445
(GyrI-like)
PF13411
(MerR_1)
12 PRO A 144
VAL A 147
ASN A 149
TYR A 152
TYR A 170
ILE A 182
TYR A 187
PHE A 224
TYR A 229
GLU A 253
ILE A 255
TYR A 268
TAC A7101
4B3A_A_TACA222 4b3a TAC

DB00759
(Tetracycline)
Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR PROTEIN
CLASS D
PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C)
12 LEU A  60
HIS A  64
SER A  67
ASN A  82
PHE A  86
ARG A 104
PRO A 105
GLN A 109
VAL A 113
GLN A 116
ILE A 134
SER A 138
TAC A 222
4V2G_B_CTCB222 4v2g CTC

DB09093
(Chlortetracycline)
Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR PROTEIN
CLASS D
None
PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C)
14 HIS B  64
SER B  67
ASN B  82
PHE B  86
HIS B 100
ARG B 104
PRO B 105
THR B 112
VAL B 113
GLN B 116
ILE B 134
SER B 138
LEU A 170
LEU A 174
CTC B 222
5TUI_B_CTCB405 5tui CTC

DB09093
(Chlortetracycline)
uncultured
bacterium
TETRACYCLINE
DESTRUCTASE TET(50)
None 17 ASP B  47
ARG B  49
GLY B  94
PHE B  95
ARG B  96
GLU B 102
VAL B 181
LEU B 198
LEU B 205
THR B 207
GLY B 220
MET B 222
PRO B 296
GLY B 299
PHE B 344
VAL B 348
ILE B 371
CTC B 405