DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'PAROMOMYCIN'

List of Binding Interfaces

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DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
2VQY_A_PARA1201 2vqy PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Escherichia coli AAC(6')-IB PF13523
(Acetyltransf_8) 		15 TRP A  49
GLY A  50
GLN A  64
TYR A  65
LEU A  70
GLU A  73
VAL A  75
GLN A  91
TYR A  93
SER A  98
TRP A 102
TRP A 103
ASP A 115
ASP A 152
ASP A 179
 PAR A1201
4DR2_A_PARA1609 4dr2 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
30S RIBOSOMAL
PROTEIN S10;
30S RIBOSOMAL
PROTEIN S9 		PF00338
(Ribosomal_S10)
PF00380
(Ribosomal_S9)
no annotation 		3 ARG J  51
SER J  59
TYR I 114
 PAR A1609
4KHP_A_PARA1606 4khp PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RIBOSOMAL RNA;
30S RIBOSOMAL
PROTEIN S10;
30S RIBOSOMAL
PROTEIN S9 		PF00338
(Ribosomal_S10)
PF00380
(Ribosomal_S9)
no annotation 		3 ARG J  51
SER J  59
TYR I 114
 PAR A1606
4LF7_A_PARA1817 4lf7 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S10;
RIBOSOMAL PROTEIN S9 		PF00338
(Ribosomal_S10)
PF00380
(Ribosomal_S9)
no annotation 		3 ARG J  51
SER J  59
TYR I 114
 PAR A1817
4LF8_A_PARA1817 4lf8 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Thermus
thermophilus 		16S RRNA;
RIBOSOMAL PROTEIN
S10;
RIBOSOMAL PROTEIN S9 		PF00338
(Ribosomal_S10)
PF00380
(Ribosomal_S9)
no annotation 		3 ARG J  51
SER J  59
TYR I 114
 PAR A1817
4QB9_A_PARA500 4qb9 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Mycolicibacterium
smegmatis 		ENHANCED
INTRACELLULAR
SURVIVAL PROTEIN 		PF13527
(Acetyltransf_9)
PF13530
(SCP2_2) 		10 PHE A  26
SER A  83
PHE A  84
THR A 119
SER A 121
GLU A 137
ASP A 290
ASP A 291
TYR A 400
GLY A 401
 PAR A 500
4QB9_B_PARB500 4qb9 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Mycolicibacterium
smegmatis 		ENHANCED
INTRACELLULAR
SURVIVAL PROTEIN 		no annotation 9 PHE B  26
SER B  83
THR B 119
SER B 121
GLU B 137
ARG B 205
ASP B 291
TYR B 400
GLY B 401
 PAR B 500
4QB9_C_PARC500 4qb9 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Mycolicibacterium
smegmatis 		ENHANCED
INTRACELLULAR
SURVIVAL PROTEIN 		no annotation 10 SER C  83
PHE C  84
THR C 119
SER C 121
TYR C 126
GLU C 137
ASP C 290
ASP C 291
TYR C 400
GLY C 401
 PAR C 500
4QB9_D_PARD500 4qb9 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Mycolicibacterium
smegmatis 		ENHANCED
INTRACELLULAR
SURVIVAL PROTEIN 		no annotation 8 PHE D  26
SER D  83
THR D 119
SER D 121
GLU D 137
ASP D 290
ASP D 291
TYR D 400
 PAR D 500
4QB9_E_PARE500 4qb9 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Mycolicibacterium
smegmatis 		ENHANCED
INTRACELLULAR
SURVIVAL PROTEIN 		no annotation 12 PHE E  26
SER E  83
PHE E  84
LEU E 118
THR E 119
SER E 121
TYR E 126
GLU E 137
ASP E 290
ASP E 291
TYR E 400
GLY E 401
 PAR E 500
4QB9_F_PARF500 4qb9 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Mycolicibacterium
smegmatis 		ENHANCED
INTRACELLULAR
SURVIVAL PROTEIN 		no annotation 11 PHE F  26
SER F  83
THR F 119
SER F 121
TYR F 126
GLU F 137
GLU F 238
ASP F 290
ASP F 291
TYR F 400
GLY F 401
 PAR F 500
5NDV_1_PAR13407 5ndv PAR

DB01421
(Paromomycin) 		;
Saccharomyces
cerevisiae 		;
25S RIBOSOMAL RNA 		no annotation 4 ASNQ0 119
GLUM0 150
ARGM0 153
ARGM0 154
 PAR 13407
5NDV_1_PAR13413 5ndv PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Saccharomyces
cerevisiae 		25S RIBOSOMAL RNA;
5S RIBOSOMAL RNA 		no annotation 3 LYSL7 121
GLUL7 125
LYSL7 128
 PAR 13413
5NDV_1_PAR13415 5ndv PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Saccharomyces
cerevisiae 		18S RIBOSOMAL RNA;
25S RIBOSOMAL RNA 		no annotation 3 GLNL2  24
LYSL2  60
ILEL2  75
 PAR 13415
5NDV_1_PAR13424 5ndv PAR

DB01421
(Paromomycin) 		;
Saccharomyces
cerevisiae 		;
18S RIBOSOMAL RNA;
25S RIBOSOMAL RNA 		no annotation 3 ARGM9  64
SERN2  72
LYSN2  74
 PAR 13424
5NDV_2_PAR21903 5ndv PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Saccharomyces
cerevisiae 		18S RIBOSOMAL RNA;
5S RIBOSOMAL RNA 		no annotation 4 VALD3  17
ASND3  21
TRPD3  24
LYSD3  30
 PAR 21903
5NDV_5_PAR53404 5ndv PAR

DB01421
(Paromomycin) 		;
Saccharomyces
cerevisiae 		;
18S RIBOSOMAL RNA;
25S RIBOSOMAL RNA 		no annotation 3 ARGm9  64
SERn2  72
LYSn2  74
 PAR 53404
5NDV_5_PAR53423 5ndv PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Saccharomyces
cerevisiae 		25S RIBOSOMAL RNA;
5.8S RIBOSOMAL RNA 		no annotation 3 LYSn8  63
THRm8 168
ARGm8 174
 PAR 53423
5NDV_6_PAR61901 5ndv PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Saccharomyces
cerevisiae 		18S RIBOSOMAL RNA;
5.8S RIBOSOMAL RNA 		no annotation 3 ASNd4 113
LYSd4 116
LYSd4 117
 PAR 61901
5NDV_8_PAR8202 5ndv PAR

DB01421
(Paromomycin) 		;
Saccharomyces
cerevisiae 		;
5.8S RIBOSOMAL RNA;
5S RIBOSOMAL RNA 		no annotation 3 GLNo9  19
ARGo7  24
ASNo9  50
 PAR 8 202
6AZ3_1_PAR11801 6az3 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Leishmania
donovani 		RIBOSOMAL PROTEIN
EL18;
RRNA ALPHA 		no annotation 4 ARG P  66
ARG P 149
GLY P 152
ARG P 157
 PAR 11801
6AZ3_1_PAR11802 6az3 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Leishmania
donovani 		RIBOSOMAL PROTEIN
EL15;
RIBOSOMAL PROTEIN
UL15;
RIBOSOMAL PROTEIN
UL4;
RRNA ALPHA 		no annotation 3 LYS L   6
ARG C 109
ARG M 204
 PAR 11802
6AZ3_1_PAR11803 6az3 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Leishmania
donovani 		RIBOSOMAL PROTEIN
EL18;
RRNA ALPHA 		no annotation 3 SER P   9
LYS P  10
SER P  12
 PAR 11803
6MB7_A_PARA900 6mb7 PAR

DB01421
(Paromomycin) 		Pseudomonas
aeruginosa 		AAC(3)-IIIB PROTEIN PF02522
(Antibiotic_NAT) 		10 TYR A  65
ASP A  67
ASN A 104
TYR A 147
THR A 172
HIS A 177
THR A 213
GLY A 214
ASP A 215
GLU A 223
 PAR A 900