DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'SAQUINAVIR'

List of Binding Interfaces

(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1C6Z_B_ROCB505 1c6z ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEIN (PROTEASE) PF00077
(RVP)
no annotation
27 ARG A   8
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  32
ILE A  47
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
THR A  82
ILE A  84
ARG B 208
ASP B 225
GLY B 227
ALA B 228
ASP B 229
ASP B 230
VAL B 232
ILE B 247
GLY B 249
ILE B 250
THR B 280
PRO B 281
THR B 282
ILE B 284
ROC B 505
1FB7_A_ROCA100 1fb7 ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
12 ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  48
GLY A  49
ILE A  50
THR A  80
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ROC A 100
1HXB_A_ROCA100 1hxb ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
31 ARG B   8
ARG A   8
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL A  32
VAL B  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  48
GLY B  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
THR B  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
ROC A 100
2NMY_A_ROCA401 2nmy ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
27 ARG A   8
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ILE A  47
GLY A  49
ILE A  50
THR A  80
PRO A  81
ILE A  84
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
ILE B 147
GLY B 148
GLY B 149
ILE B 150
THR B 180
PRO B 181
ALA B 182
ILE B 184
ROC A 401
2NMZ_B_ROCB401 2nmz ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
29 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  32
ILE A  47
GLY A  49
ILE A  50
THR A  80
PRO A  81
ALA A  82
ILE A  84
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
THR B 180
PRO B 181
ALA B 182
ILE B 184
ROC B 401
2NNK_A_ROCA401 2nnk ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
28 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  32
ILE A  47
GLY A  49
ILE A  50
THR A  80
PRO A  81
VAL A  82
VAL A  84
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ASP B 129
ASP B 130
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
THR B 180
PRO B 181
VAL B 182
VAL B 184
ROC A 401
2NNP_A_ROCA401 2nnp ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
22 ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ILE A  47
GLY A  49
ILE A  50
THR A  80
PRO A  81
VAL A  82
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
ALA B 128
VAL B 132
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
VAL B 184
ROC A 401
3CYX_A_ROCA201 3cyx ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
31 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY B  48
GLY A  49
GLY B  49
VAL B  50
VAL A  50
THR A  80
THR B  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
ROC A 201
3D1X_A_ROCA201 3d1x ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
27 ARG B   8
ARG A   8
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
THR B  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
ROC A 201
3D1Y_A_ROCA201 3d1y ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
21 ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ILE A  47
GLY A  49
ILE A  50
THR A  80
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
ROC A 201
3EKQ_A_ROCA100 3ekq ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
22 ARG B   8
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL B  32
ILE B  47
ILE A  47
VAL A  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
PRO B  81
PRO A  81
THR A  82
ILE A  84
ILE B  84
ROC A 100
3EL4_A_ROCA100 3el4 ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
21 ARG B   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL B  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
PRO A  81
PRO B  81
THR A  82
THR B  82
VAL A  84
ROC A 100
3K4V_B_ROCB201 3k4v ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
32 TRP C   6
ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY B  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
THR B  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
ROC B 201
3K4V_D_ROCD201 3k4v ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
31 ARG D   8
ARG C   8
LEU C  23
LEU D  23
ASP D  25
ASP C  25
GLY C  27
GLY D  27
ALA C  28
ALA D  28
ASP D  29
ASP C  29
ASP C  30
ASP D  30
VAL C  32
VAL D  32
ILE D  47
ILE C  47
GLY C  48
GLY D  49
GLY C  49
ILE D  50
ILE C  50
THR D  80
THR C  80
PRO D  81
PRO C  81
VAL D  82
VAL C  82
ILE D  84
ILE C  84
ROC D 201
3N3I_A_ROCA201 3n3i ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE PF00077
(RVP)
18 ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ILE A  47
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ARG A1008
ASP A1025
ALA A1028
ASP A1030
ILE A1047
GLY A1049
ILE A1050
VAL A1082
ROC A 201
3NDT_A_ROCA101 3ndt ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
30 TRP C   6
ARG B   9
ARG A   9
LEU A  24
LEU B  24
ASP A  26
ASP B  26
GLY A  28
GLY B  28
ALA B  29
ALA A  29
ASP B  30
ASP A  30
ASP B  31
ASP A  31
VAL A  33
ILE B  48
ILE A  48
GLY A  50
GLY B  50
ILE B  51
ILE A  51
THR A  81
THR B  81
PRO B  82
PRO A  82
VAL A  83
VAL B  83
ILE A  85
ILE B  85
ROC A 101
3NDT_D_ROCD100 3ndt ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE no annotation 28 ARG D   8
ARG C   8
LEU C  23
LEU D  23
ASP D  25
ASP C  25
GLY C  27
GLY D  27
ALA C  28
ALA D  28
ASP D  29
ASP C  29
ASP C  30
ASP D  30
VAL D  32
ILE C  47
GLY D  49
GLY C  49
ILE D  50
ILE C  50
THR D  80
THR C  80
PRO D  81
PRO C  81
VAL D  82
VAL C  82
ILE D  84
ILE C  84
ROC D 100
3NDU_A_ROCA101 3ndu ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
29 TRP C   6
ARG B   9
ARG A   9
LEU A  24
LEU B  24
ASP A  26
ASP B  26
GLY A  28
GLY B  28
ALA B  29
ALA A  29
ASP B  30
ASP A  30
ASP B  31
ASP A  31
ILE B  48
ILE A  48
GLY A  50
GLY B  50
ILE B  51
ILE A  51
THR A  81
THR B  81
PRO B  82
PRO A  82
VAL A  83
VAL B  83
ILE A  85
ILE B  85
ROC A 101
3NDU_D_ROCD100 3ndu ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE no annotation 29 ARG D   8
ARG C   8
LEU C  23
LEU D  23
ASP D  25
ASP C  25
GLY C  27
GLY D  27
ALA D  28
ASP D  29
ASP C  29
ASP C  30
ASP D  30
VAL C  32
VAL D  32
ILE D  47
ILE C  47
GLY D  49
GLY C  49
ILE D  50
ILE C  50
THR D  80
THR C  80
PRO D  81
PRO C  81
VAL D  82
VAL C  82
ILE D  84
ILE C  84
ROC D 100
3OXC_A_ROCA401 3oxc ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
29 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  32
ILE A  47
GLY A  49
ILE A  50
THR A  80
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
THR B 180
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
ROC A 401
3PWR_A_ROCA401 3pwr ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
29 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL A  32
ILE A  47
GLY A  49
ILE A  50
THR A  80
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ARG B 108
LEU B 123
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
ROC A 401
3PWW_A_ROCA1001 3pww ROC

DB01232
(Saquinavir)
Cryphonectria
parasitica
ENDOTHIAPEPSIN PF00026
(Asp)
20 ILE A  10
ASP A  15
ASP A  33
ASP A  35
GLY A  37
SER A  38
ILE A  77
TYR A  79
GLY A  80
ASP A  81
SER A  83
PHE A 116
LEU A 125
PHE A 194
ILE A 217
ASP A 219
THR A 222
THR A 223
TYR A 226
ILE A 304
ROC A1001
3S56_A_ROCA201 3s56 ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
21 ARG B   8
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ASP B  30
ILE A  32
VAL A  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
ILE B  50
THR A  80
PRO A  81
PRO B  81
ILE B  82
ILE A  82
ILE B  84
ROC A 201
3S56_B_ROCB203 3s56 ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE no annotation 7 ARG B   8
LEU B  10
GLU B  21
LEU B  23
GLU B  34
PRO B  81
ILE B  82
ROC B 203
3TKG_B_ROCB801 3tkg ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
29 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
ILE A  47
ILE B  47
GLY B  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
THR B  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
ROC B 801
3TKG_C_ROCC901 3tkg ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE no annotation 28 ARG D   8
ARG C   8
LEU D  23
ASP D  25
ASP C  25
GLY C  27
GLY D  27
ALA C  28
ALA D  28
ASP D  29
ASP C  29
ASP C  30
ASP D  30
VAL D  32
ILE D  47
ILE C  47
GLY D  49
GLY C  49
ILE D  50
ILE C  50
THR D  80
THR C  80
PRO D  81
PRO C  81
VAL D  82
VAL C  82
ILE D  84
ILE C  84
ROC C 901
3TL9_A_ROCA401 3tl9 ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
31 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY B  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
THR B  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
ROC A 401
3UFN_A_ROCA401 3ufn ROC

DB01232
(Saquinavir)
Homo sapiens HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
18 ARG B   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASN A  30
VAL A  47
VAL B  47
GLY A  48
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
ILE B  50
THR A  80
PRO A  81
VAL B  82
VAL B  84
ROC A 401
3UFN_A_ROCA402 3ufn ROC

DB01232
(Saquinavir)
Homo sapiens HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
5 ARG A   8
LEU A  23
ASP B  29
PRO A  81
VAL A  82
ROC A 402
4Q5M_A_ROCA1101 4q5m ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE PF00077
(RVP)
27 ARG A   8
ASP A  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASN A  30
VAL A  32
ILE A  47
GLY A  49
ILE A  50
THR A  80
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ARG A1008
ASP A1025
GLY A1027
ASP A1029
ASN A1030
VAL A1032
ILE A1047
GLY A1049
ILE A1050
THR A1080
PRO A1081
VAL A1082
ILE A1084
ROC A1101
4QGI_A_ROCA101 4qgi ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
22 ARG B   8
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL B  32
ILE B  47
ILE A  47
THR A  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE B  84
ROC A 101
5KQX_A_ROCA101 5kqx ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE E35D-SQV PF00077
(RVP)
no annotation
21 ARG B   8
LEU B  23
ASN A  25
ASN B  25
GLY A  27
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
VAL B  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
ILE A  84
ILE B  84
ROC A 101
5KR2_A_ROCA101 5kr2 ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE PR5-SQV PF00077
(RVP)
no annotation
20 ARG B   8
LEU B  23
ASN A  25
ASN B  25
ALA A  28
ALA B  28
ASP A  29
ASP A  30
ASP B  30
ILE A  47
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
THR A  80
PRO A  81
PRO B  81
VAL B  82
ILE B  84
ROC A 101
5KR2_C_ROCC101 5kr2 ROC

DB01232
(Saquinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE PR5-SQV no annotation 18 ARG D   8
LEU D  23
ASN D  25
ASN C  25
ALA C  28
ASP C  29
ASP C  30
ILE D  47
ILE C  47
GLY D  49
GLY C  49
ILE D  50
ILE C  50
THR C  80
PRO C  81
PRO D  81
VAL D  82
ILE D  84
ROC C 101